单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-09 |
[Research frontiers in precision therapy for liver cancer]
2020-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）在精准治疗领域的最新进展，包括新型血清生物标志物的发现与应用、精准肝脏手术技术的改进以及分子靶向治疗和免疫治疗的结合 | 介绍了单细胞测序、基因组编辑和创新药物研发等技术革新对HCC生物学理解的加速作用，以及这些技术带来的新的治疗机会 | 肝细胞癌的高度异质性和治疗抵抗性仍然是未满足的医疗需求，需要更深入的疾病生物学研究和新型疗法 | 探讨肝细胞癌精准治疗的最新研究前沿，以提高患者生存率并寻找新的治疗突破 | 肝细胞癌（HCC）及其精准治疗策略 | NA | 肝癌 | 单细胞测序、基因组编辑 | NA | 血清生物标志物、影像数据 | NA |
| 602 | 2024-08-09 |
Single-cell network biology for resolving cellular heterogeneity in human diseases
2020-11, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00528-0
PMID:33244151
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综述 | 本文综述了单细胞网络生物学在解析人类疾病中细胞异质性的应用和进展 | 介绍了利用单细胞转录组数据进行网络生物学研究的新方法，以及其在精准医学中的潜在应用 | NA | 加速对细胞异质性的理解 | 细胞类型特异性的基因网络及其在疾病相关细胞类型和状态中的调控程序 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 603 | 2024-08-09 |
Microglia Diversity in Health and Multiple Sclerosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.588021
PMID:33240276
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在健康和多发性硬化症中的多样性及其对病理和修复的贡献 | 利用单细胞RNA测序和免疫细胞的质谱流式细胞术等技术，深入理解了微胶质细胞和巨噬细胞的表型变化 | NA | 探讨微胶质细胞在正常衰老和多发性硬化症中的异质性及其对免疫机制的影响 | 微胶质细胞和巨噬细胞在多发性硬化症中的功能多样性 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-08-09 |
The Expression Pattern and Clinical Significance of the Immune Checkpoint Regulator VISTA in Human Breast Cancer
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.563044
PMID:33250890
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研究论文 | 研究分析了免疫检查点调节因子VISTA在人乳腺癌中的表达模式及其临床意义 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌组织中VISTA的表达水平，并验证了其在乳腺癌免疫治疗中的潜在价值 | NA | 探讨VISTA在乳腺癌中的免疫调节作用及其对乳腺癌免疫治疗的潜在影响 | 人乳腺癌组织及其配对的正常细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14897个乳腺癌细胞和7320个正常细胞，以及324个人乳腺癌样本 |
| 605 | 2024-08-09 |
Vascular Heterogeneity With a Special Focus on the Hepatic Microenvironment
2020, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2020.591901
PMID:33262705
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术对血管异质性及其在不同组织中的复杂组成的深入分析，特别关注了肝脏微环境中的血管结构和功能 | NA | NA | 旨在总结不同血管床的变异性、内皮细胞的多样性以及支持细胞如何使血管实现其多种功能 | 血管组织的异质性，特别是内皮细胞和基质微环境的多样性及其在生理和病理条件下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 606 | 2024-08-09 |
In silico immune infiltration profiling combined with functional enrichment analysis reveals a potential role for naïve B cells as a trigger for severe immune responses in the lungs of COVID-19 patients
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0242900
PMID:33264345
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研究论文 | 本研究利用CIBERSORT-X方法评估COVID-19患者肺组织中的转录估计免疫浸润景观，并发现幼稚B细胞高度浸润，可能是导致过度活跃的体液免疫反应的主要原因。 | 首次揭示了幼稚B细胞在COVID-19患者肺组织中的高度浸润，并提出抑制幼稚B细胞可能是一种缓解COVID-19严重症状的新策略。 | 研究主要基于转录组数据和单细胞RNA测序数据，需要进一步的实验验证。 | 探讨SARS-CoV-2感染引起的免疫反应机制，特别是免疫细胞浸润在肺组织中的变化。 | COVID-19患者的肺组织和免疫细胞亚群。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | CIBERSORT-X | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 涉及COVID-19患者和特发性肺纤维化（IPF）患者的肺组织样本 |
| 607 | 2024-08-09 |
High-resolution mouse subventricular zone stem-cell niche transcriptome reveals features of lineage, anatomy, and aging
2020-12-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2014389117
PMID:33229571
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的转录组分析 | 首次对SVZ区域从小到老的干细胞进行了全面的单细胞RNA测序分析，揭示了不同年龄段干细胞的异质性和转录特征 | NA | 研究SVZ区域神经干细胞的异质性及其在不同年龄段的转录特征 | 小鼠SVZ区域的神经干细胞及其在不同年龄段的转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从小鼠SVZ区域从小到老的干细胞样本 |
| 608 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA Sequencing of Human Milk-Derived Cells Reveals Sub-Populations of Mammary Epithelial Cells with Molecular Signatures of Progenitor and Mature States: a Novel, Non-invasive Framework for Investigating Human Lactation Physiology
2020-12, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-020-09466-z
PMID:33216249
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人乳来源的乳腺上皮细胞，揭示了其亚群及其转录特征，为研究人类哺乳生理提供了一种新颖的非侵入性框架 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析人乳来源的乳腺上皮细胞，并提供了一个计算框架供未来研究使用 | 目前使用乳汁来源细胞研究人类乳腺生理的临床潜力和局限性 | 研究人乳中的细胞作为非侵入性材料，用于探索哺乳生理 | 人乳来源的乳腺上皮细胞及其转录特征 | 数字病理学 | 妊娠糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 3740个细胞来自两名产后两周的母亲的乳汁样本 |
| 609 | 2024-08-09 |
Author Correction: Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-seq reveals tissue architecture in pancreatic ductal adenocarcinomas
2020-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-020-00776-5
PMID:33230294
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-09 |
Deconvolution of cellular subsets in human tissue based on targeted DNA methylation analysis at individual CpG sites
2020-11-24, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-020-00910-4
PMID:33234153
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研究论文 | 本研究通过靶向DNA甲基化分析在单个CpG位点上对人类组织中的细胞亚群进行去卷积 | 本研究首次探讨了使用单个细胞类型特异性CpG位点进行靶向分析的可行性，并开发了基于这些位点的去卷积方法 | NA | 验证通过单个CpG位点的DNA甲基化分析来反映细胞混合物和不同组织中细胞组成的可行性 | 人类非恶性细胞类型及其在组织中的相对含量 | 数字病理学 | NA | DNA甲基化分析，pyrosequencing | NA | DNA甲基化数据 | 579个Illumina 450k BeadChip DNA甲基化数据集，涵盖14种不同的非恶性人类细胞类型 |
| 611 | 2024-08-09 |
Integrating transcriptomics and bulk time course data into a mathematical framework to describe and predict therapeutic resistance in cancer
2020-11-20, Physical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1088/1478-3975/abb09c
PMID:33215611
|
研究论文 | 本文提出了一种将机器学习模型的静态输出与治疗反应的动态模型相结合的框架，用于整合单细胞转录组数据和纵向的细胞群体数据，以描述和预测癌症治疗抵抗 | 首次明确地将单细胞克隆解析的转录组数据与批量时间序列数据结合，共同校准药物抵抗动力学的数学模型 | NA | 开发一种方法，将分散的数据集整合到全面的框架中，以生成最佳的临床决策 | 乳腺癌细胞 | 生物医学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 612 | 2024-08-09 |
Functional compensation precedes recovery of tissue mass following acute liver injury
2020-11-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19558-3
PMID:33214549
|
研究论文 | 本文研究了急性肝损伤后功能补偿在组织恢复前的作用机制 | 首次识别了急性肝损伤后功能补偿的新阶段，并揭示了依赖于巨噬细胞来源的WNT/β-catenin信号的适应性重编程机制 | NA | 探讨急性肝损伤后肝脏如何在组织恢复前维持重要生理功能 | 肝脏在急性损伤后的功能补偿机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个独立的小鼠肝损伤模型 |
| 613 | 2024-08-09 |
Opportunities for Single-Cell Sequencing Technologies and Data Science
2020-Nov-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12113433
PMID:33227959
|
研究论文 | 本特刊旨在强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 | NA | NA | 强调单细胞测序技术和数据分析领域的最新进展 | 单细胞测序技术和数据分析 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 614 | 2024-08-09 |
Bivalent genes that undergo transcriptional switching identify networks of key regulators of embryonic stem cell differentiation
2020-Nov-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07009-8
PMID:33208095
|
研究论文 | 本文开发了一种方法，通过检测单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的'双峰'基因表达模式，捕捉经历转录开关的基因，并结合染色质状态分析，识别出与细胞状态相关的双峰、双价基因模式。 | 本文提出了一种新的方法，通过分析接近活动边界（ON/OFF）的基因，从scRNA-seq数据中推断转录开关网络，这种方法补充了传统的scRNA-seq分析。 | NA | 研究胚胎干细胞分化过程中双价基因的转录开关及其调控网络。 | 胚胎干细胞中的双价基因及其在分化过程中的转录开关。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 隐马尔可夫模型 | 基因表达数据 | NA |
| 615 | 2024-08-09 |
I-Impute: a self-consistent method to impute single cell RNA sequencing data
2020-Nov-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07007-w
PMID:33208097
|
研究论文 | 本文提出了一种名为I-Impute的自一致性方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | I-Impute方法通过优化连续相似性和缺失概率，在迭代改进中达到自一致性，从而提高了填补效果 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据分析中缺失值填补的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括三个湿实验数据集：小鼠膀胱细胞、胚胎干细胞和主动脉白细胞 |
| 616 | 2024-08-09 |
Long-term skin-resident memory T cells proliferate in situ and are involved in human graft-versus-host disease
2020-11-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abb7028
PMID:33208504
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研究论文 | 研究揭示了人类皮肤中长期存在的组织驻留记忆T细胞在同种异体造血干细胞移植患者中的稳定性和功能，并探讨了其在移植物抗宿主病中的作用 | 首次展示了人类皮肤中长期存在的组织驻留记忆T细胞的稳定性和功能，并发现了RUNX3和galectin-3作为新的标记物 | 研究主要基于同种异体造血干细胞移植患者，可能不适用于其他疾病或健康人群 | 探讨人类皮肤中组织驻留记忆T细胞的生物学特性及其在移植物抗宿主病中的作用 | 人类皮肤中的组织驻留记忆T细胞及其在移植物抗宿主病中的作用 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者皮肤样本 |
| 617 | 2024-08-09 |
Alteration of tumor-associated macrophage subtypes mediated by KRT6A in pancreatic ductal adenocarcinoma
2020-11-18, Aging
DOI:10.18632/aging.104091
PMID:33221741
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研究论文 | 本研究通过分析基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据集，探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)亚型的变化及其潜在调控因子KRT6A。 | 发现了KRT6A作为差异表达基因，可能通过调控COL5A2、COL1A2、MIR3606、SPARC和COL6A3等基因影响TAMs亚型的组成，为PDAC的免疫治疗提供了新的靶点。 | NA | 阐明胰腺导管腺癌中肿瘤免疫微环境的组成和调控因子，寻找新的免疫治疗靶点。 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其邻近正常组织(ANT)中的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)亚型。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了GEO和TCGA数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中明确。 |
| 618 | 2024-08-09 |
A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2922-4
PMID:33208946
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，构建了人类肺部的分子细胞图谱 | 首次系统性地识别并定位了人类肺部所有分子细胞类型，包括14种先前未知的细胞类型 | NA | 创建一个全面的人类肺部细胞图谱，揭示肺细胞的生物化学功能及其在疾病和进化中的变化 | 人类肺部的细胞类型及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约75,000个人类肺部细胞和循环血液细胞 |
| 619 | 2024-08-09 |
SCRINSHOT enables spatial mapping of cell states in tissue sections with single-cell resolution
2020-11, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000675
PMID:33216742
|
研究论文 | SCRINSHOT技术通过单细胞分辨率在组织切片中实现细胞状态的空间映射 | 开发了SCRINSHOT技术，一种敏感的多重RNA映射方法，通过直接杂交padlock探针到mRNA上，随后通过SplintR连接酶进行环化并进行滚环扩增，实现对组织切片中单细胞的数千个细胞的序列检测 | NA | 研究细胞身份和位置的变化如何影响组织发育和疾病进展 | 小鼠和人类器官中的细胞类型及其空间分布 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq, 滚环扩增(RCA) | NA | mRNA | 小鼠和人类器官中的数千个细胞 |
| 620 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling Reveals Divergent, Globally Patterned Immune Responses in Murine Skin Inflammation
2020-Oct-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101582
PMID:33205009
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了在小鼠皮肤炎症模型中免疫细胞的异质性反应 | 首次揭示了不同炎症诱导剂在小鼠皮肤炎症中引起的全局分子模式差异 | NA | 探讨不同炎症诱导剂如何影响小鼠皮肤免疫细胞的转录反应 | 小鼠皮肤免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13种CD45亚群的免疫细胞 |