单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-09 |
Stemness Related Genes Revealed by Network Analysis Associated With Tumor Immune Microenvironment and the Clinical Outcome in Lung Adenocarcinoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.549213
PMID:33193623
|
研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）全面分析了癌症干细胞特性与肿瘤微环境（TME）在肺腺癌（LUAD）中的作用 | 本研究首次揭示了癌症干细胞特性与抗肿瘤免疫之间的关系，并通过多种算法探索了关键基因表达与癌症免疫特性的关系 | 研究结果需要在更大样本中进一步验证，以确认其作为预测标志物和治疗靶点的潜力 | 探讨癌症干细胞特性与肿瘤微环境在肺腺癌中的作用及其对临床结果的影响 | 肺腺癌（LUAD）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 642 | 2024-08-09 |
Evolution of Advanced Chronic Lymphoid Leukemia Unveiled by Single-Cell Transcriptomics: A Case Report
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.584607
PMID:33194728
|
病例报告 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了慢性淋巴细胞白血病（CLL）在诊断和复发阶段的遗传和转录异质性 | 利用单细胞RNA测序技术，首次在CLL患者中发现了在治疗过程中克隆优势的重大转变，并揭示了与疾病进展相关的特定克隆和信号通路的激活 | 本研究仅基于单一病例，可能无法完全代表所有CLL患者的普遍情况 | 通过单细胞转录组学分析，揭示CLL的疾病异质性，以优化治疗方案 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）的遗传和转录异质性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 单一CLL病例，包括诊断和复发阶段的样本 |
| 643 | 2024-08-09 |
Identification of Differential Gene Groups From Single-Cell Transcriptomes Using Network Entropy
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.588041
PMID:33195248
|
研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法DiffGE，利用网络熵来测量不同细胞类型间基因组的表达动态，并识别高度差异的基因组 | 采用网络熵作为测量工具，以识别不同细胞类型间高度差异的基因组 | NA | 揭示特定细胞类型间的转录差异 | 单细胞转录组数据中的差异基因组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的单细胞RNA-seq数据集 |
| 644 | 2024-08-09 |
Vertebrate Sensory Ganglia: Common and Divergent Features of the Transcriptional Programs Generating Their Functional Specialization
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.587699
PMID:33195244
|
研究论文 | 本文总结了脊椎动物头部感觉神经节的普遍解剖结构、功能和神经多样性，并概述了控制感觉系统发育中神经发生和神经元分化的转录网络的当前知识，特别关注头部感觉神经节，强调其发育的特定方面并与躯干感觉神经节进行比较 | 利用单细胞RNA测序技术，近期研究在大多数感觉神经节的神经元多样性表征方面取得了显著进展 | 目前对不同头部感觉神经节胚胎发育的分子机制的理解仍然有限 | 探讨脊椎动物感觉神经节的转录程序及其功能特化的共同和差异特征 | 脊椎动物的感觉神经节及其相关的神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 645 | 2024-08-09 |
Spatio-temporal regulation of gene expression defines subpopulations of epidermal stem cells
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200740
PMID:33170265
|
研究论文 | 本文探讨了表皮干细胞的基因表达时空调控及其在再生医学中的应用 | 引入了单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度和细胞熵等技术，揭示了表皮干细胞的高度异质性和可塑性 | 分离表皮干细胞与其后代仍然是一个挑战 | 探索表皮干细胞的可塑性及其在再生医学中的应用 | 表皮干细胞及其亚群角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 646 | 2024-08-09 |
CaMKIIα-Positive Interneurons Identified via a microRNA-Based Viral Gene Targeting Strategy
2020-12-09, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2570-19.2020
PMID:33158963
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于microRNA的病毒基因靶向策略，用于识别表达CaMKIIα的阳性中间神经元 | 提出了一种新的病毒基因表达策略，使用microRNA引导的神经元标签（mAGNET）来靶向具有特定microRNA表达的细胞 | NA | 研究大脑细胞中基因表达的多样性，并探索基因表达与生理特性之间的关系 | 表达CaMKIIα的中间神经元及其生理特性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性和雌性小鼠 |
| 647 | 2024-08-09 |
Optimized Langendorff perfusion system for cardiomyocyte isolation in adult mouse heart
2020-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.15773
PMID:33147379
|
research paper | 本文介绍了一种优化的Langendorff灌流系统，用于从成年小鼠心脏中分离心肌细胞 | 提出了一个简化和标准化的操作协议，利用重力作为灌流压力，并引入了新的去泡方法和消化终止标准 | NA | 改进Langendorff灌流系统，以提高心肌细胞的活性和纯度，满足单细胞测序技术的要求 | 成年小鼠心脏中的心肌细胞 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | 多次自然重力沉降后获得稳定的心肌细胞 |
| 648 | 2024-08-09 |
Toward a Consensus View of Mammalian Adipocyte Stem and Progenitor Cell Heterogeneity
2020-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2020.09.007
PMID:33148396
|
综述 | 本文综述了关于哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞异质性的当前知识 | 利用单细胞转录组学技术，提供了对不同哺乳动物脂肪库中ASPCs细胞复杂性的新见解 | ASPCs的分子异质性和功能多样性仍未完全理解 | 探讨哺乳动物脂肪细胞干细胞和前体细胞的异质性 | 脂肪干细胞和前体细胞（ASPCs）及其在脂肪组织中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明 |
| 649 | 2024-08-09 |
Defining the Teratoma as a Model for Multi-lineage Human Development
2020-11-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.10.018
PMID:33152263
|
研究论文 | 本文提出畸胎瘤作为研究人类多谱系发育过程的有前景的平台，并通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9敲除筛选等技术验证了其潜力 | 畸胎瘤被证明能够模拟多谱系发育、泛组织功能遗传筛选和组织工程 | NA | 探索畸胎瘤作为研究人类发育过程的平台 | 畸胎瘤及其在人类发育中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq), CRISPR-Cas9, 微RNA (miRNA) 调控 | NA | 细胞 | 23个畸胎瘤，共179,632个细胞，来自4个细胞系 |
| 650 | 2024-08-09 |
Comprehensive analysis of single-cell RNA sequencing data from healthy human marrow hematopoietic cells
2020-Nov-10, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-020-05357-y
PMID:33168060
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自健康供体的391个骨髓CD34+细胞，以揭示造血过程中的转录异质性和动态变化 | 首次综合分析了健康人骨髓造血细胞的单细胞RNA测序数据，并结合长非编码RNA表达和染色质可及性测序数据，揭示了造血细胞分化过程中的基因表达调控模式 | NA | 探究造血过程中的转录异质性和动态变化 | 健康人骨髓中的CD34+造血干细胞/祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 391个单细胞 |
| 651 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis demonstrates inter-patient and intra-tumor heterogeneity in primary and metastatic lung adenocarcinoma
2020-11-10, Aging
DOI:10.18632/aging.103945
PMID:33170151
|
研究论文 | 本研究通过分析来自GSE123902和GSE131907数据集的50个原发性和转移性肺腺癌样本的单细胞转录组数据，揭示了患者间和肿瘤内异质性的景观 | 研究展示了单细胞转录组分析在揭示肺腺癌原发和转移组织中与肿瘤进展、化疗抵抗和代谢相关的通路调控异质性方面的创新应用 | NA | 确定原发性和转移性肺腺癌中患者间和肿瘤内异质性的景观 | 原发性和转移性肺腺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 50个原发性和转移性肺腺癌样本 |
| 652 | 2024-08-09 |
Unveiling the heterogeneity of NKT cells in the liver through single cell RNA sequencing
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76659-1
PMID:33173202
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肝脏中NKT细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描述了NKT细胞的异质性，并发现了一个先前未定义的功能性NKT细胞亚群 | NA | 研究NKT细胞在肝脏中的异质性及其功能 | 肝脏中的NKT细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型、Jα18缺陷型和CD1d缺陷型小鼠的肝脏NKT细胞 |
| 653 | 2024-08-09 |
Fate and functional roles of Prominin 1+ cells in liver injury and cancer
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76458-8
PMID:33173221
|
研究论文 | 本文通过遗传谱系追踪研究了Prominin 1 (PROM1)细胞在酒精性肝炎(AH)和肝细胞癌(HCC)中的起源、命运和功能 | 首次揭示了PROM1细胞在AH和HCC中的起源和功能，并发现Discodin Domain Receptor 1 (DDR1)在PROM1细胞中的独特上调及其与患者生存的负相关性 | NA | 探讨PROM1细胞在肝脏损伤和癌症中的作用及其潜在的驱动因子 | PROM1细胞在酒精性肝炎和肝细胞癌中的起源、命运和功能 | NA | 肝细胞癌 | 遗传谱系追踪、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 654 | 2024-08-09 |
Benchmarking of cell type deconvolution pipelines for transcriptomics data
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19015-1
PMID:33159064
|
研究论文 | 本文通过五个单细胞RNA测序数据集生成的伪批量混合物，评估了数据转换、预处理、标记选择、细胞类型组成和方法选择对转录组数据细胞类型反卷积结果的综合影响 | 首次全面评估了影响转录组数据细胞类型反卷积的各种因素，并提出了提高反卷积性能的一般指导原则 | 研究主要集中在方法的比较和数据处理的影响上，未涉及实际生物样本的应用 | 评估和优化转录组数据细胞类型反卷积的方法 | 转录组数据的细胞类型反卷积方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个单细胞RNA测序数据集 |
| 655 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas and lineage analysis of the adult Drosophila ovary
2020-11-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19361-0
PMID:33159074
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术构建了成年果蝇卵巢的综合细胞图谱，包括生殖干细胞及其微环境细胞、滤泡干细胞和先前未描述的伴细胞亚群的转录组特征 | 发现了伴细胞的一个独特亚群能够在饥饿或遗传操作下转化为滤泡干细胞 | NA | 研究果蝇卵巢中细胞类型及其转录组特征和细胞谱系 | 成年果蝇卵巢中的主要细胞类型及其功能 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 包含成年果蝇卵巢中每种主要细胞类型的转录组数据 |
| 656 | 2024-08-09 |
Investigating transcriptome-wide sex dimorphism by multi-level analysis of single-cell RNA sequencing data in ten mouse cell types
2020-11-05, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-020-00335-2
PMID:33153500
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了十种小鼠细胞类型中的转录组范围内的性别二态性，并探索了其功能后果。 | 本研究采用了一种新颖的计算流程，结合标准差异表达分析和单细胞转录组中差异分布的鉴定，以测试基于性别的基因表达差异。 | NA | 探索性别二态性相关的基于基因表达的生物标志物、功能细胞组分和转录调控网络。 | 十种小鼠细胞类型（来自大脑和心脏）的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 年轻成年雌性和雄性小鼠的十种细胞类型 |
| 657 | 2024-08-09 |
Widespread Traces of Lytic Kaposi Sarcoma-Associated Herpesvirus in Primary Effusion Lymphoma at Single-Cell Resolution
2020-Nov-05, Microbiology resource announcements
IF:0.7Q4
DOI:10.1128/MRA.00851-20
PMID:33154001
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术，检测了原发性渗出性淋巴瘤（PEL）细胞中Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）和Epstein-Barr病毒（EBV）的转录相互作用 | 首次在单细胞分辨率下检测到KSHV裂解基因的广泛表达痕迹 | NA | 探究KSHV和EBV在PEL细胞中的转录相互作用 | 原发性渗出性淋巴瘤细胞中的KSHV和EBV | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 658 | 2024-08-09 |
The bone marrow microenvironment of pre-B acute lymphoblastic leukemia at single-cell resolution
2020-11-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76157-4
PMID:33154494
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了小鼠骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的动力学特征 | 首次详细揭示了骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病早期阶段的分子复杂性和细胞间相互作用 | NA | 深入了解骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病中的分子复杂性 | 骨髓微环境在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的分子变化和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠骨髓微环境中的细胞样本 |
| 659 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Bayesian model selection reveals biological origins of zero inflation in single-cell transcriptomics
2020-Nov-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02182-1
PMID:33143736
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 660 | 2024-08-09 |
Embryonic liver developmental trajectory revealed by single-cell RNA sequencing in the Foxa2eGFP mouse
2020-11-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01364-8
PMID:33144666
|
研究论文 | 本研究利用转基因Foxa2报告鼠系，通过单细胞全长mRNA测序技术，揭示了从E7.5到E15.5胚胎阶段肝脏发育轨迹及其转录组特征 | 首次详细描述了胚胎肝脏发育轨迹，识别了具有肠道和肝脏特征的肝脏原基，并记录了肝细胞转化过程中的动态基因表达 | NA | 深入理解肝脏和胆囊在早期胚胎阶段的发育过程 | 胚胎肝脏和胆囊的发育轨迹及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞全长mRNA测序 | NA | 转录组 | 从E7.5到E15.5的十个胚胎阶段的内胚层和肝细胞 |