单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2024-08-09 |
Bimodal function of chromatin remodeler Hmga1 in neural crest induction and Wnt-dependent emigration
2020-09-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57779
PMID:32965216
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序结合高分辨率杂交技术，揭示了染色质重塑因子Hmga1在神经嵴细胞诱导和迁移中的双模态功能 | 首次展示了Hmga1在神经嵴发育中的两个不同功能，即在神经板边缘调节Pax7依赖的神经嵴谱系指定和在迁移前阶段减少颅神经嵴从背神经管的迁出 | NA | 探究Hmga1在神经嵴细胞发育中的作用 | 神经嵴细胞的诱导和迁移 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高分辨率杂交, CRISPR-Cas9 | NA | RNA | NA |
| 782 | 2024-08-09 |
Multi-scale supervised clustering-based feature selection for tumor classification and identification of biomarkers and targets on genomic data
2020-Sep-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07038-3
PMID:32962626
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研究论文 | 本文设计了一种基于多尺度监督聚类的特征选择算法MCBFS，用于基因组数据分析中的特征选择和模型学习，并通过实验验证了其有效性和鲁棒性 | 开发了一种新的特征选择算法MCBFS，结合了多尺度聚类和监督学习方法，提高了算法的解释性和可视化效果 | 文章未明确提及现有方法的具体局限性 | 提高疾病分类中深度学习技术的应用效果，增强特征选择算法的解释性和可视化能力 | 基因组数据中的特征选择、肿瘤分类、生物标志物和治疗靶点的识别 | 机器学习 | 肺癌 | 多尺度聚类 | MCBFS算法 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 涉及八个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 783 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Identifies Cell Subsets in Human Placenta That Highly Expresses Factors Driving Pathogenesis of SARS-CoV-2
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00783
PMID:32974340
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，识别了人类胎盘中表达SARS-CoV-2感染所需因子的细胞亚群，并探讨了这些细胞在病毒感染中的作用 | 本文首次揭示了胎盘中特定细胞亚群表达SARS-CoV-2感染所需因子，并展示了这些细胞可能驱动病毒在发育中的人类胎盘中的传播 | NA | 旨在预测胎盘是否易受SARS-CoV-2感染，并揭示其在妊娠期病毒感染中的作用 | 人类胎盘中的细胞亚群及其在SARS-CoV-2感染中的作用 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个物种的胎盘样本，包括人类 |
| 784 | 2024-08-09 |
HSPA12B Secreted by Tumor-Associated Endothelial Cells Might Induce M2 Polarization of Macrophages via Activating PI3K/Akt/mTOR Signaling
2020, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S254985
PMID:32982299
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的潜在功能角色 | 发现肿瘤相关内皮细胞通过分泌HSPA12B，激活PI3K/Akt/mTOR信号通路，诱导巨噬细胞M2极化，这是一种新的肿瘤相关内皮细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用 | NA | 探索肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的功能角色 | 头颈部鳞状细胞癌中的肿瘤相关内皮细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | Bulk-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过5000个细胞来自18个原发性头颈部鳞状细胞癌病例 |
| 785 | 2024-08-09 |
Re-analysis of Single Cell Transcriptome Reveals That the NR3C1-CXCL8-Neutrophil Axis Determines the Severity of COVID-19
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.02145
PMID:32983174
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研究论文 | 本研究通过重新分析COVID-19患者的单细胞转录组数据，探讨了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴与疾病严重程度的关系 | 首次揭示了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴在决定COVID-19严重程度中的作用 | NA | 探讨COVID-19患者疾病严重程度与免疫特征的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 786 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Sequencing From Mouse Incisor Reveals Dental Epithelial Cell-Type Specific Genes
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00841
PMID:32984333
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠门齿中的牙上皮细胞类型特异性基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了牙上皮细胞类型的异质性，并鉴定了新的牙上皮细胞标记基因 | NA | 旨在阐明牙上皮细胞类型的异质性及其在牙釉质形成中的分子机制 | 小鼠门齿中的牙上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6,260个单细胞 |
| 787 | 2024-08-09 |
Reproducibility across single-cell RNA-seq protocols for spatial ordering analysis
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0239711
PMID:32986734
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研究论文 | 本文评估了三种不同单细胞RNA测序协议（Smart-seq、MARS-seq和10X）在空间重构分析中的可重复性 | 发现不同协议和计算算法生成的数据在空间重构分析后基因表达谱高度一致 | 需要优化协议中测序深度和细胞数量的平衡，以有效利用资源 | 评估不同单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的表现 | 三种单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的可重复性和生物信号再现能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种不同协议的数据集 |
| 788 | 2024-08-09 |
Mechanisms of cell specification and differentiation in vertebrate cranial sensory systems
2020-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2020.08.006
PMID:32950922
|
研究论文 | 本文探讨了脊椎动物颅部感觉系统的细胞特化与分化机制 | 利用单细胞转录组学、高分辨率成像和系统生物学方法，以空前的分辨率研究这些过程 | NA | 揭示脊椎动物感觉器官中驱动细胞多样性的转录因子程序及其与组织形态发生的耦合 | 脊椎动物的感觉细胞特化和分化机制 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学、高分辨率成像、系统生物学 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA |
| 789 | 2024-08-09 |
A single-cell view of spermatogonial stem cells
2020-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2020.07.005
PMID:32950921
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析探讨了精子发生干细胞（SSCs）及其前体细胞的特性和异质性 | 揭示了SSCs及其前体细胞的异质性，并提出了可能存在多个SSC亚群的新观点 | NA | 探讨单细胞RNA测序分析在精子发生干细胞研究中的应用及其揭示的生物学特性 | 精子发生干细胞（SSCs）及其前体细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 人类、猕猴和小鼠的睾丸细胞 |
| 790 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Unveils Unique Transcriptomic Signatures of Organ-Specific Endothelial Cells
2020-11-10, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了特定组织来源的小鼠内皮细胞的转录组特征 | 发现了特定组织内皮细胞的新标记物和可能参与维持其身份的信号通路，并揭示了性别对内皮细胞转录组的显著影响 | NA | 探究内皮细胞特异性的转录组基础 | 特定组织来源的小鼠内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图聚类算法 | 转录组数据 | 来自Tabula Muris联盟生成的小鼠特定组织内皮细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 791 | 2024-08-09 |
Single-Cell Characterization of Malignant Phenotypes and Developmental Trajectories of Adrenal Neuroblastoma
2020-11-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.08.014
PMID:32946775
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了16名肾上腺神经母细胞瘤患者的160,910个细胞和早期人类胚胎及胎儿肾上腺中12,103个潜在发育细胞的转录组 | 首次揭示了肾上腺神经母细胞瘤肿瘤细胞的转录特征与去甲肾上腺素能嗜铬细胞相似，并重现了嗜铬细胞在正常发育过程中的增殖/分化状态 | NA | 探究神经母细胞瘤的发育起源及其细胞状态 | 肾上腺神经母细胞瘤及其潜在发育细胞 | 数字病理学 | 儿童常见体腔外实体瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 16名患者和早期人类胚胎及胎儿肾上腺中的细胞，共计173,013个细胞 |
| 792 | 2024-08-09 |
Multi-layered Spatial Transcriptomics Identify Secretory Factors Promoting Human Hematopoietic Stem Cell Development
2020-11-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.08.004
PMID:32946788
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研究论文 | 本文通过结合空间转录组学分析和基因表达谱分析，研究了人类造血干细胞发育过程中的分泌因子 | 首次揭示了内皮素1作为人类造血干细胞发育的重要分泌调节因子 | NA | 识别促进人类造血干细胞发育的分泌因子 | 人类造血干细胞的发育机制 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及胚胎主动脉的多个细胞群和单细胞 |
| 793 | 2024-08-09 |
Generation of a p16 Reporter Mouse and Its Use to Characterize and Target p16high Cells In Vivo
2020-11-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.09.006
PMID:32949498
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研究论文 | 本文生成了一个p16报告小鼠模型，用于在单细胞水平上分析p16细胞在体内的特征，并发现这些细胞在所有器官中随年龄增长而富集，且无法增殖，半衰期因组织而异。 | 本文创新性地使用p16-Cre-tdTomato小鼠模型，结合单细胞转录组学，揭示了p16细胞在体内的分布和功能，为研究细胞衰老提供了新的工具。 | NA | 研究细胞衰老在年龄相关器官功能障碍中的作用及其在体内的发病机制。 | p16细胞在体内的特征及其在不同器官中的分布和功能。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | p16-Cre-tdTomato小鼠模型 | 单细胞数据 | 涉及多个器官的p16细胞 |
| 794 | 2024-08-09 |
NPC1 silent variant induces skipping of exon 11 (p.V562V) and unfolded protein response was found in a specific Niemann-Pick type C patient
2020-11, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1451
PMID:32931663
|
研究论文 | 研究了Niemann-Pick病C型（NPC）患者中NPC1基因的静默变异对蛋白质功能的影响 | 首次证明了NPC1基因的静默多态性（p.V562V）是NPC的致病变异，并发现UPR在特定NPC患者中上调 | NA | 探究NPC1基因变异对NPC病的影响及其分子机制 | Niemann-Pick病C型患者及其NPC1基因变异 | 数字病理学 | 神经内脏疾病 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（MARS-Seq） | NA | 基因组数据 | 两个无关家庭的NPC患者 |
| 795 | 2024-08-09 |
Detection of chemotherapy-resistant patient-derived acute lymphoblastic leukemia clones in murine xenografts using cellular barcodes
2020-11, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.09.188
PMID:32946982
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研究论文 | 本研究使用细胞条形码分析方法，追踪化疗介导选择压力下数百个患者来源的急性淋巴细胞白血病克隆的体内竞争动态 | 首次展示了化疗在药物依赖性方式下减少克隆多样性，并发现化疗介导的选择导致白血病克隆在解剖部位的分布更加不对称 | 研究主要集中在化疗对克隆动态的影响，未来需要结合单细胞测序技术进行更深入的分析 | 探索化疗对急性淋巴细胞白血病克隆动态的影响，并寻找预防复发的潜在目标 | 患者来源的急性淋巴细胞白血病细胞及其克隆 | NA | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞条形码分析 | NA | 细胞 | 使用Nod/Scid/Il2Rγ (NSG)小鼠移植了条形码标记的患者来源或SupB15急性淋巴细胞白血病细胞，并在九个解剖位置进行纵向评估 |
| 796 | 2024-08-09 |
SpaGE: Spatial Gene Enhancement using scRNA-seq
2020-10-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa740
PMID:32955565
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaGE的方法，该方法通过整合空间和单细胞RNA测序数据集，预测空间配置中的全转录组表达。 | SpaGE方法能够解决单细胞RNA测序缺乏空间定位的问题，并且能够预测新的空间基因模式。 | NA | 开发一种方法，将空间和单细胞RNA测序数据集整合，以预测空间配置中的全转录组表达。 | 单细胞RNA测序数据及其空间定位。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了五个数据集对进行验证。 |
| 797 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of Tocilizumab-treated peripheral blood mononuclear cells as an in vitro model of inflammation
2020-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.09.11.281782
PMID:32935096
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了托珠单抗治疗前后外周血单个核细胞的表达变化，以此构建体外炎症模型，探讨托珠单抗对COVID-19相关细胞因子风暴的影响 | 利用单细胞RNA测序技术，首次在单细胞水平上展示了托珠单抗治疗后炎症相关基因和生物途径的表达减少 | 研究仅限于体外模型和特定人群（肾移植受者），需要进一步的临床试验验证 | 探讨托珠单抗在治疗COVID-19中的作用及其对细胞因子风暴的影响 | 托珠单抗治疗前后的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 798 | 2024-08-09 |
Transcription factor expression defines subclasses of developing projection neurons highly similar to single-cell RNA-seq subtypes
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2008013117
PMID:32948690
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研究论文 | 本文研究了在小鼠大脑发育过程中，从胚胎第13天到出生后第5天，两类具有不同形态和功能特征的投射神经元的基因表达和染色质可及性，以识别分化神经元细胞命运的转录网络 | 本文通过深度测序识别了具有密集亚类特异性调控和亚类富集转录因子结合基序的转录因子组，并描述了定义每个亚类的转录因子相邻长非编码RNA | NA | 旨在理解大脑皮层中细胞类型多样化的机制及其与功能的关系 | 小鼠大脑中两类投射神经元的基因表达和染色质可及性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠大脑中分离的单细胞 |
| 799 | 2024-08-09 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
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研究论文 | 本研究通过基于适配体的蛋白质组学方法，分析了22名接受侵入性采样个体的动脉到肾静脉的蛋白质梯度，发现testican-2是一个由足细胞衍生的肾脏健康标志物 | 首次发现testican-2作为足细胞衍生的肾脏健康标志物，并展示了其在临床上的应用潜力 | NA | 探究肾脏健康相关的生物标志物 | testican-2在肾脏健康中的作用 | NA | NA | 基于适配体的蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据 | 22名个体，Jackson Heart Study中的1928名非洲裔美国人，Framingham Heart Study中的1621名白人 |
| 800 | 2024-08-09 |
Reprogramming roadmap reveals route to human induced trophoblast stem cells
2020-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2734-6
PMID:32939092
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学重建了人类皮肤成纤维细胞的重编程轨迹，揭示了从体细胞到诱导多能干细胞及诱导滋养层干细胞的重编程过程。 | 本文首次揭示了重编程过程中滋养层细胞特异性调控程序的作用，并成功诱导出与天然滋养层干细胞分子和功能相似的诱导滋养层干细胞。 | NA | 探讨人类体细胞重编程为多能干细胞及滋养层干细胞的分子机制。 | 人类皮肤成纤维细胞的重编程过程及诱导滋养层干细胞的生成。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |