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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-04-18 |
Elevated Calprotectin and Abnormal Myeloid Cell Subsets Discriminate Severe from Mild COVID-19
2020-09-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.08.002
PMID:32810439
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了严重COVID-19患者中非经典单核细胞消失、经典单核细胞积累及钙卫蛋白大量释放等先天免疫异常特征 | 首次结合高维流式细胞术和单细胞RNA测序,系统揭示了COVID-19严重程度与先天免疫细胞亚群及钙卫蛋白水平的关联,并提出了具有潜在预测价值的生物标志物组合 | 研究为观察性分析,需前瞻性研究验证预测价值;样本来源和规模可能限制结论的普适性 | 探究COVID-19严重程度与先天免疫反应差异的关系,并寻找可区分高风险患者的生物标志物 | COVID-19患者的外周血细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 高维流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞RNA测序数据 | COVID-19患者外周血细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-04-18 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
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研究论文 | 本文描述了一位由JAK1基因镶嵌性功能获得性突变引起的早发性多器官免疫失调患者,通过单细胞RNA测序揭示突变转录型与基因型的差异,并探索JAK1激酶的功能机制 | 引入突变'转录型'概念,揭示JAK1 S703I突变不仅增强细胞因子信号传导,还赋予非经典信号传导能力,为个性化医疗提供新平台 | 研究基于单个患者案例,样本量有限,可能无法完全代表所有JAK1相关疾病 | 探究JAK1激酶在自身炎症性疾病中的转录和生化功能机制 | 携带JAK1 S703I镶嵌突变的自体炎症性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 1位患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制单细胞RNA测序 |
| 23 | 2026-04-18 |
Purification of Human CD34+CD90+ HSCs Reduces Target Cell Population and Improves Lentiviral Transduction for Gene Therapy
2020-Sep-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2020.07.010
PMID:32802914
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研究论文 | 本研究探讨了通过纯化人类CD34+CD90+造血干细胞来优化慢病毒介导的基因治疗策略 | 首次在临床适用性GMP级流式分选协议中直接比较CD90+细胞选择与CD133+或CD38- CD34+细胞选择,证明CD90+富集能显著减少靶细胞数量并提高慢病毒转导效率 | 研究主要基于体外和动物模型,尚未在人类临床试验中全面验证其安全性和长期疗效 | 优化造血干细胞基因治疗的靶细胞纯化策略以提高治疗效率和安全性 | 人类造血干细胞(HSC),特别是CD34+CD90+细胞亚群 | 基因治疗 | 遗传性疾病、恶性肿瘤、感染性疾病 | 流式细胞分选、单细胞RNA测序、慢病毒转导 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确指定样本数量,但涉及人类血液制品中的细胞分选比较 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-04-18 |
Microglia Require CD4 T Cells to Complete the Fetal-to-Adult Transition
2020-08-06, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.026
PMID:32702313
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研究论文 | 本研究通过成像、单细胞和手术方法,识别了小鼠和人类大脑中的CD69+ CD4 T细胞群体,并探讨了其在脑发育中的作用 | 首次揭示了大脑中CD69+ CD4 T细胞的存在及其通过原位分化形成的过程,并发现这些细胞对微胶质细胞成熟和神经发育至关重要 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证可能有限;具体分子机制和临床相关性需进一步探索 | 探究健康大脑中CD4 T细胞的存在、来源及其在脑发育和免疫-神经系统互作中的功能 | 小鼠和人类大脑中的CD4 T细胞及微胶质细胞 | 神经科学 | NA | 成像技术、单细胞测序、手术方法 | NA | 图像数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-04-18 |
Single-cell RNA sequencing in breast cancer: Understanding tumor heterogeneity and paving roads to individualized therapy
2020-08, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12078
PMID:32654419
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用,包括理解肿瘤异质性和推动个体化治疗 | 综述了scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的最新应用,强调了其在解析肿瘤异质性和识别治疗靶点方面的创新潜力 | 当前scRNA-seq技术在治疗选择方面的研究有限,且存在技术挑战需要克服 | 探讨scRNA-seq技术在乳腺癌研究中的应用,以促进个体化治疗 | 乳腺癌细胞及其微环境中的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2026-04-18 |
BREM-SC: a bayesian random effects mixture model for joint clustering single cell multi-omics data
2020-06-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa314
PMID:32379315
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研究论文 | 本研究开发了一种名为BREM-SC的贝叶斯随机效应混合模型,用于联合聚类单细胞转录组和蛋白质组数据 | 提出了一种新的统计方法,能够同时利用转录组和蛋白质组数据进行细胞聚类,并量化每个单细胞的聚类不确定性 | NA | 开发用于分析多模态CITE-Seq数据的统计方法和计算工具 | 单细胞转录组和蛋白质组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq),CITE-seq | 贝叶斯随机效应混合模型 | 转录组和蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium系统 |
| 27 | 2026-04-17 |
Preclinical safety studies of human embryonic stem cell-derived retinal pigment epithelial cells for the treatment of age-related macular degeneration
2020-08, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.19-0396
PMID:32319201
|
研究论文 | 本研究对人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞进行了临床前安全性评估,以支持其用于年龄相关性黄斑变性的治疗 | 采用无外源成分的明确分化方案生成功能性hESC-RPE细胞,并通过全基因组测序、单细胞RNA测序等多层次分析评估细胞安全性和基因组稳定性 | 研究主要基于体外和临床前模型,未涉及长期临床疗效或人体内安全性数据 | 评估人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞在治疗年龄相关性黄斑变性中的安全性 | 人胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮细胞 | 干细胞治疗 | 年龄相关性黄斑变性 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-04-17 |
A Single-Cell Transcriptomics CRISPR-Activation Screen Identifies Epigenetic Regulators of the Zygotic Genome Activation Program
2020-07-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.06.004
PMID:32634384
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学与CRISPR激活技术,在小鼠胚胎干细胞中鉴定了调控合子基因组激活程序的表观遗传因子 | 首次将CRISPR激活筛选与单细胞转录组学结合,系统识别ZGA样转录的调控因子,并揭示其分子机制 | 使用小鼠胚胎干细胞作为早期胚胎的体外模型,可能无法完全模拟体内胚胎的复杂性 | 识别调控合子基因组激活程序的表观遗传因子 | 小鼠胚胎干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, CRISPR激活 | MOFA+ | 单细胞转录组数据 | 约200,000个单细胞转录组,包含230个CRISPR激活扰动 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 29 | 2026-04-16 |
Expression of Amyloidogenic Transthyretin Drives Hepatic Proteostasis Remodeling in an Induced Pluripotent Stem Cell Model of Systemic Amyloid Disease
2020-08-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.07.003
PMID:32735824
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研究论文 | 本研究利用诱导多能干细胞模型探索系统性淀粉样变疾病中肝细胞样细胞对淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌的贡献 | 首次结合诱导多能干细胞和单细胞RNA测序技术,揭示肝细胞在淀粉样蛋白原性转甲状腺素蛋白分泌中的蛋白稳态重塑作用 | 研究基于体外诱导多能干细胞模型,可能无法完全模拟体内肝细胞的复杂生理环境 | 探究系统性淀粉样变疾病中合成器官对疾病发病机制的贡献 | 遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性患者的诱导多能干细胞及其衍生的肝细胞样细胞 | 单细胞组学 | 系统性淀粉样变疾病 | 单细胞RNA测序 | 诱导多能干细胞模型 | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-04-12 |
Extraction of Distinct Neuronal Cell Types from within a Genetically Continuous Population
2020-07-22, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2020.04.018
PMID:32396852
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研究论文 | 本研究通过投射依赖的单细胞转录组分析和单突触狂犬病示踪技术,比较了小鼠初级视觉皮层中投射至不同高级视觉区域的皮质-皮质投射神经元,发现尽管这些神经元在转录组上仅形成一个遗传簇,但其基因表达存在系统性差异,且选择性接收来自其投射区域的反馈输入 | 揭示了皮质-皮质投射神经元在单一遗传簇内仍存在与解剖投射类型相关的系统性基因表达差异,并首次证明这些神经元接收来自其投射区域的特定反馈输入,挑战了仅依赖基因表达聚类识别神经元类型的传统观点 | 研究仅聚焦于小鼠初级视觉皮层的特定层(2/3层)皮质-皮质投射神经元,结论在其他脑区或物种中的普适性有待验证;单细胞转录组分析可能受技术灵敏度限制,未能检测到更细微的表达差异 | 探究皮质-皮质投射神经元的转录组特征与其解剖投射类型之间的关联,并解析其反馈回路的功能组织 | 小鼠初级视觉皮层中投射至不同高级视觉区域的层2/3皮质-皮质投射神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组测序、单突触狂犬病示踪 | NA | 基因表达数据、神经解剖追踪数据 | 未明确说明样本数量,但涉及多个投射类型的小鼠皮质-皮质投射神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2026-04-11 |
Proteolysis targeting chimeras (PROTACs) are emerging therapeutics for hematologic malignancies
2020-07-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-020-00924-z
PMID:32718354
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综述 | 本文综述了蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)作为新兴疗法在血液恶性肿瘤治疗中的应用潜力 | 提出利用最新的人类全组织单细胞RNA测序数据识别造血细胞类型特异性/选择性E3连接酶,以开发肿瘤特异性/选择性PROTACs,从而提高治疗安全性 | NA | 系统总结可用于治疗各种血液恶性肿瘤的已知PROTACs,并讨论提高其临床应用安全性的策略 | 蛋白水解靶向嵌合体(PROTACs)及其在血液恶性肿瘤治疗中的应用 | NA | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-04-10 |
3D curvature-instructed endothelial flow response and tissue vascularization
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3629
PMID:32938662
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研究论文 | 本研究开发了一种螺旋微血管模型,用于研究三维曲率对血管内皮细胞表型和转录的影响,并展示了其在肿瘤进展模拟和工程化心脏组织血管化中的应用 | 开发了可精确控制曲率和扭转的螺旋微血管模型,首次在厘米尺度实现均匀组织灌注,并揭示了三维曲率诱导层流下旋转和混合的独特流体动力学效应及其对内皮细胞表型和转录组的特异性影响 | 模型仍处于原理验证阶段,需要进一步在更复杂的组织环境中验证其长期功能和稳定性,且单细胞RNA-seq的样本量可能有限 | 研究三维血管几何特征(特别是曲率和扭转)对血管内皮细胞行为和组织血管化的影响,以解决工程化复杂组织血管化的长期挑战 | 螺旋微血管模型中的内皮细胞,以及在该模型中模拟的肿瘤组织和工程化心脏组织 | 组织工程与血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 螺旋微血管模型(体外三维模型) | 转录组数据, 表型数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-04-08 |
Ribonucleotide reductase small subunit M2 is a master driver of aggressive prostate cancer
2020-08, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12706
PMID:32385899
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研究论文 | 本文探讨了核糖核苷酸还原酶小亚基M2(RRM2)在驱动侵袭性前列腺癌亚型中的作用及其与免疫抑制微环境的关联 | 首次将RRM2特征与PCS和PAM50分子分类系统整合,识别出侵袭性前列腺癌亚型,并揭示了RRM2在免疫逃逸和恩杂鲁胺耐药中的新作用 | 研究主要基于已发表的队列数据,缺乏前瞻性临床验证,且单细胞RNA-seq数据集样本来源有限 | 确定RRM2特征是否能用于识别侵袭性前列腺癌亚型,并评估其临床意义 | 前列腺癌细胞及来自六个已发表队列的4000例前列腺癌病例 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因本体和通路分析, CIBERSORT分析 | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | 六个已发表队列共4000例前列腺癌病例 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2026-04-08 |
Selective LXR agonist DMHCA corrects retinal and bone marrow dysfunction in type 2 diabetes
2020-07-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.137230
PMID:32641586
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研究论文 | 本研究探讨了选择性LXR激动剂DMHCA在2型糖尿病小鼠模型和人类循环血管生成细胞中纠正视网膜和骨髓功能障碍的作用及分子机制 | 首次采用单细胞RNA测序技术分析糖尿病小鼠造血干细胞,揭示了DMHCA通过减少髓系分化、增加循环血管生成细胞和红细胞祖细胞来纠正糖尿病造血干细胞功能障碍的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未在人体临床试验中验证DMHCA的疗效和安全性 | 探究DMHCA对2型糖尿病引起的视网膜和骨髓病理改变的改善作用及其分子机制 | 2型糖尿病(db/db)小鼠、人类循环血管生成细胞(CACs)、小鼠造血干细胞(HSCs) | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,使用糖尿病小鼠和人类CACs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 35 | 2026-04-05 |
Ocular macrophage origin and heterogeneity during steady state and experimental choroidal neovascularization
2020-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02010-0
PMID:33187533
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠和人类脉络膜中巨噬细胞的起源和异质性,特别是在稳态和实验性脉络膜新生血管形成(CNV)条件下的变化 | 首次系统性地揭示了脉络膜巨噬细胞在稳态和激光损伤后的异质性,并鉴定了小鼠和人类中不同的巨噬细胞亚群及其与疾病(如nAMD)的关联 | 研究主要基于小鼠模型和已发表的单细胞RNA-seq数据,可能无法完全反映人类nAMD的复杂性,且样本量有限 | 探究脉络膜巨噬细胞的起源、异质性及其在脉络膜新生血管形成(CNV)中的作用,以寻找nAMD的潜在治疗靶点 | 小鼠(野生型和Ccr2-/-突变体)以及人类脉络膜样本(来自健康个体和nAMD患者) | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA-seq、命运映射 | NA | 流式细胞数据、单细胞RNA-seq数据 | 小鼠模型和已发表的人类单细胞RNA-seq数据(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-04-03 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析发现循环中的testican-2是一种足细胞来源的肾脏健康生物标志物 | 首次发现testican-2在肾脏健康中的关键作用,证明其可作为肾脏功能和预后的新型生物标志物 | 研究样本量相对有限,且主要基于观察性研究,需要进一步验证其因果关系 | 探索肾脏释放到循环中的分子是否能够反映肾脏健康状况 | 人类肾脏组织、循环蛋白质、足细胞 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 适体蛋白质组学、单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、电子显微镜 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、影像数据 | 22名接受侵入性采样的个体,Jackson心脏研究(1,928名非裔美国人),Framingham心脏研究(1,621名白人) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-04-03 |
Prospective isolation of chondroprogenitors from human iPSCs based on cell surface markers identified using a CRISPR-Cas9-generated reporter
2020-02-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-01597-8
PMID:32070421
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9生成的报告基因系统,识别并分离了人诱导多能干细胞中表达特定表面标志物的软骨祖细胞亚群 | 首次利用CRISPR-Cas9编辑的COL2A1-GFP报告基因hiPSC系结合表面标志物筛选,鉴定出CD146+/CD166+/PDGFRβ+/CD45-的独特软骨祖细胞亚群 | 研究仅基于体外实验,未验证体内修复效果;样本量未明确说明 | 提高hiPSC软骨分化的同质性和效率,为软骨组织工程和疾病建模提供纯化细胞源 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其衍生的软骨祖细胞 | 干细胞与再生医学 | 骨关节炎 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-04-03 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
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研究论文 | 本文提出了一种名为DSAVE的新方法,用于评估单细胞转录组簇的纯度并识别错误分类的细胞 | 开发了基于下采样的变异估计方法,通过消除采样噪声差异并使用基于对数似然的度量来识别错误分类的细胞,这是现有类似工具无法检测的 | 未在摘要中明确说明 | 评估单细胞RNA测序数据中细胞亚群的纯度并检测错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的细胞簇和细胞亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-04-02 |
Tumor-on-a-chip platform to interrogate the role of macrophages in tumor progression
2020-09-30, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyaa017
PMID:32930334
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研究论文 | 本研究利用微生理“肿瘤芯片”平台,探究了特定巨噬细胞亚群对肿瘤行为的影响 | 开发了一种新型的3D体外模型,能够高时空分辨率地捕捉细胞间动态,并首次在TOC设备中展示了M1和M2巨噬细胞对肿瘤生长、血管生成和迁移的不同作用机制 | 研究依赖于体外模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性,且样本类型和数量有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类胰腺癌和结直肠癌细胞,以及M1和M2极化巨噬细胞 | 数字病理 | 胰腺癌,结直肠癌 | 单细胞RNA测序,蛋白质分析,抗体中和研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2026-04-01 |
Variance-adjusted Mahalanobis (VAM): a fast and accurate method for cell-specific gene set scoring
2020-09-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa582
PMID:32633778
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Variance-adjusted Mahalanobis (VAM)的新方法,用于单细胞RNA测序数据中的基因集评分,以提高细胞特异性通路分析的准确性和计算效率 | VAM方法首次支持细胞水平的基因集推断,通过整合Seurat框架,能有效处理单细胞RNA测序数据中的技术噪声、稀疏性和大样本量,并提供快速的gamma近似分布用于统计推断 | 未在摘要中明确提及具体限制,但可能依赖于模拟和真实数据的验证范围 | 开发一种快速且准确的细胞特异性基因集评分方法,以改善单细胞RNA测序数据的统计分析和可视化 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵和通路水平聚合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Variance-adjusted Mahalanobis (VAM) 方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |