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当前共找到 114 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
SCGRNs: Novel supervised inference of single-cell gene regulatory networks of complex diseases
2020-03, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2020.103656
PMID:32174324
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研究论文 | 本文提出了一种新的监督学习方法来推断单细胞基因调控网络（SCGRN），以帮助理解复杂疾病的基因调控机制 | 本文提出了三种机器学习方法来预测转录因子（TF）与目标基因之间的调控关系，其中包括使用堆叠自编码器和拓扑特征的方法 | NA | 推断单细胞基因调控网络，以更好地理解疾病 | 单细胞基因调控网络 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 健康和2型胰腺糖尿病的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
scID Uses Discriminant Analysis to Identify Transcriptionally Equivalent Cell Types across Single-Cell RNA-Seq Data with Batch Effect
2020-Mar-27, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.100914
PMID:32151972
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scID的方法，利用Fisher线性判别分析框架来识别跨批次效应的单细胞RNA测序数据中的转录相关细胞类型 | scID方法能够提高在存在批次效应的单细胞RNA测序数据集中识别转录相似细胞类型的能力 | NA | 开发一种新的方法来解决单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别问题，特别是在存在批次效应的情况下 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Fisher线性判别分析 | RNA测序数据 | 多个已发表的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Single-cell mutational profiling enhances the clinical evaluation of AML MRD
2020-03-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019001181
PMID:32150611
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研究论文 | 本研究通过靶向单细胞测序技术，在急性髓系白血病（AML）的诊断、缓解和复发阶段对MRD进行评估 | 采用靶向单细胞测序技术，提高了AML MRD临床评估的准确性，并能区分前白血病克隆和恶性克隆 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探索单细胞测序技术在AML MRD检测中的应用及其对克隆演化的影响 | 急性髓系白血病患者的MRD及克隆演化 | 数字病理学 | 白血病 | 靶向单细胞测序 | NA | 单细胞序列数据 | 共测序了310,737个单细胞，包括10例复发和4例未复发患者 | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Complementary Metagenomic Approaches Improve Reconstruction of Microbial Diversity in a Forest Soil
2020-Mar-10, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00768-19
PMID:32156798
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研究论文 | 本文通过结合细胞分选基础的迷你宏基因组学方法和整体宏基因组学方法，提高了森林土壤微生物多样性的重建 | 本文采用细胞分选基础的迷你宏基因组学方法，与整体宏基因组学方法相结合，揭示了土壤微生物群落的系统发育多样性和功能特性 | 尽管本文的方法提高了微生物多样性的重建，但仍存在部分微生物难以在实验室培养和复杂样本序列组装有限的问题 | 探索和提高森林土壤微生物多样性的认识 | 森林土壤中的微生物群落 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组学 | NA | 基因组 | 200个迷你宏基因组组装的基因组（sorted-MAGs）和29个整体宏基因组组装的基因组（MAGs） | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of the Muscle Stem Cell Hierarchy Identifies Heterotypic Communication Signals Involved in Skeletal Muscle Regeneration
2020-03-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.067
PMID:32160558
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肌肉再生过程中肌肉干细胞的调控机制 | 研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了肌肉干细胞与非肌源性细胞之间的旁分泌信号交流，并确定了与肌肉再生相关的多个候选配对 | NA | 探究肌肉再生过程中肌肉干细胞的调控机制 | 肌肉干细胞及其在肌肉再生中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 超过34,000个单细胞转录组，涵盖四个时间点 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
Functional hypoxia drives neuroplasticity and neurogenesis via brain erythropoietin
2020-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15041-1
PMID:32152318
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研究论文 | 本研究通过新型报告鼠模型，展示了认知挑战在海马体锥体神经元中诱导局部/内源性低氧，从而增强EPO及其受体EPOR的表达，并通过高剂量EPO管理促进新CA1神经元的出现和树突棘密度的增加。 | 首次揭示了认知挑战通过诱导局部低氧，触发神经元EPO/EPOR表达，进而促进神经可塑性和神经发生的机制。 | 研究主要依赖于动物模型，需要进一步的人体临床试验验证。 | 探讨EPO在脑部的作用机制及其对认知功能的改善效果。 | EPO在脑部的表达及其对神经可塑性和神经发生的影响。 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 使用新型报告鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Time-lapse single-cell transcriptomics reveals modulation of histone H3 for dormancy breaking in fission yeast
2020-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15060-y
PMID:32152323
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研究论文 | 本研究开发了一种方法，用于从正在进行萌发的单个非同步分生酵母孢子中组装转录组，以评估萌发过程中随时间的转录组变化 | 本研究首次揭示了在萌发初期，组蛋白H3基因的转录波动对孢子萌发的重要性 | 本研究缺乏同步萌发大量孢子的方法，因此分析萌发时的基因表达仍具有挑战性 | 探讨休眠细胞如何打破休眠的关键问题 | 分生酵母的休眠孢子 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 单个非同步分生酵母孢子 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Long-lived T follicular helper cells retain plasticity and help sustain humoral immunity
2020-03-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aay5552
PMID:32144185
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研究论文 | 本文探讨了长寿的T滤泡辅助细胞（T）在维持体液免疫中的作用及其生物学特性 | 首次揭示了T细胞在组织分离过程中易受NAD诱导的细胞死亡影响，以及长寿T细胞在转录和代谢上的独特性 | NA | 研究长寿T细胞的生物学特性和其在体液免疫中的作用 | 长寿T滤泡辅助细胞及其在免疫反应中的功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 至少400天后的感染样本 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Foxp1-Driven Mechanisms Essential for Striatal Development
2020-03-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.030
PMID:32130906
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research paper | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了Foxp1转录因子在小鼠纹状体发育中的细胞类型特异性调控机制 | 首次揭示了Foxp1在单细胞水平上调控纹状体细胞组成、神经化学结构和连接性的机制，并关联到FOXP1功能缺失突变患者的表型 | NA | 探究Foxp1在纹状体发育中的转录调控机制及其对功能和行为的影响 | 小鼠纹状体的单细胞和Foxp1调控的靶基因 | digital pathology | autism | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis software providers scramble to offer solutions
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0449-8
PMID:32152578
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Epithelial Planar Bipolarity Emerges from Notch-Mediated Asymmetric Inhibition of Emx2
2020-03-23, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2020.01.027
PMID:32109392
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、扩散伪时间分析、谱系追踪和突变分析，揭示了表皮细胞平面双极性起源于Notch介导的Emx2不对称抑制的机制 | 首次揭示了表皮细胞平面双极性形成的初始对称性破坏步骤，并阐明了Emx2不对称表达的机制 | NA | 探究表皮细胞平面双极性的形成机制 | 斑马鱼神经毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Sonoselective transfection of cerebral vasculature without blood-brain barrier disruption
2020-03-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914595117
PMID:32123081
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研究论文 | 本文介绍了一种在不影响血脑屏障的情况下，通过磁共振成像引导的聚焦超声方法实现脑部血管内皮细胞选择性转染的技术 | 首次实现了在不影响血脑屏障的情况下，通过低压脉冲1.1-MHz聚焦超声激活携带阳离子质粒的微泡，实现脑部血管内皮细胞的选择性基因传递 | NA | 开发一种非侵入性治疗手段，实现特定脑区域内皮细胞选择性基因表达，以改善脑部病理状况的治疗 | 脑部血管内皮细胞 | 生物医学工程 | NA | 聚焦超声 (FUS), 微泡 (MBs), 磁共振成像 (MRI) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
The Molecular Anatomy of Mouse Skin during Hair Growth and Rest
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.01.012
PMID:32109378
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和单分子RNA荧光原位杂交技术，构建了小鼠皮肤在毛发生长和休息期的系统分子图谱，确定了56种细胞类型和状态的基因表达谱及其空间位置。 | 研究揭示了外根鞘（ORS）和内毛囊层如何协调毛发生产，并发现了ORS由两种转录上不同的细胞类型组成，这些细胞类型具有不同的基质细胞类型相互作用能力。 | NA | 旨在深入理解皮肤稳态的分子机制，特别是在毛发生长和休息期间。 | 小鼠皮肤在毛发生长和休息期间的细胞类型和状态。 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing, single-molecule RNA FISH | NA | 基因表达数据 | 56种细胞类型和状态 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Embracing the dropouts in single-cell RNA-seq analysis
2020-03-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-14976-9
PMID:32127540
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序分析中的dropout现象，并提出了一种基于dropout模式的共现聚类算法 | 本文创新地将dropout视为有用信号而非问题，并提出了一种新的聚类算法来基于dropout模式对细胞进行聚类 | NA | 探索dropout在单细胞RNA测序分析中的应用，并开发新的计算算法 | 单细胞RNA测序数据中的dropout现象 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | 多个已发表数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Peripheral T cell expansion predicts tumour infiltration and clinical response
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2056-8
PMID:32103181
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研究论文 | 本文通过深度单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了不同类型癌症患者肿瘤、正常邻近组织和外周血中T细胞和T细胞受体的分布情况 | 首次揭示了效应样T细胞的克隆型扩张不仅在肿瘤内，还在正常邻近组织中，并且这种扩张与患者对PD-L1抑制剂的反应相关 | 文章未明确提及 | 探究T细胞在肿瘤免疫中的起源和命运，以及其与癌症治疗反应的关系 | 不同类型癌症患者的T细胞和T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同类型癌症患者 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of blood reveals a natural killer cell subset depletion in tuberculosis
2020-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2020.102686
PMID:32114394
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了健康对照组、潜伏性结核感染和活动性结核患者的外周血单个核细胞，揭示了结核感染中自然杀伤细胞亚群的逐渐减少 | 发现了结核感染中自然杀伤细胞亚群CD3-CD7+GZMB+的减少，并验证了其在结核病诊断中的潜在价值 | NA | 探究结核感染中免疫细胞亚群的变化及其作为生物标志物的可能性 | 健康对照组、潜伏性结核感染和活动性结核患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照组、潜伏性结核感染和活动性结核患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Unraveling the Architecture of Classic Hodgkin Lymphoma One Cell at a Time
2020-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-1538
PMID:32127404
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研究论文 | Aoki及其同事利用单细胞RNA测序和成像质谱流式技术，描述了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）中存在的反应性非恶性免疫细胞群，并描绘了它们与恶性霍奇金-里德-斯特恩伯格细胞的空间接近性 | 研究首次识别出在MHC-II阴性cHL中占主导地位的LAG3表达的Tr1型Treg细胞群，暗示了MHC-II阴性和MHC-II阳性cHL对免疫治疗反应差异的潜在功能关系 | NA | 揭示经典霍奇金淋巴瘤中免疫细胞群的组成及其与恶性细胞的空间关系 | 经典霍奇金淋巴瘤中的免疫细胞群及其与恶性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，成像质谱流式技术 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Size-Dependent Effects of Polystyrene Microplastics on Immune and Secretory Cell Populations from Zebrafish Intestines
2020-03-17, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.9b06386
PMID:32092251
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨了聚苯乙烯微塑料对斑马鱼肠道细胞群体的大小依赖性影响 | 首次揭示了不同大小的聚苯乙烯微塑料对斑马鱼肠道免疫细胞和分泌细胞的具体影响，并发现了这些微塑料与肠道微生物群变化的关联 | 研究仅限于斑马鱼，且样本仅包括暴露于三种不同大小微塑料的肠道细胞 | 深入理解聚苯乙烯微塑料对斑马鱼肠道细胞群体的大小依赖性影响及其与肠道微生物群的相互作用 | 斑马鱼肠道细胞及肠道微生物群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 12,000个来自暴露于100 nm、5 μm和200 μm聚苯乙烯微塑料21天的斑马鱼肠道细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
High-Resolution Dissection of Chemical Reprogramming from Mouse Embryonic Fibroblasts into Fibrocartilaginous Cells
2020-03-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.01.013
PMID:32084387
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研究论文 | 本文通过化学混合物VCRTc在小鼠胚胎成纤维细胞中直接重编程为PRG4+软骨细胞，并研究了这一过程中的细胞转录组变化及其在体内的修复效果 | 首次使用化学方法直接将小鼠胚胎成纤维细胞重编程为软骨细胞，并展示了其在体内修复关节表面的效果 | NA | 探索通过化学重编程方法生成软骨细胞的可行性及其在关节损伤修复中的应用 | 小鼠胚胎成纤维细胞和化学诱导的软骨细胞 | 细胞生物学 | 关节疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Ascl2-Dependent Cell Dedifferentiation Drives Regeneration of Ablated Intestinal Stem Cells
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.12.011
PMID:32084390
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研究论文 | 研究探讨了肠道干细胞（ISCs）在LGR5干细胞被清除后通过细胞去分化进行再生的机制 | 揭示了ASCL2依赖的去分化过程在肠道干细胞再生中的关键作用，并通过单细胞RNA测序分析了去分化的转录路径 | NA | 研究肠道干细胞在清除后的再生机制 | 肠道干细胞及其再生过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |