单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1501 - 1520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1501 | 2024-08-09 |
Chromatin mapping and single-cell immune profiling define the temporal dynamics of ibrutinib response in CLL
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14081-6
PMID:31996669
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研究论文 | 本研究通过结合免疫表型分析、单细胞转录组测序和染色质图谱，分析了慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者在接受伊布替尼治疗期间的时间动态变化 | 研究揭示了伊布替尼治疗CLL的细胞和分子层面的时间依赖性效应，并建立了一种基于表观基因组/转录组的治疗监测方法 | NA | 定义伊布替尼治疗CLL的潜在调控动态 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者 | NA | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序，染色质图谱 | NA | 基因表达数据，染色质数据 | 多个CLL患者样本 |
| 1502 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14171-5
PMID:31996681
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析和抗体筛选，识别CD44作为内皮细胞向造血细胞转变（EHT）的标记物和调节因子 | 首次确定CD44作为EHT的标记物，并证明通过抑制CD44与其配体透明质酸的相互作用可以阻断EHT | NA | 阐明内皮细胞向造血细胞转变过程中的中间步骤和相关细胞的身份 | 内皮细胞向造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的转变过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1503 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional diversity is a hallmark of developmental potential
2020-01-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aax0249
PMID:31974247
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据，开发了一种计算框架CytoTRACE，用于预测细胞分化状态 | 提出了一种新的计算框架CytoTRACE，用于从单细胞RNA测序数据中预测分化状态，并在多种组织类型和生物体中表现优于先前方法 | NA | 研究细胞分化潜力及其在不同组织和生物体中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | RNA测序数据 | 近19,000个注释基因集和52个实验确定的发育轨迹 |
| 1504 | 2024-08-09 |
scMAGeCK links genotypes with multiple phenotypes in single-cell CRISPR screens
2020-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1928-4
PMID:31980032
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMAGeCK的计算框架，用于在单细胞CRISPR筛选中识别与多种表达型表型相关的基因组元件 | scMAGeCK超越现有方法，能够识别与细胞增殖相关的已知和新功能基因及增强子，并实现基因型-表型网络的无偏构建 | NA | 研究基因型与表型之间的关系 | 单细胞CRISPR筛选中的基因组元件 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因组数据, 表达数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 1505 | 2024-08-09 |
Cellular diversity and lineage trajectory: insights from mouse single cell transcriptomes
2020-01-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.179788
PMID:31980483
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析小鼠胚胎发育中的细胞多样性和谱系轨迹方面的应用 | 文章介绍了单细胞技术与计算方法的最新进展，这些方法能够在没有明确引入遗传标记的情况下推断细胞的分化谱系 | 分析和解释这些多组学数据仍面临挑战，需要进一步的方法学发展 | 探讨单细胞实验和计算方法在小鼠胚胎发育研究中的应用，并强调其在细胞身份、多样性和谱系分化方面的关键见解 | 小鼠胚胎发育中的细胞多样性和谱系轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 大量单细胞样本 |
| 1506 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals new evolutionary complexity in uveal melanoma
2020-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14256-1
PMID:31980621
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了8个原发性和3个转移性葡萄膜黑色素瘤样本中的59,915个肿瘤和非瘤细胞，揭示了肿瘤细胞的新亚克隆基因组复杂性和转录状态，以及肿瘤浸润免疫细胞的先前未被识别的多样性。 | 发现了葡萄膜黑色素瘤中肿瘤细胞的新亚克隆基因组复杂性和转录状态，以及肿瘤浸润免疫细胞的多样性，特别是CD8 T细胞主要表达LAG3而不是PD1或CTLA4。 | NA | 探究葡萄膜黑色素瘤的肿瘤微环境，并寻找潜在的免疫治疗靶点。 | 葡萄膜黑色素瘤的原发性和转移性样本中的肿瘤和非瘤细胞。 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 59,915个肿瘤和非瘤细胞，来自8个原发性和3个转移性样本 |
| 1507 | 2024-08-09 |
Snake Venom Gland Organoids
2020-01-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.11.038
PMID:31978343
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研究论文 | 本研究建立了来自多种蛇类的长期扩展的毒腺类器官，并利用单细胞RNA测序分析了这些类器官和原始组织的细胞类型。 | 首次将类器官技术扩展到爬行动物的组织，并描述了一个实验上可操作的蛇毒腺模型系统。 | NA | 扩展类器官技术至爬行动物组织，并建立蛇毒腺的实验模型。 | 蛇毒腺类器官及其细胞类型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种蛇类的毒腺组织 |
| 1508 | 2024-08-09 |
Multiplexed Single Cell mRNA Sequencing Analysis of Mouse Embryonic Cells
2020-01-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/60647
PMID:31984954
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研究论文 | 本文使用基于液滴的scRNA-Seq方法，以心脏为例，展示了如何对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 本文将两种策略整合到工作流程中，以在单次实验中同时分析多个样本，并成功同时分析了来自八个心脏样本的9,000多个细胞 | NA | 展示如何使用基于液滴的scRNA-Seq方法对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 小鼠胚胎组织细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-Seq | NA | mRNA | 9,000多个细胞，来自八个心脏样本 |
| 1509 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics from human pancreatic islets: sample preparation matters
2020, Biology methods & protocols
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/biomethods/bpz019
PMID:31984226
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研究论文 | 本文通过比较四种不同的样本处理策略对新鲜胰岛样本的单细胞RNA测序数据的影响，探讨了样本准备对研究结果的重要性。 | 首次详细比较了不同样本处理方法对人类胰岛单细胞RNA测序数据的影响，强调了样本处理方法在单细胞研究中的重要性。 | 研究仅限于胰岛组织，可能需要进一步研究其他类型组织以验证结论的普遍性。 | 评估不同样本准备协议对新鲜胰岛样本单细胞RNA测序数据的可能影响。 | 人类胰岛组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两个捐赠者的新鲜胰岛样本 |
| 1510 | 2024-08-09 |
Microglia response following acute demyelination is heterogeneous and limits infiltrating macrophage dispersion
2020-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aay6324
PMID:31998844
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研究论文 | 本研究通过基因标记和单细胞RNA测序技术，探讨了急性脱髓鞘后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相互作用 | 揭示了小胶质细胞在限制浸润巨噬细胞扩散中的新作用，并提出这可能是中枢神经系统维持其“免疫特权”状态的一种先前未被识别的机制 | NA | 研究中枢神经系统损伤后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相对贡献 | 小胶质细胞和浸润巨噬细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1511 | 2024-08-09 |
Preparation of single cells from tumors for single-cell RNA sequencing
2020, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.05.057
PMID:32000902
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研究论文 | 本文描述了一种从人类肿瘤样本中生成单细胞悬浮液的协议，该协议已针对单细胞RNA测序进行了优化 | 提出了一个优化的单细胞RNA测序样本准备协议，旨在最大化细胞活力并最小化可能影响下游分析的细胞应激因素 | 样本准备过程如果执行不当，可能会产生误导性结果 | 优化单细胞RNA测序的样本准备过程 | 人类肿瘤样本中的单细胞悬浮液 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 1512 | 2024-08-09 |
Liquid Biopsy Based Single-Cell Transcriptome Profiling Characterizes Heterogeneity of Disseminated Tumor Cells from Lung Adenocarcinoma
2020-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201900224
PMID:31960581
|
研究论文 | 本文利用高通量单细胞转录组测序技术和稀有DTC富集方法，解析了来自肺腺癌的恶性胸腔积液（MPE）中DTCs的异质性和独特的分子特征 | 首次使用单细胞转录组测序技术研究液体活检中的DTCs异质性，并识别出19个肿瘤特异性标记物 | 研究仅限于肺腺癌的恶性胸腔积液样本，未涉及其他类型的癌症或样本 | 解析肿瘤细胞的异质性及其分子机制 | 肺腺癌中的扩散肿瘤细胞（DTCs） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 8213个来自恶性胸腔积液的细胞 |
| 1513 | 2024-08-09 |
Progress and applications of single-cell sequencing techniques
2020-06, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2020.104198
PMID:31958516
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综述 | 本文主要总结了单细胞测序技术的方法及其应用领域 | NA | NA | 总结单细胞测序技术的方法和应用领域，为其未来在临床上的应用提供潜在参考 | 单细胞测序技术的方法及其在胚胎和器官发育、免疫系统、癌症进展、寄生虫和传染病以及干细胞研究、抗体筛选和治疗研究开发等领域的应用 | NA | NA | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组和表观基因组 | NA |
| 1514 | 2024-08-09 |
Surfactant Expression Defines an Inflamed Subtype of Lung Adenocarcinoma Brain Metastases that Correlates with Prolonged Survival
2020-05-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-2184
PMID:31953311
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研究论文 | 研究通过量化肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）并分析其与肺腺癌脑转移的关系，揭示了表面活性剂代谢相关基因表达与免疫微环境及患者生存期的关联 | 首次发现表面活性剂代谢相关基因（SFTPA1, SFTPB, NAPSA）的高表达与肺腺癌脑转移的炎症亚型相关，这种亚型具有高密度的TIL和较长的生存期 | 研究样本量有限，且仅分析了部分患者的转录组数据 | 深入理解免疫系统与脑转移之间的相互作用，为这种致命疾病提供新的治疗选择 | 肺腺癌脑转移患者的肿瘤浸润淋巴细胞及表面活性剂代谢相关基因表达 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 81例肺腺癌脑转移患者，其中63例进行了转录组分析 |
| 1515 | 2024-08-09 |
Enhancing Hematopoiesis from Murine Embryonic Stem Cells through MLL1-Induced Activation of a Rac/Rho/Integrin Signaling Axis
2020-02-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.12.009
PMID:31951812
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研究论文 | 本文开发了一种可诱导MLL1的胚胎干细胞系统，并展示了在胚胎干细胞分化过程中诱导野生型MLL1能够选择性地增加胚胎体和胚胎中造血潜能的过渡性c-Kit/Cd41群体 | 本文首次展示了MLL1通过增强Rac/Rho/整合素信号状态，而非增加Hox或其他经典MLL1靶点，来促进造血承诺 | 由于缺乏生理模型系统，MLL1蛋白是否限制HSC发育尚不清楚 | 研究MLL1在造血干细胞发育中的作用及其机制 | 小鼠胚胎干细胞和造血干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 涉及小鼠胚胎干细胞和造血干细胞群体 |
| 1516 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of Trypanosoma brucei from tsetse salivary glands unveils metacyclogenesis and identifies potential transmission blocking antigens
2020-02-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914423117
PMID:31964820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从感染的采采蝇唾液腺中收集的2,045个寄生虫样本中，揭示了非洲锥虫的metacyclogenesis过程及其潜在的阻断传播抗原 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细揭示了非洲锥虫在采采蝇唾液腺中的发育过程，并识别了可能的阻断传播抗原 | 需要进一步研究Fam10家族蛋白作为潜在的锥虫传播阻断疫苗抗原 | 深入理解非洲锥虫在采采蝇唾液腺中的发育过程，并寻找阻断传播的潜在抗原 | 非洲锥虫及其在采采蝇唾液腺中的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2,045个寄生虫样本 |
| 1517 | 2024-08-09 |
Single-cell RNAseq analysis of testicular germ and somatic cell development during the perinatal period
2020-02-03, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.183251
PMID:31964773
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠围产期睾丸生殖细胞和体细胞的发育过程 | 研究首次识别了三个时间上不同的ProSG细胞亚群，包括一个迁移细胞群，其转录组与先前定义的T1-和T2-ProSG阶段不同 | NA | 研究睾丸生殖细胞和体细胞在围产期的发育过程 | 小鼠围产期的ProSG细胞及其后代和睾丸体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1518 | 2024-08-09 |
Tracking the important role of JUNB in hepatocellular carcinoma by single-cell sequencing analysis
2020-Feb, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2019.11235
PMID:31966074
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了JUNB在肝细胞癌（HCC）中的重要作用 | 首次揭示了JunB原癌基因在HCC的免疫反应和进展中的作用 | 研究仅基于一个HCC肿瘤样本和两个HCC细胞系，样本量较小 | 旨在揭示HCC发展和进展的潜在机制 | 肝细胞癌（HCC）及其相关细胞和免疫反应 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 一个HCC肿瘤样本，两个HCC细胞系和正常外周血单个核细胞 |
| 1519 | 2024-08-09 |
Chromosome segregation error during early cleavage in mouse pre-implantation embryo does not necessarily cause developmental failure after blastocyst stage
2020-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-57817-x
PMID:31965014
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研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单个囊胚移植评估了早期卵裂阶段染色体分离错误与发育之间的关系 | 首次展示了早期染色体分离错误导致的微核形成并不一定会导致囊胚阶段后的发育失败 | 研究仅限于体外受精获得的鼠胚胎，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期卵裂阶段染色体分离错误对胚胎发育的影响 | 鼠的早期植入前胚胎 | NA | NA | 活细胞成像，单细胞测序 | NA | 图像，序列数据 | 使用了通过体外受精获得的鼠胚胎进行实验 |
| 1520 | 2024-08-09 |
Memory B Cell Activation, Broad Anti-influenza Antibodies, and Bystander Activation Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2020-01-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.12.063
PMID:31968262
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学、纵向抗体谱系测序和抗体结合测量，研究了流感疫苗接种后的抗体反应的分子和细胞特征 | 揭示了记忆B细胞激活的程序，包括CD11c和T-bet表达，与克隆扩增和分化为效应功能相关，并发现了流感疫苗接种引发的非特异性旁观者抗体激活 | NA | 探讨抗体记忆反应中转录程序、细胞增殖和抗原特异性抗体产生的协调机制 | 记忆B细胞的激活、抗体克隆的广谱性和旁观者激活 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |