单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling of Immune Cell Repertoire of the Atlantic Cod Which Naturally Lacks the Major Histocompatibility Class II System
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.559555
PMID:33154745
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，深入分析了大西洋鳕鱼免疫组织（脾脏和外周血白细胞）中的细胞类型 | 首次揭示了大西洋鳕鱼中可能代表树突状细胞、自然杀伤样细胞和表达T辅助2细胞主转录因子的细胞亚群 | NA | 探究缺乏主要组织相容性II类系统的大西洋鳕鱼如何对抗细菌感染及产生免疫记忆的机制 | 大西洋鳕鱼的免疫细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 脾脏和外周血白细胞中的细胞 |
| 662 | 2024-08-09 |
Identification of a novel cancer stem cell subpopulation that promotes progression of human fatal renal cell carcinoma by single-cell RNA-seq analysis
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.46645
PMID:33162821
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，鉴定了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群促进人类致命性肾细胞癌的进展 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，鉴定并表征了一种新型癌症干细胞亚群，该亚群在肾细胞癌的进展和转移中起关键作用 | 研究样本仅来自一对原发和转移部位的集合管肾细胞癌，可能限制了结果的普遍性 | 旨在描绘癌症干细胞介导的生物学特性的基线图谱，为肿瘤进化、抗肿瘤药物选择和药物抗性提供重要信息 | 癌症干细胞亚群及其在肾细胞癌进展中的作用 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15208个细胞 |
| 663 | 2024-08-09 |
Characteristics of TCR Repertoire Associated With Successful Immune Checkpoint Therapy Responses
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.587014
PMID:33163002
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综述 | 本文综述了TCR库如何影响免疫检查点疗法（ICT）的反应，以及ICT如何影响TCR库的多样性 | 探讨了网络分析氨基酸相似性在TCR序列中的应用，以及单细胞测序技术在识别关键T细胞克隆中的作用 | 讨论了当前用于表征和表示TCR库多样性的指标的优缺点 | 旨在理解免疫机制，识别预测ICT反应的生物标志物，并开发将非反应患者转化为反应患者的方法 | T细胞受体（TCR）库及其在ICT中的动态变化 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA |
| 664 | 2024-08-09 |
Transcriptional Programs of Circuit Assembly in the Drosophila Visual System
2020-12-23, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.10.006
PMID:33125872
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，研究了果蝇视觉系统发育过程中多个阶段的神经元转录组，揭示了神经元间突触连接的遗传编码模式。 | 本文开发了一种高效策略，通过在单一池中对多个时间点的神经元进行测序，减少了批次效应并提高了时间序列数据的可靠性。 | NA | 研究果蝇视觉系统中神经元电路组装的转录程序。 | 果蝇视觉系统中多个发育阶段的神经元转录组。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过150种不同的神经元群体，其中88种神经元群体在突触形成过程中被追踪。 |
| 665 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis reveals thyrocyte diversity in the zebrafish thyroid gland
2020-12-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202050612
PMID:33140917
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其周围非腺泡细胞的分子特征 | 首次通过单细胞转录组测序揭示了斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性，并验证了转录因子pax2a在腺泡细胞中的双峰表达模式 | NA | 探索斑马鱼甲状腺腺泡细胞的异质性及其分子特征 | 斑马鱼甲状腺腺泡细胞及其周围细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 6249个细胞 |
| 666 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptome research in human placenta
2020-12, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-20-0231
PMID:33112783
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在人类胎盘研究中的应用，总结了不同妊娠阶段及妊娠并发症中的研究进展 | 介绍了单细胞RNA测序技术在胎盘细胞异质性研究中的应用 | 未提及具体的研究局限性 | 揭示正常和疾病胎盘中不同细胞类型的异质性及细胞间的分子相互作用 | 人类胎盘及其在妊娠并发症中的表现 | 基因组学 | 妊娠并发症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未提及具体样本量 |
| 667 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling of AKI in a Murine Model Reveals Novel Transcriptional Signatures, Profibrotic Phenotype, and Epithelial-to-Stromal Crosstalk
2020-12, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2020010052
PMID:33115917
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，在AKI的小鼠模型中揭示了新的转录组特征、促纤维化表型和上皮-间质相互作用 | 发现了AKI中多个阶段和所有肾细胞类型的基因表达模式变化，以及新的基因和细胞身份混合现象 | NA | 深入理解AKI中的分子通路，以识别可能改善治疗的潜在靶点 | AKI的小鼠模型中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个时间点（1天、2天、4天、7天、11天和14天）的AKI小鼠模型 |
| 668 | 2024-08-09 |
Breast cancers, mammary stem cells, and cancer stem cells, characteristics, and hypotheses
2020-12, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2020.09.009
PMID:33142233
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研究论文 | 本文探讨了乳腺癌细胞异质性对治疗的影响，并提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞 | 提出了两种模型来解释乳腺癌的起源细胞，并探讨了癌症干细胞在乳腺癌发展、转移和复发中的作用 | 目前针对这些特定癌细胞群体的临床试验较少 | 研究乳腺癌的细胞异质性及其对治疗的影响 | 乳腺癌、乳腺干细胞和癌症干细胞 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 669 | 2024-08-09 |
Functional module detection through integration of single-cell RNA sequencing data with protein-protein interaction networks
2020-Nov-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07144-2
PMID:33138772
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为SCPPIN的方法，该方法通过整合单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质相互作用网络，来检测不同转录状态细胞中的活性模块 | SCPPIN方法能够识别出不仅限于差异表达基因的生物学信息，揭示了标准差异表达基因分析之外的生物学功能 | NA | 开发一种方法，通过整合单细胞RNA测序数据与蛋白质相互作用数据，系统分析差异表达基因 | 人类肝脏球体和人类脂肪组织的RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 两个RNA测序数据集 |
| 670 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis of copy-number alterations in serous ovarian cancer reveals substantial heterogeneity in both low- and high-grade tumors
2020-11, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2020.1836439
PMID:33121339
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了浆液性卵巢癌中的拷贝数变异，揭示了高低级别肿瘤中均存在显著的细胞间异质性 | 利用单细胞测序技术首次在单细胞水平上分析了浆液性卵巢癌的臂级非整倍体 | NA | 研究浆液性卵巢癌中单细胞水平的拷贝数变异 | 浆液性卵巢癌细胞的拷贝数变异 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 671 | 2024-08-09 |
Pan-cancer single-cell RNA-seq identifies recurring programs of cellular heterogeneity
2020-11, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-020-00726-6
PMID:33128048
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研究论文 | 本研究利用多重单细胞RNA测序技术，分析了来自22种癌症类型的198个癌细胞系，识别出在多个癌细胞系中反复出现的12种表达程序，这些程序与多种生物过程相关 | 首次通过大规模单细胞RNA测序揭示了癌细胞系中的异质性模式，并发现这些模式与人类肿瘤中的异质性相似 | NA | 探索癌细胞系中的异质性及其与肿瘤中异质性的关系 | 来自22种癌症类型的198个癌细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 198个癌细胞系 |
| 672 | 2024-08-09 |
Age-related loss of gene-to-gene transcriptional coordination among single cells
2020-11, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-020-00304-4
PMID:33139959
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法来分析单细胞RNA测序数据中的转录调控，重点关注基因间的全局协调而非单个基因的变异性或基因对之间的相关性 | 本文创新地关注了衰老细胞中基因间转录协调的减少，并发现这种损失与特定的年龄相关突变负荷和辐射诱导的DNA损伤有关 | NA | 研究衰老过程中转录调控的随机异常现象 | 衰老细胞中的基因间转录协调 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种不同生物和细胞类型 |
| 673 | 2024-08-09 |
Persistent STAT5 activation reprograms the epigenetic landscape in CD4+ T cells to drive polyfunctionality and antitumor immunity
2020-Oct-30, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aba5962
PMID:33127608
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研究论文 | 本文报道了持续激活信号转导子和转录激活子5（STAT5）在肿瘤特异性CD4 T细胞中驱动多功能T细胞发展的作用 | 首次揭示了STAT5持续激活在CD4 T细胞中诱导基因组范围的染色质重塑，并建立独特的表观遗传和转录景观，从而促进多功能T细胞的形成 | NA | 探讨STAT5在肿瘤特异性CD4 T细胞中的持续激活对多功能性和抗肿瘤免疫的影响 | 肿瘤特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | 涉及小鼠和人类CD4 T细胞样本 |
| 674 | 2024-08-09 |
Cellular taxonomy and spatial organization of the murine ventral posterior hypothalamus
2020-10-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.58901
PMID:33119507
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对小鼠腹后下丘脑的细胞类型和空间组织进行了系统分类 | 首次揭示了小鼠腹后下丘脑中20种神经元和18种非神经元细胞群体，并验证了这些细胞群体的差异表达基因 | NA | 旨在阐明腹后下丘脑中不同神经回路在生理和行为中的作用 | 小鼠腹后下丘脑的细胞类型和空间组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过16,000个单细胞 |
| 675 | 2024-08-09 |
Functional in vivo and in vitro effects of 20q11.21 genetic aberrations on hPSC differentiation
2020-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75657-7
PMID:33122739
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研究论文 | 本研究探讨了20q11.21拷贝数变异（CNV）在人多能干细胞（hPSCs）早期分化过程中的体内外功能效应 | 本研究首次全面分析了20q11.21 CNV在hPSCs分化中的全转录组效应，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了转录异质性 | 研究主要集中在20q11.21 CNV的影响，未涉及其他基因区域的变异对hPSCs分化的影响 | 旨在检查20q11.21 CNV在hPSCs早期分化过程中的功能效应 | 人多能干细胞（hPSCs）及其分化过程中的20q11.21拷贝数变异（CNV） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | 22个畸胎瘤样本，两个不同同源系hPSCs的胚体 |
| 676 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Emergence of Liver Parenchymal and Non-parenchymal Cell Lineages
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.012
PMID:33125890
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研究论文 | 本研究通过分析从胚胎第7.5天到第10.5天的45,334个单细胞转录组，揭示了肝脏实质和非实质细胞谱系在器官发生早期的出现 | 本研究首次详细描述了血管和窦状内皮的差异，包括窦状内皮在第8.75天的独特转录特征，并揭示了早期肝星状细胞和两种不同间皮细胞类型的特征 | NA | 研究肝脏在器官发生早期的细胞复杂性和谱系建立 | 肝脏的实质和非实质细胞谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 45,334个单细胞 |
| 677 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Highlights a Role for Neutrophils and Inflammatory Macrophages in the Pathogenesis of Severe COVID-19
2020-10-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9112374
PMID:33138195
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研究论文 | 本研究利用迭代聚类和引导基因选择2（ICGS2）以及统一流形逼近和投影（UMAP）降维计算算法，分析了来自两名健康受试者和三名轻度及五名重度COVID-19患者的68,873个单细胞的公开数据集，揭示了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19发病机制中的作用 | 本研究首次详细描述了中性粒细胞和巨噬细胞集群1在重度COVID-19中的免疫细胞组成和基因特征，为诊断和治疗干预提供了新的可能性 | 研究主要基于公开数据集，样本量和数据来源可能限制了结果的普遍性 | 探讨免疫细胞亚群在COVID-19疾病严重程度中的作用 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液（BAL）中的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | ICGS2, UMAP | 单细胞转录组数据 | 68,873个单细胞，来自两名健康受试者、三名轻度COVID-19患者和五名重度COVID-19患者 |
| 678 | 2024-08-09 |
Nuclear gene proximity and protein interactions shape transcript covariations in mammalian single cells
2020-10-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19011-5
PMID:33116115
|
研究论文 | 本文研究了哺乳动物单细胞中基因共表达模式的形成机制 | 首次提供了miRNAs自然诱导转录组广泛共变的证据，并比较了核组织、转录和转录后调控在定义共变中的相对重要性 | NA | 探讨基因共变在哺乳动物单细胞中的形成机制及其生物学意义 | 小鼠胚胎干细胞中的基因共变网络 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千对内在共变基因 |
| 679 | 2024-08-09 |
Cell Dissociation from Butterfly Pupal Wing Tissues for Single-Cell RNA Sequencing
2020-Oct-28, Methods and protocols
IF:2.3Q3
DOI:10.3390/mps3040072
PMID:33126499
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研究论文 | 本文提供了一种从蝴蝶蛹翅组织中分离细胞以进行单细胞RNA测序的详细方案 | 利用单细胞测序技术研究蝴蝶翅鳞片细胞的基因表达模式，以识别产生不同颜色和鳞片结构的细胞类型 | 讨论了当前技术在研究单细胞鳞片发育方面的一些挑战 | 理解蝴蝶翅鳞片的基因表达模式和识别不同鳞片细胞类型 | 蝴蝶蛹翅组织中的细胞 | 遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 680 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell Atlases Reveal an Oral SARS-CoV-2 Infection and Transmission Axis
2020-Oct-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.10.26.20219089
PMID:33140061
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研究论文 | 本文通过整合人类小唾液腺和牙龈的单细胞RNA测序数据集，揭示了口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 首次详细描述了口腔黏膜和唾液腺在SARS-CoV-2感染和传播中的具体机制 | NA | 探讨口腔在COVID-19感染和传播中的作用 | 人类小唾液腺和牙龈的细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括11种上皮细胞、7种间质细胞和15种免疫细胞集群 |