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当前共找到 1659 篇文献,本页显示第 721 - 740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
721 2024-08-09
Expression profiles revealed potential kidney injury caused by SARS-CoV-2: a systematic analysis of ACE2 and clinical lessons learned from this discovery
2020-11-21, Aging
研究论文 本研究通过系统分析ACE2表达和临床数据,揭示了COVID-19可能导致的肾脏损伤 首次通过单细胞RNA测序数据分析,展示了冠状病毒可能直接结合ACE2阳性细胞并损伤肾脏组织 研究样本仅限于特定时间段内武汉市某医院的119名COVID-19阳性患者,可能存在地域和时间限制 全面理解COVID-19对肾脏损伤的影响 COVID-19患者的肾脏功能及ACE2在肾脏组织中的分布 NA COVID-19 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 119名COVID-19阳性患者 NA NA NA NA
722 2024-08-09
Single-cell network biology for resolving cellular heterogeneity in human diseases
2020-11, Experimental & molecular medicine
综述 本文综述了单细胞网络生物学在解析人类疾病中细胞异质性的应用和进展 介绍了利用单细胞转录组数据进行网络生物学研究的新方法,以及其在精准医学中的潜在应用 NA 加速对细胞异质性的理解 细胞类型特异性的基因网络及其在疾病相关细胞类型和状态中的调控程序 生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
723 2024-08-09
Microglia Diversity in Health and Multiple Sclerosis
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了微胶质细胞在健康和多发性硬化症中的多样性及其对病理和修复的贡献 利用单细胞RNA测序和免疫细胞的质谱流式细胞术等技术,深入理解了微胶质细胞和巨噬细胞的表型变化 NA 探讨微胶质细胞在正常衰老和多发性硬化症中的异质性及其对免疫机制的影响 微胶质细胞和巨噬细胞在多发性硬化症中的功能多样性 NA 多发性硬化症 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 NA NA NA NA NA NA NA
724 2024-08-09
The Expression Pattern and Clinical Significance of the Immune Checkpoint Regulator VISTA in Human Breast Cancer
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究分析了免疫检查点调节因子VISTA在人乳腺癌中的表达模式及其临床意义 首次使用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌组织中VISTA的表达水平,并验证了其在乳腺癌免疫治疗中的潜在价值 NA 探讨VISTA在乳腺癌中的免疫调节作用及其对乳腺癌免疫治疗的潜在影响 人乳腺癌组织及其配对的正常细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 14897个乳腺癌细胞和7320个正常细胞,以及324个人乳腺癌样本 NA NA NA NA
725 2024-08-09
Vascular Heterogeneity With a Special Focus on the Hepatic Microenvironment
2020, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
综述 本文综述了利用单细胞测序技术对血管异质性及其在不同组织中的复杂组成的深入分析,特别关注了肝脏微环境中的血管结构和功能 NA NA 旨在总结不同血管床的变异性、内皮细胞的多样性以及支持细胞如何使血管实现其多种功能 血管组织的异质性,特别是内皮细胞和基质微环境的多样性及其在生理和病理条件下的相互作用 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 细胞 NA NA NA NA NA
726 2024-08-09
In silico immune infiltration profiling combined with functional enrichment analysis reveals a potential role for naïve B cells as a trigger for severe immune responses in the lungs of COVID-19 patients
2020, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用CIBERSORT-X方法评估COVID-19患者肺组织中的转录估计免疫浸润景观,并发现幼稚B细胞高度浸润,可能是导致过度活跃的体液免疫反应的主要原因。 首次揭示了幼稚B细胞在COVID-19患者肺组织中的高度浸润,并提出抑制幼稚B细胞可能是一种缓解COVID-19严重症状的新策略。 研究主要基于转录组数据和单细胞RNA测序数据,需要进一步的实验验证。 探讨SARS-CoV-2感染引起的免疫反应机制,特别是免疫细胞浸润在肺组织中的变化。 COVID-19患者的肺组织和免疫细胞亚群。 数字病理学 肺部疾病 CIBERSORT-X NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据 涉及COVID-19患者和特发性肺纤维化(IPF)患者的肺组织样本 NA NA NA NA
727 2024-08-09
High-resolution mouse subventricular zone stem-cell niche transcriptome reveals features of lineage, anatomy, and aging
2020-12-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,对从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的转录组分析 首次对SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的单细胞RNA测序分析,揭示了不同年龄段干细胞的异质性和转录特征 NA 研究SVZ区域神经干细胞的异质性及其在不同年龄段的转录特征 小鼠SVZ区域的神经干细胞及其在不同年龄段的转录特征 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞样本 NA NA NA NA
728 2024-08-09
Single Cell RNA Sequencing of Human Milk-Derived Cells Reveals Sub-Populations of Mammary Epithelial Cells with Molecular Signatures of Progenitor and Mature States: a Novel, Non-invasive Framework for Investigating Human Lactation Physiology
2020-12, Journal of mammary gland biology and neoplasia IF:3.0Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人乳来源的乳腺上皮细胞,揭示了其亚群及其转录特征,为研究人类哺乳生理提供了一种新颖的非侵入性框架 首次使用单细胞RNA测序技术分析人乳来源的乳腺上皮细胞,并提供了一个计算框架供未来研究使用 目前使用乳汁来源细胞研究人类乳腺生理的临床潜力和局限性 研究人乳中的细胞作为非侵入性材料,用于探索哺乳生理 人乳来源的乳腺上皮细胞及其转录特征 数字病理学 妊娠糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 3740个细胞来自两名产后两周的母亲的乳汁样本 NA NA NA NA
729 2024-08-09
Author Correction: Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas
2020-Dec, Nature biotechnology IF:33.1Q1
correction NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
730 2024-08-09
Deconvolution of cellular subsets in human tissue based on targeted DNA methylation analysis at individual CpG sites
2020-11-24, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过靶向DNA甲基化分析在单个CpG位点上对人类组织中的细胞亚群进行去卷积 本研究首次探讨了使用单个细胞类型特异性CpG位点进行靶向分析的可行性,并开发了基于这些位点的去卷积方法 NA 验证通过单个CpG位点的DNA甲基化分析来反映细胞混合物和不同组织中细胞组成的可行性 人类非恶性细胞类型及其在组织中的相对含量 数字病理学 NA DNA甲基化分析,pyrosequencing NA DNA甲基化数据 579个Illumina 450k BeadChip DNA甲基化数据集,涵盖14种不同的非恶性人类细胞类型 NA NA NA NA
731 2024-08-09
Integrating transcriptomics and bulk time course data into a mathematical framework to describe and predict therapeutic resistance in cancer
2020-11-20, Physical biology IF:2.0Q3
研究论文 本文提出了一种将机器学习模型的静态输出与治疗反应的动态模型相结合的框架,用于整合单细胞转录组数据和纵向的细胞群体数据,以描述和预测癌症治疗抵抗 首次明确地将单细胞克隆解析的转录组数据与批量时间序列数据结合,共同校准药物抵抗动力学的数学模型 NA 开发一种方法,将分散的数据集整合到全面的框架中,以生成最佳的临床决策 乳腺癌细胞 生物医学 乳腺癌 单细胞RNA测序 机器学习模型 转录组数据 NA NA NA NA NA
732 2024-08-09
Functional compensation precedes recovery of tissue mass following acute liver injury
2020-11-19, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了急性肝损伤后功能补偿在组织恢复前的作用机制 首次识别了急性肝损伤后功能补偿的新阶段,并揭示了依赖于巨噬细胞来源的WNT/β-catenin信号的适应性重编程机制 NA 探讨急性肝损伤后肝脏如何在组织恢复前维持重要生理功能 肝脏在急性损伤后的功能补偿机制 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 两个独立的小鼠肝损伤模型 NA NA NA NA
733 2024-08-09
Opportunities for Single-Cell Sequencing Technologies and Data Science
2020-Nov-19, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本特刊旨在强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 NA NA 强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 单细胞测序技术和数据分析 生物信息学 NA 单细胞测序 NA 单细胞数据 NA NA NA NA NA
734 2024-08-09
Bivalent genes that undergo transcriptional switching identify networks of key regulators of embryonic stem cell differentiation
2020-Nov-18, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文开发了一种方法,通过检测单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据中的'双峰'基因表达模式,捕捉经历转录开关的基因,并结合染色质状态分析,识别出与细胞状态相关的双峰、双价基因模式。 本文提出了一种新的方法,通过分析接近活动边界(ON/OFF)的基因,从scRNA-seq数据中推断转录开关网络,这种方法补充了传统的scRNA-seq分析。 NA 研究胚胎干细胞分化过程中双价基因的转录开关及其调控网络。 胚胎干细胞中的双价基因及其在分化过程中的转录开关。 分子生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 隐马尔可夫模型 基因表达数据 NA NA NA NA NA
735 2024-08-09
I-Impute: a self-consistent method to impute single cell RNA sequencing data
2020-Nov-18, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文提出了一种名为I-Impute的自一致性方法,用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 I-Impute方法通过优化连续相似性和缺失概率,在迭代改进中达到自一致性,从而提高了填补效果 NA 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据分析中缺失值填补的准确性 单细胞RNA测序数据中的缺失值 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括三个湿实验数据集:小鼠膀胱细胞、胚胎干细胞和主动脉白细胞 NA NA NA NA
736 2024-08-09
Alteration of tumor-associated macrophage subtypes mediated by KRT6A in pancreatic ductal adenocarcinoma
2020-11-18, Aging
研究论文 本研究通过分析基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据集,探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)亚型的变化及其潜在调控因子KRT6A。 发现了KRT6A作为差异表达基因,可能通过调控COL5A2、COL1A2、MIR3606、SPARC和COL6A3等基因影响TAMs亚型的组成,为PDAC的免疫治疗提供了新的靶点。 NA 阐明胰腺导管腺癌中肿瘤免疫微环境的组成和调控因子,寻找新的免疫治疗靶点。 胰腺导管腺癌(PDAC)及其邻近正常组织(ANT)中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)亚型。 数字病理学 胰腺癌 基因表达分析 NA 基因表达数据 使用了GEO和TCGA数据库中的数据,具体样本数量未在摘要中明确。 NA NA NA NA
737 2024-08-09
SCRINSHOT enables spatial mapping of cell states in tissue sections with single-cell resolution
2020-11, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 SCRINSHOT技术通过单细胞分辨率在组织切片中实现细胞状态的空间映射 开发了SCRINSHOT技术,一种敏感的多重RNA映射方法,通过直接杂交padlock探针到mRNA上,随后通过SplintR连接酶进行环化并进行滚环扩增,实现对组织切片中单细胞的数千个细胞的序列检测 NA 研究细胞身份和位置的变化如何影响组织发育和疾病进展 小鼠和人类器官中的细胞类型及其空间分布 数字病理学 NA scRNA-Seq, 滚环扩增(RCA) NA mRNA 小鼠和人类器官中的数千个细胞 NA NA NA NA
738 2024-08-09
Single-Cell Profiling Reveals Divergent, Globally Patterned Immune Responses in Murine Skin Inflammation
2020-Oct-23, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了在小鼠皮肤炎症模型中免疫细胞的异质性反应 首次揭示了不同炎症诱导剂在小鼠皮肤炎症中引起的全局分子模式差异 NA 探讨不同炎症诱导剂如何影响小鼠皮肤免疫细胞的转录反应 小鼠皮肤免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 13种CD45亚群的免疫细胞 NA NA NA NA
739 2024-08-09
A Random Matrix Theory Approach to Denoise Single-Cell Data
2020-Jun-12, Patterns (New York, N.Y.)
研究论文 本文提出了一种基于随机矩阵理论的新方法,用于分析和去噪单细胞测序数据 利用随机矩阵理论的普遍分布来区分噪声和信号,并解释了稀疏性如何导致虚假的特征向量定位 仅在标记的细胞群体的多种示例中验证了方法的有效性 开发一种新方法来去噪单细胞数据,以更好地识别生物信号 单细胞测序数据 生物信息学 NA 随机矩阵理论 NA 测序数据 涉及的单细胞数据中,约95%的信息与随机矩阵理论的预测相符,3%为稀疏性引起的虚假信号,2%为真实生物信号 NA NA NA NA
740 2024-08-09
Autophagy Regulatory Genes MET and RIPK2 Play a Prognostic Role in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: A Bioinformatic Analysis Based on GEO and TCGA
2020, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过分析GEO和TCGA数据库中的基因表达数据,探讨了自噬调控基因MET和RIPK2在胰腺导管腺癌中的预后作用 本研究首次构建了基于MET和RIPK2的预后风险特征,并通过基因集富集分析预测了这两个基因在胰腺导管腺癌中促进自噬的作用 研究主要基于公共数据库数据,未进行体内外实验验证 预测胰腺导管腺癌中的预后自噬调控基因及其在自噬调控中的作用 胰腺导管腺癌中的自噬调控基因MET和RIPK2 数字病理学 胰腺癌 RNA-seq NA 基因表达数据 使用了来自不同平台的多个数据集,包括GSE62165、GSE85916、TCGA和GSE111672 NA NA NA NA
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