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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-01 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Dissects the Replicating Process of Pancreatic Beta Cells in Partial Pancreatectomy Model
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101774
PMID:33294783
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析部分胰腺切除模型中胰腺β细胞的复制过程 | 首次在单细胞水平揭示部分胰腺切除后β细胞复制过程中的转录动态,并识别出具有高表达细胞增殖标志物的复制β细胞簇 | 未明确说明局限性 | 阐明成年胰腺β细胞在损伤后复制过程中的转录变化 | 小鼠胰腺β细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰腺组织,包括部分胰腺切除和对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 22 | 2026-04-30 |
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019103476
PMID:32985719
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研究论文 | 建立了三维鼠支气管肺泡类器官模型,模拟远端肺发育和疾病 | 首次通过FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养,实现了高度分支的三维结构生成,并结合单细胞RNA测序和电镜验证细胞组成,支持巨噬细胞植入和病毒建模 | 未提及体外模型与体内环境的完全对应性及长期培养稳定性 | 建立复杂类器官模型以研究远端肺发育、感染和再生过程 | 小鼠支气管肺泡干细胞和肺驻留间充质细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、荧光成像、电子显微镜 | 三维类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-04-30 |
Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104063
PMID:32790115
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research paper | 通过对五例三阴性乳腺癌进行单细胞RNA测序,揭示了肿瘤基质中成纤维细胞和血管周细胞的异质性及其与免疫逃逸的关联 | 首次描绘了三阴性乳腺癌中两种癌症相关成纤维细胞和两种血管周样细胞亚群,并揭示了它们与细胞毒性T细胞功能障碍和排斥的强相关性 | 未明确说明局限性 | 探究人类三阴性乳腺癌中肿瘤基质的细胞异质性及其与免疫逃逸的关系 | 五例三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本 | machine learning | lung cancer | NA | NA | 文本和测序数据 | 5例三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-04-30 |
A Widespread Neurogenic Potential of Neocortical Astrocytes Is Induced by Injury
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.006
PMID:32758425
|
研究论文 | 研究发现,当Notch信号被阻断时,大脑皮层星形胶质细胞在损伤后能够产生新的神经元,并揭示了其分子调控机制 | 首次证明Notch信号缺陷的星形胶质细胞在损伤后可转变为神经干细胞样状态并启动神经发生程序,且成功将星形胶质细胞神经发生与反应性胶质增生在单细胞水平上解耦 | 仅在小鼠模型中验证,且神经发生效率较低,仅少数预激活的星形胶质细胞在损伤后启动神经发生程序 | 阐明非神经源性脑区星形胶质细胞在损伤后产生新神经元的分子调控机制 | 小鼠大脑皮层星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 25 | 2026-04-30 |
Endothelial, pericyte and tumor cell expression in glioblastoma identifies fibroblast activation protein (FAP) as an excellent target for immunotherapy
2020, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1191
PMID:33082953
|
研究论文 | 研究确认成纤维细胞活化蛋白(FAP)作为胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点,并详细分析其在肿瘤血管内皮细胞、周细胞及肿瘤细胞中的表达情况 | 首次通过多模态分析揭示FAP在胶质母细胞瘤的血管内皮细胞和周细胞上显著表达,而非正常组织血管,提出FAP可作为同时靶向肿瘤细胞及血管网络的理想免疫治疗抗原 | 未提及具体临床试验验证或体内功能研究,且儿童脑肿瘤样本的泛癌表达分析可能局限于已公开转录组数据集 | 验证FAP作为胶质母细胞瘤免疫治疗抗原的可行性,并明确其细胞定位与表达特征 | 人类胶质母细胞瘤组织样本、正常脑组织、胶质瘤神经干细胞(GNS)培养物、健康星形胶质细胞和神经元培养物及多个儿科脑肿瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫染色、流式细胞术、单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 组织切片、细胞培养物、单细胞测序数据 | 包含多个胶质母细胞瘤患者组织样本及公开转录组数据集,具体数字未明确说明 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序试剂盒及Illumina NovaSeq测序平台 |
| 26 | 2026-04-29 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
|
研究论文 | 研究了新冠病毒(SARS-CoV-2)进入因子在正常人胰腺和COVID-19患者胰腺中的表达 | 首次在蛋白质和mRNA水平系统验证ACE2在胰腺不同细胞类型的表达分布,并结合COVID-19病例显示病毒主要感染导管而非内分泌细胞 | 仅基于公开的scRNA-seq数据集和有限数量的COVID-19病例样本,可能无法完全代表临床异质性 | 探究SARS-CoV-2进入因子ACE2在胰腺中的表达模式及其与COVID-19相关糖尿病的潜在关联 | 正常人胰腺组织(跨不同年龄段)和COVID-19患者胰腺组织 | 机器学习和数字病理学 | COVID-19相关糖尿病 | 单细胞RNA测序、荧光原位杂交、western blotting、免疫定位 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像 | 5个公开scRNA-seq胰腺数据集及不同年龄段正常人和COVID-19病例的胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-04-27 |
Defective Sec61α1 underlies a novel cause of autosomal dominant severe congenital neutropenia
2020-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.03.034
PMID:32325141
|
研究论文 | 发现SEC61A1基因的c.A275G;p.Q92R错义突变是导致常染色体显性遗传重症先天性中性粒细胞减少症的新病因 | 首次发现SEC61A1基因突变可导致重症先天性中性粒细胞减少症,扩展了SEC61A1相关疾病的表型谱,并揭示了未折叠蛋白反应失调作为潜在机制 | 仅基于一名患者的病例研究,样本量有限,需要更多病例验证 | 扩展SEC61A1介导的疾病谱系,将其与常染色体显性遗传重症先天性中性粒细胞减少症联系起来 | 一名父母非近亲婚配的比利时重症先天性中性粒细胞减少症患者及其CD34+细胞和HL-60细胞 | 自然语言处理 | 重症先天性中性粒细胞减少症 | 全外显子组测序、Western blotting、Ca2+通量测定、HL-60细胞分化、原代CD34细胞体外分化、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、钙离子流数据、蛋白质表达数据 | 1例患者及其骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-04-27 |
Single-Cell Isolation from Regenerating Murine Muscles for RNA-Sequencing Analysis
2020-09-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100051
PMID:33111097
|
实验方案 | 提出一个用于再生小鼠骨骼肌单细胞RNA测序分析的完整方案,重点从肌肉中分离单核细胞 | 针对骨骼肌细胞组成独特(主要为多核肌纤维)的特点,优化了单核细胞分离方法 | 未提及 | 建立无偏的再生小鼠骨骼肌单细胞RNA测序分析方案 | 再生小鼠骨骼肌中的单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-04-27 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Lymph Node Stroma
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100021
PMID:33111075
|
研究论文 | 提供用于表征人类淋巴结基质细胞异质性的单细胞RNA测序的细胞制备方案 | 利用单细胞技术无偏倚地全面表征基质细胞异质性 | 未提供与Takeda等人(2019)研究相关的完整实验操作细节 | 为研究人类淋巴结基质细胞的单细胞转录组提供标准化实验方案 | 人类淋巴结基质细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 30 | 2026-04-27 |
Protocol to Prepare Single-Cell Suspensions from Mouse Vagal Sensory Ganglia for Transcriptomic Studies
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100030
PMID:33111081
|
protocol | 提供了一个从小鼠迷走感觉神经节制备单细胞悬浮液的详细方案,用于转录组研究 | 提供了从迷走神经节提取高质量单细胞悬浮液的标准化方案,可适用于其他外周和中枢神经元群体 | 文中未明确说明局限性 | 提供从小鼠迷走感觉神经节制备单细胞悬浮液用于转录组研究的详细方案 | 小鼠迷走感觉神经节 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞悬浮液 | 小鼠迷走感觉神经节样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-27 |
Protocol for Dissection and Dissociation of Zebrafish Telencephalon for Single-Cell Sequencing
2020-06-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100042
PMID:32835293
|
protocol | 展示如何解剖斑马鱼端脑并将其解离为单细胞悬浮液,随后通过流式细胞术分选富集神经祖干细胞 | 提供了一种详细的斑马鱼端脑解剖和解离方案,专门用于单细胞测序,能够从单个斑马鱼端脑中获取约70,000个活细胞 | 仅针对斑马鱼端脑组织,可能不适用于其他组织或物种;依赖流式细胞术分选,设备成本较高 | 提供一种从斑马鱼端脑制备高质量单细胞悬浮液的标准化实验方案 | 斑马鱼端脑及其中的神经祖干细胞 | machine learning | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 每个斑马鱼端脑样本约70,000个活细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-04-26 |
Hemolysis transforms liver macrophages into antiinflammatory erythrophagocytes
2020-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI137282
PMID:32663195
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现溶血过程中肝脏巨噬细胞转化为抗炎性红细胞吞噬细胞,并可缓解炎症性疾病 | 首次揭示溶血诱导的肝脏巨噬细胞转化为具有MarcohiHmoxhiMHC class IIlo特征的红细胞吞噬细胞,并证明这种表型转化可显著减轻由巨噬细胞驱动的无菌性炎症疾病 | NA | 研究溶血过程中肝脏巨噬细胞吞噬受损红细胞后功能的改变及其在炎症性疾病中的作用 | 小鼠和人类巨噬细胞 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝炎, 高炎症综合征 | 单细胞RNA测序, 转座酶可及染色质单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 遗传性球形红细胞增多症小鼠模型和抗CD40诱导的高炎症综合征小鼠模型,以及非酒精性脂肪性肝炎小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 33 | 2026-04-25 |
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
PMID:32702314
|
研究论文 | 利用空间转录组学和原位测序研究阿尔茨海默病中淀粉样斑块周围的转录变化和细胞相互作用 | 首次使用全基因组空间转录组学分析揭示AD小鼠模型淀粉样斑块周围100微米范围内的早期和晚期转录变化,并定义了两个基因共表达网络(OLIGs和PIGs),且通过原位测序在细胞水平验证 | 未提及具体局限性 | 研究阿尔茨海默病中淀粉样斑块周围的分子变化和细胞相互作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型和人类脑切片 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 原位测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠和人类脑切片 | 10x Genomics | 空间转录组学, 原位测序 | 10x Visium, 原位测序平台 | 10x Visium空间转录组学, 原位测序(具体平台未说明) |
| 34 | 2026-04-20 |
TOX correlates with prognosis, immune infiltration, and T cells exhaustion in lung adenocarcinoma
2020-09, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.3324
PMID:32700817
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研究论文 | 本研究探讨了TOX基因在肺腺癌中的预后价值及其与免疫浸润和T细胞耗竭的相关性 | 首次全面分析TOX在多种癌症特别是肺腺癌中的表达、预后关联及其与免疫细胞浸润和T细胞耗竭的相互作用,并利用单细胞RNA-seq数据验证TOX在耗竭T细胞中的富集 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证,且样本来源和平台技术细节未明确说明 | 探索TOX基因的预后潜力,并分析其与免疫浸润和T细胞功能在癌症特别是肺腺癌中的相关性 | 多种癌症类型,重点关注肺腺癌(LUAD) | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-04-18 |
Elevated Calprotectin and Abnormal Myeloid Cell Subsets Discriminate Severe from Mild COVID-19
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.002
PMID:32810439
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了严重COVID-19患者中非经典单核细胞消失、经典单核细胞积累及钙卫蛋白大量释放等先天免疫异常特征 | 首次结合高维流式细胞术和单细胞RNA测序,系统揭示了COVID-19严重程度与先天免疫细胞亚群及钙卫蛋白水平的关联,并提出了具有潜在预测价值的生物标志物组合 | 研究为观察性分析,需前瞻性研究验证预测价值;样本来源和规模可能限制结论的普适性 | 探究COVID-19严重程度与先天免疫反应差异的关系,并寻找可区分高风险患者的生物标志物 | COVID-19患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | COVID-19患者外周血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2026-04-18 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
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研究论文 | 本文描述了一位由JAK1基因镶嵌性功能获得性突变引起的早发性多器官免疫失调患者,通过单细胞RNA测序揭示突变转录型与基因型的差异,并探索JAK1激酶的功能机制 | 引入突变'转录型'概念,揭示JAK1 S703I突变不仅增强细胞因子信号传导,还赋予非经典信号传导能力,为个性化医疗提供新平台 | 研究基于单个患者案例,样本量有限,可能无法完全代表所有JAK1相关疾病 | 探究JAK1激酶在自身炎症性疾病中的转录和生化功能机制 | 携带JAK1 S703I镶嵌突变的自体炎症性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1位患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制单细胞RNA测序 |
| 37 | 2026-04-18 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
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研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人类CD34+CD90+造血干细胞来优化慢病毒介导的基因治疗策略 | 首次在临床适用性GMP级流式分选协议中直接比较CD90+细胞选择与CD133+或CD38- CD34+细胞选择,证明CD90+富集能显著减少靶细胞数量并提高慢病毒转导效率 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未在人类临床试验中全面验证其安全性和长期疗效 | 优化造血干细胞基因治疗的靶细胞纯化策略以提高治疗效率和安全性 | 人类造血干细胞(HSC),特别是CD34+CD90+细胞亚群 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性肿瘤、感染性疾病 | 流式细胞分选、单细胞RNA测序、慢病毒转导 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类血液制品中的细胞分选比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-04-18 |
Microglia Require CD4 T Cells to Complete the Fetal-to-Adult Transition
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.026
PMID:32702313
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研究论文 | 本研究通过成像、单细胞和手术方法,识别了小鼠和人类大脑中的CD69+ CD4 T细胞群体,并探讨了其在脑发育中的作用 | 首次揭示了大脑中CD69+ CD4 T细胞的存在及其通过原位分化形成的过程,并发现这些细胞对微胶质细胞成熟和神经发育至关重要 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证可能有限;具体分子机制和临床相关性需进一步探索 | 探究健康大脑中CD4 T细胞的存在、来源及其在脑发育和免疫-神经系统互作中的功能 | 小鼠和人类大脑中的CD4 T细胞及微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 成像技术、单细胞测序、手术方法 | NA | 图像数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-04-18 |
Single-cell RNA sequencing in breast cancer: Understanding tumor heterogeneity and paving roads to individualized therapy
2020-08, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12078
PMID:32654419
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用,包括理解肿瘤异质性和推动个体化治疗 | 综述了scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的最新应用,强调了其在解析肿瘤异质性和识别治疗靶点方面的创新潜力 | 当前scRNA-seq技术在治疗选择方面的研究有限,且存在技术挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的应用,以促进个体化治疗 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-18 |
BREM-SC: a bayesian random effects mixture model for joint clustering single cell multi-omics data
2020-06-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa314
PMID:32379315
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研究论文 | 本研究开发了一种名为BREM-SC的贝叶斯随机效应混合模型,用于联合聚类单细胞转录组和蛋白质组数据 | 提出了一种新的统计方法,能够同时利用转录组和蛋白质组数据进行细胞聚类,并量化每个单细胞的聚类不确定性 | NA | 开发用于分析多模态CITE-Seq数据的统计方法和计算工具 | 单细胞转录组和蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq),CITE-seq | 贝叶斯随机效应混合模型 | 转录组和蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium系统 |