单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-07 |
Exploring Additional Valuable Information From Single-Cell RNA-Seq Data
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.593007
PMID:33335900
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review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据在细胞间通信探索、RNA速度推断、大规模拷贝数变异和单核苷酸变化识别、染色质可及性预测等方面的应用 | 探讨了scRNA-seq数据在发现新基因/转录本、长非编码RNA和环状RNA的分析，以及单细胞和批量RNA-seq数据集整合的应用 | NA | 旨在探索scRNA-seq数据在基础科学和临床应用中的额外价值 | scRNA-seq数据中的细胞间通信、RNA速度、拷贝数变异、单核苷酸变化、染色质可及性、新基因/转录本、长非编码RNA和环状RNA | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | NA |
| 82 | 2024-08-07 |
Stem Cell Pluripotency Genes Klf4 and Oct4 Regulate Complex SMC Phenotypic Changes Critical in Late-Stage Atherosclerotic Lesion Pathogenesis
2020-11-24, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序等技术，探讨了Klf4和Oct4基因在晚期动脉粥样硬化病变中对平滑肌细胞表型变化的影响。 | 研究发现平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化病变中表现出比普遍认为的更大的表型可塑性，并且Klf4基因调控了多种表型的转变，包括可能对晚期动脉粥样硬化病变有害的Lgals3+成骨细胞。 | NA | 探讨晚期动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的来源、身份和功能，以及它们如何控制斑块稳定性。 | 晚期动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞和内皮细胞。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | RNA | 人类颈动脉内膜切除术样本和微切割的小鼠晚期动脉粥样硬化病变样本 |
| 83 | 2024-08-07 |
Research and application of single-cell sequencing in tumor heterogeneity and drug resistance of circulating tumor cells
2020-Nov-10, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00240-1
PMID:33292625
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研究论文 | 本文研究了单细胞测序技术在肿瘤异质性和循环肿瘤细胞药物抗性中的应用 | 利用单细胞测序技术研究循环肿瘤细胞，避免了肿瘤异质性的干扰，为理解肿瘤药物抗性提供了新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在解决肿瘤异质性和药物抗性问题中的应用 | 肿瘤异质性和循环肿瘤细胞的药物抗性 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 84 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome conservation in a comparative analysis of fresh and cryopreserved human skin tissue: pilot in localized scleroderma
2020-11-09, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02343-4
PMID:33168063
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研究论文 | 本研究评估了使用CryoStor® CS10与RPMI在局部硬皮病患者皮肤组织中细胞组成和细胞特异性基因表达的变异性 | 首次比较了新鲜和冷冻保存的人类皮肤组织在单细胞转录组水平上的保守性 | 研究样本量较小，仅包括3名局部硬皮病患者 | 评估不同保存方法对局部硬皮病患者皮肤组织细胞组成和基因表达的影响 | 局部硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名局部硬皮病患者的皮肤活检样本 |
| 85 | 2024-08-07 |
CD63+ Cancer-Associated Fibroblasts Confer Tamoxifen Resistance to Breast Cancer Cells through Exosomal miR-22
2020-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202002518
PMID:33173749
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了肿瘤微环境的整体景观，并发现了一种新的癌症相关成纤维细胞（CD63 CAFs），这种细胞通过分泌富含miR-22的胞外囊泡促进乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 首次揭示了CD63 CAFs通过分泌富含miR-22的胞外囊泡诱导乳腺癌细胞对他莫昔芬产生耐药性，并提出了CD63 CAFs作为增强他莫昔芬敏感性的新型治疗靶点 | NA | 旨在从肿瘤微环境的角度更好地理解他莫昔芬耐药性 | 乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 86 | 2024-08-07 |
Identification of diverse cell populations in skeletal muscles and biomarkers for intramuscular fat of chicken by single-cell RNA sequencing
2020-Oct-31, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07136-2
PMID:33129271
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次描述了鸡骨骼肌在两个发育阶段的异质性，并鉴定了APOA1和COL1A1作为鸡肌内脂肪细胞的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群，并鉴定了新的肌内脂肪细胞生物标志物。 | NA | 研究鸡骨骼肌发育过程中的细胞异质性及其与肌内脂肪细胞的关系。 | 鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群及其基因表达。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在孵化后第5天和第100天分别鉴定了10个和7个细胞集群。 |
| 87 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of Neuroinflammatory Responses in Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Challenge or an Opportunity?
2020-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217923
PMID:33113845
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综述 | 本文综述了肌萎缩侧索硬化症（ALS）中神经炎症反应的异质性，并探讨了其作为治疗挑战或机遇的可能性 | 介绍了单细胞和空间转录组学技术在发现新的治疗靶点和非侵入性诊断/预后标志物方面的潜力 | 异质性/多方面的微胶质细胞反应在不同中枢神经系统区域的发生为单一药物疗法的临床转化带来了障碍 | 总结过去十年中关于ALS中微胶质细胞反应复杂性的研究结果，并讨论新技术带来的新治疗途径 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS）中的神经炎症反应及其微胶质细胞的作用 | NA | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 88 | 2024-08-07 |
Genomic Analysis of Hematopoietic Stem Cell at the Single-Cell Level: Optimization of Cell Fixation and Whole Genome Amplification (WGA) Protocol
2020-Oct-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21197366
PMID:33036143
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研究论文 | 本文评估了不同的细胞免疫染色、固定和全基因组扩增方法对单细胞测序效率和产量的影响 | 优化了单细胞水平上造血干细胞的细胞固定和全基因组扩增协议 | NA | 深入理解肿瘤发病机制及肿瘤群体对治疗的反应 | 造血干细胞的单细胞基因组分析 | NA | 血液系统肿瘤 | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | NA |
| 89 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals mRNA Splice Isoform Switching during Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080770
PMID:32651222
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研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎肾脏中544个单细胞的转录组，揭示了肾脏发育过程中mRNA剪接异构体转换的现象 | 本研究首次通过全长单细胞RNA测序技术，全面分析了肾脏发育过程中细胞状态转换时的剪接异构体转换，并识别了几个潜在的剪接调控因子 | NA | 揭示胎儿肾脏间质向管状上皮分化过程中基因的替代剪接机制，以增进对肾脏发育分子机制的理解 | 小鼠胚胎肾脏中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA | 544个小鼠胚胎肾脏单细胞 |
| 90 | 2024-08-07 |
An Experiment on Ab Initio Discovery of Biological Knowledge from scRNA-Seq Data Using Machine Learning
2020-Aug-14, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2020.100071
PMID:33205121
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法在单细胞RNA测序数据上进行实验，探索了在没有现有知识指导的情况下发现生物学知识的能力和局限性 | 本研究采用无监督和监督机器学习相结合的策略，揭示了主要细胞谱系，且最小程度依赖先验知识或人工干预，实现了人类早期胚胎细胞分化的新发现 | 研究展示了机器学习在复杂生物问题知识发现的可行性和重要性，但也指出了其局限性 | 探索机器学习在无现有知识指导的高通量生物数据中发现新模式的潜力和局限 | 早期胚胎发育的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | NA | 数据 | NA |
| 91 | 2024-08-07 |
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
PMID:32928889
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研究论文 | 本文研究了果蝇电压门控钠通道在神经元中的表达和亚细胞定位，发现这些通道主要在活跃神经元的远端轴突初始段样域中表达。 | 首次确定了果蝇神经元中动作电位起始的特定位置，即远端轴突段（DAS），并揭示了该位置与电压门控钠通道的富集相关。 | 研究主要集中在果蝇的神经元上，可能不完全适用于其他类型的神经元或生物体。 | 确定果蝇神经元中动作电位的起始位置，并探讨其与电压门控钠通道表达的关系。 | 果蝇的电压门控钠通道及其在神经元中的表达和定位。 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序，全细胞膜片钳电生理记录 | NA | 转录组数据，电生理数据 | 胚胎和幼虫中枢神经系统中的神经元，成年中枢神经系统中的神经元 |
| 92 | 2024-08-05 |
Second-Strand Synthesis-Based Massively Parallel scRNA-Seq Reveals Cellular States and Molecular Features of Human Inflammatory Skin Pathologies
2020-10-13, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.09.015
PMID:33053333
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研究论文 | 该文章介绍了一种新的高通量单细胞RNA测序方法，旨在揭示人类炎症性皮肤病的细胞状态和分子特征 | 文章提出了Seq-Well S方法，通过随机引物二链合成技术提高了转录本捕获和基因检测的效率 | 由于关注点主要集中在皮肤炎症，可能未能涵盖所有相关的生物学样本和病理特征 | 研究的目的是开发一种高保真和高通量的单细胞RNA测序平台 | 研究对象是五种人类炎症性皮肤疾病 | 数字病理学 | 炎症性皮肤病 | RNA-seq | NA | NA | 五种人类皮肤炎症疾病的样本 |
| 93 | 2024-08-07 |
Prospects for Use of Single-Cell Sequencing to Assess DNA Methylation in Asthma
2020-Oct-03, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.925514
PMID:33009362
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在评估哮喘中DNA甲基化作用的应用前景 | 单细胞测序技术能够揭示不同细胞群中基因的甲基化和表达情况，相较于传统的多组学测序，能更好地反映哮喘的发病机制 | 目前关于哮喘中DNA甲基化的研究较少，且主要使用单细胞测序技术的研究有限 | 研究单细胞测序技术在揭示哮喘中DNA甲基化功能和调控机制的作用 | 哮喘中的DNA甲基化 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 94 | 2024-08-07 |
Heterogeneous expression of the SARS-Coronavirus-2 receptor ACE2 in the human respiratory tract
2020-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2020.102976
PMID:32971472
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和免疫组织化学技术，系统研究了人类呼吸道中SARS-CoV-2受体ACE2的表达情况及其与COVID-19严重程度风险因素的关系 | 首次详细描述了ACE2蛋白在人类呼吸道中的分布，并探讨了其与COVID-19易感性的关系 | NA | 研究SARS-CoV-2受体ACE2在人类呼吸道中的表达及其与COVID-19严重程度的关系 | 人类呼吸道中的ACE2蛋白表达 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 蛋白质 | NA |
| 95 | 2024-08-05 |
An optimized protocol for retina single-cell RNA sequencing
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33088174
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研究论文 | 本研究提出了一种优化的视网膜单细胞RNA测序的协议 | 提出了一种温和的视网膜解离方法，最大限度减少细胞死亡并保存细胞形态，同时改进计算管道以提高单细胞RNA测序数据的质量 | 对新鲜与冷冻视网膜在制备细胞或细胞核悬浮液方面的优缺点进行了演示 | 优化视网膜样本的单细胞RNA测序流程，获得更高质量的转录组数据 | 小鼠视网膜样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | 小鼠视网膜样本的数量未明确说明 |
| 96 | 2024-08-05 |
Controlled Cycling and Quiescence Enables Efficient HDR in Engraftment-Enriched Adult Hematopoietic Stem and Progenitor Cells
2020-09-01, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108093
PMID:32877675
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研究论文 | 本文研究了通过控制细胞周期和静止状态来提高成年造血干细胞和祖细胞中同源重组修复效率的方法 | 提出了一种控制循环和静止状态的策略，使得静息干细胞中HDR与NHEJ的比率增加了6倍 | 文章中未具体说明对所有类型细胞的影响，主要集中在特定亚群体 | 探讨并重新编程成年造血干细胞和祖细胞中的基因组编辑结果 | 成年造血干细胞和祖细胞的亚群体 | 数字病理学 | NA | 下一代测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | NA |
| 97 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Six Subpopulations Reflecting Distinct Cellular Fates in Senescent Mouse Embryonic Fibroblasts
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00867
PMID:32849838
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了衰老小鼠胚胎成纤维细胞的六个亚群，揭示了不同的细胞命运。 | 本研究首次在衰老的小鼠胚胎成纤维细胞中识别出六个具有明显异质性的亚群，并发现HOXD8是新的衰老调控因子。 | 该研究主要基于小鼠模型，其结果可能不完全适用于其他物种或人类。 | 本研究旨在深入了解衰老小鼠胚胎成纤维细胞中的细胞异质性及其衰老机制。 | 研究对象为衰老小鼠胚胎成纤维细胞。 | 数字病理学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个衰老小鼠胚胎成纤维细胞 |
| 98 | 2024-08-05 |
The history and advances in cancer immunotherapy: understanding the characteristics of tumor-infiltrating immune cells and their therapeutic implications
2020-08, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-020-0488-6
PMID:32612154
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评论 | 本文回顾了癌症免疫治疗的历史和最新进展，重点关注肿瘤浸润免疫细胞的特征及其治疗意义 | 本文强调了单细胞技术在全面分析肿瘤微环境中的应用，提供了肿瘤浸润免疫细胞功能多样性的见解 | 肿瘤微环境的高度异质性和动态特性阻碍了对肿瘤内免疫细胞的精确解析 | 阐明肿瘤浸润免疫细胞的特征并探讨其对癌症免疫治疗的影响 | 肿瘤浸润免疫细胞及其在癌症免疫治疗中的作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-05 |
Unveiling functional heterogeneity in breast cancer multicellular tumor spheroids through single-cell RNA-seq
2020-07-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-69026-7
PMID:32728097
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌多细胞肿瘤球体中的功能异质性 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了不同细胞亚型之间的功能关系及其对肿瘤发展的促进作用 | 研究仅限于MCF7多细胞肿瘤球体模型，可能不适用于所有类型的乳腺癌 | 研究肿瘤细胞亚群间的功能关系及其在肿瘤进展中的作用 | 乳腺癌细胞系MCF7的多细胞肿瘤球体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | MCF7多细胞肿瘤球体的单细胞样本，两个时间点的分析 |
| 100 | 2024-08-05 |
Prototypical pacemaker neurons interact with the resident microbiota
2020-07-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1920469117
PMID:32647059
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研究论文 | 本研究识别和功能性表征了基底多细胞生物中的原型节律神经元，阐明了其与微生物之间的相互作用 | 识别了原型节律神经元表达丰富的免疫相关基因，并提出了节律神经元进化起源的新模型 | 对节律神经元及其与微生物相互作用的了解仍然有限 | 旨在探讨节律神经元的进化起源及其与微生物的相互作用 | 基底多细胞生物中的原型ANO/SCN/TRPM离子通道表达的节律细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、免疫化学和功能实验 | NA | NA | NA |