单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-08-09 |
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution
2020-12-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01499-8
PMID:33339962
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research paper | 本文开发了一种基于单分子测序系统HeliScope的测序系统，用于在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息 | 开发了一种新的测序系统，能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子的空间信息，并提出了名为“分子足迹”的新方法 | NA | 开发一种能够在单分子分辨率下解码DNA条形码分子空间信息的测序系统 | DNA条形码分子及其在空间转录组学和空间蛋白质组学中的应用 | NA | NA | 单分子测序 | NA | DNA条形码分子 | 30种DNA条形码分子 |
| 542 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of Mouse Islets Following Short-Term Obesogenic Dietary Intervention
2020-Dec-18, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo10120513
PMID:33353164
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了在高脂饮食干预下小鼠胰岛中β细胞的早期转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了高脂饮食对小鼠胰岛β细胞转录组的影响，并识别了不同β细胞群的基因表达模式 | 研究仅限于一周的高脂饮食干预，可能无法完全反映长期饮食干预的影响 | 阐明肥胖环境下导致β细胞功能障碍的早期转录事件 | 小鼠胰岛中的β细胞及其他内分泌细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自四只高脂饮食小鼠和三只对照饮食小鼠的胰岛样本 |
| 543 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis supports a luminal-neuroendocrine transdifferentiation in human prostate cancer
2020-12-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01476-1
PMID:33328604
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了6例去势抵抗性前列腺癌的21,292个细胞，揭示了神经内分泌肿瘤细胞具有腔型上皮表型，并提出神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞而非基底细胞。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了神经内分泌前列腺癌中神经内分泌分化主要来源于腔型恶性细胞，并通过组织微阵列分析验证了这一发现。 | 研究样本仅限于6例去势抵抗性前列腺癌，可能影响结果的普遍性。 | 探究人类前列腺癌中神经内分泌分化的细胞起源。 | 去势抵抗性前列腺癌中的神经内分泌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 21,292个细胞来自6例去势抵抗性前列腺癌的针刺活检样本 |
| 544 | 2024-08-09 |
Human Pluripotent Stem Cell-Derived Kidney Organoids with Improved Collecting Duct Maturation and Injury Modeling
2020-12-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108514
PMID:33326782
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研究论文 | 本文通过独立生成两种肾前体细胞群——间充质和尿管芽样细胞，成功生成了具有收集系统的肾类器官，并探讨了激素在收集管细胞分化中的作用。 | 本文首次通过独立生成两种肾前体细胞群，实现了肾类器官中收集系统的形成，并利用单细胞RNA测序技术展示了近端小管成熟度的提高和非目标细胞群的减少。 | NA | 探索人类多能干细胞衍生的肾类器官在药物测试和再生医学中的应用，以及疾病模型的建立。 | 人类多能干细胞衍生的肾类器官及其收集管成熟和损伤模型的建立。 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 545 | 2024-08-09 |
GAS2L1 Is a Potential Biomarker of Circulating Tumor Cells in Pancreatic Cancer
2020-Dec-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123774
PMID:33333841
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研究论文 | 本研究分析了胰腺癌循环肿瘤细胞（CTC）的单细胞RNA测序数据，并提出GAS2L1作为胰腺癌CTC的新型生物标志物 | 本研究通过组合使用GAS2L1和其他标志物，提高了胰腺癌CTC的检测率 | NA | 探索胰腺癌循环肿瘤细胞的生物标志物 | 胰腺癌循环肿瘤细胞及其生物标志物 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括遗传工程小鼠模型（GEMM）和胰腺癌患者样本 |
| 546 | 2024-08-09 |
The Evolving Knowledge on T and NK Cells in Classic Hodgkin Lymphoma: Insights into Novel Subsets Populating the Immune Microenvironment
2020-Dec-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12123757
PMID:33327433
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综述 | 本文综述了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）中T细胞和NK细胞的最新研究进展，特别是通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等高维度分析技术揭示的免疫微环境中T细胞和NK细胞亚群的新发现 | 利用高维度分析技术揭示了cHL中T细胞和NK细胞亚群的新组成，并识别出具有耗竭表型的新型细胞毒性亚群，这些发现有助于理解先前未被认识的免疫逃逸机制 | NA | 探讨cHL微环境中最近识别的T细胞和NK细胞亚群的免疫学特征和功能属性，并讨论如何利用这些知识预测免疫治疗反应及设计提高PD-1阻断疗效的新策略 | 经典霍奇金淋巴瘤中的T细胞和NK细胞亚群 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 547 | 2024-08-09 |
Elevated TUBA1A Might Indicate the Clinical Outcomes of Patients with Gastric Cancer, Being Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment
2020-Dec-12, Journal of gastrointestinal and liver diseases : JGLD
IF:2.1Q3
DOI:10.15403/jgld-2834
PMID:33331338
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研究论文 | 本研究评估了TUBA1A在胃癌中的表达及其对临床结果的影响，特别是与肿瘤免疫微环境中巨噬细胞浸润的关联 | 首次探讨了TUBA1A与胃癌患者生存和临床病理特征的关系，以及其在肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的作用 | NA | 探究TUBA1A在胃癌中的表达及其对患者生存和临床病理特征的影响 | 胃癌患者及正常样本中的TUBA1A表达 | 数字病理学 | 胃癌 | 基因集富集分析(GSEA) | NA | RNA测序数据 | 1881个样本，包括1618名胃癌患者和263个正常样本 |
| 548 | 2024-08-09 |
Creation of bladder assembloids mimicking tissue regeneration and cancer
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-3034-x
PMID:33328632
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研究论文 | 本文通过重组组织干细胞与基质成分，创建了多层膀胱'装配体'，模拟成熟器官结构和相关组织微环境，并开发了恶性肿瘤装配体以重现体内尿路上皮癌的病理生理特征。 | 本文创新性地创建了模拟成熟膀胱结构和功能的膀胱装配体，并开发了恶性肿瘤装配体，揭示了FOXA1-BMP-hedgehog信号反馈轴在肿瘤可塑性控制中的重要性。 | NA | 研究旨在开发新型组织模型，以更好地模拟成熟器官结构和功能，并探索肿瘤发展的分子机制。 | 膀胱组织装配体及其恶性肿瘤对应物。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA |
| 549 | 2024-08-09 |
Redox Regulator GLRX Is Associated With Tumor Immunity in Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.580934
PMID:33329553
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研究论文 | 本研究旨在探讨谷氧还蛋白在胶质瘤中的转录组水平作用及其临床预后价值 | 发现谷氧还蛋白在恶性胶质瘤中高度富集，并与肿瘤免疫微环境密切相关，可能增强胶质瘤免疫治疗的疗效 | NA | 阐明谷氧还蛋白在胶质瘤中的生物学功能及其临床预后价值 | 谷氧还蛋白在胶质瘤中的作用及其临床预后价值 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析，单细胞测序 | NA | 转录组数据，单细胞测序数据 | 1717个胶质瘤样本，6个胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
| 550 | 2024-08-09 |
Integrative Analysis Extracts a Core ceRNA Network of the Fetal Hippocampus With Down Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.565955
PMID:33329702
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研究论文 | 本研究通过综合分析提取了与唐氏综合症胎儿海马体相关的核心ceRNA网络 | 首次描绘了唐氏综合症中circRNAs的图谱，并有效整合了ceRNA调控与单细胞RNA测序数据 | NA | 探究唐氏综合症神经病理学的分子机制或治疗靶点 | 唐氏综合症胎儿海马体中的circRNAs、miRNAs和mRNAs | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 唐氏综合症患者8例，对照组6例 |
| 551 | 2024-08-09 |
EC-PGMGR: Ensemble Clustering Based on Probability Graphical Model With Graph Regularization for Single-Cell RNA-seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.572242
PMID:33329710
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研究论文 | 本文提出了一种基于概率图模型和图正则化的集成聚类算法EC-PGMGR，用于单细胞RNA测序数据 | EC-PGMGR算法通过概率图模型自动确定聚类数目，并通过添加正则化项减少弱基础聚类结果的影响，实现了自调节权重组合的预学习过程 | 集成聚类方法的结果依赖于基础聚类结果，且集成系统通常不具有自调节能力 | 设计一种鲁棒的无监督聚类方法，以提高聚类准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率图模型 | RNA-seq数据 | 涉及7个数据集，单细胞数量从822到5,132 |
| 552 | 2024-08-09 |
Plant stem-cell organization and differentiation at single-cell resolution
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2018788117
PMID:33318187
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）对玉米茎尖干细胞微环境及其分化后代进行了无偏差的转录组景观分析 | 发现玉米茎尖干细胞并不存在传统的干细胞组织中心，并且通过轨迹推断揭示了基因表达变化伴随细胞分化的过程 | NA | 研究植物干细胞的组织和分化 | 玉米茎尖干细胞及其分化细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 553 | 2024-08-09 |
Human embryonic stem cell-derived organoid retinoblastoma reveals a cancerous origin
2020-12-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2011780117
PMID:33318192
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研究论文 | 本研究开发了一种基于遗传工程人胚胎干细胞（hESCs）衍生的视网膜类器官的视网膜母细胞瘤（Rb）模型，揭示了Rb的癌变起源 | 首次在视网膜类器官中建立了Rb的癌变模型，并通过单细胞测序和免疫染色验证了Rb起源于ARR3阳性成熟锥体前体细胞 | NA | 建立视网膜母细胞瘤的类器官模型，探索其细胞起源并测试新的候选治疗药物 | 视网膜母细胞瘤的细胞起源和治疗策略 | 数字病理学 | 儿童眼内恶性肿瘤 | 单细胞测序 | 类器官模型 | 基因组甲基化数据 | NA |
| 554 | 2024-08-09 |
Longitudinal Multi-omics Analyses Identify Responses of Megakaryocytes, Erythroid Cells, and Plasmablasts as Hallmarks of Severe COVID-19
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.017
PMID:33296687
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研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析，揭示了严重COVID-19患者中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的反应特征 | 首次在严重COVID-19患者中识别出巨核细胞和红细胞的扩展以及浆母细胞的增殖，这些特征与疾病结局相关 | 研究样本量较小，且仅限于两个中心的患者 | 理解严重COVID-19的免疫反应偏斜并定义疾病结局的预测因子 | 严重COVID-19患者的免疫细胞反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 多组学分析 | NA | 转录组、DNA甲基化组和单细胞转录组数据 | 14名患者，包括超过358,000个细胞 |
| 555 | 2024-08-09 |
Olfactomedin 4 mediation of prostate stem/progenitor-like cell proliferation and differentiation via MYC
2020-12-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-78774-5
PMID:33318499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了嗅觉蛋白4（OLFM4）在正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞（RWPE1）中的表达及其生理功能。 | 首次揭示了OLFM4在前列腺上皮细胞中的表达模式及其在干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 | NA | 研究OLFM4在前列腺干细胞/祖细胞增殖和分化中的作用。 | 正常前列腺上皮细胞和永生化正常人前列腺上皮细胞（RWPE1）中的OLFM4表达细胞。 | NA | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个干细胞/祖细胞样细胞群 |
| 556 | 2024-08-09 |
Stromal Cells Exhibit Prevalent Genetic Aberrations in Colorectal Cancer
2020-12-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.11.003
PMID:33321084
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中基质细胞的遗传异常 | 首次结合多组学单细胞测序技术，揭示了结直肠癌基质细胞群体中的普遍遗传改变 | NA | 研究肿瘤微环境中基质细胞的遗传变化对肿瘤进展的影响 | 结直肠癌中的基质细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学单细胞测序 | NA | 遗传数据 | NA |
| 557 | 2024-08-09 |
Mouse embryonic stem cells self-organize into trunk-like structures with neural tube and somites
2020-12-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aba4937
PMID:33303587
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研究论文 | 本文研究了多能性小鼠胚胎干细胞（mESCs）在体外形成高度组织的“躯干样结构”（TLSs），包含神经管和体节的过程 | 通过单细胞RNA测序分析，证实了这一过程与小鼠发育高度相似，并遵循相同的逐步基因调控程序 | NA | 探究胚胎植入后胚胎发生过程 | 小鼠胚胎干细胞的自组织能力及其形成的结构 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 558 | 2024-08-09 |
Trajectory of chemical cocktail-induced neutrophil reprogramming
2020-12-10, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-020-01008-8
PMID:33302977
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研究论文 | 本研究利用遗传追踪方法CellTagging和单细胞RNA测序技术，揭示了化学混合物诱导的中性粒细胞重编程轨迹 | 首次报道了中性粒细胞可以被重编程为多能祖细胞，并在体外和体内获得多向分化潜能 | NA | 研究化学混合物诱导的造血细胞重编程过程 | 中性粒细胞的重编程轨迹 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | NA |
| 559 | 2024-08-09 |
Global immune characterization of HBV/HCV-related hepatocellular carcinoma identifies macrophage and T-cell subsets associated with disease progression
2020-Dec-08, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00214-5
PMID:33298893
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了HBV/HCV相关肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的免疫细胞异质性及其动态变化 | 首次在单细胞水平上揭示了HBV/HCV相关HCC中免疫细胞的复杂网络，并识别出与疾病进展相关的特定巨噬细胞和T细胞亚群 | NA | 探究HBV/HCV相关肝细胞癌中免疫细胞的异质性及其与疾病进展的关系 | HBV/HCV相关肝细胞癌中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 41,698个免疫细胞来自七对HBV/HCV相关HCC肿瘤和非肿瘤肝组织 |
| 560 | 2024-08-09 |
Characterization and generation of human definitive multipotent hematopoietic stem/progenitor cells
2020-Dec-01, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00213-6
PMID:33298886
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，解析了人类早期造血阶段的多能造血干细胞/祖细胞（HSPCs）的特征，并从人类胚胎干细胞（hESCs）中生成了这些细胞 | 首次详细描述了人类早期造血过程中的分子特征，并发现了CD44在区分早期原始和确定性造血中的特异性作用 | NA | 深入理解人类早期造血过程，并为临床目的生成血液和免疫细胞提供基础 | 人类多能造血干细胞/祖细胞（HSPCs）及其在早期造血过程中的特征 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |