单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
PMID:32702314
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研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病小鼠模型中，淀粉样斑块周围的转录变化 | 提供了一种前所未有的方法，通过空间转录组学分析解开阿尔茨海默病及其他脑部疾病致病标志物附近的失调细胞网络 | 该研究主要基于小鼠模型，临床应用可能受限 | 探讨阿尔茨海默病相关的分子变化和细胞相互作用 | 以阿尔茨海默病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学和原位测序 | NA | 组织样本 | 涉及小鼠和人类脑切片 |
| 122 | 2024-08-05 |
Efficient Generation and Transcriptomic Profiling of Human iPSC-Derived Pulmonary Neuroendocrine Cells
2020-May-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101083
PMID:32380423
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研究论文 | 本研究展示了如何通过诱导性多能干细胞生成肺神经内分泌细胞，并进行了转录组特征分析 | 本研究首次利用诱导性多能干细胞生成并表征肺神经内分泌细胞，提供了全新的细胞模型 | 该研究未在临床样本中验证生成的细胞功能 | 研究肺神经内分泌细胞的发生和其在肺部疾病中的作用 | 诱导性多能干细胞衍生的肺神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | iPNECs | 转录组数据 | NA |
| 123 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics inferred from pathology whole-slide images links tumor heterogeneity to survival in breast and lung cancer
2020-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75708-z
PMID:33139755
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研究论文 | 本文介绍了一种利用数字病理全切片图像进行空间转录组分析的方法，以连接肿瘤异质性与乳腺癌和肺癌的生存率 | 提出了一种新的方法，通过深度学习模型在病理全切片图像上空间解析mRNA和miRNA表达水平，并构建异质性指数(HTI) | 现有分析方法需要大量训练样本和复杂的流程，而我们的模型在样本数量较少的情况下仍显示了良好的性能 | 研究肿瘤异质性及其对生存的影响，以改善癌症的诊断和治疗 | 研究了乳腺癌和肺癌样本中的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 乳腺癌，肺癌 | 深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | 使用了来自两个癌症队列的少量训练样本 |
| 124 | 2024-08-05 |
Targeted therapy guided by single-cell transcriptomic analysis in drug-induced hypersensitivity syndrome: a case report
2020-02, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0733-7
PMID:31959990
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案例报告 | 该文章通过单细胞转录组分析指导靶向治疗药物诱导的超敏反应综合症的案例 | 提出通过单细胞RNA测序识别JAK-STAT信号通路作为潜在靶点，实现个性化治疗 | 临床应用的限制和对复杂人类病理生理理解的不充分 | 探讨药物诱导的超敏反应综合症的治疗策略 | 一名难治性药物诱导的超敏反应综合症患者 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和皮肤样本 | 一名患者的样本 |
| 125 | 2024-08-05 |
Clonal kinetics and single-cell transcriptional profiling of CAR-T cells in patients undergoing CD19 CAR-T immunotherapy
2020-01-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13880-1
PMID:31924795
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研究论文 | 本文探讨了在接受CD19 CAR-T免疫治疗的患者中，CAR-T细胞的克隆动力学和转录组特征 | 本研究揭示了CAR-T细胞在输注后如何受到转录程序的调控，特别关注了细胞的克隆多样性及其对抗肿瘤反应的影响 | 尽管发现了克隆动力学的不同模式，但整合位点并未被确认作为克隆动力学的主要驱动因素 | 研究CAR-T细胞在输注后行为的转录程序及其克隆动力学 | 研究重点是CD8 CAR-T细胞，包括输注产品和患者的血液样本 | 数字病理学 | B细胞恶性肿瘤 | TCRB测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 研究涉及的样本包括输注产品和接受治疗患者的血液样本 |
| 126 | 2024-08-05 |
Cancer cells deploy lipocalin-2 to collect limiting iron in leptomeningeal metastasis
2020-07-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz2193
PMID:32675368
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研究论文 | 本研究探讨了癌细胞如何在脑脊液中利用脂质载体蛋白-2来克服微环境限制以收集铁。 | 揭示了癌细胞在脑膜转移中的生存机制，尤其是脂质载体蛋白-2在铁代谢中的作用。 | 该研究的样本量相对较小，仅包含五位患者的脑脊液样本。 | 研究脑膜转移癌细胞如何在不利的微环境中生存和发展。 | 研究对象为脑脊液中存在的癌细胞及其相应的微环境。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 五位脑膜转移患者的脑脊液样本 |
| 127 | 2024-08-05 |
Rate of replenishment and microenvironment contribute to the sexually dimorphic phenotype and function of peritoneal macrophages
2020-06-19, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abc4466
PMID:32561560
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研究论文 | 本研究探讨了性别和年龄对小鼠腹膜巨噬细胞的分化、更新和功能的影响 | 揭示了性别依赖的腹膜巨噬细胞更新速率与局部微环境信号之间的关系 | 研究主要集中于小鼠模型，结果是否适用于其他物种尚不清楚 | 理解性别和年龄如何影响腹膜巨噬细胞的行为和功能 | 小鼠模型中的腹膜巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 多个小鼠样本 |
| 128 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic analysis of allergen-specific T cells in allergy and asthma
2020-06-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba6087
PMID:32532832
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研究论文 | 该文章分析了在过敏和哮喘中对常见过敏原反应的CD4 T细胞和调节性T细胞的单细胞转录组。 | 首次实现了对特定过敏原反应的T细胞进行直接、无偏见的分子分析，揭示了这些细胞群体的多样性和功能差异。 | 样本主要集中于尘螨过敏的哮喘病人，可能无法完全代表所有类型的过敏反应。 | 更好地理解过敏和哮喘患者中这些T细胞亚群的多样性。 | 对约50,000个对尘螨过敏原反应的T细胞和调节性T细胞进行分析。 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约50,000个T细胞和调节性T细胞 |
| 129 | 2024-08-05 |
Identification of a nerve-associated, lung-resident interstitial macrophage subset with distinct localization and immunoregulatory properties
2020-03-27, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aax8756
PMID:32220976
|
研究论文 | 本文报告了一种具有特定定位和免疫调节特性的肺内间质巨噬细胞亚群。 | 发现了一种不同于肺泡巨噬细胞的神经相关肺驻留间质巨噬细胞亚群，并揭示其在免疫和组织稳态中的独特功能。 | 未提及具体的限制。 | 阐明神经相关的肺驻留巨噬细胞在免疫调节和组织稳态中的作用。 | 研究了CD169肺驻留巨噬细胞的间质亚群及其不同的发育和转录特征。 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析 | NA | 细胞 | NA |
| 130 | 2024-08-05 |
Restraining Lysosomal Activity Preserves Hematopoietic Stem Cell Quiescence and Potency
2020-03-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.01.013
PMID:32109377
|
研究论文 | 该文章展示了抑制溶酶体活性如何维持造血干细胞的静息和活力 | 通过单细胞RNA测序，发现线粒体膜电位有助于区分静息和循环准备状态的造血干细胞，并表明抑制溶酶体活性可以增强其再生能力 | 未提及具体的临床转化研究结果 | 探讨造血干细胞的代谢特性及其在维持静息状态中的作用 | 造血干细胞及其代谢特性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene Expression Analyses Reveal Distinct Self-Renewing and Proliferating Subsets in the Leukemia Stem Cell Compartment in Acute Myeloid Leukemia
2020-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-18-2932
PMID:31784425
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞基因表达分析揭示了急性骨髓性白血病中的不同自我更新和增殖亚群 | 首次展示了急性骨髓性白血病中白血病干细胞的自我更新和增殖功能是独立的 | 主要研究集中在小鼠模型上，可能与人类的情况有所不同 | 探讨急性骨髓性白血病中白血病干细胞的自我更新与增殖功能是否是分开的 | 急性骨髓性白血病中的白血病干细胞 | 数字病理学 | 急性骨髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠AML模型以及初级人类白血病干细胞和正常人类造血干细胞的样本 |
| 132 | 2024-08-05 |
Transcriptional characterisation of human lung cells identifies novel mesenchymal lineage markers
2020-01, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00746-2019
PMID:31619469
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研究论文 | 本研究通过分析人类肺细胞的转录特征，确定了新的间充质谱系标记物 | 识别出表现出独特转录特征的人类肺间充质细胞亚群，并提供了特定的标记物 | 缺乏对成年肺组织中相同细胞谱系的进一步验证和分析 | 全面了解人类肺中间充质细胞的特征及其发育 | 胎儿人类肺组织中的细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 胎儿人类肺组织样本 |
| 133 | 2024-08-05 |
Single-cell gene profiling and lineage tracing analyses revealed novel mechanisms of endothelial repair by progenitors
2020-Dec, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03480-4
PMID:32166394
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研究论文 | 本研究揭示了干/祖细胞在大血管内皮修复中的新机制 | 展示了c-Kit谱系细胞在主动脉内皮更新和替代中的关键作用 | 未详细探讨细胞内在机制和其他类型祖细胞的潜在功能 | 阐明内源性血管干/祖细胞在大血管内皮修复中的角色 | 内源性c-Kit细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 使用小鼠模型进行的实验和细胞样本分析 |
| 134 | 2024-08-05 |
The role of the NMD factor UPF3B in olfactory sensory neurons
2020-08-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57525
PMID:32773035
|
研究论文 | 本文研究了NMD因子UPF3B在嗅觉系统中的作用 | 揭示了UPF3B在成熟嗅觉感受器神经元中选择性表达特定嗅觉受体基因的调控 | 本文未深入探讨UPF3B在其他类型神经元中的作用 | 研究UPF3B在嗅觉感知中的功能及机制 | 以小鼠模型为对象，分析嗅觉感受器神经元的UPF3B功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和RNA-seq | NA | RNA数据 | 野生型小鼠中嗅觉感受器神经元的细胞群体 |
| 135 | 2024-08-05 |
Antibody targeting of B7-H4 enhances the immune response in urothelial carcinoma
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1744897
PMID:32363111
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研究论文 | 该文章探讨了抗B7-H4抗体在尿路上皮癌中增强免疫反应的作用 | 阐明了B7-H4在小鼠癌症模型中的新表达，以及其在促进T细胞活性的潜力 | 缺乏对其他种类肿瘤模型中的B7-H4表现的综合分析 | 识别新的治疗靶点以改善尿路上皮癌患者的生存率 | 研究对象包括小鼠癌症模型和人类膀胱癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，免疫质量细胞术 | NA | 肿瘤样本 | 包括小鼠模型及人类膀胱癌样本 |
| 136 | 2024-08-05 |
Endothelial Reprogramming by Disturbed Flow Revealed by Single-Cell RNA and Chromatin Accessibility Study
2020-12-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108491
PMID:33326796
|
研究论文 | 这篇文章研究了受扰流对内皮细胞的重编程影响 | 该研究揭示了扰流如何导致内皮细胞从抗动脉粥样硬化表型转变为促动脉粥样硬化表型及其潜在的新型免疫细胞样表型 | NA | 深入理解扰流对内皮细胞基因表达的机制 | 来自小鼠部分颈动脉结扎模型的内皮细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 细胞数据 | 来自左侧和右侧颈动脉的内皮细胞 |
| 137 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Transcriptional Roadmap of the Mouse and Human Lymph Node Lymphatic Vasculature
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.00052
PMID:32426372
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究小鼠和人类淋巴结淋巴血管的细胞异质性和组织结构 | 识别出淋巴小结中的五个明确的细胞亚群，并揭示了新的淋巴血管组织特征 | NA | 深入理解淋巴血管的发育与构建 | 小鼠淋巴结淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 138 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq atlas of Schistosoma mansoni identifies a key regulator of blood feeding
2020-09-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb7709
PMID:32973030
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了血吸虫，并识别出一个关键的血液摄取调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出68种不同的细胞群体以及维持血吸虫消化道的专门干细胞 | 尚未完全了解寄生虫不同组织在成功寄生中的功能 | 研究血吸虫的细胞特性和潜在治疗靶点 | 成人血吸虫的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 43,642个细胞 |
| 139 | 2024-08-05 |
ZipSeq: barcoding for real-time mapping of single cell transcriptomes
2020-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0880-2
PMID:32632238
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研究论文 | 本文提出了一种名为‘ZipSeq’的方法，用于在活组织中实时映射单细胞转录组。 | 创新点在于使用图案照明和光封闭的寡核苷酸即时为活细胞打印条形码，解决了细胞位置与转录组关联的局限性。 | 目前方法在实时定位细胞转录组方面存在不同的局限性。 | 本研究旨在提高细胞转录组数据与细胞在三维空间中位置的整合能力。 | 研究对象包括体外创伤愈合、活淋巴结切片和活肿瘤微环境中的细胞。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光照和光封闭的寡核苷酸 | NA | 基因表达数据 | 在各种设置中发现新的基因表达模式，具体样本数量未提及 |
| 140 | 2024-08-05 |
Early precursors and molecular determinants of tissue-resident memory CD8+ T lymphocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2020-05-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz6894
PMID:32414833
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究CD8 T细胞在对病毒感染反应中的基因表达模式 | 揭示了在病毒感染早期，组织中特定CD8 T细胞前体的转录异质性 | 研究可能未涵盖所有组织环境下的CD8 T细胞特征 | 探讨CD8 T细胞在病毒感染中的分化过程 | CD8 T细胞在脾脏和小肠内的特定亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在病毒感染过程中对不同分化阶段的个体CD8 T细胞进行了分析 |