单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2024-08-09 |
Investigating transcriptome-wide sex dimorphism by multi-level analysis of single-cell RNA sequencing data in ten mouse cell types
2020-11-05, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-020-00335-2
PMID:33153500
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了十种小鼠细胞类型中的转录组范围内的性别二态性，并探索了其功能后果。 | 本研究采用了一种新颖的计算流程，结合标准差异表达分析和单细胞转录组中差异分布的鉴定，以测试基于性别的基因表达差异。 | NA | 探索性别二态性相关的基于基因表达的生物标志物、功能细胞组分和转录调控网络。 | 十种小鼠细胞类型（来自大脑和心脏）的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 年轻成年雌性和雄性小鼠的十种细胞类型 |
| 662 | 2024-08-09 |
Widespread Traces of Lytic Kaposi Sarcoma-Associated Herpesvirus in Primary Effusion Lymphoma at Single-Cell Resolution
2020-Nov-05, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00851-20
PMID:33154001
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，检测了原发性渗出性淋巴瘤（PEL）细胞中Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）和Epstein-Barr病毒（EBV）的转录相互作用 | 首次在单细胞分辨率下检测到KSHV裂解基因的广泛表达痕迹 | NA | 探究KSHV和EBV在PEL细胞中的转录相互作用 | 原发性渗出性淋巴瘤细胞中的KSHV和EBV | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 663 | 2024-08-09 |
The bone marrow microenvironment of pre-B acute lymphoblastic leukemia at single-cell resolution
2020-11-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76157-4
PMID:33154494
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了小鼠骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的动力学特征 | 首次详细揭示了骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病早期阶段的分子复杂性和细胞间相互作用 | NA | 深入了解骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病中的分子复杂性 | 骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的分子变化和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨髓微环境中的细胞样本 |
| 664 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Bayesian model selection reveals biological origins of zero inflation in single-cell transcriptomics
2020-Nov-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02182-1
PMID:33143736
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 665 | 2024-08-09 |
Embryonic liver developmental trajectory revealed by single-cell RNA sequencing in the Foxa2eGFP mouse
2020-11-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01364-8
PMID:33144666
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研究论文 | 本研究利用转基因Foxa2报告鼠系，通过单细胞全长mRNA测序技术，揭示了从E7.5到E15.5胚胎阶段肝脏发育轨迹及其转录组特征 | 首次详细描述了胚胎肝脏发育轨迹，识别了具有肠道和肝脏特征的肝脏原基，并记录了肝细胞转化过程中的动态基因表达 | NA | 深入理解肝脏和胆囊在早期胚胎阶段的发育过程 | 胚胎肝脏和胆囊的发育轨迹及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞全长mRNA测序 | NA | 转录组 | 从E7.5到E15.5的十个胚胎阶段的内胚层和肝细胞 |
| 666 | 2024-08-09 |
Mitochondria Define Intestinal Stem Cell Differentiation Downstream of a FOXO/Notch Axis
2020-11-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.10.005
PMID:33147486
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研究论文 | 本文研究了线粒体在FOXO/Notch信号通路下游对肠道干细胞分化的影响 | 揭示了FOXO转录因子和Notch信号在调控线粒体分裂及干细胞向杯状细胞和潘氏细胞分化中的新作用 | NA | 探讨线粒体在肠道干细胞分化中的作用及其与FOXO和Notch信号的相互关系 | 肠道干细胞及其分化过程 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 小鼠肠道组织 |
| 667 | 2024-08-09 |
A network medicine approach to investigation and population-based validation of disease manifestations and drug repurposing for COVID-19
2020-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000970
PMID:33156843
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研究论文 | 本研究采用网络医学方法，结合临床和多组学观察，旨在识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 研究揭示了COVID-19与炎症性肠病和哮喘之间的共同病理生物学，并发现褪黑素可能作为预防和治疗COVID-19的潜在药物 | 研究主要基于观察性研究和网络预测，需要进一步的临床试验验证 | 识别SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | SARS-CoV-2的发病机制、疾病表现及COVID-19的治疗方法 | 网络医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、代谢组学、转录组学 | 网络模型 | 蛋白质相互作用、转录组、蛋白质组 | 26,779名个体 |
| 668 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of Different Stages of Oral Cancer Carcinogenesis in a Mouse Model
2020-Oct-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21218171
PMID:33142921
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了在小鼠模型中口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征 | 首次在单细胞水平上分析了口腔癌致癌过程中的基因表达变化，并识别了与MYC_targets_v1通路相关的细胞亚型标记物 | 研究仅限于小鼠模型，结果的临床应用需要进一步验证 | 探究口腔癌致癌过程中不同阶段的基因表达特征，并寻找潜在的生物标志物 | 小鼠口腔癌致癌过程中的细胞亚型及其基因表达 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序 | Louvain算法 | 基因表达数据 | 使用了C57BL/6J雄性小鼠，分为对照组和治疗组，共进行了8、16、20和29周的实验 |
| 669 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals the heterogeneity of the decidual endothelial cells that participate in labor onset
2020-10, European review for medical and pharmacological sciences
DOI:10.26355/eurrev_202010_23385
PMID:33155267
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术探讨了分娩前后蜕膜内皮细胞的异质性及其功能变化 | 揭示了蜕膜内皮细胞在分娩过程中的异质性，并发现了可能在分娩中更活跃的特定亚型 | NA | 探究蜕膜内皮细胞的异质性及其在分娩过程中的变化 | 蜕膜内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9748个细胞 |
| 670 | 2024-08-09 |
Advances and challenges in single-cell RNA-seq of microbial communities
2020-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2020.10.001
PMID:33160164
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在微生物群落研究中的进展和挑战 | 探讨了如何将单细胞RNA测序技术扩展到高吞吐量，以研究数千种微生物 | 单细胞RNA测序技术在真菌、原生生物和细菌中的应用仍处于初级阶段 | 旨在整合哺乳动物和微生物的单细胞分析，以研究健康和疾病中的微生物群落 | 微生物群落的分子状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 671 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses identify dysfunctional CD16+ CD8 T cells in smokers
2020-07-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100054
PMID:33163982
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了吸烟者和非吸烟者外周血中的免疫细胞，发现吸烟者中CD16+ CD8 T细胞亚群增加，这些细胞表现出NK细胞样特征和免疫老化迹象 | 首次揭示吸烟者中CD16+ CD8 T细胞亚群的增加及其与免疫老化的关联 | NA | 识别吸烟对免疫细胞的影响 | 吸烟者和非吸烟者的外周血免疫细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 吸烟者和非吸烟者的外周血样本 |
| 672 | 2024-08-09 |
The identification and functional analysis of CD8+PD-1+CD161+ T cells in hepatocellular carcinoma
2020, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-020-00133-4
PMID:33145436
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研究论文 | 本研究通过构建单细胞免疫环境，分析了肝细胞癌（HCC）中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的分布、功能和进化轨迹 | 首次详细描述了CD8+PD-1+CD161+和CD8+PD-1+CD161- T细胞在肿瘤和非肿瘤组织中的差异分布及其免疫活性，为HCC免疫环境的异质性提供了新的见解 | NA | 探索肝细胞癌中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的功能和分布，为免疫治疗提供新的靶点 | 肝细胞癌（HCC）中的CD8+PD-1+CD161+ T细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约20,000,000个免疫细胞来自15对HCC肿瘤和非肿瘤邻近组织及10份血液样本（包括5份HCC和5份健康对照） |
| 673 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Immune Cell Repertoire of the Atlantic Cod Which Naturally Lacks the Major Histocompatibility Class II System
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.559555
PMID:33154745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，深入分析了大西洋鳕鱼免疫组织（脾脏和外周血白细胞）中的细胞类型 | 首次揭示了大西洋鳕鱼中可能代表树突状细胞、自然杀伤样细胞和表达T辅助2细胞主转录因子的细胞亚群 | NA | 探究缺乏主要组织相容性II类系统的大西洋鳕鱼如何对抗细菌感染及产生免疫记忆的机制 | 大西洋鳕鱼的免疫细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 脾脏和外周血白细胞中的细胞 |
| 674 | 2024-08-09 |
Identification of a novel cancer stem cell subpopulation that promotes progression of human fatal renal cell carcinoma by single-cell RNA-seq analysis
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.46645
PMID:33162821
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群促进人类致命性肾细胞癌的进展 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，鉴定并表征了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群在肾细胞癌的进展和转移中起关键作用 | 研究样本仅来自一对原发和转移部位的集合管肾细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 旨在描绘癌症干细胞介导的生物学特性的基线图谱，为肿瘤进化、抗肿瘤药物选择和药物抗性提供重要信息 | 癌症干细胞亚群及其在肾细胞癌进展中的作用 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15208个细胞 |
| 675 | 2024-08-09 |
Characteristics of TCR Repertoire Associated With Successful Immune Checkpoint Therapy Responses
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.587014
PMID:33163002
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综述 | 本文综述了TCR库如何影响免疫检查点疗法（ICT）的反应，以及ICT如何影响TCR库的多样性 | 探讨了网络分析氨基酸相似性在TCR序列中的应用，以及单细胞测序技术在识别关键T细胞克隆中的作用 | 讨论了当前用于表征和表示TCR库多样性的指标的优缺点 | 旨在理解免疫机制，识别预测ICT反应的生物标志物，并开发将非反应患者转化为反应患者的方法 | T细胞受体（TCR）库及其在ICT中的动态变化 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |
| 676 | 2024-08-09 |
Transcriptional Programs of Circuit Assembly in the Drosophila Visual System
2020-12-23, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.10.006
PMID:33125872
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了果蝇视觉系统发育过程中多个阶段的神经元转录组，揭示了神经元间突触连接的遗传编码模式。 | 本文开发了一种高效策略，通过在单一池中对多个时间点的神经元进行测序，减少了批次效应并提高了时间序列数据的可靠性。 | NA | 研究果蝇视觉系统中神经元电路组装的转录程序。 | 果蝇视觉系统中多个发育阶段的神经元转录组。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过150种不同的神经元群体，其中88种神经元群体在突触形成过程中被追踪。 |
| 677 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals thyrocyte diversity in the zebrafish thyroid gland
2020-12-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202050612
PMID:33140917
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其周围非腺泡细胞的分子特征 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性，并验证了转录因子pax2a在腺泡细胞中的双峰表达模式 | NA | 探索斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其分子特征 | 斑马鱼甲状腺腺泡细胞及其周围细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 6249个细胞 |
| 678 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptome research in human placenta
2020-12, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0231
PMID:33112783
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类胎盘研究中的应用，总结了不同妊娠阶段及妊娠并发症中的研究进展 | 介绍了单细胞RNA测序技术在胎盘细胞异质性研究中的应用 | 未提及具体的研究局限性 | 揭示正常和疾病胎盘中不同细胞类型的异质性及细胞间的分子相互作用 | 人类胎盘及其在妊娠并发症中的表现 | 基因组学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未提及具体样本量 |
| 679 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling of AKI in a Murine Model Reveals Novel Transcriptional Signatures, Profibrotic Phenotype, and Epithelial-to-Stromal Crosstalk
2020-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020010052
PMID:33115917
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在AKI的小鼠模型中揭示了新的转录组特征、促纤维化表型和上皮-间质相互作用 | 发现了AKI中多个阶段和所有肾细胞类型的基因表达模式变化，以及新的基因和细胞身份混合现象 | NA | 深入理解AKI中的分子通路，以识别可能改善治疗的潜在靶点 | AKI的小鼠模型中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个时间点（1天、2天、4天、7天、11天和14天）的AKI小鼠模型 |
| 680 | 2024-08-09 |
Breast cancers, mammary stem cells, and cancer stem cells, characteristics, and hypotheses
2020-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2020.09.009
PMID:33142233
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研究论文 | 本文探讨了乳腺癌细胞异质性对治疗的影响，并提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞 | 提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞，并探讨了癌症干细胞在乳腺癌发展、转移和复发中的作用 | 目前针对这些特定癌细胞群体的临床试验较少 | 研究乳腺癌的细胞异质性及其对治疗的影响 | 乳腺癌、乳腺干细胞和癌症干细胞 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |