单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-09 |
Cellular taxonomy and spatial organization of the murine ventral posterior hypothalamus
2020-10-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.58901
PMID:33119507
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对小鼠腹后下丘脑的细胞类型和空间组织进行了系统分类 | 首次揭示了小鼠腹后下丘脑中20种神经元和18种非神经元细胞群体，并验证了这些细胞群体的差异表达基因 | NA | 旨在阐明腹后下丘脑中不同神经回路在生理和行为中的作用 | 小鼠腹后下丘脑的细胞类型和空间组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过16,000个单细胞 |
| 682 | 2024-08-09 |
Functional in vivo and in vitro effects of 20q11.21 genetic aberrations on hPSC differentiation
2020-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75657-7
PMID:33122739
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研究论文 | 本研究探讨了20q11.21拷贝数变异（CNV）在人多能干细胞（hPSCs）早期分化过程中的体内外功能效应 | 本研究首次全面分析了20q11.21 CNV在hPSCs分化中的全转录组效应，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了转录异质性 | 研究主要集中在20q11.21 CNV的影响，未涉及其他基因区域的变异对hPSCs分化的影响 | 旨在检查20q11.21 CNV在hPSCs早期分化过程中的功能效应 | 人多能干细胞（hPSCs）及其分化过程中的20q11.21拷贝数变异（CNV） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 22个畸胎瘤样本，两个不同同源系hPSCs的胚体 |
| 683 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Emergence of Liver Parenchymal and Non-parenchymal Cell Lineages
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.012
PMID:33125890
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研究论文 | 本研究通过分析从胚胎第7.5天到第10.5天的45,334个单细胞转录组，揭示了肝脏实质和非实质细胞谱系在器官发生早期的出现 | 本研究首次详细描述了血管和窦状内皮的差异，包括窦状内皮在第8.75天的独特转录特征，并揭示了早期肝星状细胞和两种不同间皮细胞类型的特征 | NA | 研究肝脏在器官发生早期的细胞复杂性和谱系建立 | 肝脏的实质和非实质细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 45,334个单细胞 |
| 684 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Highlights a Role for Neutrophils and Inflammatory Macrophages in the Pathogenesis of Severe COVID-19
2020-10-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9112374
PMID:33138195
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研究论文 | 本研究利用迭代聚类和引导基因选择2（ICGS2）以及统一流形逼近和投影（UMAP）降维计算算法，分析了来自两名健康受试者和三名轻度及五名重度COVID-19患者的68,873个单细胞的公开数据集，揭示了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19发病机制中的作用 | 本研究首次详细描述了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19中的免疫细胞组成和基因特征，为诊断和治疗干预提供了新的可能性 | 研究主要基于公开数据集，样本量和数据来源可能限制了结果的普遍性 | 探讨免疫细胞亚群在COVID-19疾病严重程度中的作用 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液（BAL）中的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | ICGS2, UMAP | 单细胞转录组数据 | 68,873个单细胞，来自两名健康受试者、三名轻度COVID-19患者和五名重度COVID-19患者 |
| 685 | 2024-08-09 |
Nuclear gene proximity and protein interactions shape transcript covariations in mammalian single cells
2020-10-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19011-5
PMID:33116115
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研究论文 | 本文研究了哺乳动物单细胞中基因共表达模式的形成机制 | 首次提供了miRNAs自然诱导转录组广泛共变的证据，并比较了核组织、转录和转录后调控在定义共变中的相对重要性 | NA | 探讨基因共变在哺乳动物单细胞中的形成机制及其生物学意义 | 小鼠胚胎干细胞中的基因共变网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千对内在共变基因 |
| 686 | 2024-08-09 |
Cell Dissociation from Butterfly Pupal Wing Tissues for Single-Cell RNA Sequencing
2020-Oct-28, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps3040072
PMID:33126499
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研究论文 | 本文提供了一种从蝴蝶蛹翅组织中分离细胞以进行单细胞RNA测序的详细方案 | 利用单细胞测序技术研究蝴蝶翅鳞片细胞的基因表达模式，以识别产生不同颜色和鳞片结构的细胞类型 | 讨论了当前技术在研究单细胞鳞片发育方面的一些挑战 | 理解蝴蝶翅鳞片的基因表达模式和识别不同鳞片细胞类型 | 蝴蝶蛹翅组织中的细胞 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 687 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell Atlases Reveal an Oral SARS-CoV-2 Infection and Transmission Axis
2020-Oct-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.10.26.20219089
PMID:33140061
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研究论文 | 本文通过整合人类小唾液腺和牙龈的单细胞RNA测序数据集，揭示了口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 首次详细描述了口腔黏膜和唾液腺在SARS-CoV-2感染和传播中的具体机制 | NA | 探讨口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 人类小唾液腺和牙龈的细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括11种上皮细胞、7种间质细胞和15种免疫细胞集群 |
| 688 | 2024-08-09 |
Enzymatic Dissociation Induces Transcriptional and Proteotype Bias in Brain Cell Populations
2020-Oct-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217944
PMID:33114694
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研究论文 | 本文系统研究了不同细胞分离协议对小鼠脑组织转录组和蛋白质组的影响 | 发现标准酶消化法在37°C下会引起神经元和胶质细胞转录组和蛋白质组的深刻且一致的改变 | 强调了使用基于酶消化分离方法进行脑细胞分析时引入技术偏差和生物假象的风险 | 探讨不同细胞分离技术对脑细胞转录组和蛋白质组的影响 | 小鼠脑组织的转录组和蛋白质组 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 转录组、蛋白质组 | NA |
| 689 | 2024-08-09 |
Highly Multiplexed Single-Cell In Situ RNA and DNA Analysis by Consecutive Hybridization
2020-Oct-23, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules25214900
PMID:33113917
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研究论文 | 本文报道了一种新的空间转录组学和基因组学分析方法，通过连续荧光原位杂交（C-FISH）技术，能够在单细胞水平上全面分析核酸分子 | 该方法通过连续的杂交、成像和光漂白循环，利用独特的颜色序列确定不同核酸的身份，实现了高度多重化的单细胞内核酸分析 | NA | 旨在提高对生物学和医学中单细胞内核酸分子的全面理解 | 单细胞内的转录本和基因组位点 | 基因组学 | NA | 连续荧光原位杂交（C-FISH） | NA | 荧光图像 | 使用2种荧光素和16个C-FISH循环或3种荧光素和9个C-FISH循环进行单细胞分析 |
| 690 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune modulation and metabolic switch in tumor-draining lymph nodes
2020-10-19, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1830513
PMID:33117603
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了肿瘤引流淋巴结中的免疫调节和代谢转换 | 首次在单细胞水平揭示了乳腺癌进展过程中肿瘤引流淋巴结的重新编程，并指出了免疫调节和代谢转换的关键变化 | 研究仅限于FVB/NJ和MMTV-PyMT小鼠模型，可能需要进一步在人类样本中验证 | 探讨乳腺癌细胞如何在肿瘤引流淋巴结中建立前转移生态位 | 从FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中分离的异质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中的多种细胞类型 |
| 691 | 2024-08-09 |
Learning for single-cell assignment
2020-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd0855
PMID:33127686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLearn的学习框架，用于自动推断定量测量和相似度阈值，以实现不同单细胞分配任务的泛化性能 | scLearn框架能够自动推断定量测量和相似度阈值，适用于不同的单细胞分配任务，并能识别参考数据集中不存在的新的细胞类型 | NA | 开发一种有效的单细胞分配方法，无需先验标记基因注释 | 单细胞测序数据中的细胞类型分配 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 学习框架 | 单细胞测序数据 | 使用了公开可用的综合基准数据集 |
| 692 | 2024-08-09 |
The noncoding and coding transcriptional landscape of the peripheral immune response in patients with COVID-19
2020-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.200
PMID:33135345
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研究论文 | 研究分析了COVID-19患者外周免疫反应中的非编码和编码转录组景观 | 定义了四种不同表达趋势的microRNAs作为COVID-19进展的生物标志物，并识别了miR-146a-5p等可能参与疾病发病机制的microRNAs作为严重COVID-19的生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解COVID-19发病机制并提供新的见解 | COVID-19患者的非编码和编码转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | 多转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 来自中度和重度COVID-19患者的去红细胞全血样本 |
| 693 | 2024-08-09 |
Hypoxia Promotes Syndecan-3 Expression in the Tumor Microenvironment
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.586977
PMID:33117401
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研究论文 | 本文研究了缺氧条件下肿瘤微环境中Syndecan-3表达的上调及其机制 | 首次揭示了Syndecan-3在癌症中的表达模式及其与缺氧环境的关联 | NA | 探讨Syndecan-3在肿瘤微环境中的表达及其与缺氧的关系 | Syndecan-3在不同癌症类型中的表达及缺氧对其表达的影响 | 数字病理学 | 癌症 | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种癌症类型的肿瘤细胞系及黑色素瘤患者样本 |
| 694 | 2024-08-09 |
Microglia in the Brain Tumor Microenvironment
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-49270-0_11
PMID:33119883
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研究论文 | 本文综述了小胶质细胞在脑肿瘤微环境中的作用及其生物学特性 | 利用先进的成像技术和单细胞RNA测序技术，提供了对小胶质细胞生物学复杂性的新见解 | NA | 总结小胶质细胞的生成方式及其在脑发育、损伤修复和稳态维持中的功能，并探讨其在胶质瘤微环境中的作用及治疗意义 | 小胶质细胞及其在脑肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 695 | 2024-08-09 |
Reconstructing the Developmental Trajectories of Multiple Subtypes in Pulmonary Parenchymal Epithelial Cells by Single-Cell RNA-seq
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.573429
PMID:33133163
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术重建了肺实质上皮细胞中多种亚型的发展轨迹 | 首次展示了肺上皮细胞亚型的发展轨迹，并鉴定了决定细胞命运的六个关键基因 | NA | 探索正常人肺细胞的细胞解剖结构，以及肺疾病细胞起源和细胞发展轨迹 | 人正常肺组织中的上皮细胞亚型 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20154个高质量细胞 |
| 696 | 2024-08-09 |
Tumor Fibroblast-Derived FGF2 Regulates Expression of SPRY1 in Esophageal Tumor-Infiltrating T Cells and Plays a Role in T-cell Exhaustion
2020-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1542
PMID:33093168
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现食管癌中的T细胞比以往认识的更为异质性，并揭示了肿瘤相关成纤维细胞衍生的FGF2通过调节SPRY1表达在CD8 T细胞功能障碍中的作用 | 首次报道了FGF2在食管癌中通过调节SPRY1表达影响CD8 T细胞功能障碍的分子机制 | NA | 探讨食管癌中T细胞功能障碍的分子机制 | 食管癌中的T细胞及肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 697 | 2024-08-09 |
Cell-Type Transcriptome Atlas of Human Aortic Valves Reveal Cell Heterogeneity and Endothelial to Mesenchymal Transition Involved in Calcific Aortic Valve Disease
2020-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314789
PMID:33086873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类主动脉瓣的细胞类型转录组图谱，揭示了钙化性主动脉瓣疾病中的细胞异质性和内皮细胞向间充质细胞的转变 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了健康和钙化性主动脉瓣疾病中的细胞亚型，并发现了在疾病中特异表达的新型瓣膜衍生基质细胞 | 研究仅限于6个不同的人类主动脉瓣样本，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 旨在构建健康和钙化性主动脉瓣疾病的人类主动脉瓣细胞图谱，以深入了解钙化性主动脉瓣疾病的细胞起源和复杂的细胞病理分化过程 | 人类主动脉瓣细胞在健康和钙化性主动脉瓣疾病中的异质性和分化过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 34,632个细胞来自6个不同的人类主动脉瓣叶 |
| 698 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis identified lung progenitor cells in COVID-19 patients
2020-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12931
PMID:33094537
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液，揭示了肺祖细胞在严重SARS-CoV-2感染后肺修复中的作用 | 首次发现TM4SF1+和KRT5+肺祖细胞在严重COVID-19患者中的显著扩张，并证实这些祖细胞在肺泡细胞再生和上皮屏障重建中的关键作用 | NA | 旨在揭示严重SARS-CoV-2感染后肺修复的可能机制 | COVID-19患者的肺祖细胞及其在肺修复中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 699 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals that CD9 Is a Negative Marker of Glucose-Responsive Pancreatic β-like Cells Derived from Human Pluripotent Stem Cells
2020-11-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.09.009
PMID:33096048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现CD9是人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | 首次确定CD9作为人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | NA | 寻找并验证人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的特定细胞表面标记物 | 人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 700 | 2024-08-09 |
RNA editing in cancer impacts mRNA abundance in immune response pathways
2020-10-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02171-4
PMID:33106178
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研究论文 | 本文通过综合分析上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征，揭示了RNA编辑在癌症中的广泛差异及其对mRNA丰度的调控机制 | 发现了上皮和间质肿瘤间不同的编辑模式，并揭示了RNA编辑通过调控mRNA丰度影响免疫反应途径的新机制 | 主要集中在非编码区域的肿瘤相关位点的功能相关性仍未知 | 研究RNA编辑在癌症中的作用及其对免疫反应途径的影响 | 上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征 | 数字病理学 | NA | TCGA数据分析, 单细胞RNA测序, ADAR扰动实验 | NA | RNA序列 | 涉及七种癌症类型的数据 |