单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-07 |
SARS-CoV-2 Spike Protein Interacts with Multiple Innate Immune Receptors
2020-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.07.29.227462
PMID:32766577
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2的刺突蛋白与多种先天免疫受体的相互作用 | 首次展示了SARS-CoV-2刺突蛋白通过其糖基化与多种先天免疫受体相互作用 | NA | 探讨SARS-CoV-2刺突蛋白与先天免疫受体的相互作用及其在治疗干预中的潜在应用 | SARS-CoV-2刺突蛋白及其与先天免疫受体的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 242 | 2024-08-07 |
Genome-wide studies reveal the essential and opposite roles of ARID1A in controlling human cardiogenesis and neurogenesis from pluripotent stem cells
2020-07-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02082-4
PMID:32646524
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研究论文 | 本文报道了ARID1A在人类胚胎干细胞中调控神经发生和心脏发生的相反作用 | 首次揭示了ARID1A在人类胚胎干细胞中调控心脏发生和神经发生的分子机制 | NA | 探究ARID1A在人类胚胎干细胞中调控心脏发生和神经发生的分子机制 | 人类胚胎干细胞中的心脏发生和神经发生 | 干细胞生物学 | 先天性心脏缺陷 | scRNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 人类胚胎干细胞 |
| 243 | 2024-08-07 |
Circulating immune cell phenotype dynamics reflect the strength of tumor-immune cell interactions in patients during immunotherapy
2020-07-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1918937117
PMID:32571915
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研究论文 | 研究探讨了免疫治疗期间外周血免疫细胞表型动态变化与肿瘤内免疫活性的关系 | 通过生态种群模型和单细胞RNA测序分析，揭示了响应患者中肿瘤与循环免疫细胞的强相互作用及其表型变化 | 研究仅限于胃肠道癌症患者，且样本来自单一临床试验 | 探讨外周血免疫细胞表型在癌症治疗前后及早期如何反映肿瘤内免疫活性 | 胃肠道癌症患者在接受化疗和免疫治疗期间的肿瘤和免疫细胞 | 数字病理学 | 胃肠道癌 | 单细胞RNA测序 | 生态种群模型 | 临床数据和基因组数据 | 一批晚期胃肠道癌症患者 |
| 244 | 2024-08-07 |
Integrated Transcriptome and Network Analysis Reveals Spatiotemporal Dynamics of Calvarial Suturogenesis
2020-07-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107871
PMID:32640236
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研究论文 | 本研究通过综合转录组和网络分析，揭示了颅骨缝合生成的时空动态特征 | 本研究首次在组织和单细胞水平上对小鼠额缝进行了胚胎日E16.5和E18.5的转录组分析，并结合共表达网络分析，验证了调控成骨细胞分化的关键驱动基因 | NA | 研究颅面异常中涉及的缝合组织的发育机制 | 小鼠额缝及其在Saethre-Chotzen和Apert综合征中的模型 | 数字病理学 | 颅面异常 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠额缝组织和单细胞样本 |
| 245 | 2024-08-07 |
Analysis of endothelial-to-haematopoietic transition at the single cell level identifies cell cycle regulation as a driver of differentiation
2020-07-01, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02058-4
PMID:32611441
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研究论文 | 本研究利用人多能干细胞分化系统和单细胞转录组学在体外重现内皮-造血转化过程，并揭示了内皮细胞如何生成早期造血细胞的机制 | 首次揭示了细胞周期调控在内皮-造血转化中的关键作用，特别是CDK4/6和CDK1在转化过程中的重要作用 | 研究主要基于体外模型，可能与人体内的实际情况存在差异 | 探究内皮-造血转化的分子机制 | 内皮细胞和造血干细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 246 | 2024-08-07 |
Artificial-cell-type aware cell-type classification in CITE-seq
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa467
PMID:32657383
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研究论文 | 本文提出了一种名为CITE-sort的人工细胞类型感知表面标记聚类方法，用于CITE-seq数据中的细胞类型分类 | CITE-sort能够识别并分离由多重细胞引起的人工细胞类型，提高了细胞表面表型的自动化分析准确性 | NA | 旨在解决CITE-seq数据中多重细胞导致的人工细胞类型问题，提高细胞类型分类的准确性 | CITE-seq数据中的细胞类型分类 | 单细胞测序 | NA | CITE-seq | 聚类方法 | 单细胞转录组数据 | 使用了真实和模拟的CITE-seq数据集进行验证 |
| 247 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals profibrotic roles of distinct epithelial and mesenchymal lineages in pulmonary fibrosis
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1972
PMID:32832598
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肺纤维化中不同上皮和间质细胞系的促纤维化作用 | 发现了在肺纤维化中，外周肺上皮细胞表型的显著变化，并识别出几种先前未被认识的上皮细胞表型，包括在肺纤维化中高度富集的病理性和产生细胞外基质的上皮细胞群体 | NA | 全面定义驱动肺纤维化中纤维化重塑的细胞类型、机制和介质 | 肺纤维化中的上皮和间质细胞系 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 10个非纤维化对照肺和20个肺纤维化肺的单细胞悬液，共分析了114,396个细胞 |
| 248 | 2024-08-07 |
Discovery of CD80 and CD86 as recent activation markers on regulatory T cells by protein-RNA single-cell analysis
2020-06-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-020-00756-z
PMID:32580776
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研究论文 | 本研究通过多组学方法，同时定量单细胞中的mRNA和蛋白质表达，以解析人类免疫细胞群体的异质性 | 首次使用多组学方法在单细胞水平上同时检测mRNA和蛋白质表达，并发现了CD80和CD86作为调节性T细胞的近期激活标志 | NA | 研究旨在通过多组学方法解析人类免疫细胞群体的异质性 | 人类初级CD4+ T细胞及其分化轨迹 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和抗体偶联的寡核苷酸（AbSeq） | NA | mRNA和蛋白质 | 43,656个初级CD4+ T细胞和31,907个CD45+细胞 |
| 249 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptomic and anatomic atlas of mouse dorsal raphe Pet1 neurons
2020-06-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.55523
PMID:32568072
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研究论文 | 本文通过高吞吐量和针对背侧中缝核（DR）亚域的单细胞转录组学以及交叉遗传工具，绘制了DR-Pet1神经元的分子和解剖多样性图谱 | 本文描述了多达十四种神经元亚型，其中许多显示出偏向于DR的细胞体分布，并展示了DR神经元的独特传出投射和电生理特性 | NA | 旨在通过分子异质性的表征及其与解剖结构的关联，理解背侧中缝核的功能组织，并为治疗情感障碍提供潜在的疗法信息 | 小鼠背侧中缝核中的Pet1神经元 | 数字病理学 | 情感障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 250 | 2024-08-07 |
Deconvolution of bulk blood eQTL effects into immune cell subpopulations
2020-Jun-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-03576-5
PMID:32532224
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Decon2的新方法，用于从批量血液样本中估计细胞比例并解卷积细胞类型eQTL效应 | Decon2方法能够从批量血液eQTL中检测细胞类型交互效应，为确定特定复杂疾病最相关的细胞类型提供了有效手段 | NA | 开发一种新方法来解释疾病相关遗传风险因素的功能，并揭示eQTL调控效应的细胞类型背景 | 批量血液样本中的细胞类型eQTL效应 | 遗传学 | NA | eQTL分析 | Decon2 | 表达谱 | 3194个样本 |
| 251 | 2024-08-07 |
Dermal Adipocyte Lipolysis and Myofibroblast Conversion Are Required for Efficient Skin Repair
2020-06-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.03.013
PMID:32302523
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研究论文 | 本文探讨了皮肤中的脂肪细胞在损伤后炎症反应和修复过程中的关键作用 | 首次揭示了皮肤脂肪细胞通过脂解作用调节炎症和修复的机制，并发现脂肪细胞能转变为产生细胞外基质的肌成纤维细胞 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 研究脂肪细胞在皮肤组织稳态和修复中的作用 | 皮肤中的脂肪细胞及其在损伤后的功能 | NA | NA | 遗传学实验、组织学、超微结构分析、脂质组学、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 小鼠 |
| 252 | 2024-08-07 |
Targeted Perturb-seq enables genome-scale genetic screens in single cells
2020-06, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-020-0837-5
PMID:32483332
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研究论文 | 本文介绍了一种名为targeted Perturb-seq（TAP-seq）的新方法，该方法通过聚焦单细胞RNA测序覆盖感兴趣的基因，显著提高了遗传筛选的灵敏度和规模 | TAP-seq是一种敏感、低成本且平台独立的方法，能够在一个实验中常规分析数千个CRISPR介导的扰动，检测弱效应和低表达基因，并将测序需求减少高达50倍 | NA | 克服单细胞转录组学在遗传筛选中的实验和统计限制 | 单细胞转录组学中的遗传筛选 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | CRISPR | 转录组 | 1,778个增强子在人类基因组的2.5%范围内 |
| 253 | 2024-08-07 |
Application of information theoretical approaches to assess diversity and similarity in single-cell transcriptomics
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.05.005
PMID:32728406
|
综述 | 本文综述了16种信息论方法在单细胞转录组数据中评估多样性和相似性的应用 | 总结了16种信息论方法，并提供了一个R包来辅助研究者进行单细胞转录组研究 | NA | 探讨信息论方法在单细胞转录组数据多样性和相似性评估中的应用 | 单细胞转录组数据的多样性和相似性 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 254 | 2024-08-07 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Vaccinology
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8624963
PMID:32802896
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序技术在预防性疫苗开发中的应用，特别是针对传染病如COVID-19 | 利用单细胞RNA测序技术详细分析细胞免疫反应，为系统免疫学的新时代提供了可能性 | NA | 研究单细胞RNA测序技术在疫苗学中的应用 | 单细胞RNA测序技术在预防性疫苗开发中的应用，特别是针对传染病 | 数字病理学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 有限体积的样本 |
| 255 | 2024-08-07 |
Probing infectious disease by single-cell RNA sequencing: Progresses and perspectives
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.10.016
PMID:33106757
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在生命科学和生物医学研究中的应用，特别是在传染病领域的应用 | 探讨了scRNA-seq技术在传染病研究中的当前进展和潜在应用 | NA | 总结scRNA-seq技术的发展，并讨论其在传染病研究中的应用 | scRNA-seq技术及其在传染病研究中的应用 | 生物医学研究 | 传染病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 256 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing Shift in the Interaction Pattern Between Glioma Stem Cells and Immune Cells During Tumorigenesis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.581209
PMID:33133100
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研究论文 | 研究旨在揭示胶质瘤干细胞与免疫细胞在肿瘤发生过程中的相互作用 | 利用单细胞测序技术分析了胶质母细胞瘤患者样本和患者来源的胶质瘤干细胞与外周白细胞共培养的数据，揭示了胶质瘤干细胞与免疫细胞在肿瘤发生过程中相互作用模式的变化 | 未提及 | 揭示胶质瘤干细胞与免疫细胞在肿瘤发生过程中的相互作用 | 胶质瘤干细胞与免疫细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 7个胶质母细胞瘤患者的手术样本和患者来源的胶质瘤干细胞与外周白细胞共培养 |
| 257 | 2024-08-07 |
Flow-Induced Transcriptomic Remodeling of Endothelial Cells Derived From Human Induced Pluripotent Stem Cells
2020, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2020.591450
PMID:33178051
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研究论文 | 研究使用人诱导多能干细胞衍生的内皮细胞（hiPSC-ECs）和批量及单细胞RNA测序，探讨了血流对hiPSC-ECs转录组景观及其异质性的影响 | 首次展示了hiPSC-ECs在血流作用下的转录组重塑，并揭示了其在血流作用下变得更加均一和稳态更稳定的特性 | NA | 研究血流对内皮细胞转录组的影响及其在血管发育中的作用 | 人诱导多能干细胞衍生的内皮细胞（hiPSC-ECs） | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 258 | 2024-08-07 |
Patterns, Profiles, and Parsimony: Dissecting Transcriptional Signatures From Minimal Single-Cell RNA-Seq Output With SALSA
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.511286
PMID:33193599
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研究论文 | 介绍了一种名为SALSA的工作流程，该流程通过结合测量可靠性指标和潜在变量提取，从超稀疏的单细胞RNA测序数据中推断出稳健的表达谱 | SALSA工作流程能够从超稀疏的单细胞RNA测序数据中推断出稳健的表达谱，且仅需要少量的数据 | NA | 开发一种经济高效的生物信息学工具，用于从单细胞RNA测序数据中重建细胞谱系特异性和分化过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在语义分析 | RNA测序数据 | 使用10X Genomics PBMC 3K数据集，包含2,700个单细胞条形码；使用多批次小鼠视网膜实验设计的DropSeq数据，包含超过64,000个单细胞 |
| 259 | 2024-08-07 |
Age-associated changes in the transcriptomes of non-cultured adipose-derived stem cells from young and old mice assessed via single-cell transcriptome analysis
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0242171
PMID:33237970
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了年轻和老年小鼠非培养脂肪源性干细胞的转录组年龄相关变化。 | 首次使用新鲜分离的基质血管部分进行全面的单细胞转录组分析，并鉴定了三个新的与脂肪源性干细胞相关的基因。 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨这些发现对人类干细胞的适用性。 | 探讨年龄对脂肪源性干细胞分化潜能的影响。 | 年轻和老年小鼠的非培养脂肪源性干细胞。 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 年轻和老年小鼠的脂肪源性干细胞样本 |
| 260 | 2024-08-07 |
Applications of Single-Cell Omics to Dissect Tumor Microenvironment
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.548719
PMID:33329692
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析肿瘤微环境（TME）中的最新进展及其对肿瘤进展和免疫治疗反应的功能影响 | 单细胞转录组学技术提供了前所未有的细胞和分子复杂性解析，加速了对TME中异质性、可塑性和复杂细胞间相互作用的理解 | 讨论了现有方法的局限性，并展望了未来利用单细胞多组学技术进行研究的前景 | 探讨单细胞测序技术在理解TME多样性及其对肿瘤进展和免疫治疗反应中的作用 | 主要关注人类TME中浸润的主要免疫细胞类型，包括T细胞、树突状细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组 | NA |