单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2024-08-09 |
Got your mother in a whirl: The role of maternal T cells and myeloid cells in pregnancy
2020-11, HLA
IF:5.9Q1
DOI:10.1111/tan.14055
PMID:32841539
|
综述 | 本文综述了母体T细胞和髓系细胞（巨噬细胞、树突状细胞）在妊娠中的作用及其与滋养层细胞的相互作用 | 讨论了单细胞测序实验在研究母体免疫细胞异质性和预测细胞间相互作用中的应用，以及长期培养初级滋养层细胞的新方法 | 需要在未来研究中解决这些细胞类型及其途径的未决问题 | 探讨母体免疫细胞在健康和复杂妊娠中的功能及其与滋养层细胞的相互作用 | 母体T细胞、髓系细胞（巨噬细胞、树突状细胞）和滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 862 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Entry Factors: ACE2 and TMPRSS2 Are Expressed in Peri-Implantation Embryos and the Maternal-Fetal Interface
2020-Oct, Engineering (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.eng.2020.07.013
PMID:32837754
|
研究论文 | 本文探讨了SARS-CoV-2进入因子ACE2和TMPRSS2在胚胎植入期和母胎界面中的表达模式 | 首次利用单细胞转录组数据分析了ACE2和TMPRSS2在不同发育阶段的胚胎和母胎界面细胞中的表达情况，揭示了SARS-CoV-2感染的潜在风险 | 研究依赖于已发表的单细胞转录组数据，可能存在样本选择偏差 | 研究SARS-CoV-2垂直传播的潜在风险 | 胚胎植入期的胚胎和母胎界面细胞 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 包括6天胚胎滋养层细胞、8周妊娠期的合体滋养层细胞和24周妊娠期的外胚层滋养层细胞 |
| 863 | 2024-08-09 |
A pathogenic and clonally expanded B cell transcriptome in active multiple sclerosis
2020-09-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008523117
PMID:32859762
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞免疫球蛋白测序，探讨了多发性硬化症中B细胞的致病作用及其分子机制 | 首次通过多种测序技术综合分析了多发性硬化症患者脑脊液和血液中B细胞的转录组特征，揭示了特定信号通路的激活与抑制 | 样本量相对较小，且未检测到病毒转录本，可能限制了对病毒在多发性硬化症中作用的理解 | 探究多发性硬化症中B细胞的致病作用及其分子机制 | 多发性硬化症患者的脑脊液和血液中的B细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、单细胞免疫球蛋白测序（scIg-Seq）、荧光激活细胞分选（FACS）、批量RNA测序（RNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 12名复发缓解型多发性硬化症患者、1名其他神经系统疾病患者、3名健康对照者 |
| 864 | 2024-08-09 |
β2 Integrins differentially regulate γδ T cell subset thymic development and peripheral maintenance
2020-09-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921930117
PMID:32848068
|
研究论文 | 研究探讨了β整合素在γδ T细胞亚群胸腺发育和外周维持中的不同调控作用 | 揭示了β整合素在γδ T细胞稳态中的重要作用，特别是抑制IL-17产生Vγ6Vδ1细胞的生存和促进IFNγ产生Vγ4亚群的胸腺发育 | NA | 探究γδ T细胞的基本生物学特性及其在体内的数量调控机制 | γδ T细胞及其亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | β整合素缺陷小鼠的肺、子宫和循环系统中的γδ T细胞 |
| 865 | 2024-08-09 |
A clustering-independent method for finding differentially expressed genes in single-cell transcriptome data
2020-08-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17900-3
PMID:32859930
|
研究论文 | 本文介绍了一种无需依赖细胞聚类即可预测单细胞转录组数据中差异表达基因的方法singleCellHaystack | 该方法使用Kullback-Leibler散度来识别在多维空间中非随机定位的细胞子集中表达的基因，相比现有方法具有更高的准确性 | NA | 开发一种不依赖细胞聚类的新方法来预测单细胞转录组数据中的差异表达基因 | 单细胞转录组数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 136个真实转录组数据集和一个空间转录组数据集 |
| 866 | 2024-08-09 |
A systematic evaluation of single-cell RNA-sequencing imputation methods
2020-08-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02132-x
PMID:32854757
|
研究论文 | 本文系统评估了18种单细胞RNA测序（scRNA-seq）插补方法的准确性和可用性 | 首次系统性地比较了多种scRNA-seq插补方法，并评估了它们在下游分析中的表现 | 大多数插补方法在下游分析中的表现并未优于无插补方法，特别是在聚类和轨迹分析中 | 评估scRNA-seq插补方法的性能，以确定其在恢复基因表达和下游分析中的有效性 | 18种scRNA-seq插补方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自细胞系和组织的样本，以及基于板和液滴的单细胞平台的数据 |
| 867 | 2024-08-09 |
High-Quality Draft Single-Cell Genome Sequences of Two Gammaproteobacteria Strains Sampled from Soil in a Strawberry Farm
2020-Aug-27, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00743-20
PMID:32855250
|
研究论文 | 本文介绍了从草莓农场土壤中采集的两个Gammaproteobacteria菌株BBSC-SA01和BBSC-SA02的高质量单细胞基因组草图序列 | 这些草图基因组可能代表了新的物种，并为进一步研究土壤微生物组提供了可能 | NA | 研究草莓农场土壤中的Gammaproteobacteria菌株的单细胞基因组 | Gammaproteobacteria菌株BBSC-SA01和BBSC-SA02 | NA | NA | 单细胞测序平台bit-MAP | NA | 基因组序列 | 两个菌株样本 |
| 868 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Colon Cancer Cell Response to 5-Fluorouracil-Induced DNA Damage
2020-08-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108077
PMID:32846134
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶诱导的DNA损伤的转录组响应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶诱导的DNA损伤的异质性细胞命运响应 | 研究仅限于细胞培养模型，未涉及临床样本 | 探究结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶诱导的DNA损伤的转录组响应 | 结直肠癌细胞对5-氟尿嘧啶诱导的DNA损伤的转录组响应 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个结直肠癌细胞群体 |
| 869 | 2024-08-09 |
Landscape of Exhausted Virus-Specific CD8 T Cells in Chronic LCMV Infection
2020-08-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108078
PMID:32846135
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，详细描述了在慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染期间，从六个不同组织中分离出的耗竭性CD8 T细胞的特征 | 揭示了耗竭性CD8 T细胞的异质性，并发现它们具有器官特异性的转录组特征，可以分为五个主要的功能亚群 | NA | 研究慢性LCMV感染中耗竭性病毒特异性CD8 T细胞的特性 | 慢性LCMV感染中的耗竭性CD8 T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从六个不同组织中分离出的耗竭性CD8 T细胞 |
| 870 | 2024-08-09 |
OscoNet: inferring oscillatory gene networks
2020-Aug-21, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03561-y
PMID:32838730
|
研究论文 | 本文提出了一种改进的优化方案OscoNet，用于从单细胞RNA-seq数据中识别振荡基因网络，并提供了一种校准良好的非参数假设检验方法来选择振荡基因 | OscoNet通过改进优化方案和提供非参数假设检验方法，提高了对振荡基因的检测灵敏度，并能更准确地恢复基因簇的真实细胞顺序 | NA | 旨在从单细胞数据中发现振荡基因网络 | 振荡基因及其在生物学中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及合成数据和三个真实数据集 |
| 871 | 2024-08-09 |
Isolation of Adipogenic and Fibro-Inflammatory Stromal Cell Subpopulations from Murine Intra-Abdominal Adipose Depots
2020-08-16, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/61610
PMID:32865529
|
研究论文 | 本文描述了从成年小鼠的腹腔内脂肪库中分离脂肪生成和纤维炎症间质细胞亚群的方法 | 利用单细胞测序技术识别了功能上不同的纤维炎症和脂肪生成PDGFRβ+周围血管细胞亚群，并介绍了通过荧光激活细胞分选（FACS）或基于生物素化抗体的免疫磁珠技术分离这些细胞亚群的方法 | NA | 研究在生理或病理条件下，单独研究间质细胞亚群的功能特性，以扩展我们对脂肪组织重塑的当前认识 | 成年小鼠腹腔内脂肪库中的脂肪生成和纤维炎症间质细胞亚群 | NA | NA | 单细胞测序技术，荧光激活细胞分选（FACS），免疫磁珠技术 | NA | 细胞 | 成年小鼠的腹腔内脂肪库中的细胞亚群 |
| 872 | 2024-08-09 |
Vascular underpinning of COVID-19
2020-08, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.200208
PMID:32847471
|
研究论文 | 本文综述了COVID-19的血管基础，包括微血管炎症、细胞因子释放失调、血管通透性增加和促血栓形成状态，并探讨了SARS-CoV-2进入宿主血管细胞的途径及实验设计考虑。 | 首次整合了COVID-19的微血管炎症和细胞因子释放失调的信息，并探讨了SARS-CoV-2进入血管细胞的替代途径。 | NA | 理解COVID-19发病机制的血管基础，以改善治疗结果和降低死亡率。 | COVID-19的血管功能障碍、血栓形成和炎症调节。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 多个器官的病人组织 |
| 873 | 2024-08-09 |
Heterotypic cell-cell communication regulates glandular stem cell multipotency
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2632-y
PMID:32848220
|
研究论文 | 研究显示，在腺体上皮中，LCs的缺失会重新激活BSCs的多能性，并通过RNA测序揭示了BSCs在LCs缺失后激活的混合基底和腔细胞分化程序。 | 首次揭示了LCs与BCs之间的异型细胞间通讯对于维持腺体上皮干细胞谱系忠实性的重要性。 | NA | 探讨腺体上皮干细胞多能性的调控机制。 | 腺体上皮的基底细胞（BCs）和腔细胞（LCs）。 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠体内的多个上皮组织和体外器官培养模型。 |
| 874 | 2024-08-09 |
Cellular diversity of the regenerating caudal fin
2020-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba2084
PMID:32851162
|
研究论文 | 本文通过创建单细胞转录组图谱，研究了斑马鱼尾鳍再生过程中基因调控程序的动态变化。 | 首次系统性地描述了再生尾鳍中细胞的组成及其状态转换的分子定义。 | NA | 研究斑马鱼尾鳍再生过程中细胞多样性和基因调控程序的动态变化。 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的细胞类型和基因表达模式。 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 包括受伤前和受伤后1/2/4天的尾鳍组织样本 |
| 875 | 2024-08-09 |
Ischemia Reperfusion Injury Triggers CXCL13 Release and B-Cell Recruitment After Allogenic Kidney Transplantation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01204
PMID:32849490
|
研究论文 | 本研究探讨了缺血再灌注损伤（IRI）在同种异体肾移植后是否会导致CXCL13水平上调及其对B细胞招募的影响 | 首次证明了IRI在肾移植中与CXCL13水平升高相关，并揭示了B细胞的招募与CXCL13表达的关系 | 研究仅在鼠模型中进行，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探索IRI在肾移植中对CXCL13水平的影响及其机制 | CXCL13在肾移植中的表达及其对B细胞招募的作用 | NA | 肾移植 | 免疫组织化学研究，单细胞RNA测序分析 | NA | 细胞 | 研究使用了单侧和双侧肾IRI的鼠模型 |
| 876 | 2024-08-09 |
Conventional and Computational Flow Cytometry Analyses Reveal Sustained Human Intrathymic T Cell Development From Birth Until Puberty
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01659
PMID:32849574
|
研究论文 | 本文通过常规和计算流式细胞术分析，研究了从出生到青春期人类胸腺内T细胞发育的持续性 | 建立了新的计算分析流程，该流程从单细胞转录组测序数据分析中改编而来，能够克服批次效应，同时分析多个样本，并通过子采样限制计算成本，依赖KNN图进行基于图的聚类 | 尽管使用了新的计算分析方法，但胸腺早期退化对T细胞发育的影响仍需进一步研究 | 研究胸腺退化对胸腺内免疫亚群频率的影响 | 从出生到14岁的人类胸腺样本 | NA | NA | 流式细胞术 | KNN图 | 细胞 | 从出生到14岁的多个胸腺样本 |
| 877 | 2024-08-09 |
Characterization of the Bronchoalveolar Lavage Fluid by Single Cell Gene Expression Analysis in Healthy Dogs: A Promising Technique
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01707
PMID:32849601
|
研究论文 | 本研究利用单细胞mRNA测序技术（scRNA-seq）分析健康犬的支气管肺泡灌洗液（BALF）中的细胞异质性 | 首次在犬类中使用scRNA-seq技术研究BALF中的细胞亚群，并识别出14种不同的细胞集群 | NA | 验证scRNA-seq技术在犬类组织成分研究中的潜力 | 健康犬的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 4只健康犬，共分析了5,710个细胞 |
| 878 | 2024-08-09 |
Neural Regulation of Feeding Behavior
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-7086-5_3
PMID:32852737
|
研究论文 | 本文探讨了神经调节摄食行为的电路和细胞机制 | 采用了基因操作、光遗传学、病毒示踪和单细胞测序等先进技术，提供了关于中枢神经系统如何调节食物摄入的新见解 | NA | 研究能量平衡和摄食行为的协调机制 | 神经调节摄食行为的电路和细胞机制 | 神经科学 | 肥胖症，厌食症 | 基因操作，光遗传学，病毒示踪，单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 879 | 2024-08-09 |
Reciprocal change in Glucose metabolism of Cancer and Immune Cells mediated by different Glucose Transporters predicts Immunotherapy response
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.48954
PMID:32863946
|
研究论文 | 研究通过分析RNA-seq和FDG正电子发射断层扫描（PET）数据，探讨了肺癌鳞状细胞癌（LUSC）中葡萄糖转运蛋白（GLUT）表达与免疫细胞富集分数（ImmuneScore）及免疫治疗反应之间的关系 | 首次探讨了GLUT3/GLUT1比率作为免疫代谢功能的代表，并研究了其与免疫治疗反应的关联 | 研究样本量有限，且仅限于肺癌鳞状细胞癌和黑色素瘤患者 | 探索肿瘤微环境中的葡萄糖代谢特性及其在免疫治疗反应中的潜在应用 | 肺癌鳞状细胞癌（LUSC）和黑色素瘤患者的肿瘤和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, FDG正电子发射断层扫描 | NA | RNA-seq数据, 图像 | 63例肺癌鳞状细胞癌样本, 5例肺癌样本, 两个黑色素瘤队列 |
| 880 | 2024-08-09 |
Skin is a potential host of SARS-CoV-2: A clinical, single-cell transcriptome-profiling and histologic study
2020-Dec, Journal of the American Academy of Dermatology
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.jaad.2020.08.057
PMID:32822795
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |