单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1341 - 1360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1341 | 2024-08-09 |
Cardelino: computational integration of somatic clonal substructure and single-cell transcriptomes
2020-04, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0766-3
PMID:32203388
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cardelino的计算方法，用于推断克隆树配置和单细胞RNA测序（scRNA-seq）检测的单个细胞的克隆起源 | Cardelino方法灵活地整合了基于批量外显子测序数据推断的不完美克隆树信息和scRNA-seq数据中稀疏表达的变异等位基因信息 | NA | 开发一种方法来描述克隆之间的表型变异 | 人类皮肤成纤维细胞系的scRNA-seq和外显子测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），外显子测序 | NA | RNA | 32个人类皮肤成纤维细胞系 |
| 1342 | 2024-08-09 |
Integrative differential expression and gene set enrichment analysis using summary statistics for scRNA-seq studies
2020-03-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15298-6
PMID:32221292
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研究论文 | 本文开发了一种名为iDEA的集成计算方法，通过分层贝叶斯框架联合执行差异表达（DE）和基因集富集（GSE）分析，适用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究 | iDEA方法通过集成DE和GSE分析，提高了DE分析的效力和一致性以及GSE分析的准确性，并且仅使用DE汇总统计数据作为输入，便于与现有DE方法互补和配对 | NA | 开发一种集成且可扩展的计算方法，用于在scRNA-seq研究中联合进行差异表达和基因集富集分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分层贝叶斯框架 | 汇总统计数据 | 分析了三个scRNA-seq数据集 |
| 1343 | 2024-08-09 |
Acute kidney injury promotes development of papillary renal cell adenoma and carcinoma from renal progenitor cells
2020-03-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aaw6003
PMID:32213630
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研究论文 | 本文研究了急性肾损伤（AKI）如何促进肾前体细胞发展为乳头状肾细胞腺瘤和癌 | 首次展示了AKI如何通过增加细胞有丝分裂和多倍体化，以及NOTCH1过表达，促进乳头状肾细胞癌的发展和复发 | 研究主要基于小鼠模型和人类细胞培养，可能需要更多临床数据验证 | 探讨急性肾损伤对乳头状肾细胞癌发展的影响及其分子机制 | 急性肾损伤后的肾前体细胞和乳头状肾细胞癌 | NA | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个单中心和多中心研究的数据，以及小鼠和人类细胞培养样本 |
| 1344 | 2024-08-09 |
Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network Underlying Gastric Premalignant Lesions and Early Gastric Cancer
2020-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.020
PMID:32209487
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1345 | 2024-08-09 |
Analysis of Dual Class I Histone Deacetylase and Lysine Demethylase Inhibitor Domatinostat (4SC-202) on Growth and Cellular and Genomic Landscape of Atypical Teratoid/Rhabdoid
2020-Mar-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030756
PMID:32210076
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研究论文 | 研究Domatinostat（4SC-202）对非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）细胞存活和单细胞异质性的影响 | 首次探讨了Domatinostat（4SC-202）对ATRT细胞的细胞毒性和细胞抑制作用，并可能靶向癌症干细胞 | 研究主要在2D和3D细胞培养模型中进行，尚未在体内进行验证 | 探究Domatinostat（4SC-202）对非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）的治疗潜力 | 非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤（ATRT）细胞 | 数字病理学 | 非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | ATRT-06球状体样本 |
| 1346 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing and its application in breast cancer
2020-Mar-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.19-268
PMID:32217511
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术及其在乳腺癌研究中的应用 | 单细胞测序技术能够分析转录组，探索细胞组成、分化和命运，精细绘制肿瘤微环境，为精准分层和个性化治疗提供支持 | 传统的高通量测序在描述基因组结构改变和亚克隆进化方面存在不足，忽视了肿瘤内、肿瘤间或患者间的异质性 | 旨在解码肿瘤与其微环境在单细胞水平上的多方面相互作用变化，为更好地理解复杂的发病机制和新的免疫治疗途径提供基础 | 乳腺癌及其微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1347 | 2024-08-09 |
Applications of single-cell RNA sequencing in virology
2020-Mar-20, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.19-223
PMID:32217512
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在病毒学中的应用及其研究进展 | scRNA-seq技术能够揭示病毒感染过程中细胞异质性的影响，以及病毒与宿主细胞间复杂的相互作用 | NA | 旨在为理解病毒感染和致病机制提供参考，并可能促进潜在抗病毒靶点的开发 | 病毒感染及其与宿主细胞的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 1348 | 2024-08-09 |
Long-Term Expansion of Pancreatic Islet Organoids from Resident Procr+ Progenitors
2020-03-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.02.048
PMID:32200801
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术发现了一种新的Procr阳性细胞群，这些细胞在成年小鼠胰腺胰岛中存在，并能形成胰岛样类器官，具有功能性β细胞的特性 | 首次发现并描述了成年小鼠胰腺中的一种新的Procr阳性细胞群，这些细胞能够形成功能性胰岛样类器官 | NA | 探索成年小鼠胰腺中Procr阳性细胞群的特性和功能 | 成年小鼠胰腺中的Procr阳性细胞群及其形成的胰岛样类器官 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约占胰岛细胞1%的Procr细胞 |
| 1349 | 2024-08-09 |
Myeloid Cells Enriched for a Dendritic Cell Population From People Living With HIV Have Altered Gene Expression Not Restored by Antiretroviral Therapy
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00261
PMID:32194550
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研究论文 | 研究了HIV感染者中富集的髓系树突状细胞（mDC）的基因表达变化，并探讨了抗逆转录病毒治疗（ART）对这些变化的影响 | 发现HIV感染者中的mDC存在转录变化，部分变化无法通过ART完全恢复 | ART未能完全恢复HIV感染者中mDC的功能 | 探讨ART对HIV感染者中mDC基因表达变化的影响 | HIV感染者中的髓系树突状细胞（mDC） | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HIV感染者和未感染个体的mDC |
| 1350 | 2024-08-09 |
Alginate oligosaccharides improve germ cell development and testicular microenvironment to rescue busulfan disrupted spermatogenesis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.43189
PMID:32194870
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研究论文 | 本文研究了海藻酸寡糖（AOS）对布苏法因破坏的精子发生过程的缓解作用，并通过单细胞RNA测序等技术分析了其对小鼠睾丸细胞的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其分子机制 | NA | 探讨AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其机制 | 小鼠睾丸细胞及精子发生过程 | NA | 男性生殖障碍 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 蛋白质印迹, 液相色谱-质谱联用 | NA | RNA, 代谢物 | 小鼠睾丸样本 |
| 1351 | 2024-08-09 |
Identification and Analysis of Glioblastoma Biomarkers Based on Single Cell Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00167
PMID:32195242
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序结果，利用计算方法筛选出能够区分胶质母细胞瘤肿瘤与其周围环境的标志物，并构建了分类模型。 | 本研究首次应用单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤中筛选出31个重要基因作为潜在的标志物，并构建了支持向量机分类模型。 | 本研究仅分析了2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞的基因表达谱，样本量相对较小。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和分析胶质母细胞瘤的生物标志物。 | 胶质母细胞瘤的肿瘤细胞及其周围环境。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达谱 | 2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞 |
| 1352 | 2024-08-09 |
Corrigendum: The Tumor Suppressor Role of Zinc Finger Protein 671 (ZNF671) in Multiple Tumors Based on Cancer Single-Cell Sequencing
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.00339
PMID:32211338
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1353 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing study of retinal immune regulators identified CD47 and CD59a expression in photoreceptors-Implications in subretinal immune regulation
2020-07, Journal of neuroscience research
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/jnr.24618
PMID:32166783
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集，发现视网膜神经元表达多种免疫调节分子，特别是光感受器中CD47和CD59a的高表达，并探讨了其在亚视网膜免疫调节中的潜在作用。 | 首次揭示了光感受器中CD47和CD59a的高表达，并探讨了其在亚视网膜免疫调节中的作用。 | 研究主要基于已发表的单细胞RNA测序数据集和细胞培养实验，缺乏直接的体内功能验证。 | 探讨视网膜神经元中免疫调节分子的表达及其在亚视网膜免疫调节中的作用。 | 视网膜神经元中的免疫调节分子CD47和CD59a的表达及其功能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括661W细胞、WERI-Rb1细胞、人眼微切割的光感受器以及实验性自身免疫性葡萄膜视网膜炎（EAU）小鼠的视网膜。 |
| 1354 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing in Hematological Diseases
2020-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201900228
PMID:32181578
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研究论文 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在血液系统疾病中的应用 | 单细胞RNA测序技术提供了对肿瘤和微环境细胞间变异的深入见解，并允许高分辨率地解析疾病的发病机制 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血液系统疾病中的应用 | 血液系统疾病，包括白血病、淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 1355 | 2024-08-09 |
Exploring high-dimensional biological data with sparse contrastive principal component analysis
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa176
PMID:32176249
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研究论文 | 本文提出了一种新的主成分分析（PCA）变体——稀疏对比PCA，用于从高维生物数据中提取稀疏、稳定、可解释且相关的生物信号 | 稀疏对比PCA方法结合了控制数据的使用，以去除不想要的变异，同时满足恢复稳定和相关特征的双重目标 | NA | 解决从受技术噪声干扰的高通量测序数据中恢复可解释生物信号的问题 | 高维生物数据，包括蛋白质表达、微阵列基因表达和单细胞转录组测序数据 | 生物信息学 | NA | PCA | 稀疏对比PCA | 高维数据 | 涉及多个公开可用的数据集 |
| 1356 | 2024-08-09 |
The liver as an immunological barrier redefined by single-cell analysis
2020-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13193
PMID:32176810
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研究论文 | 本文通过单细胞分析技术重新定义了肝脏作为免疫屏障的作用 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，对肝脏中的免疫细胞进行了深入的表型分析，从而重新定义了肝脏的免疫屏障功能 | 需要多模态单细胞深度表型分析方法来研究难以获取的稀有细胞群体 | 探讨单细胞技术如何推进或重新定义我们对肝脏免疫屏障的理解 | 肝脏中的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及小鼠和人类的健康及疾病状态下的肝脏样本 |
| 1357 | 2024-08-09 |
Mass Cytometry and Single-Cell RNA-seq Profiling of the Heterogeneity in Human Peripheral Blood Mononuclear Cells Interacting with Silver Nanoparticles
2020-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.201907674
PMID:32163679
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研究论文 | 本文利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，研究了银纳米颗粒与人类外周血单个核细胞的异质性相互作用 | 本文首次结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，深入研究了纳米颗粒与免疫细胞的异质性相互作用 | NA | 探究纳米颗粒与人类免疫细胞的相互作用，为纳米材料的毒性评估提供深入知识 | 银纳米颗粒与人类外周血单个核细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多种细胞类型，包括单核细胞和B细胞 |
| 1358 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq data analysis on the receptor ACE2 expression reveals the potential risk of different human organs vulnerable to 2019-nCoV infection
2020-Apr, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-020-0754-0
PMID:32170560
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了不同人体器官对2019-nCoV感染的潜在风险 | 首次通过scRNA-seq数据分析，构建了不同人体器官对2019-nCoV感染的风险图 | NA | 研究2019-nCoV感染的病理机制和传播途径 | 人体主要生理系统的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 主要人体生理系统的单细胞RNA测序数据 |
| 1359 | 2024-08-09 |
Significant Evolutionary Constraints on Neuron Cells Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2020-04-01, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaa054
PMID:32176293
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研究论文 | 本文通过分析超过280,000个单细胞的RNA测序数据和大量脑组织的发育转录组，揭示了神经元细胞在进化上的显著限制 | 发现不同器官的细胞类型在进化限制上显著重叠，且成熟神经元比神经干细胞及新生神经元受到更多限制 | NA | 探讨脑细胞类型间的进化差异及其对神经疾病发病机制和药物开发的影响 | 神经元细胞及其在不同脑区的进化限制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过280,000个细胞 |
| 1360 | 2024-08-09 |
ISX-9 manipulates endocrine progenitor fate revealing conserved intestinal lineages in mouse and human organoids
2020-04, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.01.012
PMID:32180555
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研究论文 | 研究使用小分子ISX-9探索肠内分泌细胞（EECs）的分化过程 | 首次使用ISX-9作为工具，探索EECs的分化，并揭示了人类和老鼠肠道器官中保守的内分泌谱系 | NA | 探索ISX-9对肠内分泌细胞分化的影响 | 肠内分泌细胞的分化过程 | NA | NA | 实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR），荧光激活细胞分选，免疫染色和单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |