单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the developing Drosophila ovary identifies follicle stem cell progenitors
2020-02-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.330464.119
PMID:31919193
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了发育中的果蝇卵巢中所有已知细胞类型，并识别了细胞类型特异性标记，用于追踪细胞谱系 | 本研究首次鉴定了难以捉摸的卵泡干细胞前体细胞类型，并预测了已知细胞类型的亚型 | NA | 旨在全面理解成年细胞类型、其起源及前体关系，特别是在器官发生过程中的复杂性 | 发育中的果蝇卵巢中的细胞类型及其前体关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 402 | 2024-08-07 |
ReactomeGSA - Efficient Multi-Omics Comparative Pathway Analysis
2020-12, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1074/mcp.TIR120.002155
PMID:32907876
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研究论文 | 介绍了一种名为ReactomeGSA的新资源，用于多组学数据集的比较途径分析 | ReactomeGSA通过Reactome的现有网页界面和新的ReactomeGSA R Bioconductor包，支持scRNA-seq数据，并能自动将不同物种的数据映射到共同的途径空间，大大降低了多组学、跨物种比较途径分析的技术门槛 | NA | 探索多组学数据集的比较途径分析方法 | B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | 生物信息学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 多组学数据 | 比较了来自Cancer Genome Atlas (TCGA)的五个转录组学研究和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC)的两个蛋白质组学研究的B细胞丰富和贫乏的人类癌症样本 |
| 403 | 2024-08-07 |
Quantitative single-cell interactomes in normal and virus-infected mouse lungs
2020-06-26, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.044404
PMID:32461220
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研究论文 | 本文介绍了一种定量直观算法和优化实验方案，用于构建和比较正常与感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞间的相互作用网络。 | 提出了一种新的定量直观算法，结合优化的实验协议，使不具有高级编程技能的实验室科学家也能适应。 | 算法和方法的通用性需要在其他器官和人类样本中进一步验证。 | 解析哺乳动物器官中通过配体-受体相互作用进行的细胞间信号传递，特别是在病毒感染情况下的变化。 | 正常和感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 定量直观算法 | RNA序列数据 | 每种细胞类型至少90个细胞 |
| 404 | 2024-08-07 |
Clonally expanded CD8 T cells patrol the cerebrospinal fluid in Alzheimer's disease
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1895-7
PMID:31915375
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研究论文 | 本研究通过综合分析多个队列，揭示了阿尔茨海默病中血液和脑脊液的适应性免疫变化，并发现了克隆扩增的CD8 T细胞在脑脊液中的存在 | 首次发现阿尔茨海默病患者脑脊液中存在克隆扩增的CD8 T细胞，并证实这些细胞对Epstein-Barr病毒抗原具有特异性 | NA | 探究阿尔茨海默病中适应性免疫反应的贡献 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞和脑脊液中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 机器学习 | 细胞 | 多个队列的患者样本 |
| 405 | 2024-08-07 |
Effective single-cell clustering through ensemble feature selection and similarity measurements
2020-May-19, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于集成特征选择和相似性度量的有效单细胞聚类算法 | 该算法通过多特征采样方法测量细胞间的相似性，并构建基于细胞间相似性的集成网络，最终应用基于网络的聚类算法进行单细胞聚类 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞类型分类和识别的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成特征选择和相似性度量 | 基因表达数据 | 多个真实世界的单细胞RNA测序数据集 |
| 406 | 2024-08-07 |
Resolving the Instructions for αβ T Cell Development
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.014
PMID:33326761
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研究论文 | Chopp等人利用单细胞转录组学和表观基因组学在鼠和人类样本中描绘了αβ T细胞亚群的发育轨迹，并细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | 利用单细胞转录组学和表观基因组学技术，细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | NA | 描绘αβ T细胞亚群的发育轨迹并细化T细胞谱系承诺的模型 | αβ T细胞亚群的发育轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 鼠和人类样本 |
| 407 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics analysis showing functional heterogeneity in decidual stromal cells during labor
2020-Dec-28, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1136/jim-2020-001616
PMID:33372108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了分娩前后基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了分娩过程中基底层间质细胞的功能异质性 | NA | 研究分娩过程中基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 基底层间质细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6382个细胞 |
| 408 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of long noncoding RNAs and their cell lineage commitment roles via RNA-DNA-DNA triplex formation in mammary epithelium
2020-Sep-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3274
PMID:32930441
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研究论文 | 本研究利用高吞吐量的单细胞RNA测序数据，探讨了长非编码RNA（lncRNAs）在乳腺上皮细胞中的表达模式及其在细胞谱系承诺中的作用，通过lncRNA-DNA-DNA三链结构的形成进行功能验证。 | 首次通过单细胞RNA测序数据全面注释乳腺上皮细胞中的lncRNAs表达，并揭示了lncRNAs通过形成三链结构调控下游谱系特异性标记基因的机制。 | 研究仅以lncRNA-Carmn为例进行验证，可能需要进一步的研究来验证其他lncRNAs在细胞谱系承诺中的作用。 | 探讨lncRNAs在乳腺上皮细胞中的表达模式及其在细胞谱系承诺中的作用。 | 乳腺上皮细胞中的长非编码RNA（lncRNAs）及其在细胞谱系承诺中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 409 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of equine mesenchymal stromal cells from primary donor-matched tissue sources reveals functional heterogeneity in immune modulation and cell motility
2020-12-04, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-02043-5
PMID:33276815
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了从马的三种不同组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）获得的间充质干细胞，揭示了这些细胞在免疫调节和细胞迁移功能上的异质性 | 首次在马的间充质干细胞中使用单细胞RNA测序技术，并结合功能实验验证了转录差异与细胞迁移和免疫调节功能的关系 | NA | 研究间充质干细胞的异质性及其对治疗潜力的影响 | 马的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从三种植入匹配的组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）收集的马间充质干细胞 |
| 410 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of human islet ontogeny defines the molecular basis of β-cell dedifferentiation in T2D
2020-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.101057
PMID:32739450
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了人类发育过程中α-和β-细胞的成熟过程，并比较了非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞。 | 首次揭示了2型糖尿病患者胰岛β细胞的去分化现象及其分子基础。 | NA | 探讨2型糖尿病中胰岛β细胞去分化的分子机制。 | 人类胰岛细胞的成熟过程及2型糖尿病中的变化。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞样本 |
| 411 | 2024-08-07 |
Sexually Dimorphic Crosstalk at the Maternal-Fetal Interface
2020-12-01, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaa503
PMID:32772088
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研究论文 | 研究胎儿性别如何影响母胎界面的受体配体相互作用，并探讨其在早期胎盘形成中的作用 | 首次定义了早期胎盘形成阶段的性别二态性信号 | NA | 探究胎儿性别对母胎界面相互作用的影响 | 母胎界面的受体配体相互作用及早期胎盘形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 晚期第一孕期（约10-13周）的胎盘（胎儿）和蜕膜（母体）样本 |
| 412 | 2024-08-07 |
Integrative genomics approach identifies conserved transcriptomic networks in Alzheimer's disease
2020-10-10, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa182
PMID:32803238
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研究论文 | 本研究采用系统生物学元分析方法，结合多尺度数据集，分析了阿尔茨海默病（AD）的遗传结构，并识别了AD相关的转录组网络。 | 本研究通过整合多种数据类型，包括DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究等，识别了AD中未在正常衰老中改变的稳健转录组失调。 | NA | 进一步阐明阿尔茨海默病的遗传结构 | 阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究 | 共表达网络分析 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 超过1200个人脑样本，27,321个来自人类死后前额叶皮质组织的细胞核 |
| 413 | 2024-08-07 |
Single-cell deconstruction of post-sepsis skeletal muscle and adipose tissue microenvironments
2020-10, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.12596
PMID:32643301
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研究论文 | 本研究全面评估了实验性脓毒症诱导后肌肉和脂肪在单细胞分辨率下的转录变化 | 首次从组织微环境的角度全面评估了脓毒症后肌肉和脂肪的单细胞转录变化 | NA | 研究脓毒症后肌肉和脂肪组织的微环境变化 | 小鼠的骨骼肌和内脏白色脂肪组织 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达 | 骨骼肌1438个单细胞，脂肪组织2281个单细胞 |
| 414 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing in cardiovascular development, disease and medicine
2020-08, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-020-0359-y
PMID:32231331
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其在心血管系统发育、疾病和精准医学中的应用 | scRNA-seq技术使得能够在前所未有的分辨率和通量下对单细胞转录组进行分析，促进了新细胞类型和罕见细胞类型的鉴定，以及健康和疾病相关组织在单细胞水平上的比较 | NA | 总结当前可用的scRNA-seq技术和分析工具，并讨论使用scRNA-seq的最新发现，这些发现显著提高了我们对心血管系统发育和心血管疾病机制的认识 | 心血管系统的发育、心血管疾病以及心血管精准医学 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 415 | 2024-08-07 |
Alveolar wars: The rise of in vitro models to understand human lung alveolar maintenance, regeneration, and disease
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0433
PMID:32272001
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研究论文 | 本文讨论了利用体外模型，特别是单细胞RNA测序和人类肺泡类器官，来研究人类肺泡的维持、再生和疾病 | 文章介绍了通过单细胞RNA测序技术识别肺泡细胞的分子异质性和细胞多样性，以及从人类多能干细胞、胚胎祖细胞和成人组织中建立的肺泡类器官模型 | 文章指出了现有系统的局限性，并提出了可能的解决方案，如使用芯片上的类器官和精确切割的肺切片等 | 旨在深入理解人类肺泡干细胞/祖细胞的生物学特性，并探索未来对晚期肺疾病患者的治疗或药物干预 | 研究对象包括人类肺泡的维持、再生和疾病，特别是与肺泡细胞相关的疾病如特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺病和支气管肺发育不良 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 涉及从健康和疾病肺组织中提取的多种样本 |
| 416 | 2024-08-07 |
Cell type-specific immune dysregulation in severely ill COVID-19 patients
2020-Jul-24, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2020.07.23.20161182
PMID:32743611
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了COVID-19患者外周血单个核细胞的转录组，以揭示严重病例中的免疫失调反应 | 首次详细描述了COVID-19患者中ARDS相关的特定免疫缺陷和炎症反应 | 样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 进一步阐明SARS-CoV-2感染导致严重临床过程的免疫失调反应 | COVID-19患者的免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 17名COVID-19患者，包括5名轻症患者、6名发展为ARDS的患者和6名从ARDS恢复的患者 |
| 417 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of alloreactive CD4+ T cells over time reveals divergent fates during gut graft-versus-host disease
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.137990
PMID:32484791
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组测序和计算建模，探讨了在小鼠模型中，供体树突细胞介导的GVHD加剧过程中，同种异体反应性CD4+ T细胞在肠道GVHD中的分化途径 | 首次在单细胞水平上揭示了GVHD过程中同种异体反应性CD4+ T细胞的分化轨迹，包括一个意外的第二轨迹，表现为低增殖、低细胞因子表达、高tcf7表达和较高的静息状态 | 研究基于小鼠模型，其结果在人类患者中的适用性需要进一步验证 | 探讨同种异体反应性CD4+ T细胞在肠道GVHD中的分化途径及其在GVHD过程中的作用 | 同种异体反应性CD4+ T细胞在肠道GVHD中的分化途径 | 单细胞测序 | GVHD | scRNA-Seq | 计算模型 | 转录组数据 | 小鼠模型中的CD4+ T细胞样本 |
| 418 | 2024-08-07 |
Ageing hallmarks exhibit organ-specific temporal signatures
2020-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2499-y
PMID:32669715
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和血浆蛋白质组学分析了Mus musculus的17个器官在10个不同年龄段的衰老动态，揭示了基因表达在衰老过程中的线性和非线性变化 | 首次进行了全生物体范围的衰老动态综合分析，并结合单细胞RNA测序数据，展示了免疫细胞在衰老过程中的广泛激活 | NA | 理解衰老过程中的生物学过程，以改善生活质量 | Mus musculus的17个器官和血浆在不同年龄段的衰老动态 | 生物学 | NA | RNA测序，蛋白质组学 | NA | 基因表达数据，蛋白质水平数据 | 17个器官，10个不同年龄段 |
| 419 | 2024-08-07 |
Joint single cell DNA-seq and RNA-seq of gastric cancer cell lines reveals rules of in vitro evolution
2020-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaa016
PMID:32215369
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研究论文 | 本研究通过单细胞DNA测序和RNA测序技术，分析了九种胃癌细胞系的细胞多样性，并揭示了体外进化的规律 | 首次量化了细胞系中共存的克隆数量及其特征，并通过单细胞RNA测序独立验证了单细胞DNA分析的克隆结构 | NA | 探究胃癌细胞系中的细胞多样性及其对实验重复性的影响 | 九种胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞DNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 8824个细胞的基因组，超过28000个单细胞的转录组 |
| 420 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Fibrosis Development in Nonalcoholic Steatohepatitis
2020-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2019.11.311
PMID:32044315
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综述 | 本文综述了非酒精性脂肪肝病如何进展为非酒精性脂肪性肝炎（NASH）并导致肝纤维化的机制，重点探讨了肝细胞、巨噬细胞和肝星状细胞之间的相互作用及其对纤维化发展的影响。 | 讨论了通过单细胞RNA测序揭示的肝星状细胞和巨噬细胞的异质性，以及这些发现对治疗干预的潜在影响。 | NA | 探讨非酒精性脂肪性肝炎中肝纤维化的发生机制及其治疗干预的可能性。 | 非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中的肝纤维化机制。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |