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当前共找到 114 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Distinct Mesenchymal Cell Populations Generate the Essential Intestinal BMP Signaling Gradient
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.01.008
PMID:32084389
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研究论文 | 本研究通过结合全装高分辨率显微镜与集合和单细胞RNA测序，识别了三种不同的PDGFRA间质细胞类型，揭示了它们在肠道BMP信号梯度形成中的作用 | 首次详细描述了肠道间质细胞的精细解剖、分子和功能细节，以及这些细胞在组织自我更新所需的信号梯度中的细胞基础 | NA | 揭示肠道间质细胞结构及其在组织自我更新中的作用 | 肠道间质细胞及其在BMP信号梯度中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-09 |
New insights into the early mechanisms of epileptogenesis in a zebrafish model of Dravet syndrome
2020-03, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.16456
PMID:32096222
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术在斑马鱼模型中引入突变，探索Dravet综合征早期癫痫发生机制及5HT2受体激动剂芬氟拉明的潜在疾病修饰作用。 | 首次在斑马鱼模型中揭示Dravet综合征早期发病机制，并提供芬氟拉明可能的疾病修饰证据。 | NA | 确定Dravet综合征新生儿脑发育期间癫痫发作的最早细胞缺陷，并研究芬氟拉明的潜在疾病修饰活性。 | 斑马鱼模型中的Dravet综合征。 | 数字病理学 | 癫痫 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | 15个突变斑马鱼样本，16个野生型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-09 |
scCATCH: Automatic Annotation on Cell Types of Clusters from Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-Mar-27, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.100882
PMID:32062421
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研究论文 | 介绍了一种名为scCATCH的单细胞聚类自动注释工具，用于从单细胞RNA测序数据中自动注释细胞类型 | scCATCH通过基于证据的评分和组织特异性细胞注释策略，实现了高一致性的细胞类型注释，并优于现有的Seurat等方法 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和可重复性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在六个来自不同组织的已发表的单细胞RNA测序数据集中，scCATCH准确注释了67%-100%的聚类（平均83%） | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-09 |
Epithelial Vegfa Specifies a Distinct Endothelial Population in the Mouse Lung
2020-03-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.01.009
PMID:32059772
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研究论文 | 本文研究了小鼠肺部由上皮细胞VEGFA指定的一种特殊内皮细胞群体 | 首次揭示了上皮细胞VEGFA在小鼠肺部指定一种特殊内皮细胞群体中的作用 | NA | 探讨上皮细胞VEGFA在小鼠肺部内皮细胞分化中的作用 | 小鼠肺部的内皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 约15%的肺部内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-09 |
A Comparative Analysis of Single-Cell Transcriptome Identifies Reprogramming Driver Factors for Efficiency Improvement
2020-Mar-06, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2019.12.035
PMID:32045876
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研究论文 | 本文通过比较分析单细胞转录组，识别出提高重编程效率的驱动因子 | 发现了在核移植2细胞和4细胞胚胎中不完全激活的途径，以及在正常发育的核移植胚胎中发育转录因子的显著表达变化 | NA | 阐明体细胞核移植重编程的潜在分子机制并提高其效率 | 体细胞核移植胚胎中的重编程过程 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及核移植2细胞和4细胞胚胎的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-09 |
Occludin protects secretory cells from ER stress by facilitating SNARE-dependent apical protein exocytosis
2020-03-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1909731117
PMID:32051248
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研究论文 | 本文研究了闭合蛋白通过促进SNARE依赖的顶端蛋白胞吐作用保护分泌细胞免受内质网压力的影响 | 首次揭示了闭合蛋白在保护乳汁产生细胞免受内质网压力中的作用，并提出其他紧密连接成分可能参与类似功能的可能性 | NA | 探讨闭合蛋白在乳腺生理中的作用及其对乳汁产生细胞内质网压力的影响 | 闭合蛋白在乳汁产生细胞中的功能及其对内质网压力的影响 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 突变小鼠的乳腺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-09 |
Origin and functional heterogeneity of fibroblasts
2020-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201903188R
PMID:32037627
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综述 | 本文综述了成纤维细胞的起源、功能异质性及其在疾病中的作用 | 探讨了成纤维细胞的发育起源、分子和功能定义、表观遗传控制及其免疫调节功能的演变 | NA | 探讨成纤维细胞的起源和功能异质性 | 成纤维细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因工程小鼠模型 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-09 |
CellTagging: combinatorial indexing to simultaneously map lineage and identity at single-cell resolution
2020-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0247-2
PMID:32051617
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellTagging的方法，通过组合细胞索引技术同时捕获细胞谱系信息和细胞身份 | CellTagging方法能够与高通量单细胞RNA测序结合，通过连续的细胞标记构建多层次的谱系树 | 目前的单细胞方法在细胞处理过程中通常会丢失谱系关系 | 开发一种能够同时映射细胞谱系和身份的高通量单细胞技术 | 细胞谱系信息和细胞身份 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-09 |
Elevated circulating Th2 but not group 2 innate lymphoid cell responses characterize canine atopic dermatitis
2020-Mar, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2020.110015
PMID:32058160
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研究论文 | 研究探讨了犬类特应性皮炎中Th2细胞和2型先天淋巴细胞（ILC2）的反应特征 | 描述了先前未被特征化的犬类ILC2样细胞和Th2细胞，并发现它们在体外产生2型细胞因子并表达转录因子Gata3 | NA | 旨在深入了解导致犬类特应性皮炎的免疫学和遗传学途径，以促进新型治疗方法的开发 | 犬类特应性皮炎中的Th2细胞和ILC2细胞 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-09 |
Dissecting the spatial bone marrow microenvironment of hematopoietic stem cells
2020-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000605
PMID:32022758
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研究论文 | 本文综述了利用先进成像技术和单细胞测序方法，对骨髓微环境中造血干细胞（HSCs）及其微环境细胞类型的精确识别和空间分布的研究进展 | 采用体积成像技术和单细胞RNA测序及质谱流式细胞术，以前所未有的分辨率解析骨髓微环境的复杂性 | 尽管研究广泛，但与HSCs物理关联的骨髓细胞群的确切身份仍存在争议 | 确定在稳态和应激状态下，与HSCs直接相邻的骨髓细胞类型，以揭示驱动HSC维持和再生的细胞和分子信号 | 骨髓微环境中的造血干细胞及其微环境细胞类型 | 数字病理学 | NA | 体积成像技术，单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-09 |
Cytokeratin 5 alters β-catenin dynamics in breast cancer cells
2020-03, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-020-1164-0
PMID:31988452
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研究论文 | 研究探讨了细胞角蛋白5（CK5）在雌激素受体阳性乳腺癌细胞中对β-连环蛋白动态的影响 | 首次揭示了CK5与β-连环蛋白的相互作用及其对乳腺癌细胞的影响，并提出了阻断这种相互作用可能逆转CK5阳性乳腺癌细胞的有害特性 | 研究主要集中在细胞和动物模型上，尚未在临床试验中验证 | 探究CK5在乳腺癌干细胞中的调控作用及其与β-连环蛋白的相互作用 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫沉淀-质谱法 | NA | RNA测序 | 涉及多个乳腺癌细胞系和乳腺癌患者来源的异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Epigenetic Heterogeneity and Mitotic Heritability Prime Endothelial Cell Gene Induction
2020-03-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1900744
PMID:31996458
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研究论文 | 本文研究了人类内皮细胞在TNF-α刺激后VCAM1表达的异质性，发现这种异质性与细胞内信号传导的随机性无关，而是由预先存在的、通过有丝分裂代代相传的启动子DNA甲基化异质状态引起的。 | 首次揭示了内皮细胞中可遗传的表观遗传异质性在炎症信号传导中的基本作用，并强调了这种异质性作为亚稳态表位的重要性。 | NA | 探讨成熟分化初级细胞类型对外界刺激反应异质性的潜在机制。 | 人类内皮细胞的VCAM1表达异质性及其表观遗传调控机制。 | 数字病理学 | NA | DNA甲基化测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
Deciphering the functional heterogeneity of skin fibroblasts using single-cell RNA sequencing
2020-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201902001RR
PMID:31930613
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析皮肤成纤维细胞的功能异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了皮肤成纤维细胞的异质性，并识别出DPP4成纤维细胞作为人体皮肤中主要细胞外基质（ECM）生成细胞 | 研究仅限于皮肤成纤维细胞，未涉及其他细胞类型 | 填补关于人类皮肤成纤维细胞多样性的知识空白 | 皮肤成纤维细胞及其亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个皮肤成纤维细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-09 |
Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0392-8
PMID:31932730
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研究论文 | 本研究结合微阵列空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺导管腺癌中的组织结构 | 引入了一种多模态交叉分析方法，用于精确注释不同组织区域的细胞组成 | NA | 研究胰腺导管腺癌中细胞亚群的空间组织和相互作用 | 胰腺导管腺癌中的细胞亚群及其空间分布 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），微阵列空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个胰腺肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-09 |
Bulk and single cell transcriptomic data indicate that a dichotomy between inflammatory pathways in peripheral blood and arthritic joints complicates biomarker discovery
2020-03, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2019.154960
PMID:31881419
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研究论文 | 本研究通过整合分析基因表达微阵列数据和单细胞RNA测序数据，探讨了类风湿性关节炎（RA）中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异，以及这种差异对生物标志物发现的影响。 | 本研究首次通过大规模和单细胞转录组数据分析，揭示了周围血液和关节炎关节中炎症通路的差异，为生物标志物的发现提供了新的视角。 | 研究主要基于RA患者和健康对照的数据，未涵盖其他类型的关节炎，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨类风湿性关节炎中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异，以及这种差异对生物标志物发现的影响。 | 类风湿性关节炎患者的滑膜、全血细胞、外周血单个核细胞和CD4+ T细胞，以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 基因表达微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括RA患者和健康对照的多个样本类型，以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Accurate detection of mosaic variants in sequencing data without matched controls
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0368-8
PMID:31907404
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MosaicForecast的机器学习方法，用于在无匹配对照的测序数据中准确检测嵌合变异 | MosaicForecast利用基于读取的相位和读取级别特征，与现有算法相比，显著提高了检测嵌合单核苷酸变异和插入缺失的特异性 | NA | 开发一种新的方法来检测嵌合体突变，并探讨其在疾病起源和发展中的作用 | 人类大脑全基因组测序数据中的嵌合单核苷酸变异和插入缺失 | 机器学习 | NA | 单细胞测序和靶向测序 | 机器学习方法 | 测序数据 | 人类大脑全基因组测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Disease-Defining T-cell Subsets in the Tumor Microenvironment of Classic Hodgkin Lymphoma
2020-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-0680
PMID:31857391
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了经典霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中定义疾病的T细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下对霍奇金淋巴瘤特异性免疫微环境进行表型分析，并发现了一种新的霍奇金淋巴瘤相关T细胞亚群，该亚群表达抑制性受体LAG3，具有免疫抑制功能 | NA | 研究霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中细胞成分及其空间关系，以理解细胞间的相互作用及治疗靶点 | 霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 从22个霍奇金淋巴瘤组织样本和5个反应性淋巴结中获取超过127,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Investigation of Antigen-Specific T-Cell Receptor Clusters in Human Cancers
2020-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3249
PMID:31831563
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研究论文 | 本研究利用TRUST算法和iSMART方法，从9,700个肿瘤RNA测序样本中组装TCR超变CDR3区域，并进行综合分析，以揭示癌症相关T细胞和新型癌症抗原 | 开发了iSMART计算方法来将相似的TCR分组为抗原特异性集群，并首次通过综合分析HLA等位基因和基因组数据，识别出候选的癌症/睾丸基因HSFX1 | NA | 旨在从肿瘤基因组测序数据中识别抗原特异性TCR | 癌症抗原特异性T细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 9,700个肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics approaches of the bone marrow microenvironment
2020-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000602
PMID:31833957
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综述 | 本文综述了利用单细胞和空间转录组学技术在稳态、应激和癌症诱导重塑过程中对小鼠骨髓微环境的研究主要发现 | 首次系统且无标签地识别了骨髓细胞类型，揭示了其分子和空间特征，并阐明了关键造血因子的细胞来源 | NA | 深入探索小鼠和人类骨髓微环境中的细胞类型及其分子身份和定位 | 骨髓微环境中的细胞类型及其在稳态、应激和癌症诱导重塑过程中的变化 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
FLASH Irradiation Spares Lung Progenitor Cells and Limits the Incidence of Radio-induced Senescence
2020-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1440
PMID:31796518
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研究论文 | 研究FLASH照射对肺祖细胞的保护作用及其减少放射诱导衰老的效果 | FLASH照射技术能特异性地保护正常组织免受晚期放射诱导毒性的影响，减少DNA损伤和复制性衰老的风险 | FLASH照射的有益效果在缺乏端粒酶活性的Terc-/-小鼠中消失，表明其效果依赖于正常的端粒酶功能 | 探讨FLASH照射与传统放射治疗相比，在减少正常细胞DNA损伤和保护肺祖细胞方面的效果 | 使用C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠以及人肺细胞进行体外研究 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq） | NA | RNA | C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠，以及人肺细胞 | NA | NA | NA | NA |