单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1541 - 1560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1541 | 2024-08-09 |
Recovery of viable endocrine-specific cells and transcriptomes from human pancreatic islet-engrafted mice
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901022RR
PMID:31914605
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研究论文 | 本文开发了一种从人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠中恢复活细胞的方法，并进行了功能和激素特异性转录组分析 | 首次实现了从移植后的小鼠中恢复活细胞，并进行了单细胞RNA测序和体外葡萄糖刺激胰岛素分泌实验 | 恢复的胰岛细胞产量相对较低 | 研究人胰腺胰岛移植后的细胞特性和功能 | 人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠后的活细胞和转录组 | NA | 糖尿病 | RNA测序 | 单细胞RNA测序 | 细胞 | NA |
| 1542 | 2024-08-09 |
Lineage specification and pluripotency revealed by transcriptome analysis from oocyte to blastocyst in pig
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901818RR
PMID:31914626
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了从卵母细胞到猪早期囊胚的转录组，揭示了细胞谱系特化和多能性的分子特征 | 首次展示了猪早期胚胎中原始多能性特征的存在，并描述了X染色体剂量补偿的动态变化 | NA | 探讨猪早期胚胎发育中的细胞谱系特化和多能性 | 猪从卵母细胞到早期囊胚的早期胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从卵母细胞到早期囊胚的多个猪早期胚胎样本 |
| 1543 | 2024-08-09 |
Tracheal brush cells release acetylcholine in response to bitter tastants for paracrine and autocrine signaling
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901314RR
PMID:31914675
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研究论文 | 本文研究了气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制，及其在旁分泌和自分泌信号传导中的作用 | 首次直接证明了气管刷状细胞在苦味物质刺激下释放乙酰胆碱，并揭示了这一过程在自分泌和旁分泌信号传导中的调节机制 | NA | 探讨气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制及其在免疫反应中的作用 | 气管刷状细胞、苦味受体激动剂、乙酰胆碱释放 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠气管刷状细胞 |
| 1544 | 2024-08-09 |
Differential excitatory vs inhibitory SCN expression at single cell level regulates brain sodium channel function in neurodevelopmental disorders
2020-Jan, European journal of paediatric neurology : EJPN : official journal of the European Paediatric Neurology Society
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.ejpn.2019.12.019
PMID:31928904
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类和小鼠中电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式，揭示了这些通道在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达，及其在神经发育障碍中的潜在作用 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了SCN1/2/3/8A在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达，与之前的低分辨率RNA筛选结果形成对比 | NA | 探讨电压门控钠通道在神经发育障碍中的作用机制 | 电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的样本 |
| 1545 | 2024-08-09 |
Simultaneous Measurement of Surface Proteins and Gene Expression from Single Cells
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0266-9_3
PMID:31933196
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CITE-seq的新方法，该方法能够同时从单个细胞中测量表面蛋白和基因表达 | CITE-seq方法结合了单细胞测序技术和寡核苷酸标记的抗体，实现了对细胞表面蛋白和基因表达的同步测量 | NA | 开发一种能够同时测量单细胞表面蛋白和基因表达的新技术 | 单细胞的表面蛋白和基因表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单个细胞 |
| 1546 | 2024-08-09 |
Analysis of Transcriptional Profiling of Immune Cells at the Single-Cell Level
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0266-9_4
PMID:31933197
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研究论文 | 本文介绍了如何将10× genomics 5'V(D)J免疫细胞分析流程生成的单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中 | 单细胞测序技术揭示了免疫细胞先前未知的多样性和特异性 | NA | 研究如何将单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中 | 免疫细胞的转录组 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 1547 | 2024-08-09 |
Decoding the development of the human hippocampus
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1917-5
PMID:31942070
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和ATAC-seq分析技术，揭示了人类海马体发育过程中的细胞类型、细胞谱系、分子特征和转录调控 | 首次通过多组学数据揭示了人类海马体发育的转录调控网络，并比较了人类和鼠类海马体的基因表达差异 | NA | 理解人类海马体的发育过程及其相关疾病 | 人类海马体在妊娠16-27周的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 30,416个细胞 |
| 1548 | 2024-08-09 |
B cells and tertiary lymphoid structures promote immunotherapy response
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1922-8
PMID:31942075
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研究论文 | 本文通过RNA测序和计算方法研究了B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断（ICB）治疗反应中的作用 | 首次详细探讨了B细胞在ICB治疗反应中的作用，并发现B细胞标志物在响应者肿瘤中差异表达 | 研究主要基于RNA测序和计算方法，可能需要进一步的实验验证 | 探讨B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断治疗反应中的作用 | B细胞和三级淋巴结构在ICB治疗中的功能和潜在作用 | 肿瘤学 | 黑色素瘤，肾细胞癌 | RNA测序，MCP-counter计算方法，质谱流式细胞术 | NA | RNA | 多个ICB治疗的患者群体，包括黑色素瘤和肾细胞癌患者 |
| 1549 | 2024-08-09 |
Allergen-specific IgG+ memory B cells are temporally linked to IgE memory responses
2020-07, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2019.11.046
PMID:31883847
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研究论文 | 本研究探讨了黏膜过敏原暴露后IgE记忆反应的细胞和克隆起源 | 首次证明了在黏膜过敏原暴露下，人类IgE记忆存在于过敏原特异性的IgG+记忆B细胞中，这些细胞能迅速转换同种型，扩展为短寿命的IgE+浆母细胞，并作为治疗干预的潜在目标 | NA | 研究黏膜过敏原暴露后IgE记忆反应的细胞和克隆起源 | 季节性过敏性鼻炎成年患者的PBMCs和鼻活检样本 | 免疫学 | 过敏性鼻炎 | 重链可变基因序列分析，单细胞转录组学 | NA | RNA | 40名季节性过敏性鼻炎成年患者 |
| 1550 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals alginate oligosaccharides preventing chemotherapy-induced mucositis
2020-05, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-019-0248-z
PMID:31900405
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了海藻酸寡糖（AOS）预防化疗引起的肠道黏膜炎的作用 | 首次在单细胞水平上研究了AOS对化疗引起的肠道黏膜炎的保护作用，并通过深度分析揭示了AOS通过调节转录因子表达来改善肠道功能 | NA | 研究AOS在单细胞水平上预防化疗引起的肠道黏膜炎的作用 | 海藻酸寡糖（AOS）对化疗引起的肠道黏膜炎的保护作用 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1551 | 2024-08-09 |
Identification of key genes and pathways in abdominal aortic aneurysm by integrated bioinformatics analysis
2020-Apr, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/0300060519894437
PMID:31885343
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研究论文 | 通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别与腹主动脉瘤相关的关键基因和通路 | 发现了四个新的与腹主动脉瘤相关的主要基因，这些基因在已知的动脉瘤基因数据库中未被记录 | NA | 识别与腹主动脉瘤发病机制和进展相关的关键基因，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 腹主动脉瘤的关键基因和生物通路 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 507个上调基因和842个下调基因 |
| 1552 | 2024-08-09 |
Bulk and single cell transcriptomic data indicate that a dichotomy between inflammatory pathways in peripheral blood and arthritic joints complicates biomarker discovery
2020-03, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2019.154960
PMID:31881419
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研究论文 | 本研究通过整合分析基因表达微阵列数据和单细胞RNA测序数据，探讨了类风湿性关节炎（RA）中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异，以及这种差异对生物标志物发现的影响。 | 本研究首次通过大规模和单细胞转录组数据分析，揭示了周围血液和关节炎关节中炎症通路的差异，为生物标志物的发现提供了新的视角。 | 研究主要基于RA患者和健康对照的数据，未涵盖其他类型的关节炎，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨类风湿性关节炎中炎症通路在周围血液和关节炎关节中的差异，以及这种差异对生物标志物发现的影响。 | 类风湿性关节炎患者的滑膜、全血细胞、外周血单个核细胞和CD4+ T细胞，以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 基因表达微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括RA患者和健康对照的多个样本类型，以及抗原诱导关节炎小鼠模型的外周血和全关节。 |
| 1553 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing in hematology
2020-03, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000000613
PMID:31895120
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综述 | 本文综述了通过新型单细胞方法在造血作用和血液系统恶性肿瘤方面取得的最新关键见解，特别关注通过单细胞分辨率研究髓系恶性肿瘤中的干细胞/祖细胞所获得的生物学见解。 | 近年来，单细胞水平的RNA、DNA和蛋白质表达分析新技术大量涌现，提供了前所未有的细胞异质性洞察。 | 传统的批量遗传分析可能会掩盖肿瘤内异质性的关键方面，这些异质性是治疗抵抗和克隆进化的关键疾病事件的基础。 | 探讨单细胞技术在血液系统癌症患者管理中的当前和潜在未来应用。 | 造血作用和血液系统恶性肿瘤中的干细胞/祖细胞。 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | RNA, DNA, 蛋白质表达 | NA |
| 1554 | 2024-08-09 |
Accurate detection of mosaic variants in sequencing data without matched controls
2020-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0368-8
PMID:31907404
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MosaicForecast的机器学习方法，用于在无匹配对照的测序数据中准确检测嵌合变异 | MosaicForecast利用基于读取的相位和读取级别特征，与现有算法相比，显著提高了检测嵌合单核苷酸变异和插入缺失的特异性 | NA | 开发一种新的方法来检测嵌合体突变，并探讨其在疾病起源和发展中的作用 | 人类大脑全基因组测序数据中的嵌合单核苷酸变异和插入缺失 | 机器学习 | NA | 单细胞测序和靶向测序 | 机器学习方法 | 测序数据 | 人类大脑全基因组测序数据 |
| 1555 | 2024-08-09 |
Inhibition of lysine-specific histone demethylase 1A results in meiotic aberration during oocyte maturation in vitro in goats
2020-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术探讨山羊卵母细胞体外成熟过程中组蛋白去甲基化酶LSD1的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了山羊卵母细胞成熟过程中LSD1的功能及其对卵母细胞成熟的影响 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的体内实验验证 | 探讨组蛋白甲基化在山羊卵母细胞成熟中的作用机制 | 山羊的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4516个差异表达基因 |
| 1556 | 2024-08-09 |
Critical Role of Cytosolic DNA and Its Sensing Adaptor STING in Aortic Degeneration, Dissection, and Rupture
2020-01-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了细胞质DNA及其感应适配器STING在主动脉退化、撕裂和破裂中的关键作用 | 首次揭示了细胞质DNA和STING信号通路在主动脉退化和散发型主动脉夹层形成中的关键机制 | NA | 识别驱动主动脉退化的机制，以开发有效的药物治疗预防疾病进展 | 主动脉平滑肌细胞和巨噬细胞中的细胞质DNA及STING通路的激活 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 组织样本 | 来自散发型升主动脉夹层患者的主动脉组织样本及Stinggt/gt小鼠模型 |
| 1557 | 2024-08-09 |
Arterial Sca1+ Vascular Stem Cells Generate De Novo Smooth Muscle for Artery Repair and Regeneration
2020-01-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.11.010
PMID:31883835
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研究论文 | 本文通过细胞命运图谱和单细胞RNA测序技术，识别了动脉壁外膜层的Sca1血管干细胞（VSCs），并研究了其在严重损伤后迁移至中膜层并生成新的平滑肌细胞（SMCs）的过程。 | 首次提供了遗传学证据，证明Sca1 VSCs能够生成SMCs，并在血管修复中发挥关键作用。 | NA | 研究血管干细胞在动脉修复和再生中的作用。 | 动脉壁中的Sca1血管干细胞及其在损伤后的行为。 | NA | NA | 细胞命运图谱，单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1558 | 2024-08-09 |
Outer Radial Glia-like Cancer Stem Cells Contribute to Heterogeneity of Glioblastoma
2020-01-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.11.015
PMID:31901251
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学创建了胶质母细胞瘤肿瘤细胞图谱，并发现肿瘤内存在多种癌症干细胞（GSC）亚型，其中包括类似外侧放射状胶质细胞（oRG）的侵袭性细胞群。 | 首次发现胶质母细胞瘤中的oRG样细胞表现出特征性的有丝分裂体细胞转移行为，并揭示了PTPRZ1在有丝分裂体细胞转移和胶质母细胞瘤侵袭中的作用。 | NA | 旨在揭示胶质母细胞瘤异质性的驱动因素及其与肿瘤侵袭的关系。 | 胶质母细胞瘤及其癌症干细胞亚型。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1559 | 2024-08-09 |
Single-cell Digital Twins for Cancer Preclinical Investigation
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0159-4_15
PMID:31893381
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞通量平衡分析（scFBA）的新计算框架，旨在建立数字代谢双胞胎，以更好地利用实验室患者细胞模型 | 提出了scFBA框架，能够量化单细胞水平的通量，并结合单细胞RNA-seq数据，描绘单细胞代谢表型，并识别代谢亚群 | 目前仅限于描述细胞样本中的总体通量分布，忽略了可能的异质性行为 | 旨在通过量化单细胞水平的通量来分层癌症异质性亚群 | 癌症异质性亚群的代谢表型 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq | scFBA | 单细胞数据 | 未具体说明 |
| 1560 | 2024-08-09 |
Neuron-glia interaction through Serotonin-BDNF-NGFR axis enables regenerative neurogenesis in Alzheimer's model of adult zebrafish brain
2020-01, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000585
PMID:31905199
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，揭示了在阿尔茨海默病模型中，血清素-脑源性神经营养因子-神经生长因子受体轴在成年斑马鱼大脑神经再生中的作用 | 发现了血清素通过下调脑源性神经营养因子的表达抑制神经干细胞增殖，而脑源性神经营养因子通过神经生长因子受体A/核因子κB信号增强神经干细胞可塑性和神经发生 | 研究仅在斑马鱼模型中进行，尚未在哺乳动物模型中验证 | 探讨阿尔茨海默病中神经再生的分子机制 | 成年斑马鱼大脑中的神经干细胞和神经发生 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼大脑样本 |