单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-09 |
Enzymatic Dissociation Induces Transcriptional and Proteotype Bias in Brain Cell Populations
2020-Oct-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217944
PMID:33114694
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研究论文 | 本文系统研究了不同细胞分离协议对小鼠脑组织转录组和蛋白质组的影响 | 发现标准酶消化法在37°C下会引起神经元和胶质细胞转录组和蛋白质组的深刻且一致的改变 | 强调了使用基于酶消化分离方法进行脑细胞分析时引入技术偏差和生物假象的风险 | 探讨不同细胞分离技术对脑细胞转录组和蛋白质组的影响 | 小鼠脑组织的转录组和蛋白质组 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 转录组、蛋白质组 | NA |
| 682 | 2024-08-09 |
Highly Multiplexed Single-Cell In Situ RNA and DNA Analysis by Consecutive Hybridization
2020-Oct-23, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules25214900
PMID:33113917
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研究论文 | 本文报道了一种新的空间转录组学和基因组学分析方法，通过连续荧光原位杂交（C-FISH）技术，能够在单细胞水平上全面分析核酸分子 | 该方法通过连续的杂交、成像和光漂白循环，利用独特的颜色序列确定不同核酸的身份，实现了高度多重化的单细胞内核酸分析 | NA | 旨在提高对生物学和医学中单细胞内核酸分子的全面理解 | 单细胞内的转录本和基因组位点 | 基因组学 | NA | 连续荧光原位杂交（C-FISH） | NA | 荧光图像 | 使用2种荧光素和16个C-FISH循环或3种荧光素和9个C-FISH循环进行单细胞分析 |
| 683 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune modulation and metabolic switch in tumor-draining lymph nodes
2020-10-19, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1830513
PMID:33117603
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了肿瘤引流淋巴结中的免疫调节和代谢转换 | 首次在单细胞水平揭示了乳腺癌进展过程中肿瘤引流淋巴结的重新编程，并指出了免疫调节和代谢转换的关键变化 | 研究仅限于FVB/NJ和MMTV-PyMT小鼠模型，可能需要进一步在人类样本中验证 | 探讨乳腺癌细胞如何在肿瘤引流淋巴结中建立前转移生态位 | 从FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中分离的异质细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及FVB/NJ小鼠的正常淋巴结和MMTV-PyMT小鼠的肿瘤引流淋巴结中的多种细胞类型 |
| 684 | 2024-08-09 |
Learning for single-cell assignment
2020-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abd0855
PMID:33127686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLearn的学习框架，用于自动推断定量测量和相似度阈值，以实现不同单细胞分配任务的泛化性能 | scLearn框架能够自动推断定量测量和相似度阈值，适用于不同的单细胞分配任务，并能识别参考数据集中不存在的新的细胞类型 | NA | 开发一种有效的单细胞分配方法，无需先验标记基因注释 | 单细胞测序数据中的细胞类型分配 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 学习框架 | 单细胞测序数据 | 使用了公开可用的综合基准数据集 |
| 685 | 2024-08-09 |
The noncoding and coding transcriptional landscape of the peripheral immune response in patients with COVID-19
2020-Oct, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.200
PMID:33135345
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研究论文 | 研究分析了COVID-19患者外周免疫反应中的非编码和编码转录组景观 | 定义了四种不同表达趋势的microRNAs作为COVID-19进展的生物标志物，并识别了miR-146a-5p等可能参与疾病发病机制的microRNAs作为严重COVID-19的生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解COVID-19发病机制并提供新的见解 | COVID-19患者的非编码和编码转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | 多转录组测序 | NA | RNA序列数据 | 来自中度和重度COVID-19患者的去红细胞全血样本 |
| 686 | 2024-08-09 |
Hypoxia Promotes Syndecan-3 Expression in the Tumor Microenvironment
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.586977
PMID:33117401
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研究论文 | 本文研究了缺氧条件下肿瘤微环境中Syndecan-3表达的上调及其机制 | 首次揭示了Syndecan-3在癌症中的表达模式及其与缺氧环境的关联 | NA | 探讨Syndecan-3在肿瘤微环境中的表达及其与缺氧的关系 | Syndecan-3在不同癌症类型中的表达及缺氧对其表达的影响 | 数字病理学 | 癌症 | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种癌症类型的肿瘤细胞系及黑色素瘤患者样本 |
| 687 | 2024-08-09 |
Microglia in the Brain Tumor Microenvironment
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-49270-0_11
PMID:33119883
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研究论文 | 本文综述了小胶质细胞在脑肿瘤微环境中的作用及其生物学特性 | 利用先进的成像技术和单细胞RNA测序技术，提供了对小胶质细胞生物学复杂性的新见解 | NA | 总结小胶质细胞的生成方式及其在脑发育、损伤修复和稳态维持中的功能，并探讨其在胶质瘤微环境中的作用及治疗意义 | 小胶质细胞及其在脑肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 688 | 2024-08-09 |
Reconstructing the Developmental Trajectories of Multiple Subtypes in Pulmonary Parenchymal Epithelial Cells by Single-Cell RNA-seq
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.573429
PMID:33133163
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术重建了肺实质上皮细胞中多种亚型的发展轨迹 | 首次展示了肺上皮细胞亚型的发展轨迹，并鉴定了决定细胞命运的六个关键基因 | NA | 探索正常人肺细胞的细胞解剖结构，以及肺疾病细胞起源和细胞发展轨迹 | 人正常肺组织中的上皮细胞亚型 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 20154个高质量细胞 |
| 689 | 2024-08-09 |
Tumor Fibroblast-Derived FGF2 Regulates Expression of SPRY1 in Esophageal Tumor-Infiltrating T Cells and Plays a Role in T-cell Exhaustion
2020-12-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-1542
PMID:33093168
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现食管癌中的T细胞比以往认识的更为异质性，并揭示了肿瘤相关成纤维细胞衍生的FGF2通过调节SPRY1表达在CD8 T细胞功能障碍中的作用 | 首次报道了FGF2在食管癌中通过调节SPRY1表达影响CD8 T细胞功能障碍的分子机制 | NA | 探讨食管癌中T细胞功能障碍的分子机制 | 食管癌中的T细胞及肿瘤相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 690 | 2024-08-09 |
Cell-Type Transcriptome Atlas of Human Aortic Valves Reveal Cell Heterogeneity and Endothelial to Mesenchymal Transition Involved in Calcific Aortic Valve Disease
2020-12, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.120.314789
PMID:33086873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类主动脉瓣的细胞类型转录组图谱，揭示了钙化性主动脉瓣疾病中的细胞异质性和内皮细胞向间充质细胞的转变 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了健康和钙化性主动脉瓣疾病中的细胞亚型，并发现了在疾病中特异表达的新型瓣膜衍生基质细胞 | 研究仅限于6个不同的人类主动脉瓣样本，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 旨在构建健康和钙化性主动脉瓣疾病的人类主动脉瓣细胞图谱，以深入了解钙化性主动脉瓣疾病的细胞起源和复杂的细胞病理分化过程 | 人类主动脉瓣细胞在健康和钙化性主动脉瓣疾病中的异质性和分化过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 34,632个细胞来自6个不同的人类主动脉瓣叶 |
| 691 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis identified lung progenitor cells in COVID-19 patients
2020-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.12931
PMID:33094537
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液，揭示了肺祖细胞在严重SARS-CoV-2感染后肺修复中的作用 | 首次发现TM4SF1+和KRT5+肺祖细胞在严重COVID-19患者中的显著扩张，并证实这些祖细胞在肺泡细胞再生和上皮屏障重建中的关键作用 | NA | 旨在揭示严重SARS-CoV-2感染后肺修复的可能机制 | COVID-19患者的肺祖细胞及其在肺修复中的作用 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 692 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals that CD9 Is a Negative Marker of Glucose-Responsive Pancreatic β-like Cells Derived from Human Pluripotent Stem Cells
2020-11-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.09.009
PMID:33096048
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，发现CD9是人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | 首次确定CD9作为人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的负标记物 | NA | 寻找并验证人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞的特定细胞表面标记物 | 人类多能干细胞衍生的葡萄糖反应性胰腺β样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 693 | 2024-08-09 |
RNA editing in cancer impacts mRNA abundance in immune response pathways
2020-10-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02171-4
PMID:33106178
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研究论文 | 本文通过综合分析上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征，揭示了RNA编辑在癌症中的广泛差异及其对mRNA丰度的调控机制 | 发现了上皮和间质肿瘤间不同的编辑模式，并揭示了RNA编辑通过调控mRNA丰度影响免疫反应途径的新机制 | 主要集中在非编码区域的肿瘤相关位点的功能相关性仍未知 | 研究RNA编辑在癌症中的作用及其对免疫反应途径的影响 | 上皮和间质肿瘤的RNA编辑特征 | 数字病理学 | NA | TCGA数据分析, 单细胞RNA测序, ADAR扰动实验 | NA | RNA序列 | 涉及七种癌症类型的数据 |
| 694 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics Reveals Genes Associated with Dysregulated Mitochondrial Functions and Stress Signaling in Alzheimer Disease
2020-Oct-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101556
PMID:33083725
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了与阿尔茨海默病中失调的线粒体功能和应激信号相关的基因 | 首次在阿尔茨海默病的小鼠模型中，通过空间转录组学技术识别出在海马体和嗅球中空间下调的基因Bok，该基因与线粒体生理和细胞死亡相关 | NA | 旨在同时发现海马体和嗅球结构层中可能与阿尔茨海默病早期海马体突触缺陷和嗅觉功能障碍相关的新的和已知的分子靶点 | 阿尔茨海默病小鼠模型的海马体和嗅球 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类阿尔茨海默病脑组织 |
| 695 | 2024-08-09 |
Neural crest lineage analysis: from past to future trajectory
2020-10-23, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193193
PMID:33097550
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综述 | 本文从历史角度回顾了神经嵴细胞谱系追踪的主要发现，并讨论了先进技术如何改进谱系追踪研究以及如何应用于多能性问题 | 结合新兴的分子和成像工具，如单细胞转录组学、单分子荧光杂交和高分辨率成像，扩展了神经嵴细胞谱系研究的范畴，超越了发育阶段，涵盖了再生和癌症起始 | NA | 回顾神经嵴细胞谱系追踪的历史发展，并探讨新技术如何推动该领域的研究 | 神经嵴细胞的谱系追踪及其在发育、再生和癌症起始中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组学、单分子荧光杂交、高分辨率成像 | NA | NA | NA |
| 696 | 2024-08-09 |
A distinct GM-CSF+ T helper cell subset requires T-bet to adopt a TH1 phenotype and promote neuroinflammation
2020-Oct-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba9953
PMID:33097590
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和高维单细胞质谱流式技术，鉴定了健康个体血液中包括GM-CSF产生细胞在内的八种抗原经验性CD45RACD4 T细胞群体，并研究了这些细胞在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中的作用。 | 首次详细研究了GM-CSF产生T细胞的身份，并发现这些细胞在自身免疫性脑脊髓炎模型中通过T-bet表达增强其致脑炎性。 | NA | 探讨GM-CSF产生T细胞在自身免疫性疾病中的作用及其分子机制。 | GM-CSF产生T细胞及其在实验性自身免疫性脑脊髓炎中的作用。 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序，高维单细胞质谱流式技术 | NA | 细胞数据 | 健康个体血液样本及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 |
| 697 | 2024-08-09 |
Gene expression and functional deficits underlie TREM2-knockout microglia responses in human models of Alzheimer's disease
2020-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19227-5
PMID:33097708
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研究论文 | 研究通过CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的人类小胶质细胞，探讨TREM2在阿尔茨海默病中的作用 | 首次结合转录组学和功能分析，以及在阿尔茨海默病小鼠模型中研究TREM2缺失对人类小胶质细胞的影响 | NA | 探究TREM2在人类小胶质细胞中的正常和疾病相关功能 | TREM2敲除的人类小胶质细胞及其在阿尔茨海默病中的作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR, 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 使用CRISPR-modified TREM2-knockout iPSC分化的小胶质细胞 |
| 698 | 2024-08-09 |
Characterization of rare spindle and root cell transcriptional profiles in the stria vascularis of the adult mouse cochlea
2020-10-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75238-8
PMID:33093630
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序技术，分析了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型（如纺锤细胞和根细胞）的转录组特征 | 首次详细描述了成年小鼠耳蜗血管纹中稀有细胞类型的转录组特征，并鉴定了这些细胞的新型特异性标记物 | 研究主要集中在成年小鼠耳蜗血管纹的稀有细胞类型，未涉及其他细胞类型或不同发育阶段的细胞 | 探讨耳蜗血管纹稀有细胞类型的转录组特征及其在听力维持中的功能作用 | 成年小鼠耳蜗血管纹中的稀有细胞类型，包括纺锤细胞和根细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年小鼠耳蜗血管纹样本 |
| 699 | 2024-08-09 |
Identification of a dysfunctional microglial population in human Alzheimer's disease cortex using novel single-cell histology image analysis
2020-10-20, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-020-01047-9
PMID:33081847
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research paper | 本研究通过新型单细胞组织学图像分析，鉴定了阿尔茨海默病（AD）患者大脑皮层中功能障碍的微胶质细胞群体 | 首次在人类脑组织中通过解剖学上下文验证了与AD病理相关的微胶质细胞群体，并使用高吞吐量的免疫组织化学数据支持了微胶质功能障碍假说 | NA | 鉴定和验证阿尔茨海默病中与病理相关的微胶质细胞群体 | 阿尔茨海默病患者的大脑皮层微胶质细胞 | digital pathology | 阿尔茨海默病 | 荧光免疫组织化学 | NA | image | 正常组和AD组各8个中间颞回样本 |
| 700 | 2024-08-09 |
Deep immunophenotyping at the single-cell level identifies a combination of anti-IL-17 and checkpoint blockade as an effective treatment in a preclinical model of data-guided personalized immunotherapy
2020-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2020-001358
PMID:33093158
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研究论文 | 本文通过深度免疫表型分析，识别出在一种临床前模型中，抗IL-17和免疫检查点阻断联合治疗的有效性 | 开发了一种垂直流阵列芯片（VFAC）用于靶向单细胞RNA测序，以识别T细胞的独特亚型，并发现IL-17产生细胞在肿瘤微环境中的作用 | 研究仅限于临床前模型，需要进一步的临床试验验证 | 验证个性化免疫治疗策略的可行性，通过深度免疫表型分析指导治疗 | 胃癌细胞系YTN2和YTN16在C57BL/6小鼠中的免疫反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），流式细胞术 | NA | RNA | 使用YTN2和YTN16胃癌细胞系在C57BL/6小鼠中进行实验 |