单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1201 - 1220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1201 | 2024-08-09 |
Identifying Cell-Type Specific Genes and Expression Rules Based on Single-Cell Transcriptomic Atlas Data
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00350
PMID:32411685
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠的单细胞转录组图谱数据，旨在识别在组织发育和器官发生中起功能作用的特定细胞类型关键基因和表达规则 | 本研究利用单细胞测序技术，针对以往研究中未深入探讨的个体多细胞生物细胞间基因组差异，识别特定细胞类型的关键基因和表达规则 | NA | 识别在组织发育和器官发生中起功能作用的特定细胞类型关键基因和表达规则 | 小鼠的单细胞转录组图谱数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 转录组数据 | 18种细胞类别 |
| 1202 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Dynamics in Oocytes of Patients With Polycystic Ovary Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00396
PMID:32425983
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了多囊卵巢综合征（PCOS）患者卵母细胞中线粒体动力学的变化 | 首次揭示了PCOS患者卵母细胞发育失败与线粒体功能异常之间的关系 | 研究样本量较小，需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 探究PCOS患者卵母细胞中线粒体功能与卵母细胞质量下降的关系 | PCOS患者的卵母细胞 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | WGCNA（加权基因共表达网络分析） | 转录组数据 | 14个健康女性和20个PCOS患者的卵母细胞 |
| 1203 | 2024-08-09 |
An Adaptive Sparse Subspace Clustering for Cell Type Identification
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00407
PMID:32425984
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研究论文 | 本文设计了一种自适应稀疏子空间聚类方法（AdaptiveSSC）用于细胞类型识别 | AdaptiveSSC方法基于同一类型细胞表达在同一子空间的假设，并使用数据驱动的自适应稀疏约束构建相似矩阵 | NA | 解决单细胞数据计算分析中细胞类型识别的问题 | 单细胞转录组测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 稀疏子空间聚类 | 表达谱 | 10个scRNA-seq数据集 |
| 1204 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of exhausted T cells in the tumor microenvironment is linked to patient survival following resection in hepatocellular carcinoma
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1746573
PMID:32426177
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研究论文 | 研究分析了肝细胞癌患者手术样本中耗竭T细胞（Tex）的浸润情况及其对患者预后的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示了CD4-Tex、CD8-Tex和FOXP3-Treg在肿瘤及邻近组织中的组成变化及其分子特征 | NA | 评估肿瘤邻近区域T细胞状态及其对肝细胞癌预后的影响 | 肝细胞癌患者的手术样本中的耗竭T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 117个肝细胞癌患者的手术样本 |
| 1205 | 2024-08-09 |
Characterization of Human iPSC-derived Spinal Motor Neurons by Single-cell RNA Sequencing
2020-12-01, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了从人诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的脊髓运动神经元（MNs）的特性和亚型 | 本文首次详细描述了从人iPSCs衍生的MNs的亚型及其分子特征，为理解iPSC衍生的MNs的功能和功能障碍提供了新的见解 | 研究受限于来自单一供体的iPSC系之间的变异性和从iPSCs衍生的特定细胞类型的异质性 | 旨在深入表征不同iPSC衍生细胞类型，以促进该技术在人类疾病模型和新疗法开发中的应用 | 人诱导多能干细胞衍生的脊髓运动神经元及其亚型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约58%的iPSC衍生MNs显示侧运动柱MNs的分子特征，约19%类似轴下运动柱MNs，约6%具有中运动柱MNs的特征 |
| 1206 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing of miRNAs: A modified technology
2020-Sep, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11376
PMID:32379363
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综述 | 本文综述了单细胞miRNA测序技术的最新科学探索及其在果蝇和线虫中的应用 | 介绍了单细胞miRNA测序技术在基因调控中的重要性及其在个体细胞表观基因组学、基因组学和转录组学研究中的应用 | NA | 探索单细胞miRNA测序技术在个体细胞表观基因组学、基因组学和转录组学中的逻辑难题 | 果蝇和线虫中的单细胞miRNA测序 | 基因组学 | NA | 下一代测序技术 | NA | 测序数据 | 涉及果蝇和线虫的单细胞测序 |
| 1207 | 2024-08-09 |
Fgfr3 Is a Positive Regulator of Osteoblast Expansion and Differentiation During Zebrafish Skull Vault Development
2020-09, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1002/jbmr.4042
PMID:32379366
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研究论文 | 本研究通过生成首个fgfr3功能丧失的斑马鱼模型，探讨了FGFR3在斑马鱼颅骨发育中的作用 | 首次生成了fgfr3功能丧失的斑马鱼模型，并通过体内成像和单细胞RNA测序分析了其对成骨细胞系的影响 | NA | 研究FGFR3在斑马鱼颅骨发育中的作用及其对成骨细胞扩展和分化的影响 | 斑马鱼的颅骨发育和成骨细胞 | NA | NA | 体内成像，单细胞RNA测序 | NA | 图像，RNA序列 | fgfr3功能丧失的斑马鱼 |
| 1208 | 2024-08-09 |
An organoid model to assay the role of CFTR in the human epididymis epithelium
2020-Aug, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-020-03208-7
PMID:32377875
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研究论文 | 本文利用人类附睾上皮细胞（HEE）类器官和极化的HEE细胞培养物，研究了囊性纤维化跨膜传导调节因子（CFTR）在人类附睾中的作用 | 首次使用3D HEE类器官和极化的2D HEE细胞培养物来评估CFTR在人类附睾中的功能，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了类器官中的细胞类型特异性基因表达 | NA | 研究CFTR在人类附睾上皮细胞中的作用及其对生育能力的影响 | 人类附睾上皮细胞（HEE）类器官和极化的HEE细胞培养物 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从人类附睾头部分离的HEE类器官和细胞培养物 |
| 1209 | 2024-08-09 |
Ribonucleotide reductase small subunit M2 is a master driver of aggressive prostate cancer
2020-08, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12706
PMID:32385899
|
研究论文 | 研究探讨了核糖核苷酸还原酶小亚基M2（RRM2）在前列腺癌中的作用，特别是其作为侵袭性前列腺癌驱动因子的潜力 | 通过整合RRM2特征与两个分子分类系统（PCS和PAM50亚型），确定了RRM2特征与侵袭性前列腺癌亚型的关联，并发现RRM2抑制可能对前列腺癌患者具有临床益处 | NA | 确定RRM2特征是否可用于识别侵袭性前列腺癌亚型 | 前列腺癌细胞中RRM2的表达及其对临床结果的影响 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及六个已发表的前列腺癌队列，共4000例病例 |
| 1210 | 2024-08-09 |
An ultra-sensitive T-cell receptor detection method for TCR-Seq and RNA-Seq data
2020-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa432
PMID:32399561
|
研究论文 | 提出了一种名为CATT的计算方法，用于超敏感和精确地检测TCR CDR3序列 | CATT整合了基于de Bruijn图的微组装算法、数据驱动的错误校正模型和贝叶斯推理算法，能够自适应地和高性能地表征CDR3库 | NA | 开发一种超敏感的T细胞受体检测方法，用于TCR-Seq和RNA-Seq数据 | T细胞受体（TCR）的CDR3区域 | 生物信息学 | NA | TCR-Seq, RNA-Seq | 贝叶斯推理算法 | 序列数据 | NA |
| 1211 | 2024-08-09 |
Extraction of Distinct Neuronal Cell Types from within a Genetically Continuous Population
2020-07-22, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.04.018
PMID:32396852
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和单突触狂犬病毒追踪技术，分析了小鼠初级视觉皮层中皮质-皮质投射神经元（CCPNs）的基因表达差异及其与投射区域的关系 | 发现尽管CCPNs在基因表达上形成单一集群，但其不同解剖学投射的神经元在基因表达上存在系统性差异，并选择性地接收来自相同投射区域的反馈 | 仅限于小鼠初级视觉皮层的CCPNs，未涉及其他脑区和神经元类型 | 探讨基因表达分析在识别神经元类型中的局限性及其对理解皮质反馈回路功能角色的影响 | 小鼠初级视觉皮层中的皮质-皮质投射神经元（CCPNs） | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学，单突触狂犬病毒追踪 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠初级视觉皮层CCPNs样本 |
| 1212 | 2024-08-09 |
A Human Skeletal Muscle Atlas Identifies the Trajectories of Stem and Progenitor Cells across Development and from Human Pluripotent Stem Cells
2020-07-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.04.017
PMID:32396864
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，分析了从胚胎、胎儿到出生后阶段的人体骨骼肌组织，构建了人体骨骼肌发育的“路线图”，并研究了人多能干细胞衍生的肌源性前体细胞在胚胎到胎儿过渡期的特征 | 首次构建了人体骨骼肌发育的综合图谱，并揭示了人多能干细胞衍生的肌源性前体细胞在不同发育阶段的生物学过程和基因调控网络 | NA | 深入了解人体肌生成过程及人多能干细胞衍生的肌源性前体细胞的特征，为骨骼肌再生医学的转化应用提供工具 | 人体骨骼肌组织及人多能干细胞衍生的肌源性前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎、胎儿和出生后阶段的人体骨骼肌组织及人多能干细胞衍生的肌源性前体细胞 |
| 1213 | 2024-08-09 |
Reconstructing human DC, monocyte and macrophage development in utero using single cell technologies
2020-07, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2020.04.023
PMID:32380279
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在研究人类胎儿期树突状细胞、单核细胞和巨噬细胞发育中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胎儿期树突状细胞、单核细胞和巨噬细胞的早期发育过程 | NA | 探讨单细胞技术在胎儿期免疫系统发育研究中的应用 | 树突状细胞、单核细胞和巨噬细胞的发育 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1214 | 2024-08-09 |
Bioinformatics Core Survey Highlights the Challenges Facing Data Analysis Facilities
2020-07, Journal of biomolecular techniques : JBT
DOI:10.7171/jbt.20-3102-005
PMID:32382253
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研究论文 | 本文通过调查分析了生物信息学核心设施在数据分析支持方面面临的挑战 | 探讨了生物信息学核心设施在处理新技术和分析需求时的新应用和数据集整合问题 | 小型生物信息学核心设施在成本回收模式下运营，面临较大的行政负担 | 评估生物信息学核心设施的运营状况，了解其面临的挑战 | 生物信息学核心设施的员工、服务、财务模型和挑战 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 组学数据 | 主要关注小型核心设施的调查数据 |
| 1215 | 2024-08-09 |
In-vivo differentiation of adult hematopoietic stem cells from a single-cell point of view
2020-07, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000587
PMID:32398457
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综述 | 本文综述了通过诱导性HSC特异性谱系追踪和单细胞RNA测序（scRNA-Seq）推断造血轨迹，来研究造血干细胞（HSC）在其原生环境中的功能的新技术进展 | 介绍了通过HSC特异性谱系追踪结合scRNA-Seq的动态分析，揭示了造血干细胞分化过程中的异质性和造血谱系的出现顺序 | 目前用于追踪细胞条形码（特别是突变或插入位点）的技术仍处于起步阶段，成年骨髓中HSC克隆的谱系追踪仍然难以实现 | 研究HSC在其原生环境中的分化过程，无需移植 | 造血干细胞（HSC）及其分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 多个造血干细胞克隆 |
| 1216 | 2024-08-09 |
BREM-SC: a bayesian random effects mixture model for joint clustering single cell multi-omics data
2020-06-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa314
PMID:32379315
|
研究论文 | 本文开发了一种名为BREM-SC的贝叶斯随机效应混合模型，用于联合聚类单细胞多组学数据 | BREM-SC模型能够同时处理单细胞转录组和蛋白质组数据，并量化每个单细胞的聚类不确定性 | NA | 开发新的统计方法和计算工具，以分析多模态CITE-Seq数据 | 单细胞转录组和蛋白质组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | 贝叶斯随机效应混合模型 | 多组学数据 | 数万个单细胞 |
| 1217 | 2024-08-09 |
Neuroligin3 splice isoforms shape inhibitory synaptic function in the mouse hippocampus
2020-06-19, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.AC120.012571
PMID:32381505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、免疫组织化学和电生理学方法，探讨了神经连接蛋白3（NLGN3）基因在海马CA1锥体神经元中的剪接异构体对抑制性突触传递的调控作用 | 首次展示了NLGN3蛋白在海马CA1突触中以剪接异构体依赖的方式不同程度地调节抑制性突触传递，并发现NLGN3异构体的不同亚细胞定位导致了这些异构体之间的功能差异 | NA | 阐明神经连接蛋白基因在调节小鼠海马中兴奋性和抑制性突触传递平衡中的特定效应 | 小鼠海马CA1锥体神经元 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学、免疫组织化学、电生理学 | NA | RNA-Seq | 来自器官型海马切片培养物的小鼠CA1锥体神经元 |
| 1218 | 2024-08-09 |
Identification of pathogenic TRAIL-expressing innate immune cells during HIV-1 infection in humanized mice by scRNA-Seq
2020-06-04, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.135344
PMID:32406872
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术研究HIV-1感染下淋巴器官中先天免疫细胞的转录组变化，并鉴定了表达TRAIL的先天免疫细胞在HIV-1感染中的作用 | 首次在单细胞水平上描述了HIV-1感染下先天免疫细胞的转录组变化，并确定了TRAIL信号通路在HIV-1诱导的CD4+ T细胞耗竭中的重要作用 | NA | 研究HIV-1感染下先天免疫细胞的转录组变化及其在CD4+ T细胞耗竭中的作用 | 人源化NOD/Rag2-/-γc-/- (NRG)小鼠的脾脏中分离的人类白细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 转录组数据 | 从人源化NRG-hu HSC小鼠的脾脏中分离的hCD45+hCD3-hCD19-人类白细胞 |
| 1219 | 2024-08-09 |
NFI transcription factors provide chromatin access to maintain stem cell identity while preventing unintended lineage fate choices
2020-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0513-0
PMID:32393888
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研究论文 | 本文通过在小鼠毛囊中进行时空基因敲除，揭示了转录因子NFIB和NFIX在维持干细胞身份中的关键作用 | 首次揭示NFIB和NFIX在维持干细胞身份和防止不希望的谱系命运选择中的重要作用 | NA | 探究NFIB和NFIX在维持干细胞身份和防止不希望的谱系命运选择中的作用 | 小鼠毛囊中的干细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组学, ATAC-Seq, ChIP-Seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 1220 | 2024-08-09 |
Single-cell landscape of bronchoalveolar immune cells in patients with COVID-19
2020-06, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0901-9
PMID:32398875
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了不同严重程度的COVID-19患者和健康人的支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞特征 | 首次详细描述了COVID-19患者支气管肺泡灌洗液中免疫细胞的单细胞景观，揭示了不同疾病严重程度下的免疫特征 | NA | 探究COVID-19患者呼吸道免疫特征与疾病严重程度之间的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 不同严重程度的COVID-19患者和健康人的支气管肺泡灌洗液样本 |