单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2024-08-09 |
Massively parallel and time-resolved RNA sequencing in single cells with scNT-seq
2020-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0935-4
PMID:32868927
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scNT-seq的新方法，用于从单个细胞中大规模并行分析新转录和预存的mRNA | scNT-seq方法通过滴液微流控技术，高效地标记新转录的mRNA，并能同时分析新旧转录组 | NA | 揭示时间分辨的转录因子活性和细胞状态轨迹，以及在特定细胞状态下RNA生物合成和降解的速率 | 单个细胞中的新转录和预存mRNA | 基因组学 | NA | scNT-seq | NA | RNA序列 | 约55,000个单细胞 |
| 842 | 2024-08-09 |
Two Tales of Single-Cell RNA Sequencing: Gene Expression and Alternative Splicing in Mouse Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020081180
PMID:32883701
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 843 | 2024-08-09 |
T-cell repertoire analysis and metrics of diversity and clonality
2020-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.07.010
PMID:32889231
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研究论文 | 本文介绍了T细胞受体（TCR）的批量和单细胞测序技术，讨论了基于共享结构基序的TCR谱系聚类和特异性预测的计算工具，并回顾了谱系多样性和收敛性分析的主要指数。 | 本文介绍了新的计算工具，用于分析T细胞受体的多样性和特异性，这些工具可能成为个性化免疫治疗的潜在生物标志物。 | NA | 探讨T细胞受体谱系的复杂性和多样性，以及这些特性在健康和疾病中的应用。 | T细胞受体的多样性和特异性。 | 生物信息学 | NA | 高通量批量和单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 844 | 2024-08-09 |
Changes in regeneration-responsive enhancers shape regenerative capacities in vertebrates
2020-09-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aaz3090
PMID:32883834
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研究论文 | 本文通过比较表观基因组学和单细胞测序研究了两种相关硬骨鱼的再生能力差异及其遗传机制 | 发现了几个再生响应增强子（RREs），包括一个已知的脊椎动物再生效应子上游的元素，并揭示了其在再生中的作用 | 该增强子在哺乳动物中存在且响应损伤，但无法在鱼类中恢复再生能力 | 探讨脊椎动物再生能力差异的遗传机制 | 两种相关硬骨鱼的再生能力 | NA | NA | 比较表观基因组学，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 两种相关硬骨鱼 |
| 845 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulation of the PGE2 pathway modulates macrophage phenotype in normal and pathologic wound repair
2020-09-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.138443
PMID:32879137
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研究论文 | 本文研究了在正常和病理伤口修复过程中，表观遗传调控对PGE2通路的影响，以及其对巨噬细胞表型的调节作用 | 首次揭示了TGF-β诱导的miRNA29b通过抑制DNA甲基转移酶3b介导的Cox-2启动子超甲基化，增加COX-2/PGE2的产生，以及MLL1上调cPLA2表达并驱动COX-2/PGE2的过程 | NA | 探讨表观遗传调控在正常和病理伤口修复中对巨噬细胞表型和功能的影响 | 人类和小鼠的伤口巨噬细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的伤口组织 |
| 846 | 2024-08-09 |
Hematopoiesis in High Definition: Combining State and Fate Mapping
2020-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.08.010
PMID:32888423
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研究论文 | 本文结合谱系追踪和单细胞测序方法，同时分析克隆和转录轨迹，以深入了解造血过程中的组织和决策机制 | 本文通过同时考虑克隆和转录轨迹，提供了对造血组织和决策机制的关键新见解 | NA | 探索造血过程中的组织和决策机制 | 造血过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 847 | 2024-08-09 |
Extensive and spatially variable within-cell-type heterogeneity across the basolateral amygdala
2020-09-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59003
PMID:32869744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，揭示了小鼠基底侧杏仁核复合体（BLA）内细胞类型特异性的转录组异质性和空间分布特征 | 首次详细描述了BLA中细胞类型的转录组异质性及其与空间分布的关系，并展示了这种异质性在局部形态和远程连接中的体现 | NA | 旨在理解基底侧杏仁核复合体的细胞类型特异性转录组景观及其在功能多样性中的作用 | 小鼠基底侧杏仁核复合体的细胞类型及其转录组异质性 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，原位杂交 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 848 | 2024-08-09 |
Application of single-cell sequencing in autoimmune diseases
2020-Sep-01, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000001050
PMID:32889911
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 849 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing identifies shared differentiation paths of mouse thymic innate T cells
2020-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18155-8
PMID:32868763
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠胸腺中固有T细胞（包括iNKT、MAIT和γδ T细胞）的效应分化路径，并发现这些细胞类型在胸腺中成熟过程中共享转录组特征 | 首次展示了iNKT、MAIT和γδ T细胞在小鼠胸腺中通过共享的分支分化路径成熟，而非线性成熟或TCR介导的指令 | NA | 探究小鼠胸腺中固有T细胞的效应分化路径及其发育调控机制 | 小鼠胸腺中的iNKT、MAIT和γδ T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及小鼠胸腺和人类肝脏样本中的固有T细胞 |
| 850 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing uncovers heterogenous transcriptional signatures in macrophages during efferocytosis
2020-08-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-70353-y
PMID:32868786
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了在吞噬凋亡细胞过程中巨噬细胞的异质性转录特征 | 首次在单细胞水平上解析了巨噬细胞在吞噬凋亡细胞过程中的转录多样性，特别是不同亚群巨噬细胞的转录响应差异 | 研究仅限于体外培养的巨噬细胞与凋亡细胞共培养体系，可能与体内环境存在差异 | 探究吞噬凋亡细胞过程中巨噬细胞的转录异质性 | 巨噬细胞及其在吞噬凋亡细胞过程中的转录响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个巨噬细胞亚群 |
| 851 | 2024-08-09 |
Characterization of Diabetic and Non-Diabetic Foot Ulcers Using Single-Cell RNA-Sequencing
2020-Aug-28, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi11090815
PMID:32872278
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研究论文 | 本文探讨了使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术分析临床获取的人类慢性伤口样本的可行性，并对糖尿病和非糖尿病足溃疡组织进行了比较分析 | 本文采用了优化的10X Genomics scRNA-seq平台和针对低产量样本的改进数据处理流程，成功识别了糖尿病和非糖尿病组织中的不同细胞亚型及其转录程序 | 本文面临的挑战包括组织活力、细胞产量和延迟捕获时间等问题，特别是慢性伤口中的大量纤维蛋白碎片、细胞外基质成分和非活细胞 | 评估单细胞RNA测序技术在分析临床获取的人类慢性伤口样本中的应用 | 糖尿病和非糖尿病足溃疡组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 139,000个糖尿病和非糖尿病伤口细胞 |
| 852 | 2024-08-09 |
Δ9-Tetrahydrocannabinol Prevents Mortality from Acute Respiratory Distress Syndrome through the Induction of Apoptosis in Immune Cells, Leading to Cytokine Storm Suppression
2020-Aug-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21176244
PMID:32872332
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研究论文 | 研究探讨了Δ9-四氢大麻酚（THC）通过诱导免疫细胞凋亡来减轻急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的机制 | 首次揭示了THC通过激活大麻素受体，诱导免疫细胞凋亡，从而抑制细胞因子风暴，提高ARDS小鼠的生存率 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类中验证THC的治疗效果 | 探索THC减轻ARDS的机制，为COVID-19相关的ARDS治疗提供新策略 | 急性呼吸窘迫综合征（ARDS）及其与COVID-19的关系 | NA | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序，转录组分析，代谢组分析 | NA | RNA序列，代谢物浓度 | 使用C3H小鼠模型，进行了人类COVID-19患者的基因表达数据分析 |
| 853 | 2024-08-09 |
Identification of the key gene and pathways associated with osteoarthritis via single-cell RNA sequencing on synovial fibroblasts
2020-Aug-14, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000021707
PMID:32872047
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析滑膜成纤维细胞，旨在识别与骨关节炎相关的关键基因和通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术在滑膜成纤维细胞中识别出与骨关节炎发生密切相关的关键基因FN1及其相关通路 | NA | 探索与骨关节炎发生相关的关键基因和通路 | 骨关节炎患者的滑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因数据 | 来自骨关节炎患者的滑膜成纤维细胞数据 |
| 854 | 2024-08-09 |
Effects of Cryopreservation and Thawing on Single-Cell Transcriptomes of Human T Cells
2020-Aug, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2020.20.e34
PMID:32895621
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研究论文 | 研究了冷冻保存和解冻过程对人类T细胞单细胞转录组的影响 | 首次详细探讨了冷冻保存和解冻对PBMCs中Tregs分子特征的影响 | 需要谨慎解释使用冷冻保存和解冻样本进行scRNA-seq时与热休克相关特性的细胞簇 | 探究冷冻保存和解冻对人类免疫学实验中PBMCs转录组的影响 | 人类T细胞的单细胞转录组 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自同一捐赠者的PBMCs样本 |
| 855 | 2024-08-09 |
Got your mother in a whirl: The role of maternal T cells and myeloid cells in pregnancy
2020-11, HLA
IF:5.9Q1
DOI:10.1111/tan.14055
PMID:32841539
|
综述 | 本文综述了母体T细胞和髓系细胞（巨噬细胞、树突状细胞）在妊娠中的作用及其与滋养层细胞的相互作用 | 讨论了单细胞测序实验在研究母体免疫细胞异质性和预测细胞间相互作用中的应用，以及长期培养初级滋养层细胞的新方法 | 需要在未来研究中解决这些细胞类型及其途径的未决问题 | 探讨母体免疫细胞在健康和复杂妊娠中的功能及其与滋养层细胞的相互作用 | 母体T细胞、髓系细胞（巨噬细胞、树突状细胞）和滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 856 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Entry Factors: ACE2 and TMPRSS2 Are Expressed in Peri-Implantation Embryos and the Maternal-Fetal Interface
2020-Oct, Engineering (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.eng.2020.07.013
PMID:32837754
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研究论文 | 本文探讨了SARS-CoV-2进入因子ACE2和TMPRSS2在胚胎植入期和母胎界面中的表达模式 | 首次利用单细胞转录组数据分析了ACE2和TMPRSS2在不同发育阶段的胚胎和母胎界面细胞中的表达情况，揭示了SARS-CoV-2感染的潜在风险 | 研究依赖于已发表的单细胞转录组数据，可能存在样本选择偏差 | 研究SARS-CoV-2垂直传播的潜在风险 | 胚胎植入期的胚胎和母胎界面细胞 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 包括6天胚胎滋养层细胞、8周妊娠期的合体滋养层细胞和24周妊娠期的外胚层滋养层细胞 |
| 857 | 2024-08-09 |
A pathogenic and clonally expanded B cell transcriptome in active multiple sclerosis
2020-09-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008523117
PMID:32859762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞免疫球蛋白测序，探讨了多发性硬化症中B细胞的致病作用及其分子机制 | 首次通过多种测序技术综合分析了多发性硬化症患者脑脊液和血液中B细胞的转录组特征，揭示了特定信号通路的激活与抑制 | 样本量相对较小，且未检测到病毒转录本，可能限制了对病毒在多发性硬化症中作用的理解 | 探究多发性硬化症中B细胞的致病作用及其分子机制 | 多发性硬化症患者的脑脊液和血液中的B细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、单细胞免疫球蛋白测序（scIg-Seq）、荧光激活细胞分选（FACS）、批量RNA测序（RNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 12名复发缓解型多发性硬化症患者、1名其他神经系统疾病患者、3名健康对照者 |
| 858 | 2024-08-09 |
β2 Integrins differentially regulate γδ T cell subset thymic development and peripheral maintenance
2020-09-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1921930117
PMID:32848068
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研究论文 | 研究探讨了β整合素在γδ T细胞亚群胸腺发育和外周维持中的不同调控作用 | 揭示了β整合素在γδ T细胞稳态中的重要作用，特别是抑制IL-17产生Vγ6Vδ1细胞的生存和促进IFNγ产生Vγ4亚群的胸腺发育 | NA | 探究γδ T细胞的基本生物学特性及其在体内的数量调控机制 | γδ T细胞及其亚群 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | β整合素缺陷小鼠的肺、子宫和循环系统中的γδ T细胞 |
| 859 | 2024-08-09 |
A clustering-independent method for finding differentially expressed genes in single-cell transcriptome data
2020-08-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17900-3
PMID:32859930
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研究论文 | 本文介绍了一种无需依赖细胞聚类即可预测单细胞转录组数据中差异表达基因的方法singleCellHaystack | 该方法使用Kullback-Leibler散度来识别在多维空间中非随机定位的细胞子集中表达的基因，相比现有方法具有更高的准确性 | NA | 开发一种不依赖细胞聚类的新方法来预测单细胞转录组数据中的差异表达基因 | 单细胞转录组数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 136个真实转录组数据集和一个空间转录组数据集 |
| 860 | 2024-08-09 |
A systematic evaluation of single-cell RNA-sequencing imputation methods
2020-08-27, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02132-x
PMID:32854757
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研究论文 | 本文系统评估了18种单细胞RNA测序（scRNA-seq）插补方法的准确性和可用性 | 首次系统性地比较了多种scRNA-seq插补方法，并评估了它们在下游分析中的表现 | 大多数插补方法在下游分析中的表现并未优于无插补方法，特别是在聚类和轨迹分析中 | 评估scRNA-seq插补方法的性能，以确定其在恢复基因表达和下游分析中的有效性 | 18种scRNA-seq插补方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用了来自细胞系和组织的样本，以及基于板和液滴的单细胞平台的数据 |