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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-05 |
Single-Cell Gene Expression Analyses Reveal Distinct Self-Renewing and Proliferating Subsets in the Leukemia Stem Cell Compartment in Acute Myeloid Leukemia
2020-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-18-2932
PMID:31784425
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞基因表达分析揭示了急性骨髓性白血病中的不同自我更新和增殖亚群 | 首次展示了急性骨髓性白血病中白血病干细胞的自我更新和增殖功能是独立的 | 主要研究集中在小鼠模型上,可能与人类的情况有所不同 | 探讨急性骨髓性白血病中白血病干细胞的自我更新与增殖功能是否是分开的 | 急性骨髓性白血病中的白血病干细胞 | 数字病理学 | 急性骨髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠AML模型以及初级人类白血病干细胞和正常人类造血干细胞的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-05 |
The role of the NMD factor UPF3B in olfactory sensory neurons
2020-08-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.57525
PMID:32773035
|
研究论文 | 本文研究了NMD因子UPF3B在嗅觉系统中的作用 | 揭示了UPF3B在成熟嗅觉感受器神经元中选择性表达特定嗅觉受体基因的调控 | 本文未深入探讨UPF3B在其他类型神经元中的作用 | 研究UPF3B在嗅觉感知中的功能及机制 | 以小鼠模型为对象,分析嗅觉感受器神经元的UPF3B功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和RNA-seq | NA | RNA数据 | 野生型小鼠中嗅觉感受器神经元的细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-08-05 |
Antibody targeting of B7-H4 enhances the immune response in urothelial carcinoma
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1744897
PMID:32363111
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研究论文 | 该文章探讨了抗B7-H4抗体在尿路上皮癌中增强免疫反应的作用 | 阐明了B7-H4在小鼠癌症模型中的新表达,以及其在促进T细胞活性的潜力 | 缺乏对其他种类肿瘤模型中的B7-H4表现的综合分析 | 识别新的治疗靶点以改善尿路上皮癌患者的生存率 | 研究对象包括小鼠癌症模型和人类膀胱癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,免疫质量细胞术 | NA | 肿瘤样本 | 包括小鼠模型及人类膀胱癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-05 |
Endothelial Reprogramming by Disturbed Flow Revealed by Single-Cell RNA and Chromatin Accessibility Study
2020-12-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108491
PMID:33326796
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研究论文 | 这篇文章研究了受扰流对内皮细胞的重编程影响 | 该研究揭示了扰流如何导致内皮细胞从抗动脉粥样硬化表型转变为促动脉粥样硬化表型及其潜在的新型免疫细胞样表型 | NA | 深入理解扰流对内皮细胞基因表达的机制 | 来自小鼠部分颈动脉结扎模型的内皮细胞 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq) | NA | 细胞数据 | 来自左侧和右侧颈动脉的内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-08-05 |
A Single-Cell Transcriptional Roadmap of the Mouse and Human Lymph Node Lymphatic Vasculature
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.00052
PMID:32426372
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究小鼠和人类淋巴结淋巴血管的细胞异质性和组织结构 | 识别出淋巴小结中的五个明确的细胞亚群,并揭示了新的淋巴血管组织特征 | NA | 深入理解淋巴血管的发育与构建 | 小鼠淋巴结淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq atlas of Schistosoma mansoni identifies a key regulator of blood feeding
2020-09-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abb7709
PMID:32973030
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了血吸虫,并识别出一个关键的血液摄取调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出68种不同的细胞群体以及维持血吸虫消化道的专门干细胞 | 尚未完全了解寄生虫不同组织在成功寄生中的功能 | 研究血吸虫的细胞特性和潜在治疗靶点 | 成人血吸虫的细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 43,642个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-05 |
ZipSeq: barcoding for real-time mapping of single cell transcriptomes
2020-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0880-2
PMID:32632238
|
研究论文 | 本文提出了一种名为‘ZipSeq’的方法,用于在活组织中实时映射单细胞转录组。 | 创新点在于使用图案照明和光封闭的寡核苷酸即时为活细胞打印条形码,解决了细胞位置与转录组关联的局限性。 | 目前方法在实时定位细胞转录组方面存在不同的局限性。 | 本研究旨在提高细胞转录组数据与细胞在三维空间中位置的整合能力。 | 研究对象包括体外创伤愈合、活淋巴结切片和活肿瘤微环境中的细胞。 | 数字病理学 | 肿瘤 | 光照和光封闭的寡核苷酸 | NA | 基因表达数据 | 在各种设置中发现新的基因表达模式,具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-05 |
Early precursors and molecular determinants of tissue-resident memory CD8+ T lymphocytes revealed by single-cell RNA sequencing
2020-05-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz6894
PMID:32414833
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究CD8 T细胞在对病毒感染反应中的基因表达模式 | 揭示了在病毒感染早期,组织中特定CD8 T细胞前体的转录异质性 | 研究可能未涵盖所有组织环境下的CD8 T细胞特征 | 探讨CD8 T细胞在病毒感染中的分化过程 | CD8 T细胞在脾脏和小肠内的特定亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在病毒感染过程中对不同分化阶段的个体CD8 T细胞进行了分析 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-05 |
CD52 Is Elevated on B cells of SLE Patients and Regulates B Cell Function
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.626820
PMID:33658999
|
研究论文 | 本研究揭示了系统性红斑狼疮(SLE)患者B细胞上CD52的升高及其对B细胞功能的调节 | 本研究首次揭示了SLE患者B细胞表面CD52的显著升高及其在B细胞功能调节中的抑制作用 | 本研究未涉及CD52对其他免疫细胞的影响 | 探讨CD52在SLE患者B细胞功能中的作用 | SLE患者与健康供体的B细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | JeKo-1细胞 | RNA序列数据 | 涉及SLE患者和健康供体的B细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-05 |
Semiochemical responsive olfactory sensory neurons are sexually dimorphic and plastic
2020-11-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54501
PMID:33231170
|
研究论文 | 本研究探讨了基因和经验如何共同作用生成表型变异性,特别是在小鼠的主要嗅觉上皮中 | 识别出了一群性别特异性的嗅觉感知神经元,并发现其在不同性别小鼠中的表现出性别差异,同时揭示了活动依赖基因表达的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能不适用于其他物种 | 研究基因和经验在表现性状变异中的作用 | 主要嗅觉上皮中的嗅觉感知神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | 性别分离的小鼠和性别结合的小鼠的嗅觉神经元亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-05 |
Identification of Repurposable Drugs and Adverse Drug Reactions for Various Courses of COVID-19 Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-May-16, ArXiv
PMID:33299905
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据筛选出可重新利用的抗COVID-19药物和不良药物反应 | 首次使用系统生物学方法结合FDA批准的药物和小分子化合物的数据来发现防治COVID-19的新药物 | 未详细探讨所有候选药物的临床适应性和潜在不良反应 | 寻找可重新利用的药物以治疗COVID-19 | 美国FDA批准的药物和前临床小分子化合物 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含轻症和重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-08-05 |
Ocular macrophage origin and heterogeneity during steady state and experimental choroidal neovascularization
2020-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02010-0
PMID:33187533
|
研究论文 | 本研究探讨了小鼠和人类眼部巨噬细胞在稳态和实验性脉络膜新生血管形成中的起源与异质性 | 首次揭示了小鼠和人类眼部巨噬细胞亚群的组成及其在疾病中的功能差异 | 尚未明确人类巨噬细胞亚群的所有功能特点和生物学意义 | 研究眼部巨噬细胞在稳态和病理状态下的异质性及其起源 | 小鼠模型及人类nAMD患者的巨噬细胞 | 数字病理学 | 与年龄相关的黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | Cx3cr1CreER/+ ; Rosa26zsGFP/+小鼠模型 | RNA数据 | 涉及的小鼠和人类样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-05 |
Matrix factorization and transfer learning uncover regulatory biology across multiple single-cell ATAC-seq data sets
2020-07-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa349
PMID:32392348
|
研究论文 | 本文提出了一种分析框架,用于整合多个单细胞ATAC-seq数据集。 | 通过应用CoGAPS矩阵分解算法和projectR转移学习程序,有助于识别多个scATAC-seq数据集中的共同调控模式。 | 本文没有提到具体的限制。 | 探讨如何整合多个单细胞ATAC-seq数据集和/或测序方式。 | 分析可公开获得的单细胞ATAC-seq数据集。 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq | CoGAPS矩阵分解算法 | 单细胞基因组数据 | 使用了公开可得的多个单细胞ATAC-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-05 |
Multimodal single-cell analysis reveals distinct radioresistant stem-like and progenitor cell populations in murine glioma
2020-12, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.23866
PMID:32621641
|
研究论文 | 这篇文章展示了小鼠胶质瘤中不同的耐辐射干样和祖细胞群体的多模态单细胞分析 | 首次结合侧群分析和单细胞RNA测序,揭示了胶质瘤对辐射的细胞反应时间过程 | 研究主要集中在小鼠模型上,可能无法完全代表人类胶质瘤的复杂性 | 探讨胶质瘤中耐辐射细胞群体及其对辐射的反应 | 小鼠胶质瘤模型中的肿瘤细胞和免疫细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序,FACS | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-05 |
RNA-seq analysis of galaninergic neurons from ventrolateral preoptic nucleus identifies expression changes between sleep and wake
2020-Sep-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07050-7
PMID:32928100
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研究论文 | 本文研究了在睡眠和觉醒状态下,腹外侧前视核的加拉宁能神经元的转录调控。 | 本研究揭示了加拉宁能神经元在睡眠和缺觉中的转录响应变化,扩展了对这一特定神经元群体的重要知识。 | 研究可能未能充分考虑其他神经元类型及其在睡眠/觉醒中的作用。 | 探讨腹外侧前视核加拉宁能神经元的转录调控机制,特别是在睡眠状态下的变化。 | 研究对象为腹外侧前视核的加拉宁能神经元,比较其在睡眠与觉醒状态下的表达变化。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从腹外侧前视核分离的eGFP(+)加拉宁神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-05 |
Diversification of reprogramming trajectories revealed by parallel single-cell transcriptome and chromatin accessibility sequencing
2020-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1190
PMID:32917699
|
研究论文 | 本文探讨了细胞重编程过程中的异质性及其机制 | 首次利用单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序揭示了重编程细胞的多样性和异步轨迹 | 未提及具体样本数量和实验限制 | 揭示重编程细胞的异质性及成功重编程的机制 | 重编程的人类细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-05 |
Social reprogramming in ants induces longevity-associated glia remodeling
2020-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba9869
PMID:32875108
|
研究论文 | 本文探讨了社会性昆虫中工蚁转变为类女王状态对神经胶质细胞重塑及寿命的影响 | 发现社交行为的重编程与神经保护胶质细胞的扩展相关,揭示了工蚁转变为gamergate对寿命延长的影响 | 研究主要集中在特定的社交转变上,可能无法广泛适用于所有社交昆虫 | 探索社会性昆虫中工作形式与寿命之间的关系及其机制 | 研究对象是社会性昆虫中的工蚁与gamergate状态的比较 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals ectopic and aberrant lung-resident cell populations in idiopathic pulmonary fibrosis
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1983
PMID:32832599
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研究论文 | 我们提供了一幅特发性肺纤维化(IPF)单细胞图谱,揭示了该致命间质肺病中的细胞多样性 | 识别出一种先前未被发现的异常基底细胞群体,并展示了IPF肺中细胞群体的复杂性 | 研究仅涉及有限的样本种类,可能无法完全代表所有IPF患者中的细胞异质性 | 研究特发性肺纤维化中的细胞组成及其潜在功能 | 312,928个来自32个IPF患者和其他对照的单细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 312,928个细胞来自32个IPF患者、28个吸烟和不吸烟的对照以及18个COPD患者的肺 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-05 |
Site-1 protease ablation in the osterix-lineage in mice results in bone marrow neutrophilia and hematopoietic stem cell alterations
2020-06-23, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.052993
PMID:32576566
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研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠中osterix谱系中Site-1蛋白酶的缺失对骨髓中中性粒细胞及造血干细胞的影响 | 本研究初步揭示了Site-1蛋白酶在维持骨髓造血微环境平衡中的重要作用 | 研究主要在小鼠模型中进行,结果能否推广到人类需进一步验证 | 研究Site-1蛋白酶缺失对骨髓细胞组成及造血干细胞功能的影响 | 小鼠,尤其是osterix谱系中Site-1蛋白酶缺失的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质质谱 | NA | NA | 涉及多种骨髓来源的细胞,具体样本量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-05 |
Dynamics of peripheral T cell clones during PD-1 blockade in non-small cell lung cancer
2020-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-020-02642-4
PMID:32591861
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研究论文 | 本文探讨了在非小细胞肺癌中PD-1阻断期间外周T细胞克隆的动态变化 | 通过Smart-seq2单细胞RNA测序分析,首次对T细胞克隆在免疫治疗中的动态进行了全面监测 | 研究样本仅限于非小细胞肺癌患者,可能影响结果的普遍适用性 | 研究PD-1阻断患者外周T细胞克隆的功能状态和动态变化 | 分析了3,110个非小细胞肺癌患者的外周T细胞 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | Smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3,110个外周T细胞 | NA | NA | NA | NA |