单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-07 |
FLOW-MAP: a graph-based, force-directed layout algorithm for trajectory mapping in single-cell time course datasets
2020-02, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0246-3
PMID:31932774
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为FLOW-MAP的图形用户界面（GUI）软件工具，该工具利用基于图布局分析和时间顺序的方法，用于可视化高维单细胞数据集中的细胞轨迹 | FLOW-MAP算法通过图形布局分析和时间顺序的方法，为单细胞时间序列数据集的分析提供了一种新的可视化工具 | NA | 开发一种新的工具来分析和可视化单细胞时间序列数据集中的细胞轨迹 | 单细胞时间序列数据集，特别是来自流式细胞术、质谱细胞术或单细胞RNA测序（scRNAseq）实验的数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 图布局算法 | 高维单细胞数据 | 包括从小鼠胚胎干细胞分化的时间序列数据集和已发表的scRNAseq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-07 |
In vitro Targeting of Transcription Factors to Control the Cytokine Release Syndrome in COVID-19
2020-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.12.29.424728
PMID:33398281
|
研究论文 | 本研究系统探索了COVID-19中细胞因子释放综合征（CRS）相关的炎症细胞因子的转录调节因子，以识别可用于治疗目标的候选转录因子（TFs）和已批准的药物 | 发现了581个显著相关的TF-细胞因子基因相互作用，并识别出19个可作为FDA批准药物靶点的TFs，以及10种药物和25种药物组合在体外抑制细胞因子产生的效果 | NA | 寻找治疗COVID-19患者细胞因子释放综合征（CRS）的潜在治疗方法 | COVID-19患者的细胞因子释放综合征（CRS）及其相关的转录因子 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-07 |
Structural Variability, Expression Profile, and Pharmacogenetic Properties of TMPRSS2 Gene as a Potential Target for COVID-19 Therapy
2020-12-25, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12010019
PMID:33375616
|
研究论文 | 本文研究了TMPRSS2基因的结构变异性、表达谱和药物遗传学特性，探讨其作为COVID-19治疗潜在靶点的可能性 | 首次分析了TMPRSS2基因在76个人群中的结构变异性，并发现了与前列腺癌相关的错义突变在不同人群中的分布模式 | 未提及具体限制 | 探讨TMPRSS2基因作为COVID-19治疗潜在靶点的可能性 | TMPRSS2基因的结构变异性、表达谱和药物遗传学特性 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 76个人群 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2024-08-07 |
Short-Chain Fatty Acid-Producing Gut Microbiota Is Decreased in Parkinson's Disease but Not in Rapid-Eye-Movement Sleep Behavior Disorder
2020-Dec-08, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00797-20
PMID:33293403
|
研究论文 | 本研究通过16S rRNA测序分析了26名快速眼动睡眠行为障碍（iRBD）患者和137名对照组的肠道微生物群，并与223名帕金森病（PD）患者的肠道微生物群进行了比较，发现短链脂肪酸（SCFA）产生菌在PD患者中减少，而在iRBD患者中未见显著减少。 | 首次对iRBD患者的肠道微生物群进行了大规模分析，并与PD患者的肠道微生物群进行了比较，揭示了SCFA产生菌在两种疾病中的不同变化。 | 研究样本主要来自日本和德国，可能存在地域偏差；仅分析了肠道微生物群的组成，未探讨其功能。 | 探讨帕金森病和快速眼动睡眠行为障碍患者肠道微生物群的差异及其与疾病发展的关系。 | 帕金森病和快速眼动睡眠行为障碍患者的肠道微生物群。 | NA | 帕金森病 | 16S rRNA测序 | NA | 微生物群数据 | 26名iRBD患者，137名对照组，223名PD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-Seq reveals the transcriptional landscape and heterogeneity of skin macrophages in Vsir-/- murine psoriasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.45614
PMID:32929361
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，揭示了Vsir-/-小鼠银屑病皮肤中巨噬细胞的转录组图谱和异质性 | 首次全面展示了Vsir psoriatic小鼠皮肤免疫细胞的单细胞景观，揭示了银屑病皮肤巨噬细胞的转录组图谱和表型异质性，并识别了其基因表达特征 | NA | 研究Vsir-/-小鼠银屑病皮肤炎症中涉及的免疫细胞亚群 | Vsir psoriatic小鼠的皮肤免疫细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23,258个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-07 |
WWOX Loss of Function in Neurodevelopmental and Neurodegenerative Disorders
2020-Nov-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21238922
PMID:33255508
|
研究论文 | 本文探讨了WWOX基因功能丧失在神经发育和神经退行性疾病中的作用 | 首次全面描述了WWOX基因在多种中枢神经系统疾病中的表达模式及其与疾病的相关性 | 尚未完全阐明WWOX功能丧失导致神经退行性疾病的具体分子机制 | 研究WWOX基因在神经发育和神经退行性疾病中的作用及其分子机制 | WWOX基因及其在中枢神经系统中的表达 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及人类和小鼠的多个脑区及特定神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2024-08-07 |
TLR-9 agonist and CD40-targeting vaccination induces HIV-1 envelope-specific B cells with a diversified immunoglobulin repertoire in humanized mice
2020-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009025
PMID:33253297
|
研究论文 | 本研究探讨了在人源化小鼠中，通过CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用，诱导针对HIV-1 Env蛋白的B细胞反应及其免疫球蛋白谱系多样性 | 本研究首次展示了CD40靶向疫苗与CpG-B佐剂联合使用能在人源化小鼠中有效促进人B细胞从IgM向IgG的转变和成熟，并诱导出针对HIV-1 Env蛋白的特异性IgG转换记忆B细胞 | 研究主要在人源化小鼠模型中进行，其结果在人类中的直接应用尚需进一步验证 | 开发针对HIV-1的疫苗，特别是在人源化小鼠模型中诱导人B细胞和T细胞的反应 | 人源化小鼠中的B细胞和T细胞反应 | 疫苗学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2024-08-07 |
Inference of mutability landscapes of tumors from single cell sequencing data
2020-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008454
PMID:33253159
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MULAN的最大似然计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤细胞的突变率，从而构建肿瘤的突变景观 | 提出了MULAN框架，利用癌症突变树提供的部分突变事件顺序信息，推断肿瘤的完整进化历史和突变景观 | NA | 开发一种新的计算框架，用于从单细胞测序数据中推断肿瘤的突变率和进化历史 | 肿瘤细胞的突变率和进化历史 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 最大似然法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2024-08-07 |
Integrated Skin Transcriptomics and Serum Multiplex Assays Reveal Novel Mechanisms of Wound Healing in Diabetic Foot Ulcers
2020-10, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db20-0188
PMID:32763913
|
研究论文 | 本研究通过综合分析糖尿病足溃疡（DFU）患者的皮肤转录组和血清多重检测，揭示了伤口愈合的新机制。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了糖尿病足溃疡患者的皮肤纤维母细胞群和炎症情况，并识别了可能影响伤口愈合的关键基因和通路。 | NA | 探讨糖尿病足溃疡伤口愈合的新机制。 | 糖尿病足溃疡患者的皮肤和血清。 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一组糖尿病足溃疡患者 | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2024-08-07 |
Exploring Additional Valuable Information From Single-Cell RNA-Seq Data
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.593007
PMID:33335900
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据在细胞间通信探索、RNA速度推断、大规模拷贝数变异和单核苷酸变化识别、染色质可及性预测等方面的应用 | 探讨了scRNA-seq数据在发现新基因/转录本、长非编码RNA和环状RNA的分析，以及单细胞和批量RNA-seq数据集整合的应用 | NA | 旨在探索scRNA-seq数据在基础科学和临床应用中的额外价值 | scRNA-seq数据中的细胞间通信、RNA速度、拷贝数变异、单核苷酸变化、染色质可及性、新基因/转录本、长非编码RNA和环状RNA | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | NA | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2024-08-07 |
Stem Cell Pluripotency Genes Klf4 and Oct4 Regulate Complex SMC Phenotypic Changes Critical in Late-Stage Atherosclerotic Lesion Pathogenesis
2020-11-24, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色质免疫沉淀测序等技术，探讨了Klf4和Oct4基因在晚期动脉粥样硬化病变中对平滑肌细胞表型变化的影响。 | 研究发现平滑肌细胞在晚期动脉粥样硬化病变中表现出比普遍认为的更大的表型可塑性，并且Klf4基因调控了多种表型的转变，包括可能对晚期动脉粥样硬化病变有害的Lgals3+成骨细胞。 | NA | 探讨晚期动脉粥样硬化病变中平滑肌细胞的来源、身份和功能，以及它们如何控制斑块稳定性。 | 晚期动脉粥样硬化病变中的平滑肌细胞和内皮细胞。 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序 | NA | RNA | 人类颈动脉内膜切除术样本和微切割的小鼠晚期动脉粥样硬化病变样本 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2024-08-07 |
Research and application of single-cell sequencing in tumor heterogeneity and drug resistance of circulating tumor cells
2020-Nov-10, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-020-00240-1
PMID:33292625
|
研究论文 | 本文研究了单细胞测序技术在肿瘤异质性和循环肿瘤细胞药物抗性中的应用 | 利用单细胞测序技术研究循环肿瘤细胞，避免了肿瘤异质性的干扰，为理解肿瘤药物抗性提供了新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在解决肿瘤异质性和药物抗性问题中的应用 | 肿瘤异质性和循环肿瘤细胞的药物抗性 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome conservation in a comparative analysis of fresh and cryopreserved human skin tissue: pilot in localized scleroderma
2020-11-09, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-020-02343-4
PMID:33168063
|
研究论文 | 本研究评估了使用CryoStor® CS10与RPMI在局部硬皮病患者皮肤组织中细胞组成和细胞特异性基因表达的变异性 | 首次比较了新鲜和冷冻保存的人类皮肤组织在单细胞转录组水平上的保守性 | 研究样本量较小，仅包括3名局部硬皮病患者 | 评估不同保存方法对局部硬皮病患者皮肤组织细胞组成和基因表达的影响 | 局部硬皮病患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名局部硬皮病患者的皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 254 | 2024-08-07 |
CD63+ Cancer-Associated Fibroblasts Confer Tamoxifen Resistance to Breast Cancer Cells through Exosomal miR-22
2020-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202002518
PMID:33173749
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序描绘了肿瘤微环境的整体景观，并发现了一种新的癌症相关成纤维细胞（CD63 CAFs），这种细胞通过分泌富含miR-22的胞外囊泡促进乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 首次揭示了CD63 CAFs通过分泌富含miR-22的胞外囊泡诱导乳腺癌细胞对他莫昔芬产生耐药性，并提出了CD63 CAFs作为增强他莫昔芬敏感性的新型治疗靶点 | NA | 旨在从肿瘤微环境的角度更好地理解他莫昔芬耐药性 | 乳腺癌细胞对他莫昔芬的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2024-08-07 |
Identification of diverse cell populations in skeletal muscles and biomarkers for intramuscular fat of chicken by single-cell RNA sequencing
2020-Oct-31, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-020-07136-2
PMID:33129271
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，首次描述了鸡骨骼肌在两个发育阶段的异质性，并鉴定了APOA1和COL1A1作为鸡肌内脂肪细胞的生物标志物。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群，并鉴定了新的肌内脂肪细胞生物标志物。 | NA | 研究鸡骨骼肌发育过程中的细胞异质性及其与肌内脂肪细胞的关系。 | 鸡骨骼肌在不同发育阶段的细胞亚群及其基因表达。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 在孵化后第5天和第100天分别鉴定了10个和7个细胞集群。 | NA | NA | NA | NA |
| 256 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of Neuroinflammatory Responses in Amyotrophic Lateral Sclerosis: A Challenge or an Opportunity?
2020-Oct-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21217923
PMID:33113845
|
综述 | 本文综述了肌萎缩侧索硬化症（ALS）中神经炎症反应的异质性，并探讨了其作为治疗挑战或机遇的可能性 | 介绍了单细胞和空间转录组学技术在发现新的治疗靶点和非侵入性诊断/预后标志物方面的潜力 | 异质性/多方面的微胶质细胞反应在不同中枢神经系统区域的发生为单一药物疗法的临床转化带来了障碍 | 总结过去十年中关于ALS中微胶质细胞反应复杂性的研究结果，并讨论新技术带来的新治疗途径 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS）中的神经炎症反应及其微胶质细胞的作用 | NA | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞和空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 257 | 2024-08-07 |
Genomic Analysis of Hematopoietic Stem Cell at the Single-Cell Level: Optimization of Cell Fixation and Whole Genome Amplification (WGA) Protocol
2020-Oct-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21197366
PMID:33036143
|
研究论文 | 本文评估了不同的细胞免疫染色、固定和全基因组扩增方法对单细胞测序效率和产量的影响 | 优化了单细胞水平上造血干细胞的细胞固定和全基因组扩增协议 | NA | 深入理解肿瘤发病机制及肿瘤群体对治疗的反应 | 造血干细胞的单细胞基因组分析 | NA | 血液系统肿瘤 | 全基因组扩增 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals mRNA Splice Isoform Switching during Kidney Development
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080770
PMID:32651222
|
研究论文 | 本研究利用全长单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎肾脏中544个单细胞的转录组，揭示了肾脏发育过程中mRNA剪接异构体转换的现象 | 本研究首次通过全长单细胞RNA测序技术，全面分析了肾脏发育过程中细胞状态转换时的剪接异构体转换，并识别了几个潜在的剪接调控因子 | NA | 揭示胎儿肾脏间质向管状上皮分化过程中基因的替代剪接机制，以增进对肾脏发育分子机制的理解 | 小鼠胚胎肾脏中的单细胞 | 数字病理学 | NA | 全长单细胞RNA测序 | NA | RNA | 544个小鼠胚胎肾脏单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 259 | 2024-08-07 |
An Experiment on Ab Initio Discovery of Biological Knowledge from scRNA-Seq Data Using Machine Learning
2020-Aug-14, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2020.100071
PMID:33205121
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法在单细胞RNA测序数据上进行实验，探索了在没有现有知识指导的情况下发现生物学知识的能力和局限性 | 本研究采用无监督和监督机器学习相结合的策略，揭示了主要细胞谱系，且最小程度依赖先验知识或人工干预，实现了人类早期胚胎细胞分化的新发现 | 研究展示了机器学习在复杂生物问题知识发现的可行性和重要性，但也指出了其局限性 | 探索机器学习在无现有知识指导的高通量生物数据中发现新模式的潜力和局限 | 早期胚胎发育的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | NA | 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-07 |
Prospects for Use of Single-Cell Sequencing to Assess DNA Methylation in Asthma
2020-Oct-03, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.925514
PMID:33009362
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在评估哮喘中DNA甲基化作用的应用前景 | 单细胞测序技术能够揭示不同细胞群中基因的甲基化和表达情况，相较于传统的多组学测序，能更好地反映哮喘的发病机制 | 目前关于哮喘中DNA甲基化的研究较少，且主要使用单细胞测序技术的研究有限 | 研究单细胞测序技术在揭示哮喘中DNA甲基化功能和调控机制的作用 | 哮喘中的DNA甲基化 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |