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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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581 | 2024-08-09 |
Shifts of Immune Cell Populations Differ in Response to Different Effectors of Beige Remodeling of Adipose Tissue
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101765
PMID:33294778
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,全面分析了白色脂肪组织在Adrb3和冷诱导的米色重塑过程中的细胞动态变化。 | 揭示了Adrb3和冷诱导的米色重塑过程中细胞组成和转录状态的显著变化,并发现冷刺激导致免疫细胞从髓系向淋巴系转移。 | NA | 探讨不同效应因子诱导的米色脂肪组织重塑过程中免疫细胞群的变化。 | 白色脂肪组织在Adrb3和冷诱导的米色重塑过程中的细胞动态变化。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
582 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Dissects the Replicating Process of Pancreatic Beta Cells in Partial Pancreatectomy Model
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101774
PMID:33294783
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了部分胰腺切除模型中胰腺β细胞的复制过程的转录动态 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胰腺β细胞复制过程中的基因表达异质性和细胞周期转换 | NA | 探究成人胰腺中β细胞质量恢复的分子机制 | 胰腺β细胞的复制过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠胰腺组织 |
583 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing-Enabled Hexokinase 2 Assay for Noninvasive Bladder Cancer Diagnosis and Screening by Detecting Rare Malignant Cells in Urine
2020-12-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c04282
PMID:33269906
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞测序的己糖激酶2(HK2)检测方法,用于非侵入性膀胱癌诊断和筛查 | 该方法通过检测尿液中罕见的恶性细胞,提高了膀胱癌诊断的敏感性和特异性 | 需要进一步研究以验证该方法在更大规模人群中的应用效果 | 开发一种非侵入性且敏感的膀胱癌诊断方法 | 尿液中的恶性细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序(SCS) | NA | 细胞 | 训练集包含8名尿路上皮癌患者的385个细胞样本,验证集包含384名患者,健康组包含846名健康个体 |
584 | 2024-08-09 |
Neuronal differentiation strategies: insights from single-cell sequencing and machine learning
2020-12-08, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.193631
PMID:33293292
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假设性文章 | 本文探讨了利用单细胞测序技术和机器学习改进神经元分化策略的方法 | 提出了一种结合单细胞测序技术和机器学习的选择编程因子序列的方法,以改善神经元分化过程 | 当前的分化协议通常导致部分分化的细胞或产生多种细胞类型的混合 | 克服现有神经元分化方法的低效率,提高分化协议的效果 | 神经元分化过程中的编程因子选择 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
585 | 2024-08-09 |
Thymic iNKT single cell analyses unmask the common developmental program of mouse innate T cells
2020-12-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20073-8
PMID:33288744
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了超过10,000个胸腺不变自然杀伤T细胞的分化过程,揭示了这些细胞的成熟、功能和命运决策 | 研究发现胸腺不变自然杀伤T细胞与黏膜相关不变T细胞之间存在共同的转录谱,并揭示了Hivep3转录因子在早期前体中的表达及其对iNKT细胞增殖、分化和功能的影响 | NA | 研究胸腺中不变自然杀伤T细胞的分化过程及其共同发育程序 | 胸腺不变自然杀伤T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过10,000个胸腺不变自然杀伤T细胞 |
586 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of a Postmenopausal Normal Breast Tissue Identifies Multiple Cell Types That Contribute to Breast Cancer
2020-Dec-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123639
PMID:33291647
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自绝经后正常乳腺组织的3193个单细胞,识别出多种与乳腺癌相关的细胞类型 | 首次全面分析了绝经后正常乳腺组织中的非上皮细胞类型,并探讨了这些细胞类型在乳腺癌中的潜在作用 | 研究样本仅来自单一的绝经后乳腺组织,可能无法代表所有乳腺组织的情况 | 探究绝经后正常乳腺组织中的细胞组成及其在乳腺癌中的作用 | 绝经后正常乳腺组织中的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3193个单细胞 |
587 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals CD16- monocytes as key regulators of human monocyte transcriptional response to Toxoplasma
2020-12-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-78250-0
PMID:33273621
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研究论文 | 本研究使用单细胞双RNA测序技术(scDual-Seq)首次全面定义了人类单核细胞与弓形虫相互作用中的转录反应 | 首次使用单细胞双RNA测序技术在单细胞水平上全面定义了人类单核细胞与弓形虫的相互作用 | NA | 深入理解人类单核细胞与弓形虫相互作用的分子机制,以加速开发新型人类弓形虫病控制策略 | 人类单核细胞与弓形虫的相互作用 | 数字病理学 | 弓形虫病 | 单细胞双RNA测序(scDual-Seq) | NA | 转录组数据 | 涉及单个单核细胞样本 |
588 | 2024-08-09 |
Tumor-promoting macrophages prevail in malignant ascites of advanced gastric cancer
2020-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-020-00538-y
PMID:33277616
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了胃癌恶性腹水中的肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞的细胞特征 | 首次揭示了胃癌恶性腹水中巨噬细胞的非炎症特性,并展示了这些特性与胃癌预后的关联 | 样本量较小,仅分析了四个恶性腹水样本和一个脑脊液样本 | 探索胃癌恶性腹水中细胞的特征,以优化治疗策略 | 胃癌恶性腹水中的肿瘤细胞、巨噬细胞和间皮细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 分析了180个细胞,包括肿瘤细胞、巨噬细胞和间皮细胞 |
589 | 2024-08-09 |
Alternative Polyadenylation: a new frontier in post transcriptional regulation
2020-Nov-25, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00249-6
PMID:33292571
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综述 | 本文综述了选择性多聚腺苷酸化(APA)这一重要的转录后调控机制,及其在RNA加工、细胞功能和疾病调控中的作用 | 介绍了现代高通量技术如下一代测序(NGS)和单细胞测序技术在APA研究中的应用 | APA的许多生物学过程仍未知,需要进一步研究 | 综述APA的当前知识及其调控机制,并探讨APA研究的未来方向 | 选择性多聚腺苷酸化及其调控因子 | NA | NA | 下一代测序(NGS) | NA | NA | NA |
590 | 2024-08-09 |
Osteopontin Links Myeloid Activation and Disease Progression in Systemic Sclerosis
2020-11-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100140
PMID:33294861
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研究论文 | 本文探讨了骨桥蛋白(OPN)在系统性硬化症(SSc)患者中与髓系细胞激活和疾病进展的关系 | 首次证明了免疫复合物(ICs)通过激活人单核细胞并促进肺成纤维细胞迁移,部分通过OPN分泌,以及OPN与单核细胞集落刺激因子和白细胞介素-6的相互作用 | NA | 揭示系统性硬化症中肺纤维化的潜在机制 | 系统性硬化症患者的肺纤维化 | NA | 系统性硬化症 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 系统性硬化症患者的肺组织和血清样本 |
591 | 2024-08-09 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
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研究论文 | 本文开发了一种名为DSAVE的方法,用于评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | DSAVE方法利用下采样消除采样噪声差异,并使用基于对数似然度的度量来帮助识别错误分类的细胞 | NA | 评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的错误分类细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
592 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Receptors and Entry Genes Are Expressed in the Human Olfactory Neuroepithelium and Brain
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101839
PMID:33251489
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2受体和进入基因在人类嗅觉神经上皮和大脑中的表达 | 首次发现嗅觉神经上皮中的支持细胞表达SARS-CoV-2受体ACE2和TMPRSS2,可能是病毒进入神经系统的一个潜在入口 | NA | 验证嗅觉神经上皮是否为SARS-CoV-2的靶点,并探讨其在神经系统中的潜在作用 | 人类嗅觉神经上皮和支持细胞,以及特定脑细胞类型 | NA | COVID-19 | RNA-seq | NA | RNA | 人类和鼠类的嗅觉组织及脑细胞 |
593 | 2024-08-09 |
New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20191255
PMID:33259583
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在理解心脏纤维化和心力衰竭发展中的应用 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)提供了一个新的平台,用于识别可能驱动心脏纤维化和心力衰竭发展的新的细胞和分子主角 | 讨论了在解释scRNA-seq数据时的一些关键考虑因素及其局限性 | 理解心脏纤维化和心力衰竭的发展 | 心脏细胞景观及其在心脏纤维化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
594 | 2024-08-09 |
Single-Cell Immune Profiling in Coronary Artery Disease: The Role of State-of-the-Art Immunophenotyping With Mass Cytometry in the Diagnosis of Atherosclerosis
2020-12-15, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.120.017759
PMID:33251927
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综述 | 本文综述了心血管免疫学的重要进展,并总结了免疫系统与动脉粥样硬化之间的临床证据 | 介绍了质谱流式细胞术和单细胞RNA测序等高分辨率技术在早期动脉粥样硬化诊断中的应用 | 主要血清生物标志物的特异性较低 | 探讨新的诊断和治疗方法,以改善冠状动脉疾病的早期检测和干预 | 冠状动脉疾病及其相关免疫细胞亚型 | NA | 心血管疾病 | 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞数据 | NA |
595 | 2024-08-09 |
Decoding the Heterogeneity of Human Dendritic Cell Subsets
2020-12, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2020.10.002
PMID:33250080
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,探讨了人类树突状细胞(DCs)的新亚群及其在基于发育的分类中的位置 | 利用高吞吐量的单细胞方法,特别是在转录组水平上揭示了人类DCs的进一步异质性 | NA | 研究人类树突状细胞的新亚群及其特征 | 人类树突状细胞的亚群及其分类 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
596 | 2024-08-09 |
muscat detects subpopulation-specific state transitions from multi-sample multi-condition single-cell transcriptomics data
2020-11-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19894-4
PMID:33257685
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研究论文 | 本文探讨了在多样本多条件单细胞转录组数据中检测亚群特异性状态转换的方法 | 开发了一种灵活的模拟方法来评估跨条件差异状态分析的方法性能,并提供了muscat R包中的多条件分析工具 | NA | 评估和比较不同统计框架在跨条件差异状态分析中的表现 | 单细胞RNA测序数据中的亚群特异性响应 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 混合模型 | 转录组数据 | 涉及小鼠皮质细胞的scRNA-seq数据 |
597 | 2024-08-09 |
Atherosclerosis in Different Vascular Locations Unbiasedly Approached with Mouse Genetics
2020-11-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11121427
PMID:33260687
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研究论文 | 本文探讨了不同血管位置的动脉粥样硬化与遗传因素之间的关系,并利用小鼠模型进行无偏倚的遗传学研究 | 通过全基因组关联研究揭示了人类颈动脉斑块和冠状动脉疾病相关的遗传位点不重叠,表明不同位置可能涉及不同的遗传途径。此外,单细胞转录组分析揭示了一小群对炎症刺激“超响应”的血管平滑肌细胞 | 物种差异限制了小鼠模型的直接应用 | 研究不同血管位置动脉粥样硬化的遗传机制 | 不同血管位置的动脉粥样硬化及其遗传影响因素 | NA | 心血管疾病 | 全基因组关联研究、单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 小鼠模型 |
598 | 2024-08-09 |
An allosteric interleukin-1 receptor modulator mitigates inflammation and photoreceptor toxicity in a model of retinal degeneration
2020-Nov-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02032-8
PMID:33246504
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研究论文 | 本文研究了一种变构白细胞介素-1受体调节剂在视网膜退化模型中减轻炎症和光感受器毒性的作用 | 首次验证了变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela在抑制有害炎症反应和保护光感受器密度及功能方面的有效性 | NA | 验证白细胞介素-1β在神经视网膜退化中的重要性,并评估变构白细胞介素-1受体调节剂rytvela的疗效 | 小鼠视网膜在蓝光诱导下的退化 | NA | 视网膜退化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠样本,具体数量未详述 |
599 | 2024-08-09 |
Single cell profiling of capillary blood enables out of clinic human immunity studies
2020-11-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-77073-3
PMID:33239690
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研究论文 | 本文开发了一种利用多重单细胞测序和非临床毛细血管血液提取的平台,以简化、低成本地对人类免疫系统进行单细胞分辨率的跨时间和人群的分析 | 本文创新地利用了多重单细胞测序技术,结合非临床毛细血管血液提取,实现了对人类免疫系统的单细胞分辨率分析 | NA | 研究目的是更好地理解基因表达在不同免疫细胞类型中的时间性和个体间变异性 | 研究对象是人类免疫系统中的基因表达变异性 | 数字病理学 | NA | 多重单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个受试者的毛细血管血液样本 |
600 | 2024-08-09 |
Expression profiles revealed potential kidney injury caused by SARS-CoV-2: a systematic analysis of ACE2 and clinical lessons learned from this discovery
2020-11-21, Aging
DOI:10.18632/aging.202224
PMID:33234728
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研究论文 | 本研究通过系统分析ACE2表达和临床数据,揭示了COVID-19可能导致的肾脏损伤 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析,展示了冠状病毒可能直接结合ACE2阳性细胞并损伤肾脏组织 | 研究样本仅限于特定时间段内武汉市某医院的119名COVID-19阳性患者,可能存在地域和时间限制 | 全面理解COVID-19对肾脏损伤的影响 | COVID-19患者的肾脏功能及ACE2在肾脏组织中的分布 | NA | COVID-19 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 119名COVID-19阳性患者 |