单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2024-08-09 |
MARS: discovering novel cell types across heterogeneous single-cell experiments
2020-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-00979-3
PMID:33077966
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MARS的元学习方法，用于在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释已知及新型细胞类型 | MARS通过跨多个数据集转移潜在细胞表示来克服细胞类型的异质性，并能发现以前未见过的细胞类型 | NA | 开发一种方法以在异质单细胞RNA测序数据中识别和注释新型细胞类型 | 异质单细胞RNA测序数据中的新型细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 数据集 | 大量小鼠细胞图谱 |
| 722 | 2024-08-09 |
A new lymphoid-primed progenitor marked by Dach1 downregulation identified with single cell multi-omics
2020-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0799-x
PMID:33077975
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了Dach1及其相关基因在淋巴样前体细胞中的表达模式，并利用Dach1-GFP报告鼠模型，鉴定了一类具有淋巴样潜能的新型前体细胞——淋巴样前体细胞（LPPs）。 | 本文首次鉴定了一种新型淋巴样前体细胞（LPPs），并定义了淋巴样发育在造血过程中的早期分支点。 | NA | 研究淋巴样前体细胞的鉴定及其在造血过程中的作用。 | 淋巴样前体细胞（LPPs）及其在造血过程中的作用。 | 血液学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 723 | 2024-08-09 |
Visualizing HIF-1α mRNA in a Subpopulation of Bone Marrow-Derived Cells to Predict Retinal Neovascularization
2020-11-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.0c00662
PMID:33080135
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研究论文 | 本文描述了一种新的混合纳米颗粒的合成，用于在小鼠新生血管化模型中选择性地可视化微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA | 开发了一种新的混合纳米颗粒，能够选择性地在特定组织微胶质细胞/巨噬细胞中可视化HIF-1α mRNA，用于预测新生血管化的发生和进展 | NA | 研究微胶质细胞/巨噬细胞在新生血管化中的调控作用，并开发一种新的方法来预测新生血管化的发生和进展 | 微胶质细胞/巨噬细胞中的HIF-1α mRNA表达 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 724 | 2024-08-09 |
Leveraging Uncertainty in Machine Learning Accelerates Biological Discovery and Design
2020-11-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.09.007
PMID:33065027
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研究论文 | 本文展示了利用基于高斯过程的不确定性预测在生物发现中的广泛应用 | 通过量化预测不确定性，算法能够更好地处理超出训练数据分布的新现象 | NA | 加速生物发现和设计 | 化合物库中的化合物及其对不同激酶和结核分枝杆菌细胞生长的抑制作用 | 机器学习 | NA | 高斯过程 | NA | 化合物 | 72个化合物用于训练模型，10,833个化合物用于预测 |
| 725 | 2024-08-09 |
Cell-type-specific 3D epigenomes in the developing human cortex
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2825-4
PMID:33057195
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研究论文 | 研究了人类皮质发育过程中特定细胞类型的三维表观基因组特征 | 开发了CRISPRview技术，整合免疫染色、CRISPR干扰、RNAscope和图像分析，验证了细胞类型特异性的顺式调控元件 | NA | 揭示发育中人类皮质中细胞类型特异性的基因表达模式，并增进对基因调控和谱系特化的理解 | 放射状胶质细胞、中间前体细胞、兴奋性神经元和抑制性神经元 | 表观遗传学 | NA | CRISPR干扰、RNAscope、图像分析 | NA | 基因组数据 | 来自中孕期人类皮质样本的多种细胞类型 |
| 726 | 2024-08-09 |
PREIMPLANTATION GENETIC TESTING: Single-cell technologies at the forefront of PGT and embryo research
2020-11, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0102
PMID:33065545
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研究论文 | 本文探讨了单细胞技术在胚胎植入前遗传测试（PGT）和胚胎研究中的应用 | 介绍了高吞吐量技术如DNA微阵列和大规模并行测序的发展，使得单细胞基因组研究从评估少数位点扩展到全面筛查所有24条染色体 | NA | 研究单细胞技术在胚胎发育和遗传疾病检测中的应用 | 胚胎的染色体镶嵌现象及其对胚胎发育的影响 | 遗传学 | 遗传性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 727 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: A single-cell transcriptome atlas of marsupial embryogenesis and X inactivation
2020-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2840-5
PMID:33067604
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 728 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics uncover distinct innate and adaptive cell subsets during tissue homeostasis and regeneration
2020-11, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MR0720-131R
PMID:33070367
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示组织稳态和再生过程中不同免疫细胞亚群中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）提供了一种前所未有的方法，无需依赖先验的细胞特异性标记即可揭示细胞多样性 | NA | 探讨scRNA-Seq如何促进免疫细胞的表征，包括巨噬细胞、固有淋巴细胞和T、B淋巴细胞，以及发现免疫细胞异质性、识别新亚群和追踪不同免疫细胞在组织稳态、修复和再生中的发育轨迹 | 免疫细胞在组织修复和再生中的作用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 729 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Engineered Cardiac Tissues From Patient-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Cardiomyocytes Reveals Abnormal Developmental Trajectory and Intrinsic Contractile Defects in Hypoplastic Right Heart Syndrome
2020-10-20, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.016528
PMID:33059525
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和表型分析，比较了来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型，揭示了肺动脉闭锁伴完整室间隔（PAIVS）中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 首次揭示了PAIVS中心肌细胞发育和功能的内在异常，排除了次要解剖缺陷的影响 | NA | 理解PAIVS中先天性心脏病的内在发育和功能异常 | 来自患者和健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 3名PAIVS患者和3名健康个体的诱导多能干细胞衍生的心肌细胞及其工程化组织模型 |
| 730 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Parkinson's Disease Human In Vitro Models Reveals Dopamine Neuron-Specific Stress Responses
2020-10-13, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108263
PMID:33053338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了帕金森病人类体外模型中多巴胺神经元对细胞毒性和遗传应激的基因表达动态 | 首次进行了最大规模的单细胞转录组学研究，揭示了多巴胺神经元亚型的转录特征和应激敏感性差异 | NA | 阐明帕金森病中多巴胺神经元在细胞毒性和遗传应激下的基因表达动态 | 人类诱导多能干细胞（iPSC）衍生的多巴胺神经元 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个神经元亚型 |
| 731 | 2024-08-09 |
Identification of oncolytic vaccinia restriction factors in canine high-grade mammary tumor cells using single-cell transcriptomics
2020-10, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1008660
PMID:33075093
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法，分析了犬高级别乳腺肿瘤细胞中溶瘤痘病毒的限制因子，特别是DDIT4基因的作用 | 首次揭示了DDIT4基因在溶瘤痘病毒治疗中的潜在抗性标记作用，并展示了单细胞转录组学在识别影响病毒复制的细胞因子方面的应用 | NA | 探讨溶瘤痘病毒在犬乳腺肿瘤细胞中的效力和潜在的抗性因子 | 犬高级别乳腺肿瘤细胞，特别是三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个不同的三阴性乳腺癌细胞样本，分别感染或未感染痘病毒 |
| 732 | 2024-08-09 |
Cell Development Deficiency and Gene Expression Dysregulation of Trisomy 21 Retina Revealed by Single-Nucleus RNA Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.564057
PMID:33072724
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术揭示了唐氏综合症（T21）视网膜的细胞发育缺陷和基因表达失调 | 首次提供了人类T21视网膜的单细胞转录组图谱，揭示了细胞组成的多样性和异质性以及异常的细胞构成 | NA | 评估染色体非整倍性对视网膜发育的影响 | 唐氏综合症（T21）视网膜的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个T21胎儿的视网膜样本 |
| 733 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Abedinium Reveals a New Early-Branching Dinoflagellate Lineage
2020-12-06, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaa196
PMID:33045041
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，研究了Abedinium属的两个细胞，揭示了其作为早期分支甲藻的一个新谱系 | 首次通过转录组分析将Abedinium定位为一个独立的谱系，并发现了其隐秘的质体和线粒体基因组的新特征 | 研究样本数量较少，且细胞采集自深海环境，可能影响分析结果的普遍性 | 解析甲藻的进化起源及其细胞特征的祖先状态和早期中间体 | Abedinium属的两个细胞及其转录组 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 两个细胞 |
| 734 | 2024-08-09 |
SIMPLEs: a single-cell RNA sequencing imputation strategy preserving gene modules and cell clusters variation
2020-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa077
PMID:33029585
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研究论文 | 本文提出了一种名为SIMPLEs的单细胞RNA测序填补策略，该策略能够保留基因模块和细胞集群的变异 | SIMPLEs方法通过迭代识别相关基因模块和细胞集群，并为每个基因模块和细胞类型定制填补缺失值，同时量化填补和细胞聚类的置信度 | NA | 旨在减少单细胞RNA测序数据中的技术变异，同时保留细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 统计模型 | 基因表达数据 | 多个真实数据集 |
| 735 | 2024-08-09 |
Downregulation of M Current Is Coupled to Membrane Excitability in Sympathetic Neurons Before the Onset of Hypertension
2020-12, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 研究了在高血压前期自发性高血压大鼠的星状神经节神经元中，M电流下调与膜兴奋性之间的关系，并探讨了其电生理表型和分子机制。 | 首次揭示了M电流抑制在星状神经节神经元异常兴奋性中的作用，并验证了关键离子通道转录本在人类星状神经节中的表达保守性。 | 文章未详细说明研究的局限性。 | 探讨星状神经节神经元在疾病早期阶段的异常活动及其生物物理特性。 | 自发性高血压大鼠的星状神经节神经元。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子生物学、穿孔膜片钳技术 | NA | 电生理数据 | 未具体说明样本数量 |
| 736 | 2024-08-09 |
Transcriptome dynamics of CD4+ T cells during malaria maps gradual transit from effector to memory
2020-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-020-0800-8
PMID:33046889
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和计算模型，研究了CD4+ T细胞在疟疾感染和治疗期间的记忆发展动态。 | 首次在全基因组尺度上探讨了CD4 T细胞记忆发展的动态过程，并揭示了抗疟药物对这一过程的调节作用。 | 研究主要集中在疟疾流行区域的CD4+ T细胞，可能不完全适用于其他疾病或非流行区域。 | 探讨CD4+ T细胞在疟疾感染和治疗期间的记忆发展动态及其与抗疟药物的关系。 | CD4+ T细胞在疟疾感染和治疗期间的记忆发展。 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 基因表达数据 | 多个CD4+ T细胞样本 |
| 737 | 2024-08-09 |
Microglia-organized scar-free spinal cord repair in neonatal mice
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2795-6
PMID:33029008
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研究论文 | 本文研究了新生小鼠脊髓损伤后的无瘢痕修复过程，并探讨了小胶质细胞在此过程中的关键作用 | 首次揭示了新生小鼠脊髓损伤后无瘢痕修复的细胞和分子机制，并提出了促进成年哺乳动物神经系统无瘢痕愈合的策略 | NA | 探讨新生小鼠脊髓损伤后的无瘢痕修复机制及小胶质细胞的作用 | 新生小鼠的脊髓损伤及小胶质细胞的功能 | NA | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 新生小鼠及成年小鼠的脊髓组织 |
| 738 | 2024-08-09 |
Jointly defining cell types from multiple single-cell datasets using LIGER
2020-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-0391-8
PMID:33046898
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研究论文 | 本文提供了一个使用LIGER方法联合定义多个单细胞数据集中的细胞类型的详细协议 | 开发了LIGER方法，通过整合非负矩阵分解技术，解决了从多种协议、生物背景和数据模式中整合单细胞数据集的关键挑战 | NA | 实现通过基因表达和表观基因组状态无偏见地定义细胞类型 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核ATAC测序（snATAC-seq）数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 取决于数据集大小 |
| 739 | 2024-08-09 |
Correction to: Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-Oct-13, Circulation
IF:35.5Q1
DOI:10.1161/CIR.0000000000000926
PMID:33044854
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 740 | 2024-08-09 |
Assessment of long non-coding RNA expression reveals novel mediators of the lung tumour immune response
2020-10-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-73787-6
PMID:33037279
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研究论文 | 本文通过分析长非编码RNA（lncRNA）在肺腺癌（LUAD）肿瘤中的表达，揭示了lncRNA在肿瘤免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 发现lncRNA表达模式与免疫相关蛋白质编码基因之间的调控关系，并提供了lncRNA在抗肿瘤免疫活性中的功能性证据 | NA | 探索肺肿瘤免疫微环境中lncRNA的作用，以指导免疫治疗方案并发现新的干预点 | 肺腺癌肿瘤中的lncRNA表达及其与免疫细胞的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括微切割和非微切割样本（BCCRC和TCGA）以及单细胞RNA测序数据 |