单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新,已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价10元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202001-202012] [清除筛选条件]
当前共找到 1659 篇文献,本页显示第 501 - 520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
501 2024-08-09
Deep soft K-means clustering with self-training for single-cell RNA sequence data
2020-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 本文提出了一种结合深度学习和去噪自编码器的软自训练K-means算法,用于单细胞RNA测序数据的聚类 本文创新性地结合了深度学习技术和去噪自编码器,提出了一种软自训练K-means算法,有效解决了现有算法在处理高维、稀疏和大规模转录表达数据时的局限性 NA 研究目的是改进单细胞RNA测序数据的聚类方法 研究对象是单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 深度学习, 去噪自编码器 自编码器 RNA测序数据 大规模数据集
502 2024-08-09
Bayesian correlation is a robust gene similarity measure for single-cell RNA-seq data
2020-Mar, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 本文探讨了在单细胞RNA测序数据中使用贝叶斯相关性作为基因相似性度量的鲁棒性 提出了一种贝叶斯相关性方案,该方案通过考虑低置信度表达估计的基因来扩展其在单细胞RNA测序数据中的应用 NA 旨在扩展贝叶斯相关性在单细胞RNA测序数据中的应用,通过三种方式计算相似性 单细胞RNA测序数据中的基因相似性 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 贝叶斯相关性算法 基因表达数据 涉及多个细胞和基因对
503 2024-08-09
Single-Cell Analysis Reveals Characterization of Infiltrating T Cells in Moderately Differentiated Colorectal Cancer
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究旨在通过单细胞RNA测序数据分析中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征及其在结肠癌和直肠癌中的差异 NA 研究中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征 中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 肿瘤组织中1632个T细胞和外周血中1252个T细胞
504 2024-08-09
Intestinal Stem Cells and Immune Cell Relationships: Potential Therapeutic Targets for Inflammatory Bowel Diseases
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文探讨了肠道干细胞与免疫细胞之间的关系,并提出这些关系可能是治疗炎症性肠病的新疗法 提出了将生物制剂与肠道干细胞移植结合的新疗法,以改善炎症性肠病患者的临床症状和疾病复发情况 NA 研究肠道干细胞与免疫细胞的相互作用,探索治疗炎症性肠病的新策略 肠道干细胞、分化上皮细胞和肠道驻留免疫细胞 NA 炎症性肠病 肠道类器官培养和单细胞RNA测序技术 NA NA NA
505 2024-08-09
Construction of Bone Metastasis-Specific Regulation Network Based on Prognostic Stemness-Related Signatures in Breast Invasive Carcinoma
2020, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究基于预测性干细胞相关特征(PSRSs)构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络 首次基于PSRSs构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络,并发现CD248是关键的PSRS,受MAF正向调控并通过顶端连接途径影响骨转移 NA 构建乳腺癌骨转移特异性调控网络,并探索其潜在的治疗策略 乳腺癌骨转移的调控网络及其治疗策略 数字病理学 乳腺癌 RNA-seq, ChIP-seq NA 基因表达数据 1080个原发性乳腺癌样本(1048个无骨转移,32个有骨转移)
506 2024-08-09
Alterations in Chromatin Structure and Function in the Microglia
2020, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了微胶质细胞在不同发育阶段和疾病条件下表观遗传机制的变化及其对功能多样性的影响 总结了当前关于微胶质细胞表观遗传机制的知识,并讨论了这些知识如何促进疾病治疗策略的发展 NA 探讨微胶质细胞表观遗传变化对功能多样性的影响及其在疾病治疗中的应用 微胶质细胞的表观遗传机制及其在不同发育阶段和疾病条件下的变化 NA NA RNA-seq NA 基因表达谱 NA
507 2024-08-09
Susceptibility Factors of Stomach for SARS-CoV-2 and Treatment Implication of Mucosal Protective Agent in COVID-19
2020, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃对SARS-CoV-2的易感性因素,并探讨黏膜保护剂在COVID-19治疗中的应用 首次探讨了胃黏膜对SARS-CoV-2的易感性因素,并评估了黏膜保护剂在阻断SARS-CoV-2从胃到肠道传播中的潜在作用 研究样本量相对较小,且未涵盖所有可能的易感性因素 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃的易感性因素 SARS-CoV-2感染患者及胃黏膜样本 NA COVID-19 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 12个胃黏膜样本和420例COVID-19患者
508 2024-08-09
Dissecting the Invasion-Associated Long Non-coding RNAs Using Single-Cell RNA-Seq Data of Glioblastoma
2020, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过分析来自四名胶质母细胞瘤患者的3345个单细胞RNA测序数据,识别了与胶质母细胞瘤发展和进展相关的失调基因,包括长非编码RNAs(lncRNAs),并通过共表达网络分析和整合EMT签名、实验验证的侵袭标记及伪时间轨迹分析,确认了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs。 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs,并展示了这些lncRNAs在肿瘤细胞侵袭轨迹中的逐渐增加的表达水平。 研究仅基于两个数据集的分析,可能需要更多样本和数据集来进一步验证这些发现。 理解胶质母细胞瘤细胞侵袭的分子机制,为治疗提供新的见解和潜在靶点。 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序数据和相关的lncRNAs。 数字病理学 脑癌 单细胞RNA测序 共表达网络分析 RNA测序数据 3345个细胞来自四名患者,以及7930个单细胞来自28名胶质母细胞瘤患者
509 2024-08-09
The Role of Anti-angiogenesis in the Treatment Landscape of Non-small Cell Lung Cancer - New Combinational Approaches and Strategies of Neovessel Inhibition
2020, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了非小细胞肺癌(NSCLC)治疗中抗血管生成的作用,探讨了新的联合治疗策略和血管新生抑制方法 利用单细胞RNA测序(scRNA-Seq)等先进方法深入表征NSCLC的肿瘤微环境(TME),识别更个性化的抗血管生成抑制新方面 抗血管生成疗法在NSCLC患者中仅产生边际临床效益,原因包括高度适应性的肿瘤微环境和对肿瘤血管特征的理解不足 总结肿瘤血管生成和相应抗血管生成疗法的当前知识,探讨新的抗血管生成治疗策略和血管抑制方法 非小细胞肺癌(NSCLC)及其肿瘤微环境 NA 肺癌 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA RNA NA
510 2024-08-09
Single-Cell Transcriptomics Reveals That Metabolites Produced by Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526 Ameliorate Type 2 Diabetes in GK Rats by Downregulating the Inflammatory Response
2020, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
研究论文 本文通过单细胞转录组测序研究了Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526产生的代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响,发现这些代谢物通过下调炎症反应改善了GK大鼠的2型糖尿病症状 首次使用单细胞RNA测序技术探讨BD3526代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响,并揭示了代谢物通过调节免疫细胞和DCs中的WNT/β-catenin通路来改善糖尿病的机制 NA 研究BD3526代谢物如何通过调节肠道细胞和免疫细胞来改善2型糖尿病 Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526的代谢物对GK大鼠肠道细胞和免疫细胞的影响 代谢综合征 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及GK大鼠的肠道细胞和免疫细胞样本
511 2024-08-09
Single-Cell RNA Sequencing Efficiently Predicts Transcription Factor Targets in Plants
2020, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
研究论文 本研究首次基于10× Genomics的单细胞RNA测序方法,在稻叶细胞中建立了一个简单的系统来预测转录因子(TF)目标 首次在植物中利用单细胞RNA测序技术有效预测转录因子目标,并提供了一种新的应用 NA 探索转录因子目标,以研究调控途径 稻叶细胞中的转录因子OsNAC78及其目标基因 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 表达谱 涉及多个单细胞的转录组
512 2024-08-09
Discrepant mRNA and Protein Expression in Immune Cells
2020-Dec, Current genomics IF:1.8Q3
研究论文 研究报道了免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平不一致的现象 提出将单细胞mRNA测序(scRNA-seq)与其他测序方法(如CITE-seq)结合使用,以提高结果的精确性和可信度 未提及具体限制 探讨免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平的差异 免疫细胞中的mRNA与蛋白质表达 NA NA 单细胞mRNA测序(scRNA-seq) NA mRNA与蛋白质表达数据 未提及具体样本数量
513 2024-08-09
Single-cell Sequencing in the Field of Stem Cells
2020-Dec, Current genomics IF:1.8Q3
综述 本文综述了单细胞测序技术在干细胞领域的最新进展和未来展望 单细胞测序技术能够有效分析细胞异质性并识别少数细胞群体 NA 探讨单细胞测序技术在干细胞研究中的应用 多能干细胞、组织特异性干细胞和癌症干细胞 NA NA 单细胞测序 NA 基因组 单个细胞
514 2024-08-09
Single-cell RNA Sequencing: In-depth Decoding of Heart Biology and Cardiovascular Diseases
2020-Dec, Current genomics IF:1.8Q3
综述 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的最新进展,并总结了该技术在心脏发育科学、干细胞研究以及正常或疾病相关工作机制方面提供的新见解 单细胞RNA测序技术在解码细胞异质性、表型转变和发育动力学方面取得了突破 NA 综述单细胞RNA测序技术在心血管系统研究中的应用 心血管系统及其相关疾病 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
515 2024-08-09
The Comparison of Two Single-cell Sequencing Platforms: BD Rhapsody and 10x Genomics Chromium
2020-Dec, Current genomics IF:1.8Q3
研究论文 本文比较了两种单细胞测序平台BD Rhapsody和10x Genomics Chromium的机制和scRNA-seq结果 本文提供了对两种常用单细胞测序平台的系统比较 目前对这些常用平台的系统比较较少 比较两种单细胞测序平台的优势和局限性 BD Rhapsody和10x Genomics Chromium单细胞测序平台 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据 NA
516 2024-08-09
Single-cell RNA sequencing reveals compromised immune microenvironment in precursor stages of multiple myeloma
2020-05, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,分析了多发性骨髓瘤前驱阶段(MGUS和SMM)及健康捐赠者的骨髓细胞,揭示了早期免疫微环境的变化 首次展示了多发性骨髓瘤前驱阶段免疫细胞的早期变化,包括NK细胞的增加和GrK记忆性细胞毒性T细胞的丢失 NA 深入了解多发性骨髓瘤前驱阶段的分子特征,以更好地对高风险患者进行分层和治疗 多发性骨髓瘤的前驱阶段(MGUS和SMM)及其肿瘤微环境 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 包括多发性骨髓瘤前驱阶段(MGUS和SMM)患者及健康捐赠者的骨髓细胞
517 2024-08-09
The T Cell Receptor Immune Repertoire Protects the Liver From Reconsitution
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肝脏内CD45免疫细胞在纤维化发病过程中的转录组,揭示了免疫细胞在肝脏纤维化中的变化及其保护作用 发现了与纤维化相关的新的CD8 T和CD4 T细胞亚群,并揭示了T细胞受体(TCR)在纤维化肝脏中的明显下降 NA 理解肝脏纤维化发病过程中肝脏内免疫细胞的景观 小鼠肝脏内的CD45免疫细胞 数字病理学 肝脏疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组 约10,000个单细胞转录组
518 2024-08-09
Six Immune Associated Genes Construct Prognostic Model Evaluate Low-Grade Glioma
2020, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过分析NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据,筛选出六个与免疫相关的基因,构建了一个预测低级别胶质瘤预后的风险评分模型 首次利用六个特定基因构建风险评分模型,用于评估低级别胶质瘤的预后 NA 研究如何通过特定基因评估胶质瘤的预后 胶质瘤及其相关的肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞(TAMs) 数字病理学 脑瘤 基因表达分析 风险评分模型 基因表达数据 包括20个胶质瘤样本和15个对照样本,以及669名患者的生存率数据
519 2024-08-09
SCHNEL: scalable clustering of high dimensional single-cell data
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了SCHNEL,一种用于高维单细胞数据的可扩展、可靠且自动化的聚类工具 SCHNEL通过将数据的层次表示与图聚类相结合,使图聚类可扩展到数百万个细胞 NA 开发一种可扩展的聚类工具,用于处理大规模的高维单细胞数据 单细胞数据,包括细胞计数数据和单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 图聚类 NA 高维数据 涉及3.5百万和17.2百万个细胞的数据集
520 2024-08-09
Conditional out-of-distribution generation for unpaired data using transfer VAE
2020-12-30, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种新的条件变分自编码器(trVAE),通过在解码器层使用最大均值差异来匹配不同条件下的分布,从而提高了模型在未配对数据上的泛化能力和准确性 引入最大均值差异在解码器层进行分布匹配,增强了模型在同一条件内重建样本和跨条件转换样本的能力 NA 克服条件变分自编码器在未配对数据上生成分布的局限性 高维图像和单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 条件变分自编码器(CVAE) 变分自编码器(VAE) 高维数据 NA
回到顶部