单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1241 - 1260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1241 | 2024-08-09 |
Prediction model construction of mouse stem cell pluripotency using CpG and non-CpG DNA methylation markers
2020-May-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-3448-3
PMID:32366211
|
研究论文 | 本研究利用单细胞DNA甲基化和RNA测序数据，构建了一个机器学习模型，用于预测小鼠胚胎干细胞的多能性程度 | 首次测试了CpG和非CpG标记以及它们的组合在预测小鼠胚胎干细胞多能性中的预测能力 | NA | 研究CpG和非CpG甲基化与小鼠干细胞多能性的关系，并开发相应的预测模型 | 小鼠胚胎干细胞的多能性 | 机器学习 | NA | scBS-seq, scRNA-seq | 机器学习模型 | DNA甲基化数据, RNA测序数据 | 16个CpG标记和33个非CpG标记 |
| 1242 | 2024-08-09 |
Reprogramming Axial Level Identity to Rescue Neural-Crest-Related Congenital Heart Defects
2020-05-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.04.005
PMID:32369742
|
研究论文 | 本研究探讨了心脏神经嵴的分子机制，并发现了一种转录子电路，该电路能够赋予躯干神经嵴细胞修复心脏缺陷的能力 | 发现了一种新的转录子电路（Tgif1, Ets1, 和 Sox8），该电路能够赋予躯干神经嵴细胞修复心脏缺陷的能力 | NA | 揭示心脏神经嵴的分子机制，并探索其对心脏发育的影响 | 心脏神经嵴及其在心脏发育中的作用 | 心血管疾病 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1243 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Combination with Protein and DNA Analyses
2020-05-04, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9051130
PMID:32375335
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其与蛋白质和DNA分析结合的最新进展和应用 | 结合scRNA-seq与基因组或蛋白质组数据，能更全面地描述细胞异质性 | 讨论了scRNA-seq技术的优势和局限性，并指出其在商业化过程中仍面临的挑战 | 全面回顾scRNA-seq技术及其在生物医学应用中的潜力 | 单细胞RNA测序技术及其与蛋白质和DNA分析的结合 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 1244 | 2024-08-09 |
Regenerative potential of prostate luminal cells revealed by single-cell analysis
2020-05-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aay0267
PMID:32355025
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺腔细胞的再生潜力 | 研究发现前列腺再生不仅由稀有的干细胞驱动，而是几乎所有持续存在的前列腺腔细胞都参与其中 | NA | 探讨前列腺再生过程中腔细胞的作用 | 前列腺腔细胞及其在再生过程中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的前列腺组织样本 |
| 1245 | 2024-08-09 |
Context specificity of the EMT transcriptional response
2020-05-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16066-2
PMID:32358524
|
研究论文 | 本文通过高多重单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了上皮-间质转化（EMT）反应的上下文特异性 | 首次展示了EMT反应的高度上下文特异性，并揭示了其信号依赖性和模块性 | NA | 研究EMT反应的特异性和复杂性 | 上皮-间质转化（EMT）反应 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 103,999个细胞，来自960个样本，包括12个EMT时间序列实验和独立的激酶抑制剂筛选 |
| 1246 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome in Chronic Myeloid Leukemia: Pseudotime Analysis Reveals Evidence of Embryonic and Transitional Stem Cell States
2020-05, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.04.005
PMID:32360510
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了慢性髓性白血病（CML）患者CD34+细胞的基因表达模式，并利用伪时间分析揭示了胚胎和过渡性干细胞状态的存在 | 首次通过单细胞转录组测序和伪时间分析，揭示了CML干细胞中存在的胚胎和过渡性干细胞状态，并发现了与多能性标记相关的基因表达模式 | 研究样本仅来自三位CML患者，可能影响结果的普遍性 | 探索慢性髓性白血病干细胞异质性的分子机制 | 慢性髓性白血病患者的CD34+细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序 | t-分布随机邻域嵌入（tSNE）算法 | 基因表达数据 | 三位CML患者的CD34+细胞 |
| 1247 | 2024-08-09 |
Highly parallel and efficient single cell mRNA sequencing with paired picoliter chambers
2020-04-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15765-0
PMID:32355211
|
research paper | 本文介绍了一种名为Paired-seq的单细胞mRNA测序平台，具有高细胞/珠利用效率、无细胞RNA去除能力、高基因检测能力和低成本的特点 | 利用差流阻力原理实现单细胞/条形码珠配对，结合阀门和泵实现无细胞RNA的完全去除，提高了mRNA检测的准确性和灵敏度 | NA | 开发一种高效、低成本的单细胞mRNA测序技术 | 单细胞mRNA测序技术及其在细胞生物学、发育生物学和精准医学中的应用 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | 涉及mES细胞和药物处理细胞的单细胞表达谱 |
| 1248 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional networks in differentiating preadipocytes suggest drivers associated with tissue heterogeneity
2020-04-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16019-9
PMID:32355218
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，结合独特的网络方法和数据整合技术，预测了分化细胞的代谢表型，并识别了与脂肪细胞异质性相关的锌指蛋白网络 | 本研究首次识别了与脂肪细胞分化相关的锌指蛋白网络，并揭示了白色脂肪细胞的异质性及其与正常代谢和疾病的关系 | NA | 深入理解白色脂肪细胞的异质性及其与正常代谢和疾病的关系 | 人类前脂肪细胞在体外脂肪生成过程中的单细胞RNA测序 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 至少两种不同类型的皮下白色脂肪细胞 |
| 1249 | 2024-08-09 |
SpatialCPie: an R/Bioconductor package for spatial transcriptomics cluster evaluation
2020-Apr-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-3489-7
PMID:32349652
|
研究论文 | 介绍了一个名为SpatialCPie的R包，用于空间转录组数据聚类评估 | SpatialCPie能够在多个分辨率下对数据进行聚类，并通过饼图和聚类图直观展示空间区域与聚类之间的相似性和聚类间的关系 | NA | 开发工具以简化空间转录组数据分析中的聚类评估 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 多个公开可用数据集 |
| 1250 | 2024-08-09 |
Association of Urine sCD163 With Proliferative Lupus Nephritis, Fibrinoid Necrosis, Cellular Crescents and Intrarenal M2 Macrophages
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00671
PMID:32351512
|
研究论文 | 研究评估尿液可溶性CD163（sCD163）作为狼疮性肾炎（LN）生物标志物的潜力 | 发现尿液sCD163在活动性LN患者中显著升高，并与多种肾脏病理特征相关，表明其作为预测肾脏病理的潜在标志物 | 研究主要集中在活动性LN患者，未涵盖所有LN患者群体 | 评估尿液sCD163作为狼疮性肾炎生物标志物的潜力 | 活动性狼疮性肾炎患者、活动性非肾脏狼疮患者、非活动性系统性红斑狼疮患者及健康对照 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA | NA | 尿液蛋白质 | 228名系统性红斑狼疮患者和56名健康对照 |
| 1251 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of liver-resident immune cells in human
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-0157-z
PMID:32351704
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了人肝脏驻留免疫细胞的异质性 | 首次详细描述了人肝脏中超过30种不同免疫细胞亚群的组成、基因表达和功能模块，并提出了基于趋化因子受体的T和NK细胞分类系统 | NA | 揭示人肝脏驻留免疫细胞的异质性和功能多样性 | 人肝脏驻留免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共70,706个CD45免疫细胞样本，包括肝脏、脾脏和外周血 |
| 1252 | 2024-08-09 |
Defective Sec61α1 underlies a novel cause of autosomal dominant severe congenital neutropenia
2020-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.03.034
PMID:32325141
|
研究论文 | 本文探讨了SEC61A1基因突变导致常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症的新机制 | 首次报道SEC61A1基因突变与常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症的关联 | NA | 扩展SEC61A1介导的疾病谱，包括常染色体显性遗传性严重先天性中性粒细胞减少症 | SEC61A1基因突变及其对中性粒细胞成熟的影响 | NA | 严重先天性中性粒细胞减少症 | 全外显子测序、Western blot、Ca2+通量测定、CD34+细胞体外分化、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、RNA | 一个患有严重先天性中性粒细胞减少症的患者及其非近亲比利时父母 |
| 1253 | 2024-08-09 |
The origin, fate and function of macrophages in the peripheral nervous system-an update
2020-10-20, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaa030
PMID:32322888
|
研究论文 | 本文综述了近年来巨噬细胞生物学领域的进展，特别是关于外周神经系统中巨噬细胞的起源、命运和功能 | 利用Cre/loxP为基础的转基因小鼠模型和高通量技术如bulk RNA测序和单细胞RNA测序，首次详细描述了特定巨噬细胞群体的发育和功能 | 外周神经系统中的巨噬细胞群体尚未得到详细研究 | 探讨外周神经系统中巨噬细胞的发育、异质性和基因表达特征 | 外周神经系统中的巨噬细胞 | NA | NA | Cre/loxP为基础的转基因小鼠模型、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 转基因小鼠模型 |
| 1254 | 2024-08-09 |
Identification of differentially expressed genes in lung adenocarcinoma cells using single-cell RNA sequencing not detected using traditional RNA sequencing and microarray
2020-10, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-020-0428-1
PMID:32327726
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术在肺腺癌细胞中识别出传统RNA测序和微阵列技术未能检测到的差异表达基因 | 本研究首次使用10× genomics单细胞RNA测序技术在肺腺癌细胞中识别出传统技术未能检测到的差异表达基因，并探讨了这些基因与肺腺癌生存的关系 | 本研究仅限于肺腺癌细胞，且样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别肺腺癌细胞中的差异表达基因，并探讨其与癌症进展的关系 | 肺腺癌细胞和正常肺细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 159,219个细胞和594个样本 |
| 1255 | 2024-08-09 |
Using Single-Cell and Spatial Transcriptomes to Understand Stem Cell Lineage Specification During Early Embryo Development
2020-08-31, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
|
综述 | 本文综述了利用单细胞和空间转录组学技术在早期胚胎发育过程中理解干细胞谱系特化的分子调控和组织模式 | 介绍了单细胞RNA测序和空间转录组学等新兴技术在解析细胞组织、形态和分子特性差异以及谱系分配中的应用 | NA | 探讨胚胎发育和干细胞分化过程中的分子调控机制和组织结构 | 干细胞谱系特化及其在胚胎发育中的分子轨迹和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1256 | 2024-08-09 |
Preclinical safety studies of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells for the treatment of age-related macular degeneration
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0396
PMID:32319201
|
研究论文 | 本研究针对人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞进行临床前安全性评估，以治疗老年性黄斑变性 | 采用全基因组测序和单细胞RNA测序等方法，深入评估细胞的基因组稳定性和纯度，以及生物分布和致瘤性 | NA | 评估人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞在治疗老年性黄斑变性中的安全性 | 人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞 | NA | 老年性黄斑变性 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, RNA数据 | NA |
| 1257 | 2024-08-09 |
Between life and death: Epithelial cells in lung pathologies
2020-08, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2020.109652
PMID:32325184
|
研究论文 | 本文通过最近的谱系追踪策略、单细胞RNA测序和超高分辨率成像技术，探讨了肺上皮细胞在健康和疾病中的结构和功能多样性 | 本文揭示了肺上皮细胞的显著异质性，并探讨了其在肺健康和疾病中的特定功能 | 尽管取得了显著进展，但仍远未达到能够训练/指导肺上皮细胞以促进肺修复和再生的目标 | 理解控制肺上皮细胞形态发生、分化以及与其他细胞类型和细胞外基质交流的分子机制，以改善呼吸系统疾病患者的治疗效果 | 肺上皮细胞在健康和疾病中的功能和结构多样性 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 1258 | 2024-08-09 |
Is Low Alveolar Type II Cell SOD3 in the Lungs of Elderly Linked to the Observed Severity of COVID-19?
2020-07-10, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2020.8111
PMID:32323565
|
研究论文 | 本研究分析了来自健康供体的肺部单细胞RNA测序数据，以隔离和专门研究肺泡II型细胞中的基因表达 | 发现老年人的肺泡II型细胞中超氧化物歧化酶3（SOD3）显著下调，并提出肺部特异性递送SOD3相关抗氧化剂与抗病毒药物如瑞德西韦协同作用，可能改善老年COVID-19患者的预后 | NA | 探讨老年肺泡II型细胞中SOD3表达与COVID-19严重程度的关系 | 肺泡II型细胞中的基因表达 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自老年和年轻健康供体的肺部单细胞RNA测序数据 |
| 1259 | 2024-08-09 |
Metabolic changes in human brain evolution
2020-Jul, Evolutionary anthropology
IF:4.6Q1
DOI:10.1002/evan.21831
PMID:32329960
|
综述 | 本文综述了通过多种方法（如脑成像、立体测量学和转录组学）了解人类大脑代谢的现状，并探讨了干细胞技术和单细胞转录组学在深入研究人类大脑能量代谢方面的新机遇 | 利用干细胞技术和单细胞转录组学提供了新的实验方法，以阐明基因序列和表达水平变化对人类大脑进化的功能影响 | NA | 探讨人类大脑代谢的变化及其在进化中的作用 | 人类大脑的代谢和进化 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因序列和表达数据 | NA |
| 1260 | 2024-08-09 |
alona: a web server for single-cell RNA-seq analysis
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa269
PMID:32324845
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为alona的网络服务器，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | 将多种流行的单细胞分析算法整合到一个灵活的管道中，提供了一个用户友好的数据分析平台 | NA | 开发一个用户友好的软件工具，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达矩阵 | NA |