单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
Temporal specificity and heterogeneity of Drosophila immune cells
2020-06-17, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020104486
PMID:32162708
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research paper | 本文通过批量RNA测序和单细胞RNA测序研究了果蝇免疫细胞（血细胞）在胚胎和幼虫阶段的异质性及其在不同生理过程中的作用 | 首次构建了果蝇血细胞的分子图谱，并发现了在黄蜂侵扰下血细胞群中出现的新型血细胞类型——片状细胞 | NA | 研究果蝇免疫细胞的异质性及其在不同生理过程中的作用 | 果蝇免疫细胞（血细胞）在胚胎和幼虫阶段的异质性及其在不同生理过程中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 涉及十四种血细胞群 |
| 302 | 2024-08-07 |
Cell Atlas of The Human Fovea and Peripheral Retina
2020-06-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-66092-9
PMID:32555229
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了来自人类成人供体的85,000个细胞的转录组，以深入了解视网膜疾病的病因 | 首次构建了人类中央凹和周边视网膜的细胞图谱，并比较了人类与猕猴的细胞类型表达模式 | NA | 深入理解导致失明的视网膜疾病的病因 | 人类中央凹和周边视网膜的细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 85,000个细胞，来自7名成年人类供体 |
| 303 | 2024-08-07 |
A Multiplexed Barcodelet Single-Cell RNA-Seq Approach Elucidates Combinatorial Signaling Pathways that Drive ESC Differentiation
2020-06-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.04.020
PMID:32459995
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研究论文 | 本文介绍了一种名为barRNA-seq的单细胞RNA测序方法，通过使用RNA“条形码”标记单个细胞，系统地探索细胞扰动，并应用于同时操纵多达七种发育途径，研究其对胚胎干细胞（ESC）胚层分化和中胚层分化的影响。 | barRNA-seq方法的创新之处在于能够同时操纵多个发育途径，并通过RNA条形码标记细胞，从而系统地探索细胞扰动。 | NA | 研究目的是阐明驱动胚胎干细胞分化的组合信号通路，并开发一种数据驱动的框架来识别驱动细胞向特定命运的组合信号扰动。 | 研究对象包括胚胎干细胞（ESC）的胚层分化和中胚层分化，以及通过组合信号通路激活对基因表达的影响。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 涉及多达七个发育途径的细胞样本 |
| 304 | 2024-08-07 |
Unravelling the heterogeneity and dynamic relationships of tumor-infiltrating T cells by single-cell RNA sequencing analysis
2020-06, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1002/JLB.6MR0320-234R
PMID:32272497
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review | 本文综述了单细胞RNA测序技术在解析肿瘤浸润T细胞异质性和动态关系方面的最新进展 | 结合深度转录组信息与T细胞受体（TCR）基的谱系追踪，深入理解肿瘤内T细胞群体 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术如何揭示肿瘤浸润T细胞的异质性及功能意义 | 肿瘤浸润T细胞的异质性、克隆扩增、迁移及效应功能 | digital pathology | NA | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | NA |
| 305 | 2024-08-07 |
Tissue-resident macrophages promote extracellular matrix homeostasis in the mammary gland stroma of nulliparous mice
2020-06-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57438
PMID:32479261
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研究论文 | 本文研究了组织驻留巨噬细胞在未产雌鼠乳腺基质中促进细胞外基质稳态的作用 | 通过转录组分析和单细胞RNA测序，发现了在未产雌鼠乳腺中存在一种表达Lyve-1的特殊基质巨噬细胞亚群，该亚群与细胞外基质（ECM）重塑相关 | NA | 探讨巨噬细胞在未产雌鼠乳腺基质中的作用及其对细胞外基质稳态的影响 | 未产雌鼠乳腺中的组织驻留巨噬细胞及其在基质中的功能 | NA | NA | 转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 未产雌鼠乳腺组织中的巨噬细胞亚群 |
| 306 | 2024-08-07 |
Molecular design of hypothalamus development
2020-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2266-0
PMID:32499648
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、基因调控网络筛选和基于全基因组关联研究的疾病表型分析，以及遗传谱系重建，揭示了在妊娠中期由不同的基因调控网络控制的九种胶质细胞和三十三种神经元亚型的生成 | 首次展示了组合分子代码如何从神经递质、神经肽和转录因子中解码下丘脑神经元的分类层次，并发现γ-氨基丁酸（GABA）和多巴胺神经元的分化依赖于准稳定中间状态 | NA | 揭示下丘脑发育的分子设计原理 | 下丘脑的神经元和胶质细胞多样性 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络 | 基因组数据 | 51,199个源自外胚层的鼠细胞 |
| 307 | 2024-08-07 |
Applications of single-cell sequencing for the field of otolaryngology: A contemporary review
2020-Jun, Laryngoscope investigative otolaryngology
IF:1.6Q2
DOI:10.1002/lio2.388
PMID:32596483
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）技术在耳鼻喉科学领域的应用 | scRNA-Seq技术能够揭示患者组织中的异质性和罕见细胞类型，有助于疾病发病机制的理解和新疾病生物标志物或药物靶点的发现 | scRNA-Seq技术在临床应用中存在一定的局限性 | 旨在激发scRNA-Seq在耳鼻喉科学中的应用，并通过实例展示其在临床医学中的应用潜力 | 主要研究对象包括小鼠听觉系统（包括内耳的毛细胞和支持细胞、螺旋神经节神经元和内耳类器官）以及人类初级细胞样本 | 数字病理学 | 耳鼻喉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA数据 | 涉及小鼠听觉系统及人类初级细胞样本 |
| 308 | 2024-08-07 |
Molecular atlas of the adult mouse brain
2020-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abb3446
PMID:32637622
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research paper | 本文通过全脑空间转录组学技术，对成年小鼠大脑进行了系统的分子分类，揭示了大脑的复杂神经解剖结构。 | 本文通过无偏倚的空间定义特征识别，发现分子信息足以推导出大脑的复杂和详细的神经解剖组织结构，并揭示了新的区域和层次特异性亚区域。 | NA | 旨在基于空间定义特征的无偏倚识别，生成成年小鼠大脑的系统分类。 | 成年小鼠大脑的神经解剖结构和分子组织。 | digital pathology | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠大脑 |
| 309 | 2024-08-07 |
Single-Cell Analyses Reveal Megakaryocyte-Biased Hematopoiesis in Myelofibrosis and Identify Mutant Clone-Specific Targets
2020-05-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2020.04.008
PMID:32386542
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、蛋白质组学、基因组学和功能测试，分析了骨髓纤维化中的造血干细胞和前体细胞，揭示了骨髓纤维化中巨核细胞偏向性造血的现象，并识别了突变克隆特异性靶点 | 本研究首次通过单细胞多组学技术，揭示了骨髓纤维化中巨核细胞偏向性造血的细胞和分子基础，并提供了早期验证的免疫治疗潜在靶点G6B | NA | 确定骨髓纤维化中异常巨核细胞生成的细胞和分子基础 | 骨髓纤维化中的造血干细胞和前体细胞 | 数字病理学 | 骨髓增生性肿瘤 | 单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、基因组学 | NA | 单细胞数据 | 135,929个CD34系造血干细胞和前体细胞 |
| 310 | 2024-08-07 |
A Quantitative Framework for Evaluating Single-Cell Data Structure Preservation by Dimensionality Reduction Techniques
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107576
PMID:32375029
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研究论文 | 本文提出了一种无偏框架，用于评估降维技术在单细胞数据结构保留方面的性能 | 定义了全局和局部结构保留的度量标准，并展示了不同降维方法在实际和合成单细胞RNA测序数据集上的表现 | NA | 评估降维技术在单细胞数据结构保留方面的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了离散和连续的实际和合成单细胞RNA测序数据集 |
| 311 | 2024-08-07 |
SCARLET: Single-cell tumor phylogeny inference with copy-number constrained mutation losses
2020-04-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2020.04.001
PMID:32864481
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research paper | 本文介绍了一种名为SCARLET的算法，用于从单细胞DNA测序数据中推断肿瘤谱系，同时考虑了由拷贝数异常（CNA）驱动的单核苷酸变异（SNV）丢失和测序错误。 | SCARLET算法在模拟数据上优于现有方法，能更准确地推断出突变获取的顺序和单个细胞中的突变。 | NA | 开发一种新的算法来更准确地从单细胞测序数据中推断肿瘤的进化历史。 | 单细胞DNA测序数据，特别是涉及拷贝数异常和单核苷酸变异的肿瘤数据。 | digital pathology | colorectal cancer | single-cell DNA sequencing | NA | single-cell DNA sequencing data | 使用了一个来自结直肠癌患者的单细胞数据集 |
| 312 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic atlas of the adult Drosophila ventral nerve cord
2020-04-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54074
PMID:32314735
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research paper | 本文利用单细胞转录组学技术，对成年果蝇腹神经索（VNC）中的细胞多样性进行了无偏分类研究 | 首次生成了包含26,000个高质量细胞的成年果蝇VNC单细胞转录组图谱，涵盖超过100种转录上不同的细胞类型 | NA | 旨在揭示成年果蝇腹神经索中的细胞多样性及其转录特征 | 成年果蝇腹神经索中的细胞 | digital pathology | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 26,000个高质量细胞 |
| 313 | 2024-08-07 |
Brain Endothelial Cells Are Exquisite Sensors of Age-Related Circulatory Cues
2020-03-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.012
PMID:32234477
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研究论文 | 研究探讨了脑内皮细胞（BECs）在正常老化过程中对循环信号的敏感性及其转录变化 | 首次揭示了海马体中的毛细血管内皮细胞在老化过程中表现出最大的转录变化，上调了先天免疫和氧化应激反应途径 | NA | 探究脑内皮细胞是否接收并可能在血液和大脑之间传递与年龄相关的循环信号 | 脑内皮细胞（BECs）及其在老化过程中的转录变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 314 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Entry Genes Are Most Highly Expressed in Nasal Goblet and Ciliated Cells within Human Airways
2020-Mar-13, ArXiv
PMID:32550242
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了SARS-CoV-2病毒受体和S蛋白激活酶在人体呼吸道细胞中的表达情况 | 发现鼻腔杯状细胞和纤毛细胞中病毒受体和激活酶的表达最高，这可能与病毒的高传播性有关 | NA | 旨在更好地理解SARS-CoV-2病毒的趋向性及其在人体呼吸道中的表达情况 | SARS-CoV-2病毒受体和S蛋白激活酶在人体呼吸道细胞中的表达 | 数字病理学 | COVID-19冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康个体的单细胞RNA测序数据 |
| 315 | 2024-08-07 |
Robustness and applicability of transcription factor and pathway analysis tools on single-cell RNA-seq data
2020-02-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1949-z
PMID:32051003
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研究论文 | 本文研究了转录因子和通路分析工具在单细胞RNA测序数据上的鲁棒性和适用性 | 首次系统评估了针对批量测序数据开发的转录因子和通路分析工具在单细胞RNA测序数据上的应用效果 | 研究主要基于模拟数据和真实数据进行，实际应用中可能存在更多变数 | 探讨批量测序的转录因子和通路分析工具是否能有效应用于单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据及其与批量测序数据的比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 包括模拟数据和真实单细胞RNA测序数据 |
| 316 | 2024-08-07 |
Adult Human Glioblastomas Harbor Radial Glia-like Cells
2020-02-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.01.007
PMID:32004492
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研究论文 | 本文研究了成人胶质母细胞瘤中存在的放射状胶质样细胞，并探讨了其在肿瘤发生或维持中的作用 | 首次揭示了成人胶质母细胞瘤中存在具有典型放射状胶质细胞形态和标记的亚群，并通过单细胞RNA测序分析了这些细胞的转录动态 | NA | 探讨成人胶质母细胞瘤中放射状胶质样细胞的存在及其在肿瘤发生或维持中的作用 | 成人胶质母细胞瘤中的放射状胶质样细胞 | NA | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 317 | 2024-08-07 |
Two-phase wash to solve the ubiquitous contaminant-carryover problem in commercial nucleic-acid extraction kits
2020-02-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-58586-3
PMID:32029846
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研究论文 | 本文介绍了一种两阶段洗涤（TPW）方法，用于解决商业核酸提取试剂盒中普遍存在的污染物携带问题，特别是在低稀释度下提高核酸纯度。 | 开发了一种两阶段洗涤方法，通过在洗脱步骤前添加低水溶性的洗涤缓冲液，有效减少了提取缓冲液的携带，同时不降低核酸产量。 | NA | 提高核酸研究的纯度，特别是在需要高灵敏度的应用中，如单细胞测序和病原体诊断。 | 商业核酸提取试剂盒中的污染物携带问题及其对PCR、LAMP和RT反应的影响。 | 分子生物学 | NA | 数字PCR | NA | 核酸 | NA |
| 318 | 2024-08-07 |
Systematic Comparison of High-throughput Single-Cell and Single-Nucleus Transcriptomes during Cardiomyocyte Differentiation
2020-01-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-58327-6
PMID:32001747
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研究论文 | 本文通过比较Drop-seq和DroNc-seq两种微流控3' RNA捕获技术，系统评估了高吞吐量单细胞和单核RNA测序方法在人诱导多能干细胞向心肌细胞分化过程中的差异 | 首次系统比较了单细胞和单核RNA测序技术在心肌细胞分化过程中的应用，并验证了DroNc-seq在处理异质性人心脏组织样本时的有效性 | NA | 评估高吞吐量单细胞和单核RNA测序技术在心肌细胞分化过程中的差异 | 人诱导多能干细胞向心肌细胞的分化过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 319 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomes Reveal a Complex Cellular Landscape in the Middle Ear and Differential Capacities for Acute Response to Infection
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00358
PMID:32351546
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研究论文 | 使用单细胞转录组学技术分析正常小鼠中耳细胞，揭示了中耳黏膜的细胞多样性和对感染的急性反应能力 | 发现了中耳黏膜中未知的细胞多样性，并识别了几种新的细胞类型或亚型 | NA | 研究中耳黏膜的细胞组成及其对感染的急性反应能力 | 小鼠中耳细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 6770个转录组 |
| 320 | 2024-08-07 |
From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Underlying Complex Diseases
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00424
PMID:32477401
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综述 | 本文综述了如何通过整合全基因组关联研究（GWAS）与功能基因组学数据来解决复杂疾病相关位点的机制识别问题 | 提出了将GWAS结果与单细胞测序输出、功能性多基因风险评分设计以及遗传工程验证疾病相关基因相结合的未来研究方向 | GWAS中大多数疾病相关位点位于非编码区域，其调控的基因及调控发生的细胞类型或生理环境尚不明确 | 探讨如何通过功能基因组学方法识别复杂疾病背后的分子机制，并发现新的药物靶点 | 复杂疾病的分子机制及潜在药物靶点 | 功能基因组学 | 复杂疾病 | NA | NA | 基因组数据 | NA |