单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-05 |
Prototypical pacemaker neurons interact with the resident microbiota
2020-07-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1920469117
PMID:32647059
|
研究论文 | 本研究识别和功能性表征了基底多细胞生物中的原型节律神经元，阐明了其与微生物之间的相互作用 | 识别了原型节律神经元表达丰富的免疫相关基因，并提出了节律神经元进化起源的新模型 | 对节律神经元及其与微生物相互作用的了解仍然有限 | 旨在探讨节律神经元的进化起源及其与微生物的相互作用 | 基底多细胞生物中的原型ANO/SCN/TRPM离子通道表达的节律细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、免疫化学和功能实验 | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-05 |
Meta-Analysis of Leukocyte Diversity in Atherosclerotic Mouse Aortas
2020-07-17, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.316903
PMID:32673538
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meta-analysis | 这项综合性荟萃分析确认了动脉粥样硬化小鼠主动脉中的四种已知巨噬细胞亚群，并识别出一种新型巨噬细胞亚群 | 本研究识别出一种类似腔巨噬细胞的新型巨噬细胞亚群，并揭示了一些长期存在的争议 | 本研究克服了个别研究因实验方法而造成的某些细胞群体的过度或不足表示 | 分析动脉粥样硬化小鼠主动脉中的白细胞多样性 | 动脉粥样硬化小鼠主动脉中的免疫细胞群体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、质量细胞术 | NA | RNA序列数据、细胞表面表型数据 | 9个单细胞RNA测序研究和2个质量细胞术研究 |
| 103 | 2024-08-05 |
CD70 expression determines the therapeutic efficacy of expanded human regulatory T cells
2020-07-14, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-1097-8
PMID:32665635
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研究论文 | 本文揭示了CD70表达对扩展人类调节性T细胞（Tregs）治疗效果的影响 | 发现经过长期体外刺激后，人类Tregs表现出稳定的CD70表达，而CD27表达减少，这显著影响其调节功能 | 研究主要集中于体外实验，临床应用尚需进一步验证 | 探讨CD70在调节性T细胞治疗中的作用 | 扩展的人类调节性T细胞及其对常规T细胞的共刺激能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 人类外周血中的调节性T细胞 |
| 104 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell RNAseq identifies transitional states of T cells associated with hepatocellular carcinoma
2020-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.133
PMID:32659053
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研究论文 | 该文章分析了与肝细胞癌相关的T细胞过渡状态的单细胞RNAseq数据 | 文章揭示了T细胞功能耗竭的渐进过程及其基因表达特征，提供了免疫治疗的新见解 | 研究主要基于手术切除样本，可能无法完全代表所有HCC患者的T细胞状态 | 探讨肝细胞癌患者T细胞亚群的多样性及其在肿瘤免疫环境中的作用 | 研究对象为235例手术切除的肝细胞癌患者的样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 235例肝细胞癌患者的手术切除样本 |
| 105 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human embryos reveals diverse patterns of aneuploidy and mosaicism
2020-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262774.120
PMID:32641298
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研究论文 | 本研究通过单细胞基因组数据分析人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体的多样性模式 | 首次利用单细胞RNA测序数据对人类胚胎中的镶嵌非整倍体进行广泛量化分析 | 研究依赖于已发表的单细胞RNA测序数据，可能无法全面代表所有胚胎情况 | 量化人类胚胎中的非整倍体和镶嵌体现象 | 74个人类胚胎，从囊胚阶段到晚期筛选的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 74个人类胚胎 |
| 106 | 2024-08-05 |
FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00216
PMID:32194545
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研究论文 | 介绍了一种名为FB5P-seq的基于FACS的单细胞RNA序列技术，用于分析B细胞和T细胞的转录组及抗原受体库 | FB5P-seq是一种新颖的、经济高效的单细胞RNA-seq方法，能够实现转录组和成对的BCR或TCR库的综合分析 | NA | 本研究旨在通过新方法分析适应性免疫系统中的B细胞和T细胞的转录组和抗原受体 | 研究对象为表型定义的B细胞和T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | FB5P-seq | NA | 转录组数据 | 应用于人类扁桃体B细胞亚群和外周血抗原特异性CD4 T细胞 |
| 107 | 2024-08-05 |
A reference single-cell transcriptomic atlas of human skeletal muscle tissue reveals bifurcated muscle stem cell populations
2020-07-06, Skeletal muscle
IF:5.3Q2
DOI:10.1186/s13395-020-00236-3
PMID:32624006
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研究论文 | 本文提供了人类骨骼肌组织的单细胞转录组数据集，揭示了肌肉干细胞的两种亚群体 | 通过细胞群体的无监督聚类，识别了16种不同的肌肉细胞群体，并描述了早期激活的肌肉干细胞亚群及其转录特征 | 未提及具体的样本限制或研究限制 | 研究人类骨骼肌组织的异质性及其在疾病背景下的干细胞多样性和失调 | 来自10名成年供体的肌肉样本 | 数字病理学 | 肌肉萎缩疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 10名成年供体的肌肉样本 |
| 108 | 2024-08-05 |
Enhancing droplet-based single-nucleus RNA-seq resolution using the semi-supervised machine learning classifier DIEM
2020-07-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-67513-5
PMID:32620816
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研究论文 | 本文提出了一种新方法DIEM，旨在提高单核RNA测序的分辨率。 | 创新点在于使用期望最大化的方法定量评估污染并过滤snRNA-seq实验中的液滴。 | 虽然DIEM设计用于snRNA-seq，但其在单细胞RNA-seq数据上的效果未给出具体的评价。 | 研究目标是提高单核RNA测序中的污染分析和液滴过滤的精确度。 | 研究对象包括三组snRNA-seq数据集，涉及人类前脂肪细胞、鼠脑组织和人类冷冻脂肪组织。 | 机器学习 | NA | NA | NA | RNA序列数据 | 三个snRNA-seq数据集，涉及六个个体的人类冷冻脂肪组织 |
| 109 | 2024-08-05 |
Cell atlas of the foetal human heart and implications for autoimmune-mediated congenital heart block
2020-07-01, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvz257
PMID:31589297
|
研究论文 | 本研究探讨了人类胎心的单细胞转录组和自体免疫介导的先天性心脏阻滞(CHB)的影响。 | 首次识别和表征了心脏中以前未被描述的多样化内皮细胞亚群，并发现了CHB心脏中不同细胞类型的干扰素反应的增加与异质性。 | 样本量较小，仅包含三个人类健康胎心和一个受CHB影响的胎心，可能影响研究结果的普适性。 | 旨在通过分子特征化正常心脏功能所需的细胞类型来深入理解人类心脏发育。 | 研究对象为人类胎心的单细胞转录组，包括健康胎心和与抗SSA/Ro相关的CHB样本。 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 四个样本，包括三个健康胎心和一个CHB受影响的胎心 |
| 110 | 2024-08-05 |
Deciphering the regulatory landscape of fetal and adult γδ T-cell development at single-cell resolution
2020-07-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104159
PMID:32627520
|
研究论文 | 本文建立了胎儿和成人γδ T细胞分化的高分辨率图谱 | 揭示了未极化的胸腺群体，并识别了胎儿和成人γδ T细胞分化过程中活跃的基因网络的显著相似性 | 对胸腺中γδ T细胞分化的所有方面仍未完全理解 | 探讨胎儿和成人γδ T细胞的发展和分化机制 | 胎儿和成人的γδ T细胞及其在免疫反应中的角色 | 免疫学 | 自体免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了Sox13、Maf和Rorc敲除小鼠进行组合的单细胞分析 |
| 111 | 2024-08-05 |
Mouse Retinal Cell Atlas: Molecular Identification of over Sixty Amacrine Cell Types
2020-07-01, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0471-20.2020
PMID:32457074
|
研究论文 | 本研究使用高通量单细胞RNA测序对小鼠的阿马克林细胞进行分子鉴定，识别出63种细胞类型 | 首次全面分类并分子特征化超过60种阿马克林细胞类型，且发现许多新的细胞类型 | 未明确指出研究限制 | 研究小鼠视网膜内阿马克林细胞的多样性及其分子特征 | 来自小鼠（两性别）超过32,000个阿马克林细胞 | 数字病理学 | NA | 高通量单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过32,000个小鼠阿马克林细胞 |
| 112 | 2024-08-05 |
T Cell-Expressed microRNA-155 Reduces Lifespan in a Mouse Model of Age-Related Chronic Inflammation
2020-04-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901484
PMID:32161096
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研究论文 | 本研究报告了T细胞中miR-155对miR-146a小鼠寿命缩短的影响。 | 本研究揭示了miR-155通过影响效应T细胞的活化和代谢重编程在衰老相关慢性炎症中起关键作用。 | 本研究的局限性在于只在小鼠模型中进行，可能无法完全应用于人类。 | 研究T细胞中特定miRNA对寿命和炎症老化的调节作用。 | 研究对象为miR-146a缺失的小鼠及其T细胞。 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 小鼠生物样本 | 超过15个月大的小鼠 |
| 113 | 2024-08-05 |
Novel insights into breast cancer copy number genetic heterogeneity revealed by single-cell genome sequencing
2020-05-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51480
PMID:32401198
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研究论文 | 本文使用单细胞基因组测序全面映射了乳腺癌肿瘤中拷贝数改变异质性的各个方面 | 提供了乳腺癌肿瘤内非肿瘤细胞的遗传异质性及其对肿瘤基因组的影响的新见解 | 对拷贝数改变异质性的了解仍然有限 | 探讨乳腺癌中拷贝数改变的遗传异质性及其临床意义 | 一组乳腺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 一组乳腺癌肿瘤样本 |
| 114 | 2024-08-05 |
Transcriptome Dynamics of Hematopoietic Stem Cell Formation Revealed Using a Combinatorial Runx1 and Ly6a Reporter System
2020-05-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.03.020
PMID:32302558
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研究论文 | 该文章研究了造血干细胞(HSC)形成的转录组动态，利用组合的Runx1和Ly6a报告系统进行可视化 | 通过生成Tg(Runx1-mKO2; Ly6a-GFP)双重报告小鼠，首次识别并追踪造血干细胞的发育过程 | 由于造血干细胞及其前体细胞的稀缺性，可能导致研究样本的局限性 | 揭示前造血干细胞的出现和成熟过程 | 研究对象包括前造血干细胞及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了双重报告小鼠的细胞样本 |
| 115 | 2024-08-05 |
A single-cell survey of Drosophila blood
2020-05-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54818
PMID:32396065
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研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序对果蝇血细胞进行了调查 | 发现了在不同炎症条件下果蝇血细胞的多样性，并首次揭示了FGF信号在血细胞之间的相互作用中的新角色 | 目前只集中于果蝇的血细胞种类，结果是否适用于其他物种尚未确定 | 旨在通过单细胞RNA测序深入理解果蝇血细胞的功能 | 果蝇幼虫中的血细胞（称为hemocytes） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 116 | 2024-08-05 |
Pooled Knockin Targeting for Genome Engineering of Cellular Immunotherapies
2020-Apr-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.039
PMID:32302591
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研究论文 | 本研究开发了一种技术用于对人类T细胞进行高通量的基因敲入筛选 | 提出了一种新颖的合并基因组工程技术，可以对大规模非病毒DNA模板进行条形码标记和追踪 | 未提及具体的样本量和方法的局限性 | 研究目的在于提高基因改造免疫细胞在癌症免疫治疗中的效果 | 主要研究对象为经过基因敲入的初级人类T细胞 | 数字病理学 | 癌症免疫治疗 | CRISPR | NA | 细胞转录组数据 | 数十个独特的条形码模板 |
| 117 | 2024-08-05 |
Association Analysis of Single-Cell RNA Sequencing and Proteomics Reveals a Vital Role of Ca2+ Signaling in the Determination of Skeletal Muscle Development Potential
2020-04-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9041045
PMID:32331484
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研究论文 | 本研究探讨了特定猪模型中肌肉发育潜力决定机制 | 首次揭示了Ca2+信号在骨骼肌发育潜力中的重要作用 | 只使用了特定的猪模型，可能限制了结果的普遍性 | 探索肌肉生成与脂肪生成之间的稳态机制 | 瘦型猪和肥胖型猪的肌肉衍生Myo-谱系细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质组学分析 | NA | RNA和蛋白质数据 | 瘦型猪与肥胖型猪的肌肉衍生细胞 |
| 118 | 2024-08-05 |
Characterizing pancreatic β-cell heterogeneity in the streptozotocin model by single-cell transcriptomic analysis
2020-07, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.100982
PMID:32247924
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研究论文 | 本研究探索了在链脲佐菌素（STZ）模型下胰岛细胞的分子特征 | 识别了β细胞在生理和病理条件下的异质性，并未观察到Glut2low向Glut2high的转化 | 未能发现STZ模型中非β内分泌细胞的转录组变化或α细胞谱系向β细胞谱系的直接转分化途径 | 重新评估链脲佐菌素（STZ）模型中β细胞的功能和再生 | 链脲佐菌素处理的小鼠胰腺内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2999个细胞 |
| 119 | 2024-08-05 |
Chloride channels regulate differentiation and barrier functions of the mammalian airway
2020-04-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.53085
PMID:32286221
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研究论文 | 本文系统地表征了小鼠气道的发育景观，并确定了在人类胎儿发育过程中操作的高度保守的细胞程序 | 揭示氯离子通道在哺乳动物气道形成与功能中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类情况存在差异 | 探讨气道粘膜屏障的形成和功能的分子事件 | 小鼠气道的发育和修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 120 | 2024-08-05 |
Integrating GWAS with bulk and single-cell RNA-sequencing reveals a role for LY86 in the anti-Candida host response
2020-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1008408
PMID:32251450
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研究论文 | 该文章探讨了LY86在抗念珠菌宿主反应中的作用 | 首次揭示LY86与念珠菌易感性之间的潜在新联系 | 没有明确提到样本量的细节和数据的长期影响 | 更好地理解抗念珠菌宿主反应 | 与念珠菌刺激的免疫细胞进行的转录组分析 | 数字病理学 | 念珠菌感染 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |