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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-05 |
Transcriptome Dynamics of Hematopoietic Stem Cell Formation Revealed Using a Combinatorial Runx1 and Ly6a Reporter System
2020-05-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2020.03.020
PMID:32302558
|
研究论文 | 该文章研究了造血干细胞(HSC)形成的转录组动态，利用组合的Runx1和Ly6a报告系统进行可视化 | 通过生成Tg(Runx1-mKO2; Ly6a-GFP)双重报告小鼠，首次识别并追踪造血干细胞的发育过程 | 由于造血干细胞及其前体细胞的稀缺性，可能导致研究样本的局限性 | 揭示前造血干细胞的出现和成熟过程 | 研究对象包括前造血干细胞及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用了双重报告小鼠的细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-08-05 |
A single-cell survey of Drosophila blood
2020-05-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54818
PMID:32396065
|
研究论文 | 该论文利用单细胞RNA测序对果蝇血细胞进行了调查 | 发现了在不同炎症条件下果蝇血细胞的多样性，并首次揭示了FGF信号在血细胞之间的相互作用中的新角色 | 目前只集中于果蝇的血细胞种类，结果是否适用于其他物种尚未确定 | 旨在通过单细胞RNA测序深入理解果蝇血细胞的功能 | 果蝇幼虫中的血细胞（称为hemocytes） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-08-05 |
Pooled Knockin Targeting for Genome Engineering of Cellular Immunotherapies
2020-Apr-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.03.039
PMID:32302591
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研究论文 | 本研究开发了一种技术用于对人类T细胞进行高通量的基因敲入筛选 | 提出了一种新颖的合并基因组工程技术，可以对大规模非病毒DNA模板进行条形码标记和追踪 | 未提及具体的样本量和方法的局限性 | 研究目的在于提高基因改造免疫细胞在癌症免疫治疗中的效果 | 主要研究对象为经过基因敲入的初级人类T细胞 | 数字病理学 | 癌症免疫治疗 | CRISPR | NA | 细胞转录组数据 | 数十个独特的条形码模板 | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-05 |
Association Analysis of Single-Cell RNA Sequencing and Proteomics Reveals a Vital Role of Ca2+ Signaling in the Determination of Skeletal Muscle Development Potential
2020-04-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9041045
PMID:32331484
|
研究论文 | 本研究探讨了特定猪模型中肌肉发育潜力决定机制 | 首次揭示了Ca2+信号在骨骼肌发育潜力中的重要作用 | 只使用了特定的猪模型，可能限制了结果的普遍性 | 探索肌肉生成与脂肪生成之间的稳态机制 | 瘦型猪和肥胖型猪的肌肉衍生Myo-谱系细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质组学分析 | NA | RNA和蛋白质数据 | 瘦型猪与肥胖型猪的肌肉衍生细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-05 |
Characterizing pancreatic β-cell heterogeneity in the streptozotocin model by single-cell transcriptomic analysis
2020-07, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2020.100982
PMID:32247924
|
研究论文 | 本研究探索了在链脲佐菌素（STZ）模型下胰岛细胞的分子特征 | 识别了β细胞在生理和病理条件下的异质性，并未观察到Glut2low向Glut2high的转化 | 未能发现STZ模型中非β内分泌细胞的转录组变化或α细胞谱系向β细胞谱系的直接转分化途径 | 重新评估链脲佐菌素（STZ）模型中β细胞的功能和再生 | 链脲佐菌素处理的小鼠胰腺内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2999个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-08-05 |
Chloride channels regulate differentiation and barrier functions of the mammalian airway
2020-04-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.53085
PMID:32286221
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研究论文 | 本文系统地表征了小鼠气道的发育景观，并确定了在人类胎儿发育过程中操作的高度保守的细胞程序 | 揭示氯离子通道在哺乳动物气道形成与功能中的重要作用 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类情况存在差异 | 探讨气道粘膜屏障的形成和功能的分子事件 | 小鼠气道的发育和修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-08-05 |
Cerebro: interactive visualization of scRNA-seq data
2020-04-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz877
PMID:31764967
|
研究论文 | 介绍Cerebro，一款无需生物信息学经验的单细胞转录组数据互动可视化工具 | Cerebro提供了一种用户友好的图形界面，允许生物学家不需要生物信息学知识即可直接与数据互动 | 仅针对已经预处理的单细胞转录组数据，可能限制了其应用范围 | 旨在为生物学家提供一个可以互动分析单细胞RNA-seq数据的平台 | 生物学家和生物信息学家使用单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 使用了来自公共可用数据集的三个示例 | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-08-05 |
Machine Learning of Single-Cell Transcriptome Highly Identifies mRNA Signature by Comparing F-Score Selection with DGE Analysis
2020-Jun-05, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2020.02.004
PMID:32169803
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为EmPredictor的预测器，以识别人体植入前胚胎发育阶段 | 提出了使用F-score算法与差异基因表达分析相比较，以识别发育阶段特定标记的创新方法 | 需高实验成本和较长的实验周期 | 开发计算方法以识别发育标记的有效基因 | 人类植入前胚胎发育的关键基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 1,881个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-05 |
Latent periodic process inference from single-cell RNA-seq data
2020-03-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15295-9
PMID:32188848
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Cyclum的自编码器方法，用于从单细胞RNA测序数据中推断潜在的周期性生物过程 | Cyclum显著提高了细胞周期特征化的准确性和稳健性，超越了现有方法 | 对于周期性过程的准确表征仍然具有挑战性 | 研究如何从单细胞RNA测序数据中推断生物发育过程中潜在的周期性过程 | 通过分析不同发育阶段细胞的转录组特征，聚焦于细胞周期的识别 | 数字病理学 | 肿瘤异质性 | RNA测序 | 自编码器 | transcriptomic 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-08-05 |
Connect-seq to superimpose molecular on anatomical neural circuit maps
2020-02-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1912176117
PMID:32034095
|
研究论文 | 本文描述了一种结合逆行病毒追踪和单细胞转录组学的方法，称为“Connect-seq”，用于揭示特定神经回路中上游神经元的分子身份及其信号分子 | Connect-seq方法的创新在于将分子图谱与神经解剖图谱叠加，实现对神经回路功能的分子和遗传学研究 | NA | 探究小鼠大脑神经回路内个体神经元的身份和功能 | 小鼠大脑中的下丘脑神经元，尤其是控制对恐惧和压力生理反应的神经元 | 数字病理 | NA | 逆行病毒追踪和单细胞转录组学 | NA | 分子图谱与神经解剖图谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-08-05 |
Metastatic Conditioning of Myeloid Cells at a Subcutaneous Synthetic Niche Reflects Disease Progression and Predicts Therapeutic Outcomes
2020-02-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-1932
PMID:31662327
|
研究论文 | 本研究监测了合成生物材料支架中髓系细胞的转移条件，反映了疾病进展并预测了治疗结果 | 引入合成转移微环境作为监测肿瘤细胞动态的创新途径 | 研究主要集中在小鼠模型上，翻译到人类临床应用时可能会存在差异 | 探讨合成微环境中免疫细胞的表型如何反映转移性疾病的进展及其对治疗的反应 | 分析植入生物材料支架后，髓系细胞在不同时间点的免疫表型变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 治疗前后单只小鼠的多个生物材料植入样本 | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-08-05 |
Benchmarking principal component analysis for large-scale single-cell RNA-sequencing
2020-01-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1900-3
PMID:31955711
|
研究论文 | 本文评估了用于大规模单细胞RNA测序数据集的主成分分析(PCA)算法 | 提出了基于Krylov子空间和随机奇异值分解的PCA算法的基准评估 | 未提及特定的局限性 | 评估现有的快速和内存高效的PCA算法在大规模scRNA-seq数据集中的应用 | 大规模单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Uncovers a Vast Diversity in Intracellular Viral Defective Interfering RNA Content Affecting the Large Cell-to-Cell Heterogeneity in Influenza A Virus Replication
2020-01-07, Viruses
DOI:10.3390/v12010071
PMID:31936115
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研究论文 | 本研究探讨了缺陷干扰颗粒（DIP）对流感A病毒复制过程中细胞间变异性的影响 | 首次揭示了感染细胞中缺陷干扰vRNA含量的显著细胞间异质性及其对病毒释放的影响 | 未明确探讨不同DIP类型对细胞间变异性的具体作用 | 研究缺陷干扰颗粒在流感A病毒复制中的作用及其对细胞间异质性的影响 | 流感A病毒感染的细胞及其内部缺陷干扰RNA含量 | 病毒学 | 流感 | 单细胞RNA测序, 逆转录聚合酶链反应 | NA | RNA | 使用细胞样本进行分析，具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-08-05 |
Functionally Diverse Inflammatory Responses in Peripheral and Liver Monocytes in Alcohol-Associated Hepatitis
2020-Oct, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1563
PMID:33024916
|
研究论文 | 本研究探讨了酒精相关肝炎中外周和肝脏单核细胞的功能多样性炎症反应 | 揭示了在酒精相关肝炎中不同单核细胞亚群对炎症反应的不同表达特征 | 研究可能未考虑其他慢性肝病与酒精相关肝炎的比较 | 研究酒精相关肝炎中单核细胞的炎症反应机制 | 酒精相关肝炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 酒精相关肝炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-08-05 |
Heterogeneous groups of alveolar type II cells in lung homeostasis and repair
2020-12-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00341.2020
PMID:32903031
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mini review | 本文讨论了不同亚群的肺泡II型细胞及其在稳态、损伤后和病理条件下的功能 | 发现了不同亚型的肺泡II型细胞具有不同的自我更新和分化能力 | 研究未深入探讨所有可能的AT2细胞亚群及其功能 | 探讨肺泡II型细胞在肺部稳态和修复中的作用及其异质性 | 肺泡II型细胞的不同亚群及其在不同环境中的功能 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-05 |
Complex Autoinflammatory Syndrome Unveils Fundamental Principles of JAK1 Kinase Transcriptional and Biochemical Function
2020-09-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.07.006
PMID:32750333
|
研究论文 | 本文描述了一种患者的罕见自炎症综合症及其与JAK1激酶突变的关联 | 提出了突变'转录型'的概念，展示了S703I突变的独特功能 | 研究主要基于单个病例，缺乏更大样本的验证 | 探索JAK1在自炎症疾病中的转录和生化功能 | 一名因JAK1突变出现多脏器免疫失调的患者 | 数字病理学 | 自炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 1名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease
2020-08-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.06.038
PMID:32702314
|
研究论文 | 本文研究了阿尔茨海默病小鼠模型中，淀粉样斑块周围的转录变化 | 提供了一种前所未有的方法，通过空间转录组学分析解开阿尔茨海默病及其他脑部疾病致病标志物附近的失调细胞网络 | 该研究主要基于小鼠模型，临床应用可能受限 | 探讨阿尔茨海默病相关的分子变化和细胞相互作用 | 以阿尔茨海默病小鼠模型为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学和原位测序 | NA | 组织样本 | 涉及小鼠和人类脑切片 | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Efficient Generation and Transcriptomic Profiling of Human iPSC-Derived Pulmonary Neuroendocrine Cells
2020-May-22, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101083
PMID:32380423
|
研究论文 | 本研究展示了如何通过诱导性多能干细胞生成肺神经内分泌细胞，并进行了转录组特征分析 | 本研究首次利用诱导性多能干细胞生成并表征肺神经内分泌细胞，提供了全新的细胞模型 | 该研究未在临床样本中验证生成的细胞功能 | 研究肺神经内分泌细胞的发生和其在肺部疾病中的作用 | 诱导性多能干细胞衍生的肺神经内分泌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | iPNECs | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics inferred from pathology whole-slide images links tumor heterogeneity to survival in breast and lung cancer
2020-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-75708-z
PMID:33139755
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研究论文 | 本文介绍了一种利用数字病理全切片图像进行空间转录组分析的方法，以连接肿瘤异质性与乳腺癌和肺癌的生存率 | 提出了一种新的方法，通过深度学习模型在病理全切片图像上空间解析mRNA和miRNA表达水平，并构建异质性指数(HTI) | 现有分析方法需要大量训练样本和复杂的流程，而我们的模型在样本数量较少的情况下仍显示了良好的性能 | 研究肿瘤异质性及其对生存的影响，以改善癌症的诊断和治疗 | 研究了乳腺癌和肺癌样本中的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 乳腺癌，肺癌 | 深度学习 | 深度学习模型 | 图像 | 使用了来自两个癌症队列的少量训练样本 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-08-05 |
Clonal kinetics and single-cell transcriptional profiling of CAR-T cells in patients undergoing CD19 CAR-T immunotherapy
2020-01-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13880-1
PMID:31924795
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研究论文 | 本文探讨了在接受CD19 CAR-T免疫治疗的患者中，CAR-T细胞的克隆动力学和转录组特征 | 本研究揭示了CAR-T细胞在输注后如何受到转录程序的调控，特别关注了细胞的克隆多样性及其对抗肿瘤反应的影响 | 尽管发现了克隆动力学的不同模式，但整合位点并未被确认作为克隆动力学的主要驱动因素 | 研究CAR-T细胞在输注后行为的转录程序及其克隆动力学 | 研究重点是CD8 CAR-T细胞，包括输注产品和患者的血液样本 | 数字病理学 | B细胞恶性肿瘤 | TCRB测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 研究涉及的样本包括输注产品和接受治疗患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |