单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2024-08-09 |
Susceptibility Factors of Stomach for SARS-CoV-2 and Treatment Implication of Mucosal Protective Agent in COVID-19
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.597967
PMID:33521016
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃对SARS-CoV-2的易感性因素，并探讨黏膜保护剂在COVID-19治疗中的应用 | 首次探讨了胃黏膜对SARS-CoV-2的易感性因素，并评估了黏膜保护剂在阻断SARS-CoV-2从胃到肠道传播中的潜在作用 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的易感性因素 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃的易感性因素 | SARS-CoV-2感染患者及胃黏膜样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胃黏膜样本和420例COVID-19患者 |
| 522 | 2024-08-09 |
Dissecting the Invasion-Associated Long Non-coding RNAs Using Single-Cell RNA-Seq Data of Glioblastoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.633455
PMID:33505440
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研究论文 | 本研究通过分析来自四名胶质母细胞瘤患者的3345个单细胞RNA测序数据，识别了与胶质母细胞瘤发展和进展相关的失调基因，包括长非编码RNAs（lncRNAs），并通过共表达网络分析和整合EMT签名、实验验证的侵袭标记及伪时间轨迹分析，确认了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs，并展示了这些lncRNAs在肿瘤细胞侵袭轨迹中的逐渐增加的表达水平。 | 研究仅基于两个数据集的分析，可能需要更多样本和数据集来进一步验证这些发现。 | 理解胶质母细胞瘤细胞侵袭的分子机制，为治疗提供新的见解和潜在靶点。 | 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序数据和相关的lncRNAs。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | RNA测序数据 | 3345个细胞来自四名患者，以及7930个单细胞来自28名胶质母细胞瘤患者 |
| 523 | 2024-08-09 |
The Role of Anti-angiogenesis in the Treatment Landscape of Non-small Cell Lung Cancer - New Combinational Approaches and Strategies of Neovessel Inhibition
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.610903
PMID:33469537
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）治疗中抗血管生成的作用，探讨了新的联合治疗策略和血管新生抑制方法 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）等先进方法深入表征NSCLC的肿瘤微环境（TME），识别更个性化的抗血管生成抑制新方面 | 抗血管生成疗法在NSCLC患者中仅产生边际临床效益，原因包括高度适应性的肿瘤微环境和对肿瘤血管特征的理解不足 | 总结肿瘤血管生成和相应抗血管生成疗法的当前知识，探讨新的抗血管生成治疗策略和血管抑制方法 | 非小细胞肺癌（NSCLC）及其肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 524 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals That Metabolites Produced by Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526 Ameliorate Type 2 Diabetes in GK Rats by Downregulating the Inflammatory Response
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.568805
PMID:33424779
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526产生的代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，发现这些代谢物通过下调炎症反应改善了GK大鼠的2型糖尿病症状 | 首次使用单细胞RNA测序技术探讨BD3526代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，并揭示了代谢物通过调节免疫细胞和DCs中的WNT/β-catenin通路来改善糖尿病的机制 | NA | 研究BD3526代谢物如何通过调节肠道细胞和免疫细胞来改善2型糖尿病 | Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526的代谢物对GK大鼠肠道细胞和免疫细胞的影响 | 代谢综合征 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及GK大鼠的肠道细胞和免疫细胞样本 |
| 525 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Efficiently Predicts Transcription Factor Targets in Plants
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.603302
PMID:33424903
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研究论文 | 本研究首次基于10× Genomics的单细胞RNA测序方法，在稻叶细胞中建立了一个简单的系统来预测转录因子（TF）目标 | 首次在植物中利用单细胞RNA测序技术有效预测转录因子目标，并提供了一种新的应用 | NA | 探索转录因子目标，以研究调控途径 | 稻叶细胞中的转录因子OsNAC78及其目标基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 涉及多个单细胞的转录组 |
| 526 | 2024-08-09 |
Discrepant mRNA and Protein Expression in Immune Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 研究报道了免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平不一致的现象 | 提出将单细胞mRNA测序（scRNA-seq）与其他测序方法（如CITE-seq）结合使用，以提高结果的精确性和可信度 | 未提及具体限制 | 探讨免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平的差异 | 免疫细胞中的mRNA与蛋白质表达 | NA | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA与蛋白质表达数据 | 未提及具体样本数量 |
| 527 | 2024-08-09 |
Single-cell Sequencing in the Field of Stem Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在干细胞领域的最新进展和未来展望 | 单细胞测序技术能够有效分析细胞异质性并识别少数细胞群体 | NA | 探讨单细胞测序技术在干细胞研究中的应用 | 多能干细胞、组织特异性干细胞和癌症干细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 单个细胞 |
| 528 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA Sequencing: In-depth Decoding of Heart Biology and Cardiovascular Diseases
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的最新进展，并总结了该技术在心脏发育科学、干细胞研究以及正常或疾病相关工作机制方面提供的新见解 | 单细胞RNA测序技术在解码细胞异质性、表型转变和发育动力学方面取得了突破 | NA | 综述单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的应用 | 心血管系统及其相关疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 529 | 2024-08-09 |
The Comparison of Two Single-cell Sequencing Platforms: BD Rhapsody and 10x Genomics Chromium
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
|
研究论文 | 本文比较了两种单细胞测序平台BD Rhapsody和10x Genomics Chromium的机制和scRNA-seq结果 | 本文提供了对两种常用单细胞测序平台的系统比较 | 目前对这些常用平台的系统比较较少 | 比较两种单细胞测序平台的优势和局限性 | BD Rhapsody和10x Genomics Chromium单细胞测序平台 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据 | NA |
| 530 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals compromised immune microenvironment in precursor stages of multiple myeloma
2020-05, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-0053-3
PMID:33409501
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，分析了多发性骨髓瘤前驱阶段（MGUS和SMM）及健康捐赠者的骨髓细胞，揭示了早期免疫微环境的变化 | 首次展示了多发性骨髓瘤前驱阶段免疫细胞的早期变化，包括NK细胞的增加和GrK记忆性细胞毒性T细胞的丢失 | NA | 深入了解多发性骨髓瘤前驱阶段的分子特征，以更好地对高风险患者进行分层和治疗 | 多发性骨髓瘤的前驱阶段（MGUS和SMM）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括多发性骨髓瘤前驱阶段（MGUS和SMM）患者及健康捐赠者的骨髓细胞 |
| 531 | 2024-08-09 |
The T Cell Receptor Immune Repertoire Protects the Liver From Reconsitution
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.584979
PMID:33391261
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肝脏内CD45免疫细胞在纤维化发病过程中的转录组，揭示了免疫细胞在肝脏纤维化中的变化及其保护作用 | 发现了与纤维化相关的新的CD8 T和CD4 T细胞亚群，并揭示了T细胞受体（TCR）在纤维化肝脏中的明显下降 | NA | 理解肝脏纤维化发病过程中肝脏内免疫细胞的景观 | 小鼠肝脏内的CD45免疫细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 约10,000个单细胞转录组 |
| 532 | 2024-08-09 |
Six Immune Associated Genes Construct Prognostic Model Evaluate Low-Grade Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.606164
PMID:33408717
|
研究论文 | 本文通过分析NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据，筛选出六个与免疫相关的基因，构建了一个预测低级别胶质瘤预后的风险评分模型 | 首次利用六个特定基因构建风险评分模型，用于评估低级别胶质瘤的预后 | NA | 研究如何通过特定基因评估胶质瘤的预后 | 胶质瘤及其相关的肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 基因表达分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 包括20个胶质瘤样本和15个对照样本，以及669名患者的生存率数据 |
| 533 | 2024-08-09 |
SCHNEL: scalable clustering of high dimensional single-cell data
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa816
PMID:33381821
|
研究论文 | 本文介绍了SCHNEL，一种用于高维单细胞数据的可扩展、可靠且自动化的聚类工具 | SCHNEL通过将数据的层次表示与图聚类相结合，使图聚类可扩展到数百万个细胞 | NA | 开发一种可扩展的聚类工具，用于处理大规模的高维单细胞数据 | 单细胞数据，包括细胞计数数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 图聚类 | NA | 高维数据 | 涉及3.5百万和17.2百万个细胞的数据集 |
| 534 | 2024-08-09 |
Conditional out-of-distribution generation for unpaired data using transfer VAE
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa800
PMID:33381839
|
研究论文 | 本文提出了一种新的条件变分自编码器（trVAE），通过在解码器层使用最大均值差异来匹配不同条件下的分布，从而提高了模型在未配对数据上的泛化能力和准确性 | 引入最大均值差异在解码器层进行分布匹配，增强了模型在同一条件内重建样本和跨条件转换样本的能力 | NA | 克服条件变分自编码器在未配对数据上生成分布的局限性 | 高维图像和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 条件变分自编码器（CVAE） | 变分自编码器（VAE） | 高维数据 | NA |
| 535 | 2024-08-09 |
Comprehensive network modeling from single cell RNA sequencing of human and mouse reveals well conserved transcription regulation of hematopoiesis
2020-Dec-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07241-2
PMID:33372598
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类和小鼠骨髓中的转录调控网络，揭示了血液生成过程中转录调控的保守性 | 设计了一种网络重建算法，用于比较人类和小鼠骨髓细胞中血液生成相关基因的共表达和转录调控 | NA | 研究血液生成过程中的转录调控网络的保守性 | 人类和小鼠的骨髓细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠的骨髓细胞 |
| 536 | 2024-08-09 |
Airway-Associated Macrophages in Homeostasis and Repair
2020-12-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108553
PMID:33378665
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序、流式细胞术和免疫荧光技术，研究了小鼠气管在稳态和上皮损伤/修复过程中的髓系细胞特征 | 本文首次详细描述了与气道相关的亚粘膜巨噬细胞和上皮内巨噬细胞，并探讨了它们在损伤后的动态变化及其对修复过程的影响 | NA | 研究气道相关巨噬细胞在稳态和修复过程中的作用 | 小鼠气管的髓系细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光 | NA | 细胞 | 小鼠气管样本 |
| 537 | 2024-08-09 |
Aging-Associated Alterations in Mammary Epithelia and Stroma Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-12-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108566
PMID:33378681
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细分析了年轻和老年小鼠乳腺组织的转录组图谱，揭示了与年龄相关的乳腺上皮和基质细胞的改变 | 首次系统地研究了年龄诱导的乳腺上皮和基质细胞的改变，并揭示了潜在的促肿瘤发生机制 | NA | 探究年龄对乳腺生理的影响及其与乳腺癌风险的关系 | 年轻和老年小鼠的乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的乳腺组织样本 |
| 538 | 2024-08-09 |
Feature Selection for Topological Proximity Prediction of Single-Cell Transcriptomic Profiles in Drosophila Embryo Using Genetic Algorithm
2020-12-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12010028
PMID:33379262
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研究论文 | 本文使用遗传算法（GA）和DistMap算法来预测果蝇胚胎中单细胞转录组特征的拓扑邻近性，并选择最重要的基因 | 本文详细讨论了遗传算法的实现及其在挑战后的参数化，旨在改进基于GA的基因集选择方法，以更有效地预测拓扑关联 | 由于复杂的聚合排名，该方法的详细信息未能在主要挑战出版物中发表 | 旨在改进基于遗传算法的基因集选择方法，以更有效地预测单细胞相似性 | 果蝇胚胎中的单细胞转录组特征 | 基因组学 | NA | 遗传算法（GA） | DistMap算法 | 转录组数据 | 从84个已知的原位基因模式中选择了60、40和20个基因的单细胞数据集 |
| 539 | 2024-08-09 |
Constitutive activation of cellular immunity underlies the evolution of resistance to infection in Drosophila
2020-12-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.59095
PMID:33357377
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研究论文 | 本文研究了果蝇在高度寄生虫寄生下通过增强细胞免疫反应来发展抗性的机制 | 通过单细胞RNA测序发现，抗性果蝇的免疫诱导基因被持续上调，这是由于抗性幼虫分化出之前仅在感染后产生的特殊免疫细胞的前体细胞 | NA | 探讨果蝇在高度寄生环境下如何通过增强细胞免疫反应来发展抗性 | 果蝇及其对寄生虫的免疫反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 540 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Immune Mechanisms of the Onset and Progression of IgA Nephropathy
2020-12-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108525
PMID:33357427
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了IgA肾病和正常样本中的肾脏和CD14外周血单个核细胞，揭示了IgA肾病的免疫机制及其发病和进展过程 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了IgA肾病中免疫细胞和肾细胞的分子事件，特别是JCHAIN在系膜细胞中的上调机制 | NA | 揭示IgA肾病的发病和进展的免疫机制 | IgA肾病和正常样本中的肾脏和CD14外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | IgA肾病和正常样本 |