单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1041 - 1060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1041 | 2024-08-09 |
Immunophenotyping of COVID-19 and influenza highlights the role of type I interferons in development of severe COVID-19
2020-07-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abd1554
PMID:32651212
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康捐赠者、轻度或重度COVID-19患者以及重度流感患者的外周血单个核细胞（PBMCs），以识别导致COVID-19严重进展的因素 | 首次揭示了重度COVID-19患者中I型干扰素反应与TNF/IL-1β驱动的炎症共存的现象，并提出I型干扰素在加重COVID-19炎症中的关键作用 | NA | 识别导致COVID-19严重进展的因素 | 健康捐赠者、轻度或重度COVID-19患者以及重度流感患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康捐赠者、轻度或重度COVID-19患者以及重度流感患者的PBMCs样本 |
| 1042 | 2024-08-09 |
Selective LXR agonist DMHCA corrects retinal and bone marrow dysfunction in type 2 diabetes
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.137230
PMID:32641586
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研究论文 | 本研究探讨了选择性LXR激动剂DMHCA在2型糖尿病小鼠和人类循环血管生成细胞中的作用及其分子机制 | DMHCA能够纠正糖尿病引起的视网膜和骨髓功能障碍，恢复视网膜结构和胆固醇稳态，并减少系统性炎症 | NA | 研究DMHCA在2型糖尿病中的治疗效果及其分子机制 | 2型糖尿病小鼠和人类循环血管生成细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2型糖尿病小鼠和人类循环血管生成细胞 |
| 1043 | 2024-08-09 |
Comparative analysis of single-cell transcriptomics in human and Zebrafish oocytes
2020-Jul-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-06860-z
PMID:32640983
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术比较了人类和斑马鱼卵母细胞的基因表达 | 首次详细比较了斑马鱼和人类卵母细胞的转录组，并发现高度表达的同源基因在两种生物中具有相似的功能类别 | NA | 探讨斑马鱼和人类卵母细胞在基因表达水平上的相似性 | 人类和斑马鱼的卵母细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及斑马鱼和人类卵母细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 1044 | 2024-08-09 |
Sierra: discovery of differential transcript usage from polyA-captured single-cell RNA-seq data
2020-07-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02071-7
PMID:32641141
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Sierra的计算流程，用于从常用的polyA捕获的单细胞RNA-seq数据中发现差异转录本使用情况 | Sierra能够检测单细胞RNA-seq数据中的差异转录本使用情况，这是当前大多数单细胞RNA-seq生物信息学工具所忽略的 | NA | 开发一种新的计算方法来分析单细胞RNA-seq数据中的差异转录本使用情况 | 单细胞RNA-seq数据中的差异转录本使用情况 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 包括人类外周血单个核细胞和Tabula Muris数据集 |
| 1045 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals that glioblastoma recapitulates a normal neurodevelopmental hierarchy
2020-07-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17186-5
PMID:32641768
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了成人胶质母细胞瘤细胞和正常人类胎儿脑细胞的转录组，揭示了胶质母细胞瘤重现正常神经发育层次的现象 | 发现了胶质母细胞瘤中保守的神经三线性癌症层次结构，并展示了这种层次结构在识别特定于癌症干细胞的治疗靶点中的应用 | NA | 探讨癌症干细胞在胶质母细胞瘤起始、发展和治疗抵抗中的作用，并揭示其与胶质母细胞瘤异质性的关系 | 成人胶质母细胞瘤细胞和正常人类胎儿脑细胞 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53586个成人胶质母细胞瘤细胞和22637个正常人类胎儿脑细胞 |
| 1046 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals that lung mesenchymal progenitor cells in IPF exhibit pathological features early in their differentiation trajectory
2020-07-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66630-5
PMID:32636398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了335个从3名对照组和3名特发性肺纤维化（IPF）患者肺部分离的间充质前体细胞（MPCs）的转录组，探讨了IPF MPCs在其分化轨迹中获得纤维化特性的位置 | 首次使用转录熵作为分化状态的指标，并验证了CD44作为最熵IPF MPCs的特征，以及通过FACS和形态学验证分析 | NA | 确定特发性肺纤维化中MPCs在其分化轨迹中何时获得纤维化特性 | 间充质前体细胞（MPCs） | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 335个MPCs，来自3名对照组和3名IPF患者 |
| 1047 | 2024-08-09 |
Baseline Frequency of Inflammatory Cxcl9-Expressing Tumor-Associated Macrophages Predicts Response to Avelumab Treatment
2020-07-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107873
PMID:32640238
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肿瘤微环境中的免疫异质性，探讨avelumab治疗反应的潜在机制 | 发现了一种与avelumab治疗反应相关的促炎性肿瘤相关巨噬细胞群体，这些巨噬细胞是干扰素诱导的趋化因子Cxcl9的主要来源 | NA | 研究avelumab治疗反应的潜在机制 | 肿瘤微环境中的免疫异质性及肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 1048 | 2024-08-09 |
Single-Cell and Population Transcriptomics Reveal Pan-epithelial Remodeling in Type 2-High Asthma
2020-07-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107872
PMID:32640237
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了IL-13在人类气道上皮细胞培养中的作用，揭示了IL-13在哮喘类型2高（T2H）中的广泛上皮重塑现象。 | 发现IL-13在所有细胞类型中诱导了一个独特的转录状态，导致粘液分泌细胞和防御分泌细胞转变为一种具有新生物合成和分泌功能的化生状态，同时在纤毛细胞中引起内质网应激和细胞死亡。 | NA | 进一步研究不完全理解的哮喘类型2高（T2H）的病理生物学机制。 | IL-13对人类气道上皮细胞的影响。 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及哮喘类型2高和类型2低儿童的鼻气道上皮细胞。 |
| 1049 | 2024-08-09 |
Comparison of Scanpy-based algorithms to remove the batch effect from single-cell RNA-seq data
2020-Jul-06, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-020-00041-9
PMID:32632608
|
研究论文 | 本文比较了四种基于Scanpy的批量校正方法在两个大型单细胞RNA测序数据集上的优势和局限性 | 本文量化评估了批量校正性能和效率，并在算法层面讨论了评估方法之间的性能差异 | NA | 研究如何选择最佳的整合方法来去除批量效应 | 四种常用的基于Scanpy的批量校正方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据 | 两个大型单细胞RNA测序数据集 |
| 1050 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analyses of the Developing Meninges Reveal Meningeal Fibroblast Diversity and Function
2020-07-06, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.06.009
PMID:32634398
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了发育中的脑膜，揭示了脑膜成纤维细胞的多样性和功能 | 首次报道了胚胎期硬脑膜、蛛网膜和软脑膜中成纤维细胞的不同转录特征，并定义了新的脑膜层标志物 | NA | 研究脑膜成纤维细胞的异质性和发育机制 | 脑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1051 | 2024-08-09 |
The Impact of Single-Cell Genomics on Adipose Tissue Research
2020-Jul-05, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21134773
PMID:32635651
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）在脂肪细胞生物学以及肥胖和糖尿病研究中的应用 | 结合纳米技术、分子生物学和信息学的独特调查能力，扩展了对脂肪组织组成和功能特化方面的理解 | NA | 总结scRNA-seq和snRNA-seq在脂肪细胞生物学中的应用，并推广其在肥胖和糖尿病研究中的使用 | 脂肪组织及其在代谢疾病中的作用 | 基因组学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 1052 | 2024-08-09 |
How far is single-cell sequencing from clinical application?
2020-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.117
PMID:32623809
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1053 | 2024-08-09 |
Simple Method to Quantify Protein Abundances from 1000 Cells
2020-Jun-30, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c01191
PMID:32637829
|
研究论文 | 本文介绍了一种从最少1000个哺乳动物干细胞中定量蛋白质表达水平的方法 | 该方法整合并优化了多项近期进展，使用化学肽标记，无需特定设备，能高重复性地定量超过2500种蛋白质 | NA | 开发一种从少量细胞中定量蛋白质表达水平的方法 | 哺乳动物干细胞和体外分化的运动神经元 | 蛋白质组学 | NA | 化学肽标记 | NA | 蛋白质数据 | 最少1000个细胞 |
| 1054 | 2024-08-09 |
Simulation, power evaluation and sample size recommendation for single-cell RNA-seq
2020-12-08, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa607
PMID:32614380
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研究论文 | 本文提出了一种基于模拟的方法POWSC，用于单细胞RNA测序差异表达分析的功率评估和样本量推荐 | POWSC方法在捕捉真实数据集的关键特征方面优于其他两种先进的模拟器，并提供了多种功率评估，包括分层和边际功率分析 | NA | 确定高吞吐量实验设计阶段中检测统计显著性所需样本量的关键步骤 | 单细胞RNA测序中的样本量计算 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | NA |
| 1055 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals novel mechanisms of Aflatoxin B1-induced hepatotoxicity in S phase-arrested L02 cells
2020-12, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-020-09547-z
PMID:32607778
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和单细胞简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）技术，探讨了黄曲霉素B1（AFB1）在S期停滞的L02细胞中诱导肝毒性的机制 | 本研究揭示了AFB1通过调节促性腺激素释放激素受体途径、Wnt信号通路和TGF-beta信号通路中的DNA甲基化作用，诱导S期停滞的L02细胞肝毒性的新机制 | NA | 研究AFB1在S期停滞的L02细胞中诱导肝毒性的机制 | S期停滞的L02细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序，单细胞简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS） | NA | RNA，DNA | NA |
| 1056 | 2024-08-09 |
GPress: a framework for querying general feature format (GFF) files and expression files in a compressed form
2020-09-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa604
PMID:32609343
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研究论文 | 本文提出了一种名为GPress的框架，用于以压缩形式查询GFF文件和表达文件 | GPress框架能够显著减少存储空间，同时支持对GFF文件和表达文件的快速查询 | NA | 开发一种新的框架以优化GFF文件和表达文件的存储和查询效率 | GFF文件和表达文件的压缩与查询 | 生物信息学 | NA | GFF, GTF, GFF3, BSC压缩算法 | NA | 序列数据 | 涉及多种生物的GFF文件和表达文件 |
| 1057 | 2024-08-09 |
CD81 Controls Beige Fat Progenitor Cell Growth and Energy Balance via FAK Signaling
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.021
PMID:32615086
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，发现并验证了CD81在调控米色脂肪祖细胞增殖和能量平衡中的关键作用 | 首次揭示了CD81作为米色脂肪祖细胞的标记物，并发现其在冷暴露后新生米色脂肪生物发生中的必要性 | 研究主要集中在CD81的功能验证上，对于其具体分子机制和调控网络的深入解析尚需进一步研究 | 探讨米色脂肪祖细胞的发育起源及其调控途径 | 米色脂肪祖细胞及其相关蛋白CD81 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 1058 | 2024-08-09 |
Global Dynamic Molecular Profiling of Stomatal Lineage Cell Development by Single-Cell RNA Sequencing
2020-08-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2020.06.010
PMID:32592820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术对5天龄拟南芥幼苗子叶中的12,844个单个细胞进行分析，全面描述了气孔系细胞发育的分子动态过程 | 首次基于单细胞转录组分析全面描述了气孔系细胞发育的生物学过程，并揭示了调控从分生组织母细胞到保卫细胞母细胞发育的转录网络 | NA | 理解气孔系细胞发育过程中新鉴定标记基因的调控作用 | 气孔系细胞发育 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12,844个单个细胞 |
| 1059 | 2024-08-09 |
Application of single-cell RNA sequencing on human skin: Technical evolution and challenges
2020-Aug, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2020.06.002
PMID:32593488
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类皮肤研究中的应用及其技术进步和挑战 | scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率进行基因表达分析，并识别细胞异质性，从而深化了对皮肤生物学多个方面的理解 | 由于单个细胞中可检测到的mRNA数量较少以及样本准备过程中转录组的变化，scRNA-seq数据通常非常嘈杂，且样本准备和生物信息学分析方法的不标准化阻碍了可靠的跨研究比较 | 探讨scRNA-seq在皮肤学研究中的优势和技术挑战 | 人类皮肤细胞的基因表达和细胞异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 1060 | 2024-08-09 |
The ACE2 expression in Sertoli cells and germ cells may cause male reproductive disorder after SARS-CoV-2 infection
2020-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.15541
PMID:32594644
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研究论文 | 研究分析了单细胞RNA测序数据，探讨了SARS-CoV-2感染后ACE2在睾丸细胞中的表达及其对男性生殖障碍的可能影响 | 首次分析了ACE2在人类睾丸细胞中的表达，并探讨了其与男性生殖障碍的关系 | NA | 探讨SARS-CoV-2感染后ACE2在睾丸细胞中的表达及其对男性生殖功能的影响 | 人类睾丸细胞中的ACE2表达 | NA | 男性生殖障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年人类睾丸细胞 |