单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 105 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Linked optical and gene expression profiling of single cells at high-throughput
2020-02-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-01958-9
PMID:32093753
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研究论文 | 开发了一种高通量平台，能够同时进行单细胞光学分析和基因表达谱分析 | 首次实现了高通量的单细胞光学与基因表达关联分析，突破了现有方法的通量限制 | 未提及具体的技术验证样本数量或应用范围的局限性 | 开发多模态单细胞分析平台，实现光学特征与基因表达的关联分析 | 单细胞 | 单细胞分析技术 | NA | 单细胞RNA测序，荧光成像 | NA | 基因表达数据，荧光图像数据 | 数千个细胞（单次实验） | NA | 单细胞RNA-seq，光学分析 | NA | 高通量单细胞光学与基因表达关联分析平台 |
| 2 | 2025-10-06 |
Bone Marrow Stromal Cells Drive Key Hallmarks of B Cell Malignancies
2020-Feb-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21041466
PMID:32098106
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综述 | 本文综述了骨髓基质细胞与恶性B细胞之间的相互作用及其在B细胞恶性肿瘤发病机制中的作用 | 强调肿瘤细胞与基质细胞相互作用的双向性，提出靶向肿瘤-基质相互作用具有治疗潜力 | NA | 探讨骨髓基质细胞与恶性B细胞之间的相互作用机制及其在B细胞恶性肿瘤中的关键作用 | 骨髓基质细胞和恶性B细胞 | NA | B细胞恶性肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
A cell atlas of human thymic development defines T cell repertoire formation
2020-02-21, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aay3224
PMID:32079746
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人类胸腺生命周期细胞图谱，揭示T细胞发育轨迹和T细胞受体重组动力学 | 首次创建人类胸腺生命周期单细胞图谱，识别新型CD8αα T细胞群、胸腺成纤维细胞亚型和活化树突状细胞状态，揭示TCR重组的基因组位置偏好性 | NA | 解析人类胸腺T细胞发育过程和T细胞受体形成机制 | 人类胸腺组织样本 | 单细胞组学 | 免疫系统发育 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖整个生命周期的人类胸腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Adult Human Glioblastomas Harbor Radial Glia-like Cells
2020-02-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.01.007
PMID:32004492
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研究论文 | 本研究在成人胶质母细胞瘤中发现存在放射状胶质细胞样细胞亚群 | 首次在成人胶质母细胞瘤中发现具有典型放射状胶质细胞形态和标志物的细胞亚群，并揭示其与正常人类胎儿放射状胶质细胞的转录组相似性 | 研究主要基于单细胞RNA测序分析，需要进一步功能验证这些细胞在肿瘤发生中的具体作用 | 探索成人胶质母细胞瘤中是否存在放射状胶质细胞样细胞及其在肿瘤中的作用 | 成人胶质母细胞瘤组织样本 | 单细胞生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
The Repertoire of Serous Ovarian Cancer Non-genetic Heterogeneity Revealed by Single-Cell Sequencing of Normal Fallopian Tube Epithelial Cells
2020-02-10, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.01.003
PMID:32049047
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研究论文 | 通过正常输卵管上皮细胞的单细胞测序揭示浆液性卵巢癌的非遗传异质性 | 首次利用正常输卵管上皮细胞的分子特征来准确测量浆液性卵巢癌的非遗传异质性 | 样本主要来自非卵巢癌患者，可能影响细胞亚型特征的普适性 | 量化浆液性卵巢癌的非遗传异质性并评估其预后价值 | 正常输卵管上皮细胞和浆液性卵巢癌肿瘤组织 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约6,000个正常输卵管上皮细胞和约1,700个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Eleven grand challenges in single-cell data science
2020-02-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1926-6
PMID:32033589
|
综述 | 本文概述了单细胞数据科学领域面临的十一项重大挑战 | 首次系统性地提出单细胞数据科学领域的核心挑战，为未来研究指明方向 | 未提供具体解决方案，主要聚焦于问题识别和框架构建 | 推动单细胞数据科学领域的发展，界定关键研究问题 | 单细胞测序技术产生的海量数据及其分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞测序数据 | 数千至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-induced hypersensitivity syndrome: a case report
2020-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0733-7
PMID:31959990
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病例报告 | 通过单细胞转录组分析指导药物超敏综合征的靶向治疗 | 首次应用单细胞RNA测序技术解析难治性药物超敏综合征的病理机制，并基于发现指导靶向治疗 | 仅基于单一病例报告，需要更大样本量验证 | 探索难治性药物超敏综合征的病理机制和靶向治疗策略 | 一名难治性药物超敏综合征患者的皮肤和血液样本 | 单细胞组学 | 药物超敏综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Using single-cell technologies to map the human immune system - implications for nephrology
2020-02, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-019-0227-3
PMID:31831877
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综述 | 探讨单细胞技术如何推动人类免疫系统图谱绘制及其在肾脏病学中的应用前景 | 系统阐述单细胞技术对肾脏免疫景观研究的革命性影响，提出临床转化应用路径 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于技术前景的理论分析 | 探索单细胞技术在肾脏免疫系统研究和肾脏疾病诊疗中的应用价值 | 肾脏组织、血液、次级淋巴器官中的免疫细胞及上皮/内皮细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Pro-efferocytic nanoparticles are specifically taken up by lesional macrophages and prevent atherosclerosis
2020-02, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-019-0619-3
PMID:31988506
|
研究论文 | 开发了一种基于单壁碳纳米管的巨噬细胞特异性纳米疗法，用于预防动脉粥样硬化 | 利用单壁碳纳米管作为'特洛伊木马'纳米颗粒，特异性靶向病变巨噬细胞并重新激活胞葬作用 | 研究仅在易患动脉粥样硬化的载脂蛋白E缺陷小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 开发安全有效的纳米疗法来预防和治疗动脉粥样硬化心血管疾病 | 易患动脉粥样硬化的载脂蛋白E缺陷小鼠和病变巨噬细胞 | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics: A High-Resolution Avenue for Plant Functional Genomics
2020-02, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2019.10.008
PMID:31780334
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物功能基因组学中的应用与潜力 | 首次系统阐述单细胞RNA测序技术在植物复杂组织中研究调控过程的新能力，无需依赖报告基因系即可分析任何植物组织 | 面临复杂数据集处理和分析的挑战 | 探索单细胞转录组学在植物功能基因组学研究中的应用 | 植物组织和单细胞 | 植物基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
The genetic architecture of Parkinson's disease
2020-02, The Lancet. Neurology
DOI:10.1016/S1474-4422(19)30287-X
PMID:31521533
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综述 | 本文综述了帕金森病的遗传结构研究现状与挑战 | 系统总结了90个已鉴定的独立风险相关变异，并指出新兴技术将推动该领域发展 | 大多数遗传研究基于欧洲血统患者，对其他人群的遗传学了解有限 | 解析帕金森病的遗传结构及其对疾病风险、发病和进展的影响 | 帕金森病相关遗传变异（罕见和常见变异） | 遗传学 | 帕金森病 | 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、机器学习、高通量筛选 | NA | 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of human prostate carcinoma-associated fibroblasts implicates a role for subpopulations in myeloid cell recruitment
2020-02, The Prostate
DOI:10.1002/pros.23929
PMID:31763714
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类前列腺癌相关成纤维细胞的异质性及其在髓系细胞招募中的作用 | 首次在前列腺癌中发现CAF存在六个功能异质性亚群，并证实特定亚群通过分泌CCL2趋化因子招募髓系细胞 | 研究样本量有限（3321个CAF），机制研究主要基于体外实验，需要更多体内验证 | 鉴定前列腺癌相关成纤维细胞的功能亚群及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类前列腺癌相关成纤维细胞（CAF）和正常前列腺成纤维细胞（NPF） | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，贝叶斯分析，体外迁移实验 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 3321个CAF细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
FLOW-MAP: a graph-based, force-directed layout algorithm for trajectory mapping in single-cell time course datasets
2020-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0246-3
PMID:31932774
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FLOW-MAP的图形用户界面（GUI）软件工具，该工具利用基于图布局分析和时间顺序的方法，用于可视化高维单细胞数据集中的细胞轨迹 | FLOW-MAP算法通过图形布局分析和时间顺序的方法，为单细胞时间序列数据集的分析提供了一种新的可视化工具 | NA | 开发一种新的工具来分析和可视化单细胞时间序列数据集中的细胞轨迹 | 单细胞时间序列数据集，特别是来自流式细胞术、质谱细胞术或单细胞RNA测序（scRNAseq）实验的数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 图布局算法 | 高维单细胞数据 | 包括从小鼠胚胎干细胞分化的时间序列数据集和已发表的scRNAseq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-05 |
Connect-seq to superimpose molecular on anatomical neural circuit maps
2020-02-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1912176117
PMID:32034095
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研究论文 | 本文描述了一种结合逆行病毒追踪和单细胞转录组学的方法，称为“Connect-seq”，用于揭示特定神经回路中上游神经元的分子身份及其信号分子 | Connect-seq方法的创新在于将分子图谱与神经解剖图谱叠加，实现对神经回路功能的分子和遗传学研究 | NA | 探究小鼠大脑神经回路内个体神经元的身份和功能 | 小鼠大脑中的下丘脑神经元，尤其是控制对恐惧和压力生理反应的神经元 | 数字病理 | NA | 逆行病毒追踪和单细胞转录组学 | NA | 分子图谱与神经解剖图谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-05 |
Metastatic Conditioning of Myeloid Cells at a Subcutaneous Synthetic Niche Reflects Disease Progression and Predicts Therapeutic Outcomes
2020-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-1932
PMID:31662327
|
研究论文 | 本研究监测了合成生物材料支架中髓系细胞的转移条件，反映了疾病进展并预测了治疗结果 | 引入合成转移微环境作为监测肿瘤细胞动态的创新途径 | 研究主要集中在小鼠模型上，翻译到人类临床应用时可能会存在差异 | 探讨合成微环境中免疫细胞的表型如何反映转移性疾病的进展及其对治疗的反应 | 分析植入生物材料支架后，髓系细胞在不同时间点的免疫表型变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 治疗前后单只小鼠的多个生物材料植入样本 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene Expression Analyses Reveal Distinct Self-Renewing and Proliferating Subsets in the Leukemia Stem Cell Compartment in Acute Myeloid Leukemia
2020-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-18-2932
PMID:31784425
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研究论文 | 这篇文章通过单细胞基因表达分析揭示了急性骨髓性白血病中的不同自我更新和增殖亚群 | 首次展示了急性骨髓性白血病中白血病干细胞的自我更新和增殖功能是独立的 | 主要研究集中在小鼠模型上，可能与人类的情况有所不同 | 探讨急性骨髓性白血病中白血病干细胞的自我更新与增殖功能是否是分开的 | 急性骨髓性白血病中的白血病干细胞 | 数字病理学 | 急性骨髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠AML模型以及初级人类白血病干细胞和正常人类造血干细胞的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-07 |
STAT Signaling Modifies Ascl1 Chromatin Binding and Limits Neural Regeneration from Muller Glia in Adult Mouse Retina
2020-02-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.01.075
PMID:32075759
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研究论文 | 研究探讨了STAT信号通路对Ascl1染色质结合的影响及其在成年小鼠视网膜Müller胶质细胞神经再生中的限制作用 | 发现STAT信号通路可能引导Ascl1至发育不适宜的目标，使用STAT抑制剂结合重编程范式显著增加了Müller胶质细胞生成神经元的能力 | 新神经元仅从Müller胶质细胞的子集中生成，表明存在限制Ascl1介导的Müller胶质细胞重编程的因素 | 测试损伤诱导的STAT激活是否阻碍Ascl1将Müller胶质细胞重编程为视网膜神经元的能力 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, Ascl1-ChIPseq, ATAC-seq | NA | RNA, 染色质结合数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
A single-parasite transcriptional atlas of Toxoplasma Gondii reveals novel control of antigen expression
2020-02-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54129
PMID:32065584
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了弓形虫在速殖子和缓殖子阶段的转录组，揭示了其发育过程中的隐藏状态和转录因子 | 发现了AP2IX-1转录因子控制从普遍表达的SAG1到稀有表面抗原的切换，并构建了一个互动的数据浏览器用于可视化资源 | NA | 揭示弓形虫发育过程中的转录调控机制 | 弓形虫的速殖子和缓殖子阶段 | 分子生物学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过5,400个弓形虫样本，包括三种广泛研究的菌株 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
A reference profile-free deconvolution method to infer cancer cell-intrinsic subtypes and tumor-type-specific stromal profiles
2020-02-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-0720-0
PMID:32111252
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研究论文 | 开发了一种名为DeClust的计算去卷积方法，用于从肿瘤转录组数据中推断癌症细胞内在亚型和肿瘤类型特异性基质 profiles，无需参考表达 profiles 或特征矩阵 | DeClust方法直接将实体瘤的分子分型纳入去卷积过程，并输出分子亚型特异性的肿瘤参考 profiles，而不是单个肿瘤 profiles | DeClust识别的亚型在总体上与生存率没有更显著的关联 | 开发一种新的去卷积方法，用于从肿瘤转录组数据中推断癌症细胞内在亚型和肿瘤类型特异性基质 profiles | 实体瘤的分子亚型和肿瘤类型特异性基质 profiles | 数字病理学 | NA | 转录组数据分析 | 去卷积方法 | 转录组数据 | 13个实体瘤数据集来自癌症基因组图谱(TCGA) | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Tailless/TLX reverts intermediate neural progenitors to stem cells driving tumourigenesis via repression of asense/ASCL1
2020-02-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.53377
PMID:32073402
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研究论文 | 本文研究了Tailless/TLX通过抑制asense/ASCL1将中间神经前体细胞逆转为干细胞，从而驱动肿瘤发生的过程。 | 本文首次展示了Tailless通过逆转中间神经前体细胞为干细胞来启动肿瘤发生，并通过重新表达Asense来完全阻止肿瘤形成。 | NA | 旨在理解导致癌症的一系列事件，特别是胶质母细胞瘤的早期疾病进展。 | 研究对象包括神经谱系细胞、胶质细胞以及Tailless和Asense在肿瘤发生中的作用。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 人类胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |