单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-27 |
Single-Cell Isolation from Regenerating Murine Muscles for RNA-Sequencing Analysis
2020-09-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100051
PMID:33111097
|
实验方案 | 提出一个用于再生小鼠骨骼肌单细胞RNA测序分析的完整方案，重点从肌肉中分离单核细胞 | 针对骨骼肌细胞组成独特（主要为多核肌纤维）的特点，优化了单核细胞分离方法 | 未提及 | 建立无偏的再生小鼠骨骼肌单细胞RNA测序分析方案 | 再生小鼠骨骼肌中的单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-04-27 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Lymph Node Stroma
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100021
PMID:33111075
|
研究论文 | 提供用于表征人类淋巴结基质细胞异质性的单细胞RNA测序的细胞制备方案 | 利用单细胞技术无偏倚地全面表征基质细胞异质性 | 未提供与Takeda等人(2019)研究相关的完整实验操作细节 | 为研究人类淋巴结基质细胞的单细胞转录组提供标准化实验方案 | 人类淋巴结基质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 23 | 2026-04-27 |
Protocol to Prepare Single-Cell Suspensions from Mouse Vagal Sensory Ganglia for Transcriptomic Studies
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100030
PMID:33111081
|
protocol | 提供了一个从小鼠迷走感觉神经节制备单细胞悬浮液的详细方案，用于转录组研究 | 提供了从迷走神经节提取高质量单细胞悬浮液的标准化方案，可适用于其他外周和中枢神经元群体 | 文中未明确说明局限性 | 提供从小鼠迷走感觉神经节制备单细胞悬浮液用于转录组研究的详细方案 | 小鼠迷走感觉神经节 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞悬浮液 | 小鼠迷走感觉神经节样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-04-27 |
Protocol for Dissection and Dissociation of Zebrafish Telencephalon for Single-Cell Sequencing
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100042
PMID:32835293
|
protocol | 展示如何解剖斑马鱼端脑并将其解离为单细胞悬浮液，随后通过流式细胞术分选富集神经祖干细胞 | 提供了一种详细的斑马鱼端脑解剖和解离方案，专门用于单细胞测序，能够从单个斑马鱼端脑中获取约70,000个活细胞 | 仅针对斑马鱼端脑组织，可能不适用于其他组织或物种；依赖流式细胞术分选，设备成本较高 | 提供一种从斑马鱼端脑制备高质量单细胞悬浮液的标准化实验方案 | 斑马鱼端脑及其中的神经祖干细胞 | machine learning | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 每个斑马鱼端脑样本约70,000个活细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 25 | 2026-04-26 |
Hemolysis transforms liver macrophages into antiinflammatory erythrophagocytes
2020-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137282
PMID:32663195
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现溶血过程中肝脏巨噬细胞转化为抗炎性红细胞吞噬细胞，并可缓解炎症性疾病 | 首次揭示溶血诱导的肝脏巨噬细胞转化为具有MarcohiHmoxhiMHC class IIlo特征的红细胞吞噬细胞，并证明这种表型转化可显著减轻由巨噬细胞驱动的无菌性炎症疾病 | NA | 研究溶血过程中肝脏巨噬细胞吞噬受损红细胞后功能的改变及其在炎症性疾病中的作用 | 小鼠和人类巨噬细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎, 高炎症综合征 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 遗传性球形红细胞增多症小鼠模型和抗CD40诱导的高炎症综合征小鼠模型，以及非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 26 | 2026-04-25 |
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
PMID:32702314
|
研究论文 | 利用空间转录组学和原位测序研究阿尔茨海默病中淀粉样斑块周围的转录变化和细胞相互作用 | 首次使用全基因组空间转录组学分析揭示AD小鼠模型淀粉样斑块周围100微米范围内的早期和晚期转录变化，并定义了两个基因共表达网络（OLIGs和PIGs），且通过原位测序在细胞水平验证 | 未提及具体局限性 | 研究阿尔茨海默病中淀粉样斑块周围的分子变化和细胞相互作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型和人类脑切片 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 原位测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠和人类脑切片 | 10x Genomics | 空间转录组学, 原位测序 | 10x Visium, 原位测序平台 | 10x Visium空间转录组学, 原位测序（具体平台未说明） |
| 27 | 2026-04-20 |
TOX correlates with prognosis, immune infiltration, and T cells exhaustion in lung adenocarcinoma
2020-09, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.3324
PMID:32700817
|
研究论文 | 本研究探讨了TOX基因在肺腺癌中的预后价值及其与免疫浸润和T细胞耗竭的相关性 | 首次全面分析TOX在多种癌症特别是肺腺癌中的表达、预后关联及其与免疫细胞浸润和T细胞耗竭的相互作用，并利用单细胞RNA-seq数据验证TOX在耗竭T细胞中的富集 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证，且样本来源和平台技术细节未明确说明 | 探索TOX基因的预后潜力，并分析其与免疫浸润和T细胞功能在癌症特别是肺腺癌中的相关性 | 多种癌症类型，重点关注肺腺癌（LUAD） | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 28 | 2026-04-18 |
Elevated Calprotectin and Abnormal Myeloid Cell Subsets Discriminate Severe from Mild COVID-19
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.002
PMID:32810439
|
研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序，揭示了严重COVID-19患者中非经典单核细胞消失、经典单核细胞积累及钙卫蛋白大量释放等先天免疫异常特征 | 首次结合高维流式细胞术和单细胞RNA测序，系统揭示了COVID-19严重程度与先天免疫细胞亚群及钙卫蛋白水平的关联，并提出了具有潜在预测价值的生物标志物组合 | 研究为观察性分析，需前瞻性研究验证预测价值；样本来源和规模可能限制结论的普适性 | 探究COVID-19严重程度与先天免疫反应差异的关系，并寻找可区分高风险患者的生物标志物 | COVID-19患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | COVID-19患者外周血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-04-18 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
|
研究论文 | 本文描述了一位由JAK1基因镶嵌性功能获得性突变引起的早发性多器官免疫失调患者，通过单细胞RNA测序揭示突变转录型与基因型的差异，并探索JAK1激酶的功能机制 | 引入突变'转录型'概念，揭示JAK1 S703I突变不仅增强细胞因子信号传导，还赋予非经典信号传导能力，为个性化医疗提供新平台 | 研究基于单个患者案例，样本量有限，可能无法完全代表所有JAK1相关疾病 | 探究JAK1激酶在自身炎症性疾病中的转录和生化功能机制 | 携带JAK1 S703I镶嵌突变的自体炎症性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1位患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制单细胞RNA测序 |
| 30 | 2026-04-18 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
|
研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人类CD34+CD90+造血干细胞来优化慢病毒介导的基因治疗策略 | 首次在临床适用性GMP级流式分选协议中直接比较CD90+细胞选择与CD133+或CD38- CD34+细胞选择，证明CD90+富集能显著减少靶细胞数量并提高慢病毒转导效率 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未在人类临床试验中全面验证其安全性和长期疗效 | 优化造血干细胞基因治疗的靶细胞纯化策略以提高治疗效率和安全性 | 人类造血干细胞（HSC），特别是CD34+CD90+细胞亚群 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性肿瘤、感染性疾病 | 流式细胞分选、单细胞RNA测序、慢病毒转导 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量，但涉及人类血液制品中的细胞分选比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-18 |
Microglia Require CD4 T Cells to Complete the Fetal-to-Adult Transition
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.026
PMID:32702313
|
研究论文 | 本研究通过成像、单细胞和手术方法，识别了小鼠和人类大脑中的CD69+ CD4 T细胞群体，并探讨了其在脑发育中的作用 | 首次揭示了大脑中CD69+ CD4 T细胞的存在及其通过原位分化形成的过程，并发现这些细胞对微胶质细胞成熟和神经发育至关重要 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证可能有限；具体分子机制和临床相关性需进一步探索 | 探究健康大脑中CD4 T细胞的存在、来源及其在脑发育和免疫-神经系统互作中的功能 | 小鼠和人类大脑中的CD4 T细胞及微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 成像技术、单细胞测序、手术方法 | NA | 图像数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-04-18 |
Single-cell RNA sequencing in breast cancer: Understanding tumor heterogeneity and paving roads to individualized therapy
2020-08, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12078
PMID:32654419
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用，包括理解肿瘤异质性和推动个体化治疗 | 综述了scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的最新应用，强调了其在解析肿瘤异质性和识别治疗靶点方面的创新潜力 | 当前scRNA-seq技术在治疗选择方面的研究有限，且存在技术挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的应用，以促进个体化治疗 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-18 |
BREM-SC: a bayesian random effects mixture model for joint clustering single cell multi-omics data
2020-06-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa314
PMID:32379315
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为BREM-SC的贝叶斯随机效应混合模型，用于联合聚类单细胞转录组和蛋白质组数据 | 提出了一种新的统计方法，能够同时利用转录组和蛋白质组数据进行细胞聚类，并量化每个单细胞的聚类不确定性 | NA | 开发用于分析多模态CITE-Seq数据的统计方法和计算工具 | 单细胞转录组和蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），CITE-seq | 贝叶斯随机效应混合模型 | 转录组和蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium系统 |
| 34 | 2026-04-17 |
Preclinical safety studies of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells for the treatment of age-related macular degeneration
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0396
PMID:32319201
|
研究论文 | 本研究对人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞进行了临床前安全性评估，以支持其用于年龄相关性黄斑变性的治疗 | 采用无外源成分的明确分化方案生成功能性hESC-RPE细胞，并通过全基因组测序、单细胞RNA测序等多层次分析评估细胞安全性和基因组稳定性 | 研究主要基于体外和临床前模型，未涉及长期临床疗效或人体内安全性数据 | 评估人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞在治疗年龄相关性黄斑变性中的安全性 | 人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞 | 干细胞治疗 | 年龄相关性黄斑变性 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-04-17 |
A Single-Cell Transcriptomics CRISPR-Activation Screen Identifies Epigenetic Regulators of the Zygotic Genome Activation Program
2020-07-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.06.004
PMID:32634384
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与CRISPR激活技术，在小鼠胚胎干细胞中鉴定了调控合子基因组激活程序的表观遗传因子 | 首次将CRISPR激活筛选与单细胞转录组学结合，系统识别ZGA样转录的调控因子，并揭示其分子机制 | 使用小鼠胚胎干细胞作为早期胚胎的体外模型，可能无法完全模拟体内胚胎的复杂性 | 识别调控合子基因组激活程序的表观遗传因子 | 小鼠胚胎干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, CRISPR激活 | MOFA+ | 单细胞转录组数据 | 约200,000个单细胞转录组，包含230个CRISPR激活扰动 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-04-16 |
Expression of Amyloidogenic Transthyretin Drives Hepatic Proteostasis Remodeling in an Induced Pluripotent Stem Cell Model of Systemic Amyloid Disease
2020-08-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.07.003
PMID:32735824
|
研究论文 | 本研究利用诱导多能干细胞模型探索系统性淀粉样变疾病中肝细胞样细胞对淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌的贡献 | 首次结合诱导多能干细胞和单细胞RNA测序技术，揭示肝细胞在淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌中的蛋白稳态重塑作用 | 研究基于体外诱导多能干细胞模型，可能无法完全模拟体内肝细胞的复杂生理环境 | 探究系统性淀粉样变疾病中合成器官对疾病发病机制的贡献 | 遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性患者的诱导多能干细胞及其衍生的肝细胞样细胞 | 单细胞组学 | 系统性淀粉样变疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-04-12 |
Extraction of Distinct Neuronal Cell Types from within a Genetically Continuous Population
2020-07-22, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.04.018
PMID:32396852
|
研究论文 | 本研究通过投射依赖的单细胞转录组分析和单突触狂犬病示踪技术，比较了小鼠初级视觉皮层中投射至不同高级视觉区域的皮质-皮质投射神经元，发现尽管这些神经元在转录组上仅形成一个遗传簇，但其基因表达存在系统性差异，且选择性接收来自其投射区域的反馈输入 | 揭示了皮质-皮质投射神经元在单一遗传簇内仍存在与解剖投射类型相关的系统性基因表达差异，并首次证明这些神经元接收来自其投射区域的特定反馈输入，挑战了仅依赖基因表达聚类识别神经元类型的传统观点 | 研究仅聚焦于小鼠初级视觉皮层的特定层（2/3层）皮质-皮质投射神经元，结论在其他脑区或物种中的普适性有待验证；单细胞转录组分析可能受技术灵敏度限制，未能检测到更细微的表达差异 | 探究皮质-皮质投射神经元的转录组特征与其解剖投射类型之间的关联，并解析其反馈回路的功能组织 | 小鼠初级视觉皮层中投射至不同高级视觉区域的层2/3皮质-皮质投射神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序、单突触狂犬病示踪 | NA | 基因表达数据、神经解剖追踪数据 | 未明确说明样本数量，但涉及多个投射类型的小鼠皮质-皮质投射神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-04-11 |
Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) are emerging therapeutics for hematologic malignancies
2020-07-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-020-00924-z
PMID:32718354
|
综述 | 本文综述了蛋白水解靶向嵌合体（PROTACs）作为新兴疗法在血液恶性肿瘤治疗中的应用潜力 | 提出利用最新的人类全组织单细胞RNA测序数据识别造血细胞类型特异性/选择性E3连接酶，以开发肿瘤特异性/选择性PROTACs，从而提高治疗安全性 | NA | 系统总结可用于治疗各种血液恶性肿瘤的已知PROTACs，并讨论提高其临床应用安全性的策略 | 蛋白水解靶向嵌合体（PROTACs）及其在血液恶性肿瘤治疗中的应用 | NA | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-04-10 |
3D curvature-instructed endothelial flow response and tissue vascularization
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3629
PMID:32938662
|
研究论文 | 本研究开发了一种螺旋微血管模型，用于研究三维曲率对血管内皮细胞表型和转录的影响，并展示了其在肿瘤进展模拟和工程化心脏组织血管化中的应用 | 开发了可精确控制曲率和扭转的螺旋微血管模型，首次在厘米尺度实现均匀组织灌注，并揭示了三维曲率诱导层流下旋转和混合的独特流体动力学效应及其对内皮细胞表型和转录组的特异性影响 | 模型仍处于原理验证阶段，需要进一步在更复杂的组织环境中验证其长期功能和稳定性，且单细胞RNA-seq的样本量可能有限 | 研究三维血管几何特征（特别是曲率和扭转）对血管内皮细胞行为和组织血管化的影响，以解决工程化复杂组织血管化的长期挑战 | 螺旋微血管模型中的内皮细胞，以及在该模型中模拟的肿瘤组织和工程化心脏组织 | 组织工程与血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 螺旋微血管模型（体外三维模型） | 转录组数据, 表型数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-08 |
Ribonucleotide reductase small subunit M2 is a master driver of aggressive prostate cancer
2020-08, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12706
PMID:32385899
|
研究论文 | 本文探讨了核糖核苷酸还原酶小亚基M2（RRM2）在驱动侵袭性前列腺癌亚型中的作用及其与免疫抑制微环境的关联 | 首次将RRM2特征与PCS和PAM50分子分类系统整合，识别出侵袭性前列腺癌亚型，并揭示了RRM2在免疫逃逸和恩杂鲁胺耐药中的新作用 | 研究主要基于已发表的队列数据，缺乏前瞻性临床验证，且单细胞RNA-seq数据集样本来源有限 | 确定RRM2特征是否能用于识别侵袭性前列腺癌亚型，并评估其临床意义 | 前列腺癌细胞及来自六个已发表队列的4000例前列腺癌病例 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因本体和通路分析, CIBERSORT分析 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 六个已发表队列共4000例前列腺癌病例 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |