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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2024-08-09 |
Macrophage subsets in atherosclerosis as defined by single-cell technologies
2020-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5392
PMID:32003464
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综述 | 本文综述了单细胞技术在定义动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群方面的最新进展 | 利用单细胞技术如时间飞行流式细胞术和单细胞RNA测序,全面绘制动脉粥样硬化斑块中各种细胞类型及其表型 | NA | 探讨单细胞技术在定义动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的应用 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 涉及小鼠和人类的动脉粥样硬化斑块 |
82 | 2024-08-09 |
In vitro characterization of the human segmentation clock
2020-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1885-9
PMID:31915384
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研究论文 | 本文通过体外培养的人类前体脊索中胚层细胞研究了人类分割时钟的特征 | 首次在人类细胞中证实了与小鼠相似的分割时钟振荡器,并揭示了FGF信号通路在调节振荡周期和相位中的新作用 | NA | 探讨人类是否存在与小鼠类似的分割时钟振荡器 | 人类前体脊索中胚层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 人类和小鼠的前体脊索中胚层细胞 |
83 | 2024-08-09 |
Identification of key genes and pathways in abdominal aortic aneurysm by integrated bioinformatics analysis
2020-Apr, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/0300060519894437
PMID:31885343
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研究论文 | 通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据,识别与腹主动脉瘤相关的关键基因和通路 | 发现了四个新的与腹主动脉瘤相关的主要基因,这些基因在已知的动脉瘤基因数据库中未被记录 | NA | 识别与腹主动脉瘤发病机制和进展相关的关键基因,并探索其作为治疗靶点的潜力 | 腹主动脉瘤的关键基因和生物通路 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 507个上调基因和842个下调基因 |
84 | 2024-08-09 |
Causal network perturbations for instance-specific analysis of single cell and disease samples
2020-04-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz949
PMID:31873725
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ssNPA的新方法,用于基于基因网络失调对样本进行亚型分类 | ssNPA直接从对照数据中学习因果图,并通过预测每个基因表达的误差来量化样本特定网络邻域的失调 | NA | 旨在通过分析个体样本中的通路扰动,改善诊断并实现个性化治疗 | 单细胞和疾病样本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 因果图 | 基因表达数据 | 包括肝脏发育的单细胞RNA-seq数据和两个TCGA数据集 |
85 | 2024-08-09 |
Design and application of single-cell RNA sequencing to study kidney immune cells in lupus nephritis
2020-04, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-019-0232-6
PMID:31853010
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了狼疮性肾炎中的肾脏免疫细胞 | 采用单细胞RNA测序技术对狼疮性肾炎患者的肾脏活检样本进行详细细胞群特征分析,并探讨了非侵入性监测肾脏免疫激活的可能性 | NA | 揭示狼疮性肾炎中导致组织损伤的免疫机制 | 狼疮性肾炎患者的肾脏免疫细胞和实质细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 多个地点和不同人群的肾脏活检样本 |
86 | 2024-08-09 |
Transcriptional profiling of microglia; current state of the art and future perspectives
2020-04, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23767
PMID:31846124
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综述 | 本文综述了微胶质细胞转录组学领域的最新进展,并比较了新鲜和冷冻样本中细胞和核转录组的差异 | 介绍了单核RNA测序技术在冷冻中枢神经系统组织中的应用,以及其在研究微胶质细胞基因表达和细胞异质性中的可靠性 | NA | 探讨微胶质细胞在神经病理学中的作用 | 微胶质细胞的转录组学特征 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类的中枢神经系统组织样本 |
87 | 2024-08-09 |
Dissecting the human immune system with single cell RNA sequencing technology
2020-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5MR1019-179R
PMID:31803960
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在解析人类免疫系统中的最新进展和挑战 | 单细胞RNA测序技术能够分析单个细胞的转录组,特别适合解析免疫细胞的异质性 | 文章提到了单细胞RNA测序技术在免疫学应用中需要克服的潜在障碍 | 促进对人类免疫学的理解 | 人类免疫系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
88 | 2024-08-09 |
SpaCell: integrating tissue morphology and spatial gene expression to predict disease cells
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz914
PMID:31808789
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaCell的用户友好型深度学习软件,该软件能够整合组织形态学和空间基因表达数据,以预测疾病细胞 | SpaCell软件创新地整合了数百万像素强度值与数千个基因表达测量数据,提高了细胞类型识别和组织图像标签预测的分辨率和准确性 | NA | 开发一种能够整合组织形态学和空间基因表达数据以预测疾病细胞的深度学习软件 | 组织形态学和空间基因表达数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学(ST) | 深度学习模型 | 图像和基因表达数据 | NA |
89 | 2024-08-09 |
CellBench: R/Bioconductor software for comparing single-cell RNA-seq analysis methods
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz889
PMID:31778143
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研究论文 | 本文介绍了CellBench软件,用于比较单细胞RNA测序分析方法 | CellBench软件支持任务中心或组合方式的方法比较,自动运行方法组合,并提供运行时间测量和表格输出,便于总结和可视化 | NA | 开发新软件以管理单细胞RNA测序分析方法的基准测试 | 单细胞RNA测序分析方法的基准测试 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
90 | 2024-08-09 |
Somatic mutations - Evolution within the individual
2020-04-01, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2019.11.002
PMID:31711929
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研究论文 | 本文探讨了利用先进的测序技术和机器学习方法来研究体细胞突变,以及这些突变在衰老相关疾病中的作用 | 结合实验和计算方法,利用机器学习提高检测效率和敏感性,并应用数学框架分析体细胞进化 | 识别真正的体细胞突变仍然具有挑战性 | 深入了解与衰老相关的疾病,如癌症、炎症和偶发性精神障碍 | 体细胞突变及其在疾病发展中的作用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习 | 基因组数据 | NA |
91 | 2024-08-09 |
Migraine-associated gene expression in cell types of the central and peripheral nervous system
2020-04, Cephalalgia : an international journal of headache
IF:5.0Q1
DOI:10.1177/0333102419877834
PMID:31660761
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据,分析了中枢和周围神经系统中与偏头痛相关的基因表达情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术,确定了与偏头痛相关的基因在中枢和周围神经系统中的具体细胞类型表达 | NA | 确定与偏头痛相关的基因在神经系统中的细胞类型特异性表达 | 中枢和周围神经系统中的细胞类型 | NA | 偏头痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
92 | 2024-08-09 |
Topical Application of a Mast Cell Stabilizer Improves Impaired Diabetic Wound Healing
2020-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2019.08.449
PMID:31568772
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研究论文 | 本文研究了一种新型色胺酸-羧酰胺类肥大细胞稳定剂MCS-01在糖尿病伤口愈合中的应用 | 开发了一种新型肥大细胞稳定剂MCS-01,并通过特定设计的海藻酸盐绷带实现长期局部控制释放,加速了糖尿病小鼠的伤口愈合 | NA | 探讨肥大细胞稳定剂在改善糖尿病伤口愈合中的作用 | 糖尿病小鼠的伤口愈合过程 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6,154个细胞 |