单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic atlas of the adult Drosophila ventral nerve cord
2020-04-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54074
PMID:32314735
|
research paper | 本文利用单细胞转录组学技术，对成年果蝇腹神经索（VNC）中的细胞多样性进行了无偏分类研究 | 首次生成了包含26,000个高质量细胞的成年果蝇VNC单细胞转录组图谱，涵盖超过100种转录上不同的细胞类型 | NA | 旨在揭示成年果蝇腹神经索中的细胞多样性及其转录特征 | 成年果蝇腹神经索中的细胞 | digital pathology | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 26,000个高质量细胞 |
| 322 | 2024-08-07 |
Brain Endothelial Cells Are Exquisite Sensors of Age-Related Circulatory Cues
2020-03-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.012
PMID:32234477
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研究论文 | 研究探讨了脑内皮细胞（BECs）在正常老化过程中对循环信号的敏感性及其转录变化 | 首次揭示了海马体中的毛细血管内皮细胞在老化过程中表现出最大的转录变化，上调了先天免疫和氧化应激反应途径 | NA | 探究脑内皮细胞是否接收并可能在血液和大脑之间传递与年龄相关的循环信号 | 脑内皮细胞（BECs）及其在老化过程中的转录变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 323 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Entry Genes Are Most Highly Expressed in Nasal Goblet and Ciliated Cells within Human Airways
2020-Mar-13, ArXiv
PMID:32550242
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了SARS-CoV-2病毒受体和S蛋白激活酶在人体呼吸道细胞中的表达情况 | 发现鼻腔杯状细胞和纤毛细胞中病毒受体和激活酶的表达最高，这可能与病毒的高传播性有关 | NA | 旨在更好地理解SARS-CoV-2病毒的趋向性及其在人体呼吸道中的表达情况 | SARS-CoV-2病毒受体和S蛋白激活酶在人体呼吸道细胞中的表达 | 数字病理学 | COVID-19冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康个体的单细胞RNA测序数据 |
| 324 | 2024-08-07 |
Robustness and applicability of transcription factor and pathway analysis tools on single-cell RNA-seq data
2020-02-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1949-z
PMID:32051003
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研究论文 | 本文研究了转录因子和通路分析工具在单细胞RNA测序数据上的鲁棒性和适用性 | 首次系统评估了针对批量测序数据开发的转录因子和通路分析工具在单细胞RNA测序数据上的应用效果 | 研究主要基于模拟数据和真实数据进行，实际应用中可能存在更多变数 | 探讨批量测序的转录因子和通路分析工具是否能有效应用于单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据及其与批量测序数据的比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 包括模拟数据和真实单细胞RNA测序数据 |
| 325 | 2024-08-07 |
Adult Human Glioblastomas Harbor Radial Glia-like Cells
2020-02-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.01.007
PMID:32004492
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研究论文 | 本文研究了成人胶质母细胞瘤中存在的放射状胶质样细胞，并探讨了其在肿瘤发生或维持中的作用 | 首次揭示了成人胶质母细胞瘤中存在具有典型放射状胶质细胞形态和标记的亚群，并通过单细胞RNA测序分析了这些细胞的转录动态 | NA | 探讨成人胶质母细胞瘤中放射状胶质样细胞的存在及其在肿瘤发生或维持中的作用 | 成人胶质母细胞瘤中的放射状胶质样细胞 | NA | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 326 | 2024-08-07 |
Two-phase wash to solve the ubiquitous contaminant-carryover problem in commercial nucleic-acid extraction kits
2020-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-58586-3
PMID:32029846
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研究论文 | 本文介绍了一种两阶段洗涤（TPW）方法，用于解决商业核酸提取试剂盒中普遍存在的污染物携带问题，特别是在低稀释度下提高核酸纯度。 | 开发了一种两阶段洗涤方法，通过在洗脱步骤前添加低水溶性的洗涤缓冲液，有效减少了提取缓冲液的携带，同时不降低核酸产量。 | NA | 提高核酸研究的纯度，特别是在需要高灵敏度的应用中，如单细胞测序和病原体诊断。 | 商业核酸提取试剂盒中的污染物携带问题及其对PCR、LAMP和RT反应的影响。 | 分子生物学 | NA | 数字PCR | NA | 核酸 | NA |
| 327 | 2024-08-07 |
Systematic Comparison of High-throughput Single-Cell and Single-Nucleus Transcriptomes during Cardiomyocyte Differentiation
2020-01-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-58327-6
PMID:32001747
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研究论文 | 本文通过比较Drop-seq和DroNc-seq两种微流控3' RNA捕获技术，系统评估了高吞吐量单细胞和单核RNA测序方法在人诱导多能干细胞向心肌细胞分化过程中的差异 | 首次系统比较了单细胞和单核RNA测序技术在心肌细胞分化过程中的应用，并验证了DroNc-seq在处理异质性人心脏组织样本时的有效性 | NA | 评估高吞吐量单细胞和单核RNA测序技术在心肌细胞分化过程中的差异 | 人诱导多能干细胞向心肌细胞的分化过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 328 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomes Reveal a Complex Cellular Landscape in the Middle Ear and Differential Capacities for Acute Response to Infection
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00358
PMID:32351546
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研究论文 | 使用单细胞转录组学技术分析正常小鼠中耳细胞，揭示了中耳黏膜的细胞多样性和对感染的急性反应能力 | 发现了中耳黏膜中未知的细胞多样性，并识别了几种新的细胞类型或亚型 | NA | 研究中耳黏膜的细胞组成及其对感染的急性反应能力 | 小鼠中耳细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 6770个转录组 |
| 329 | 2024-08-07 |
From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Underlying Complex Diseases
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00424
PMID:32477401
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综述 | 本文综述了如何通过整合全基因组关联研究（GWAS）与功能基因组学数据来解决复杂疾病相关位点的机制识别问题 | 提出了将GWAS结果与单细胞测序输出、功能性多基因风险评分设计以及遗传工程验证疾病相关基因相结合的未来研究方向 | GWAS中大多数疾病相关位点位于非编码区域，其调控的基因及调控发生的细胞类型或生理环境尚不明确 | 探讨如何通过功能基因组学方法识别复杂疾病背后的分子机制，并发现新的药物靶点 | 复杂疾病的分子机制及潜在药物靶点 | 功能基因组学 | 复杂疾病 | NA | NA | 基因组数据 | NA |
| 330 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell multi-omics for gene regulatory network inference
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.06.033
PMID:32774787
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综述 | 本文综述了利用单细胞多组学数据重建基因调控网络（GRN）的技术和方法 | 介绍了单细胞基因组、转录组和表观基因组的测序技术，并概述了利用不同单细胞测序数据重建GRN的策略 | 总结并比较了不同方法的适应性和局限性 | 旨在帮助研究人员识别最适合他们的工具 | 单细胞测序技术和基因调控网络重建方法 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | 数千个单细胞样本 |
| 331 | 2024-08-07 |
Targeting Subsets of Mammalian Neurons
2020, Neuroscience insights
IF:2.9Q2
DOI:10.1177/2633105520908537
PMID:32783027
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研究论文 | 本文开发了基于病毒的方法，用于精确靶向哺乳动物前脑的抑制性和兴奋性神经元亚群 | 利用单细胞转录组数据和基因表达变异来细化神经元靶向，为非转基因方法提供了及时蓝图 | 主要集中在哺乳动物前脑的神经元亚群，未涵盖所有神经元类型 | 开发和优化靶向哺乳动物神经元亚群的方法，特别是在难以进行基因操作的物种中 | 哺乳动物前脑的抑制性和兴奋性神经元亚群 | 神经科学 | NA | 病毒载体 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 332 | 2024-08-07 |
scRepertoire: An R-based toolkit for single-cell immune receptor analysis
2020, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.22139.2
PMID:32789006
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研究论文 | scRepertoire是一个基于R的工具包，用于单细胞免疫受体分析 | scRepertoire填补了单细胞免疫受体分析软件的空白，能够轻松结合mRNA和免疫受体分析 | NA | 开发一个用于单细胞免疫受体分析的工具包 | 单细胞免疫受体数据 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 数据来源于10x Genomics Chromium免疫受体分析 |
| 333 | 2024-08-07 |
Encoding Method of Single-cell Spatial Transcriptomics Sequencing
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.43887
PMID:32792863
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综述 | 本文综述了单细胞空间转录组测序技术的最新进展，特别是位置信息编码方法 | 介绍了基于微孔板、条形码珠阵列、显微切割、杂交和条形码定位以及混合分离技术的单细胞空间转录组技术 | NA | 探讨单细胞空间转录组测序技术在组织功能识别、发育过程追踪及病理和分子检测中的应用 | 单细胞空间转录组测序技术及其位置信息编码方法 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 334 | 2024-08-07 |
Redefining Tumor-Associated Macrophage Subpopulations and Functions in the Tumor Microenvironment
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01731
PMID:32849616
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综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在肿瘤微环境（TME）中的亚群及其功能的重定义 | 探讨了TAM亚群与功能的新证据，并提出了通过新技术整合来解析TAM详细图景的可能性 | 肿瘤微环境的免疫抑制状态仍因对TAM功能理解不足而未明确定义 | 旨在重新定义肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞的亚群及其功能 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | NA | 多重免疫组化（mIHC）、时间飞行质谱细胞术（CyTOF）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学、系统生物学方法 | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-07 |
Pinpointing Cell Identity in Time and Space
2020, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2020.00209
PMID:32923457
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评论 | 本文讨论了整合细胞转录状态与组织及亚细胞空间和时间信息对于全面表征细胞类型和状态的重要性 | 提出了在细胞分类中应考虑分子如RNA和蛋白质的亚细胞空间分布等额外信息层级 | NA | 深入表征细胞群体，特别是在时间和空间维度上 | 哺乳动物细胞的类型和状态 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 336 | 2024-08-07 |
Deciphering Cell Fate Decision by Integrated Single-Cell Sequencing Analysis
2020-07, Annual review of biomedical data science
IF:7.0Q1
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综述 | 本文综述了通过综合单细胞测序分析来解读细胞命运决策的方法和工具 | 介绍了利用单细胞RNA测序和其他测序模式来阐明谱系特化的分子基础，并讨论了计算工具在重建谱系轨迹、量化细胞命运偏倚和进行数据降维可视化方面的新机制见解 | NA | 深入理解细胞命运选择在发育、再生、稳态和疾病中的调控机制 | 细胞分化过程及其在健康和疾病中的行为 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 337 | 2024-08-07 |
Random Parametric Perturbations of Gene Regulatory Circuit Uncover State Transitions in Cell Cycle
2020-Jun-26, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101150
PMID:32450514
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研究论文 | 本文使用芽殖酵母细胞周期作为模型系统，研究基因调控电路如何编码细胞状态转换的关键信息 | 提出了一种通用的随机电路扰动方法，用于包含异质调控类型的电路，并分析了从随机动力学参数的电路模型集合中得到的稳态和振荡状态 | NA | 探索基因调控电路如何编码细胞状态转换的关键信息 | 芽殖酵母细胞周期 | 生物信息学 | NA | 随机电路扰动方法 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 338 | 2024-08-07 |
CB2 improves power of cell detection in droplet-based single-cell RNA sequencing data
2020-06-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02054-8
PMID:32513247
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研究论文 | 本文介绍了一种基于聚类的方法CB2，用于区分单细胞RNA测序数据中的真实细胞与背景条码 | CB2利用了数据集中存在的强细胞间相关性，相较于现有方法，能更有效地识别真实细胞 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞检测的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的真实细胞与背景条码 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类方法 | RNA测序数据 | NA |
| 339 | 2024-08-07 |
Systematic assessment of tissue dissociation and storage biases in single-cell and single-nucleus RNA-seq workflows
2020-06-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02048-6
PMID:32487174
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研究论文 | 本文系统比较了单细胞和单核RNA测序工作流程中组织解离和存储方法的相对偏差和优势 | 首次系统比较了不同组织解离和存储方法对单细胞和单核RNA测序结果的影响 | 研究仅限于成年小鼠肾脏组织，可能不适用于其他组织类型 | 旨在揭示不同组织解离和存储方法对单细胞和单核RNA测序结果的影响 | 成年小鼠肾脏组织的单细胞和单核RNA测序 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年小鼠肾脏组织 |
| 340 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the tumor microenvironment and facilitates strategic choices to circumvent treatment failure in a chemorefractory bladder cancer patient
2020-05-27, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00741-6
PMID:32460812
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了一位化疗耐药性膀胱癌患者的肿瘤微环境，并基于此分析提出了个性化治疗策略 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了化疗耐药性膀胱癌患者的肿瘤微环境和细胞类型特异性转录组变化，为个性化治疗提供了新思路 | 研究仅基于单一病例，结果的普遍性和可复制性有待进一步验证 | 探索化疗耐药性膀胱癌的肿瘤微环境，并开发个性化治疗策略 | 化疗耐药性转移性肌肉浸润性尿路上皮膀胱癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单一病例及其对应的病人源性异种移植模型（PDX） |