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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-03-29 |
Simple Method to Quantify Protein Abundances from 1000 Cells
2020-Jun-30, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c01191
PMID:32637829
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研究论文 | 本文介绍了一种从1000个哺乳动物干细胞中量化蛋白质表达水平的简化蛋白质组学工作流程 | 整合并优化了多项近期技术进展,实现了从极少量细胞(低至1000个)中进行蛋白质定量,无需特殊设备,仅需细胞裂解工具 | 方法虽已验证于小鼠胚胎干细胞和体外分化运动神经元,但在其他细胞类型或更复杂组织中的适用性可能有限 | 开发一种从最小输入样本中获取蛋白质组学数据的简单准确方法 | 小鼠胚胎干细胞、体外分化运动神经元以及荧光激活细胞分选纯化的海鞘细胞 | 蛋白质组学 | NA | 化学肽标记 | NA | 蛋白质表达数据 | 低至1000个哺乳动物干细胞 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA |
| 62 | 2026-03-25 |
Selective Induction of Human Autonomic Neurons Enables Precise Control of Cardiomyocyte Beating
2020-06-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66303-3
PMID:32528170
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研究论文 | 本研究开发了一种逐步化学诱导方法,从人类多能干细胞中诱导出交感样和副交感样自主神经元,并展示了它们对心肌细胞搏动速率的拮抗性调控 | 首次有效从人类多能干细胞中诱导出胆碱能副交感神经元,并建立了选择性诱导交感样和副交感样神经元的方法,实现了对心肌细胞搏动的精确控制 | 研究主要基于体外诱导和共培养实验,尚未在体内模型中验证神经元的功能和长期效应 | 开发从人类多能干细胞中诱导自主神经系统神经元的方法,以研究其对靶器官(如心肌细胞)的调控 | 人类多能干细胞诱导的自主神经元和人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 | 干细胞生物学与神经科学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、药理学和电生理学功能分析 | NA | RNA表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-03-25 |
CD39 Produced from Human GMSCs Regulates the Balance of Osteoclasts and Osteoblasts through the Wnt/β-Catenin Pathway in Osteoporosis
2020-06-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2020.04.003
PMID:32304668
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研究论文 | 本研究探讨了人牙龈来源间充质干细胞(GMSCs)通过CD39和Wnt/β-catenin通路调节骨质疏松中破骨细胞和成骨细胞平衡的作用 | 首次发现CD39+ GMSC亚群在促进骨形成中的关键作用,并揭示其通过Wnt/β-catenin通路发挥成骨能力的机制 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证,且具体临床应用潜力需进一步探索 | 探究GMSCs在骨质疏松中调节骨形成和保护的潜力 | 人牙龈来源间充质干细胞(GMSCs)和卵巢切除小鼠模型 | NA | 骨质疏松 | RNA测序(RNA-seq),单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 64 | 2026-03-25 |
Single-cell RNA sequencing identifies senescent cerebromicrovascular endothelial cells in the aged mouse brain
2020-04, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-020-00177-1
PMID:32236824
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别了老年小鼠大脑中衰老的脑血管内皮细胞,并探讨了其在血管性认知障碍中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序在野生型衰老小鼠模型中检测到衰老的脑血管内皮细胞,为评估抗衰老治疗效率提供了新方法 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且样本量相对有限 | 旨在检测衰老小鼠大脑中衰老的脑血管内皮细胞,并评估单细胞RNA测序方法在衰老研究中的应用 | 年轻(3月龄)和老年(28月龄)C57BL/6小鼠的脑血管内皮细胞及神经血管单元相关细胞 | 数字病理学 | 血管性认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 4233个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-03-25 |
Hybrid Stem Cell States: Insights Into the Relationship Between Mammary Development and Breast Cancer Using Single-Cell Transcriptomics
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00288
PMID:32457901
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,结合机器学习数据对齐方法,探索了正常乳腺和乳腺癌中混合干细胞状态与发育阶段的关系 | 通过整合人类和小鼠乳腺单细胞RNA-seq数据集及TCGA肿瘤数据,首次系统量化了正常乳腺发育过程中混合干细胞状态分布,并揭示了条件重编程诱导的干细胞状态扩展 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究正常乳腺干细胞状态在发育阶段和癌症中的变化,以及混合细胞群与干细胞特性及癌症的关系 | 人类和小鼠的乳腺细胞,包括正常状态、条件重编程诱导的干细胞样状态以及TCGA中的乳腺癌样本 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习数据对齐,伪时间分析 | 机器学习 | 单细胞RNA-seq数据,批量RNA-seq数据 | 多个乳腺单细胞RNA-seq数据集(人类和小鼠),TCGA乳腺癌肿瘤数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-03-24 |
Cortical Foxp2 Supports Behavioral Flexibility and Developmental Dopamine D1 Receptor Expression
2020-03-14, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhz209
PMID:31711176
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研究论文 | 本研究通过分析皮层特异性Foxp2条件敲除小鼠,揭示了Foxp2在行为灵活性及皮层多巴胺D1受体表达发育中的作用 | 首次在皮层特异性Foxp2敲除模型中,结合行为学、分子表达和单细胞转录组学,系统阐明了Foxp2通过调控D1R表达影响皮层回路发育和非细胞自主性变化的机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类神经发育障碍的转化需进一步验证;单细胞转录组学分析仅聚焦于新生儿期前额叶皮层,成年期或其他脑区变化未全面评估 | 探究Foxp2在皮层发育中的分子和行为功能,及其与神经发育障碍的相关性 | 皮层特异性Foxp2条件敲除小鼠 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | 条件敲除小鼠模型 | 基因表达数据、行为学数据 | 未明确指定样本数量,但涉及敲除小鼠和对照组的比较分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-03-24 |
CLEAR: coverage-based limiting-cell experiment analysis for RNA-seq
2020-02-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-020-02247-6
PMID:32039730
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CLEAR的工作流程,用于在限制细胞RNA测序数据中识别可靠可定量的转录本,以进行差异表达基因分析 | CLEAR是首个专门为lcRNA-seq数据设计的定制化算法,用于选择稳健/低噪声转录本进行组间比较,填补了该领域预处理工具的空白 | 未明确说明CLEAR算法在处理极低细胞数样本时的性能极限或与其他方法的全面比较 | 开发并验证一种工作流程,以改善限制细胞RNA测序数据的分析质量,特别是用于差异表达基因分析 | 慢性淋巴细胞白血病CD5+和CD5-细胞、小鼠齿状回富集细胞以及公开可用的lcRNA-seq数据集 | 单细胞转录组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 限制细胞RNA测序、直接cDNA预扩增协议 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量,但涉及人类CLL样本、小鼠DG样本及两个公开数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 68 | 2026-03-24 |
Association of Urine sCD163 With Proliferative Lupus Nephritis, Fibrinoid Necrosis, Cellular Crescents and Intrarenal M2 Macrophages
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00671
PMID:32351512
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研究论文 | 本研究探讨了尿液可溶性CD163(sCD163)作为狼疮性肾炎(LN)生物标志物的潜力,特别是在区分活动性LN、增殖性LN及与肾脏病理特征的相关性方面 | 首次通过多队列研究验证尿液sCD163在区分活动性狼疮性肾炎、增殖性病变中的诊断价值,并结合单细胞RNA测序分析揭示其与肾内M2巨噬细胞的关联 | 研究为观察性设计,未进行前瞻性验证或干预性试验,样本来自多个队列可能存在异质性,且未评估尿液sCD163的动态变化对治疗反应的预测能力 | 评估尿液sCD163作为狼疮性肾炎生物标志物的临床价值,及其与肾脏病理特征的关联 | 系统性红斑狼疮患者(包括活动性狼疮性肾炎、活动性非肾脏狼疮、非活动性狼疮)及健康对照 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA、单细胞RNA测序 | NA | 尿液蛋白质检测数据、临床参数、肾脏病理学数据 | 284名参与者(228名SLE患者,56名健康对照),来自三个队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-03-16 |
Amniotic fluid cell-free transcriptome: a glimpse into fetal development and placental cellular dynamics during normal pregnancy
2020-02-12, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-020-0690-5
PMID:32050959
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研究论文 | 本研究通过分析羊水细胞游离转录组,探讨正常妊娠期间胎儿发育和胎盘细胞动态变化 | 首次报道单细胞基因组特征可在羊水中追踪并显示妊娠期间复杂的表达模式,同时揭示了选择性剪接在组织身份获取、器官发育和免疫过程中的作用 | 样本量相对有限(共98例),且仅关注正常妊娠,未纳入病理妊娠病例进行对比 | 建立正常妊娠羊水基因表达和剪接模式,为产科生物标志物发现提供基础 | 正常妊娠女性的羊水样本(孕中期30例,足月68例) | 转录组学 | NA | 人类转录组芯片(Human Transcriptome Arrays)和单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 98例羊水样本(孕中期30例,足月68例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-03-16 |
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14171-5
PMID:31996681
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和抗体筛选,鉴定出CD44作为内皮向造血转变(EHT)的标志物,并揭示了其在造血干细胞和祖细胞(HSPCs)发育中的调控作用 | 首次识别CD44为EHT过程的特异性标记物,并证明其与透明质酸的相互作用是HSPC发育的关键调控因素 | 研究主要基于小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域,人类或其他物种中的适用性尚未验证 | 阐明内皮向造血转变(EHT)的中间步骤及调控机制 | 小鼠主动脉-性腺-中肾(AGM)区域的内皮细胞和造血干细胞/祖细胞(HSPCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组分析,抗体筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量,但涉及AGM区域的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-03-04 |
V-SVA: an R Shiny application for detecting and annotating hidden sources of variation in single-cell RNA-seq data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa128
PMID:32119082
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研究论文 | 本文介绍了一个名为V-SVA的R Shiny应用,用于检测和注释单细胞RNA测序数据中的隐藏变异源 | 开发了一个交互式网络浏览器界面,结合了基因关联发现、公开数据库注释和数据可视化工具,以辅助解释单细胞RNA测序中的变异源 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 促进单细胞RNA测序数据中隐藏变异源的识别和注释,以区分技术变异和生物变异 | 单细胞RNA测序数据及其中的变异源 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | IA-SVA, SVA, ZINB-WaVE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-03-02 |
A distinct GM-CSF+ T helper cell subset requires T-bet to adopt a TH1 phenotype and promote neuroinflammation
2020-Oct-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba9953
PMID:33097590
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高维单细胞质谱流式技术,识别了一种独特的GM-CSF+ T辅助细胞亚群(TGM),并探讨其在神经炎症中的作用 | 首次系统性地识别并表征了GM-CSF+ TGM细胞亚群,揭示了其缺乏经典T细胞谱系标志,但能在IL-12刺激下向TH1表型转化并促进神经炎症 | 研究主要基于小鼠模型和健康人血液样本,在人类自身免疫疾病中的直接验证尚需进一步研究 | 探究GM-CSF+ T辅助细胞的身份、特性及其在自身免疫神经炎症中的致病机制 | 健康人血液中的抗原经验性CD45RA- CD4+ T细胞,以及实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型中的外周和中枢神经系统细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序,高维单细胞质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据,质谱流式数据 | 健康人血液样本及EAE小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-03-02 |
SAME-clustering: Single-cell Aggregated Clustering via Mixture Model Ensemble
2020-01-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz959
PMID:31777938
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研究论文 | 本文提出了一种名为SAME-clustering的集成聚类方法,通过混合模型整合多种单细胞RNA测序数据的聚类结果,以提高聚类准确性 | SAME-clustering采用混合模型集成策略,从多种聚类方法中选择最大多样性的子集,生成改进的集成聚类解决方案,这在单细胞RNA测序数据分析中是一种创新方法 | 论文未明确讨论该方法在极端大规模数据集或高度噪声数据下的性能限制,也未涉及计算效率的详细评估 | 开发一种集成聚类方法,以解决单细胞RNA测序数据聚类中不同方法结果不一致的问题,提高聚类结果的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据,涉及从49到32,695个单细胞,涵盖3到15个不同的细胞类型或簇 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 单细胞RNA测序数据 | 15个数据集,单细胞数量从49到32,695个 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-02-20 |
LIM-Nebulette Reinforces Podocyte Structural Integrity by Linking Actin and Vimentin Filaments
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019121261
PMID:32737144
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研究论文 | LIM-nebulette通过连接肌动蛋白和波形蛋白丝来增强足细胞结构完整性 | 揭示了LIM-nebulette在足细胞中作为多功能细胞骨架蛋白的新作用,通过主动重组黏着斑、肌动蛋白细胞骨架和中间丝来维持结构完整性 | NA | 研究足细胞结构完整性的细胞骨架机制 | 大鼠、小鼠和人类的足细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、免疫金标记、高内涵成像、超分辨率显微镜、原子力显微镜、活细胞钙成像 | NA | 图像、文本、视频 | 大鼠、小鼠和人类细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-02-20 |
Integrative analyses of single-cell transcriptome and regulome using MAESTRO
2020-08-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02116-x
PMID:32767996
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研究论文 | 本文介绍了MAESTRO,一个用于整合分析单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据的开源计算工作流程 | 通过建模单细胞水平的染色质可及性来预测基因调控潜力,在整合scRNA-seq和scATAC-seq细胞聚类方面优于现有方法 | NA | 开发一个综合性的计算工作流程,用于整合分析来自多个平台的单细胞转录组和调控组数据 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-02-17 |
Single-cell transcriptomics identifies an effectorness gradient shaping the response of CD4+ T cells to cytokines
2020-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15543-y
PMID:32286271
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了CD4+ T细胞对细胞因子反应的效应梯度 | 首次在人类CD4+ T细胞中通过单细胞RNA-seq识别出从初始到效应记忆T细胞的转录连续体,并发现效应梯度影响细胞活化和细胞因子反应 | 研究主要关注人类CD4+ T细胞,未涉及其他免疫细胞类型或体内验证 | 探究初始和记忆CD4+ T细胞对细胞因子反应的差异及其异质性 | 人类初始和记忆CD4+ T细胞 | 单细胞组学 | 炎症相关疾病 | 定量蛋白质组学, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据, RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 超过40,000个人类初始和记忆CD4+ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2025-12-19 |
T-cell repertoire analysis and metrics of diversity and clonality
2020-10, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2020.07.010
PMID:32889231
|
综述 | 本文综述了T细胞受体(TCR)测序技术、计算工具及多样性指标,以解析免疫库在健康和疾病中的动态 | 整合了高通量测序技术与计算工具,用于TCR库的聚类、特异性预测及多样性分析,推动个性化免疫治疗 | NA | 综述T细胞受体测序技术、计算工具及多样性指标,以促进免疫库在疾病和治疗中的研究 | T细胞受体(TCR)库 | 自然语言处理 | NA | 高通量测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2025-11-16 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
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研究论文 | 本研究通过开发小鼠模型,在单细胞分辨率下探究了拉伸如何通过调控表皮干细胞和基底祖细胞的活性来介导皮肤扩张 | 首次在单细胞分辨率下揭示拉伸诱导皮肤扩张的机制,结合克隆分析、定量建模和单细胞RNA测序的多学科方法 | 研究基于小鼠模型,在人类皮肤中的适用性需要进一步验证 | 阐明机械力在体内对表皮细胞行为的影响机制 | 小鼠皮肤表皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、克隆分析、定量建模、转录组分析、染色质分析 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
The Transcriptome of Hepatic Fibrosis Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-05, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31155
PMID:32017148
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
PMID:32928889
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研究论文 | 本研究通过标记果蝇中唯一的电压门控钠通道Para,揭示了其在神经元中的表达模式和亚细胞定位 | 首次发现果蝇钠通道仅表达于活跃神经元,并定位于轴突远端起始段样结构 | 研究主要聚焦果蝇模型,在其它无脊椎动物中的普适性需要进一步验证 | 探究无脊椎神经元中动作电位的起始位置和钠通道的表达特征 | 果蝇胚胎期、幼虫期和成年期中枢神经系统神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳电生理记录, 基因标记技术 | NA | 基因表达数据, 电生理记录数据, 转录组数据 | 果蝇第三龄幼虫全脑单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |