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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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621 | 2024-08-09 |
Integrated Single-Cell RNA-Sequencing Analysis of Aquaporin 5-Expressing Mouse Lung Epithelial Cells Identifies GPRC5A as a Novel Validated Type I Cell Surface Marker
2020-11-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9112460
PMID:33187367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了表达水通道蛋白5(AQP5)的小鼠肺上皮细胞,并鉴定出GPRC5A作为新型验证的I型细胞表面标记物 | 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定出GPRC5A作为I型肺泡上皮细胞(AT1细胞)的保守表面标记物 | 研究仅限于特定的小鼠模型,且样本量较小 | 旨在通过单细胞RNA测序技术鉴定和验证新的肺泡上皮I型细胞表面标记物 | 表达AQP5的小鼠肺上皮细胞和AT1细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 92个细胞 |
622 | 2024-08-09 |
Prepronociceptin-Expressing Neurons in the Extended Amygdala Encode and Promote Rapid Arousal Responses to Motivationally Salient Stimuli
2020-11-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108362
PMID:33176134
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研究论文 | 本文研究了表达prepronociceptin基因的神经元在终纹床核中对动机性显著刺激引起的快速生理唤醒反应的调节作用 | 首次发现prepronociceptin神经元在终纹床核中对动机性显著刺激引起的快速生理唤醒反应的调节作用,并揭示了这些神经元的亚群可能对动机性刺激的快速唤醒反应有不同的调节作用 | NA | 探讨prepronociceptin神经元在终纹床核中对动机性显著刺激引起的快速生理唤醒反应的调节作用 | 表达prepronociceptin基因的神经元在终纹床核中的功能 | 神经科学 | NA | 双光子钙成像、光遗传学 | NA | 生理数据 | 小鼠 |
623 | 2024-08-09 |
Prrx1 Fibroblasts Represent a Pro-fibrotic Lineage in the Mouse Ventral Dermis
2020-11-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108356
PMID:33176144
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和单细胞转录组学研究,揭示了在小鼠腹侧真皮中表达配对相关同源盒1(Prrx1)的成纤维细胞在急性和慢性纤维化中的作用 | 首次证明Prrx1表达的成纤维细胞在小鼠腹侧真皮中具有内在的瘢痕形成潜力 | NA | 研究小鼠腹侧真皮中成纤维细胞的异质性及其在纤维化中的作用 | 小鼠腹侧真皮中的成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 谱系追踪,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
624 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Unravels Heterogeneity of the Stromal Niche in Cutaneous Melanoma Heterogeneous Spheroids
2020-Nov-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12113324
PMID:33182777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同真皮成纤维细胞引入的黑色素瘤异质性球体中的微环境因子 | 本研究首次区分了黑色素瘤球体中人类原代成纤维细胞的三个功能簇,并验证了IL-6在促进黑色素瘤侵袭中的作用 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序分析不同成纤维细胞对黑色素瘤异质性球体微环境的影响 | 黑色素瘤异质性球体中的微环境因子及成纤维细胞的多样性 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了来自年轻捐赠者防晒皮肤和成年捐赠者日晒损伤皮肤的正常真皮成纤维细胞 |
625 | 2024-08-09 |
Laser Capture Microdissection-Based RNA Microsequencing Reveals Optic Nerve Crush-Related Early mRNA Alterations in Retinal Ganglion Cell Layer
2020-10, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.9.11.30
PMID:33173609
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研究论文 | 本文通过激光捕获显微切割(LCM)和RNA微测序技术,研究了视神经挤压(ONC)相关的视网膜神经节细胞(RGC)层早期mRNA变化 | 首次使用LCM结合单细胞RNA测序技术,揭示了ONC相关早期mRNA变化的分子机制 | NA | 建立LCM和RNA微测序方法,探索视神经挤压相关的视网膜神经节细胞层早期mRNA变化 | 视网膜神经节细胞层的早期mRNA变化 | 数字病理学 | NA | 激光捕获显微切割(LCM),RNA微测序 | NA | RNA | 30微米厚的视网膜组织切片 |
626 | 2024-08-09 |
Multiple Expression Assessments of ACE2 and TMPRSS2 SARS-CoV-2 Entry Molecules in the Urinary Tract and Their Associations with Clinical Manifestations of COVID-19
2020, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S270543
PMID:33177848
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研究论文 | 本研究探讨了ACE2和TMPRSS2在人体主要器官中的表达模式,特别是在特定疾病条件下,并评估了它们与COVID-19临床表现的关系 | 首次详细研究了ACE2和TMPRSS2在泌尿系统中的表达及其与COVID-19临床表现的关系 | NA | 揭示SARS-CoV-2的致病机制及其在人体睾丸和肾脏中的临床表现 | ACE2和TMPRSS2在人体器官中的表达及其与COVID-19的关系 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 涉及慢性肾脏疾病或糖尿病肾病的个体 |
627 | 2024-08-09 |
Current Status of Stem Cell-Derived Therapies for Parkinson's Disease: From Cell Assessment and Imaging Modalities to Clinical Trials
2020, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2020.558532
PMID:33177975
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研究论文 | 本文综述了干细胞衍生的多巴胺神经元移植作为帕金森病治疗方案的最新进展,包括细胞来源、评估方法和临床试验结果 | 探讨了干细胞移植在帕金森病治疗中的应用潜力,并总结了临床试验的教训 | 文章指出干细胞移植治疗帕金森病仍需考虑多种因素,如干细胞来源、质量、患者年龄等 | 旨在更新干细胞衍生的多巴胺神经元移植治疗帕金森病的现状和进展 | 主要研究对象为帕金森病患者和干细胞衍生的多巴胺神经元 | NA | 帕金森病 | 单细胞测序、成像技术 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
628 | 2024-08-09 |
Differential Expression of Viral Transcripts From Single-Cell RNA Sequencing of Moderate and Severe COVID-19 Patients and Its Implications for Case Severity
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.603509
PMID:33178176
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析中度和重度COVID-19患者的病毒转录本表达差异及其对病例严重程度的意义 | 首次报道了SARS-CoV-2 ORF10基因在中度和重度病例中的差异表达,并发现了与病毒领导者序列独立融合的转录调控序列(TRS)主要在死亡病例中检测到 | 研究结果需要更多数据验证 | 探索SARS-CoV-2感染细胞中病毒基因表达的特征和进化差异,以预测疾病进展和患者分级 | 中度和重度COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的感染细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 中度和重度COVID-19患者的样本 |
629 | 2024-08-09 |
Profiling Microglia From Alzheimer's Disease Donors and Non-demented Elderly in Acute Human Postmortem Cortical Tissue
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.00134
PMID:33192286
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研究论文 | 研究通过批量和单细胞RNA测序技术,分析了阿尔茨海默病(AD)患者和非痴呆老年人死后急性皮质脑组织中的小胶质细胞转录组 | 首次在人类样本中识别出七种具有基因表达异质性的小胶质细胞亚群 | 研究未发现AD患者和非痴呆老年人之间小胶质细胞的基因表达和亚群组成有显著差异 | 探讨小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其基因表达特征 | 阿尔茨海默病患者和非痴呆老年人的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用急性人类死后皮质脑样本 |
630 | 2024-08-09 |
LRR-Containing Oncofetal Trophoblast Glycoprotein 5T4 Shapes Neural Circuits in Olfactory and Visual Systems
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.581018
PMID:33192298
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研究论文 | 本文探讨了含有LRR的癌胚滋养层糖蛋白5T4在嗅觉和视觉系统中神经回路形成中的作用 | 首次揭示了5T4在嗅觉和视觉系统中对神经回路形成的关键作用 | NA | 研究5T4在嗅觉和视觉系统中对神经回路形成的作用 | 嗅觉和视觉系统中的神经回路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
631 | 2024-08-09 |
BrainWiki-A Wiki-Style, User Driven, Comparative Brain Anatomy Tool
2020, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2020.548172
PMID:33192339
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研究论文 | 介绍了一个名为BrainWiki的用户友好型网络脑图谱平台,该平台将人类和小鼠大脑并列展示,便于直接比较 | BrainWiki是首个将人类和小鼠大脑并列展示的网络平台,支持用户互动和贡献,使其成为一个动态更新的脑科学资源 | NA | 旨在创建一个用户驱动的、比较性的脑解剖学工具,以促进对人类和小鼠大脑的理解 | 人类和小鼠的大脑解剖结构及其相关研究 | 神经科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
632 | 2024-08-09 |
Identification of Immune Cell Infiltration and Immune-Related Genes in the Tumor Microenvironment of Glioblastomas
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.585034
PMID:33193404
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研究论文 | 本研究旨在识别胶质母细胞瘤(GBM)肿瘤微环境中的免疫细胞浸润和免疫相关基因 | 本研究通过RNA测序和临床数据分析,识别了24个与肿瘤微环境浸润相关的免疫相关基因,这些基因可能作为新的生物标志物和免疫治疗靶点 | NA | 识别胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫相关基因 | 胶质母细胞瘤(GBM)的肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫相关基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和CGGA的GBM样本数据 |
633 | 2024-08-09 |
NeuralEE: A GPU-Accelerated Elastic Embedding Dimensionality Reduction Method for Visualizing Large-Scale scRNA-Seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00786
PMID:33193561
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研究论文 | 本文设计了一种GPU加速的方法NeuralEE,结合了弹性嵌入和神经网络的优势,用于大规模单细胞RNA测序数据的降维和可视化 | NeuralEE方法具有可扩展性和通用性,能够在有限的计算资源下保持高性能 | NA | 开发一种高效的降维和可视化工具,以应对单细胞RNA测序数据量和规模的急剧增加 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | GPU加速 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 130万个小鼠脑细胞 |
634 | 2024-08-09 |
Stemness Related Genes Revealed by Network Analysis Associated With Tumor Immune Microenvironment and the Clinical Outcome in Lung Adenocarcinoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.549213
PMID:33193623
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)全面分析了癌症干细胞特性与肿瘤微环境(TME)在肺腺癌(LUAD)中的作用 | 本研究首次揭示了癌症干细胞特性与抗肿瘤免疫之间的关系,并通过多种算法探索了关键基因表达与癌症免疫特性的关系 | 研究结果需要在更大样本中进一步验证,以确认其作为预测标志物和治疗靶点的潜力 | 探讨癌症干细胞特性与肿瘤微环境在肺腺癌中的作用及其对临床结果的影响 | 肺腺癌(LUAD)及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单样本基因集富集分析(ssGSEA) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
635 | 2024-08-09 |
Evolution of Advanced Chronic Lymphoid Leukemia Unveiled by Single-Cell Transcriptomics: A Case Report
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.584607
PMID:33194728
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病例报告 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了慢性淋巴细胞白血病(CLL)在诊断和复发阶段的遗传和转录异质性 | 利用单细胞RNA测序技术,首次在CLL患者中发现了在治疗过程中克隆优势的重大转变,并揭示了与疾病进展相关的特定克隆和信号通路的激活 | 本研究仅基于单一病例,可能无法完全代表所有CLL患者的普遍情况 | 通过单细胞转录组学分析,揭示CLL的疾病异质性,以优化治疗方案 | 慢性淋巴细胞白血病(CLL)的遗传和转录异质性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 单一CLL病例,包括诊断和复发阶段的样本 |
636 | 2024-08-09 |
Identification of Differential Gene Groups From Single-Cell Transcriptomes Using Network Entropy
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.588041
PMID:33195248
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法DiffGE,利用网络熵来测量不同细胞类型间基因组的表达动态,并识别高度差异的基因组 | 采用网络熵作为测量工具,以识别不同细胞类型间高度差异的基因组 | NA | 揭示特定细胞类型间的转录差异 | 单细胞转录组数据中的差异基因组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的单细胞RNA-seq数据集 |
637 | 2024-08-09 |
Vertebrate Sensory Ganglia: Common and Divergent Features of the Transcriptional Programs Generating Their Functional Specialization
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.587699
PMID:33195244
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研究论文 | 本文总结了脊椎动物头部感觉神经节的普遍解剖结构、功能和神经多样性,并概述了控制感觉系统发育中神经发生和神经元分化的转录网络的当前知识,特别关注头部感觉神经节,强调其发育的特定方面并与躯干感觉神经节进行比较 | 利用单细胞RNA测序技术,近期研究在大多数感觉神经节的神经元多样性表征方面取得了显著进展 | 目前对不同头部感觉神经节胚胎发育的分子机制的理解仍然有限 | 探讨脊椎动物感觉神经节的转录程序及其功能特化的共同和差异特征 | 脊椎动物的感觉神经节及其相关的神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
638 | 2024-08-09 |
Spatio-temporal regulation of gene expression defines subpopulations of epidermal stem cells
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200740
PMID:33170265
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研究论文 | 本文探讨了表皮干细胞的基因表达时空调控及其在再生医学中的应用 | 引入了单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度和细胞熵等技术,揭示了表皮干细胞的高度异质性和可塑性 | 分离表皮干细胞与其后代仍然是一个挑战 | 探索表皮干细胞的可塑性及其在再生医学中的应用 | 表皮干细胞及其亚群角质形成细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、伪时间推断、RNA速度 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
639 | 2024-08-09 |
CaMKIIα-Positive Interneurons Identified via a microRNA-Based Viral Gene Targeting Strategy
2020-12-09, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2570-19.2020
PMID:33158963
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研究论文 | 本文介绍了一种基于microRNA的病毒基因靶向策略,用于识别表达CaMKIIα的阳性中间神经元 | 提出了一种新的病毒基因表达策略,使用microRNA引导的神经元标签(mAGNET)来靶向具有特定microRNA表达的细胞 | NA | 研究大脑细胞中基因表达的多样性,并探索基因表达与生理特性之间的关系 | 表达CaMKIIα的中间神经元及其生理特性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性和雌性小鼠 |
640 | 2024-08-09 |
Optimized Langendorff perfusion system for cardiomyocyte isolation in adult mouse heart
2020-12, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.15773
PMID:33147379
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research paper | 本文介绍了一种优化的Langendorff灌流系统,用于从成年小鼠心脏中分离心肌细胞 | 提出了一个简化和标准化的操作协议,利用重力作为灌流压力,并引入了新的去泡方法和消化终止标准 | NA | 改进Langendorff灌流系统,以提高心肌细胞的活性和纯度,满足单细胞测序技术的要求 | 成年小鼠心脏中的心肌细胞 | digital pathology | 心血管疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | 多次自然重力沉降后获得稳定的心肌细胞 |