单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 105 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-07 |
High-complexity extracellular barcoding using a viral hemagglutinin
2020-02-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1919182117
PMID:31988118
|
research paper | 本研究利用流感病毒血凝素开发了一种遗传编码的细胞表面蛋白条形码系统，以解决混合细胞库中细胞克隆的解析问题 | 开发了一种基于血凝素的指数级蛋白条形码系统，能够使用七种抗体标记128个克隆 | NA | 提供一种在体内追踪克隆种群的策略 | 细胞克隆的追踪和解析 | NA | NA | NA | NA | NA | 使用七种抗体标记128个克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-07 |
MAFG-driven astrocytes promote CNS inflammation
2020-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-1999-0
PMID:32051591
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、细胞特异性Ribotag RNA分析、ATAC-seq、ChIP-seq、全基因组DNA甲基化分析及体内CRISPR-Cas9遗传扰动，研究了多发性硬化症及其前临床模型实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的星形胶质细胞 | 发现了EAE和多发性硬化症中星形胶质细胞的特征，包括NRF2表达减少和MAFG表达增加，这些细胞通过与MAT2α合作促进DNA甲基化并抑制抗氧化和抗炎转录程序 | NA | 研究星形胶质细胞在多发性硬化症和EAE中的作用及其调控机制 | 星形胶质细胞在多发性硬化症和EAE中的异质性及其调控 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq、DNA甲基化分析、CRISPR-Cas9 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-07 |
Robustness and applicability of transcription factor and pathway analysis tools on single-cell RNA-seq data
2020-02-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1949-z
PMID:32051003
|
研究论文 | 本文研究了转录因子和通路分析工具在单细胞RNA测序数据上的鲁棒性和适用性 | 首次系统评估了针对批量测序数据开发的转录因子和通路分析工具在单细胞RNA测序数据上的应用效果 | 研究主要基于模拟数据和真实数据进行，实际应用中可能存在更多变数 | 探讨批量测序的转录因子和通路分析工具是否能有效应用于单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据及其与批量测序数据的比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 包括模拟数据和真实单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-07 |
Two-phase wash to solve the ubiquitous contaminant-carryover problem in commercial nucleic-acid extraction kits
2020-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-58586-3
PMID:32029846
|
研究论文 | 本文介绍了一种两阶段洗涤（TPW）方法，用于解决商业核酸提取试剂盒中普遍存在的污染物携带问题，特别是在低稀释度下提高核酸纯度。 | 开发了一种两阶段洗涤方法，通过在洗脱步骤前添加低水溶性的洗涤缓冲液，有效减少了提取缓冲液的携带，同时不降低核酸产量。 | NA | 提高核酸研究的纯度，特别是在需要高灵敏度的应用中，如单细胞测序和病原体诊断。 | 商业核酸提取试剂盒中的污染物携带问题及其对PCR、LAMP和RT反应的影响。 | 分子生物学 | NA | 数字PCR | NA | 核酸 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-07 |
Spatial modeling of prostate cancer metabolic gene expression reveals extensive heterogeneity and selective vulnerabilities
2020-02-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-60384-w
PMID:32103057
|
研究论文 | 本研究通过空间解析的代谢网络模型分析前列腺癌微环境的代谢基因表达，揭示了恶性细胞特异性的代谢脆弱性 | 首次采用空间解析的代谢网络模型来考虑肿瘤微环境中的空间异质性，并发现了新的可靶向的恶性细胞特异性代谢脆弱性 | NA | 探索前列腺癌微环境中的空间异质性及其对肿瘤治疗的潜在影响 | 前列腺癌微环境中的代谢网络和基因表达 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 代谢网络模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-07 |
Single-cell Transcriptome Mapping Identifies Common and Cell-type Specific Genes Affected by Acute Delta9-tetrahydrocannabinol in Humans
2020-02-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-59827-1
PMID:32103029
|
研究论文 | 研究通过单细胞转录组测绘，揭示了Delta-9-四氢大麻酚（THC）对人类免疫细胞基因表达的急性影响 | 首次结合受试者内设计与单细胞转录组测绘，揭示了THC对人类免疫细胞基因表达的急性影响，并识别了细胞类型特异性和共有的受影响基因 | 研究主要集中在THC对免疫细胞的影响，未涉及其他细胞类型或THC的长期效应 | 探究THC对人类免疫细胞基因表达的影响机制 | 人类免疫细胞的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测绘 | NA | 转录组数据 | 15,973个血液细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Inherited Eye Diseases with Retinal Manifestations through the Eyes of Homeobox Genes
2020-Feb-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21051602
PMID:32111086
|
综述 | 本文综述了迄今为止关于导致眼睛器官发生中断并引起遗传性眼/视网膜疾病的家庭盒基因突变的数据和观点 | 本文总结了已知的关键眼睛发育调控因子，特别是与显示视网膜表现的单基因眼病相关的家庭盒基因，并强调了分子遗传学和细胞技术方法在遗传性视网膜疾病治疗中的潜在研究方向 | NA | 探讨家庭盒基因突变对眼睛器官发生的影响及其在遗传性眼/视网膜疾病中的作用 | 家庭盒基因及其在遗传性眼/视网膜疾病中的作用 | 遗传学 | 遗传性眼病 | 下一代测序技术，单细胞转录组分析 | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-07 |
Cellular Heterogeneity and Lineage Restriction during Mouse Digit Tip Regeneration at Single-Cell Resolution
2020-02-24, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.01.026
PMID:32097654
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠指尖再生过程中的细胞异质性和谱系限制 | 首次全面评估了指尖再生中的细胞异质性，并揭示了67个在再生纤维母细胞中富集的基因，包括一个新的再生特异性基因Mest | NA | 研究小鼠指尖再生过程中的细胞异质性和谱系限制 | 小鼠指尖再生中的细胞类型和基因表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 超过38,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-07 |
Using Transcriptomic Analysis to Assess Double-Strand Break Repair Activity: Towards Precise in vivo Genome Editing
2020-Feb-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21041380
PMID:32085662
|
研究论文 | 本文通过转录组分析评估了双链断裂修复活性，旨在实现精确的体内基因编辑 | 利用单细胞RNA测序分析了双链断裂修复途径在分裂细胞到成熟视网膜细胞转变过程中的动态变化，并发现人类诱导多能干细胞衍生的神经元和视网膜类器官可作为开发光感受器基因工程方法的合适体外测试平台 | NA | 评估双链断裂修复活性，开发精确的体内基因编辑方法 | 视网膜特异性基因突变相关的遗传性视网膜疾病 | 基因编辑 | 遗传性视网膜疾病 | 转录组分析 | NA | RNA测序数据 | 包括人类、猕猴和老鼠的视网膜样本，以及人类诱导多能干细胞衍生的神经元和视网膜类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Benchmarking algorithms for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomic data
2020-02, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0690-6
PMID:31907445
|
研究论文 | 本文系统评估了从单细胞转录组数据推断基因调控网络的先进算法 | 开发了一种模拟单细胞转录组数据的新策略，并创建了一个名为BEELINE的评估框架 | 算法在恢复合成网络中的相互作用方面优于布尔模型，且不需要伪时间排序细胞的技术通常更准确 | 评估和改进从单细胞转录组数据推断基因调控网络的算法 | 单细胞转录组数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个实验单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
Review of a novel disease entity, immunoglobulin G4-related disease
2020-Feb, Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
IF:0.9Q3
DOI:10.5125/jkaoms.2020.46.1.3
PMID:32158675
|
综述 | 本文综述了免疫球蛋白G4相关疾病（IgG4-RD）的临床特征和发病机制 | 使用新一代和单细胞RNA测序等分子生物学方法，深入探讨了IgG4-RD的免疫机制 | NA | 探讨IgG4-RD的发病机制和临床特征 | 免疫球蛋白G4相关疾病（IgG4-RD） | NA | 免疫球蛋白G4相关疾病 | 新一代RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Cardiac Fibroblast Diversity
2020-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
|
综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞的多样性和功能，并介绍了通过谱系追踪和单细胞测序技术在发育、成年和疾病状态下对这些细胞异质性的新见解 | 本文通过谱系追踪和单细胞测序技术揭示了心脏成纤维细胞在不同状态下的异质性 | NA | 探讨心脏成纤维细胞的多样性，为开发治疗心脏纤维化的新疗法提供基础 | 心脏成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the developing Drosophila ovary identifies follicle stem cell progenitors
2020-02-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.330464.119
PMID:31919193
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了发育中的果蝇卵巢中所有已知细胞类型，并识别了细胞类型特异性标记，用于追踪细胞谱系 | 本研究首次鉴定了难以捉摸的卵泡干细胞前体细胞类型，并预测了已知细胞类型的亚型 | NA | 旨在全面理解成年细胞类型、其起源及前体关系，特别是在器官发生过程中的复杂性 | 发育中的果蝇卵巢中的细胞类型及其前体关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-09 |
Targeted pharmacological therapy restores β-cell function for diabetes remission
2020-02, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-020-0171-3
PMID:32694693
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和小鼠模型，探讨了药物干预对β细胞去分化和功能恢复的影响，以实现糖尿病缓解。 | 首次揭示了通过药物干预可以靶向去分化的β细胞，实现糖尿病缓解的新机制。 | 研究主要在小鼠模型上进行，需要进一步在人体中验证其有效性和安全性。 | 探讨药物干预对去分化β细胞的影响，以实现糖尿病的缓解。 | β细胞的去分化和功能恢复。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-09 |
Stably expressed genes in single-cell RNA sequencing
2020-02, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720020400041
PMID:32336251
|
研究论文 | 本文研究了在单细胞RNA测序（scRNA-seq）中表达稳定的基因，并探讨了这些基因在数据标准化中的应用 | 提出使用内源性表达稳定的基因作为scRNA-seq数据标准化的参考，而不是依赖外部合成基因 | 尚未明确表达稳定的基因在不同标准化方法中的适用性 | 探索在单细胞RNA测序中用于数据标准化的稳定表达基因 | 研究与细胞结构相关的基因及其在scRNA-seq中的表达稳定性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-09 |
The role of bone marrow-derived cells in the origin of liver cancer revealed by single-cell sequencing
2020-02-15, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了骨髓来源细胞在肝癌起源中的作用 | 首次通过单细胞测序证实骨髓来源细胞是肝细胞癌的一个重要起源 | NA | 探讨骨髓来源细胞在肝细胞癌起源中的可能作用 | 骨髓移植小鼠中的肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 骨髓移植小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-09 |
Defining endogenous barcoding sites for CRISPR/Cas9-based cell lineage tracing in zebrafish
2020-02-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2019.11.012
PMID:32173285
|
研究论文 | 本研究在斑马鱼基因组中鉴定了78个高质量的内源性位点，这些位点可用于基于CRISPR/Cas9的细胞谱系追踪 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，鉴定了78个在大多数细胞类型中高度表达的内源性位点，这些位点可用于基于CRISPR/Cas9的细胞谱系追踪，克服了依赖外源性条形码序列的局限 | NA | 开发用于追踪复杂生物发育细胞谱系的实验方法 | 斑马鱼基因组中的内源性条形码位点 | 基因编辑 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, RNA序列数据 | 78个内源性位点 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals the alteration of peripheral blood mononuclear cells driven by sepsis
2020-Feb, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm.2020.02.35
PMID:32175418
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了脓毒症驱动的外周血单个核细胞（PBMCs）的改变 | 首次在单细胞转录水平上详细描述了脓毒症中PBMCs的组成和功能变化 | 研究规模较小，仅为初步研究 | 探讨脓毒症中PBMCs的单细胞转录组变化 | 脓毒症患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名脓毒症患者和4名供体的PBMCs | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-09 |
[Application of Single-cell RNA Sequencing in Research on Tumor Immune Microenvironment]
2020-Feb-28, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.11194
PMID:32131950
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术能够在单细胞水平上检测细胞的转录组，描述其功能状态，从而加深对肿瘤免疫微环境中不同细胞群组成和功能的理解 | NA | 探讨肿瘤免疫微环境的组成和功能 | 肿瘤免疫微环境中的细胞群 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals TOX as a promoting factor for T cell exhaustion and a predictor for anti-PD-1 responses in human cancer
2020-02-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00722-9
PMID:32111241
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了TOX作为促进T细胞耗竭和预测抗PD-1反应的因素在人类癌症中的作用 | 首次在人类癌症中预测TOX作为调节T细胞耗竭的因子，并通过单细胞转录组分析验证了其作用机制 | NA | 研究T细胞耗竭的调节因子及其在免疫治疗中的应用 | 人类黑色素瘤和非小细胞肺癌中的肿瘤浸润CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 人类黑色素瘤和非小细胞肺癌样本 | NA | NA | NA | NA |