单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 114 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Foxp1-Driven Mechanisms Essential for Striatal Development
2020-03-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.030
PMID:32130906
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research paper | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了Foxp1转录因子在小鼠纹状体发育中的细胞类型特异性调控机制 | 首次揭示了Foxp1在单细胞水平上调控纹状体细胞组成、神经化学结构和连接性的机制，并关联到FOXP1功能缺失突变患者的表型 | NA | 探究Foxp1在纹状体发育中的转录调控机制及其对功能和行为的影响 | 小鼠纹状体的单细胞和Foxp1调控的靶基因 | digital pathology | autism | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Single-cell and spatial transcriptomics reveal somitogenesis in gastruloids
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2113-3
PMID:32132714
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis software providers scramble to offer solutions
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0449-8
PMID:32152578
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Epithelial Planar Bipolarity Emerges from Notch-Mediated Asymmetric Inhibition of Emx2
2020-03-23, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2020.01.027
PMID:32109392
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、扩散伪时间分析、谱系追踪和突变分析，揭示了表皮细胞平面双极性起源于Notch介导的Emx2不对称抑制的机制 | 首次揭示了表皮细胞平面双极性形成的初始对称性破坏步骤，并阐明了Emx2不对称表达的机制 | NA | 探究表皮细胞平面双极性的形成机制 | 斑马鱼神经毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
Sonoselective transfection of cerebral vasculature without blood-brain barrier disruption
2020-03-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914595117
PMID:32123081
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研究论文 | 本文介绍了一种在不影响血脑屏障的情况下，通过磁共振成像引导的聚焦超声方法实现脑部血管内皮细胞选择性转染的技术 | 首次实现了在不影响血脑屏障的情况下，通过低压脉冲1.1-MHz聚焦超声激活携带阳离子质粒的微泡，实现脑部血管内皮细胞的选择性基因传递 | NA | 开发一种非侵入性治疗手段，实现特定脑区域内皮细胞选择性基因表达，以改善脑部病理状况的治疗 | 脑部血管内皮细胞 | 生物医学工程 | NA | 聚焦超声 (FUS), 微泡 (MBs), 磁共振成像 (MRI) | NA | RNA测序数据 | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
The Molecular Anatomy of Mouse Skin during Hair Growth and Rest
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.01.012
PMID:32109378
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序和单分子RNA荧光原位杂交技术，构建了小鼠皮肤在毛发生长和休息期的系统分子图谱，确定了56种细胞类型和状态的基因表达谱及其空间位置。 | 研究揭示了外根鞘（ORS）和内毛囊层如何协调毛发生产，并发现了ORS由两种转录上不同的细胞类型组成，这些细胞类型具有不同的基质细胞类型相互作用能力。 | NA | 旨在深入理解皮肤稳态的分子机制，特别是在毛发生长和休息期间。 | 小鼠皮肤在毛发生长和休息期间的细胞类型和状态。 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing, single-molecule RNA FISH | NA | 基因表达数据 | 56种细胞类型和状态 |
| 67 | 2024-08-09 |
Embracing the dropouts in single-cell RNA-seq analysis
2020-03-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-14976-9
PMID:32127540
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序分析中的dropout现象，并提出了一种基于dropout模式的共现聚类算法 | 本文创新地将dropout视为有用信号而非问题，并提出了一种新的聚类算法来基于dropout模式对细胞进行聚类 | NA | 探索dropout在单细胞RNA测序分析中的应用，并开发新的计算算法 | 单细胞RNA测序数据中的dropout现象 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | 基因表达数据 | 多个已发表数据集 |
| 68 | 2024-08-09 |
Peripheral T cell expansion predicts tumour infiltration and clinical response
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2056-8
PMID:32103181
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研究论文 | 本文通过深度单细胞RNA测序和T细胞受体测序，研究了不同类型癌症患者肿瘤、正常邻近组织和外周血中T细胞和T细胞受体的分布情况 | 首次揭示了效应样T细胞的克隆型扩张不仅在肿瘤内，还在正常邻近组织中，并且这种扩张与患者对PD-L1抑制剂的反应相关 | 文章未明确提及 | 探究T细胞在肿瘤免疫中的起源和命运，以及其与癌症治疗反应的关系 | 不同类型癌症患者的T细胞和T细胞受体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同类型癌症患者 |
| 69 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of blood reveals a natural killer cell subset depletion in tuberculosis
2020-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2020.102686
PMID:32114394
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了健康对照组、潜伏性结核感染和活动性结核患者的外周血单个核细胞，揭示了结核感染中自然杀伤细胞亚群的逐渐减少 | 发现了结核感染中自然杀伤细胞亚群CD3-CD7+GZMB+的减少，并验证了其在结核病诊断中的潜在价值 | NA | 探究结核感染中免疫细胞亚群的变化及其作为生物标志物的可能性 | 健康对照组、潜伏性结核感染和活动性结核患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康对照组、潜伏性结核感染和活动性结核患者的样本 |
| 70 | 2024-08-09 |
Unraveling the Architecture of Classic Hodgkin Lymphoma One Cell at a Time
2020-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-1538
PMID:32127404
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研究论文 | Aoki及其同事利用单细胞RNA测序和成像质谱流式技术，描述了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）中存在的反应性非恶性免疫细胞群，并描绘了它们与恶性霍奇金-里德-斯特恩伯格细胞的空间接近性 | 研究首次识别出在MHC-II阴性cHL中占主导地位的LAG3表达的Tr1型Treg细胞群，暗示了MHC-II阴性和MHC-II阳性cHL对免疫治疗反应差异的潜在功能关系 | NA | 揭示经典霍奇金淋巴瘤中免疫细胞群的组成及其与恶性细胞的空间关系 | 经典霍奇金淋巴瘤中的免疫细胞群及其与恶性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，成像质谱流式技术 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 71 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Size-Dependent Effects of Polystyrene Microplastics on Immune and Secretory Cell Populations from Zebrafish Intestines
2020-03-17, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.9b06386
PMID:32092251
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨了聚苯乙烯微塑料对斑马鱼肠道细胞群体的大小依赖性影响 | 首次揭示了不同大小的聚苯乙烯微塑料对斑马鱼肠道免疫细胞和分泌细胞的具体影响，并发现了这些微塑料与肠道微生物群变化的关联 | 研究仅限于斑马鱼，且样本仅包括暴露于三种不同大小微塑料的肠道细胞 | 深入理解聚苯乙烯微塑料对斑马鱼肠道细胞群体的大小依赖性影响及其与肠道微生物群的相互作用 | 斑马鱼肠道细胞及肠道微生物群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 12,000个来自暴露于100 nm、5 μm和200 μm聚苯乙烯微塑料21天的斑马鱼肠道细胞 |
| 72 | 2024-08-09 |
High-Resolution Dissection of Chemical Reprogramming from Mouse Embryonic Fibroblasts into Fibrocartilaginous Cells
2020-03-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.01.013
PMID:32084387
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研究论文 | 本文通过化学混合物VCRTc在小鼠胚胎成纤维细胞中直接重编程为PRG4+软骨细胞，并研究了这一过程中的细胞转录组变化及其在体内的修复效果 | 首次使用化学方法直接将小鼠胚胎成纤维细胞重编程为软骨细胞，并展示了其在体内修复关节表面的效果 | NA | 探索通过化学重编程方法生成软骨细胞的可行性及其在关节损伤修复中的应用 | 小鼠胚胎成纤维细胞和化学诱导的软骨细胞 | 细胞生物学 | 关节疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
Interferon lambda promotes immune dysregulation and tissue inflammation in TLR7-induced lupus
2020-03-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916897117
PMID:32094169
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研究论文 | 本文探讨了III型干扰素λ（IFN-λ）在TLR7诱导的狼疮中的作用，发现IFN-λ在免疫失调和组织炎症中扮演重要角色。 | 首次揭示了IFN-λ在TLR7诱导的狼疮中的非冗余作用，并阐明了其通过激活角质形成细胞和肾小球系膜细胞促进组织炎症的机制。 | NA | 研究IFN-λ在系统性红斑狼疮（SLE）中的作用及其对免疫反应的影响。 | 小鼠和人类的免疫细胞及组织。 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠脾脏和人类外周血样本 |
| 74 | 2024-08-09 |
Functional Heterogeneity within the Developing Zebrafish Epicardium
2020-03-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.01.023
PMID:32084358
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research paper | 本研究探讨了斑马鱼心脏发育过程中心外膜的异质性和不同心外膜亚群的功能多样性 | 通过单细胞RNA测序揭示了三个具有特定遗传程序和独特空间分布的心外膜亚群，并揭示了每个亚群的特定功能 | NA | 深入了解心外膜细胞在心脏发育中如何建立功能性心外膜及其与其他心血管细胞类型的交流机制 | 斑马鱼心脏发育中的心外膜及其亚群 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Ascl2-Dependent Cell Dedifferentiation Drives Regeneration of Ablated Intestinal Stem Cells
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.12.011
PMID:32084390
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研究论文 | 研究探讨了肠道干细胞（ISCs）在LGR5干细胞被清除后通过细胞去分化进行再生的机制 | 揭示了ASCL2依赖的去分化过程在肠道干细胞再生中的关键作用，并通过单细胞RNA测序分析了去分化的转录路径 | NA | 研究肠道干细胞在清除后的再生机制 | 肠道干细胞及其再生过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Distinct Mesenchymal Cell Populations Generate the Essential Intestinal BMP Signaling Gradient
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.01.008
PMID:32084389
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研究论文 | 本研究通过结合全装高分辨率显微镜与集合和单细胞RNA测序，识别了三种不同的PDGFRA间质细胞类型，揭示了它们在肠道BMP信号梯度形成中的作用 | 首次详细描述了肠道间质细胞的精细解剖、分子和功能细节，以及这些细胞在组织自我更新所需的信号梯度中的细胞基础 | NA | 揭示肠道间质细胞结构及其在组织自我更新中的作用 | 肠道间质细胞及其在BMP信号梯度中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Functionally distinct subgroups of oligodendrocyte precursor cells integrate neural activity and execute myelin formation
2020-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0581-2
PMID:32066987
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研究论文 | 本研究通过整合单个OPC克隆的谱系形成、单细胞转录组学、钙成像和神经活动调控，揭示了斑马鱼脊髓中的OPC可以分为两个功能不同的亚群 | 首次展示了OPC亚群在响应神经元方面的功能多样性，并揭示了活动对特定OPC亚群增殖的调控作用 | NA | 探讨少突胶质细胞前体细胞（OPC）的异质性是否反映了不同功能亚型的细胞 | 少突胶质细胞前体细胞（OPC）及其在斑马鱼脊髓中的功能亚群 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、钙成像 | NA | 转录组数据、钙信号数据 | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
New insights into the early mechanisms of epileptogenesis in a zebrafish model of Dravet syndrome
2020-03, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.16456
PMID:32096222
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术在斑马鱼模型中引入突变，探索Dravet综合征早期癫痫发生机制及5HT2受体激动剂芬氟拉明的潜在疾病修饰作用。 | 首次在斑马鱼模型中揭示Dravet综合征早期发病机制，并提供芬氟拉明可能的疾病修饰证据。 | NA | 确定Dravet综合征新生儿脑发育期间癫痫发作的最早细胞缺陷，并研究芬氟拉明的潜在疾病修饰活性。 | 斑马鱼模型中的Dravet综合征。 | 数字病理学 | 癫痫 | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞RNA测序 | 15个突变斑马鱼样本，16个野生型样本 |
| 79 | 2024-08-09 |
scCATCH: Automatic Annotation on Cell Types of Clusters from Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-Mar-27, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.100882
PMID:32062421
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研究论文 | 介绍了一种名为scCATCH的单细胞聚类自动注释工具，用于从单细胞RNA测序数据中自动注释细胞类型 | scCATCH通过基于证据的评分和组织特异性细胞注释策略，实现了高一致性的细胞类型注释，并优于现有的Seurat等方法 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和可重复性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在六个来自不同组织的已发表的单细胞RNA测序数据集中，scCATCH准确注释了67%-100%的聚类（平均83%） |
| 80 | 2024-08-09 |
Epithelial Vegfa Specifies a Distinct Endothelial Population in the Mouse Lung
2020-03-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.01.009
PMID:32059772
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研究论文 | 本文研究了小鼠肺部由上皮细胞VEGFA指定的一种特殊内皮细胞群体 | 首次揭示了上皮细胞VEGFA在小鼠肺部指定一种特殊内皮细胞群体中的作用 | NA | 探讨上皮细胞VEGFA在小鼠肺部内皮细胞分化中的作用 | 小鼠肺部的内皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 约15%的肺部内皮细胞 |