单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
A single-parasite transcriptional atlas of Toxoplasma Gondii reveals novel control of antigen expression
2020-02-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54129
PMID:32065584
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了弓形虫在速殖子和缓殖子阶段的转录组，揭示了其发育过程中的隐藏状态和转录因子 | 发现了AP2IX-1转录因子控制从普遍表达的SAG1到稀有表面抗原的切换，并构建了一个互动的数据浏览器用于可视化资源 | NA | 揭示弓形虫发育过程中的转录调控机制 | 弓形虫的速殖子和缓殖子阶段 | 分子生物学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过5,400个弓形虫样本，包括三种广泛研究的菌株 |
| 162 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a heterogeneous response to Glucocorticoids in breast cancer cells
2020-03-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0837-0
PMID:32170217
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了乳腺癌细胞对糖皮质激素的异质性反应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌细胞对糖皮质激素反应的细胞间转录异质性 | 研究仅限于一种乳腺癌细胞系，可能无法完全代表所有乳腺癌细胞的反应 | 探究乳腺癌细胞对糖皮质激素的个体细胞转录反应 | 乳腺癌细胞对糖皮质激素的反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNAseq) | NA | RNA | 一种人乳腺癌细胞系 |
| 163 | 2024-08-07 |
Phagocytosis of Wnt inhibitor SFRP4 by late wound macrophages drives chronic Wnt activity for fibrotic skin healing
2020-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aay3704
PMID:32219160
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序比较了半再生性和纤维化伤口诱导的毛发生成（WIHN）伤口，发现晚期伤口中的巨噬细胞通过吞噬皮肤Wnt抑制因子SFRP4来驱动纤维化愈合 | 揭示了巨噬细胞通过吞噬SFRP4来调节Wnt信号通路，从而影响皮肤伤口愈合的命运 | NA | 探讨巨噬细胞在皮肤伤口愈合中的作用及其机制 | 人及小鼠皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞和纤维化过程 | NA | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
A reference profile-free deconvolution method to infer cancer cell-intrinsic subtypes and tumor-type-specific stromal profiles
2020-02-28, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-0720-0
PMID:32111252
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研究论文 | 开发了一种名为DeClust的计算去卷积方法，用于从肿瘤转录组数据中推断癌症细胞内在亚型和肿瘤类型特异性基质 profiles，无需参考表达 profiles 或特征矩阵 | DeClust方法直接将实体瘤的分子分型纳入去卷积过程，并输出分子亚型特异性的肿瘤参考 profiles，而不是单个肿瘤 profiles | DeClust识别的亚型在总体上与生存率没有更显著的关联 | 开发一种新的去卷积方法，用于从肿瘤转录组数据中推断癌症细胞内在亚型和肿瘤类型特异性基质 profiles | 实体瘤的分子亚型和肿瘤类型特异性基质 profiles | 数字病理学 | NA | 转录组数据分析 | 去卷积方法 | 转录组数据 | 13个实体瘤数据集来自癌症基因组图谱(TCGA) |
| 165 | 2024-08-07 |
Tailless/TLX reverts intermediate neural progenitors to stem cells driving tumourigenesis via repression of asense/ASCL1
2020-02-19, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.53377
PMID:32073402
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研究论文 | 本文研究了Tailless/TLX通过抑制asense/ASCL1将中间神经前体细胞逆转为干细胞，从而驱动肿瘤发生的过程。 | 本文首次展示了Tailless通过逆转中间神经前体细胞为干细胞来启动肿瘤发生，并通过重新表达Asense来完全阻止肿瘤形成。 | NA | 旨在理解导致癌症的一系列事件，特别是胶质母细胞瘤的早期疾病进展。 | 研究对象包括神经谱系细胞、胶质细胞以及Tailless和Asense在肿瘤发生中的作用。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 人类胶质母细胞瘤样本 |
| 166 | 2024-08-07 |
High-complexity extracellular barcoding using a viral hemagglutinin
2020-02-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1919182117
PMID:31988118
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research paper | 本研究利用流感病毒血凝素开发了一种遗传编码的细胞表面蛋白条形码系统，以解决混合细胞库中细胞克隆的解析问题 | 开发了一种基于血凝素的指数级蛋白条形码系统，能够使用七种抗体标记128个克隆 | NA | 提供一种在体内追踪克隆种群的策略 | 细胞克隆的追踪和解析 | NA | NA | NA | NA | NA | 使用七种抗体标记128个克隆 |
| 167 | 2024-08-07 |
Progenitor identification and SARS-CoV-2 infection in long-term human distal lung organoid cultures
2020-Jul-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.07.27.212076
PMID:32743583
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研究论文 | 本文开发了一种无饲养层、化学定义的远端人肺祖细胞器官培养系统，并展示了其在模拟COVID-19远端肺疾病中的应用 | 首次成功培养了从单个成人肺泡上皮II型细胞或基底细胞克隆衍生的远端人肺器官，并展示了其在SARS-CoV-2感染模型中的应用 | 未观察到仅由杯状细胞组成的器官 | 开发一种新的体外模型来研究人远端肺疾病，特别是COVID-19相关的肺炎 | 远端人肺祖细胞及其在疾病模型中的应用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 从单个成人肺泡上皮II型细胞或基底细胞克隆衍生的器官 |
| 168 | 2024-08-07 |
A curated database reveals trends in single-cell transcriptomics
2020-11-28, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaa073
PMID:33247933
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研究论文 | 本文构建了一个详尽的手动筛选单细胞转录组学研究数据库，包含关键信息如数据类型、技术使用及研究生物系统的描述 | 提供了对已发表单细胞转录组学数据的全面汇总，便于发现相关趋势和信息 | NA | 旨在促进对已发表单细胞转录组学数据的发现和利用 | 单细胞转录组学研究及其相关数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涵盖超过1000项研究 |
| 169 | 2024-08-07 |
The differential immune responses to COVID-19 in peripheral and lung revealed by single-cell RNA sequencing
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00225-2
PMID:33101705
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了COVID-19患者外周血单个核细胞和支气管肺泡灌洗液中的细胞，揭示了COVID-19患者免疫反应的差异 | 首次详细描述了COVID-19患者外周和肺部免疫细胞景观的扰动，特别是树突状细胞和单核细胞的变化 | NA | 探究COVID-19患者免疫功能障碍的机制，为开发有效治疗提供依据 | COVID-19患者的外周血单个核细胞和支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | COVID-19患者和健康对照组的外周血单个核细胞及支气管肺泡灌洗液中的细胞 |
| 170 | 2024-08-07 |
Transdifferentiation of tumor infiltrating innate lymphoid cells during progression of colorectal cancer
2020-07, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0312-y
PMID:32367039
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了结直肠癌进展过程中肿瘤浸润性先天淋巴细胞（ILCs）的特征和功能变化 | 首次详细描述了结直肠癌进展中肿瘤浸润性ILCs的六个不同集群及其独特的功能转换，包括ILC1s的抑制性功能转换、ILC2s的子集分类及其对肿瘤进展的影响，以及ILC3s向ILCregs的转分化 | NA | 探究肿瘤浸润性先天淋巴细胞在结直肠癌进展中的作用及其潜在的免疫治疗策略 | 结直肠癌中的肿瘤浸润性先天淋巴细胞 | 免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个肿瘤浸润性ILCs样本 |
| 171 | 2024-08-07 |
Circulating miRNA Spaceflight Signature Reveals Targets for Countermeasure Development
2020-12-08, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108448
PMID:33242410
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研究论文 | 本研究鉴定并验证了与模拟、短时和长时太空飞行相关的共享微小RNA（miRNA）特征，这些特征在啮齿动物和人类中均有体现 | 首次发现并验证了太空飞行相关的miRNA特征，并利用antagomirs成功挽救了模拟深空辐射引起的血管损伤 | NA | 揭示太空飞行相关的miRNA特征，并开发针对这些特征的对抗措施 | 啮齿动物和人类的miRNA响应太空飞行的情况 | NA | NA | miRNA测序，单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞转座酶可及染色质测定（scATAC-seq） | NA | miRNA数据 | 包括啮齿动物和人类样本，具体数量未详述 |
| 172 | 2024-08-07 |
The cellular and molecular landscape of hypothalamic patterning and differentiation from embryonic to late postnatal development
2020-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18231-z
PMID:32868762
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了从胚胎期到晚期新生期小鼠下丘脑的基因表达模式和细胞命运特化 | 首次系统地描绘了小鼠下丘脑发育过程中所有主要细胞类型的发育轨迹，并区分了下丘脑的主要区域划分 | NA | 识别控制下丘脑发育的基因，并理解其分子机制 | 小鼠下丘脑的细胞和分子景观 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 12个发育时间点的小鼠下丘脑样本 |
| 173 | 2024-08-07 |
Heterogeneous expression of the SARS-Coronavirus-2 receptor ACE2 in the human respiratory tract
2020-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.04.22.056127
PMID:32577664
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组织化学技术，系统研究了人呼吸道中SARS-CoV-2受体ACE2的异质性表达及其与COVID-19严重程度风险因素的关联 | 首次详细描述了ACE2蛋白在人呼吸道中的具体定位及其与COVID-19易感性因素的关系 | NA | 探究SARS-CoV-2受体ACE2在人呼吸道中的表达模式及其与COVID-19严重程度的关系 | 人呼吸道中的ACE2蛋白表达及其与COVID-19风险因素的关联 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 蛋白质 | NA |
| 174 | 2024-08-07 |
Single-cell longitudinal analysis of SARS-CoV-2 infection in human airway epithelium
2020-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.05.06.081695
PMID:32511382
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对实验感染的人支气管上皮细胞（HBECs）在气液界面培养中进行时间序列分析，揭示了SARS-CoV-2感染的病毒复制、细胞趋向性和宿主-病毒相互作用。 | 发现了新的多聚腺苷酸化病毒转录本，并确认纤毛细胞为主要感染目标；开发了一种新的计算方法CONDENSE，用于分析和比较感染响应中的时间基因动态。 | NA | 深入理解SARS-CoV-2感染和发病机制，为治疗药物的开发提供关键信息。 | 人支气管上皮细胞（HBECs）和COVID-19患者。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 实验感染的人支气管上皮细胞（HBECs）和COVID-19患者样本。 |
| 175 | 2024-08-07 |
DNF: A differential network flow method to identify rewiring drivers for gene regulatory networks
2020-Oct-14, Neurocomputing
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.neucom.2020.05.028
PMID:34025035
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研究论文 | 本文提出了一种差异网络流（DNF）方法，用于识别基因调控网络中的关键调节因子 | DNF方法通过量化网络流分布的差异，能够从局部到全局捕捉全面的拓扑差异，从而更准确地识别驱动基因 | NA | 旨在开发一种新方法，能够从随机变化和下游效应中分离出真正的调控元件的影响 | 基因调控网络中的关键调节因子 | 基因组学 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 基因组数据 | 四个人类数据集来自癌症基因组图谱和三个小鼠神经和造血分化单细胞RNA测序数据集 |
| 176 | 2024-08-07 |
STAT3-BDNF-TrkB signalling promotes alveolar epithelial regeneration after lung injury
2020-10, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0569-x
PMID:32989251
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研究论文 | 本文通过全基因组染色质可及性和基因表达分析，研究了急性肺损伤后肺泡上皮再生的机制，特别是STAT3-BDNF-TrkB信号轴的作用。 | 首次揭示了STAT3-BDNF-TrkB信号轴在肺泡上皮再生中的生物学和治疗重要性。 | NA | 阐明肺损伤后肺泡上皮再生的机制。 | 肺泡上皮细胞（AT2和AT1细胞）及其再生过程。 | 数字病理学 | 肺疾病 | 全基因组染色质可及性分析，单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 177 | 2024-08-07 |
SciBet as a portable and fast single cell type identifier
2020-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15523-2
PMID:32286268
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SciBet的监督式细胞类型识别工具，该工具能够快速准确地预测新测序细胞的身份，具有速度优势 | SciBet提供了一种快速、鲁棒且技术独立的计算方法，用于单细胞RNA测序数据的监督式细胞类型注释 | NA | 开发一种快速且用户友好的工具，用于单细胞类型识别 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督式学习模型 | RNA测序数据 | NA |
| 178 | 2024-08-07 |
Human Cell Atlas and cell-type authentication for regenerative medicine
2020-09, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-0421-1
PMID:32929224
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综述 | 本文综述了细胞类型鉴定的当前进展，从人类细胞图谱项目到基于细胞数据指南的再生医学的分子标记数据库和其他来源 | 近年来单细胞RNA测序技术的进步为基于RNA特征的细胞个体和时空水平表征开辟了新途径，极大地改变了我们对细胞类型的理解 | NA | 探讨细胞类型鉴定的最新进展及其在再生医学中的应用 | 细胞类型的鉴定及其在组织器官发育研究和细胞疗法及疾病模型中的应用 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 179 | 2024-08-07 |
Red panda: a novel method for detecting variants in single-cell RNA sequencing
2020-Dec-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07224-3
PMID:33372593
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Red Panda的新方法，用于在单细胞RNA测序数据中准确识别变异 | Red Panda方法在单细胞RNA测序数据中识别变异的准确性和敏感性优于现有软件 | 使用单细胞RNA测序数据识别基因组变异的方法仍有改进空间 | 设计并实现一种新方法，以在单细胞RNA测序数据中准确识别变异 | 人类关节软骨细胞、小鼠胚胎成纤维细胞（MEFs）及来自MEF比对的模拟数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类关节软骨细胞、小鼠胚胎成纤维细胞及模拟数据 |
| 180 | 2024-08-07 |
Generation of a Single-Cell RNAseq Atlas of Murine Salivary Gland Development
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101838
PMID:33305192
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术生成了小鼠下颌下腺发育的图谱，揭示了在关键发育事件中的细胞异质性 | 首次生成了小鼠下颌下腺发育的单细胞RNA测序图谱，并识别了与腺泡分化相关的转录因子 | NA | 旨在理解器官发育过程中的动态转录景观，为再生疗法提供模板 | 小鼠下颌下腺的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |