单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 114 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-09 |
Bayesian correlation is a robust gene similarity measure for single-cell RNA-seq data
2020-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa002
PMID:33575552
|
研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据中使用贝叶斯相关性作为基因相似性度量的鲁棒性 | 提出了一种贝叶斯相关性方案，该方案通过考虑低置信度表达估计的基因来扩展其在单细胞RNA测序数据中的应用 | NA | 旨在扩展贝叶斯相关性在单细胞RNA测序数据中的应用，通过三种方式计算相似性 | 单细胞RNA测序数据中的基因相似性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 贝叶斯相关性算法 | 基因表达数据 | 涉及多个细胞和基因对 | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-09 |
Profiling APOL1 Nephropathy Risk Variants in Genome-Edited Kidney Organoids with Single-Cell Transcriptomics
2020-Mar, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/kid.0000422019
PMID:32656538
|
研究论文 | 本文利用单细胞转录组测序技术研究了APOL1基因风险变异在基因编辑的人类肾脏类器官中的表达及其对不同肾单位细胞类型的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了APOL1风险变异在人类基因编辑肾脏类器官中的细胞特异性表达差异 | NA | 研究APOL1基因风险变异在肾脏疾病中的病理生理机制 | APOL1基因风险变异在基因编辑的人类肾脏类器官中的表达及其对不同肾单位细胞类型的影响 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CRISPR-Cas9 | 转录组数据 | 包含肾单位样结构的肾脏类器官，包括肾小球上皮细胞、近端小管、远端小管和内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-09 |
Cortical Neural Stem Cell Lineage Progression Is Regulated by Extrinsic Signaling Molecule Sonic Hedgehog
2020-03-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.027
PMID:32234482
|
研究论文 | 本文探讨了皮质神经干细胞系的分化进程及其受外部信号分子Sonic Hedgehog调控的分子机制 | 首次证明了Sonic Hedgehog信号对于GSX2表达的中间祖细胞（IPCs）的生成是必要且充分的，并使用单细胞RNA测序揭示了GSX2 IPCs的转录组特征 | NA | 揭示皮质神经干细胞系分化的分子机制 | 皮质神经干细胞及其分化产物 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及E16.5时期的鼠皮质神经干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-09 |
Network-Based Single-Cell RNA-Seq Data Imputation Enhances Cell Type Identification
2020-03-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11040377
PMID:32244427
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于网络的单细胞RNA测序数据插补方法netImpute，通过利用基因共表达网络中的隐藏信息来恢复真实信号，以改善细胞类型识别 | netImpute采用随机游走重启（RWR）技术，通过从基因共表达网络中的邻居借用信息来调整给定细胞的基因表达水平，有效处理了数据中的缺失值问题 | 虽然netImpute的概念通用，可以应用于其他类型的网络，如细胞共表达网络或蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，但评估结果显示基因共表达网络始终更有益，而PPI网络通常缺乏细胞类型上下文，细胞共表达网络可能导致稀有细胞类型的信息丢失 | 旨在通过网络方法改善单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机游走重启（RWR） | 基因表达数据 | 七个真实数据集和模拟数据 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-09 |
Dimension Reduction and Clustering Models for Single-Cell RNA Sequencing Data: A Comparative Study
2020-Mar-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21062181
PMID:32235704
|
研究论文 | 本文对单细胞RNA测序数据进行了维度降低和聚类模型的比较研究 | 引入了几种维度降低方法和聚类模型，并通过实验验证了它们在处理高维和稀疏单细胞RNA测序数据中的有效性 | 文章指出独立成分分析在模糊C均值聚类中表现不佳 | 验证一种可靠和标准的研究流程，并对不同的维度降低方法和聚类模型进行综合评估 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | K均值聚类 | 基因表达数据 | 两个大型单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-09 |
Integrative differential expression and gene set enrichment analysis using summary statistics for scRNA-seq studies
2020-03-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15298-6
PMID:32221292
|
研究论文 | 本文开发了一种名为iDEA的集成计算方法，通过分层贝叶斯框架联合执行差异表达（DE）和基因集富集（GSE）分析，适用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究 | iDEA方法通过集成DE和GSE分析，提高了DE分析的效力和一致性以及GSE分析的准确性，并且仅使用DE汇总统计数据作为输入，便于与现有DE方法互补和配对 | NA | 开发一种集成且可扩展的计算方法，用于在scRNA-seq研究中联合进行差异表达和基因集富集分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分层贝叶斯框架 | 汇总统计数据 | 分析了三个scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-09 |
Acute kidney injury promotes development of papillary renal cell adenoma and carcinoma from renal progenitor cells
2020-03-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaw6003
PMID:32213630
|
研究论文 | 本文研究了急性肾损伤（AKI）如何促进肾前体细胞发展为乳头状肾细胞腺瘤和癌 | 首次展示了AKI如何通过增加细胞有丝分裂和多倍体化，以及NOTCH1过表达，促进乳头状肾细胞癌的发展和复发 | 研究主要基于小鼠模型和人类细胞培养，可能需要更多临床数据验证 | 探讨急性肾损伤对乳头状肾细胞癌发展的影响及其分子机制 | 急性肾损伤后的肾前体细胞和乳头状肾细胞癌 | NA | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单中心和多中心研究的数据，以及小鼠和人类细胞培养样本 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-09 |
Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network Underlying Gastric Premalignant Lesions and Early Gastric Cancer
2020-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.020
PMID:32209487
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing and its application in breast cancer
2020-Mar-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.19-268
PMID:32217511
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在乳腺癌研究中的应用 | 单细胞测序技术能够分析转录组，探索细胞组成、分化和命运，精细绘制肿瘤微环境，为精准分层和个性化治疗提供支持 | 传统的高通量测序在描述基因组结构改变和亚克隆进化方面存在不足，忽视了肿瘤内、肿瘤间或患者间的异质性 | 旨在解码肿瘤与其微环境在单细胞水平上的多方面相互作用变化，为更好地理解复杂的发病机制和新的免疫治疗途径提供基础 | 乳腺癌及其微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-09 |
Applications of single-cell RNA sequencing in virology
2020-Mar-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.19-223
PMID:32217512
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在病毒学中的应用及其研究进展 | scRNA-seq技术能够揭示病毒感染过程中细胞异质性的影响，以及病毒与宿主细胞间复杂的相互作用 | NA | 旨在为理解病毒感染和致病机制提供参考，并可能促进潜在抗病毒靶点的开发 | 病毒感染及其与宿主细胞的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-09 |
Long-Term Expansion of Pancreatic Islet Organoids from Resident Procr+ Progenitors
2020-03-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.02.048
PMID:32200801
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术发现了一种新的Procr阳性细胞群，这些细胞在成年小鼠胰腺胰岛中存在，并能形成胰岛样类器官，具有功能性β细胞的特性 | 首次发现并描述了成年小鼠胰腺中的一种新的Procr阳性细胞群，这些细胞能够形成功能性胰岛样类器官 | NA | 探索成年小鼠胰腺中Procr阳性细胞群的特性和功能 | 成年小鼠胰腺中的Procr阳性细胞群及其形成的胰岛样类器官 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约占胰岛细胞1%的Procr细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-09 |
Finding cell-specific expression patterns in the early Ciona embryo with single-cell RNA-seq
2020-03-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-61591-1
PMID:32188910
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了海鞘胚胎16细胞阶段的细胞特异性基因表达模式 | 成功发现了新的细胞特异性表达模式，并通过原位杂交和单细胞qPCR进行了验证 | NA | 探索和表征控制发育过程的基因及其表达模式 | 海鞘胚胎的细胞特异性基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 16细胞阶段的海鞘胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-09 |
Loss of the branched-chain amino acid transporter CD98hc alters the development of colonic macrophages in mice
2020-03-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0842-3
PMID:32188932
|
研究论文 | 本研究通过构建CD98hc分支链氨基酸转运蛋白在CX3CR1巨噬细胞中的可诱导敲除小鼠模型，探讨了分支链氨基酸在肠道巨噬细胞发育中的作用 | 首次揭示了CD98hc缺失对结肠巨噬细胞发育的影响，并通过单细胞RNA测序分析了其对巨噬细胞发育途径的改变 | NA | 探究分支链氨基酸转运蛋白CD98hc在结肠巨噬细胞发育中的功能 | 结肠巨噬细胞的发育 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-09 |
Defining Epidermal Basal Cell States during Skin Homeostasis and Wound Healing Using Single-Cell Transcriptomics
2020-03-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.02.091
PMID:32187560
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合RNAScope和荧光寿命成像技术，揭示了表皮基底细胞在皮肤稳态和伤口愈合过程中的转录异质性 | 首次全面解析了基底细胞在分化过程中的动态变化，并提出了一个修订的“层次-谱系”稳态模型 | NA | 研究表皮基底细胞在皮肤稳态和伤口愈合中的转录异质性 | 表皮基底细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-09 |
Recent Advances in Practical Methods for Liver Cell Biology: A Short Overview
2020-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21062027
PMID:32188134
|
综述 | 本文详细介绍了在第8届欧洲肝脏细胞生物学俱乐部会议（ECLCB-8）上提出的用于研究肝脏细胞生物学的新型体外和体内方法 | 利用先进技术改进细胞分离技术，实现高纯度细胞分离，并推动2D和3D显微镜及高通量检测方法（如批量或单细胞RNA测序）的发展 | NA | 旨在详细描述用于研究肝脏细胞生物学的新方法 | 肝脏病理学、干细胞和类器官研究、肝脏疾病的体内评估 | NA | 肝脏疾病 | RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-09 |
Comparative Molecular Analysis of Cancer Behavior Cultured In Vitro, In Vivo, and Ex Vivo
2020-Mar-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030690
PMID:32183351
|
研究论文 | 本研究通过比较4T1小鼠乳腺癌细胞在2D和3D培养、皮下或原位同种移植（来自免疫健全或免疫缺陷小鼠）以及体外肿瘤体中的转录组谱，揭示了分子特征的差异 | 本研究首次综合比较了癌细胞在不同培养条件下的分子特征，特别是细胞周期进展、细胞信号传导和细胞外基质重塑相关基因的表达差异 | 研究主要集中在小鼠乳腺癌细胞，可能不完全适用于其他类型的癌细胞或人体细胞 | 旨在通过比较不同培养条件下的癌细胞行为，提高体外培养系统的模拟能力 | 4T1小鼠乳腺癌细胞在不同培养条件下的转录组谱 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及多种培养条件和不同免疫状态的小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis
2020-03-12, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cphy.c190037
PMID:32163201
|
研究论文 | 本文介绍了单细胞转录组测序的商业平台、数据分析流程、数据库以及在生物医学研究中的应用 | 单细胞测序技术的最新进展为生物医学研究提供了深入了解多种生物过程的见解 | NA | 介绍和描述单细胞RNA测序的商业平台及其在生物医学研究中的应用 | 单细胞测序技术及其在生物学和医学中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-09 |
Cell Lysis Based on an Oscillating Microbubble Array
2020-Mar-10, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi11030288
PMID:32164279
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于振荡微泡阵列的细胞裂解方法 | 利用振荡微泡产生的剪切应力实现多次细胞裂解，提高了裂解效率 | NA | 开发一种高效、快速的细胞裂解设备，用于细胞生物学研究、疾病诊断和干细胞治疗 | 细胞裂解及其释放的DNA、RNA和蛋白质等细胞内物质 | 生物技术 | NA | DNA琼脂糖凝胶电泳 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
Molecular Heterogeneity and Cellular Diversity: Implications for Precision Treatment in Medulloblastoma
2020-Mar-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030643
PMID:32164294
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤在分子和细胞层面的异质性，包括四个主要亚组（WNT、SHH、Group 3 和 Group 4）的组织学特征、遗传和表观遗传改变、蛋白质组学景观、起源细胞、肿瘤微环境和治疗策略 | 利用癌症基因组学、单细胞测序和复杂肿瘤模型，革命性地描述和分层了髓母细胞瘤 | NA | 探讨髓母细胞瘤的异质性及其对精准治疗的影响 | 髓母细胞瘤的分子和细胞异质性 | 数字病理学 | 儿童恶性脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 分子和细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
Expression and Localization of Kcne2 in the Vertebrate Retina
2020-03-09, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.61.3.33
PMID:32191288
|
研究论文 | 研究Kcne2在脊椎动物视网膜中的表达和定位 | 首次详细描述了Kcne2在不同物种视网膜中的保守定位模式，跨越至少3亿年的脊椎动物进化 | NA | 研究Kcne2在视网膜中的表达和定位，探讨其在细胞兴奋性调节中的重要作用 | Kcne2在视网膜中的表达和定位 | NA | NA | 单细胞转录组分析，免疫组化技术 | NA | 转录组数据，免疫组化图像 | 数万个小鼠视网膜细胞，多种脊椎动物（斑马鱼、牛鸟、绵羊、小鼠、猕猴）的视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |