单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals mRNA Splice Isoform Switching during Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080770
PMID:32651222
|
研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎肾脏中544个单细胞的转录组，揭示了肾脏发育过程中mRNA剪接异构体转换的现象 | 本研究首次通过全长单细胞RNA测序技术，全面分析了肾脏发育过程中细胞状态转换时的剪接异构体转换，并识别了几个潜在的剪接调控因子 | NA | 揭示胎儿肾脏间质向管状上皮分化过程中基因的替代剪接机制，以增进对肾脏发育分子机制的理解 | 小鼠胚胎肾脏中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA | 544个小鼠胚胎肾脏单细胞 |
| 102 | 2024-08-07 |
An Experiment on Ab Initio Discovery of Biological Knowledge from scRNA-Seq Data Using Machine Learning
2020-Aug-14, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2020.100071
PMID:33205121
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法在单细胞RNA测序数据上进行实验，探索了在没有现有知识指导的情况下发现生物学知识的能力和局限性 | 本研究采用无监督和监督机器学习相结合的策略，揭示了主要细胞谱系，且最小程度依赖先验知识或人工干预，实现了人类早期胚胎细胞分化的新发现 | 研究展示了机器学习在复杂生物问题知识发现的可行性和重要性，但也指出了其局限性 | 探索机器学习在无现有知识指导的高通量生物数据中发现新模式的潜力和局限 | 早期胚胎发育的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | NA | 数据 | NA |
| 103 | 2024-08-05 |
Second-Strand Synthesis-Based Massively Parallel scRNA-Seq Reveals Cellular States and Molecular Features of Human Inflammatory Skin Pathologies
2020-10-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.015
PMID:33053333
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研究论文 | 该文章介绍了一种新的高通量单细胞RNA测序方法，旨在揭示人类炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征 | 文章提出了Seq-Well S方法，通过随机引物二链合成技术提高了转录本捕获和基因检测的效率 | 由于关注点主要集中在皮肤炎症，可能未能涵盖所有相关的生物学样本和病理特征 | 研究的目的是开发一种高保真和高通量的单细胞RNA测序平台 | 研究对象是五种人类炎症性皮肤疾病 | 数字病理学 | 炎症性皮肤病 | RNA-seq | NA | NA | 五种人类皮肤炎症疾病的样本 |
| 104 | 2024-08-07 |
Prospects for Use of Single-Cell Sequencing to Assess DNA Methylation in Asthma
2020-Oct-03, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.925514
PMID:33009362
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在评估哮喘中DNA甲基化作用的应用前景 | 单细胞测序技术能够揭示不同细胞群中基因的甲基化和表达情况，相较于传统的多组学测序，能更好地反映哮喘的发病机制 | 目前关于哮喘中DNA甲基化的研究较少，且主要使用单细胞测序技术的研究有限 | 研究单细胞测序技术在揭示哮喘中DNA甲基化功能和调控机制的作用 | 哮喘中的DNA甲基化 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 105 | 2024-08-07 |
Heterogeneous expression of the SARS-Coronavirus-2 receptor ACE2 in the human respiratory tract
2020-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2020.102976
PMID:32971472
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组织化学技术，系统研究了人类呼吸道中SARS-CoV-2受体ACE2的表达情况及其与COVID-19严重程度风险因素的关系 | 首次详细描述了ACE2蛋白在人类呼吸道中的分布，并探讨了其与COVID-19易感性的关系 | NA | 研究SARS-CoV-2受体ACE2在人类呼吸道中的表达及其与COVID-19严重程度的关系 | 人类呼吸道中的ACE2蛋白表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 蛋白质 | NA |
| 106 | 2024-08-05 |
An optimized protocol for retina single-cell RNA sequencing
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33088174
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研究论文 | 本研究提出了一种优化的视网膜单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种温和的视网膜解离方法，最大限度减少细胞死亡并保存细胞形态，同时改进计算管道以提高单细胞RNA测序数据的质量 | 对新鲜与冷冻视网膜在制备细胞或细胞核悬浮液方面的优缺点进行了演示 | 优化视网膜样本的单细胞RNA测序流程，获得更高质量的转录组数据 | 小鼠视网膜样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | 小鼠视网膜样本的数量未明确说明 |
| 107 | 2024-08-05 |
Controlled Cycling and Quiescence Enables Efficient HDR in Engraftment-Enriched Adult Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2020-09-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108093
PMID:32877675
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研究论文 | 本文研究了通过控制细胞周期和静止状态来提高成年造血干细胞和祖细胞中同源重组修复效率的方法 | 提出了一种控制循环和静止状态的策略，使得静息干细胞中HDR与NHEJ的比率增加了6倍 | 文章中未具体说明对所有类型细胞的影响，主要集中在特定亚群体 | 探讨并重新编程成年造血干细胞和祖细胞中的基因组编辑结果 | 成年造血干细胞和祖细胞的亚群体 | 数字病理学 | NA | 下一代测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
| 108 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Six Subpopulations Reflecting Distinct Cellular Fates in Senescent Mouse Embryonic Fibroblasts
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00867
PMID:32849838
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了衰老小鼠胚胎成纤维细胞的六个亚群，揭示了不同的细胞命运。 | 本研究首次在衰老的小鼠胚胎成纤维细胞中识别出六个具有明显异质性的亚群，并发现HOXD8是新的衰老调控因子。 | 该研究主要基于小鼠模型，其结果可能不完全适用于其他物种或人类。 | 本研究旨在深入了解衰老小鼠胚胎成纤维细胞中的细胞异质性及其衰老机制。 | 研究对象为衰老小鼠胚胎成纤维细胞。 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个衰老小鼠胚胎成纤维细胞 |
| 109 | 2024-08-05 |
The history and advances in cancer immunotherapy: understanding the characteristics of tumor-infiltrating immune cells and their therapeutic implications
2020-08, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-0488-6
PMID:32612154
|
评论 | 本文回顾了癌症免疫治疗的历史和最新进展，重点关注肿瘤浸润免疫细胞的特征及其治疗意义 | 本文强调了单细胞技术在全面分析肿瘤微环境中的应用，提供了肿瘤浸润免疫细胞功能多样性的见解 | 肿瘤微环境的高度异质性和动态特性阻碍了对肿瘤内免疫细胞的精确解析 | 阐明肿瘤浸润免疫细胞的特征并探讨其对癌症免疫治疗的影响 | 肿瘤浸润免疫细胞及其在癌症免疫治疗中的作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-05 |
Unveiling functional heterogeneity in breast cancer multicellular tumor spheroids through single-cell RNA-seq
2020-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-69026-7
PMID:32728097
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌多细胞肿瘤球体中的功能异质性 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了不同细胞亚型之间的功能关系及其对肿瘤发展的促进作用 | 研究仅限于MCF7多细胞肿瘤球体模型，可能不适用于所有类型的乳腺癌 | 研究肿瘤细胞亚群间的功能关系及其在肿瘤进展中的作用 | 乳腺癌细胞系MCF7的多细胞肿瘤球体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MCF7多细胞肿瘤球体的单细胞样本，两个时间点的分析 |
| 111 | 2024-08-05 |
Prototypical pacemaker neurons interact with the resident microbiota
2020-07-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1920469117
PMID:32647059
|
研究论文 | 本研究识别和功能性表征了基底多细胞生物中的原型节律神经元，阐明了其与微生物之间的相互作用 | 识别了原型节律神经元表达丰富的免疫相关基因，并提出了节律神经元进化起源的新模型 | 对节律神经元及其与微生物相互作用的了解仍然有限 | 旨在探讨节律神经元的进化起源及其与微生物的相互作用 | 基底多细胞生物中的原型ANO/SCN/TRPM离子通道表达的节律细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、免疫化学和功能实验 | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Leukocyte Diversity in Atherosclerotic Mouse Aortas
2020-07-17, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.316903
PMID:32673538
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meta-analysis | 这项综合性荟萃分析确认了动脉粥样硬化小鼠主动脉中的四种已知巨噬细胞亚群，并识别出一种新型巨噬细胞亚群 | 本研究识别出一种类似腔巨噬细胞的新型巨噬细胞亚群，并揭示了一些长期存在的争议 | 本研究克服了个别研究因实验方法而造成的某些细胞群体的过度或不足表示 | 分析动脉粥样硬化小鼠主动脉中的白细胞多样性 | 动脉粥样硬化小鼠主动脉中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、质量细胞术 | NA | RNA序列数据、细胞表面表型数据 | 9个单细胞RNA测序研究和2个质量细胞术研究 |
| 113 | 2024-08-05 |
CD70 expression determines the therapeutic efficacy of expanded human regulatory T cells
2020-07-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-1097-8
PMID:32665635
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研究论文 | 本文揭示了CD70表达对扩展人类调节性T细胞（Tregs）治疗效果的影响 | 发现经过长期体外刺激后，人类Tregs表现出稳定的CD70表达，而CD27表达减少，这显著影响其调节功能 | 研究主要集中于体外实验，临床应用尚需进一步验证 | 探讨CD70在调节性T细胞治疗中的作用 | 扩展的人类调节性T细胞及其对常规T细胞的共刺激能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 人类外周血中的调节性T细胞 |
| 114 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell RNAseq identifies transitional states of T cells associated with hepatocellular carcinoma
2020-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.133
PMID:32659053
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研究论文 | 该文章分析了与肝细胞癌相关的T细胞过渡状态的单细胞RNAseq数据 | 文章揭示了T细胞功能耗竭的渐进过程及其基因表达特征，提供了免疫治疗的新见解 | 研究主要基于手术切除样本，可能无法完全代表所有HCC患者的T细胞状态 | 探讨肝细胞癌患者T细胞亚群的多样性及其在肿瘤免疫环境中的作用 | 研究对象为235例手术切除的肝细胞癌患者的样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 235例肝细胞癌患者的手术切除样本 |
| 115 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human embryos reveals diverse patterns of aneuploidy and mosaicism
2020-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262774.120
PMID:32641298
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组数据分析人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体的多样性模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据对人类胚胎中的镶嵌非整倍体进行广泛量化分析 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能无法全面代表所有胚胎情况 | 量化人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体现象 | 74个人类胚胎，从囊胚阶段到晚期筛选的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 74个人类胚胎 |
| 116 | 2024-08-05 |
FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00216
PMID:32194545
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研究论文 | 介绍了一种名为FB5P-seq的基于FACS的单细胞RNA序列技术，用于分析B细胞和T细胞的转录组及抗原受体库 | FB5P-seq是一种新颖的、经济高效的单细胞RNA-seq方法，能够实现转录组和成对的BCR或TCR库的综合分析 | NA | 本研究旨在通过新方法分析适应性免疫系统中的B细胞和T细胞的转录组和抗原受体 | 研究对象为表型定义的B细胞和T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | FB5P-seq | NA | 转录组数据 | 应用于人类扁桃体B细胞亚群和外周血抗原特异性CD4 T细胞 |
| 117 | 2024-08-05 |
A reference single-cell transcriptomic atlas of human skeletal muscle tissue reveals bifurcated muscle stem cell populations
2020-07-06, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-020-00236-3
PMID:32624006
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研究论文 | 本文提供了人类骨骼肌组织的单细胞转录组数据集，揭示了肌肉干细胞的两种亚群体 | 通过细胞群体的无监督聚类，识别了16种不同的肌肉细胞群体，并描述了早期激活的肌肉干细胞亚群及其转录特征 | 未提及具体的样本限制或研究限制 | 研究人类骨骼肌组织的异质性及其在疾病背景下的干细胞多样性和失调 | 来自10名成年供体的肌肉样本 | 数字病理学 | 肌肉萎缩疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名成年供体的肌肉样本 |
| 118 | 2024-08-05 |
Enhancing droplet-based single-nucleus RNA-seq resolution using the semi-supervised machine learning classifier DIEM
2020-07-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-67513-5
PMID:32620816
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研究论文 | 本文提出了一种新方法DIEM，旨在提高单核RNA测序的分辨率。 | 创新点在于使用期望最大化的方法定量评估污染并过滤snRNA-seq实验中的液滴。 | 虽然DIEM设计用于snRNA-seq，但其在单细胞RNA-seq数据上的效果未给出具体的评价。 | 研究目标是提高单核RNA测序中的污染分析和液滴过滤的精确度。 | 研究对象包括三组snRNA-seq数据集，涉及人类前脂肪细胞、鼠脑组织和人类冷冻脂肪组织。 | 机器学习 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 三个snRNA-seq数据集，涉及六个个体的人类冷冻脂肪组织 |
| 119 | 2024-08-05 |
Cell atlas of the foetal human heart and implications for autoimmune-mediated congenital heart block
2020-07-01, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvz257
PMID:31589297
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研究论文 | 本研究探讨了人类胎心的单细胞转录组和自体免疫介导的先天性心脏阻滞(CHB)的影响。 | 首次识别和表征了心脏中以前未被描述的多样化内皮细胞亚群，并发现了CHB心脏中不同细胞类型的干扰素反应的增加与异质性。 | 样本量较小，仅包含三个人类健康胎心和一个受CHB影响的胎心，可能影响研究结果的普适性。 | 旨在通过分子特征化正常心脏功能所需的细胞类型来深入理解人类心脏发育。 | 研究对象为人类胎心的单细胞转录组，包括健康胎心和与抗SSA/Ro相关的CHB样本。 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个样本，包括三个健康胎心和一个CHB受影响的胎心 |
| 120 | 2024-08-05 |
Deciphering the regulatory landscape of fetal and adult γδ T-cell development at single-cell resolution
2020-07-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104159
PMID:32627520
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研究论文 | 本文建立了胎儿和成人γδ T细胞分化的高分辨率图谱 | 揭示了未极化的胸腺群体，并识别了胎儿和成人γδ T细胞分化过程中活跃的基因网络的显著相似性 | 对胸腺中γδ T细胞分化的所有方面仍未完全理解 | 探讨胎儿和成人γδ T细胞的发展和分化机制 | 胎儿和成人的γδ T细胞及其在免疫反应中的角色 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了Sox13、Maf和Rorc敲除小鼠进行组合的单细胞分析 |