单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1301 - 1320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2024-08-09 |
The role of bone marrow-derived cells in the origin of liver cancer revealed by single-cell sequencing
2020-02-15, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了骨髓来源细胞在肝癌起源中的作用 | 首次通过单细胞测序证实骨髓来源细胞是肝细胞癌的一个重要起源 | NA | 探讨骨髓来源细胞在肝细胞癌起源中的可能作用 | 骨髓移植小鼠中的肝细胞癌 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 骨髓移植小鼠模型 |
| 1302 | 2024-08-09 |
The SARS-CoV-2 receptor ACE2 expression of maternal-fetal interface and fetal organs by single-cell transcriptome study
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0230295
PMID:32298273
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了SARS-CoV-2受体ACE2在母胎界面及胎儿器官中的表达情况 | 首次揭示了ACE2在母胎界面和胎儿心脏、肝脏、肺等特定细胞类型中的广泛表达 | 研究主要基于现有单细胞RNA测序数据，未涉及直接的临床样本分析 | 探讨SARS-CoV-2在母胎界面及胎儿器官中的垂直传播潜力 | SARS-CoV-2受体ACE2在母胎界面及胎儿器官中的细胞特异性表达 | 数字病理学 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含多个胎儿和新生小鼠肺的系列样本 |
| 1303 | 2024-08-09 |
Deciphering the transcriptomic landscape of tumor-infiltrating CD8 lymphocytes in B16 melanoma tumors with single-cell RNA-Seq
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1737369
PMID:32313720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了B16黑色素瘤肿瘤中浸润的CD8 T细胞的转录组图谱 | 揭示了四种不同的CD8 TIL状态（耗竭、记忆样、幼稚和效应记忆样），并预测了新的标记物，如Ly6C用于效应记忆样细胞 | NA | 研究肿瘤浸润CD8 T细胞的异质性，并建立其转录组图谱 | B16黑色素瘤肿瘤中浸润的CD8 T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括已知肿瘤特异性的细胞在内的多个CD8 T细胞样本 |
| 1304 | 2024-08-09 |
Adverse effects of nicotine on cardiogenic differentiation from human embryonic stem cells detected by single-cell RNA sequencing
2020-06-04, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.03.149
PMID:32276728
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探讨尼古丁对人类胚胎干细胞H9心肌分化的影响及其机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示尼古丁对人类胚胎心肌发育的直接影响 | 研究仅限于特定的细胞系H9，可能需要进一步验证其他细胞系中的结果 | 探究尼古丁对人类胚胎心肌生成的影响及相关机制 | 人类胚胎干细胞H9及其心肌分化过程 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 特定浓度尼古丁处理的H9细胞 |
| 1305 | 2024-08-09 |
Dynamic changes in the regulatory T-cell heterogeneity and function by murine IL-2 mutein
2020-05, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.201900520
PMID:32269069
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了小鼠IL-2突变体（IL-2M）对调节性T细胞（Tregs）异质性和功能的影响。 | 首次揭示了IL-2M特异性扩展具有不同表达谱的多种Tregs亚状态，并发现了具有优越抑制功能的IL-2M扩展Tnfrsf9Il1rl1 Tregs。 | NA | 研究IL-2M治疗对Tregs异质性和功能的影响，以评估其在治疗自身免疫和炎症性疾病中的潜力。 | 小鼠调节性T细胞（Tregs）及其在IL-2M处理后的变化。 | NA | 自身免疫和炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 31,908个Tregs样本 |
| 1306 | 2024-08-09 |
Diversity of peripheral blood human NK cells identified by single-cell RNA sequencing
2020-04-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019000699
PMID:32271902
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了健康CMV阴性供体中未刺激和IL-2激活的NK细胞的基因表达，并发现了三种已知和三种新型的人类血液NK细胞亚群 | 本文首次识别出三种新型的人类血液NK细胞亚群，并揭示了CMV阳性供体中NK细胞亚群比例的变化及其基因调控 | NA | 研究人类外周血中NK细胞的多样性和特定亚群的分类 | 人类外周血中的NK细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康CMV阴性供体的NK细胞 |
| 1307 | 2024-08-09 |
Insights into Gonadal Sex Differentiation Provided by Single-Cell Transcriptomics in the Chicken Embryo
2020-04-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.055
PMID:32268081
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，对鸡胚胎性腺性别分化进行了全面分析 | 研究发现鸡胚胎支持细胞并非源自体腔上皮，而是源自DMRT1/PAX2/WNT4/OSR1间充质细胞群，且性腺细胞类型比以往认知更为复杂 | NA | 探究不同物种间性腺性别分化的细胞生物学差异 | 鸡胚胎性腺在性别分化过程中的细胞类型和来源 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 鸡胚胎性腺样本 |
| 1308 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Maps Endothelial Metabolic Plasticity in Pathological Angiogenesis
2020-04-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.03.009
PMID:32268117
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了28,337个鼠视网膜下腔内皮细胞（CECs）和新血管化内皮细胞（CNV-ECs）的代谢异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了内皮细胞在病理血管生成中的代谢转录组可塑性，并识别了SQLE和ALDH18A1作为新的代谢血管生成靶点 | 研究主要基于鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现 | 探索内皮细胞代谢在肿瘤血管生成和脉络膜新生血管化中的作用 | 鼠视网膜下腔内皮细胞和新生血管化内皮细胞的代谢转录组 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,337个鼠视网膜下腔内皮细胞和新生血管化内皮细胞 |
| 1309 | 2024-08-09 |
A conserved dendritic-cell regulatory program limits antitumour immunity
2020-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2134-y
PMID:32269339
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，在人鼠非小细胞肺癌中鉴定出一类名为'富含免疫调节分子的成熟树突状细胞'（mregDCs）的新型树突状细胞群，并探讨了其在肿瘤抗原摄取后对DC1功能的调节作用 | 首次发现并命名了mregDCs，并揭示了其在肿瘤抗原摄取后对DC1功能的调节机制 | 研究主要基于人鼠非小细胞肺癌模型，其结果在其他类型肿瘤中的适用性有待进一步验证 | 探讨树突状细胞在肿瘤免疫治疗中的作用及其调控机制 | 树突状细胞（DC1s和DC2s）及其在肿瘤抗原摄取后的功能变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人鼠非小细胞肺癌样本 |
| 1310 | 2024-08-09 |
Cellular, transcriptomic and isoform heterogeneity of breast cancer cell line revealed by full-length single-cell RNA sequencing
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.03.005
PMID:32257051
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研究论文 | 本研究采用全长的单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系SUM149的细胞、转录组和异构体异质性 | 本研究首次使用深度的全长单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系中癌症干细胞的细胞、转录组和异构体异质性 | 现有的单细胞转录组技术存在数据丢失和不均匀覆盖的限制，这挑战了肿瘤异质性的进一步划分 | 研究肿瘤异质性的生成机制，特别是通过遗传和表观遗传机制，以及这些机制在肿瘤形成和转移中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系SUM149及其癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三阴性乳腺癌细胞系SUM149和红白血病K562细胞系作为对照 |
| 1311 | 2024-08-09 |
Single-Cell Approaches to Profile the Response to Immune Checkpoint Inhibitors
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00490
PMID:32265933
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综述 | 本文综述了单细胞技术在免疫检查点抑制剂治疗反应分析中的应用 | 整合传统方法与新型单细胞技术，如高参数流式细胞术、单细胞测序和高分辨率成像，以深入研究肿瘤微环境中的分子和细胞相互作用 | NA | 探讨单细胞技术如何帮助揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性 | 免疫检查点抑制剂治疗反应的分子和细胞机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1312 | 2024-08-09 |
Non-coding RNAs in Cardiac Regeneration
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-1671-9_9
PMID:32285411
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研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在心脏再生中的作用 | 文章提出通过重新激活现有心肌细胞的增殖能力来促进心脏再生的新研究方向 | 尽管干细胞疗法对功能参数有积极影响，但c-kit阳性心脏前体细胞对功能性心肌细胞生成的贡献有限 | 研究如何通过重新激活心肌细胞的增殖来促进心脏再生 | 非编码RNA在心脏再生中的作用及心肌细胞的增殖机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序和遗传谱系追踪 | NA | 细胞 | 涉及小鼠心脏在稳态和再生条件下的细胞 |
| 1313 | 2024-08-09 |
Long noncoding RNA 2193 regulates meiosis through global epigenetic modification and cytoskeleton organization in pig oocytes
2020-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.29675
PMID:32239703
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在猪卵母细胞中鉴定了一种新的长非编码RNA（lncRNA2193），并探讨了其在卵母细胞减数分裂中的功能 | 首次揭示了lncRNA2193在猪卵母细胞减数分裂中的作用，包括其对全局表观遗传修饰和细胞骨架组织的调控 | 研究主要集中在体外成熟过程中，未涉及体内环境下的影响 | 探讨长非编码RNA在哺乳动物生殖细胞中的生物学功能 | 猪卵母细胞中的lncRNA2193及其在减数分裂中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 猪卵母细胞 |
| 1314 | 2024-08-09 |
Identifying cell types to interpret scRNA-seq data: how, why and more possibilities
2020-07-29, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaa003
PMID:32232401
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综述 | 本文综述了用于解释单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中细胞类型识别的方法和工具，并探讨了scRNA-seq在未来的发展可能性 | NA | NA | 探讨scRNA-seq数据中细胞类型识别的方法及其未来发展 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 1315 | 2024-08-09 |
Essential gene expression pattern of head and neck squamous cell carcinoma revealed by tumor-specific expression rule based on single-cell RNA sequencing
2020-07-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2020.165791
PMID:32234410
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研究论文 | 本文通过基于单细胞RNA测序的肿瘤特异性表达规则，揭示了头颈鳞状细胞癌的关键基因表达模式 | 利用单细胞测序技术消除了非恶性细胞对传统批量测序数据的影响，并建立了一种计算过滤策略来识别肿瘤细胞 | NA | 旨在识别头颈鳞状细胞癌的核心致癌因素，并加深对肿瘤异质性和肿瘤发生的理解 | 头颈鳞状细胞癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 多个独立数据集 |
| 1316 | 2024-08-09 |
Tumor Microenvironment Is Critical for the Maintenance of Cellular States Found in Primary Glioblastomas
2020-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-0057
PMID:32253265
|
研究论文 | 本文通过比较五名患者来源的四种胶质母细胞瘤干细胞（GSC）衍生模型类型的单细胞RNA测序，探讨了肿瘤微环境在维持原发性胶质母细胞瘤细胞状态中的关键作用 | 首次展示了神经解剖学上准确的人类微环境对于重现人类原发性胶质母细胞瘤细胞状态的关键性和充分性 | NA | 探讨不同患者来源的胶质母细胞瘤模型能否重现原发性肿瘤的全部异质性 | 胶质母细胞瘤干细胞及其衍生模型 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 五名患者的肿瘤细胞 |
| 1317 | 2024-08-09 |
Uncovering the key dimensions of high-throughput biomolecular data using deep learning
2020-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa191
PMID:32232416
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research paper | 本文提出了一种基于自编码器的深度学习框架DeepAE，用于解析高维单细胞RNA-seq数据的关键维度 | DeepAE在揭示单细胞RNA-seq数据的关键维度方面表现优于传统方法，并能在其他平台如质谱流式细胞术和代谢组学中展现全面性能 | NA | 解决高维单细胞RNA-seq数据的解析问题 | 单细胞RNA-seq数据的关键维度 | machine learning | NA | RNA-seq | auto-encoder | gene expression | 九个转录组学数据集 |
| 1318 | 2024-08-09 |
Identification of a potential mechanism of acute kidney injury during the COVID-19 outbreak: a study based on single-cell transcriptome analysis
2020-06, Intensive care medicine
IF:27.1Q1
DOI:10.1007/s00134-020-06026-1
PMID:32236644
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1319 | 2024-08-09 |
Joint learning dimension reduction and clustering of single-cell RNA-sequencing data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa231
PMID:32246821
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研究论文 | 本文提出了一种联合学习单细胞RNA测序数据降维和聚类的新算法DRjCC | DRjCC算法通过联合学习降维和细胞聚类，改善了细胞类型发现的性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型发现的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 涉及11个单细胞RNA测序数据集，细胞数量从49到68,579不等，细胞类型从3到14种 |
| 1320 | 2024-08-09 |
Genomic Analysis of Circulating Tumor Cells at the Single-Cell Level
2020-06, The Journal of molecular diagnostics : JMD
DOI:10.1016/j.jmoldx.2020.02.013
PMID:32247862
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研究论文 | 本文评估了四种全基因组扩增（WGA）/下一代测序工作流程在单个循环肿瘤细胞（CTC）基因组分析中的应用 | MALBAC与低通全基因组测序结合的工作流程在全基因组拷贝数变异（CNV）分析中表现出更好的覆盖广度、均匀性和重复性 | 所有评估的单细胞测序工作流程在突变检测方面均未达到临床应用所需的足够灵敏度和特异性 | 评估不同全基因组扩增方法在单个循环肿瘤细胞基因组分析中的性能 | 循环肿瘤细胞（CTC）的基因组分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | 四个鳞状非小细胞肺癌患者的单个循环肿瘤细胞 |