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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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561 | 2024-08-09 |
Elevated TUBA1A Might Indicate the Clinical Outcomes of Patients with Gastric Cancer, Being Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment
2020-Dec-12, Journal of gastrointestinal and liver diseases : JGLD
IF:2.1Q3
DOI:10.15403/jgld-2834
PMID:33331338
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研究论文 | 本研究评估了TUBA1A在胃癌中的表达及其对临床结果的影响,特别是与肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的关联 | 首次探讨了TUBA1A与胃癌患者生存和临床病理特征的关系,以及其在肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的作用 | NA | 探究TUBA1A在胃癌中的表达及其对患者生存和临床病理特征的影响 | 胃癌患者及正常样本中的TUBA1A表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 基因集富集分析(GSEA) | NA | RNA测序数据 | 1881个样本,包括1618名胃癌患者和263个正常样本 |
562 | 2024-08-09 |
Creation of bladder assembloids mimicking tissue regeneration and cancer
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-3034-x
PMID:33328632
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研究论文 | 本文通过重组组织干细胞与基质成分,创建了多层膀胱'装配体',模拟成熟器官结构和相关组织微环境,并开发了恶性肿瘤装配体以重现体内尿路上皮癌的病理生理特征。 | 本文创新性地创建了模拟成熟膀胱结构和功能的膀胱装配体,并开发了恶性肿瘤装配体,揭示了FOXA1-BMP-hedgehog信号反馈轴在肿瘤可塑性控制中的重要性。 | NA | 研究旨在开发新型组织模型,以更好地模拟成熟器官结构和功能,并探索肿瘤发展的分子机制。 | 膀胱组织装配体及其恶性肿瘤对应物。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA |
563 | 2024-08-09 |
Redox Regulator GLRX Is Associated With Tumor Immunity in Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.580934
PMID:33329553
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研究论文 | 本研究旨在探讨谷氧还蛋白在胶质瘤中的转录组水平作用及其临床预后价值 | 发现谷氧还蛋白在恶性胶质瘤中高度富集,并与肿瘤免疫微环境密切相关,可能增强胶质瘤免疫治疗的疗效 | NA | 阐明谷氧还蛋白在胶质瘤中的生物学功能及其临床预后价值 | 谷氧还蛋白在胶质瘤中的作用及其临床预后价值 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析,单细胞测序 | NA | 转录组数据,单细胞测序数据 | 1717个胶质瘤样本,6个胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
564 | 2024-08-09 |
Integrative Analysis Extracts a Core ceRNA Network of the Fetal Hippocampus With Down Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.565955
PMID:33329702
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研究论文 | 本研究通过综合分析提取了与唐氏综合症胎儿海马体相关的核心ceRNA网络 | 首次描绘了唐氏综合症中circRNAs的图谱,并有效整合了ceRNA调控与单细胞RNA测序数据 | NA | 探究唐氏综合症神经病理学的分子机制或治疗靶点 | 唐氏综合症胎儿海马体中的circRNAs、miRNAs和mRNAs | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 唐氏综合症患者8例,对照组6例 |
565 | 2024-08-09 |
EC-PGMGR: Ensemble Clustering Based on Probability Graphical Model With Graph Regularization for Single-Cell RNA-seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.572242
PMID:33329710
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研究论文 | 本文提出了一种基于概率图模型和图正则化的集成聚类算法EC-PGMGR,用于单细胞RNA测序数据 | EC-PGMGR算法通过概率图模型自动确定聚类数目,并通过添加正则化项减少弱基础聚类结果的影响,实现了自调节权重组合的预学习过程 | 集成聚类方法的结果依赖于基础聚类结果,且集成系统通常不具有自调节能力 | 设计一种鲁棒的无监督聚类方法,以提高聚类准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率图模型 | RNA-seq数据 | 涉及7个数据集,单细胞数量从822到5,132 |
566 | 2024-08-09 |
Plant stem-cell organization and differentiation at single-cell resolution
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2018788117
PMID:33318187
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)对玉米茎尖干细胞微环境及其分化后代进行了无偏差的转录组景观分析 | 发现玉米茎尖干细胞并不存在传统的干细胞组织中心,并且通过轨迹推断揭示了基因表达变化伴随细胞分化的过程 | NA | 研究植物干细胞的组织和分化 | 玉米茎尖干细胞及其分化细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
567 | 2024-08-09 |
Human embryonic stem cell-derived organoid retinoblastoma reveals a cancerous origin
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2011780117
PMID:33318192
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研究论文 | 本研究开发了一种基于遗传工程人胚胎干细胞(hESCs)衍生的视网膜类器官的视网膜母细胞瘤(Rb)模型,揭示了Rb的癌变起源 | 首次在视网膜类器官中建立了Rb的癌变模型,并通过单细胞测序和免疫染色验证了Rb起源于ARR3阳性成熟锥体前体细胞 | NA | 建立视网膜母细胞瘤的类器官模型,探索其细胞起源并测试新的候选治疗药物 | 视网膜母细胞瘤的细胞起源和治疗策略 | 数字病理学 | 儿童眼内恶性肿瘤 | 单细胞测序 | 类器官模型 | 基因组甲基化数据 | NA |
568 | 2024-08-09 |
Longitudinal Multi-omics Analyses Identify Responses of Megakaryocytes, Erythroid Cells, and Plasmablasts as Hallmarks of Severe COVID-19
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.017
PMID:33296687
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析,揭示了严重COVID-19患者中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的反应特征 | 首次在严重COVID-19患者中识别出巨核细胞和红细胞的扩展以及浆母细胞的增殖,这些特征与疾病结局相关 | 研究样本量较小,且仅限于两个中心的患者 | 理解严重COVID-19的免疫反应偏斜并定义疾病结局的预测因子 | 严重COVID-19患者的免疫细胞反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 多组学分析 | NA | 转录组、DNA甲基化组和单细胞转录组数据 | 14名患者,包括超过358,000个细胞 |
569 | 2024-08-09 |
Olfactomedin 4 mediation of prostate stem/progenitor-like cell proliferation and differentiation via MYC
2020-12-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-78774-5
PMID:33318499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了嗅觉蛋白4(OLFM4)在正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞(RWPE1)中的表达及其生理功能。 | 首次揭示了OLFM4在前列腺上皮细胞中的表达模式及其在干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 | NA | 研究OLFM4在前列腺干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 | 正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞(RWPE1)中的OLFM4表达细胞。 | NA | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个干细胞/祖细胞样细胞群 |
570 | 2024-08-09 |
Stromal Cells Exhibit Prevalent Genetic Aberrations in Colorectal Cancer
2020-12-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.11.003
PMID:33321084
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中基质细胞的遗传异常 | 首次结合多组学单细胞测序技术,揭示了结直肠癌基质细胞群体中的普遍遗传改变 | NA | 研究肿瘤微环境中基质细胞的遗传变化对肿瘤进展的影响 | 结直肠癌中的基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学单细胞测序 | NA | 遗传数据 | NA |
571 | 2024-08-09 |
Mouse embryonic stem cells self-organize into trunk-like structures with neural tube and somites
2020-12-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba4937
PMID:33303587
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研究论文 | 本文研究了多能性小鼠胚胎干细胞(mESCs)在体外形成高度组织的“躯干样结构”(TLSs),包含神经管和体节的过程 | 通过单细胞RNA测序分析,证实了这一过程与小鼠发育高度相似,并遵循相同的逐步基因调控程序 | NA | 探究胚胎植入后胚胎发生过程 | 小鼠胚胎干细胞的自组织能力及其形成的结构 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
572 | 2024-08-09 |
Trajectory of chemical cocktail-induced neutrophil reprogramming
2020-12-10, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-020-01008-8
PMID:33302977
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研究论文 | 本研究利用遗传追踪方法CellTagging和单细胞RNA测序技术,揭示了化学混合物诱导的中性粒细胞重编程轨迹 | 首次报道了中性粒细胞可以被重编程为多能祖细胞,并在体外和体内获得多向分化潜能 | NA | 研究化学混合物诱导的造血细胞重编程过程 | 中性粒细胞的重编程轨迹 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | NA |
573 | 2024-08-09 |
Global immune characterization of HBV/HCV-related hepatocellular carcinoma identifies macrophage and T-cell subsets associated with disease progression
2020-Dec-08, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00214-5
PMID:33298893
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV/HCV相关肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境中的免疫细胞异质性及其动态变化 | 首次在单细胞水平上揭示了HBV/HCV相关HCC中免疫细胞的复杂网络,并识别出与疾病进展相关的特定巨噬细胞和T细胞亚群 | NA | 探究HBV/HCV相关肝细胞癌中免疫细胞的异质性及其与疾病进展的关系 | HBV/HCV相关肝细胞癌中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 41,698个免疫细胞来自七对HBV/HCV相关HCC肿瘤和非肿瘤肝组织 |
574 | 2024-08-09 |
Characterization and generation of human definitive multipotent hematopoietic stem/progenitor cells
2020-Dec-01, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00213-6
PMID:33298886
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,解析了人类早期造血阶段的多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)的特征,并从人类胚胎干细胞(hESCs)中生成了这些细胞 | 首次详细描述了人类早期造血过程中的分子特征,并发现了CD44在区分早期原始和确定性造血中的特异性作用 | NA | 深入理解人类早期造血过程,并为临床目的生成血液和免疫细胞提供基础 | 人类多能造血干细胞/祖细胞(HSPCs)及其在早期造血过程中的特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
575 | 2024-08-09 |
Evolving insights: how DNA repair pathways impact cancer evolution
2020-11-15, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了DNA修复途径如何影响癌症进化的最新发现 | 利用单细胞测序等新技术深入理解癌症进化及其与DNA修复的关系 | NA | 探讨DNA修复对癌症进化的影响及其在临床治疗中的应用 | 癌症进化及其与DNA修复的关系 | NA | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
576 | 2024-08-09 |
Single-cell rna seq analysis identifies the biomarkers and differentiation of chondrocyte in human osteoarthritis
2020, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:33312370
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术识别骨关节炎中软骨细胞的生物标志物及其分化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨关节炎中不同类型软骨细胞的表达谱,并预测了与软骨细胞增殖和分化紧密相关的关键基因 | NA | 识别骨关节炎中软骨细胞的潜在标志物并探索不同类型软骨细胞在骨关节炎中的功能 | 骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 480个软骨细胞样本 |
577 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Glioblastoma Reveals Central Nervous System Susceptibility to SARS-CoV-2
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.566599
PMID:33312949
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了胶质母细胞瘤对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 揭示了SARS-CoV-2神经侵袭的机制,并指出了神经系统细胞对SARS-CoV-2的易感性 | NA | 探讨中枢神经系统对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及胶质母细胞瘤和正常脑组织样本 |
578 | 2024-08-09 |
Female reproductive tract has low concentration of SARS-CoV2 receptors
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243959
PMID:33315943
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研究论文 | 研究调查了女性生殖器官中SARS-CoV2受体的表达情况 | 首次通过单细胞测序数据分析了女性生殖组织中SARS-CoV2受体的表达,发现这些组织中受体表达较低 | 研究仅限于分析已有的单细胞测序数据,未进行新的实验验证 | 探讨SARS-CoV2在女性生殖系统中的感染风险 | 女性生殖器官如子宫、子宫肌层、卵巢、输卵管和乳腺 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 涉及多个女性生殖器官的单细胞测序数据 |
579 | 2024-08-09 |
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.599415
PMID:33324416
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研究论文 | 本文探讨了血管平滑肌细胞的可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用 | 引入了新技术如杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪以及具有空间分辨率的单细胞测序技术,以深化对这些细胞复杂生物学的理解 | NA | 旨在进一步阐明动脉粥样硬化疾病的发病机制,以发现新的治疗方法 | 血管平滑肌细胞及其在血管壁炎症中的作用 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪、单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA |
580 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Developing Human Gut Reveals Transcriptional Links to Childhood Crohn's Disease
2020-12-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.010
PMID:33290721
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术深入分析了6-10周龄人类胚胎肠道的发育过程,并探讨了其与儿童克罗恩病之间的转录联系 | 首次生成了6-10周龄人类胚胎肠道的深度单细胞图谱,并揭示了与儿童克罗恩病相关的转录因子重激活现象 | NA | 探讨人类胚胎肠道发育的转录特征及其与儿童克罗恩病的关系 | 6-10周龄人类胚胎肠道细胞及儿童克罗恩病组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |