单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2024-08-09 |
Reading the heart at single-cell resolution
2020-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2020.08.010
PMID:32871159
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研究论文 | 本文重点介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心脏研究中的应用，特别是心肌细胞的样本和数据处理步骤 | 单细胞转录组学领域的快速发展提高了我们对器官系统在空前分辨率下的研究能力 | 尽管通用的scRNA-seq流程协议已经建立，但心脏研究仍需要定制的样本准备、质量控制和数据解释 | 探讨scRNA-seq在心脏研究中的应用，提高数据质量 | 心肌细胞的样本和数据处理 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 842 | 2024-08-09 |
Monocyte recruitment and fate specification after myocardial infarction
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00330.2020
PMID:32877204
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综述 | 本文综述了单核细胞在心肌梗死后炎症反应中的关键作用及其招募和命运调控的最新研究进展 | 利用单细胞转录组学和质谱流式细胞术识别了具有功能相关性的较小、转录上不同的簇，并探讨了单核细胞在缺血损伤后的时空动态及其与其他免疫细胞的相互作用 | NA | 旨在探讨单核细胞在心肌梗死后的功能异质性、招募和命运调控机制，以及针对单核细胞治疗缺血性心脏病的潜在疗法 | 单核细胞在心肌梗死后的功能和动态变化 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 843 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies extensive heterogeneity in the cellular composition of mouse Achilles tendons
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00372.2020
PMID:32877217
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠跟腱细胞组成的异质性 | 发现了11种不同类型的细胞，包括三种先前未描述的腱成纤维细胞，并提供了证据支持周细胞可能是成年腱成纤维细胞的前体细胞 | NA | 探索小鼠跟腱细胞组成的异质性及其在组织稳态和疾病中的生物学基础 | 小鼠跟腱细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 844 | 2024-08-09 |
Aging impairs alveolar epithelial type II cell function in acute lung injury
2020-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00093.2020
PMID:32877222
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研究论文 | 研究探讨了年龄对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 | 首次揭示了老年小鼠在急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞的衰老迹象和功能障碍 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨年龄增长对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 | 肺泡上皮II型细胞在不同年龄小鼠中的功能 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻（3个月）和老年（18个月）小鼠 |
| 845 | 2024-08-09 |
Epigenetic pathways and plasticity in brain tumors
2020-11, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2020.105060
PMID:32877743
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研究论文 | 本文总结了在三种主要脑肿瘤（胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤）中活跃的表观遗传途径，并比较了这些肿瘤的单细胞RNA测序分析，以识别治疗这些肿瘤起源细胞的共同表观遗传途径。 | 探讨了通过靶向表观遗传途径与标准治疗方案结合来对抗脑肿瘤细胞的可塑性，并讨论了使用多组学方法治疗这些和其他脑肿瘤的可能组合疗法。 | 本文的焦点集中在三种肿瘤类型上，并未涵盖所有脑肿瘤，可能存在其他脑肿瘤具有类似的机制。 | 研究脑肿瘤的表观遗传途径和细胞可塑性，以开发更有效的治疗方法。 | 胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及三种主要脑肿瘤类型 |
| 846 | 2024-08-09 |
Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-10-13, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究利用血浆蛋白质组学和单细胞转录组学技术，优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的候选蛋白 | 结合大规模人类血浆蛋白质组学与无偏倚心脏单细胞分辨率转录组学，优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的蛋白候选物 | NA | 旨在通过分析血浆蛋白和基因表达，发现新的生物标志物和药物靶点候选物 | 心肌梗死后心力衰竭相关的血浆蛋白及其基因表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基于适配体的亲和捕获血浆蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 新西兰队列包括181名心肌梗死后患者和250名无事件患者，新加坡队列包括223名心肌梗死后患者 |
| 847 | 2024-08-09 |
Massively parallel and time-resolved RNA sequencing in single cells with scNT-seq
2020-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0935-4
PMID:32868927
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scNT-seq的新方法，用于从单个细胞中大规模并行分析新转录和预存的mRNA | scNT-seq方法通过滴液微流控技术，高效地标记新转录的mRNA，并能同时分析新旧转录组 | NA | 揭示时间分辨的转录因子活性和细胞状态轨迹，以及在特定细胞状态下RNA生物合成和降解的速率 | 单个细胞中的新转录和预存mRNA | 基因组学 | NA | scNT-seq | NA | RNA序列 | 约55,000个单细胞 |
| 848 | 2024-08-09 |
Two Tales of Single-Cell RNA Sequencing: Gene Expression and Alternative Splicing in Mouse Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020081180
PMID:32883701
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 849 | 2024-08-09 |
T-cell repertoire analysis and metrics of diversity and clonality
2020-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.07.010
PMID:32889231
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研究论文 | 本文介绍了T细胞受体（TCR）的批量和单细胞测序技术，讨论了基于共享结构基序的TCR谱系聚类和特异性预测的计算工具，并回顾了谱系多样性和收敛性分析的主要指数。 | 本文介绍了新的计算工具，用于分析T细胞受体的多样性和特异性，这些工具可能成为个性化免疫治疗的潜在生物标志物。 | NA | 探讨T细胞受体谱系的复杂性和多样性，以及这些特性在健康和疾病中的应用。 | T细胞受体的多样性和特异性。 | 生物信息学 | NA | 高通量批量和单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 850 | 2024-08-09 |
Changes in regeneration-responsive enhancers shape regenerative capacities in vertebrates
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz3090
PMID:32883834
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研究论文 | 本文通过比较表观基因组学和单细胞测序研究了两种相关硬骨鱼的再生能力差异及其遗传机制 | 发现了几个再生响应增强子（RREs），包括一个已知的脊椎动物再生效应子上游的元素，并揭示了其在再生中的作用 | 该增强子在哺乳动物中存在且响应损伤，但无法在鱼类中恢复再生能力 | 探讨脊椎动物再生能力差异的遗传机制 | 两种相关硬骨鱼的再生能力 | NA | NA | 比较表观基因组学，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 两种相关硬骨鱼 |
| 851 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulation of the PGE2 pathway modulates macrophage phenotype in normal and pathologic wound repair
2020-09-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.138443
PMID:32879137
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研究论文 | 本文研究了在正常和病理伤口修复过程中，表观遗传调控对PGE2通路的影响，以及其对巨噬细胞表型的调节作用 | 首次揭示了TGF-β诱导的miRNA29b通过抑制DNA甲基转移酶3b介导的Cox-2启动子超甲基化，增加COX-2/PGE2的产生，以及MLL1上调cPLA2表达并驱动COX-2/PGE2的过程 | NA | 探讨表观遗传调控在正常和病理伤口修复中对巨噬细胞表型和功能的影响 | 人类和小鼠的伤口巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的伤口组织 |
| 852 | 2024-08-09 |
Hematopoiesis in High Definition: Combining State and Fate Mapping
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.08.010
PMID:32888423
|
研究论文 | 本文结合谱系追踪和单细胞测序方法，同时分析克隆和转录轨迹，以深入了解造血过程中的组织和决策机制 | 本文通过同时考虑克隆和转录轨迹，提供了对造血组织和决策机制的关键新见解 | NA | 探索造血过程中的组织和决策机制 | 造血过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 853 | 2024-08-09 |
Extensive and spatially variable within-cell-type heterogeneity across the basolateral amygdala
2020-09-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59003
PMID:32869744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了小鼠基底侧杏仁核复合体（BLA）内细胞类型特异性的转录组异质性和空间分布特征 | 首次详细描述了BLA中细胞类型的转录组异质性及其与空间分布的关系，并展示了这种异质性在局部形态和远程连接中的体现 | NA | 旨在理解基底侧杏仁核复合体的细胞类型特异性转录组景观及其在功能多样性中的作用 | 小鼠基底侧杏仁核复合体的细胞类型及其转录组异质性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 854 | 2024-08-09 |
Application of single-cell sequencing in autoimmune diseases
2020-Sep-01, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001050
PMID:32889911
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 855 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing identifies shared differentiation paths of mouse thymic innate T cells
2020-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18155-8
PMID:32868763
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠胸腺中固有T细胞（包括iNKT、MAIT和γδ T细胞）的效应分化路径，并发现这些细胞类型在胸腺中成熟过程中共享转录组特征 | 首次展示了iNKT、MAIT和γδ T细胞在小鼠胸腺中通过共享的分支分化路径成熟，而非线性成熟或TCR介导的指令 | NA | 探究小鼠胸腺中固有T细胞的效应分化路径及其发育调控机制 | 小鼠胸腺中的iNKT、MAIT和γδ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠胸腺和人类肝脏样本中的固有T细胞 |
| 856 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing uncovers heterogenous transcriptional signatures in macrophages during efferocytosis
2020-08-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-70353-y
PMID:32868786
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了在吞噬凋亡细胞过程中巨噬细胞的异质性转录特征 | 首次在单细胞水平上解析了巨噬细胞在吞噬凋亡细胞过程中的转录多样性，特别是不同亚群巨噬细胞的转录响应差异 | 研究仅限于体外培养的巨噬细胞与凋亡细胞共培养体系，可能与体内环境存在差异 | 探究吞噬凋亡细胞过程中巨噬细胞的转录异质性 | 巨噬细胞及其在吞噬凋亡细胞过程中的转录响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个巨噬细胞亚群 |
| 857 | 2024-08-09 |
Characterization of Diabetic and Non-Diabetic Foot Ulcers Using Single-Cell RNA-Sequencing
2020-Aug-28, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi11090815
PMID:32872278
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研究论文 | 本文探讨了使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术分析临床获取的人类慢性伤口样本的可行性，并对糖尿病和非糖尿病足溃疡组织进行了比较分析 | 本文采用了优化的10X Genomics scRNA-seq平台和针对低产量样本的改进数据处理流程，成功识别了糖尿病和非糖尿病组织中的不同细胞亚型及其转录程序 | 本文面临的挑战包括组织活力、细胞产量和延迟捕获时间等问题，特别是慢性伤口中的大量纤维蛋白碎片、细胞外基质成分和非活细胞 | 评估单细胞RNA测序技术在分析临床获取的人类慢性伤口样本中的应用 | 糖尿病和非糖尿病足溃疡组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 139,000个糖尿病和非糖尿病伤口细胞 |
| 858 | 2024-08-09 |
Δ9-Tetrahydrocannabinol Prevents Mortality from Acute Respiratory Distress Syndrome through the Induction of Apoptosis in Immune Cells, Leading to Cytokine Storm Suppression
2020-Aug-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21176244
PMID:32872332
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研究论文 | 研究探讨了Δ9-四氢大麻酚（THC）通过诱导免疫细胞凋亡来减轻急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的机制 | 首次揭示了THC通过激活大麻素受体，诱导免疫细胞凋亡，从而抑制细胞因子风暴，提高ARDS小鼠的生存率 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证THC的治疗效果 | 探索THC减轻ARDS的机制，为COVID-19相关的ARDS治疗提供新策略 | 急性呼吸窘迫综合征（ARDS）及其与COVID-19的关系 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，转录组分析，代谢组分析 | NA | RNA序列，代谢物浓度 | 使用C3H小鼠模型，进行了人类COVID-19患者的基因表达数据分析 |
| 859 | 2024-08-09 |
Identification of the key gene and pathways associated with osteoarthritis via single-cell RNA sequencing on synovial fibroblasts
2020-Aug-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000021707
PMID:32872047
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析滑膜成纤维细胞，旨在识别与骨关节炎相关的关键基因和通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术在滑膜成纤维细胞中识别出与骨关节炎发生密切相关的关键基因FN1及其相关通路 | NA | 探索与骨关节炎发生相关的关键基因和通路 | 骨关节炎患者的滑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 来自骨关节炎患者的滑膜成纤维细胞数据 |
| 860 | 2024-08-09 |
Effects of Cryopreservation and Thawing on Single-Cell Transcriptomes of Human T Cells
2020-Aug, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2020.20.e34
PMID:32895621
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研究论文 | 研究了冷冻保存和解冻过程对人类T细胞单细胞转录组的影响 | 首次详细探讨了冷冻保存和解冻对PBMCs中Tregs分子特征的影响 | 需要谨慎解释使用冷冻保存和解冻样本进行scRNA-seq时与热休克相关特性的细胞簇 | 探究冷冻保存和解冻对人类免疫学实验中PBMCs转录组的影响 | 人类T细胞的单细胞转录组 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自同一捐赠者的PBMCs样本 |