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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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961 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of early female germ cell development
2020-09, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202001034RR
PMID:32716582
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术揭示了早期雌性生殖细胞发育的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了从原始生殖细胞到减数分裂细胞的转录组变化,并确定了减数分裂起始的关键阶段 | 研究仅限于小鼠胚胎卵巢样本,可能需要进一步研究以验证在其他物种中的适用性 | 解析雌性生殖细胞从有丝分裂到减数分裂转变的分子机制 | 小鼠胚胎卵巢中的单个生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 19,363个单个生殖细胞从小鼠胚胎卵巢E12.5、E14.5和E16.5收集 |
962 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals neutrophil heterogeneity in homeostasis and infection
2020-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0736-z
PMID:32719519
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,分析了超过25,000个分化和成熟的鼠中性粒细胞,揭示了中性粒细胞在稳态和细菌感染中的异质性和分化景观 | 本文首次全面描述了中性粒细胞在稳态和细菌感染中的转录组景观,定义了八个具有独特分子特征的中性粒细胞群体,并展示了细菌感染如何重新编程中性粒细胞的遗传结构 | NA | 研究中性粒细胞在稳态和细菌感染中的异质性和分化机制 | 分化和成熟的鼠中性粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过25,000个分化和成熟的鼠中性粒细胞 |
963 | 2024-08-09 |
Stimulation of Oncogene-Specific Tumor-Infiltrating T Cells through Combined Vaccine and αPD-1 Enable Sustained Antitumor Responses against Established HER2 Breast Cancer
2020-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-0389
PMID:32732224
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研究论文 | 本文探讨了通过结合疫苗和αPD-1刺激特定肿瘤浸润T细胞,以实现对已建立的HER2阳性乳腺癌的持续抗肿瘤反应 | 本文首次提出将针对致癌驱动因子的靶向疫苗与免疫检查点阻断(ICB)相结合,以增强T细胞浸润并实现对晚期癌症的抗肿瘤免疫 | NA | 旨在增强乳腺癌免疫疗法中的T细胞浸润,并探索靶向疫苗与免疫检查点阻断的联合应用效果 | HER2阳性乳腺癌模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小数量的新生抗原和升高的免疫抑制标志物 |
964 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis revealed long-lasting adverse effects of tamoxifen on neurogenesis in prenatal and adult brains
2020-08-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1918883117
PMID:32727894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了他莫昔芬对胚胎期和成年大脑神经发生的长久不良影响 | 首次通过单细胞RNA测序结合体内外实验,揭示他莫昔芬通过失调WntDmrta2信号通路对神经发生的影响 | NA | 探讨他莫昔芬对大脑神经发生的影响及其分子机制 | 胚胎期和成年大脑的神经发生 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
965 | 2024-08-09 |
Expression of Amyloidogenic Transthyretin Drives Hepatic Proteostasis Remodeling in an Induced Pluripotent Stem Cell Model of Systemic Amyloid Disease
2020-08-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.07.003
PMID:32735824
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研究论文 | 本文利用遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性(ATTR淀粉样变性)诱导的多能干细胞(iPSCs)模型,研究了肝细胞样细胞(HLCs)对分泌的转甲状腺素蛋白(TTR)的蛋白质毒性的贡献。 | 通过生成表达淀粉样变性或野生型TTR的同源、患者特异性iPSCs,并结合单细胞RNA测序,识别了与iPSC衍生HLCs中不稳定TTR产生相关的肝脏蛋白质稳态因子。 | NA | 定义肝细胞样细胞对分泌的转甲状腺素蛋白的蛋白质毒性的贡献 | 遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性诱导的多能干细胞模型 | 数字病理学 | 系统性淀粉样变性病 | 单细胞RNA测序 | iPSCs | RNA | 表达淀粉样变性或野生型TTR的同源、患者特异性iPSCs |
966 | 2024-08-09 |
Mapping a mammalian adult adrenal gland hierarchy across species by microwell-seq
2020-Aug-03, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-020-00042-8
PMID:32743779
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研究论文 | 本文通过结合Microwell-seq技术和BGI MGISEQ2000测序平台,对小鼠成年肾上腺细胞进行单细胞RNA测序,并进行了人与小鼠成年肾上腺的单细胞比较分析 | 首次使用Microwell-seq结合BGI MGISEQ2000平台进行单细胞RNA测序,揭示了哺乳动物肾上腺的保守遗传网络 | NA | 探索哺乳动物成年肾上腺的细胞层次结构 | 小鼠和人的成年肾上腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 11,883个小鼠成年肾上腺细胞 |
967 | 2024-08-09 |
Activation of a neural stem cell transcriptional program in parenchymal astrocytes
2020-08-03, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59733
PMID:32744501
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了Notch信号减少后纹状体星形胶质细胞在体内的神经发生过程 | 发现实质性星形胶质细胞具有潜在的神经干细胞特性,并通过靶向干预促进其神经分化 | 研究主要集中在小鼠模型上,需要进一步在其他物种中验证 | 探究星形胶质细胞在Notch信号减少后的神经发生机制 | 纹状体和皮质星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
968 | 2024-08-09 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
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研究论文 | 本文开发了一种小鼠模型,用于在单细胞分辨率下研究拉伸对皮肤表皮的影响,并结合多种方法揭示了拉伸诱导皮肤扩张的机制。 | 首次在单细胞分辨率下研究拉伸对皮肤表皮细胞行为的影响,并定义了拉伸介导组织扩张的详细机制。 | NA | 研究拉伸如何影响皮肤表皮细胞的行为及其分子机制。 | 皮肤表皮细胞在拉伸下的行为和分子机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型 |
969 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulator function through mouse gastrulation
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2552-x
PMID:32728215
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研究论文 | 本文通过结合合子扰动和单细胞RNA测序技术,研究了小鼠原肠胚形成期间多个关键调控因子的功能。 | 本文采用了一种新的实验框架,通过同时检测多个突变小鼠胚胎,获取了强有力的形态学和转录信息。 | 本文主要集中在原肠胚形成后的阶段,对于之前的发育阶段的研究较少。 | 研究小鼠原肠胚形成期间表观遗传调控因子的直接发育作用。 | 研究对象包括小鼠胚胎中的多个关键表观遗传调控因子。 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 研究涉及多个突变小鼠胚胎 |
970 | 2024-08-09 |
Histone deacetylase 3 controls lung alveolar macrophage development and homeostasis
2020-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17630-6
PMID:32732898
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白去乙酰化酶3(HDAC3)在肺泡巨噬细胞胚胎发育、出生后稳态、成熟及骨髓再生中的关键作用 | 首次阐明HDAC3是调控肺泡巨噬细胞发育和稳态的关键表观遗传因子 | NA | 探讨肺泡巨噬细胞发育和维持的调控机制 | 肺泡巨噬细胞的发育、稳态、成熟及再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个肺泡巨噬细胞亚群 |
971 | 2024-08-09 |
mSphere of Influence: Organoids and Single-Cell Sequencing, a Powerful Combination To Uncover Epithelial and Immune Cell Interactions in the Human Gut Environment
2020-07-29, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/mSphere.00722-20
PMID:32727865
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评论 | 文章回顾了肠道类器官和高通量单细胞测序技术在黏膜免疫学领域的应用 | 结合肠道类器官和高通量单细胞测序技术,为研究宿主对肠道病原体的免疫机制提供了新的机会 | NA | 探讨黏膜免疫学和疫苗研究中肠道类器官与单细胞测序技术的应用 | 肠道上皮细胞和免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
972 | 2024-08-09 |
Interactions of Monocytes, HIV, and ART Identified by an Innovative scRNAseq Pipeline: Pathways to Reservoirs and HIV-Associated Comorbidities
2020-07-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01037-20
PMID:32723919
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研究论文 | 本文开发了一种创新的单细胞RNA测序(scRNAseq)流程,用于同时检测HIV和宿主转录本,并研究了成熟单核细胞亚群在HIV和抗逆转录病毒治疗(ART)下的差异表达基因。 | 本文首次使用scRNAseq技术同时检测HIV和宿主转录本,并揭示了HIV成熟单核细胞与未感染单核细胞之间的基因表达差异。 | NA | 研究HIV和ART对成熟单核细胞亚群的影响,以及这些亚群在HIV相关并发症和病毒库形成中的作用。 | 成熟单核细胞亚群,包括CD14CD16细胞,以及它们在HIV和ART下的基因表达差异。 | 数字病理学 | HIV | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 转录本 | NA |
973 | 2024-08-09 |
Cycling Stem Cells Are Radioresistant and Regenerate the Intestine
2020-07-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107952
PMID:32726617
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研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了肠道隐窝中Msi1标记细胞的DNA损伤抵抗特性及其在肠道再生中的作用 | 首次揭示了Msi1细胞作为循环肠道干细胞在肠道再生中的关键作用,这些细胞具有DNA损伤抵抗性,能够在Lgr5细胞不出现时有效重构肠道上皮 | NA | 阐明肠道再生过程中的细胞机制 | 肠道隐窝中的Msi1标记细胞及其在肠道再生中的作用 | NA | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单个细胞 |
974 | 2024-08-09 |
Bayesian model selection reveals biological origins of zero inflation in single-cell transcriptomics
2020-07-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02103-2
PMID:32718323
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研究论文 | 本文通过贝叶斯模型选择方法,明确展示了在多个生物学上现实的单细胞RNA测序数据集中存在零膨胀现象,并指出其主要原因不是技术性的而是生物学性质的 | 本文首次通过贝叶斯模型选择方法明确展示了单细胞RNA测序数据中的零膨胀现象,并揭示了其生物学起源 | 尽管证明了零膨胀的存在,但作者推荐使用非零膨胀的负二项分布的广义线性模型作为单细胞RNA测序分析的合适参考模型 | 探讨单细胞RNA测序数据中零膨胀的生物学起源及其在分析中的适当处理方法 | 单细胞RNA测序数据中的零膨胀现象及其生物学和技术学原因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型选择 | 基因表达数据 | 多个生物学上现实的单细胞RNA测序数据集 |
975 | 2024-08-09 |
Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) are emerging therapeutics for hematologic malignancies
2020-07-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-020-00924-z
PMID:32718354
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综述 | 本文综述了蛋白酶体靶向嵌合体(PROTACs)在血液恶性肿瘤治疗中的应用潜力,并讨论了提高其临床安全性的策略 | PROTACs通过独特的机制(即以亚化学计量方式降解目标蛋白),能够靶向“不可成药”和突变蛋白,并提高目标选择性 | PROTACs在临床应用中存在一些靶向毒性问题 | 探讨PROTACs在血液恶性肿瘤治疗中的应用及提高其安全性的策略 | PROTACs及其在血液恶性肿瘤治疗中的应用 | NA | 血液恶性肿瘤 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
976 | 2024-08-09 |
scPADGRN: A preconditioned ADMM approach for reconstructing dynamic gene regulatory network using single-cell RNA sequencing data
2020-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007471
PMID:32716923
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPADGRN的新方法,用于利用单细胞RNA测序数据重建动态基因调控网络 | scPADGRN结合了预处理交替方向乘子法和细胞聚类,提高了准确性、鲁棒性和快速收敛性 | NA | 重建动态基因调控网络,揭示细胞分化和疾病发展中的关键转录调控因子 | 单细胞RNA测序数据中的动态基因调控网络 | 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 预处理交替方向乘子法 | 时间序列数据 | 基于三个真实的单细胞数据集 |
977 | 2024-08-09 |
Recent advances of single-cell RNA sequencing technology in mesenchymal stem cell research
2020-Jun-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v12.i6.438
PMID:32742561
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在间充质干细胞研究中的最新进展 | 通过单细胞RNA测序技术,识别了间充质干细胞的新表面标记和功能亚群 | 讨论了单细胞RNA测序在间充质干细胞研究中的挑战和未来方向 | 探讨单细胞RNA测序技术在间充质干细胞及其相关疾病病理生理中的应用 | 间充质干细胞及其在疾病中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
978 | 2024-08-09 |
Midbrain Dopaminergic Neuron Development at the Single Cell Level: In vivo and in Stem Cells
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00463
PMID:32733875
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研究论文 | 本文探讨了中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育,特别是在体内和干细胞中的发育 | 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和生物信息学技术,详细分析了人类发育中脑中的细胞类型及其基因表达模式 | 目前对人类多巴胺能神经元发育的程序了解较少 | 阐明人类多巴胺能神经元的发育过程,并探讨其在帕金森病细胞替代治疗和疾病模型中的应用 | 中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
979 | 2024-08-09 |
Comparative analysis of cell lineage differentiation during hepatogenesis in humans and mice at the single-cell transcriptome level
2020-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-020-0378-6
PMID:32690901
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术,比较了人类和小鼠胚胎发育过程中肝脏细胞谱系分化的差异 | 发现了人类和小鼠肝脏细胞谱系的新标记物,并验证了肝母细胞分化遵循“默认导向”模型 | NA | 揭示人类和小鼠胚胎肝脏发育的细胞动态景观,并比较两者之间的异同 | 人类和小鼠的胚胎肝脏细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 人类和小鼠的整个胚胎肝脏 |
980 | 2024-08-09 |
Single-Cell Reconstruction of Human Basal Cell Diversity in Normal and Idiopathic Pulmonary Fibrosis Lungs
2020-12-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201904-0792OC
PMID:32692579
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术,分析了正常和特发性肺纤维化(IPF)肺组织中上皮细胞的转录组,以揭示基底干细胞在疾病中的变化 | 发现基底细胞包括多能性和分泌性基底细胞亚群,并且这些细胞在IPF中表现出特定的扩张 | NA | 旨在更好地理解基底细胞增生及其相关分泌功能障碍在特发性肺纤维化发展中的作用 | 正常和特发性肺纤维化肺组织中的上皮细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自正常和IPF肺组织的孤立上皮细胞 |