单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 105 篇文献，本页显示第 101 - 105 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
Tissue-specific deconvolution of immune cell composition by integrating bulk and single-cell transcriptomes
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz672
PMID:31504185
|
研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞转录组数据，开发了一种针对特定组织的免疫细胞组成反卷积方法 | 使用来自不同小鼠组织的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据生成特定组织的特征基因矩阵，以提高反卷积模型的准确性 | NA | 提高从组织转录组估计免疫细胞组成的准确性 | 特定组织的免疫细胞组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 反卷积模型 | 转录组数据 | 来自不同小鼠组织的免疫细胞 |
| 102 | 2024-08-09 |
scHinter: imputing dropout events for single-cell RNA-seq data with limited sample size
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz627
PMID:31392316
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研究论文 | 提出了一种名为scHinter的方法，用于在小样本量的单细胞RNA测序数据中填补丢失事件 | scHinter采用基于投票的集成距离和合成少数过采样技术进行随机插值，并嵌入了分层框架以提高小样本的填补可靠性 | NA | 开发新的填补方法，提高对不同样本量数据的通用性 | 单细胞RNA测序数据中的丢失事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小样本量 |
| 103 | 2024-08-09 |
Using multiple measurements of tissue to estimate subject- and cell-type-specific gene expression
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz619
PMID:31400192
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研究论文 | 本文开发了一种基于经验贝叶斯方法，利用多个组织测量数据来估计个体和细胞类型特异性基因表达的方法 | 提出了一种新的方法来整合组织水平的基因表达数据和单细胞RNA测序数据，以估计个体和细胞类型特异性的基因表达 | 单细胞RNA测序数据可能存在噪声，并且通常来自少数个体 | 开发一种方法来估计个体和细胞类型特异性的基因表达，并应用于识别基因表达数量性状位点 | 基因表达数据，特别是来自多个脑区的数据 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序 | 经验贝叶斯方法 | 基因表达数据 | 数千个个体 |
| 104 | 2024-08-09 |
Alternating EM algorithm for a bilinear model in isoform quantification from RNA-seq data
2020-02-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz640
PMID:31400221
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研究论文 | 本文介绍了一种名为XAEM的新方法，用于从RNA-seq数据中进行isoform水平的基因表达估计，该方法基于一个更灵活和稳健的统计模型，并使用交替期望最大化（AEM）算法进行实现 | XAEM方法考虑了Xβ作为一个双线性模型，其中X和β都是未知的，并通过多样本RNA-seq数据的联合分析进行联合估计，自动执行潜在未知偏差的经验校正 | NA | 开发一种新的方法来提高从RNA-seq数据中估计isoform水平基因表达的准确性 | RNA-seq数据中的isoform水平基因表达 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 双线性模型 | RNA-seq数据 | 多样本RNA-seq数据 |
| 105 | 2024-08-09 |
Kidney and organoid single-cell transcriptomics: the end of the beginning
2020-02, Pediatric nephrology (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00467-018-4177-y
PMID:30607565
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肾脏发育和疾病中的应用及其最新进展 | 揭示了细胞间未预见的细胞谱系关系，定义了肾脏类器官中非目标细胞类型的存在，并展示了人类肾脏同种异体移植中多样化的炎症反应 | NA | 总结单细胞RNA测序技术在肾脏领域的快速进展，并概述其未来发展方向 | 肾脏类器官、发育中的小鼠和人类肾脏、成年肾脏及肾脏癌 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个scRNA-seq数据集 |