单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 941 - 960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 941 | 2024-08-09 |
Enhancing myocardial repair with CardioClusters
2020-08-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17742-z
PMID:32769998
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研究论文 | 本文研究通过使用CardioClusters（一种由三种不同的心脏来源间质细胞组成的3D结构）来增强心肌修复效果 | 首次报道了使用CardioClusters这种无支架的3D微环境结构，通过scRNA-Seq技术揭示了其表达与干细胞相关的因子、粘附/细胞外基质分子和细胞因子，同时保持与内源性心脏细胞相似的转录组 | 研究仅在预临床的小鼠心肌梗死模型中进行，尚未进行临床试验 | 探索通过细胞疗法改善心脏功能的新方法 | 心肌修复和心脏功能改善 | 细胞疗法 | 心血管疾病 | scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 小鼠模型，追踪20周 |
| 942 | 2024-08-09 |
Finding a Needle in a Haystack: Identification of a Beige Fat Progenitor
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.014
PMID:32763184
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研究论文 | Oguri等研究者利用单细胞RNA测序技术，在皮下脂肪组织中鉴定出一种棕色脂肪前体细胞，该细胞能分化为产热脂肪细胞 | 首次鉴定出标记为PDGFRα、Sca1和CD81的棕色脂肪前体细胞，并发现其在冷刺激和鸢尾素作用下通过FAK信号通路增殖 | NA | 鉴定棕色脂肪前体细胞及其调控机制 | 棕色脂肪前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 943 | 2024-08-09 |
scTyper: a comprehensive pipeline for the cell typing analysis of single-cell RNA-seq data
2020-Aug-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03700-5
PMID:32753029
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scTyper的综合性R语言工具包，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型分析 | scTyper提供了一个包含213个细胞标记集的数据库scTyper.db，并实现了三种定制方法来估计细胞类型标记表达，以及改进的DNA拷贝数推断方法inferCNV用于恶性细胞类型分析 | NA | 开发一个综合且用户友好的工具包，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包含213个细胞标记集的数据库 |
| 944 | 2024-08-09 |
Fusion transcript detection using spatial transcriptomics
2020-08-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-020-00738-5
PMID:32753032
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STfusion的新方法，利用空间转录组学技术推断融合转录本的存在 | 提出了一种新的C评分方法来测量观察到的和预期的多聚A尾数量的差异，从而推断融合转录本 | NA | 研究融合转录本在肿瘤发生中的作用及其在组织切片中的空间分辨率 | 融合转录本在肿瘤细胞系和临床组织数据中的检测 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 12个组织切片 |
| 945 | 2024-08-09 |
An interspecies translation model implicates integrin signaling in infliximab-resistant inflammatory bowel disease
2020-08-04, Science signaling
IF:6.7Q1
DOI:10.1126/scisignal.aay3258
PMID:32753478
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研究论文 | 本文开发了一种名为可翻译组件回归（TransComp-R）的方法，结合小鼠蛋白质组数据和患者治疗前转录组数据，以识别在小鼠数据中可预测患者治疗反应的分子特征，揭示了整合素信号通路在抗TNF治疗抵抗的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者中的激活状态。 | TransComp-R方法的创新之处在于它能够克服小鼠模型与人类受试者之间的物种和跨组学差异，为解决模型系统与患者之间的物种、分子和表型差异提供了一个可推广的框架。 | NA | 旨在克服抗肿瘤坏死因子（anti-TNF）治疗抵抗的临床挑战，通过识别和验证与治疗反应相关的分子机制。 | 研究对象包括抗TNF治疗抵抗的克罗恩病和溃疡性结肠炎患者，以及小鼠模型中的蛋白质组数据。 | 生物信息学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 可翻译组件回归（TransComp-R） | 蛋白质组数据，转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 946 | 2024-08-09 |
Nicotinamide Mononucleotide Supplementation Reverses the Declining Quality of Maternally Aged Oocytes
2020-08-04, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107987
PMID:32755581
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研究论文 | 本文研究了尼克酰胺单核苷酸（NMN）补充对自然衰老小鼠卵母细胞质量的改善效果 | 首次报道NMN补充能有效提高自然衰老小鼠卵母细胞的质量，通过恢复烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD）水平实现 | NA | 探索改善高龄产妇卵母细胞质量的有效方法 | 自然衰老小鼠的卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 947 | 2024-08-09 |
Robust gene expression programs underlie recurrent cell states and phenotype switching in melanoma
2020-08, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0547-3
PMID:32753671
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析了黑色素瘤细胞在不同状态下的基因表达程序，揭示了中间状态的存在及其调控网络 | 首次通过单细胞RNA测序和时间序列分析揭示了黑色素瘤细胞状态转换中的中间状态及其稳定的基因调控网络 | NA | 探索黑色素瘤细胞在黑色素细胞和间充质样状态之间的中间状态及其基因调控网络 | 黑色素瘤细胞的状态转换及其基因表达程序 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 10个黑色素瘤细胞培养物使用单细胞RNA测序，26个额外培养物使用批量RNA测序 |
| 948 | 2024-08-09 |
Single-Cell Heterogeneity of Cutaneous T-Cell Lymphomas Revealed Using RNA-Seq Technologies
2020-Jul-31, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12082129
PMID:32751918
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review | 本文综述了利用RNA测序和单细胞RNA测序技术揭示皮肤T细胞淋巴瘤恶性细胞分子异质性的新见解 | 利用高吞吐量技术如RNA测序和单细胞RNA测序来识别肿瘤特异性分子特征 | 皮肤T细胞淋巴瘤发展的详细发病机制仍需探索 | 总结利用高吞吐量技术揭示恶性细胞分子异质性的新见解，为治疗、诊断和预后提供指导 | 皮肤T细胞淋巴瘤的分子异质性 | digital pathology | 皮肤T细胞淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 949 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune landscape in kidneys of patients with chronic transplant rejection
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.48201
PMID:32754283
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性移植肾排斥反应患者的肾脏免疫景观 | 首次在单细胞水平上揭示了慢性移植肾排斥反应中肾脏细胞的多样性和功能差异 | 研究样本量较小，仅包括三个健康肾脏和两个慢性移植肾排斥反应样本 | 探索慢性移植肾排斥反应的细胞和分子机制 | 慢性移植肾排斥反应患者的肾脏细胞 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个健康人肾脏和两个慢性移植肾排斥反应活检样本 |
| 950 | 2024-08-09 |
Stem cell programs in cancer initiation, progression, and therapy resistance
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.41648
PMID:32754274
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）在癌症起始、进展和治疗抵抗中的关键特征和机制 | 讨论了CSC治疗抵抗的因素，如静止状态、上皮间质转化（EMT）和DNA损伤诱导的细胞死亡抵抗，并评估了消除治疗抵抗CSC亚群的治疗方法 | 仍需解决的挑战包括研究CSCs的实验方法和治疗靶向CSCs的障碍 | 阐明驱动癌症干细胞维持、可塑性和治疗抵抗的分子机制，以提高针对CSCs的靶向治疗效果 | 癌症干细胞（CSCs）及其在肿瘤进展、治疗抵抗和疾病复发中的作用 | NA | NA | 单细胞测序、CRISPR-Cas9筛选 | NA | NA | NA |
| 951 | 2024-08-09 |
Corrigendum: FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01521
PMID:32765526
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 952 | 2024-08-09 |
Gaps and Doubts in Search to Recognize Glioblastoma Cellular Origin and Tumor Initiating Cells
2020, Journal of oncology
DOI:10.1155/2020/6783627
PMID:32774372
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研究论文 | 本文讨论了胶质母细胞瘤（GB）的细胞起源及其肿瘤起始细胞的问题，并提出了基于与中枢神经系统（CNS）细胞比较的GB起源的可能建议 | 提出了GFAP阳性细胞（星形胶质细胞、放射状胶质细胞或GFAP阳性神经前体细胞）作为GB起源的可能性，并建议进一步研究应聚焦于这些细胞 | 神经生物学家在定义神经干细胞（NSC）方面的不一致性使问题复杂化 | 探讨胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞NGS和单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 953 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Profile of Meniscal Tissue Macrophages in Human Osteoarthritis
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8127281
PMID:32775469
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了人膝关节软骨组织中巨噬细胞在骨关节炎中的异质性和功能特化 | 首次系统地研究了骨关节炎中低丰度的巨噬细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了其在健康人群和骨关节炎患者中的基因表达特征变化 | NA | 深入理解骨关节炎炎症的基础，为开发新疗法提供希望 | 人膝关节软骨组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 954 | 2024-08-09 |
Autoimmunity in 2019
2020-Dec, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-020-08808-3
PMID:32729069
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综述 | 本文基于PubMed数据，对与自身免疫疾病和免疫学相关的出版物进行年度评估，以确定前者在科学文献中的相对权重 | 尽管有许多新的免疫相关机制途径，如癌症免疫疗法，但与自身免疫相关的免疫学手稿比例持续增加，2019年接近20% | NA | 评估自身免疫疾病在科学文献中的相对重要性 | 系统性红斑狼疮（SLE）、类风湿关节炎（RA）、银屑病关节炎（PsA）、自身抗体（autoAbs）以及自身免疫疾病的新治疗途径和发病机制 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质谱流式细胞术、批量RNA测序（RNA-seq）、流式细胞术 | NA | 文本 | NA |
| 955 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals multiple neuronal cell types in human midbrain-specific organoids
2020-Dec, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-020-03249-y
PMID:32737576
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、成像和电生理学方法，分析了人中脑类器官中的多种神经细胞类型 | 首次揭示了人中脑类器官中存在多种神经细胞类型，包括多巴胺能、GABA能、谷氨酸能和血清素能神经元 | NA | 揭示人中脑类器官中的细胞异质性 | 人中脑类器官中的神经细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 956 | 2024-08-09 |
Spelunking in Sputum: Single-Cell RNA Sequencing Sheds New Insights into Cystic Fibrosis
2020-11-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202006-2456ED
PMID:32721178
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 957 | 2024-08-09 |
A committed tissue-resident memory T cell precursor within the circulating CD8+ effector T cell pool
2020-10-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20191711
PMID:32728699
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和单细胞转录组分析，研究了组织驻留记忆T细胞（TRM）的起源及其与其他CD8+ T细胞亚群的关系 | 首次证明了在循环TEFF细胞中存在具有形成TRM高度能力的T细胞克隆，并揭示了TRM命运决定的早期阶段 | NA | 探讨组织驻留记忆T细胞的起源及其与其他CD8+ T细胞亚群的关系 | 组织驻留记忆T细胞（TRM）及其前体细胞 | 免疫学 | NA | 谱系追踪、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 958 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis of the Akimba mouse retina reveals cell-type-specific insights into the pathobiology of diabetic retinopathy
2020-10, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-020-05218-0
PMID:32734440
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析Akimba小鼠视网膜，揭示了糖尿病视网膜病变的细胞类型特异性病理生物学机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，系统地绘制了糖尿病小鼠视网膜中不同细胞区室的转录变化，揭示了炎症、代谢和氧化应激介导的分子途径 | NA | 深入了解糖尿病视网膜病变的分子和细胞变化网络 | Akimba小鼠视网膜的细胞类型特异性转录变化 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9474个视网膜细胞 |
| 959 | 2024-08-09 |
LIM-Nebulette Reinforces Podocyte Structural Integrity by Linking Actin and Vimentin Filaments
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019121261
PMID:32737144
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研究论文 | 本研究探讨了LIM-nebulette蛋白在维持足细胞结构完整性中的作用，通过连接肌动蛋白和波形蛋白纤维来强化足细胞的形态 | 首次揭示了LIM-nebulette蛋白在足细胞中的多功能作用，特别是在重塑粘着斑、肌动蛋白细胞骨架和中间丝中的关键作用 | 研究主要集中在动物模型和体外细胞实验，可能需要进一步的人体临床研究来验证其临床相关性 | 探究LIM-nebulette蛋白在维持足细胞结构完整性中的作用及其对肾病的影响 | 使用大鼠、小鼠和人类的细胞来研究足细胞的细胞骨架配置和LIM-nebulette蛋白的表达 | NA | 肾病 | 单细胞RNA测序、免疫金标记、高含量成像、超分辨率显微镜、原子力显微镜(AFM)、活细胞钙成像 | NA | 图像 | 涉及大鼠、小鼠和人类的多组细胞样本 |
| 960 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human kidney reveals the presence of ACE2 receptor: A potential pathway of COVID-19 infection
2020-10, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1442
PMID:32744436
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析人类肾脏，揭示了ACE2受体的存在，这可能是COVID-19感染的一个潜在途径 | 首次通过单细胞RNA测序技术在人类肾脏中发现ACE2受体的主要表达细胞，并揭示了SARS-Cov-2通过ACE2相关途径入侵肾脏组织的细胞证据 | NA | 分析SARS-Cov-2进入肾脏的潜在途径和细胞水平机制 | 人类肾脏中的ACE2受体表达细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |