单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1141 - 1160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1141 | 2024-08-09 |
Urethral luminal epithelia are castration-insensitive cells of the proximal prostate
2020-08, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24020
PMID:32497356
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠前列腺和尿道中所有上皮细胞的转录组特征，并验证了尿道上皮细胞群的存在及其在前列腺增生中的潜在作用。 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面分析了小鼠前列腺和尿道的上皮细胞，并发现了尿道上皮细胞在前列腺增生中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，客观识别前列腺和尿道上皮细胞的亚型，并探讨其在前列腺增生中的作用。 | 小鼠前列腺和尿道的上皮细胞。 | 数字病理学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 1142 | 2024-08-09 |
Discovery of New Targets to Control Metastasis in Pancreatic Cancer by Single-cell Transcriptomics Analysis of Circulating Tumor Cells
2020-08, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-19-1166
PMID:32499301
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析循环肿瘤细胞，发现胰腺癌转移的新治疗靶点 | 开发了高度转移性的胰腺癌患者来源的异种移植（PDX）小鼠模型，并通过单细胞RNA测序识别了改变的信号传导和代谢途径以及潜在的治疗靶点 | NA | 研究胰腺癌转移的机制并寻找新的治疗靶点 | 胰腺癌的转移过程和循环肿瘤细胞的转录组 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | PDX小鼠模型 |
| 1143 | 2024-08-09 |
Endogenous CCN family member WISP1 inhibits trauma-induced heterotopic ossification
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.135432
PMID:32484792
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序分析了CCN家族成员在创伤诱导异位骨化中的表达模式，特别是Wisp1的作用。 | 首次揭示了CCN家族成员Wisp1在创伤诱导异位骨化中的表达模式及其对异位骨化的抑制作用。 | NA | 研究CCN家族成员在创伤诱导异位骨化中的表达和功能。 | CCN家族成员Wisp1在创伤诱导异位骨化中的表达和作用。 | 生物医学 | 异位骨化 | RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠模型和人类样本 |
| 1144 | 2024-08-09 |
CReSCENT: CanceR Single Cell ExpressioN Toolkit
2020-07-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa437
PMID:32479601
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研究论文 | CReSCENT是一个直观且可扩展的网络平台，集成了容器化的管道执行引擎，用于标准化分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | CReSCENT使用公共数据集和预配置的管道，使计算生物学非专家也能访问，并允许用户进行优化、比较和重新分析特定实验 | NA | 开发一个用户友好的平台，用于标准化分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | scRNA-seq | NA | 数据集 | NA |
| 1145 | 2024-08-09 |
Host-Viral Infection Maps Reveal Signatures of Severe COVID-19 Patients
2020-06-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.05.006
PMID:32479746
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Viral-Track的计算方法，用于全局扫描未映射的单细胞RNA测序数据，以检测病毒RNA，并实现感染细胞与旁观细胞的转录细胞分类。 | Viral-Track方法能够系统地检测多种感染模型中的病毒，包括乙型肝炎病毒，并以无监督方式进行。 | NA | 揭示严重COVID-19患者与病毒相互作用的机制。 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 严重和轻度COVID-19患者的支气管肺泡灌洗样本 |
| 1146 | 2024-08-09 |
The Number of Transcription Factors at an Enhancer Determines Switch-like Gene Expression
2020-06-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107724
PMID:32492432
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研究论文 | 本文研究了转录因子NF-κB在超级增强子（SEs）和典型增强子（TEs）中的作用机制，以及它们如何影响基因表达的阈值和分级响应 | 首次展示了超级增强子的活性与染色质开放和丰富的NF-κB结合同时相关，导致B细胞受体（BCR）激活时基因表达的更高倍数变化和阈值表达 | NA | 探究NF-κB在超级增强子和典型增强子中的选择性参与机制及其对基因表达的影响 | 小鼠原代B淋巴细胞中的超级增强子和典型增强子 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组 | NA |
| 1147 | 2024-08-09 |
Acute Myeloid Leukemia iPSCs Reveal a Role for RUNX1 in the Maintenance of Human Leukemia Stem Cells
2020-06-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107688
PMID:32492433
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研究论文 | 本文报道了从急性髓系白血病（AML）患者中获得的遗传克隆诱导多能干细胞（iPSCs），这些细胞具有极高的移植潜力，并在造血分化后产生表型层次结构。通过命运追踪实验、异种移植和单细胞转录组学，研究人员鉴定出一种可通过体外粘附生长前瞻性分离的细胞亚群（iLSC），这些细胞位于该层次结构的顶端，并具有白血病干细胞（LSCs）的标志性特征。 | 本文通过整合iLSC转录组和染色质景观的研究，得出了一个预测患者生存的LSC基因特征，并揭示了跨AML基因型的LSCs对RUNX1转录因子的依赖性。 | NA | 研究旨在揭示白血病干细胞的特性和潜在的治疗靶点。 | 急性髓系白血病患者的诱导多能干细胞及其分化后的细胞亚群。 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 从单个AML患者中获得的遗传克隆iPSCs |
| 1148 | 2024-08-09 |
No evidence of severe acute respiratory syndrome-coronavirus 2 in semen of males recovering from coronavirus disease 2019
2020-06, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2020.04.024
PMID:32482249
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研究论文 | 研究描述了从COVID-19康复的男性患者精液中检测严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的情况，并探讨了睾丸中血管紧张素转换酶2（ACE2）和跨膜丝氨酸蛋白酶2（TMPRSS2）的表达模式 | 首次在单细胞转录组数据集上分析了人类睾丸中ACE2和TMPRSS2的稀疏表达，几乎没有重叠的基因表达 | 未评估精液质量，且SARS-CoV-2对男性生殖功能的长期影响仍未知 | 研究COVID-19康复男性精液中SARS-CoV-2的存在及睾丸中ACE2和TMPRSS2的表达 | 34名通过咽拭子样本确诊COVID-19的中国成年男性 | NA | COVID-19 | qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据 | 34名成年男性 |
| 1149 | 2024-08-09 |
Model-based analysis of sample index hopping reveals its widespread artifacts in multiplexed single-cell RNA-sequencing
2020-06-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16522-z
PMID:32483174
|
研究论文 | 本文介绍了一种统计模型，用于估计多重液滴单细胞RNA测序数据中的样本索引跳跃率，并进行概率推断以确定跳跃读取的真实样本来源 | 本文提出了一种新的统计模型，用于准确估计和校正多重单细胞RNA测序中的样本索引跳跃问题 | NA | 研究目的是分析多重单细胞RNA测序中的样本索引跳跃现象，并提出一种方法来校正由此产生的数据错误 | 多重液滴单细胞RNA测序数据中的样本索引跳跃现象 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计模型 | RNA测序数据 | 多个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 1150 | 2024-08-09 |
Hair-bearing human skin generated entirely from pluripotent stem cells
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2352-3
PMID:32494013
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研究论文 | 本文报道了一种从人类多能干细胞生成复杂皮肤的类器官培养系统 | 首次成功从多能干细胞中生成了包含表皮、富含脂肪的真皮和带有皮脂腺的色素毛发 follicles 的类器官皮肤 | NA | 重建带有附属物的皮肤，用于未来的皮肤发育研究、疾病模型和重建手术 | 人类多能干细胞生成的皮肤类器官 | 生物工程 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 细胞 | NA |
| 1151 | 2024-08-09 |
Notch signalling drives synovial fibroblast identity and arthritis pathology
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2222-z
PMID:32499639
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研究论文 | 本文研究了NOTCH3信号在类风湿性关节炎中驱动滑膜成纤维细胞分化和扩张的分子机制 | 首次揭示了NOTCH3信号在滑膜成纤维细胞分化和扩张中的关键作用，并证明了其在类风湿性关节炎病理过程中的重要性 | NA | 探讨NOTCH3信号在类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞分化和扩张的分子机制 | 滑膜成纤维细胞和NOTCH3信号 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序和滑膜组织类器官 | NA | RNA | NA |
| 1152 | 2024-08-09 |
Deciphering human macrophage development at single-cell resolution
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2316-7
PMID:32499656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，解析了人类胚胎发育过程中巨噬细胞的起源和特化过程 | 首次在单细胞分辨率下详细描述了人类胚胎巨噬细胞的发育过程，包括不同解剖部位的巨噬细胞亚群及其特化轨迹 | 研究主要集中在胚胎阶段的巨噬细胞，对成年巨噬细胞的比较分析有限 | 揭示人类胚胎巨噬细胞的发育动态，为未来研究人类组织驻留巨噬细胞的发育和功能提供参考 | 人类胚胎中的CD45造血细胞，特别是卵黄囊来源的髓系偏向前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从卡内基阶段11到23的人类胚胎中分离的CD45造血细胞 |
| 1153 | 2024-08-09 |
A single-cell view on alga-virus interactions reveals sequential transcriptional programs and infection states
2020-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba4137
PMID:32490206
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析揭示了微藻与其巨型病毒相互作用中的连续转录程序和感染状态 | 利用单细胞RNA测序技术，首次详细揭示了巨型病毒在微藻细胞中的转录轨迹和基因表达顺序 | NA | 探索巨型病毒在微藻中的复制策略和转录组调控 | 全球分布的微藻及其特定巨型病毒 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个微藻细胞及其病毒感染细胞 |
| 1154 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing identifies novel cell types in Drosophila blood
2020-04-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2020.02.004
PMID:32487456
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术在果蝇血液中发现了两种新型细胞类型：thanacytes和primocytes，并揭示了果蝇血液系统的复杂性 | 首次在果蝇血液中发现两种新型细胞类型thanacytes和primocytes，并识别出四种新的浆细胞亚型，扩展了果蝇作为人类血液系统模型在发育和疾病中的应用 | NA | 深入理解果蝇血液系统的复杂性，并探索其在人类血液系统模型中的应用 | 果蝇的循环血液细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1155 | 2024-08-09 |
MFCNV: A New Method to Detect Copy Number Variations From Next-Generation Sequencing Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00434
PMID:32499814
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法MFCNV，用于从下一代测序数据中准确检测拷贝数变异 | MFCNV方法全面考虑了基因组中相邻位置间的内在相关性，计算每个基因组bin的读取深度、GC含量偏差、碱基质量和相关性值，并通过训练神经网络算法来预测拷贝数变异 | NA | 开发一种新的方法来提高从下一代测序数据中检测拷贝数变异的准确性 | 拷贝数变异在肿瘤基因组中的检测 | 数字病理学 | 肿瘤 | NGS | 神经网络 | 测序数据 | 使用模拟和真实测序数据进行测试 |
| 1156 | 2024-08-09 |
Heterogeneity and chimerism of endothelial cells revealed by single-cell transcriptome in orthotopic liver tumors
2020-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-020-09727-9
PMID:32440964
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了原位肝肿瘤中内皮细胞的异质性和嵌合现象 | 首次详细描述了肝肿瘤内皮细胞的基因表达特征，并发现宿主器官而非肿瘤起源是内皮细胞表型的主要决定因素 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究肝肿瘤中肝间质细胞的变化及其对肿瘤内皮细胞的影响 | 肝肿瘤中的内皮细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型的肝肿瘤及邻近正常组织中的内皮细胞 |
| 1157 | 2024-08-09 |
Systematic analysis of ACE2 and TMPRSS2 expression in salivary glands reveals underlying transmission mechanism caused by SARS-CoV-2
2020-11, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.26045
PMID:32441816
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研究论文 | 本研究通过公开数据库分析了唾液腺中ACE2和TMPRSS2的表达，探讨了SARS-CoV-2可能通过唾液腺传播的机制 | 首次系统分析了唾液腺中ACE2和TMPRSS2的表达，并推测SARS-CoV-2可能通过唾液腺进入人体 | 研究未涉及SARS-CoV-2在唾液腺中的具体感染过程和机制 | 评估唾液腺中ACE2/TMPRSS2的表达，探讨SARS-CoV-2的传播机制 | 唾液腺中的ACE2和TMPRSS2表达 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠的下颌下唾液腺和腮腺样本 |
| 1158 | 2024-08-09 |
Distinct immune evasion in APOBEC-enriched, HPV-negative HNSCC
2020-10-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33123
PMID:32468570
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研究论文 | 研究分析了APOBEC富集的HPV阴性头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的免疫逃避机制 | 识别了APOBEC富集的HPV阴性HNSCC亚组，该亚组显示出更高的T细胞炎症和免疫检查点表达，可能介导对免疫治疗的反应 | 研究样本量相对较小，需要进一步的大规模验证 | 探索头颈部鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂反应的生物标志物 | APOBEC富集的HPV阴性头颈部鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 全外显子测序和RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据集496例，验证集10例，单细胞基因表达数据17例HPV阴性HNSCC |
| 1159 | 2024-08-09 |
Prokaryotic single-cell RNA sequencing by in situ combinatorial indexing
2020-10, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-020-0729-6
PMID:32451472
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PETRI-seq的低成本、高通量的原核单细胞RNA测序技术，该技术通过原位组合索引技术克服了原核细胞mRNA含量极低、缺乏mRNA多聚腺苷酸化和细胞壁厚等技术障碍 | PETRI-seq技术能够高效地捕获革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的单细胞转录组，具有高纯度和低偏差，为区分不同生长阶段的细胞状态提供了强有力的工具 | NA | 开发一种适用于原核细胞的单细胞RNA测序技术，以研究原核生物的转录异质性 | 革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数万个细胞 |
| 1160 | 2024-08-09 |
Single-cell profiling reveals sex diversity in human renal proximal tubules
2020-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2020.144790
PMID:32439376
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人类肾脏近端小管中的性别多样性基因表达差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类肾脏近端小管中的性别偏倚基因表达，并发现了跨物种的共同和特异性基因表达差异 | NA | 旨在理解人类男性和女性肾脏近端小管中的基因表达差异 | 人类男性和女性肾脏近端小管的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |