单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1659 篇文献,本页显示第 761 - 780 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
761 2024-08-09
Identification of putative master regulators in rheumatoid arthritis synovial fibroblasts using gene expression data and network inference
2020-10-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用基因表达数据和网络推断方法,识别类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的潜在主调控因子 本研究首次识别了类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的五个特定主调控因子,并评估了它们的转录因子活性 NA 旨在表征类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子,这些因子可能解释其表型特征 类风湿性关节炎滑膜成纤维细胞中的主调控转录因子 NA 类风湿性关节炎 微阵列和单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自类风湿性关节炎和骨关节炎患者的滑膜组织
762 2024-08-09
Defining the First Part of the Oncogenic KRAS Journey
2020-10-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文通过分析类器官培养、患者样本和鼠模型结合单细胞RNA测序技术,探讨了致癌KRAS激活的早期事件 结合多种技术手段,如类器官培养、患者样本分析和单细胞RNA测序,以深入研究KRAS突变相关的早期致癌过程 NA 阐明致癌KRAS激活的早期事件 KRAS突变在人类癌症中的早期致癌过程 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及类器官培养、患者样本和鼠模型
763 2024-08-09
Single-Nucleus RNA-Seq Is Not Suitable for Detection of Microglial Activation Genes in Humans
2020-09-29, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过比较单细胞和单核RNA测序技术在人类大脑样本中的应用,探讨了单核RNA测序技术在检测人类组织细胞状态中的适用性 发现单核RNA测序技术在检测微胶质细胞激活基因方面存在低敏感性 单核RNA测序技术无法有效检测微胶质细胞在人类疾病中的细胞激活状态 评估单核RNA测序技术在检测人类组织细胞状态中的能力 微胶质细胞的激活基因 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序 (snRNA-seq) NA RNA 四个人类受试者的大脑样本
764 2024-08-09
Protocol for Isolation of Cardiac Interstitial Cells from Adult Murine Hearts for Unbiased Single Cell Profiling
2020-09-18, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文介绍了一种从成年小鼠心脏中高效分离高质量活核非心肌细胞的无偏单细胞RNA测序方法 使用基于液滴的技术进行单细胞分析,革新了对细胞状态和身份的研究 NA 开发一种高效的方法来分离心脏间质细胞,以进行无偏的单细胞RNA测序 成年小鼠心脏中的心脏间质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 不同小鼠品系的健康和受伤心脏样本
765 2024-08-09
A semi-automatic cell type annotation method for single-cell RNA sequencing dataset
2020-Sep, Genomics & informatics
研究论文 本文提出了一种半自动的细胞类型注释方法,用于单细胞RNA测序数据集 该方法通过计算用户提供的细胞类型特异性标记基因列表的归一化分数,实现了细胞类型的半自动注释 NA 开发一种高效的细胞类型注释方法,用于单细胞RNA测序数据分析 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 35个t-SNE聚类
766 2024-08-09
Landscape of transcript isoforms in single T cells infiltrating in non-small-cell lung cancer
2020-07-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 本文提出了一种名为IDEA的计算方法,用于全面检测和注释肿瘤浸润T细胞中的差异表达的转录本异构体,并应用于非小细胞肺癌的单细胞RNA测序数据集 首次在转录本异构体水平上分析肿瘤浸润T细胞,揭示了T细胞在肿瘤微环境中的分子特征 NA 旨在深入了解肿瘤浸润T细胞的分子机制 非小细胞肺癌中的肿瘤浸润T细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 计算方法(IDEA) 转录本异构体数据 12,346个T细胞
767 2024-08-09
Corrigendum: FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
correction NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
768 2024-08-09
Novel Glial Cell Functions: Extensive Potency, Stem Cell-Like Properties, and Participation in Regeneration and Transdifferentiation
2020, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了胚胎期和成年期施万细胞的多潜能特性及其在再生和转分化中的作用 探讨了施万细胞在神经和非神经组织损伤修复中的潜在应用,以及在肿瘤发展调控中的可能作用 NA 深入了解施万细胞的生物学特性,以开发有效的治疗策略 施万细胞的多潜能特性和其在再生及转分化中的作用 NA 神经退行性疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
769 2024-08-09
Kidney Single-Cell Atlas Reveals Myeloid Heterogeneity in Progression and Regression of Kidney Disease
2020-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在肾脏疾病进展和恢复过程中揭示了髓系细胞的异质性。 通过单细胞转录组学技术,识别了12种髓系细胞亚群,这些亚群在传统流式细胞术标记中未被发现,为肾脏疾病的治疗提供了新的靶点。 NA 探索髓系细胞在肾脏损伤和修复中的作用,并识别新的髓系细胞亚型。 肾脏中的髓系细胞及其在肾脏疾病进展和恢复中的作用。 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用了小鼠单侧输尿管梗阻模型进行研究
770 2024-08-09
Single-Cell Genomics Reveals a Novel Cell State During Smooth Muscle Cell Phenotypic Switching and Potential Therapeutic Targets for Atherosclerosis in Mouse and Human
2020-11-24, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本文通过结合平滑肌细胞(SMC)命运图谱和单细胞RNA测序技术,揭示了SMC在动脉粥样硬化中的转分化轨迹,并识别了潜在的治疗靶点。 发现了SMC在动脉粥样硬化中转变为一种新的中间细胞状态,并确定了视黄酸信号通路作为调控SMC向SEM细胞转变的关键因素。 NA 揭示SMC在动脉粥样硬化中的转分化轨迹,并识别分子治疗靶点。 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞(SMC)。 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因组数据 小鼠和人类动脉粥样硬化斑块样本
771 2024-08-09
Single-cell transcriptome profiling reveals the mechanism of abnormal proliferation of epithelial cells in congenital cystic adenomatoid malformation
2020-11-15, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了先天性囊性腺瘤样畸形中上皮细胞异常增殖的机制 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了先天性囊性腺瘤样畸形的细胞景观,并揭示了与该疾病相关的细胞和分子事件 研究样本仅来自一名4.25岁的患者,可能存在样本量不足的问题 探索先天性囊性腺瘤样畸形的发病机制 先天性囊性腺瘤样畸形患者的病变和非病变区域细胞 数字病理学 先天性疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 共获取19,904个细胞
772 2024-08-09
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals a Crucial Role for CTHRC1 (Collagen Triple Helix Repeat Containing 1) Cardiac Fibroblasts After Myocardial Infarction
2020-11-10, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析,揭示了心肌梗死后心脏成纤维细胞中CTHRC1的关键作用 首次鉴定并表征了心肌梗死后出现的一种独特的心脏成纤维细胞亚群,并发现CTHRC1是其关键调节因子 NA 定义心肌梗死后心脏成纤维细胞的异质性及其在心室重塑过程中的作用机制 心脏成纤维细胞及其在心肌梗死后的反应 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 包括小鼠、猪和心肌梗死及扩张型心肌病患者的心脏组织样本
773 2024-08-09
Microanatomy of the Human Atherosclerotic Plaque by Single-Cell Transcriptomics
2020-11-06, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学和染色质可及性分析,深入探讨了人类动脉粥样硬化斑块的细胞异质性和分子复杂性 首次全面评估了人类动脉粥样硬化斑块中细胞的分子复杂性,并揭示了细胞间的相互转换和激活状态 NA 深入理解人类动脉粥样硬化的病理生理机制 人类颈动脉动脉粥样硬化斑块中的细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 NA 转录组数据和表观基因组数据 涉及14种不同的细胞群体,包括内皮细胞、平滑肌细胞、肥大细胞、B细胞、骨髓细胞和T细胞等
774 2024-08-09
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
研究论文 本文建立了一种三维(3D)小鼠细支气管肺泡肺类器官(BALO)模型,该模型允许通过与肺驻留间充质细胞共培养来克隆扩展和自我组织流式细胞术分选的细支气管肺泡干细胞(BASCs)。 BALO模型能够重建远端肺的表皮-间充质-髓样单位,为研究肺发育、感染和体外再生过程开辟了新的途径。 NA 研究肺发育和疾病 小鼠细支气管肺泡干细胞(BASCs)和肺驻留间充质细胞 数字病理学 肺疾病 流式细胞术(FACS),单细胞RNA测序 3D类器官模型 细胞 NA
775 2024-08-09
Single-cell RNA-seq reveals different subsets of non-specific cytotoxic cells in teleost
2020-11, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,对尼罗罗非鱼头肾来源的白细胞进行分析,揭示了非特异性细胞毒性细胞(NCC)的不同亚群 首次揭示了NCC群体中的四个亚群,包括记忆样NCC、成熟NCC、未成熟NCC和前NCC NA 阐明硬骨鱼免疫系统中非特异性细胞毒性细胞(NCC)的亚群及其调控网络 尼罗罗非鱼头肾来源的白细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 约24,062个头肾来源的白细胞
776 2024-08-09
Agonist-induced functional analysis and cell sorting associated with single-cell transcriptomics characterizes cell subtypes in normal and pathological brain
2020-11, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 本文开发了激动剂诱导的功能分析和细胞分选(aiFACS)技术,结合单细胞转录组学,用于分析正常和病理脑组织中的细胞亚型 aiFACS技术允许实时记录和分选细胞,根据其对刺激的即时和个体反应,结合单细胞转录组学构建基于细胞特定药理反应的功能组织图谱 NA 深入了解细胞与其环境之间的动态相互作用 正常和病理脑组织中的细胞亚型 数字病理学 NA aiFACS NA 转录组 使用分离的小鼠脑组织,以及来自脆弱X综合征模型小鼠脑的中间神经元
777 2024-08-09
Onco-fetal Reprogramming of Endothelial Cells Drives Immunosuppressive Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2020-10-15, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,详细描述了从发育到疾病的人类肝脏细胞图谱,并揭示了肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象 首次报道了肝细胞癌中存在与胎儿肝脏相似的免疫抑制性胎儿癌生态系统,并提供了新的治疗干预靶点 NA 探索肝细胞癌中肿瘤微环境的胎儿样重编程现象及其机制 人类胎儿、肝细胞癌及小鼠肝脏的细胞 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 转录组 约212,000个细胞
778 2024-08-09
Genetic landscape and autoimmunity of monocytes in developing Vogt-Koyanagi-Harada disease
2020-10-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用先进的单细胞RNA测序技术,系统分析了11,259个人类循环单核细胞,并对其亚群进行了遗传学定义,揭示了Vogt-Koyanagi-Harada疾病相关单核细胞的精确分类、分子标记和信号通路 本研究首次揭示了两个先前未知的单核细胞亚群:HLA和巨核细胞样单核细胞亚群,并发现了与疾病相关的促炎单核细胞亚群,其基因表达特征指示炎症、抗病毒活性和病理性激活状态 NA 研究Vogt-Koyanagi-Harada疾病中单核细胞的遗传图谱和自身免疫机制 人类循环单核细胞及其在Vogt-Koyanagi-Harada疾病中的作用 免疫学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 11,259个人类循环单核细胞
779 2024-08-09
Nanoparticle enhanced combination therapy for stem-like progenitors defined by single-cell transcriptomics in chemotherapy-resistant osteosarcoma
2020-09-25, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,系统地绘制了化疗耐药性骨肉瘤肿瘤中细胞类型特异性基因表达图谱,并探讨了纳米颗粒增强的组合疗法对耐药性骨肉瘤的治疗效果 本研究首次揭示了化疗耐药性骨肉瘤中VEGFR2-JMJD3富集的静止干细胞样细胞亚群,并发现VEGFR2抑制剂和JMJD3抑制剂的协同作用能有效抑制骨肉瘤细胞增殖和肿瘤生长 尽管研究展示了纳米颗粒增强的组合疗法对耐药性骨肉瘤的有效性,但尚未探讨该疗法在临床应用中的长期效果和潜在副作用 探讨化疗耐药性骨肉瘤的细胞特征及其治疗策略 化疗耐药性骨肉瘤肿瘤中的细胞类型特异性基因表达 数字病理学 骨肉瘤 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
780 2024-08-09
Immunosuppressive effects of mesenchymal stem cells on lung B cell gene expression in LPS-induced acute lung injury
2020-09-25, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了间充质干细胞(MSC)在脂多糖(LPS)诱导的急性肺损伤(ALI)中对肺B细胞基因表达的影响 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了MSC治疗对肺B细胞转录变化的影响,揭示了MSC治疗ALI的新机制 研究仅限于小鼠模型,未来需在人体中验证这些发现 探讨MSC治疗在ALI中对肺B细胞的作用及其机制 肺B细胞在MSC治疗ALI中的作用 数字病理学 急性肺损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型中的肺B细胞
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