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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of human islet ontogeny defines the molecular basis of β-cell dedifferentiation in T2D
2020-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.101057
PMID:32739450
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人类胰岛细胞发育成熟的分子程序以及2型糖尿病中β细胞去分化的分子基础 | 首次详细描绘了人类胰岛α和β细胞在个体发育过程中的成熟程序,并揭示了2型糖尿病中胰岛细胞转录组成熟度丧失的分子机制 | 研究样本量有限,未能确定β细胞去分化在2型糖尿病中的普遍程度和可塑性 | 阐明人类胰岛细胞发育成熟的分子程序以及2型糖尿病中β细胞去分化的分子基础 | 人类胰岛α细胞和β细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 非糖尿病和2型糖尿病供体的胰岛组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Multimodal Mapping of the Tumor and Peripheral Blood Immune Landscape in Human Pancreatic Cancer
2020-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00121-4
PMID:34296197
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研究论文 | 通过多模态分析方法揭示人类胰腺癌中肿瘤和外周血的免疫景观特征 | 首次采用CyTOF、单细胞RNA测序和多重免疫组化相结合的多模态方法,系统解析胰腺癌免疫抑制微环境的细胞互作网络 | 样本量相对有限,需要在更大队列中验证发现的患者特异性免疫变化 | 阐明胰腺导管腺癌的免疫景观特征及其对免疫治疗的影响 | 胰腺癌患者肿瘤组织、匹配血液样本和非恶性组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 图像数据 | 患者肿瘤、匹配血液和非恶性样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Analysis of Dual Class I Histone Deacetylase and Lysine Demethylase Inhibitor Domatinostat (4SC-202) on Growth and Cellular and Genomic Landscape of Atypical Teratoid/Rhabdoid
2020-Mar-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers12030756
PMID:32210076
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研究论文 | 研究表观遗传调节剂Domatinostat(4SC-202)对非典型畸胎样/横纹肌样瘤生长及细胞基因组景观的影响 | 首次探索双重I类组蛋白去乙酰化酶和赖氨酸去甲基化酶抑制剂Domatinostat在ATRT中的抗癌作用机制 | 目前仅为体外研究,缺乏体内实验验证 | 评估表观遗传药物对ATRT肿瘤生长的抑制作用及其机制 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤(ATRT)细胞系 | 癌症表观遗传学 | 非典型畸胎样/横纹肌样瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,多组学富集分析 | 2D和3D支架细胞培养模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | ATRT-06细胞球状体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Neuroinflammation and EIF2 Signaling Persist despite Antiretroviral Treatment in an hiPSC Tri-culture Model of HIV Infection
2020-04-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.02.010
PMID:32220329
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研究论文 | 开发了一种基于hiPSC的三细胞共培养模型,用于研究HIV感染和抗逆转录病毒治疗对神经炎症的影响 | 首次建立包含神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞的hiPSC三细胞共培养模型,模拟HIV中枢神经系统感染 | 模型为体外培养系统,可能无法完全模拟体内复杂环境 | 研究HIV相关神经认知障碍的发病机制和治疗靶点 | 人诱导多能干细胞分化的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | hiPSC三细胞共培养模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing of Developing Human Gut Reveals Transcriptional Links to Childhood Crohn's Disease
2020-12-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.010
PMID:33290721
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序绘制了人类肠道发育图谱,并揭示了与儿童克罗恩病的转录关联 | 发现了不同于LGR5表达细胞的循环上皮前体细胞,揭示了胎儿转录因子在克罗恩病中的重新激活 | 研究仅涵盖6-10周孕期的肠道发育阶段,样本时间范围有限 | 解析人类肠道发育过程及其与儿童克罗恩病的关联机制 | 发育中的人类肠道组织(6-10周孕期)和儿童克罗恩病患者上皮组织 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发育期肠道组织(6-10周孕期)和儿童克罗恩病匹配健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Generation of a Single-Cell RNAseq Atlas of Murine Salivary Gland Development
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101838
PMID:33305192
|
研究论文 | 构建了小鼠颌下腺发育过程的单细胞RNA测序图谱,揭示了关键发育阶段的细胞异质性 | 首次创建了小鼠唾液腺发育的单细胞转录组图谱,识别了腺泡和导管细胞群的可塑性及与腺泡分化相关的转录因子 | 仅针对小鼠模型进行研究,未涉及人类或其他物种的验证 | 解析器官发育过程中的动态转录景观,为再生治疗提供模板 | 小鼠颌下腺 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Single-cell atlas of the first intra-mammalian developmental stage of the human parasite Schistosoma mansoni
2020-12-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-20092-5
PMID:33339816
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了曼氏血吸虫早期哺乳动物内发育阶段的细胞类型图谱 | 首次提供了曼氏血吸虫最早哺乳动物内发育阶段(血吸虫体)的单细胞分辨率转录组图谱 | 仅针对两天龄的血吸虫体进行研究,未覆盖其他发育阶段 | 解析血吸虫在哺乳动物宿主内早期发育的细胞类型组成和转录动态 | 曼氏血吸虫两天龄血吸虫体 | 单细胞生物学 | 血吸虫病 | 单细胞RNA测序,原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 两天龄曼氏血吸虫血吸虫体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Transfer learning efficiently maps bone marrow cell types from mouse to human using single-cell RNA sequencing
2020-12-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-01463-6
PMID:33277618
|
研究论文 | 本研究利用迁移学习技术,通过单细胞RNA测序数据实现小鼠与人类骨髓细胞类型的高效跨物种映射 | 首次将迁移学习应用于跨物种单细胞RNA测序数据分析,证明简单逻辑回归模型能达到与复杂神经网络相当的性能 | 某些人类细胞类型难以准确识别,表明物种间存在重要生物学差异 | 开发跨物种骨髓细胞类型映射方法 | 小鼠和人类骨髓细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 多类逻辑回归, 人工神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Transcriptomic profiling across the nonalcoholic fatty liver disease spectrum reveals gene signatures for steatohepatitis and fibrosis
2020-12-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aba4448
PMID:33268509
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示非酒精性脂肪性肝病谱系中脂肪性肝炎和纤维化的基因特征 | 首次在大规模多中心研究中系统识别出25个与纤维化进展相关的差异表达基因特征,并通过单细胞RNA测序数据解析了肝内特定细胞群的贡献 | 研究样本量有限,需要进一步验证这些生物标志物在更广泛人群中的临床应用价值 | 探索非酒精性脂肪性肝病进展至肝硬化的分子机制并识别潜在的循环生物标志物 | 非酒精性脂肪性肝病患者肝组织和血清样本 | 转录组学 | 非酒精性脂肪性肝病 | RNA测序,单细胞RNA测序,SomaScan蛋白分析 | 逻辑回归模型 | 转录组数据,蛋白质组数据 | 发现队列206例患者,验证队列175例患者,300多份血清样本 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
A Conserved TCRβ Signature Dominates a Highly Polyclonal T-Cell Expansion During the Acute Phase of a Murine Malaria Infection
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.587756
PMID:33329568
|
研究论文 | 本研究通过分析小鼠疟疾感染急性期脾脏CD4 T细胞受体库,揭示了在高度多克隆扩增中存在保守的TCRβ特征 | 首次描述了疟疾感染急性期T细胞扩增的克隆性和克隆组成,发现TRBV3基因使用在效应T细胞库中持续占主导地位 | 研究仅限于小鼠模型,尚未确定驱动这种保守反应的宿主或寄生虫因素 | 阐明疟疾感染急性期T细胞受体库的克隆组成和特征 | 小鼠脾脏CD4 αβ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, RNA-seq分析 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 多个重复实验的小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Tocilizumab-Treated Peripheral Blood Mononuclear Cells as an in vitro Model of Inflammation
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.610682
PMID:33469465
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析托珠单抗处理的外周血单个核细胞,建立体外炎症模型 | 首次在单细胞水平展示托珠单抗对炎症相关基因和生物学通路的抑制作用 | 样本来源于肾移植受者,可能限制结果在COVID-19中的直接适用性 | 研究托珠单抗在炎症条件下的生物学效应 | 托珠单抗处理前后的刺激外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 体外炎症模型 | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
BingleSeq: a user-friendly R package for bulk and single-cell RNA-Seq data analysis
2020, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.10469
PMID:33391870
|
研究论文 | 开发了一个用户友好的R软件包BingleSeq,用于批量RNA测序和单细胞RNA测序数据分析 | 提供了同时支持批量RNA测序和单细胞RNA测序分析的灵活工具,集成了三种先进软件包并采用交互式仪表板界面 | 未在摘要中明确说明 | 开发无需编程经验的RNA测序数据分析工具 | RNA测序产生的计数矩阵数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达计数矩阵 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.599415
PMID:33324416
|
综述 | 本文探讨血管平滑肌细胞可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用机制 | 整合新型技术方法揭示VSMC表现型转化的多样性及其在炎症过程中的非专业吞噬功能 | NA | 阐明动脉粥样硬化疾病中血管平滑肌细胞的生物学作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | NA | 心血管疾病 | 杂交邻近连接分析, CreER-loxP系统细胞命运追踪, 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Spatio-temporal regulation of gene expression defines subpopulations of epidermal stem cells
2020-12-18, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20200740
PMID:33170265
|
综述 | 探讨表皮干细胞亚群中基因表达的时空调控机制及其在再生医学中的意义 | 通过单细胞转录组学揭示表皮干细胞的高度异质性,并利用伪时间推断、RNA速率和细胞熵分析发现表皮干细胞的可塑性特征 | 未明确说明研究样本的具体数量或实验验证的局限性 | 阐明表皮干细胞的异质性特征及其在再生医学中的潜在应用 | 表皮干细胞及其在角质形成细胞中的亚群 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学,伪时间推断,RNA速率分析,细胞熵计算 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses and machine learning define hematopoietic progenitor and HSC-like cells derived from human PSCs
2020-12-17, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020006229
PMID:32614947
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研究论文 | 通过单细胞分析和机器学习鉴定人PSCs来源的造血祖细胞和HSC样细胞 | 结合单细胞RNA测序与蛋白质表达分析,利用人工神经网络识别hPSCs衍生的HSPCs表型,包括HSC样细胞群体 | HSC样细胞群体随分化进程减少,且CD43表达筛选的数据集中完全缺失该群体 | 优化体外生产功能性造血干细胞的方法 | 人多能干细胞(hPSCs)衍生的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 机器学习 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNAseq), 单细胞蛋白质表达分析 | 人工神经网络(ANN) | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Three-Dimensional Human Alveolar Stem Cell Culture Models Reveal Infection Response to SARS-CoV-2
2020-12-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.10.004
PMID:33142113
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研究论文 | 开发三维人类肺泡干细胞培养模型研究SARS-CoV-2感染反应 | 建立无饲养层长期三维培养系统,首次实现基于原代人类肺组织的肺泡上皮细胞感染动态追踪 | 模型仍需原代人类肺组织来源,未涉及其他呼吸道细胞类型 | 研究SARS-CoV-2在人类肺泡干细胞中的感染机制和免疫反应 | 人类肺泡Ⅱ型细胞(hAT2) | 细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序,成像分析 | 三维细胞培养模型 | 图像数据,基因表达数据 | 原代人类肺组织来源的hAT2细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Single-cell gene profiling and lineage tracing analyses revealed novel mechanisms of endothelial repair by progenitors
2020-Dec, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-020-03480-4
PMID:32166394
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研究论文 | 通过单细胞基因分析和谱系追踪揭示祖细胞修复血管内皮的新机制 | 首次结合单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术揭示c-Kit阳性祖细胞在主动脉内皮更新中的关键作用及代谢重编程机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类血管疾病中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明内源性血管祖细胞在大血管内皮修复中的细胞异质性和功能作用 | 小鼠主动脉中的c-Kit阳性干细胞/祖细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 假时序分析, 体外细胞实验 | 遗传谱系追踪小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠主动脉c-Kit细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
ReactomeGSA - Efficient Multi-Omics Comparative Pathway Analysis
2020-12, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1074/mcp.TIR120.002155
PMID:32907876
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研究论文 | 介绍ReactomeGSA资源,用于多组学数据集的比较通路分析 | 开发了支持多组学数据集和跨物种比较的自动化通路分析工具,特别支持单细胞RNA-seq数据 | NA | 降低多组学、跨物种比较通路分析的技术门槛 | 多组学数据集、不同物种数据、B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | 生物信息学 | 肺癌、黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq、转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA-seq数据 | 来自TCGA的5个转录组研究和CPTAC的2个蛋白质组研究的人类癌症样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Group 2 Innate Lymphoid Cells Coordinate Damage Response in the Stomach
2020-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2020.08.051
PMID:32891625
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研究论文 | 本研究揭示了第2组先天淋巴细胞在胃黏膜损伤修复过程中协调化生反应的关键作用 | 首次发现ILC2细胞通过产生IL-13等细胞因子协调胃损伤后的上皮重编程和化生反应 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究第2组先天淋巴细胞在胃上皮损伤修复中的功能机制 | C57BL/6J野生型和RAG1敲除小鼠,胃腺癌患者的胃组织 | 免疫学 | 胃部疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,定量PCR,免疫细胞化学,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | 小鼠模型和人类胃组织微阵列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Manipulating niche composition limits damage to haematopoietic stem cells during Plasmodium infection
2020-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-00601-w
PMID:33230302
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研究论文 | 本研究通过小鼠疟疾模型揭示了感染期间骨髓微环境变化对造血干细胞功能的影响机制 | 首次发现感染通过干扰素影响骨髓微环境组成,特别是成骨细胞大量丢失和内皮细胞功能改变,并证明甲状旁腺激素治疗可逆转感染引发的造血干细胞增殖 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究骨髓微环境在介导感染对造血干细胞影响中的作用机制 | 小鼠造血干细胞和骨髓微环境细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 数学建模, 移植实验, 活体显微镜 | NA | 单细胞转录组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |