单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
CD52 Is Elevated on B cells of SLE Patients and Regulates B Cell Function
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.626820
PMID:33658999
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研究论文 | 本研究揭示了系统性红斑狼疮（SLE）患者B细胞上CD52的升高及其对B细胞功能的调节 | 本研究首次揭示了SLE患者B细胞表面CD52的显著升高及其在B细胞功能调节中的抑制作用 | 本研究未涉及CD52对其他免疫细胞的影响 | 探讨CD52在SLE患者B细胞功能中的作用 | SLE患者与健康供体的B细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | JeKo-1细胞 | RNA序列数据 | 涉及SLE患者和健康供体的B细胞样本 |
| 142 | 2024-08-05 |
Semiochemical responsive olfactory sensory neurons are sexually dimorphic and plastic
2020-11-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54501
PMID:33231170
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研究论文 | 本研究探讨了基因和经验如何共同作用生成表型变异性，特别是在小鼠的主要嗅觉上皮中 | 识别出了一群性别特异性的嗅觉感知神经元，并发现其在不同性别小鼠中的表现出性别差异，同时揭示了活动依赖基因表达的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种 | 研究基因和经验在表现性状变异中的作用 | 主要嗅觉上皮中的嗅觉感知神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | 性别分离的小鼠和性别结合的小鼠的嗅觉神经元亚群 |
| 143 | 2024-08-05 |
Identification of Repurposable Drugs and Adverse Drug Reactions for Various Courses of COVID-19 Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-May-16, ArXiv
PMID:33299905
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据筛选出可重新利用的抗COVID-19药物和不良药物反应 | 首次使用系统生物学方法结合FDA批准的药物和小分子化合物的数据来发现防治COVID-19的新药物 | 未详细探讨所有候选药物的临床适应性和潜在不良反应 | 寻找可重新利用的药物以治疗COVID-19 | 美国FDA批准的药物和前临床小分子化合物 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含轻症和重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 |
| 144 | 2024-08-05 |
Ocular macrophage origin and heterogeneity during steady state and experimental choroidal neovascularization
2020-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02010-0
PMID:33187533
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠和人类眼部巨噬细胞在稳态和实验性脉络膜新生血管形成中的起源与异质性 | 首次揭示了小鼠和人类眼部巨噬细胞亚群的组成及其在疾病中的功能差异 | 尚未明确人类巨噬细胞亚群的所有功能特点和生物学意义 | 研究眼部巨噬细胞在稳态和病理状态下的异质性及其起源 | 小鼠模型及人类nAMD患者的巨噬细胞 | 数字病理学 | 与年龄相关的黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | Cx3cr1CreER/+ ; Rosa26zsGFP/+小鼠模型 | RNA数据 | 涉及的小鼠和人类样本数量未具体说明 |
| 145 | 2024-08-05 |
Matrix factorization and transfer learning uncover regulatory biology across multiple single-cell ATAC-seq data sets
2020-07-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa349
PMID:32392348
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研究论文 | 本文提出了一种分析框架，用于整合多个单细胞ATAC-seq数据集。 | 通过应用CoGAPS矩阵分解算法和projectR转移学习程序，有助于识别多个scATAC-seq数据集中的共同调控模式。 | 本文没有提到具体的限制。 | 探讨如何整合多个单细胞ATAC-seq数据集和/或测序方式。 | 分析可公开获得的单细胞ATAC-seq数据集。 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq | CoGAPS矩阵分解算法 | 单细胞基因组数据 | 使用了公开可得的多个单细胞ATAC-seq数据集 |
| 146 | 2024-08-05 |
Multimodal single-cell analysis reveals distinct radioresistant stem-like and progenitor cell populations in murine glioma
2020-12, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23866
PMID:32621641
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研究论文 | 这篇文章展示了小鼠胶质瘤中不同的耐辐射干样和祖细胞群体的多模态单细胞分析 | 首次结合侧群分析和单细胞RNA测序，揭示了胶质瘤对辐射的细胞反应时间过程 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类胶质瘤的复杂性 | 探讨胶质瘤中耐辐射细胞群体及其对辐射的反应 | 小鼠胶质瘤模型中的肿瘤细胞和免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，FACS | NA | 细胞 | NA |
| 147 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of galaninergic neurons from ventrolateral preoptic nucleus identifies expression changes between sleep and wake
2020-Sep-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07050-7
PMID:32928100
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研究论文 | 本文研究了在睡眠和觉醒状态下，腹外侧前视核的加拉宁能神经元的转录调控。 | 本研究揭示了加拉宁能神经元在睡眠和缺觉中的转录响应变化，扩展了对这一特定神经元群体的重要知识。 | 研究可能未能充分考虑其他神经元类型及其在睡眠/觉醒中的作用。 | 探讨腹外侧前视核加拉宁能神经元的转录调控机制，特别是在睡眠状态下的变化。 | 研究对象为腹外侧前视核的加拉宁能神经元，比较其在睡眠与觉醒状态下的表达变化。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从腹外侧前视核分离的eGFP(+)加拉宁神经元 |
| 148 | 2024-08-05 |
Diversification of reprogramming trajectories revealed by parallel single-cell transcriptome and chromatin accessibility sequencing
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1190
PMID:32917699
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研究论文 | 本文探讨了细胞重编程过程中的异质性及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序揭示了重编程细胞的多样性和异步轨迹 | 未提及具体样本数量和实验限制 | 揭示重编程细胞的异质性及成功重编程的机制 | 重编程的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 149 | 2024-08-05 |
Social reprogramming in ants induces longevity-associated glia remodeling
2020-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba9869
PMID:32875108
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研究论文 | 本文探讨了社会性昆虫中工蚁转变为类女王状态对神经胶质细胞重塑及寿命的影响 | 发现社交行为的重编程与神经保护胶质细胞的扩展相关，揭示了工蚁转变为gamergate对寿命延长的影响 | 研究主要集中在特定的社交转变上，可能无法广泛适用于所有社交昆虫 | 探索社会性昆虫中工作形式与寿命之间的关系及其机制 | 研究对象是社会性昆虫中的工蚁与gamergate状态的比较 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 150 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Cellular Hierarchies and Impaired Developmental Trajectories in Pediatric Ependymoma
2020-07-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.06.004
PMID:32663469
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析小儿室管膜瘤的细胞层次和发育轨迹的影响 | 揭示了室管膜瘤的细胞层次和发育起源，以及其与生物学和临床行为相关的分子依赖性 | NA | 研究小儿室管膜瘤的肿瘤异质性及其发育起源 | 取自不同分子组和解剖位置的室管膜瘤样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 151 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals ectopic and aberrant lung-resident cell populations in idiopathic pulmonary fibrosis
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1983
PMID:32832599
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研究论文 | 我们提供了一幅特发性肺纤维化（IPF）单细胞图谱，揭示了该致命间质肺病中的细胞多样性 | 识别出一种先前未被发现的异常基底细胞群体，并展示了IPF肺中细胞群体的复杂性 | 研究仅涉及有限的样本种类，可能无法完全代表所有IPF患者中的细胞异质性 | 研究特发性肺纤维化中的细胞组成及其潜在功能 | 312,928个来自32个IPF患者和其他对照的单细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 312,928个细胞来自32个IPF患者、28个吸烟和不吸烟的对照以及18个COPD患者的肺 |
| 152 | 2024-08-05 |
Site-1 protease ablation in the osterix-lineage in mice results in bone marrow neutrophilia and hematopoietic stem cell alterations
2020-06-23, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.052993
PMID:32576566
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠中osterix谱系中Site-1蛋白酶的缺失对骨髓中中性粒细胞及造血干细胞的影响 | 本研究初步揭示了Site-1蛋白酶在维持骨髓造血微环境平衡中的重要作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果能否推广到人类需进一步验证 | 研究Site-1蛋白酶缺失对骨髓细胞组成及造血干细胞功能的影响 | 小鼠，尤其是osterix谱系中Site-1蛋白酶缺失的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质质谱 | NA | NA | 涉及多种骨髓来源的细胞，具体样本量未说明 |
| 153 | 2024-08-05 |
Dynamics of peripheral T cell clones during PD-1 blockade in non-small cell lung cancer
2020-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02642-4
PMID:32591861
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研究论文 | 本文探讨了在非小细胞肺癌中PD-1阻断期间外周T细胞克隆的动态变化 | 通过Smart-seq2单细胞RNA测序分析，首次对T细胞克隆在免疫治疗中的动态进行了全面监测 | 研究样本仅限于非小细胞肺癌患者，可能影响结果的普遍适用性 | 研究PD-1阻断患者外周T细胞克隆的功能状态和动态变化 | 分析了3,110个非小细胞肺癌患者的外周T细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | Smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3,110个外周T细胞 |
| 154 | 2024-08-05 |
Tumor-infiltrating CD39+CD8+ T cells determine poor prognosis and immune evasion in clear cell renal cell carcinoma patients
2020-Aug, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02563-2
PMID:32306075
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研究论文 | 该研究评估了肾透明细胞癌患者中肿瘤浸润CD39+CD8+ T细胞的临床价值 | 首次展示了CD39+CD8+ T细胞积累与肾透明细胞癌差预后的相关性 | 研究基于回顾性队列，缺乏前瞻性验证 | 探究CD39+CD8+ T细胞在肾透明细胞癌中的预后价值及其作为潜在治疗靶点 | 243例肾透明细胞癌患者的肿瘤微环境及其免疫细胞功能 | 数字病理学 | 肾癌 | 免疫组化分析，流式细胞术，生物信息学分析 | Kaplan-Meier分析，COX回归模型 | 样本 | 243例肾透明细胞癌患者，48个新鲜肿瘤样本 |
| 155 | 2024-08-05 |
Interpretable factor models of single-cell RNA-seq via variational autoencoders
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa169
PMID:32176273
|
研究论文 | 本文提出了一种基于变分自编码器的可解释单细胞RNA-seq因子模型 | 提出了一种修改过的变分自编码器框架，为大规模数据集中的基因程序识别提供可解释性 | 由于论文中未详细描述具体的限制，故此处为NA | 探索单细胞RNA-seq中基因表达变异和细胞类型依赖的统计推断方法 | 通过对大规模数据集的分析，识别基因程序 | 数字病理学 | NA | 变分自编码器 | 因子模型 | 基因表达数据 | NA |
| 156 | 2024-08-07 |
Defining the Design Principles of Skin Epidermis Postnatal Growth
2020-04-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.015
PMID:32259486
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研究论文 | 本文通过结合体内克隆系谱追踪、增殖动力学、单细胞转录组学和体外微图案实验，解析了出生后皮肤表皮扩张过程中的细胞动力学 | 揭示了由单一发育前体细胞群介导的和谐生长机制，这些前体细胞具有固定的命运失衡自我更新分裂和不断降低的增殖率 | NA | 探究出生后器官和组织生长过程中的细胞动力学 | 皮肤表皮在出生后的生长过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 157 | 2024-08-07 |
Neuroinflammation and EIF2 Signaling Persist despite Antiretroviral Treatment in an hiPSC Tri-culture Model of HIV Infection
2020-04-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.02.010
PMID:32220329
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研究论文 | 本文开发了一种基于人诱导多能干细胞（hiPSC）的三重培养模型，用于研究HIV感染及其抗逆转录病毒治疗（ART）对神经炎症和EIF2信号的影响。 | 首次使用hiPSC三重培养模型来模拟HIV感染及其治疗，揭示了即使在抗逆转录病毒治疗下，神经炎症和EIF2信号仍然持续存在。 | NA | 研究HIV相关神经认知障碍（HAND）的治疗靶点，特别是在抗逆转录病毒治疗下的机制。 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）分化成的神经元、星形胶质细胞和微小胶质细胞的三重培养模型。 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及HIV感染和未感染的微小胶质细胞的三重培养模型 |
| 158 | 2024-08-07 |
Platform Effects on Regeneration by Pulmonary Basal Cells as Evaluated by Single-Cell RNA Sequencing
2020-03-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.004
PMID:32209482
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估了不同平台对肺基底细胞再生的影响 | 开发了计算流程来比较不同平台样本的全局和群体水平差异 | NA | 阐明体外环境中上皮再生结果的环境效应 | 从大鼠气管中分离并培养的药理学扩增的基底细胞 | 数字病理学 | 慢性肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 从大鼠气管中分离的基底细胞样本 |
| 159 | 2024-08-07 |
Cortical Foxp2 Supports Behavioral Flexibility and Developmental Dopamine D1 Receptor Expression
2020-03-14, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhz209
PMID:31711176
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研究论文 | 本研究通过特异性敲除小鼠皮质中的Foxp2基因，探讨了Foxp2在皮质发育和行为灵活性中的作用。 | 首次揭示了Foxp2在皮质中对多巴胺D1受体表达和行为灵活性的调控作用，并通过单细胞转录组学分析了D1R表达细胞类型的变化。 | NA | 探究Foxp2在皮质发育和行为灵活性中的分子和行为功能。 | 皮质特异性Foxp2条件敲除小鼠。 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 至少五种兴奋性和三种抑制性D1R表达细胞类型 |
| 160 | 2024-08-07 |
STAT Signaling Modifies Ascl1 Chromatin Binding and Limits Neural Regeneration from Muller Glia in Adult Mouse Retina
2020-02-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.01.075
PMID:32075759
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研究论文 | 研究探讨了STAT信号通路对Ascl1染色质结合的影响及其在成年小鼠视网膜Müller胶质细胞神经再生中的限制作用 | 发现STAT信号通路可能引导Ascl1至发育不适宜的目标，使用STAT抑制剂结合重编程范式显著增加了Müller胶质细胞生成神经元的能力 | 新神经元仅从Müller胶质细胞的子集中生成，表明存在限制Ascl1介导的Müller胶质细胞重编程的因素 | 测试损伤诱导的STAT激活是否阻碍Ascl1将Müller胶质细胞重编程为视网膜神经元的能力 | 成年小鼠视网膜中的Müller胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, Ascl1-ChIPseq, ATAC-seq | NA | RNA, 染色质结合数据 | 未具体说明样本数量 |