单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing demonstrates the molecular and cellular reprogramming of metastatic lung adenocarcinoma
2020-05-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-16164-1
PMID:32385277
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了转移性肺腺癌的分子和细胞重编程特征 | 首次对转移性肺腺癌进行了大规模的单细胞转录组分析，揭示了癌症细胞亚型及其在转移阶段的主导作用，以及肿瘤微环境中基质和免疫细胞的动态变化 | NA | 深入理解转移性肺腺癌的分子和细胞动态变化，并发现潜在的诊断和治疗靶点 | 转移性肺腺癌及其微环境中的细胞和分子特征 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 44名患者的208,506个细胞 |
| 402 | 2024-08-07 |
Transcriptomic profiling across the nonalcoholic fatty liver disease spectrum reveals gene signatures for steatohepatitis and fibrosis
2020-12-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aba4448
PMID:33268509
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研究论文 | 本研究通过大规模多中心研究，分析了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）进展至肝硬化过程中的转录组变化，以识别潜在的循环标志物 | 本研究首次识别了25个差异表达基因，这些基因在纤维化脂肪肝炎进展中具有一致性表达，并通过独立验证和整合分析进一步确认了这些基因的贡献 | NA | 揭示非酒精性脂肪肝病进展过程中的基因特征，并寻找潜在的疾病进展标志物 | 非酒精性脂肪肝病患者的肝脏组织 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 高通量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 206名NAFLD患者样本用于发现队列，175名患者样本用于验证队列 |
| 403 | 2024-08-07 |
Combinatorial expression of GPCR isoforms affects signalling and drug responses
2020-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2888-2
PMID:33149304
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研究论文 | 本文通过整合人类组织层面转录组、GPCR序列和结构、蛋白质组学、单细胞转录组学、全人群遗传关联研究及药理学实验数据，探讨了GPCR基因如何多样化成具有不同信号传导特性的几种亚型，以及不同组织中独特的亚型组合如何产生不同的信号状态。 | 本文首次系统地研究了GPCR亚型的组合表达如何影响信号传导和药物反应，强调了从传统观点向特定情境观点转变的必要性。 | NA | 研究GPCR亚型的组合表达如何影响信号传导和药物反应。 | GPCR亚型的组合表达及其对信号传导和药物反应的影响。 | 生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、遗传关联研究、药理学实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、遗传数据、药理学数据 | 涉及人类组织的多种数据集 |
| 404 | 2024-08-07 |
Inflammatory Bowel Disease Through the Lens of Single-cell RNA-seq Technologies
2020-10-23, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaa089
PMID:32386055
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在炎症性肠病（IBD）研究中的关键进展和计算分析的重要方面 | 利用多模态单细胞技术，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq），能够精确绘制组织结构图，鉴定先前被忽视的稀有细胞类型，并定义单细胞水平的功能 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何重塑我们对炎症性肠病复杂性的理解，并考虑其潜在的临床应用 | 肠道黏膜的细胞组成及其在炎症性肠病中的作用 | 生物技术 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 405 | 2024-08-07 |
Tumors induce de novo steroid biosynthesis in T cells to evade immunity
2020-07-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-17339-6
PMID:32680985
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤通过诱导T淋巴细胞中的从头类固醇生成来逃避抗肿瘤免疫的机制 | 首次展示了肿瘤诱导T细胞中的从头类固醇生成以逃避免疫反应，并证明了抑制类固醇生成途径足以恢复抗肿瘤免疫 | NA | 探讨肿瘤逃避免疫反应的复杂机制 | T淋巴细胞中的从头类固醇生成 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 使用转基因类固醇生成报告小鼠品系进行研究 |
| 406 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Dynamic Stromal Niche That Supports Tumor Growth
2020-05-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107628
PMID:32433953
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠黑色素瘤及其引流淋巴结在肿瘤发展不同阶段的间质成分 | 发现了三种时间上不同的间质细胞群，这些细胞群在鼠和人类肿瘤中显示出独特的功能特征，并揭示了间质细胞在疾病早期就能调节免疫环境的能力 | NA | 探索肿瘤发展过程中间质细胞的动态变化及其对肿瘤生长的支持作用 | 小鼠黑色素瘤及其引流淋巴结中的间质细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 407 | 2024-08-07 |
Cardiac Fibroblast Diversity
2020-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
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综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞的多样性和功能，并介绍了通过谱系追踪和单细胞测序技术在发育、成年和疾病状态下对这些细胞异质性的新见解 | 本文通过谱系追踪和单细胞测序技术揭示了心脏成纤维细胞在不同状态下的异质性 | NA | 探讨心脏成纤维细胞的多样性，为开发治疗心脏纤维化的新疗法提供基础 | 心脏成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 408 | 2024-08-07 |
Integrating single-cell RNA-seq and imaging with SCOPE-seq2
2020-11-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-76599-w
PMID:33173156
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研究论文 | 本文介绍了一种升级版的单细胞光学表型和表达分析技术（SCOPE-seq2），用于结合单细胞成像和表达谱分析 | SCOPE-seq2在通量、分子捕获效率、链接准确性和与标准显微镜设备的兼容性方面有显著改进，引入了改进的光学可解码mRNA捕获珠和更可扩展、简化的光学解码过程 | NA | 旨在提高单细胞成像和RNA测序技术的结合效率和应用范围 | 人类胶质母细胞瘤（GBM）手术样本中的单个原代细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像和文本 | 单个原代细胞 |
| 409 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the developing Drosophila ovary identifies follicle stem cell progenitors
2020-02-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.330464.119
PMID:31919193
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了发育中的果蝇卵巢中所有已知细胞类型，并识别了细胞类型特异性标记，用于追踪细胞谱系 | 本研究首次鉴定了难以捉摸的卵泡干细胞前体细胞类型，并预测了已知细胞类型的亚型 | NA | 旨在全面理解成年细胞类型、其起源及前体关系，特别是在器官发生过程中的复杂性 | 发育中的果蝇卵巢中的细胞类型及其前体关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 410 | 2024-08-07 |
ReactomeGSA - Efficient Multi-Omics Comparative Pathway Analysis
2020-12, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1074/mcp.TIR120.002155
PMID:32907876
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研究论文 | 介绍了一种名为ReactomeGSA的新资源，用于多组学数据集的比较途径分析 | ReactomeGSA通过Reactome的现有网页界面和新的ReactomeGSA R Bioconductor包，支持scRNA-seq数据，并能自动将不同物种的数据映射到共同的途径空间，大大降低了多组学、跨物种比较途径分析的技术门槛 | NA | 探索多组学数据集的比较途径分析方法 | B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | 生物信息学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 多组学数据 | 比较了来自Cancer Genome Atlas (TCGA)的五个转录组学研究和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC)的两个蛋白质组学研究的B细胞丰富和贫乏的人类癌症样本 |
| 411 | 2024-08-07 |
Quantitative single-cell interactomes in normal and virus-infected mouse lungs
2020-06-26, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.044404
PMID:32461220
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研究论文 | 本文介绍了一种定量直观算法和优化实验方案，用于构建和比较正常与感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞间的相互作用网络。 | 提出了一种新的定量直观算法，结合优化的实验协议，使不具有高级编程技能的实验室科学家也能适应。 | 算法和方法的通用性需要在其他器官和人类样本中进一步验证。 | 解析哺乳动物器官中通过配体-受体相互作用进行的细胞间信号传递，特别是在病毒感染情况下的变化。 | 正常和感染Sendai病毒的小鼠肺部细胞。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 定量直观算法 | RNA序列数据 | 每种细胞类型至少90个细胞 |
| 412 | 2024-08-07 |
Clonally expanded CD8 T cells patrol the cerebrospinal fluid in Alzheimer's disease
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1895-7
PMID:31915375
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研究论文 | 本研究通过综合分析多个队列，揭示了阿尔茨海默病中血液和脑脊液的适应性免疫变化，并发现了克隆扩增的CD8 T细胞在脑脊液中的存在 | 首次发现阿尔茨海默病患者脑脊液中存在克隆扩增的CD8 T细胞，并证实这些细胞对Epstein-Barr病毒抗原具有特异性 | NA | 探究阿尔茨海默病中适应性免疫反应的贡献 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞和脑脊液中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 机器学习 | 细胞 | 多个队列的患者样本 |
| 413 | 2024-08-07 |
Effective single-cell clustering through ensemble feature selection and similarity measurements
2020-May-19, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于集成特征选择和相似性度量的有效单细胞聚类算法 | 该算法通过多特征采样方法测量细胞间的相似性，并构建基于细胞间相似性的集成网络，最终应用基于网络的聚类算法进行单细胞聚类 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞类型分类和识别的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成特征选择和相似性度量 | 基因表达数据 | 多个真实世界的单细胞RNA测序数据集 |
| 414 | 2024-08-07 |
Resolving the Instructions for αβ T Cell Development
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.014
PMID:33326761
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研究论文 | Chopp等人利用单细胞转录组学和表观基因组学在鼠和人类样本中描绘了αβ T细胞亚群的发育轨迹，并细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | 利用单细胞转录组学和表观基因组学技术，细化了CD4和CD8 T细胞谱系承诺的动力学选择模型 | NA | 描绘αβ T细胞亚群的发育轨迹并细化T细胞谱系承诺的模型 | αβ T细胞亚群的发育轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 鼠和人类样本 |
| 415 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics analysis showing functional heterogeneity in decidual stromal cells during labor
2020-Dec-28, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1136/jim-2020-001616
PMID:33372108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了分娩前后基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了分娩过程中基底层间质细胞的功能异质性 | NA | 研究分娩过程中基底层间质细胞的异质性及其功能变化 | 基底层间质细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6382个细胞 |
| 416 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of long noncoding RNAs and their cell lineage commitment roles via RNA-DNA-DNA triplex formation in mammary epithelium
2020-Sep-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3274
PMID:32930441
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研究论文 | 本研究利用高吞吐量的单细胞RNA测序数据，探讨了长非编码RNA（lncRNAs）在乳腺上皮细胞中的表达模式及其在细胞谱系承诺中的作用，通过lncRNA-DNA-DNA三链结构的形成进行功能验证。 | 首次通过单细胞RNA测序数据全面注释乳腺上皮细胞中的lncRNAs表达，并揭示了lncRNAs通过形成三链结构调控下游谱系特异性标记基因的机制。 | 研究仅以lncRNA-Carmn为例进行验证，可能需要进一步的研究来验证其他lncRNAs在细胞谱系承诺中的作用。 | 探讨lncRNAs在乳腺上皮细胞中的表达模式及其在细胞谱系承诺中的作用。 | 乳腺上皮细胞中的长非编码RNA（lncRNAs）及其在细胞谱系承诺中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 417 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of equine mesenchymal stromal cells from primary donor-matched tissue sources reveals functional heterogeneity in immune modulation and cell motility
2020-12-04, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-02043-5
PMID:33276815
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了从马的三种不同组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）获得的间充质干细胞，揭示了这些细胞在免疫调节和细胞迁移功能上的异质性 | 首次在马的间充质干细胞中使用单细胞RNA测序技术，并结合功能实验验证了转录差异与细胞迁移和免疫调节功能的关系 | NA | 研究间充质干细胞的异质性及其对治疗潜力的影响 | 马的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从三种植入匹配的组织来源（脂肪组织、骨髓和外周血）收集的马间充质干细胞 |
| 418 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics of human islet ontogeny defines the molecular basis of β-cell dedifferentiation in T2D
2020-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.101057
PMID:32739450
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，详细描述了人类发育过程中α-和β-细胞的成熟过程，并比较了非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞。 | 首次揭示了2型糖尿病患者胰岛β细胞的去分化现象及其分子基础。 | NA | 探讨2型糖尿病中胰岛β细胞去分化的分子机制。 | 人类胰岛细胞的成熟过程及2型糖尿病中的变化。 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及非糖尿病和2型糖尿病个体的胰岛细胞样本 |
| 419 | 2024-08-07 |
Sexually Dimorphic Crosstalk at the Maternal-Fetal Interface
2020-12-01, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaa503
PMID:32772088
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研究论文 | 研究胎儿性别如何影响母胎界面的受体配体相互作用，并探讨其在早期胎盘形成中的作用 | 首次定义了早期胎盘形成阶段的性别二态性信号 | NA | 探究胎儿性别对母胎界面相互作用的影响 | 母胎界面的受体配体相互作用及早期胎盘形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组 | 晚期第一孕期（约10-13周）的胎盘（胎儿）和蜕膜（母体）样本 |
| 420 | 2024-08-07 |
Integrative genomics approach identifies conserved transcriptomic networks in Alzheimer's disease
2020-10-10, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaa182
PMID:32803238
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研究论文 | 本研究采用系统生物学元分析方法，结合多尺度数据集，分析了阿尔茨海默病（AD）的遗传结构，并识别了AD相关的转录组网络。 | 本研究通过整合多种数据类型，包括DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究等，识别了AD中未在正常衰老中改变的稳健转录组失调。 | NA | 进一步阐明阿尔茨海默病的遗传结构 | 阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | DNA甲基化、组蛋白乙酰化、转录组和全基因组关联研究 | 共表达网络分析 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 超过1200个人脑样本，27,321个来自人类死后前额叶皮质组织的细胞核 |