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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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541 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals that the Switching of the Transcriptional Profiles of Cysteine-Related Genes Alters the Virulence of Entamoeba histolytica
2020-Dec-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.01095-20
PMID:33361325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)研究了阿米巴原虫的转录组特征,揭示了硫代谢和蛋白酶体途径在病原性中的重要性,并探讨了在胱氨酸缺乏条件下,阿米巴原虫如何调节胱氨酸相关基因的表达以影响其毒力和吞噬作用。 | 使用单细胞RNA测序技术揭示了阿米巴原虫在胱氨酸缺乏条件下的转录组变化,以及这种变化如何影响其毒力和细胞毒性。 | 研究主要集中在单个阿米巴原虫的转录组分析,未涉及更广泛的细胞群体或其他相关病原体的比较研究。 | 探讨阿米巴原虫的转录组特征及其在胱氨酸缺乏条件下的调节机制,以理解其毒力变化的生物学特性。 | 阿米巴原虫的单个原虫及其后代 | 数字病理学 | 阿米巴病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 单个阿米巴原虫及其后代 |
542 | 2024-08-09 |
Modulation of Immune Checkpoints by Chemotherapy in Human Colorectal Liver Metastases
2020-12-22, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2020.100160
PMID:33377131
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研究论文 | 本研究探讨了化疗对人类结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 发现了两种对化疗反应不同的细胞亚型,并揭示了化疗与免疫检查点抑制剂联合使用的潜在协同效应 | NA | 研究化疗对结直肠癌肝转移瘤免疫微环境的影响 | 人类结直肠癌肝转移瘤切片 | NA | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 8例 |
543 | 2024-08-09 |
[Research advances on application of single-cell RNA sequencing in islet cell biology]
2020-Dec-20, Zhonghua shao shang za zhi = Zhonghua shaoshang zazhi = Chinese journal of burns
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研究论文 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学研究中的应用进展 | 单细胞RNA测序技术能够表征稀有类型的内分泌细胞,发现典型内分泌细胞的细胞异质性和新的细胞亚型,分析不同物种间内分泌细胞的差异,并更准确地描述各种类型胰岛细胞在发育过程和代谢疾病中的不同状态 | 目前单细胞RNA测序对低丰度转录本的检测效率相对较低 | 探讨单细胞RNA测序技术在胰岛细胞生物学中的应用 | 胰岛细胞 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及人类和鼠类的胰岛细胞 |
544 | 2024-08-09 |
Preparing Highly Viable Single-Cell Suspensions from Mouse Pancreatic Islets for Single-Cell RNA Sequencing
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100144
PMID:33377038
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研究论文 | 本文描述了一种从鼠胰腺胰岛中制备高存活率单细胞悬液的方法,用于单细胞RNA测序 | 提供了一种有效的鼠胰腺胰岛单细胞悬液制备协议,适用于单细胞RNA测序 | NA | 研究胰腺胰岛的细胞异质性和亚群 | 鼠胰腺胰岛的单细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
545 | 2024-08-09 |
Optimized workflow for single-cell transcriptomics on infectious diseases including COVID-19
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100233
PMID:33377120
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研究论文 | 本文介绍了一种针对包括COVID-19在内的传染病进行单细胞转录组学研究的完整且安全的实验流程 | 提出了一个针对新病原体SARS-CoV-2的安全实验流程,用于从细胞分离到数据分析的scRNA-seq实验 | NA | 开发一种安全的工作流程,用于研究包括COVID-19在内的传染病的单细胞转录组学 | 感染患者的血液样本 | 单细胞测序 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 感染患者的血液样本 |
546 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of mouse preimplantation embryos by third-generation sequencing
2020-12, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001017
PMID:33378329
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研究论文 | 本文开发了一种基于第三代测序平台的新型单细胞RNA测序技术SCAN-seq,并应用于小鼠植入前胚胎的分析 | SCAN-seq技术具有高灵敏度和准确性,能够捕获大量未注释的转录本,并展示出高验证率 | NA | 开发和验证一种新的单细胞RNA测序技术,并应用于小鼠植入前胚胎的转录组分析 | 小鼠植入前胚胎 | 基因组学 | NA | 第三代测序(TGS) | NA | RNA序列 | 9,338个基因中的27,250个未注释转录本 |
547 | 2024-08-09 |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Heterogeneities of Non-cardiomyocytes in Healthy and Ischemic Hearts
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.615161
PMID:33365332
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研究论文 | 本研究通过整合三个代表性的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集,探讨了在心肌梗死或假手术后3天和7天分离的27,349个非心肌细胞的异质性 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集,揭示了健康和非健康心脏中非心肌细胞的不同动态和功能特性 | NA | 旨在探讨是否可以通过整合多个相似的scRNA-seq数据集,更全面地理解疾病 | 非心肌细胞在健康和心肌缺血心脏中的异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 27,349个非心肌细胞 |
548 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into retinal endothelial barrier properties
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33380778
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研究论文 | 通过分析牛视网膜微血管内皮细胞(RMECs)的单细胞转录组,深入了解视网膜内皮屏障特性 | 开发了一种单细胞转录组学工作流程,并揭示了视网膜微血管屏障中先前未报道的连接蛋白 | NA | 更好地表征视网膜内皮屏障特性 | 牛视网膜微血管内皮细胞(RMECs)的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 单个RMECs |
549 | 2024-08-09 |
Identification of Pro-Fibrotic Macrophage Populations by Single-Cell Transcriptomic Analysis in West Highland White Terriers Affected With Canine Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.611749
PMID:33384697
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞群体,以识别与疾病相关的细胞异质性 | 首次在犬类特发性肺纤维化模型中使用单细胞RNA测序技术,识别出具有促纤维化能力的巨噬细胞/单核细胞群体 | 需要进一步研究以理解这些巨噬细胞/单核细胞群体在疾病发病机制中的具体作用 | 识别和分析患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬肺部中的促纤维化巨噬细胞群体 | 患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞 | 数字病理学 | 犬类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5只患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬和3只健康西高地白梗犬 |
550 | 2024-08-09 |
Sc-GPE: A Graph Partitioning-Based Cluster Ensemble Method for Single-Cell
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.604790
PMID:33384718
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图划分聚类集成的单细胞RNA测序数据分析方法Sc-GPE | Sc-GPE结合了五种基于图划分的单细胞聚类方法,并通过构建加权共识矩阵来区分各方法的重要性 | NA | 开发一种有效的聚类集成策略,用于解决不同单细胞聚类方法结果不一致的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图划分聚类方法 | 数据矩阵 | 12个单细胞RNA测序数据集 |
551 | 2024-08-09 |
Study on the clinical mechanism of Tong-Xie-An-Chang Decoction in the treatment of diarrheal irritable bowel syndrome based on single-cell sequencing technology
2020-Dec-24, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000023868
PMID:33350782
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研究论文 | 本研究旨在评估通泻安肠汤治疗腹泻型肠易激综合征的临床疗效和安全性,并基于单细胞测序技术阐明其基因层面的治疗机制 | 利用单细胞测序技术探索腹泻型肠易激综合征患者外周血中T淋巴细胞的差异基因表达和细胞异质性 | NA | 评估通泻安肠汤在腹泻型肠易激综合征治疗中的临床疗效和安全性,并阐明其基因层面的治疗机制 | 腹泻型肠易激综合征患者 | NA | 肠易激综合征 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 72名符合条件的腹泻型肠易激综合征患者 |
552 | 2024-08-09 |
Lung megakaryocytes display distinct transcriptional and phenotypic properties
2020-12-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020002843
PMID:33351116
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、组织学、倍性分析和流式细胞术研究了来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞的转录组和表型特征 | 发现肺巨核细胞具有独特的转录特征,富集了成熟标志物,可能表明其具有更高效的血小板生产能力,并且表现出免疫和炎症相关的富集特征 | NA | 探讨肺巨核细胞的转录和表型特性 | 肺巨核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自同源小鼠肺和造血组织的原始巨核细胞 |
553 | 2024-08-09 |
Pulmonary neuroendocrine cells: physiology, tissue homeostasis and disease
2020-12-21, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.046920
PMID:33355253
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综述 | 本文综述了肺神经内分泌细胞(PNECs)的生理功能、组织稳态及其在疾病中的作用 | 介绍了PNECs在肺通气动力学、机械感应和类型2免疫反应中的作用,以及单细胞RNA测序揭示的PNECs基因表达异质性和再生过程中的重编程 | NA | 深入理解PNECs的基本特性在肺生物学和病理学中的重要性 | 肺神经内分泌细胞(PNECs)及其在呼吸疾病中的作用 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
554 | 2024-08-09 |
Single-cell atlas of the first intra-mammalian developmental stage of the human parasite Schistosoma mansoni
2020-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20092-5
PMID:33339816
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,对人类寄生虫曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段进行了细胞图谱分析 | 首次为曼氏血吸虫的早期哺乳动物内发育阶段提供了全面的细胞类型图谱 | NA | 揭示驱动曼氏血吸虫在哺乳动物体内发育的机制 | 曼氏血吸虫的早期发育阶段,特别是称为血吸虫幼虫的阶段 | 数字病理学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两天的曼氏血吸虫幼虫样本 |
555 | 2024-08-09 |
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution
2020-12-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01499-8
PMID:33339962
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research paper | 本文开发了一种基于单分子测序系统HeliScope的测序系统,用于在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息 | 开发了一种新的测序系统,能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息,并提出了名为“分子足迹”的新方法 | NA | 开发一种能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子空间信息的测序系统 | DNA条形码分子及其在空间转录组学和空间蛋白质组学中的应用 | NA | NA | 单分子测序 | NA | DNA条形码分子 | 30种DNA条形码分子 |
556 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of Mouse Islets Following Short-Term Obesogenic Dietary Intervention
2020-Dec-18, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo10120513
PMID:33353164
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了在高脂饮食干预下小鼠胰岛中β细胞的早期转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了高脂饮食对小鼠胰岛β细胞转录组的影响,并识别了不同β细胞群的基因表达模式 | 研究仅限于一周的高脂饮食干预,可能无法完全反映长期饮食干预的影响 | 阐明肥胖环境下导致β细胞功能障碍的早期转录事件 | 小鼠胰岛中的β细胞及其他内分泌细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自四只高脂饮食小鼠和三只对照饮食小鼠的胰岛样本 |
557 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis supports a luminal-neuroendocrine transdifferentiation in human prostate cancer
2020-12-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01476-1
PMID:33328604
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了6例去势抵抗性前列腺癌的21,292个细胞,揭示了神经内分泌肿瘤细胞具有腔型上皮表型,并提出神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞而非基底细胞。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经内分泌前列腺癌中神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞,并通过组织微阵列分析验证了这一发现。 | 研究样本仅限于6例去势抵抗性前列腺癌,可能影响结果的普遍性。 | 探究人类前列腺癌中神经内分泌分化的细胞起源。 | 去势抵抗性前列腺癌中的神经内分泌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 21,292个细胞来自6例去势抵抗性前列腺癌的针刺活检样本 |
558 | 2024-08-09 |
Human Pluripotent Stem Cell-Derived Kidney Organoids with Improved Collecting Duct Maturation and Injury Modeling
2020-12-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108514
PMID:33326782
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研究论文 | 本文通过独立生成两种肾前体细胞群——间充质和尿管芽样细胞,成功生成了具有收集系统的肾类器官,并探讨了激素在收集管细胞分化中的作用。 | 本文首次通过独立生成两种肾前体细胞群,实现了肾类器官中收集系统的形成,并利用单细胞RNA测序技术展示了近端小管成熟度的提高和非目标细胞群的减少。 | NA | 探索人类多能干细胞衍生的肾类器官在药物测试和再生医学中的应用,以及疾病模型的建立。 | 人类多能干细胞衍生的肾类器官及其收集管成熟和损伤模型的建立。 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
559 | 2024-08-09 |
GAS2L1 Is a Potential Biomarker of Circulating Tumor Cells in Pancreatic Cancer
2020-Dec-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123774
PMID:33333841
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研究论文 | 本研究分析了胰腺癌循环肿瘤细胞(CTC)的单细胞RNA测序数据,并提出GAS2L1作为胰腺癌CTC的新型生物标志物 | 本研究通过组合使用GAS2L1和其他标志物,提高了胰腺癌CTC的检测率 | NA | 探索胰腺癌循环肿瘤细胞的生物标志物 | 胰腺癌循环肿瘤细胞及其生物标志物 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括遗传工程小鼠模型(GEMM)和胰腺癌患者样本 |
560 | 2024-08-09 |
The Evolving Knowledge on T and NK Cells in Classic Hodgkin Lymphoma: Insights into Novel Subsets Populating the Immune Microenvironment
2020-Dec-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123757
PMID:33327433
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综述 | 本文综述了经典霍奇金淋巴瘤(cHL)中T细胞和NK细胞的最新研究进展,特别是通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等高维度分析技术揭示的免疫微环境中T细胞和NK细胞亚群的新发现 | 利用高维度分析技术揭示了cHL中T细胞和NK细胞亚群的新组成,并识别出具有耗竭表型的新型细胞毒性亚群,这些发现有助于理解先前未被认识的免疫逃逸机制 | NA | 探讨cHL微环境中最近识别的T细胞和NK细胞亚群的免疫学特征和功能属性,并讨论如何利用这些知识预测免疫治疗反应及设计提高PD-1阻断疗效的新策略 | 经典霍奇金淋巴瘤中的T细胞和NK细胞亚群 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |