单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2024-08-09 |
Duodenal chemosensory system: enterocytes, enteroendocrine cells, and tuft cells
2020-11, Current opinion in gastroenterology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/MOG.0000000000000685
PMID:32925177
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综述 | 本文综述了胃十二指肠上皮中由肠上皮细胞、肠内分泌细胞和绒毛细胞组成的腔内化学感应系统的最新进展，特别强调了化学感应如何影响黏膜保护反应和代谢综合征。 | 最近基于单细胞RNA测序的研究提供了详细的化学感应受体和其他生物活性分子的细胞类型特异性表达及细胞谱系信息，揭示了腔内化学感应不仅对肠道功能的局部或远程调节至关重要，还参与了代谢、能量平衡和食物摄入的系统性调节。 | NA | 总结腔内化学感应系统的最新理解，并探讨其在黏膜损伤、代谢障碍和异常内脏感觉治疗中的潜在分子靶点。 | 胃十二指肠上皮中的肠上皮细胞、肠内分泌细胞和绒毛细胞。 | NA | 代谢障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 细胞类型特异性 |
| 822 | 2024-08-09 |
A map of human breast cancer: new players in stromal-immune crosstalk
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020106368
PMID:32909627
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了人乳腺癌中的间质细胞，并发现了新的间质间充质细胞亚群 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了乳腺癌中间质间充质细胞的新亚群及其独特的转录组特征、组织定位和相关的免疫微环境 | NA | 探索乳腺癌中间质-免疫相互作用的新参与者 | 人乳腺癌中的间质间充质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 823 | 2024-08-09 |
Gene-Specific Linear Trends Constrain Transcriptional Variability of the Toll-like Receptor Signaling
2020-09-23, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.08.007
PMID:32918862
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和单分子mRNA计数（smFISH）研究免疫系统中Toll样受体信号通路的诱导基因表达，发现肿瘤坏死因子α的mRNA计数符合标准的随机开关模型，而白细胞介素-1β的转录涉及额外的调节步骤，导致异质性增加。 | 本文首次展示了单细胞mRNA响应的变异性受到转录爆发的线性约束，并通过数学建模和实验扰动验证了这一发现。 | NA | 研究单细胞基因表达变异性在刺激响应中的控制机制。 | 免疫系统中Toll样受体信号通路的诱导基因表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq），单分子mRNA计数（smFISH） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 824 | 2024-08-09 |
Oxidative Metabolism Drives Immortalization of Neural Stem Cells during Tumorigenesis
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.07.039
PMID:32916131
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研究论文 | 本文研究了氧化代谢在肿瘤发生过程中对神经干细胞永生化的驱动作用 | 首次展示了线粒体融合诱导的代谢重编程对肿瘤起始细胞永生化的速率限制作用，并触发其不可逆的肿瘤发生倾向 | NA | 探讨代谢重编程在肿瘤发生中的作用及其机制 | 神经干细胞及其在肿瘤发生中的代谢变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学, 靶向代谢组学 | NA | 转录组数据 | 涉及果蝇大脑肿瘤中的快速分裂的干细胞群体 |
| 825 | 2024-08-09 |
Ontogeny of arterial macrophages defines their functions in homeostasis and inflammation
2020-09-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18287-x
PMID:32917889
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研究论文 | 本文通过结合巨噬细胞命运图谱分析和单细胞RNA测序，研究了动脉巨噬细胞在稳态和血管紧张素II诱导的动脉炎症中的细胞身份及其发育起源与成年期表型和功能的关系 | 首次揭示了卵黄囊红系髓系前体细胞对动脉外膜巨噬细胞的显著贡献，并阐明了这些细胞在稳态和炎症中的不同功能 | NA | 探讨动脉巨噬细胞的异质性及其在健康和疾病中的不同功能 | 动脉巨噬细胞的发育起源及其在成年期的表型和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年小鼠 |
| 826 | 2024-08-09 |
Analysis of single-cell transcriptomes links enrichment of olfactory receptors with cancer cell differentiation status and prognosis
2020-09-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01232-5
PMID:32917933
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了嗅觉受体（ORs）在癌细胞分化状态和预后中的作用 | 首次全面描绘了肿瘤中单细胞水平嗅觉受体的表达动态，并构建了基于广泛嗅觉受体表达特征的表达签名 | NA | 研究嗅觉受体在癌细胞分化状态和癌症预后中的作用 | 嗅觉受体在肿瘤细胞中的表达及其与癌细胞分化和预后的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了来自癌症基因组图谱（TCGA）的肿瘤样本 |
| 827 | 2024-08-09 |
Bayesian gamma-negative binomial modeling of single-cell RNA sequencing data
2020-Sep-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-06938-8
PMID:32900358
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研究论文 | 本文提出了一种全生成层次伽马-负二项（hGNB）模型，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析，无需显式建模零膨胀 | 提出了一种新的层次伽马-负二项模型，能够自然地考虑基因和细胞水平的协变效应，无需预处理步骤如归一化 | NA | 旨在开发一种新的统计模型，用于更准确地分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 层次伽马-负二项（hGNB）模型 | RNA测序数据 | 涉及多个真实世界的scRNA-seq数据集 |
| 828 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes of pancreatic preinvasive lesions and cancer reveal acinar metaplastic cells' heterogeneity
2020-09-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18207-z
PMID:32908137
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了从小鼠胰腺前侵袭阶段到肿瘤形成过程中的细胞异质性 | 首次定义了六种腺泡化生细胞类型和状态，并揭示了肿瘤相关基质、免疫、内皮和成纤维细胞的信号，这些信号可能支持肿瘤发展及免疫细胞的招募和教育 | NA | 研究胰腺癌前病变和癌症中单细胞转录组的异质性 | 小鼠胰腺中的腺泡化生细胞及其在肿瘤发展中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 829 | 2024-08-09 |
Single Cell Technologies Define New Therapeutic Avenues for Huntington's Disease
2020-09-09, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.08.007
PMID:32910889
|
研究论文 | 使用两种独立的单细胞转录组技术，Lee等人对亨廷顿病中受影响最严重的纹状体神经元的转录变化进行了分类 | 首次使用单细胞转录组技术详细描述了亨廷顿病中纹状体神经元的转录变化 | NA | 探索亨廷顿病的新治疗途径 | 亨廷顿病中受影响最严重的纹状体神经元 | 数字病理学 | 亨廷顿病 | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 830 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome maps of myeloid blood cell lineages in Drosophila
2020-09-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18135-y
PMID:32900993
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇淋巴腺中发育中的血细胞的异质性，并发现了新的血细胞类型 | 发现了先前未描述的血细胞类型，包括脂肪血细胞、干细胞样前血细胞和中间前血细胞，并揭示了血细胞在正常发育中的发展轨迹及在受到黄蜂侵扰后扁平细胞谱系的形成 | NA | 深入了解果蝇淋巴腺中血细胞发育和细胞免疫反应的分子机制 | 果蝇淋巴腺中的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 831 | 2024-08-09 |
Tempora: Cell trajectory inference using time-series single-cell RNA sequencing data
2020-09, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008205
PMID:32903255
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Tempora的新型细胞轨迹推断方法，该方法利用时间序列单细胞RNA测序数据中的时间信息来排序细胞 | Tempora方法结合了时间和生物途径信息来指导基于scRNA-seq的轨迹推断，提高了基因表达信号的强度、处理速度和推断轨迹的可解释性 | NA | 开发一种新的细胞轨迹推断方法，以提高在时间序列scRNA-seq数据中细胞排序的准确性和速度 | 时间序列单细胞RNA测序数据中的细胞轨迹推断 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 时间序列数据 | 涉及三个不同组织发育时间序列数据集 |
| 832 | 2024-08-09 |
Adaptable haemodynamic endothelial cells for organogenesis and tumorigenesis
2020-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2712-z
PMID:32908310
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研究论文 | 本文展示了通过在成熟人内皮细胞中短暂重新激活胚胎特异性ETS变体转录因子2（ETV2），并在无血清的三维LEC基质中培养，使这些细胞恢复为可适应的、具有血管生成能力的细胞，能够形成可灌注和可塑的血管网络。 | 通过ETV2的重新激活，使成熟内皮细胞恢复到胚胎状态，能够在三维基质中自我组装成稳定的、多层和分支的血管网络，并能与宿主循环系统功能性吻合。 | NA | 研究内皮细胞在器官发生和肿瘤发生中的适应性，并开发一种新的生理平台‘Organ-On-VascularNet’，用于血管化和器官修复。 | 成熟人内皮细胞的适应性和血管生成能力。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和表观遗传学分析 | NA | 细胞 | 涉及人胰腺胰岛、去细胞化的大鼠肠道和人结肠器官样品。 |
| 833 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cell lineage specification in temporal-spatial patterns in human cortical development
2020-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaz2978
PMID:32923614
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析了人类胚胎和胎儿期大脑皮质四个脑叶和脑桥的细胞谱系特化过程 | 发现了先前未知的短暂性神经前体细胞亚型及其分子特征，并阐明了人类深层、上层和成熟神经元的神经发生路径及分子调控机制 | NA | 揭示人类皮质发育中的细胞谱系特化和分子调控机制 | 人类胚胎和胎儿期大脑皮质的神经前体细胞、神经元和胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类胚胎和胎儿期大脑皮质四个脑叶和脑桥的多个样本 |
| 834 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies multiple pathways underlying antitumor function of TCR- and CD8αβ-engineered human CD4+ T cells
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaz7809
PMID:32923584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了表达TCR和CD8αβ的工程化人类CD4+ T细胞的抗肿瘤功能及其转录基础。 | 本研究首次揭示了TCR8表达在CD4 T细胞中增强抗肿瘤功能的分子特征，为开发新型免疫疗法提供了理论基础。 | NA | 探究表达TCR和CD8αβ的工程化人类CD4+ T细胞的抗肿瘤功能及其转录基础。 | 表达TCR和CD8αβ的工程化人类CD4+ T细胞及其在肿瘤挑战后的功能变化。 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类CD4和CD8 T细胞，具体数量未在摘要中明确。 |
| 835 | 2024-08-09 |
Reading the heart at single-cell resolution
2020-11, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2020.08.010
PMID:32871159
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研究论文 | 本文重点介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在心脏研究中的应用，特别是心肌细胞的样本和数据处理步骤 | 单细胞转录组学领域的快速发展提高了我们对器官系统在空前分辨率下的研究能力 | 尽管通用的scRNA-seq流程协议已经建立，但心脏研究仍需要定制的样本准备、质量控制和数据解释 | 探讨scRNA-seq在心脏研究中的应用，提高数据质量 | 心肌细胞的样本和数据处理 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 836 | 2024-08-09 |
Monocyte recruitment and fate specification after myocardial infarction
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00330.2020
PMID:32877204
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综述 | 本文综述了单核细胞在心肌梗死后炎症反应中的关键作用及其招募和命运调控的最新研究进展 | 利用单细胞转录组学和质谱流式细胞术识别了具有功能相关性的较小、转录上不同的簇，并探讨了单核细胞在缺血损伤后的时空动态及其与其他免疫细胞的相互作用 | NA | 旨在探讨单核细胞在心肌梗死后的功能异质性、招募和命运调控机制，以及针对单核细胞治疗缺血性心脏病的潜在疗法 | 单核细胞在心肌梗死后的功能和动态变化 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 837 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies extensive heterogeneity in the cellular composition of mouse Achilles tendons
2020-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00372.2020
PMID:32877217
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠跟腱细胞组成的异质性 | 发现了11种不同类型的细胞，包括三种先前未描述的腱成纤维细胞，并提供了证据支持周细胞可能是成年腱成纤维细胞的前体细胞 | NA | 探索小鼠跟腱细胞组成的异质性及其在组织稳态和疾病中的生物学基础 | 小鼠跟腱细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 838 | 2024-08-09 |
Aging impairs alveolar epithelial type II cell function in acute lung injury
2020-11-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00093.2020
PMID:32877222
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研究论文 | 研究探讨了年龄对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 | 首次揭示了老年小鼠在急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞的衰老迹象和功能障碍 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨年龄增长对急性肺损伤中肺泡上皮II型细胞功能的影响 | 肺泡上皮II型细胞在不同年龄小鼠中的功能 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 年轻（3个月）和老年（18个月）小鼠 |
| 839 | 2024-08-09 |
Epigenetic pathways and plasticity in brain tumors
2020-11, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2020.105060
PMID:32877743
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研究论文 | 本文总结了在三种主要脑肿瘤（胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤）中活跃的表观遗传途径，并比较了这些肿瘤的单细胞RNA测序分析，以识别治疗这些肿瘤起源细胞的共同表观遗传途径。 | 探讨了通过靶向表观遗传途径与标准治疗方案结合来对抗脑肿瘤细胞的可塑性，并讨论了使用多组学方法治疗这些和其他脑肿瘤的可能组合疗法。 | 本文的焦点集中在三种肿瘤类型上，并未涵盖所有脑肿瘤，可能存在其他脑肿瘤具有类似的机制。 | 研究脑肿瘤的表观遗传途径和细胞可塑性，以开发更有效的治疗方法。 | 胶质母细胞瘤、髓母细胞瘤和弥漫性内在脑桥胶质瘤。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及三种主要脑肿瘤类型 |
| 840 | 2024-08-09 |
Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-10-13, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究利用血浆蛋白质组学和单细胞转录组学技术，优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的候选蛋白 | 结合大规模人类血浆蛋白质组学与无偏倚心脏单细胞分辨率转录组学，优先筛选与心肌梗死后心力衰竭相关的蛋白候选物 | NA | 旨在通过分析血浆蛋白和基因表达，发现新的生物标志物和药物靶点候选物 | 心肌梗死后心力衰竭相关的血浆蛋白及其基因表达 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基于适配体的亲和捕获血浆蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 新西兰队列包括181名心肌梗死后患者和250名无事件患者，新加坡队列包括223名心肌梗死后患者 |