单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2024-08-07 |
Group 2 Innate Lymphoid Cells Coordinate Damage Response in the Stomach
2020-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.08.051
PMID:32891625
|
研究论文 | 本文研究了2型先天淋巴细胞（ILC2s）在胃上皮修复中的作用 | 发现ILC2s在胃组织损伤后协调了metaplastic反应 | NA | 探讨ILC2s在胃上皮修复中的作用 | 2型先天淋巴细胞（ILC2s）在胃上皮修复中的作用 | NA | 胃癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 组织 | C57BL/6J小鼠和胃腺癌患者组织样本 |
| 462 | 2024-08-07 |
Manipulating niche composition limits damage to haematopoietic stem cells during Plasmodium infection
2020-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00601-w
PMID:33230302
|
研究论文 | 本文通过使用疟疾的小鼠模型，结合单细胞RNA测序、数学建模、移植实验和活体显微镜技术，研究了感染对造血干细胞（HSCs）功能的影响及其机制 | 首次展示了感染期间造血干细胞功能受影响的机制，并提出了通过调节骨髓微环境来恢复造血干细胞功能的方法 | NA | 探讨感染对造血干细胞功能的影响及其机制 | 造血干细胞及其骨髓微环境 | NA | 疟疾 | 单细胞RNA测序、数学建模、移植实验、活体显微镜技术 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 463 | 2024-08-07 |
RUNX1 marks a luminal castration-resistant lineage established at the onset of prostate development
2020-10-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.60225
PMID:33025905
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research paper | 本研究报告转录因子RUNX1标记了发育和成年小鼠前列腺中特定亚群的近端腔细胞（PLCs），这些细胞在前列腺发育的早期阶段出现，并与前列腺上皮细胞的谱系关系有关。 | 首次发现RUNX1 PLCs是一个内在的抗去势且自我维持的谱系，这些细胞不受雄激素剥夺的影响，且不参与远端腔隔室的再生。 | NA | 阐明前列腺上皮细胞的层次结构和谱系异质性，以理解其再生特性和恶性病变。 | 小鼠前列腺中的近端腔细胞（PLCs）及其在前列腺发育和成年阶段的功能。 | digital pathology | prostate cancer | scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 464 | 2024-08-07 |
Ageing compromises mouse thymus function and remodels epithelial cell differentiation
2020-08-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.56221
PMID:32840480
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研究论文 | 本文研究了衰老对小鼠胸腺功能的影响及其对上皮细胞分化的重塑作用 | 首次揭示了衰老过程中胸腺祖细胞分化受损的分子和细胞机制 | NA | 探讨衰老如何影响胸腺功能和上皮细胞分化 | 小鼠胸腺及其上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序和谱系追踪 | NA | RNA序列 | NA |
| 465 | 2024-08-07 |
Advances and challenges in epigenomic single-cell sequencing applications
2020-08, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2020.01.013
PMID:32304986
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在表观基因组学应用中的进展与挑战 | 单细胞测序方法消除了细胞群体或复杂组织的平均效应，但多模态数据的计算整合可能仍不完全反映基础生物学 | 目前的方法可能无法完全反映基础生物学，需要多模态分析来克服这些不足 | 理解多细胞生理学和病理生物学中基因型、染色质组织和表型之间的关系 | 探讨单细胞测序技术在表观基因组学中的应用 | 表观基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | NA |
| 466 | 2024-08-07 |
Distinct synovial tissue macrophage subsets regulate inflammation and remission in rheumatoid arthritis
2020-08, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0939-8
PMID:32601335
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研究论文 | 研究探讨了类风湿性关节炎（RA）中滑膜组织巨噬细胞（STM）在无药物缓解中的免疫调节机制 | 通过单细胞转录组学分析，识别了不同临床状态下四种不同STM亚群中的九种不同表型簇，并揭示了两种具有独特缓解转录组特征的STM亚群（MerTKTREM2和MerTKLYVE1） | NA | 探究类风湿性关节炎中滑膜组织巨噬细胞在无药物缓解中的免疫调节机制 | 滑膜组织巨噬细胞及其在类风湿性关节炎中的作用 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 32,000个滑膜组织巨噬细胞 |
| 467 | 2024-08-07 |
Synthetic Lethal and Resistance Interactions with BET Bromodomain Inhibitors in Triple-Negative Breast Cancer
2020-06-18, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2020.04.027
PMID:32416067
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研究论文 | 研究探讨了BET溴结构域抑制剂在三阴性乳腺癌中的合成致死和耐药相互作用 | 通过CRISPR和分子筛选技术，发现了与BET溴结构域抑制剂合成致死相互作用的基因，并揭示了细胞周期调控因子、YAP、AXL和SRC信号通路以及化疗药物的协同作用 | 文章指出BET溴结构域抑制剂存在固有和获得性耐药问题，限制了其在临床上的应用 | 旨在识别和理解BET溴结构域抑制剂在三阴性乳腺癌中的合成致死和耐药机制 | 三阴性乳腺癌细胞及其对BET溴结构域抑制剂的响应和耐药性 | 癌症研究 | 乳腺癌 | CRISPR, 小分子抑制剂筛选, 单细胞RNA测序, ATAC测序, 细胞条形码分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 敏感和耐药的细胞系 |
| 468 | 2024-08-07 |
Data generation and network reconstruction strategies for single cell transcriptomic profiles of CRISPR-mediated gene perturbations
2020-06, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2019.194441
PMID:31756390
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研究论文 | 本文讨论了如何克服关键挑战，以生成和分析数据，从而自信地重建细胞网络模型，特别是针对单细胞CRISPR/Cas9数据的挑战 | 提出了几种网络重建方法，包括共表达网络和贝叶斯网络，并强调了嵌套效应模型在单细胞RNA测序数据网络重建中的潜力 | 讨论了网络重建方法的局限性 | 开发大规模扰动研究的方法，并提供有关细胞响应背后生物网络的信息 | 单细胞转录组数据和CRISPR/Cas9技术 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，CRISPR/Cas9 | 共表达网络，贝叶斯网络，嵌套效应模型 | 转录组数据 | NA |
| 469 | 2024-08-07 |
Iterative Single-Cell Analyses Define the Transcriptome of the First Functional Hematopoietic Stem Cells
2020-05-12, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107627
PMID:32402290
|
研究论文 | 本文通过迭代单细胞分析方法，定义了小鼠胚胎中最早的功能性造血干细胞（HSC）的转录组 | 使用Gata2为基础的富集方法，直接关联到HSC的内部调控网络，并通过迭代分析揭示了特定的分子特征与HSC及多能祖细胞功能的关联 | NA | 确定小鼠胚胎中最早的功能性HSC的转录组特征 | 小鼠胚胎中的造血干细胞及其转录组 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包含1-2个细胞的主动脉簇 |
| 470 | 2024-08-07 |
Dissecting the early steps of MLL induced leukaemogenic transformation using a mouse model of AML
2020-03-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15220-0
PMID:32179751
|
研究论文 | 本文利用条件性阻断在多能造血祖细胞阶段的细胞，开发了一种MLL-r模型，捕捉MLL-ENL表达的早期细胞和分子后果，并通过scRNA-seq、ATAC-seq和全基因组CRISPR-Cas9筛选，识别可能驱动白血病早期阶段的通路和基因。 | 开发了一种新的MLL-r模型，捕捉早期白血病转化的细胞和分子后果，并结合多种高通量技术进行深入分析。 | NA | 研究MLL诱导的白血病转化早期步骤的细胞和分子机制。 | MLL-ENL表达对造血祖细胞的影响及其在白血病转化中的作用。 | NA | 急性髓系白血病 | scRNA-seq, ATAC-seq, CRISPR-Cas9 | NA | 基因组数据 | NA |
| 471 | 2024-08-07 |
Re-evaluation of human BDCA-2+ DC during acute sterile skin inflammation
2020-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190811
PMID:31845972
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研究论文 | 本文研究了在急性无菌皮肤炎症期间，BDCA-2+CD123int DC亚群在人类皮肤伤口中的快速浸润现象 | 发现了先前未被识别的CD123intBDCA-2+CD1a+ DC亚群在急性无菌炎症早期皮肤浸润的现象 | NA | 重新评估pDC在皮肤疾病中的作用 | BDCA-2+CD123int DC亚群和Axl+Siglec-6+ DCs（ASDC）在皮肤炎症中的作用 | 免疫学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 472 | 2024-08-07 |
Bone Marrow Stromal Cells Drive Key Hallmarks of B Cell Malignancies
2020-Feb-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21041466
PMID:32098106
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综述 | 本文综述了骨髓基质细胞与恶性B细胞之间的相互作用及其对信号传导、基因表达和代谢适应的深远影响 | 近期单细胞测序技术揭示了骨髓微环境的未被重视的细胞异质性，并探讨了肿瘤细胞与基质细胞相互作用的分子机制 | 对于这些细胞亚型如何相互作用并调节正常和恶性造血仍需进一步研究 | 探讨骨髓基质细胞与恶性B细胞在病理条件下的合作机制 | 骨髓基质细胞与恶性B细胞的相互作用 | NA | B细胞恶性肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA |
| 473 | 2024-08-07 |
Loss of Kat2a enhances transcriptional noise and depletes acute myeloid leukemia stem-like cells
2020-01-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51754
PMID:31985402
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研究论文 | 研究探讨了Kat2a基因在急性髓系白血病（AML）中的作用，发现Kat2a的缺失增强了转录噪音并耗尽了AML干细胞样细胞 | 首次证明了Kat2a在AML中的遗传脆弱性，并通过染色质分析和单细胞转录组学揭示了Kat2a对AML干细胞样细胞的维持作用 | 研究基于条件性敲除小鼠模型，可能需要进一步的人体细胞实验验证 | 探讨Kat2a在AML中的作用及其对AML干细胞样细胞的影响 | 急性髓系白血病及其干细胞样细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 染色质分析，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 条件性敲除小鼠 |
| 474 | 2024-08-07 |
Developmental trajectory of prehematopoietic stem cell formation from endothelium
2020-08-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020004801
PMID:32392346
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，探索了从小鼠胚胎尾部动脉的血管内皮细胞到造血干细胞前体的发育轨迹 | 首次识别出从内皮细胞到造血干细胞前体的连续发育轨迹，并定义了一个新的中间阶段——pre-HE细胞，该阶段具有特定的染色质可及性和转录因子富集 | NA | 探究造血干细胞前体形成的细胞和分子转变过程 | 小鼠胚胎的尾部动脉（背主动脉、脐动脉、卵黄动脉）中的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 细胞 | 约40,000个细胞从小鼠胚胎的9.5天到11.5天 |
| 475 | 2024-08-07 |
Transcriptional dynamics of pluripotent stem cell-derived endothelial cell differentiation revealed by single-cell RNA sequencing
2020-03-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz351
PMID:31242503
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人胚胎干细胞衍生的内皮细胞在定向分化过程中的转录动态 | 发现了内皮细胞和间充质细胞谱系的分化过程中的转录分支以及新的转录特征 | NA | 探索从多能干细胞到内皮细胞分化的转录景观和细胞动态 | 人胚胎干细胞衍生的内皮细胞及其与成熟内皮细胞的比较 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 总共105,727个细胞进行了单细胞RNA测序分析 |
| 476 | 2024-08-07 |
Therapy-induced mutations drive the genomic landscape of relapsed acute lymphoblastic leukemia
2020-01-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019002220
PMID:31697823
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研究论文 | 研究急性淋巴细胞白血病（ALL）复发机制，通过全基因组测序和超深度测序分析复发特异性体细胞变异 | 发现了两种新的复发特异性突变特征，其中一种与硫嘌呤治疗有关，这些特征在非ALL的复发样本和泛癌诊断样本中未见 | 研究主要集中在特定基因和突变特征上，可能未涵盖所有影响ALL复发的因素 | 探究急性淋巴细胞白血病复发机制及其与治疗诱导突变的关系 | 急性淋巴细胞白血病患者的诊断-复发-胚系三联体和连续样本 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，超深度测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 103个诊断-复发-胚系三联体和16名患者的208个连续样本 |
| 477 | 2024-08-07 |
EPISCORE: cell type deconvolution of bulk tissue DNA methylomes from single-cell RNA-Seq data
2020-09-04, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02126-9
PMID:32883324
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研究论文 | 本文介绍了一种名为EPISCORE的计算算法，用于从单细胞RNA测序数据中对大量组织DNA甲基化数据进行细胞类型反卷积 | EPISCORE算法通过应用概率性的表观遗传模型，利用单细胞RNA测序组织图谱生成组织特异性的DNA甲基化参考矩阵，从而实现对大量组织数据的细胞类型比例和细胞类型特异性差异甲基化信号的量化 | NA | 开发一种算法，用于解决细胞类型异质性对表观基因组数据解释的挑战 | 大量组织DNA甲基化数据和单细胞RNA测序数据 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率性表观遗传模型 | DNA甲基化数据 | 多个表观基因组研究和组织类型 |
| 478 | 2024-08-07 |
MYC Drives Temporal Evolution of Small Cell Lung Cancer Subtypes by Reprogramming Neuroendocrine Fate
2020-07-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2020.05.001
PMID:32473656
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研究论文 | 本研究通过时间序列单细胞转录组分析，揭示了MYC在小细胞肺癌亚型动态演化中的驱动作用 | 首次揭示了MYC通过激活Notch信号通路，促使小细胞肺癌从ASCL1到NEUROD1再到YAP1状态的时间性转变 | NA | 探讨MYC在小细胞肺癌亚型演化中的作用机制 | 小细胞肺癌的分子亚型及其动态演化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠和人类模型进行研究 |
| 479 | 2024-08-07 |
Nuclear MYH9-induced CTNNB1 transcription, targeted by staurosporin, promotes gastric cancer cell anoikis resistance and metastasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.46001
PMID:32685004
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研究论文 | 本文通过多种技术手段研究了MYH9在胃癌细胞中的表达及其对细胞凋亡抵抗和转移的影响，并探讨了staurosporin对其的抑制作用。 | 首次揭示了核定位的MYH9通过促进CTNNB1转录来增强胃癌细胞的凋亡抵抗和转移能力，并发现staurosporin可以作为潜在的治疗药物。 | NA | 探讨MYH9在胃癌转移中的作用及其潜在的治疗策略。 | 胃癌细胞及胃癌患者的转移组织。 | 数字病理学 | 胃癌 | 2-DIGE, MALDI-TOF/TOF MS, 单细胞转录组, 免疫荧光, 免疫透射电子显微镜, 染色质分离, 共免疫沉淀, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告, 琼脂糖-寡核苷酸拉下, 流式细胞术, 细胞凋亡检测 | NA | 蛋白质, 转录组 | 包括正常胃黏膜、原发性胃癌及腹膜转移组织，以及胃癌细胞系和裸鼠模型。 |
| 480 | 2024-08-07 |
A single-cell landscape of high-grade serous ovarian cancer
2020-08, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0926-0
PMID:32572264
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了11名高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者腹水样本中的约11,000个细胞，全面表征了HGSOC腹水生态系统 | 发现了腹水细胞组成的显著患者间变异性，包括免疫调节性成纤维细胞亚群和二分法巨噬细胞群体，并揭示了恶性细胞的异质性部分由异质性拷贝数改变模式或干细胞程序表达所解释 | NA | 全面表征高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）腹水生态系统 | 高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者的腹水细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 22个腹水样本，11名患者 |