本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Analysis of Dual Class I Histone Deacetylase and Lysine Demethylase Inhibitor Domatinostat (4SC-202) on Growth and Cellular and Genomic Landscape of Atypical Teratoid/Rhabdoid
2020-Mar-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030756
PMID:32210076
|
研究论文 | 研究表观遗传调节剂Domatinostat(4SC-202)对非典型畸胎样/横纹肌样瘤生长及细胞基因组景观的影响 | 首次探索双重I类组蛋白去乙酰化酶和赖氨酸去甲基化酶抑制剂Domatinostat在ATRT中的抗癌作用机制 | 目前仅为体外研究,缺乏体内实验验证 | 评估表观遗传药物对ATRT肿瘤生长的抑制作用及其机制 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤(ATRT)细胞系 | 癌症表观遗传学 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,多组学富集分析 | 2D和3D支架细胞培养模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | ATRT-06细胞球状体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Dissecting the early steps of MLL induced leukaemogenic transformation using a mouse model of AML
2020-03-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15220-0
PMID:32179751
|
研究论文 | 利用小鼠AML模型研究MLL诱导白血病转化的早期阶段 | 开发了基于明确克隆关系的MLL-r模型,能够捕获MLL-ENL表达的早期细胞和分子后果 | 人类患者和常规小鼠模型通常无法获取白血病转化的早期阶段 | 解析MLL诱导白血病转化的早期步骤 | 小鼠多能造血祖细胞 | 单细胞组学 | 白血病 | scRNA-seq, ATAC-seq, CRISPR-Cas9筛选 | 小鼠AML模型 | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals a heterogeneous response to Glucocorticoids in breast cancer cells
2020-03-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0837-0
PMID:32170217
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示乳腺癌细胞对糖皮质激素反应的异质性 | 首次在单细胞水平揭示糖皮质激素反应的细胞间异质性,发现超过100个批量RNAseq未能检测到的GR调控基因 | 仅使用单一乳腺癌细胞系进行研究,未涉及体内环境或临床样本 | 研究糖皮质激素在单细胞水平的转录反应异质性 | 人类乳腺癌细胞系 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Interferon lambda promotes immune dysregulation and tissue inflammation in TLR7-induced lupus
2020-03-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916897117
PMID:32094169
|
研究论文 | 本研究揭示了III型干扰素λ在TLR7诱导的狼疮模型中促进免疫失调和组织炎症的非冗余作用 | 首次确定了IFN-λ在自身免疫疾病狼疮中的关键作用,发现其通过激活角质形成细胞和系膜细胞诱导免疫细胞招募,而不影响自身抗体产生 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自外周血单细胞分析 | 探究III型干扰素在系统性红斑狼疮发病机制中的作用 | TLR7诱导的狼疮小鼠模型、小鼠脾脏细胞、人类外周血细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Functional Heterogeneity within the Developing Zebrafish Epicardium
2020-03-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.01.023
PMID:32084358
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼心脏发育过程中心外膜的细胞异质性和功能多样性 | 首次在斑马鱼发育心脏中发现三个具有特定遗传程序和空间分布的心外膜亚群,并揭示了它们在细胞粘附、迁移和趋化作用中的特定功能 | 研究仅限于斑马鱼发育阶段,尚未在哺乳动物或人类模型中验证 | 探究心外膜细胞异质性及其在心脏发育中的功能多样性 | 发育中的斑马鱼心脏心外膜细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Identification of region-specific astrocyte subtypes at single cell resolution
2020-03-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14198-8
PMID:32139688
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了成年小鼠前脑区域中五种转录组学上不同的星形胶质细胞亚型 | 首次在单细胞分辨率下系统识别了大脑区域特异性星形胶质细胞亚型,并揭示了其独特的空间分布模式 | 研究仅针对成年小鼠的皮层和海马区域,未涵盖其他脑区或发育阶段 | 探究前脑区域星形胶质细胞分子多样性的真实程度 | 成年小鼠大脑皮层和海马区域的星形胶质细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠大脑皮层和海马区域星形胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Re-evaluation of human BDCA-2+ DC during acute sterile skin inflammation
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190811
PMID:31845972
|
研究论文 | 重新评估急性无菌性皮肤炎症中人类BDCA-2+树突状细胞的特征和功能 | 发现了一种新型CD123intBDCA-2+CD1a+树突状细胞亚群在皮肤伤口中快速浸润,并揭示了ASDC细胞在皮肤损伤过程中的存在 | 研究主要关注急性无菌炎症模型,在慢性炎症或其他疾病条件下的适用性需进一步验证 | 重新评估人类皮肤炎症过程中BDCA-2+树突状细胞的组成和功能 | 人类皮肤伤口中的树突状细胞亚群 | 免疫学 | 皮肤炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Dynamics of human monocytes and airway macrophages during healthy aging and after transplant
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20191236
PMID:31917836
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类不同年龄段和肺移植后单核细胞与气道巨噬细胞的动态变化 | 首次系统描绘人类气道巨噬细胞在健康衰老和肺移植后的来源动态变化 | 样本量相对有限,主要基于观察性数据 | 理解人类肺中气道巨噬细胞的个体发育及其在疾病中的作用 | 健康志愿者和肺移植受者的外周血和气道单核细胞/巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖婴儿/儿童期(2-12岁)、成年期(20-50岁)和老年期(>50岁)的健康志愿者,以及性别不匹配的肺移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Titrating gene expression using libraries of systematically attenuated CRISPR guide RNAs
2020-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0387-5
PMID:31932729
|
研究论文 | 开发了一种使用CRISPR干扰和系统衰减sgRNA文库来精确调控人类基因表达水平的方法 | 利用包含错配的sgRNA系统性地调控基因表达水平,并通过深度学习推导错配sgRNA活性规则 | NA | 建立精确控制基因表达的工具,研究表达水平与表型之间的关系 | 人类基因,特别是约2,400个对细胞生长至关重要的基因 | 基因编辑 | 基因表达失调疾病 | CRISPR干扰,单细胞RNA-seq,深度学习 | 深度学习模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个细胞模型的大规模测量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Bystander IFN-γ activity promotes widespread and sustained cytokine signaling altering the tumor microenvironment
2020-03, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-0038-2
PMID:32803171
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤反应性T细胞产生的IFN-γ通过扩散和旁观者活性广泛改变肿瘤微环境的机制 | 首次证明IFN-γ可在肿瘤内远距离扩散,并通过旁观者活性介导持续的STAT1信号传导 | 人类数据主要来自单细胞RNA-seq分析,需要进一步实验验证 | 探究IFN-γ在肿瘤微环境中的时空活动模式及其功能影响 | 肿瘤反应性T细胞、肿瘤细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 活体成像、单细胞RNA测序、STAT1易位报告系统 | NA | 成像数据、基因表达数据 | 黑色素瘤患者单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Publisher Correction: Single-cell and spatial transcriptomics reveal somitogenesis in gastruloids
2020-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2113-3
PMID:32132714
|
更正 | 本文是对原论文的出版更正,可通过论文顶部链接访问 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Functionally distinct subgroups of oligodendrocyte precursor cells integrate neural activity and execute myelin formation
2020-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0581-2
PMID:32066987
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞技术揭示了少突胶质前体细胞存在功能不同的亚群 | 首次证明少突胶质前体细胞存在功能特化的稳定亚群,而非临时状态 | 研究仅基于斑马鱼脊髓模型,未验证其他物种或脑区 | 探究少突胶质前体细胞的异质性本质和功能分化 | 斑马鱼脊髓中的少突胶质前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序, 钙成像, 谱系追踪, 神经活动操控 | NA | 基因表达数据, 成像数据, 生理信号数据 | 斑马鱼脊髓少突胶质前体细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing in hematology
2020-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000613
PMID:31895120
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在血液学研究和血液恶性肿瘤研究中的最新应用与进展 | 重点介绍了通过单细胞分辨率研究髓系恶性肿瘤中干细胞/祖细胞获得的生物学新见解 | NA | 探讨单细胞测序技术在血液学研究和血液恶性肿瘤临床管理中的当前及未来应用 | 造血过程和血液恶性肿瘤,特别是髓系恶性肿瘤中的干细胞/祖细胞 | 单细胞组学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | RNA、DNA、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞DNA测序,单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Understanding the complexity of retina and pluripotent stem cell derived retinal organoids with single cell RNA sequencing: current progress, remaining challenges and future prospective
2020-03, Current eye research
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/02713683.2019.1697453
PMID:31794277
|
综述 | 综述单细胞RNA测序技术在视网膜和视网膜类器官研究中的应用进展、挑战与未来展望 | 系统比较视网膜组织与干细胞衍生视网膜类器官的单细胞转录组数据,揭示细胞类型亚群特征和地理差异 | 技术一致性有待提高,尚未完全解析所有视网膜细胞类型的复杂性、功能性和相互作用 | 探讨单细胞测序技术在视网膜研究中的应用价值与发展前景 | 视网膜组织和多能干细胞衍生的视网膜类器官 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Commensal microbiota drive the functional diversification of colon macrophages
2020-03, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-019-0228-3
PMID:31772323
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肠道菌群对结肠巨噬细胞功能多样化的驱动作用 | 首次在分子水平揭示肠道菌群通过调控转录程序驱动结肠巨噬细胞发育轨迹和功能分化 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型,未验证其他物种或人类样本 | 探究肠道菌群对结肠髓系细胞发育和功能分化的影响 | 无特定病原体(SPF)和无菌(GF) C57BL/6小鼠的结肠髓系细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据 | SPF和GF C57BL/6小鼠结肠髓系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Transcriptional dynamics of pluripotent stem cell-derived endothelial cell differentiation revealed by single-cell RNA sequencing
2020-03-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz351
PMID:31242503
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示多能干细胞分化为内皮细胞的转录动态过程 | 首次使用单细胞RNA测序技术绘制人多能干细胞向内皮细胞定向分化的转录景观和细胞动态过程,发现了新的转录特征 | 研究仅使用人类胚胎干细胞系,未涵盖其他类型的多能干细胞 | 解析多能干细胞向内皮细胞分化的分子机制和转录动态 | 人类胚胎干细胞及其分化的内皮细胞产物 | 单细胞组学 | 缺血性血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 105,727个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies meniscus progenitors and reveals the progression of meniscus degeneration
2020-03, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2019-215926
PMID:31871141
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定半月板祖细胞并揭示半月板退变进程 | 首次在人类半月板中发现两个新型细胞群体,鉴定出具有祖细胞特征的退化半月板特异性细胞簇,揭示了FCP向DegP分化的异常过程 | 研究样本量有限,主要基于体外实验和计算分析,需要进一步体内验证 | 阐明半月板细胞异质性及半月板退变机制 | 健康人类和退变半月板细胞 | 单细胞生物学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2024-12-14 |
STAT3 signaling in myeloid cells promotes pathogenic myelin-specific T cell differentiation and autoimmune demyelination
2020-03-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1913997117
PMID:32094172
|
研究论文 | 研究揭示了STAT3信号在髓系细胞中对病理性髓鞘特异性T细胞分化和自身免疫性脱髓鞘的促进作用 | 首次发现髓系细胞中的STAT3信号对髓鞘反应性T细胞的激活至关重要,并提出髓系STAT3作为自身免疫性脱髓鞘疾病的潜在治疗靶点 | NA | 探讨STAT3信号在髓系细胞中对多发性硬化症(MS)发病机制的影响 | 髓系细胞、髓鞘特异性T细胞、实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE) | NA | 多发性硬化症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 野生型和突变型小鼠的髓系细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-11-29 |
Transcriptional diversity and bioenergetic shift in human breast cancer metastasis revealed by single-cell RNA sequencing
2020-03, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0477-0
PMID:32144411
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和患者来源的异种移植模型,揭示了乳腺癌转移过程中罕见的转移细胞在播种过程中的全局转录组变化 | 本文建立了识别转移细胞播种过程中全局转录组变化的稳健方法,并发现微转移灶具有一种跨患者来源异种移植模型保守的转录组程序,这与患者的不良生存高度相关 | NA | 揭示乳腺癌转移过程中罕见的转移细胞在播种过程中的全局转录组变化 | 乳腺癌转移细胞的转录组变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者来源的异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of RORα tracer mouse lung reveals ILC progenitors and effector ILC2 subsets
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20182293
PMID:31816636
|
研究论文 | 本研究通过生成RORα谱系示踪小鼠并进行单细胞RNA测序、流式细胞术和功能分析,揭示了肺部ILC2的发育路径 | 发现了不同于传统IL-18Rα-ST2+ ILC2s的IL-18Rα+ST2-群体,并识别出新生儿肺部中的三种ILC群体 | NA | 阐明肺部ILC2的发育路径 | 肺部ILC2及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年和新生儿小鼠肺部样本 | NA | NA | NA | NA |