单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1561 - 1580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1561 | 2024-08-09 |
A Single Cell but Many Different Transcripts: A Journey into the World of Long Non-Coding RNAs
2020-Jan-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21010302
PMID:31906285
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综述 | 本文综述了长非编码RNA（lncRNAs）的分类及其在单细胞分析中的新发现 | 介绍了单细胞RNA测序和荧光放大技术在lncRNA功能研究中的应用 | NA | 收集关于lncRNA分类的最新信息及其在单细胞分析中的功能新发现 | 长非编码RNA（lncRNAs）及其在细胞中的表达和亚细胞定位 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1562 | 2024-08-09 |
Single cell RNA-sequencing reveals cellular heterogeneity and trajectories of lineage specification during murine embryonic limb development
2020-07, Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.matbio.2019.12.004
PMID:31874220
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠胚胎后肢发育过程中的细胞异质性和谱系指定轨迹 | 首次在单细胞水平上揭示了小鼠胚胎后肢发育过程中的细胞转录程序和细胞成熟连续性 | NA | 识别小鼠胚胎后肢发育过程中的细胞谱系指定轨迹 | 小鼠胚胎后肢发育过程中的细胞类型和细胞轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎后肢在胚胎日11.5至18.5的样本 |
| 1563 | 2024-08-09 |
Causal network perturbations for instance-specific analysis of single cell and disease samples
2020-04-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz949
PMID:31873725
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ssNPA的新方法，用于基于基因网络失调对样本进行亚型分类 | ssNPA直接从对照数据中学习因果图，并通过预测每个基因表达的误差来量化样本特定网络邻域的失调 | NA | 旨在通过分析个体样本中的通路扰动，改善诊断并实现个性化治疗 | 单细胞和疾病样本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 因果图 | 基因表达数据 | 包括肝脏发育的单细胞RNA-seq数据和两个TCGA数据集 |
| 1564 | 2024-08-09 |
Design and application of single-cell RNA sequencing to study kidney immune cells in lupus nephritis
2020-04, Nature reviews. Nephrology
DOI:10.1038/s41581-019-0232-6
PMID:31853010
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了狼疮性肾炎中的肾脏免疫细胞 | 采用单细胞RNA测序技术对狼疮性肾炎患者的肾脏活检样本进行详细细胞群特征分析，并探讨了非侵入性监测肾脏免疫激活的可能性 | NA | 揭示狼疮性肾炎中导致组织损伤的免疫机制 | 狼疮性肾炎患者的肾脏免疫细胞和实质细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | 多个地点和不同人群的肾脏活检样本 |
| 1565 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Disease-Defining T-cell Subsets in the Tumor Microenvironment of Classic Hodgkin Lymphoma
2020-03, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-0680
PMID:31857391
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，揭示了经典霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中定义疾病的T细胞亚群 | 首次在单细胞分辨率下对霍奇金淋巴瘤特异性免疫微环境进行表型分析，并发现了一种新的霍奇金淋巴瘤相关T细胞亚群，该亚群表达抑制性受体LAG3，具有免疫抑制功能 | NA | 研究霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中细胞成分及其空间关系，以理解细胞间的相互作用及治疗靶点 | 霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中的T细胞亚群 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 从22个霍奇金淋巴瘤组织样本和5个反应性淋巴结中获取超过127,000个细胞 |
| 1566 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies meniscus progenitors and reveals the progression of meniscus degeneration
2020-03, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2019-215926
PMID:31871141
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）识别膝关节半月板细胞的不同亚群，并揭示半月板退化的机制 | 首次通过scRNA-seq技术识别出半月板前体细胞，并揭示了半月板退化的新机制 | NA | 探究半月板细胞的异质性及其退化机制 | 人类健康及退化半月板细胞 | 数字病理学 | 关节疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括健康和退化的半月板细胞的多个样本 |
| 1567 | 2024-08-09 |
Highly multiplexed single-cell RNA-seq by DNA oligonucleotide tagging of cellular proteins
2020-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0372-z
PMID:31873215
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研究论文 | 本文描述了一种通用的单细胞RNA测序样本多重化方法，通过将识别DNA寡核苷酸附着到固定细胞的细胞蛋白上来进行化学标记 | 该方法能够揭示从大量实验或临床样本中细胞群体结构和转录状态的变化，这些变化无法通过整体测量来辨别 | NA | 建立一种高效的方法，用于从大型实验或临床样本中以单细胞RNA测序的深度和分辨率调查细胞群体 | 单细胞RNA测序中的细胞群体结构和转录状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 96个多重化样本 |
| 1568 | 2024-08-09 |
Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial target in glioblastoma
2020-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0694-x
PMID:31873309
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研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了94名代表五种不同癌症类型的患者，识别出胶质母细胞瘤中独特的CD73巨噬细胞群体，并探讨了CD73作为联合治疗靶点的重要性。 | 本文首次识别出胶质母细胞瘤中持续存在的CD73巨噬细胞群体，并通过反向转化研究证实CD73缺失可提高抗CTLA-4和抗PD-1治疗下的生存率。 | 临床试验中联合免疫检查点策略的机制合理性尚不明确，且研究仅限于特定肿瘤类型。 | 旨在识别肿瘤特异性免疫调节靶点，以改进免疫检查点疗法在胶质母细胞瘤中的应用。 | 94名代表五种不同癌症类型的患者，特别是胶质母细胞瘤、前列腺癌和结直肠癌患者。 | 数字病理学 | 脑癌 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 94名患者 |
| 1569 | 2024-08-09 |
Macrophage-tumor cell interaction promotes ATRT progression and chemoresistance
2020-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-019-02116-7
PMID:31848709
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研究论文 | 本研究通过多重免疫荧光染色和单细胞RNA测序揭示了非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）亚群中免疫性肿瘤微环境（TME）的不同组成 | 首次揭示了CD68细胞在ATRT-SHH和ATRT-MYC亚群中的主要浸润情况，并发现这些细胞是患者生存的负面预后因素 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，可能与人类实际情况存在差异 | 探索非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）亚群中的预测因子 | 非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）及其亚群 | NA | 非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤 | 多重免疫荧光染色、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及ATRT-SHH和ATRT-MYC亚群的小鼠模型 |
| 1570 | 2024-08-09 |
Transcriptional profiling of microglia; current state of the art and future perspectives
2020-04, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23767
PMID:31846124
|
综述 | 本文综述了微胶质细胞转录组学领域的最新进展，并比较了新鲜和冷冻样本中细胞和核转录组的差异 | 介绍了单核RNA测序技术在冷冻中枢神经系统组织中的应用，以及其在研究微胶质细胞基因表达和细胞异质性中的可靠性 | NA | 探讨微胶质细胞在神经病理学中的作用 | 微胶质细胞的转录组学特征 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类的中枢神经系统组织样本 |
| 1571 | 2024-08-09 |
Investigation of Antigen-Specific T-Cell Receptor Clusters in Human Cancers
2020-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-3249
PMID:31831563
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研究论文 | 本研究利用TRUST算法和iSMART方法，从9,700个肿瘤RNA测序样本中组装TCR超变CDR3区域，并进行综合分析，以揭示癌症相关T细胞和新型癌症抗原 | 开发了iSMART计算方法来将相似的TCR分组为抗原特异性集群，并首次通过综合分析HLA等位基因和基因组数据，识别出候选的癌症/睾丸基因HSFX1 | NA | 旨在从肿瘤基因组测序数据中识别抗原特异性TCR | 癌症抗原特异性T细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 9,700个肿瘤样本 |
| 1572 | 2024-08-09 |
Single-cell and spatial transcriptomics approaches of the bone marrow microenvironment
2020-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000602
PMID:31833957
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综述 | 本文综述了利用单细胞和空间转录组学技术在稳态、应激和癌症诱导重塑过程中对小鼠骨髓微环境的研究主要发现 | 首次系统且无标签地识别了骨髓细胞类型，揭示了其分子和空间特征，并阐明了关键造血因子的细胞来源 | NA | 深入探索小鼠和人类骨髓微环境中的细胞类型及其分子身份和定位 | 骨髓微环境中的细胞类型及其在稳态、应激和癌症诱导重塑过程中的变化 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1573 | 2024-08-09 |
Time-Series Single-Cell RNA-Seq Data Reveal Auxin Fluctuation during Endocycle
2020-Feb-01, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcz228
PMID:31841158
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研究论文 | 本研究重新分析了根部的单细胞转录组数据，重建了有丝分裂细胞周期和内复制周期的细胞周期轨迹，揭示了生长素在内复制周期中的动态波动。 | 首次揭示了生长素在内复制周期中的动态波动，并展示了这种波动在维持内复制阶段中的作用。 | NA | 探究生长素在内复制周期中的作用及其维持机制。 | 拟南芥中的细胞周期调控。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1574 | 2024-08-09 |
Neurological Disorder Drug Discovery from Gene Expression with Tensor Decomposition
2020, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于张量分解的策略，用于从基因表达数据中发现神经疾病药物候选化合物 | 本文采用了张量分解（TD）进行无监督特征提取，以筛选出在阿尔茨海默病模型动物实验中表达改变的基因，并与人类细胞系中药物处理后的基因表达进行比较 | NA | 旨在通过基因表达数据识别神经疾病患者的有效候选药物化合物，以缩短寻找有效治疗的时间并改善治疗结果 | 神经疾病患者的基因表达数据及药物候选化合物 | 生物信息学 | 神经疾病 | 张量分解（TD） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 401个基因在阿尔茨海默病模型动物实验中被筛选出 |
| 1575 | 2024-08-09 |
A developmental landscape of 3D-cultured human pre-gastrulation embryos
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1875-y
PMID:31830756
|
研究论文 | 本文报道了一种三维（3D）囊胚培养系统，能够支持人类囊胚发育至原条形成阶段 | 开发了一种新的三维培养系统，模拟了人类胚胎在体内的发育标志和三维结构 | NA | 探究人类胚胎在原肠形成前的发育过程，包括空间自我组织和细胞类型发育 | 人类早期胚胎的发育过程 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1576 | 2024-08-09 |
Loss of ADAMTS19 causes progressive non-syndromic heart valve disease
2020-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-019-0536-2
PMID:31844321
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研究论文 | 本文通过全外显子测序和基因敲除小鼠模型，揭示了ADAMTS19基因突变与渐进性非综合征性心脏瓣膜疾病之间的关系 | 首次发现ADAMTS19基因的截短无义突变是导致渐进性心脏瓣膜疾病的原因，并通过基因敲除小鼠模型验证了其病理机制 | NA | 研究ADAMTS19基因在心脏瓣膜疾病中的作用及其分子机制 | ADAMTS19基因及其在心脏瓣膜疾病中的功能 | NA | 心脏瓣膜疾病 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 两个近亲家族中的四名受影响成员及Adamts19基因敲除小鼠 |
| 1577 | 2024-08-09 |
Identification of differentially expressed genes by single-cell transcriptional profiling of umbilical cord and synovial fluid mesenchymal stem cells
2020-01, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.14891
PMID:31845522
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了人脐带源性间充质干细胞（hUC-MSCs）和人滑膜液源性间充质干细胞（hSF-MSCs）的异质性 | 本研究首次通过scRNA-seq技术详细分析了hUC-MSCs和hSF-MSCs的转录组特征，并识别了多个亚群及其差异表达基因 | NA | 测量人脐带源性间充质干细胞和人滑膜液源性间充质干细胞的异质性 | 人脐带源性间充质干细胞（hUC-MSCs）和人滑膜液源性间充质干细胞（hSF-MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | hUC-MSCs样本有104,761,163条读取，hSF-MSCs样本有6,577,715条读取 |
| 1578 | 2024-08-09 |
Dissecting the human immune system with single cell RNA sequencing technology
2020-04, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.5MR1019-179R
PMID:31803960
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在解析人类免疫系统中的最新进展和挑战 | 单细胞RNA测序技术能够分析单个细胞的转录组，特别适合解析免疫细胞的异质性 | 文章提到了单细胞RNA测序技术在免疫学应用中需要克服的潜在障碍 | 促进对人类免疫学的理解 | 人类免疫系统 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1579 | 2024-08-09 |
SpaCell: integrating tissue morphology and spatial gene expression to predict disease cells
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz914
PMID:31808789
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaCell的用户友好型深度学习软件，该软件能够整合组织形态学和空间基因表达数据，以预测疾病细胞 | SpaCell软件创新地整合了数百万像素强度值与数千个基因表达测量数据，提高了细胞类型识别和组织图像标签预测的分辨率和准确性 | NA | 开发一种能够整合组织形态学和空间基因表达数据以预测疾病细胞的深度学习软件 | 组织形态学和空间基因表达数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学(ST) | 深度学习模型 | 图像和基因表达数据 | NA |
| 1580 | 2024-08-09 |
FLASH Irradiation Spares Lung Progenitor Cells and Limits the Incidence of Radio-induced Senescence
2020-03-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1440
PMID:31796518
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研究论文 | 研究FLASH照射对肺祖细胞的保护作用及其减少放射诱导衰老的效果 | FLASH照射技术能特异性地保护正常组织免受晚期放射诱导毒性的影响，减少DNA损伤和复制性衰老的风险 | FLASH照射的有益效果在缺乏端粒酶活性的Terc-/-小鼠中消失，表明其效果依赖于正常的端粒酶功能 | 探讨FLASH照射与传统放射治疗相比，在减少正常细胞DNA损伤和保护肺祖细胞方面的效果 | 使用C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠以及人肺细胞进行体外研究 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（sc-RNA-Seq） | NA | RNA | C57BL/6J野生型和Terc-/-小鼠，以及人肺细胞 |