单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1121 - 1140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1121 | 2024-08-09 |
Distinct iNKT Cell Populations Use IFNγ or ER Stress-Induced IL-10 to Control Adipose Tissue Homeostasis
2020-08-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.05.017
PMID:32516575
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序发现脂肪组织中的iNKT细胞群，这些细胞群根据NK1.1表达分为两类功能性群体，分别产生IL-10和IFNγ，以维持代谢稳态 | 首次揭示了脂肪组织iNKT细胞通过产生IL-10和IFNγ来控制代谢稳态的机制，并发现了NK1.1 iNKT细胞在限制病理性巨噬细胞扩张中的新作用 | NA | 探究脂肪组织iNKT细胞如何通过不同途径维持代谢稳态 | 脂肪组织中的iNKT细胞及其在代谢稳态中的作用 | 免疫学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个脂肪组织iNKT细胞群 |
| 1122 | 2024-08-09 |
A novel recombinant cccDNA-based mouse model with long term maintenance of rcccDNA and antigenemia
2020-08, Antiviral research
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.antiviral.2020.104826
PMID:32502604
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研究论文 | 本文通过结合Cre/loxP介导的重组和腺相关病毒（AAV）载体递送策略，建立了一种新型重组共价闭合环状DNA（rcccDNA）小鼠模型，用于研究HBV的cccDNA持久性。 | 该研究首次成功建立了能够长期维持肝内rcccDNA的小鼠模型，并通过多种检测方法验证了其持久性和稳定性。 | 尽管该模型能够模拟HBV感染的免疫耐受状态，但所测试的三种抗HBV药物均未能降低rcccDNA水平。 | 旨在开发一种适用于研究HBV cccDNA持久性和干预策略的小鼠模型。 | 研究对象为HBV的cccDNA及其在体内的持久性和免疫反应。 | NA | 肝炎 | Cre/loxP介导的重组技术，腺相关病毒（AAV）载体递送 | 小鼠模型 | DNA | 实验涉及的小鼠数量未在摘要中明确提及 |
| 1123 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq Analysis Reveals That Prenatal Arsenic Exposure Results in Long-term, Adverse Effects on Immune Gene Expression in Response to Influenza A Infection
2020-08-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfaa080
PMID:32514536
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研究论文 | 本研究探讨了孕期砷暴露对成年后流感A病毒感染免疫反应的长期影响 | 首次直接证明孕期饮用水中砷暴露会导致成年小鼠对流感A病毒感染的超炎症反应，并伴随显著的肺损伤 | NA | 研究孕期砷暴露对成年后流感A病毒感染免疫反应的影响 | C57BL/6J小鼠 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 孕期暴露于100 ppb 亚砷酸钠的小鼠，成年后感染流感A病毒(H1N1) |
| 1124 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional profiling identifies a cluster of potential metastasis-associated UBE2C+ cells in immature ovarian teratoma
2020-07-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.05.144
PMID:32505346
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了一名2岁儿童的未成熟卵巢畸胎瘤及其肝转移的细胞和分子事件 | 首次在未成熟卵巢畸胎瘤中发现UBE2C+上皮细胞簇，并探讨了其在肿瘤转移中的潜在作用 | 研究样本仅来自一名患者，可能限制了结果的普遍性 | 解析未成熟卵巢畸胎瘤的疾病异质性，并识别与转移相关的细胞和分子事件 | 未成熟卵巢畸胎瘤及其转移的细胞和分子机制 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5976个细胞 |
| 1125 | 2024-08-09 |
Human CNS barrier-forming organoids with cerebrospinal fluid production
2020-07-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz5626
PMID:32527923
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研究论文 | 本文介绍了构建具有选择性屏障和类脑脊液分泌功能的人类脉络丛类器官的方法 | 首次成功构建了具有选择性屏障和类脑脊液分泌功能的人类脉络丛类器官，并展示了其在预测新化合物中枢神经系统渗透性方面的应用 | NA | 研究人类脉络丛类器官的构建及其在预测新化合物中枢神经系统渗透性中的应用 | 人类脉络丛类器官及其分泌的类脑脊液 | NA | NA | 单细胞转录组学和蛋白质组学分析 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | NA |
| 1126 | 2024-08-09 |
BATMAN: Fast and Accurate Integration of Single-Cell RNA-Seq Datasets via Minimum-Weight Matching
2020-Jun-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101185
PMID:32504875
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研究论文 | 本文提出了一种名为BATMAN的新型单细胞RNA测序数据集整合方法，通过最小权重匹配实现快速准确的整合 | BATMAN方法在多个模拟和真实数据集上显著优于现有工具，能够有效校正批次效应并保持数据集的局部结构 | NA | 提高单细胞RNA测序实验的效率和准确性 | 单细胞RNA测序数据集的整合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最小权重匹配 | 基因表达数据 | 多个数据集中的大量单细胞样本 |
| 1127 | 2024-08-09 |
Hepatocyte-specific TAK1 deficiency drives RIPK1 kinase-dependent inflammation to promote liver fibrosis and hepatocellular carcinoma
2020-06-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2005353117
PMID:32513687
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研究论文 | 本文研究了肝细胞特异性TAK1缺乏通过RIPK1激酶依赖的炎症促进肝纤维化和肝细胞癌的作用及机制 | 首次报道了RIPK1激酶在肝细胞特异性TAK1缺乏引起的炎症中的作用，并提出了通过抑制RIPK1激酶来减少肝纤维化和肝细胞癌发展的治疗策略 | 研究仅在老鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨RIPK1激酶在肝纤维化和肝细胞癌发展中的作用及其机制 | 肝细胞特异性TAK1缺乏和RIPK1激酶在肝纤维化和肝细胞癌中的作用 | 生物医学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老鼠模型 |
| 1128 | 2024-08-09 |
A flexible network-based imputing-and-fusing approach towards the identification of cell types from single-cell RNA-seq data
2020-Jun-11, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03547-w
PMID:32527285
|
研究论文 | 本文提出了一种基于网络的插补与融合框架NetImpute，用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型 | 该框架通过整合多种生物网络数据，利用统计方法检测噪声数据并开发新的插补模型，以估计真实数据值，并提出一种综合方法来识别细胞类型 | NA | 提高从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 插补模型 | 基因表达数据 | NA |
| 1129 | 2024-08-09 |
Selective Induction of Human Autonomic Neurons Enables Precise Control of Cardiomyocyte Beating
2020-06-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66303-3
PMID:32528170
|
研究论文 | 本研究开发了一种逐步化学诱导方法，用于诱导类似交感神经和副交感神经的自主神经系统（ANS）神经元 | 首次有效地从人多能干细胞（hPSCs）中诱导出副交感神经元，并实现了对心肌细胞搏动率的精确控制 | NA | 开发一种新的化学诱导方法，以诱导出具有特定功能的交感神经和副交感神经元 | 人多能干细胞（hPSCs）衍生的交感神经和副交感神经元 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA表达数据 | NA |
| 1130 | 2024-08-09 |
PRMT1-p53 Pathway Controls Epicardial EMT and Invasion
2020-06-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107739
PMID:32521264
|
研究论文 | 本研究揭示了蛋白精氨酸甲基转移酶1（PRMT1）在心外膜细胞侵袭和分化中的关键作用 | 首次阐明了PRMT1-p53通路在心外膜细胞命运转变中的分子机制 | NA | 探讨PRMT1-p53通路在心脏发育中的作用 | 心外膜细胞及其衍生的细胞系 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 特定的心外膜细胞系 |
| 1131 | 2024-08-09 |
The regulation and pharmacological modulation of immune complex induced type III IFN production by plasmacytoid dendritic cells
2020-06-05, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02186-z
PMID:32503683
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研究论文 | 研究系统性红斑狼疮（SLE）患者中，免疫复合物诱导的浆细胞样树突状细胞（pDCs）产生III型干扰素（IFN）的调控及药物调节机制 | 首次探讨了RNA-IC在pDCs中诱导III型IFN产生的方式，并研究了NK细胞、B细胞及多种促炎细胞因子对此过程的增强作用 | NA | 探讨RNA-IC如何诱导pDCs产生III型IFN及其调控机制 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMCs）或免疫细胞亚群 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（ddSEQ技术） | NA | RNA | 健康献血者及SLE患者的PBMCs或免疫细胞亚群 |
| 1132 | 2024-08-09 |
Detecting differential alternative splicing events in scRNA-seq with or without Unique Molecular Identifiers
2020-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007925
PMID:32502143
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCATS的方法，用于在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中进行差异剪接分析，该方法能够在低覆盖度下通过考虑技术噪声实现高灵敏度 | SCATS方法能够处理带有或不带有唯一分子标识符（UMIs）的scRNA-seq数据，并且通过分组来自同一异构体的'外显子'，即使在低测序深度下也能检测剪接事件 | NA | 研究单细胞RNA测序技术中的差异剪接事件 | 单细胞RNA测序数据中的差异剪接事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | SCATS | RNA测序数据 | 使用了模拟和真实的单细胞RNA测序数据集进行评估 |
| 1133 | 2024-08-09 |
Epithelial barriers in allergy and asthma
2020-06, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.04.010
PMID:32507228
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综述 | 本文综述了上皮屏障在过敏和哮喘中的作用及其在呼吸道炎症病理生理学中的重要性 | 利用单细胞转录组学揭示了可能与慢性呼吸道疾病相关的新的上皮细胞类型 | NA | 探讨上皮屏障缺陷在2型驱动慢性呼吸道炎症中的作用及当前临床诊断和治疗挑战 | 上皮屏障在过敏性鼻炎、慢性鼻窦炎和哮喘中的功能障碍 | NA | 过敏性鼻炎, 慢性鼻窦炎, 哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 1134 | 2024-08-09 |
Benchmarking single-cell RNA-sequencing protocols for cell atlas projects
2020-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-0469-4
PMID:32518403
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研究论文 | 本研究通过多中心研究比较了13种常用的单细胞RNA测序和单核RNA测序协议，评估了它们在全面描述细胞类型和状态方面的能力 | 首次系统性地评估了不同单细胞RNA测序协议在构建细胞图谱项目中的性能差异 | 研究仅限于13种常用协议，未涵盖所有可能的单细胞RNA测序技术 | 评估不同单细胞RNA测序协议在细胞图谱项目中的适用性和性能 | 13种常用的单细胞RNA测序和单核RNA测序协议 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了异质性参考样本资源 |
| 1135 | 2024-08-09 |
An in vitro model of early anteroposterior organization during human development
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2383-9
PMID:32528178
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研究论文 | 本文展示了人类胚胎干细胞可以生成三维多细胞聚集体（gastruloids），这些聚集体在不需要额外胚外组织的情况下，能够分化形成三个胚层的衍生物，并沿前后轴延长，显示出基因表达的模式 | 首次使用人类胚胎干细胞生成gastruloids，为研究人类早期发育中的轴向组织提供了可操作的模型系统 | NA | 揭示和研究人类早期发育中轴向组织特有的调控过程 | 人类胚胎干细胞生成的gastruloids | 发育生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 72小时的人类gastruloids |
| 1136 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response to severe COVID-19
2020-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.04.17.20069930
PMID:32511639
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了7名确诊COVID-19患者和6名健康对照者的外周血单个核细胞，揭示了COVID-19患者外周免疫细胞表型的显著重构 | 首次详细描绘了严重COVID-19患者外周免疫反应的细胞图谱，包括异质性干扰素刺激基因签名、HLA II类下调及新型B细胞衍生粒细胞的出现 | NA | 深入理解COVID-19的病理生理机制 | COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 7名COVID-19患者和6名健康对照者 |
| 1137 | 2024-08-09 |
POFUT1 is dispensable for structure, function and survival of mouse podocytes
2020, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:32509213
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研究论文 | 研究探讨了POFUT1基因在鼠足细胞结构、功能和存活中的必要性 | 通过单细胞RNA测序确定了POFUT1在鼠足细胞中的非必要性，并提出了预测POFUT1在其他细胞类型中必要性的可行性 | NA | 研究POFUT1基因在鼠足细胞中的作用及其非必要性的原因 | 鼠足细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 条件性敲除小鼠与野生型对照 |
| 1138 | 2024-08-09 |
Analysis of Gene Signatures of Tumor Microenvironment Yields Insight Into Mechanisms of Resistance to Immunotherapy
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00348
PMID:32528935
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，对肿瘤微环境进行分类，并识别出特定表型的基因，以揭示免疫治疗抵抗的潜在机制 | 通过单细胞RNA测序技术，首次将肿瘤微环境分为免疫治疗响应和非响应的炎症型，并识别出特定表型的基因，为理解免疫治疗抵抗机制提供了新视角 | 研究主要集中在肿瘤微环境的基因表达分析，未涉及临床试验验证潜在药物的效果 | 旨在揭示肿瘤微环境中免疫治疗抵抗的机制，并探索提高免疫治疗效果的潜在药物 | 肿瘤微环境中的基因表达模式及其与免疫治疗响应的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1139 | 2024-08-09 |
Effect of intra- and inter-tumoral heterogeneity on molecular characteristics of primary IDH-wild type glioblastoma revealed by single-cell analysis
2020-09, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.13396
PMID:32488994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了IDH野生型原发性胶质母细胞瘤细胞的分子特征受肿瘤内和肿瘤间异质性的影响 | 研究首次详细分析了IDH野生型胶质母细胞瘤的肿瘤内和肿瘤间异质性对其分子特征的影响，并探讨了细胞间的通信机制 | 研究主要依赖于数据库中的数据，可能存在样本选择偏倚；且未涉及所有可能的细胞亚型和分子机制 | 揭示肿瘤内和肿瘤间异质性对IDH野生型胶质母细胞瘤细胞分子特征的影响 | IDH野生型胶质母细胞瘤细胞的分子特征及其异质性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自GEO和TCGA数据库的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 1140 | 2024-08-09 |
Early cleavage of preimplantation embryos is regulated by tRNAGln-TTG-derived small RNAs present in mature spermatozoa
2020-08-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA120.013003
PMID:32487749
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研究论文 | 本研究探讨了精子中的tRNA衍生小RNA（tsRNAs）在早期胚胎发育中的作用，特别是在猪模型中，这些tsRNAs如何影响胚胎早期的分裂过程。 | 首次揭示了特定tsRNA组（Gln-TTGs）在猪早期胚胎分裂中的功能，这些tsRNAs可能通过调节细胞周期相关基因和逆转座子来影响胚胎发育。 | NA | 阐明精子中的tRNA衍生小RNA在早期胚胎发育中的具体作用。 | 猪的早期胚胎发育过程。 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |