单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Expansion of Cytotoxic CD4+ T Lymphocytes and a Landscape of Immune Cells in Primary Sjögren's Syndrome
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.594658
PMID:33603736
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞，揭示了疾病特异性的免疫细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 首次发现原发性干燥综合征患者中细胞毒性CD4+ T淋巴细胞的显著扩张，并识别了两个新的细胞亚群CD4+ CTLs和CD4+ TRAV13-2+ T细胞 | 研究样本量较小，仅包括五名患者和五名健康对照者 | 探索原发性干燥综合征的细胞和分子发病机制 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 57,288个外周血单个核细胞，来自五名原发性干燥综合征患者和五名健康对照者 |
| 502 | 2024-08-09 |
Development of a Prognostic Signature Based on Single-Cell RNA Sequencing Data of Immune Cells in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.615680
PMID:33613623
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了肝内胆管癌中的免疫细胞，以识别与肿瘤进展相关的生物标志物，并建立了一个与预后相关的基因签名 | 首次基于单细胞RNA测序数据建立了肝内胆管癌的预后相关基因签名，该签名反映了肿瘤微环境的免疫状态 | NA | 探讨肝内胆管癌中单细胞RNA测序数据中差异表达基因的预后价值 | 肝内胆管癌中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 33,991个细胞样本，包括17,090个肝内胆管癌细胞样本和16,901个肝内胆管癌邻近组织细胞样本 |
| 503 | 2024-08-09 |
Progress and Clinical Application of Single-Cell Transcriptional Sequencing Technology in Cancer Research
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.593085
PMID:33614479
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研究论文 | 本文总结了单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）在癌症研究中的最新进展及其对临床治疗的指导意义 | scRNA-seq在肿瘤异质性、肿瘤进化、转移扩散、化疗耐药性发展以及肿瘤微环境与免疫系统关系方面取得了突破性发现 | NA | 探讨scRNA-seq技术在癌症研究中的应用及其对临床治疗的指导作用 | 癌症细胞及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 504 | 2024-08-09 |
Integration of single-cell datasets reveals novel transcriptomic signatures of β-cells in human type 2 diabetes
2020-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa097
PMID:33575641
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据集，揭示了人类2型糖尿病中β细胞的新转录组特征 | 首次通过整合多个独立研究的单细胞RNA测序数据集，克服了变异源的干扰，更准确地识别了2型糖尿病β细胞的共同转录组特征 | 研究依赖于已有的单细胞RNA测序数据集，可能受到原始数据质量的影响 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，识别与人类2型糖尿病相关的β细胞转录组变化 | 人类2型糖尿病中的胰腺β细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 3046个单细胞，表达27931个基因 |
| 505 | 2024-08-09 |
Normalizing single-cell RNA sequencing data with internal spike-in-like genes
2020-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa059
PMID:33575610
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研究论文 | 本文开发了一种基于少量恒定表达基因作为内部标准品的算法，用于单细胞RNA测序数据的归一化处理 | 提出了一种新的归一化方法ISnorm，使用内部类似标准品的恒定表达基因来归一化单细胞RNA测序数据，以应对转录组的大幅变化 | NA | 改进单细胞RNA测序数据归一化方法，提高下游分析的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个案例研究数据集 |
| 506 | 2024-08-09 |
Dimensionality reduction for single cell RNA sequencing data using constrained robust non-negative matrix factorization
2020-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa064
PMID:33575614
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研究论文 | 本文开发了一种用于单细胞RNA测序数据降维的方法，该方法在非负矩阵分解框架下同时进行降维和缺失值插补 | 提出了一种结合降维和缺失值插补的新方法，并通过加权ℓ惩罚确保稀疏模式得以维持 | NA | 开发一种新的降维方法，以解决单细胞RNA测序数据中的缺失值和非负性约束问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | RNA测序数据 | 使用了合成数据和真实数据进行实验 |
| 507 | 2024-08-09 |
Comparative performance of the BGI and Illumina sequencing technology for single-cell RNA-sequencing
2020-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa034
PMID:33575589
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研究论文 | 本文比较了Illumina NextSeq 500、NovaSeq 6000与BGI MGISEQ-2000平台在单细胞RNA测序中的性能 | 首次对比了不同高通量测序平台在单细胞RNA测序中的性能 | NA | 评估不同测序平台在单细胞RNA测序中的性能 | Illumina NextSeq 500、NovaSeq 6000与BGI MGISEQ-2000测序平台 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 超过70,000个细胞 |
| 508 | 2024-08-09 |
Deep soft K-means clustering with self-training for single-cell RNA sequence data
2020-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa039
PMID:33575592
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研究论文 | 本文提出了一种结合深度学习和去噪自编码器的软自训练K-means算法，用于单细胞RNA测序数据的聚类 | 本文创新性地结合了深度学习技术和去噪自编码器，提出了一种软自训练K-means算法，有效解决了现有算法在处理高维、稀疏和大规模转录表达数据时的局限性 | NA | 研究目的是改进单细胞RNA测序数据的聚类方法 | 研究对象是单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 深度学习, 去噪自编码器 | 自编码器 | RNA测序数据 | 大规模数据集 |
| 509 | 2024-08-09 |
Bayesian correlation is a robust gene similarity measure for single-cell RNA-seq data
2020-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa002
PMID:33575552
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞RNA测序数据中使用贝叶斯相关性作为基因相似性度量的鲁棒性 | 提出了一种贝叶斯相关性方案，该方案通过考虑低置信度表达估计的基因来扩展其在单细胞RNA测序数据中的应用 | NA | 旨在扩展贝叶斯相关性在单细胞RNA测序数据中的应用，通过三种方式计算相似性 | 单细胞RNA测序数据中的基因相似性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 贝叶斯相关性算法 | 基因表达数据 | 涉及多个细胞和基因对 |
| 510 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis Reveals Characterization of Infiltrating T Cells in Moderately Differentiated Colorectal Cancer
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.620196
PMID:33584715
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序数据分析中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征及其在结肠癌和直肠癌中的差异 | NA | 研究中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征 | 中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 肿瘤组织中1632个T细胞和外周血中1252个T细胞 |
| 511 | 2024-08-09 |
Intestinal Stem Cells and Immune Cell Relationships: Potential Therapeutic Targets for Inflammatory Bowel Diseases
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.623691
PMID:33584726
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研究论文 | 本文探讨了肠道干细胞与免疫细胞之间的关系，并提出这些关系可能是治疗炎症性肠病的新疗法 | 提出了将生物制剂与肠道干细胞移植结合的新疗法，以改善炎症性肠病患者的临床症状和疾病复发情况 | NA | 研究肠道干细胞与免疫细胞的相互作用，探索治疗炎症性肠病的新策略 | 肠道干细胞、分化上皮细胞和肠道驻留免疫细胞 | NA | 炎症性肠病 | 肠道类器官培养和单细胞RNA测序技术 | NA | NA | NA |
| 512 | 2024-08-09 |
Construction of Bone Metastasis-Specific Regulation Network Based on Prognostic Stemness-Related Signatures in Breast Invasive Carcinoma
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.613333
PMID:33585235
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研究论文 | 本研究基于预测性干细胞相关特征（PSRSs）构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络 | 首次基于PSRSs构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络，并发现CD248是关键的PSRS，受MAF正向调控并通过顶端连接途径影响骨转移 | NA | 构建乳腺癌骨转移特异性调控网络，并探索其潜在的治疗策略 | 乳腺癌骨转移的调控网络及其治疗策略 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 1080个原发性乳腺癌样本（1048个无骨转移，32个有骨转移） |
| 513 | 2024-08-09 |
Alterations in Chromatin Structure and Function in the Microglia
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.626541
PMID:33553166
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在不同发育阶段和疾病条件下表观遗传机制的变化及其对功能多样性的影响 | 总结了当前关于微胶质细胞表观遗传机制的知识，并讨论了这些知识如何促进疾病治疗策略的发展 | NA | 探讨微胶质细胞表观遗传变化对功能多样性的影响及其在疾病治疗中的应用 | 微胶质细胞的表观遗传机制及其在不同发育阶段和疾病条件下的变化 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | NA |
| 514 | 2024-08-09 |
Susceptibility Factors of Stomach for SARS-CoV-2 and Treatment Implication of Mucosal Protective Agent in COVID-19
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.597967
PMID:33521016
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃对SARS-CoV-2的易感性因素，并探讨黏膜保护剂在COVID-19治疗中的应用 | 首次探讨了胃黏膜对SARS-CoV-2的易感性因素，并评估了黏膜保护剂在阻断SARS-CoV-2从胃到肠道传播中的潜在作用 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的易感性因素 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃的易感性因素 | SARS-CoV-2感染患者及胃黏膜样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胃黏膜样本和420例COVID-19患者 |
| 515 | 2024-08-09 |
Dissecting the Invasion-Associated Long Non-coding RNAs Using Single-Cell RNA-Seq Data of Glioblastoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.633455
PMID:33505440
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研究论文 | 本研究通过分析来自四名胶质母细胞瘤患者的3345个单细胞RNA测序数据，识别了与胶质母细胞瘤发展和进展相关的失调基因，包括长非编码RNAs（lncRNAs），并通过共表达网络分析和整合EMT签名、实验验证的侵袭标记及伪时间轨迹分析，确认了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs，并展示了这些lncRNAs在肿瘤细胞侵袭轨迹中的逐渐增加的表达水平。 | 研究仅基于两个数据集的分析，可能需要更多样本和数据集来进一步验证这些发现。 | 理解胶质母细胞瘤细胞侵袭的分子机制，为治疗提供新的见解和潜在靶点。 | 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序数据和相关的lncRNAs。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | RNA测序数据 | 3345个细胞来自四名患者，以及7930个单细胞来自28名胶质母细胞瘤患者 |
| 516 | 2024-08-09 |
The Role of Anti-angiogenesis in the Treatment Landscape of Non-small Cell Lung Cancer - New Combinational Approaches and Strategies of Neovessel Inhibition
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.610903
PMID:33469537
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）治疗中抗血管生成的作用，探讨了新的联合治疗策略和血管新生抑制方法 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）等先进方法深入表征NSCLC的肿瘤微环境（TME），识别更个性化的抗血管生成抑制新方面 | 抗血管生成疗法在NSCLC患者中仅产生边际临床效益，原因包括高度适应性的肿瘤微环境和对肿瘤血管特征的理解不足 | 总结肿瘤血管生成和相应抗血管生成疗法的当前知识，探讨新的抗血管生成治疗策略和血管抑制方法 | 非小细胞肺癌（NSCLC）及其肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 517 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals That Metabolites Produced by Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526 Ameliorate Type 2 Diabetes in GK Rats by Downregulating the Inflammatory Response
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.568805
PMID:33424779
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526产生的代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，发现这些代谢物通过下调炎症反应改善了GK大鼠的2型糖尿病症状 | 首次使用单细胞RNA测序技术探讨BD3526代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，并揭示了代谢物通过调节免疫细胞和DCs中的WNT/β-catenin通路来改善糖尿病的机制 | NA | 研究BD3526代谢物如何通过调节肠道细胞和免疫细胞来改善2型糖尿病 | Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526的代谢物对GK大鼠肠道细胞和免疫细胞的影响 | 代谢综合征 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及GK大鼠的肠道细胞和免疫细胞样本 |
| 518 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Efficiently Predicts Transcription Factor Targets in Plants
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.603302
PMID:33424903
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研究论文 | 本研究首次基于10× Genomics的单细胞RNA测序方法，在稻叶细胞中建立了一个简单的系统来预测转录因子（TF）目标 | 首次在植物中利用单细胞RNA测序技术有效预测转录因子目标，并提供了一种新的应用 | NA | 探索转录因子目标，以研究调控途径 | 稻叶细胞中的转录因子OsNAC78及其目标基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 涉及多个单细胞的转录组 |
| 519 | 2024-08-09 |
Discrepant mRNA and Protein Expression in Immune Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
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研究论文 | 研究报道了免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平不一致的现象 | 提出将单细胞mRNA测序（scRNA-seq）与其他测序方法（如CITE-seq）结合使用，以提高结果的精确性和可信度 | 未提及具体限制 | 探讨免疫细胞中mRNA与蛋白质表达水平的差异 | 免疫细胞中的mRNA与蛋白质表达 | NA | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA与蛋白质表达数据 | 未提及具体样本数量 |
| 520 | 2024-08-09 |
Single-cell Sequencing in the Field of Stem Cells
2020-Dec, Current genomics
IF:1.8Q3
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在干细胞领域的最新进展和未来展望 | 单细胞测序技术能够有效分析细胞异质性并识别少数细胞群体 | NA | 探讨单细胞测序技术在干细胞研究中的应用 | 多能干细胞、组织特异性干细胞和癌症干细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 单个细胞 |