单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 761 - 780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals the mechanism of abnormal proliferation of epithelial cells in congenital cystic adenomatoid malformation
2020-11-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2020.112299
PMID:32979365
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了先天性囊性腺瘤样畸形中上皮细胞异常增殖的机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了先天性囊性腺瘤样畸形的细胞景观，并揭示了与该疾病相关的细胞和分子事件 | 研究样本仅来自一名4.25岁的患者，可能存在样本量不足的问题 | 探索先天性囊性腺瘤样畸形的发病机制 | 先天性囊性腺瘤样畸形患者的病变和非病变区域细胞 | 数字病理学 | 先天性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共获取19,904个细胞 |
| 762 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals a Crucial Role for CTHRC1 (Collagen Triple Helix Repeat Containing 1) Cardiac Fibroblasts After Myocardial Infarction
2020-11-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，揭示了心肌梗死后心脏成纤维细胞中CTHRC1的关键作用 | 首次鉴定并表征了心肌梗死后出现的一种独特的心脏成纤维细胞亚群，并发现CTHRC1是其关键调节因子 | NA | 定义心肌梗死后心脏成纤维细胞的异质性及其在心室重塑过程中的作用机制 | 心脏成纤维细胞及其在心肌梗死后的反应 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括小鼠、猪和心肌梗死及扩张型心肌病患者的心脏组织样本 |
| 763 | 2024-08-09 |
Microanatomy of the Human Atherosclerotic Plaque by Single-Cell Transcriptomics
2020-11-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.120.316770
PMID:32981416
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和染色质可及性分析，深入探讨了人类动脉粥样硬化斑块的细胞异质性和分子复杂性 | 首次全面评估了人类动脉粥样硬化斑块中细胞的分子复杂性，并揭示了细胞间的相互转换和激活状态 | NA | 深入理解人类动脉粥样硬化的病理生理机制 | 人类颈动脉动脉粥样硬化斑块中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据和表观基因组数据 | 涉及14种不同的细胞群体，包括内皮细胞、平滑肌细胞、肥大细胞、B细胞、骨髓细胞和T细胞等 |
| 764 | 2024-08-09 |
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019103476
PMID:32985719
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研究论文 | 本文建立了一种三维（3D）小鼠细支气管肺泡肺类器官（BALO）模型，该模型允许通过与肺驻留间充质细胞共培养来克隆扩展和自我组织流式细胞术分选的细支气管肺泡干细胞（BASCs）。 | BALO模型能够重建远端肺的表皮-间充质-髓样单位，为研究肺发育、感染和体外再生过程开辟了新的途径。 | NA | 研究肺发育和疾病 | 小鼠细支气管肺泡干细胞（BASCs）和肺驻留间充质细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 流式细胞术（FACS），单细胞RNA测序 | 3D类器官模型 | 细胞 | NA |
| 765 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals different subsets of non-specific cytotoxic cells in teleost
2020-11, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2020.09.031
PMID:32971213
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对尼罗罗非鱼头肾来源的白细胞进行分析，揭示了非特异性细胞毒性细胞（NCC）的不同亚群 | 首次揭示了NCC群体中的四个亚群，包括记忆样NCC、成熟NCC、未成熟NCC和前NCC | NA | 阐明硬骨鱼免疫系统中非特异性细胞毒性细胞（NCC）的亚群及其调控网络 | 尼罗罗非鱼头肾来源的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 约24,062个头肾来源的白细胞 |
| 766 | 2024-08-09 |
Agonist-induced functional analysis and cell sorting associated with single-cell transcriptomics characterizes cell subtypes in normal and pathological brain
2020-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.262717.120
PMID:32973039
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研究论文 | 本文开发了激动剂诱导的功能分析和细胞分选（aiFACS）技术，结合单细胞转录组学，用于分析正常和病理脑组织中的细胞亚型 | aiFACS技术允许实时记录和分选细胞，根据其对刺激的即时和个体反应，结合单细胞转录组学构建基于细胞特定药理反应的功能组织图谱 | NA | 深入了解细胞与其环境之间的动态相互作用 | 正常和病理脑组织中的细胞亚型 | 数字病理学 | NA | aiFACS | NA | 转录组 | 使用分离的小鼠脑组织，以及来自脆弱X综合征模型小鼠脑的中间神经元 |
| 767 | 2024-08-09 |
Onco-fetal Reprogramming of Endothelial Cells Drives Immunosuppressive Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2020-10-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.040
PMID:32976798
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了从发育到疾病的人类肝脏细胞图谱，并揭示了肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象 | 首次报道了肝细胞癌中存在与胎儿肝脏相似的免疫抑制性胎儿癌生态系统，并提供了新的治疗干预靶点 | NA | 探索肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象及其机制 | 人类胎儿、肝细胞癌及小鼠肝脏的细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 约212,000个细胞 |
| 768 | 2024-08-09 |
Genetic landscape and autoimmunity of monocytes in developing Vogt-Koyanagi-Harada disease
2020-10-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2002476117
PMID:32989127
|
研究论文 | 本研究利用先进的单细胞RNA测序技术，系统分析了11,259个人类循环单核细胞，并对其亚群进行了遗传学定义，揭示了Vogt-Koyanagi-Harada疾病相关单核细胞的精确分类、分子标记和信号通路 | 本研究首次揭示了两个先前未知的单核细胞亚群：HLA和巨核细胞样单核细胞亚群，并发现了与疾病相关的促炎单核细胞亚群，其基因表达特征指示炎症、抗病毒活性和病理性激活状态 | NA | 研究Vogt-Koyanagi-Harada疾病中单核细胞的遗传图谱和自身免疫机制 | 人类循环单核细胞及其在Vogt-Koyanagi-Harada疾病中的作用 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,259个人类循环单核细胞 |
| 769 | 2024-08-09 |
Nanoparticle enhanced combination therapy for stem-like progenitors defined by single-cell transcriptomics in chemotherapy-resistant osteosarcoma
2020-09-25, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-020-00248-x
PMID:32973147
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，系统地绘制了化疗耐药性骨肉瘤肿瘤中细胞类型特异性基因表达图谱，并探讨了纳米颗粒增强的组合疗法对耐药性骨肉瘤的治疗效果 | 本研究首次揭示了化疗耐药性骨肉瘤中VEGFR2-JMJD3富集的静止干细胞样细胞亚群，并发现VEGFR2抑制剂和JMJD3抑制剂的协同作用能有效抑制骨肉瘤细胞增殖和肿瘤生长 | 尽管研究展示了纳米颗粒增强的组合疗法对耐药性骨肉瘤的有效性，但尚未探讨该疗法在临床应用中的长期效果和潜在副作用 | 探讨化疗耐药性骨肉瘤的细胞特征及其治疗策略 | 化疗耐药性骨肉瘤肿瘤中的细胞类型特异性基因表达 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 770 | 2024-08-09 |
Immunosuppressive effects of mesenchymal stem cells on lung B cell gene expression in LPS-induced acute lung injury
2020-09-25, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-01934-x
PMID:32977837
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研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞（MSC）在脂多糖（LPS）诱导的急性肺损伤（ALI）中对肺B细胞基因表达的影响 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了MSC治疗对肺B细胞转录变化的影响，揭示了MSC治疗ALI的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，未来需在人体中验证这些发现 | 探讨MSC治疗在ALI中对肺B细胞的作用及其机制 | 肺B细胞在MSC治疗ALI中的作用 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肺B细胞 |
| 771 | 2024-08-09 |
Bimodal function of chromatin remodeler Hmga1 in neural crest induction and Wnt-dependent emigration
2020-09-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57779
PMID:32965216
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序结合高分辨率杂交技术，揭示了染色质重塑因子Hmga1在神经嵴细胞诱导和迁移中的双模态功能 | 首次展示了Hmga1在神经嵴发育中的两个不同功能，即在神经板边缘调节Pax7依赖的神经嵴谱系指定和在迁移前阶段减少颅神经嵴从背神经管的迁出 | NA | 探究Hmga1在神经嵴细胞发育中的作用 | 神经嵴细胞的诱导和迁移 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高分辨率杂交, CRISPR-Cas9 | NA | RNA | NA |
| 772 | 2024-08-09 |
Multi-scale supervised clustering-based feature selection for tumor classification and identification of biomarkers and targets on genomic data
2020-Sep-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07038-3
PMID:32962626
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研究论文 | 本文设计了一种基于多尺度监督聚类的特征选择算法MCBFS，用于基因组数据分析中的特征选择和模型学习，并通过实验验证了其有效性和鲁棒性 | 开发了一种新的特征选择算法MCBFS，结合了多尺度聚类和监督学习方法，提高了算法的解释性和可视化效果 | 文章未明确提及现有方法的具体局限性 | 提高疾病分类中深度学习技术的应用效果，增强特征选择算法的解释性和可视化能力 | 基因组数据中的特征选择、肿瘤分类、生物标志物和治疗靶点的识别 | 机器学习 | 肺癌 | 多尺度聚类 | MCBFS算法 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 涉及八个数据集，具体样本数量未详细说明 |
| 773 | 2024-08-09 |
Biological insights from multi-omic analysis of 31 genomic risk loci for adult hearing difficulty
2020-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009025
PMID:32986727
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研究论文 | 本文通过多组学分析31个与成人听力困难相关的基因组风险位点，揭示了与年龄相关听力损伤的新风险基因和位点 | 本文首次报道了8个新的与听力困难相关的基因组风险位点，并通过多组学数据分析了这些位点的调控和细胞特异性表达 | 研究主要基于英国生物库的数据，可能存在人群特异性限制 | 揭示年龄相关听力损伤的遗传原因 | 31个与听力困难相关的基因组风险位点 | 遗传学 | 听力障碍 | GWAS, mRNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据 | 330,759名参与者 |
| 774 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Identifies Cell Subsets in Human Placenta That Highly Expresses Factors Driving Pathogenesis of SARS-CoV-2
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00783
PMID:32974340
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，识别了人类胎盘中表达SARS-CoV-2感染所需因子的细胞亚群，并探讨了这些细胞在病毒感染中的作用 | 本文首次揭示了胎盘中特定细胞亚群表达SARS-CoV-2感染所需因子，并展示了这些细胞可能驱动病毒在发育中的人类胎盘中的传播 | NA | 旨在预测胎盘是否易受SARS-CoV-2感染，并揭示其在妊娠期病毒感染中的作用 | 人类胎盘中的细胞亚群及其在SARS-CoV-2感染中的作用 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个物种的胎盘样本，包括人类 |
| 775 | 2024-08-09 |
HSPA12B Secreted by Tumor-Associated Endothelial Cells Might Induce M2 Polarization of Macrophages via Activating PI3K/Akt/mTOR Signaling
2020, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S254985
PMID:32982299
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的潜在功能角色 | 发现肿瘤相关内皮细胞通过分泌HSPA12B，激活PI3K/Akt/mTOR信号通路，诱导巨噬细胞M2极化，这是一种新的肿瘤相关内皮细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用 | NA | 探索肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的功能角色 | 头颈部鳞状细胞癌中的肿瘤相关内皮细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | Bulk-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过5000个细胞来自18个原发性头颈部鳞状细胞癌病例 |
| 776 | 2024-08-09 |
Re-analysis of Single Cell Transcriptome Reveals That the NR3C1-CXCL8-Neutrophil Axis Determines the Severity of COVID-19
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.02145
PMID:32983174
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研究论文 | 本研究通过重新分析COVID-19患者的单细胞转录组数据，探讨了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴与疾病严重程度的关系 | 首次揭示了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴在决定COVID-19严重程度中的作用 | NA | 探讨COVID-19患者疾病严重程度与免疫特征的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 777 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Sequencing From Mouse Incisor Reveals Dental Epithelial Cell-Type Specific Genes
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00841
PMID:32984333
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠门齿中的牙上皮细胞类型特异性基因 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了牙上皮细胞类型的异质性，并鉴定了新的牙上皮细胞标记基因 | NA | 旨在阐明牙上皮细胞类型的异质性及其在牙釉质形成中的分子机制 | 小鼠门齿中的牙上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6,260个单细胞 |
| 778 | 2024-08-09 |
Reproducibility across single-cell RNA-seq protocols for spatial ordering analysis
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0239711
PMID:32986734
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研究论文 | 本文评估了三种不同单细胞RNA测序协议（Smart-seq、MARS-seq和10X）在空间重构分析中的可重复性 | 发现不同协议和计算算法生成的数据在空间重构分析后基因表达谱高度一致 | 需要优化协议中测序深度和细胞数量的平衡，以有效利用资源 | 评估不同单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的表现 | 三种单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的可重复性和生物信号再现能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种不同协议的数据集 |
| 779 | 2024-08-09 |
Mechanisms of cell specification and differentiation in vertebrate cranial sensory systems
2020-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2020.08.006
PMID:32950922
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研究论文 | 本文探讨了脊椎动物颅部感觉系统的细胞特化与分化机制 | 利用单细胞转录组学、高分辨率成像和系统生物学方法，以空前的分辨率研究这些过程 | NA | 揭示脊椎动物感觉器官中驱动细胞多样性的转录因子程序及其与组织形态发生的耦合 | 脊椎动物的感觉细胞特化和分化机制 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学、高分辨率成像、系统生物学 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA |
| 780 | 2024-08-09 |
A single-cell view of spermatogonial stem cells
2020-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2020.07.005
PMID:32950921
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析探讨了精子发生干细胞（SSCs）及其前体细胞的特性和异质性 | 揭示了SSCs及其前体细胞的异质性，并提出了可能存在多个SSC亚群的新观点 | NA | 探讨单细胞RNA测序分析在精子发生干细胞研究中的应用及其揭示的生物学特性 | 精子发生干细胞（SSCs）及其前体细胞 | NA | 男性不育 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 人类、猕猴和小鼠的睾丸细胞 |