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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-07 |
Runx1 negatively regulates inflammatory cytokine production by neutrophils in response to Toll-like receptor signaling
2020-03-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019000785
PMID:32208490
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研究论文 | 本文研究了RUNX1在调节中性粒细胞通过Toll样受体信号产生炎症细胞因子中的负向作用 | 首次展示了RUNX1在调节中性粒细胞的TLR1/2和TLR4信号及炎症细胞因子产生中的作用 | 研究主要集中在体外和动物模型，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨RUNX1在调控中性粒细胞炎症反应中的作用及其在相关疾病中的潜在影响 | 中性粒细胞及其在TLR信号传导中的反应 | NA | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及骨髓中性粒细胞和肺组织的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 602 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the adult Drosophila midgut
2020-01-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916820117
PMID:31915294
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对成年果蝇中肠上皮细胞的转录组进行了表征，并识别出22个不同的细胞群 | 本研究通过无偏倚的方法恢复了大多数已知的肠道干细胞/成肠细胞和内分泌细胞标记，并揭示了肠道干细胞生物学、细胞类型特异性细胞器特征、新转录因子在祖细胞中的作用以及沿肠道区域的变异 | NA | 旨在提供一个全面的资源，用于解决中肠上皮中基因的功能 | 成年果蝇中肠上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 22个不同的细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 603 | 2024-08-07 |
Targeted Single-Cell RNA and DNA Sequencing With Fluorescence-Activated Droplet Merger
2020-11-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03059
PMID:33049138
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研究论文 | 本文介绍了一种利用荧光激活液滴合并技术进行靶向单细胞RNA和DNA测序的新方法 | 该方法通过选择性地合并细胞与试剂，实现酶促反应，无需物理隔离细胞，简化了单细胞工作流程 | NA | 旨在解决在分析异质性细胞群时，稀有细胞类型数据代表性不足的问题 | 特定细胞亚群的单细胞转录组和基因组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和DNA测序 | NA | RNA和DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 604 | 2024-08-07 |
m6A RNA methylation impacts fate choices during skin morphogenesis
2020-08-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.56980
PMID:32845239
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研究论文 | 研究m6A RNA甲基化在皮肤形态发生中的作用及其对细胞命运选择的影响 | 揭示了m6A修饰在编码序列中与增强翻译的相关性，特别是在关键形态发生信号通路中的作用 | NA | 探讨m6A RNA甲基化的功能及其在皮肤胚胎发生中的生理重要性 | 小鼠皮肤胚胎发生过程中的m6A RNA甲基化 | NA | NA | 单细胞转录组学和生物信息学 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-08-07 |
Self-Reporting Transposons Enable Simultaneous Readout of Gene Expression and Transcription Factor Binding in Single Cells
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.037
PMID:32710817
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞呼叫卡（scCC）的新技术，利用自报告转座子（SRTs）在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点（TFBS） | 首次实现了在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点，为研究细胞异质性和转录因子生物学提供了新方法 | NA | 开发一种新技术，能够在单细胞水平上同时测量基因表达和转录因子结合位点 | 单细胞中的基因表达和转录因子结合位点 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA | 多个转录因子和K562细胞，以及小鼠大脑皮层的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2024-08-07 |
Developmental trajectory of prehematopoietic stem cell formation from endothelium
2020-08-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020004801
PMID:32392346
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，探索了从小鼠胚胎尾部动脉的血管内皮细胞到造血干细胞前体的发育轨迹 | 首次识别出从内皮细胞到造血干细胞前体的连续发育轨迹，并定义了一个新的中间阶段——pre-HE细胞，该阶段具有特定的染色质可及性和转录因子富集 | NA | 探究造血干细胞前体形成的细胞和分子转变过程 | 小鼠胚胎的尾部动脉（背主动脉、脐动脉、卵黄动脉）中的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 细胞 | 约40,000个细胞从小鼠胚胎的9.5天到11.5天 | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-08-07 |
Therapy-induced mutations drive the genomic landscape of relapsed acute lymphoblastic leukemia
2020-01-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019002220
PMID:31697823
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研究论文 | 研究急性淋巴细胞白血病（ALL）复发机制，通过全基因组测序和超深度测序分析复发特异性体细胞变异 | 发现了两种新的复发特异性突变特征，其中一种与硫嘌呤治疗有关，这些特征在非ALL的复发样本和泛癌诊断样本中未见 | 研究主要集中在特定基因和突变特征上，可能未涵盖所有影响ALL复发的因素 | 探究急性淋巴细胞白血病复发机制及其与治疗诱导突变的关系 | 急性淋巴细胞白血病患者的诊断-复发-胚系三联体和连续样本 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，超深度测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 103个诊断-复发-胚系三联体和16名患者的208个连续样本 | NA | NA | NA | NA |
| 608 | 2024-08-07 |
EPISCORE: cell type deconvolution of bulk tissue DNA methylomes from single-cell RNA-Seq data
2020-09-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02126-9
PMID:32883324
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研究论文 | 本文介绍了一种名为EPISCORE的计算算法，用于从单细胞RNA测序数据中对大量组织DNA甲基化数据进行细胞类型反卷积 | EPISCORE算法通过应用概率性的表观遗传模型，利用单细胞RNA测序组织图谱生成组织特异性的DNA甲基化参考矩阵，从而实现对大量组织数据的细胞类型比例和细胞类型特异性差异甲基化信号的量化 | NA | 开发一种算法，用于解决细胞类型异质性对表观基因组数据解释的挑战 | 大量组织DNA甲基化数据和单细胞RNA测序数据 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率性表观遗传模型 | DNA甲基化数据 | 多个表观基因组研究和组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-08-07 |
MYC Drives Temporal Evolution of Small Cell Lung Cancer Subtypes by Reprogramming Neuroendocrine Fate
2020-07-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.05.001
PMID:32473656
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞转录组分析，揭示了MYC在小细胞肺癌亚型动态演化中的驱动作用 | 首次揭示了MYC通过激活Notch信号通路，促使小细胞肺癌从ASCL1到NEUROD1再到YAP1状态的时间性转变 | NA | 探讨MYC在小细胞肺癌亚型演化中的作用机制 | 小细胞肺癌的分子亚型及其动态演化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-07 |
A single-cell landscape of high-grade serous ovarian cancer
2020-08, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0926-0
PMID:32572264
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了11名高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者腹水样本中的约11,000个细胞，全面表征了HGSOC腹水生态系统 | 发现了腹水细胞组成的显著患者间变异性，包括免疫调节性成纤维细胞亚群和二分法巨噬细胞群体，并揭示了恶性细胞的异质性部分由异质性拷贝数改变模式或干细胞程序表达所解释 | NA | 全面表征高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）腹水生态系统 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者的腹水细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 22个腹水样本，11名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of the Intestinal Epithelium
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0747-3_8
PMID:32705639
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review | 本文综述了单细胞转录组学技术在研究小鼠小肠上皮细胞中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术使得能够在细胞水平上研究异质性生物系统 | NA | 探讨单细胞转录组学在小鼠小肠上皮细胞研究中的基本原理和实验设计 | 小鼠小肠上皮细胞 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | NA | NA | NA | NA | NA |
| 612 | 2024-08-07 |
Direct-seq: programmed gRNA scaffold for streamlined scRNA-seq in CRISPR screen
2020-Jun-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02044-w
PMID:32513233
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Direct-seq的方法，通过在gRNA支架中引入A/G混合捕获序列，实现gRNA转录本与内源mRNA的直接逆转录，从而在单细胞RNA测序中进行高内涵分子表型分析 | Direct-seq方法创新性地将CRISPR扰动及其转录输出在简化的工作流程中同时进行分析 | NA | 开发一种新的方法，以便在CRISPR筛选中方便地改变DNA序列、转录和表观遗传修饰后，能够以高分辨率和规模进行复杂的分子输出分析 | CRISPR-based genome perturbation及其转录输出 | 基因组学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of a mutant library generated using CRISPR-guided deaminase in human melanoma cells
2020-Apr-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0888-2
PMID:32242071
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研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR RNA引导的脱氨酶和单细胞RNA测序技术的新平台，用于在多个基因中引入突变并评估突变相关信号 | 本文首次将CRISPR RNA引导的脱氨酶与单细胞RNA测序技术结合，用于评估替代突变 | 目前该平台仅在人黑色素瘤细胞系中进行了测试，尚未应用于其他细胞类型或疾病 | 开发一种新的平台，用于在多个基因中引入突变并评估突变相关信号 | 人黑色素瘤细胞系 | 基因编辑 | 黑色素瘤 | CRISPR-guided deaminase, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 420个sgRNAs | NA | NA | NA | NA |
| 614 | 2024-08-07 |
Single cell characterization of B-lymphoid differentiation and leukemic cell states during chemotherapy in ETV6-RUNX1-positive pediatric leukemia identifies drug-targetable transcription factor activities
2020-11-20, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00799-2
PMID:33218352
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中B淋巴细胞分化和白血病细胞状态在化疗期间的变化，并确定了可作为药物靶点的转录因子活性。 | 本文首次通过单细胞RNA测序技术揭示了ETV6-RUNX1阳性白血病中B淋巴细胞分化路径上的转录因子活性，并发现了与化疗耐药性相关的细胞周期状态和分化相关调控网络的变化。 | NA | 研究ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中B淋巴细胞分化和白血病细胞状态在化疗期间的变化，并确定可作为药物靶点的转录因子活性。 | ETV6-RUNX1阳性儿童白血病中的B淋巴细胞分化和白血病细胞状态。 | 数字病理学 | 儿童白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in bladder urothelial carcinoma
2020-10-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18916-5
PMID:33033240
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析膀胱尿路上皮癌样本，揭示了肿瘤微环境中细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示膀胱尿路上皮癌中炎症相关成纤维细胞（iCAFs）在肿瘤进展中的作用及其与不良预后的关联 | NA | 探究膀胱尿路上皮癌中肿瘤微环境的作用及其对临床预后的影响 | 膀胱尿路上皮癌的肿瘤微环境及其中不同细胞类型的功能 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8个肿瘤样本和3个肿瘤旁样本 | NA | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis of tumor and stromal compartments of pancreatic ductal adenocarcinoma primary tumors and metastatic lesions
2020-09-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00776-9
PMID:32988401
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌（PDAC）原发肿瘤和转移病灶中的肿瘤和基质成分的转录组 | 首次对PDAC原发肿瘤和转移病灶的单细胞转录组进行了全面分析，并使用了一种新的监督分类算法SuperCT来识别不同的细胞类型 | 研究主要集中在原发肿瘤和转移病灶的组织样本上，未涉及其他类型的样本 | 深入了解胰腺导管腺癌的细胞组成及其与疾病进展和患者预后的关系 | 胰腺导管腺癌的原发肿瘤和转移病灶中的肿瘤细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | SuperCT | 转录组 | 来自PDAC患者的原发肿瘤和转移活检样本中的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 617 | 2024-08-07 |
Frataxin gene editing rescues Friedreich's ataxia pathology in dorsal root ganglia organoid-derived sensory neurons
2020-08-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17954-3
PMID:32826895
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研究论文 | 本文通过体外分化人诱导多能干细胞（iPSCs）生成背根神经节类器官（DRG organoids），并研究了弗里德赖希共济失调（FRDA）病理学中Frataxin基因编辑的修复作用。 | 首次展示了通过去除FXN基因第一内含子中的抑制染色质，可以恢复FXN总表达并完全逆转FRDA背根神经节神经元的病理特征。 | NA | 研究Frataxin基因编辑在修复弗里德赖希共济失调病理学中的作用。 | 背根神经节类器官（DRG organoids）及其衍生的感觉神经元。 | 数字病理学 | 弗里德赖希共济失调 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人诱导多能干细胞（iPSCs） | NA | NA | NA | NA |
| 618 | 2024-08-07 |
CD200 promotes immunosuppression in the pancreatic tumor microenvironment
2020-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2019-000189
PMID:32581043
|
研究论文 | 本文研究了CD200在胰腺肿瘤微环境中促进免疫抑制的作用 | 首次揭示了CD200在胰腺导管腺癌（PDAC）微环境中通过促进髓源抑制细胞（MDSC）的扩增和活性来限制免疫治疗反应 | NA | 探讨CD200在胰腺导管腺癌微环境中的免疫抑制作用及其对免疫治疗反应的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括人类胰腺癌细胞系、患者血液样本、小鼠肿瘤模型及健康捐赠者的外周血单个核细胞（PBMC） | NA | NA | NA | NA |
| 619 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Mouse Liver Cell-Specific Tropism and Transcriptional Dysregulation Following Intravenous Administration of AAVrh.10 Vectors
2020-05, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2019.366
PMID:32143547
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了静脉注射AAVrh.10载体后小鼠肝脏细胞特异性趋向性和转录失调 | 首次详细描述了AAVrh.10载体在小鼠肝脏细胞中的特异性趋向性和转录失调情况 | 仅限于小鼠模型，且样本量相对较小 | 评估AAVrh.10载体在肝脏细胞中的特异性趋向性和转录失调 | 小鼠肝脏细胞 | 基因工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共46,500个肝脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2024-08-07 |
Tissue substructure-specific deposition of the β3-containing laminin-332 in the biliary epithelium of human and mouse livers
2020-04-02, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2020.01.104
PMID:32008745
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研究论文 | 本文通过分析公开的单细胞RNA测序数据库，揭示了人肝细胞中层粘连蛋白基因的表达情况，特别是层粘连蛋白-332亚基在胆道上皮细胞中的共表达情况，并探讨了其在肝脏中的功能和潜在的病理生理作用。 | 首次揭示了层粘连蛋白-332亚基在胆道上皮细胞中的异质性表达，并证实了其在小鼠肝脏中的异质性表达与胆道上皮细胞的形态学亚结构有关。 | 研究主要基于公共数据库的分析，缺乏直接的实验验证，且仅探讨了生理条件下的功能，未涉及病理条件下的作用。 | 探讨层粘连蛋白-332亚基在胆道上皮细胞中的表达及其在肝脏中的功能和潜在的病理生理作用。 | 人肝细胞和胆道上皮细胞中的层粘连蛋白-332亚基表达情况。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |