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当前共找到 1659 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2025-10-06
Single-cell transcriptomics from human pancreatic islets: sample preparation matters
2020, Biology methods & protocols IF:2.5Q3
研究论文 比较不同样本制备方案对人类胰岛单细胞转录组测序结果的影响 首次系统评估不同样本处理策略(包括固定和冷冻保存)对新鲜人类胰岛单细胞RNA测序数据的影响 研究仅基于两名供体的胰岛样本,样本量较小 评估样本制备方案对单细胞转录组测序结果的影响 人类胰岛组织 单细胞组学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 2名人类供体的胰岛样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
222 2025-10-06
Data generation and network reconstruction strategies for single cell transcriptomic profiles of CRISPR-mediated gene perturbations
2020-06, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
综述 讨论单细胞RNA测序与CRISPR/Cas9技术结合进行大规模基因扰动研究的数据生成和网络重建策略 系统分析单细胞CRISPR扰动数据特有的技术挑战,并介绍网络重建新方法如嵌套效应模型 主要关注方法学讨论,缺乏实际数据验证 开发单细胞转录组基因扰动数据的生成和分析方法,以重建细胞网络模型 单细胞转录组CRISPR扰动数据 计算生物学 NA 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9 共表达网络, 贝叶斯网络, 嵌套效应模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
223 2025-10-06
Expression profiling of single cells and patient cohorts identifies multiple immunosuppressive pathways and an altered NK cell phenotype in glioblastoma
2020-04, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3
研究论文 本研究通过单细胞和患者队列分析揭示了胶质母细胞瘤中多种免疫抑制途径及NK细胞表型改变 首次结合单细胞转录组和患者队列数据系统揭示胶质母细胞瘤中NK细胞功能抑制机制及多种免疫逃避途径 研究主要基于体外实验和转录组数据分析,需要进一步体内功能验证 阐明胶质母细胞瘤免疫抑制机制及NK细胞在肿瘤微环境中的功能状态 胶质母细胞瘤患者样本、神经胶质瘤干细胞、正常神经前体细胞、NK细胞 单细胞测序 胶质母细胞瘤 单细胞转录组测序, 基因表达谱分析, 蛋白质表达分析, NK细胞功能检测 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 患者队列数据 患者队列样本 NA 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA NA
224 2025-10-06
Commensal microbiota drive the functional diversification of colon macrophages
2020-03, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示肠道菌群对结肠巨噬细胞功能多样化的驱动作用 首次在分子水平揭示肠道菌群通过调控转录程序驱动结肠巨噬细胞发育轨迹和功能分化 研究仅使用C57BL/6小鼠模型,未验证其他物种或人类样本 探究肠道菌群对结肠髓系细胞发育和功能分化的影响 无特定病原体(SPF)和无菌(GF) C57BL/6小鼠的结肠髓系细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 基因调控网络推断 单细胞转录组数据 SPF和GF C57BL/6小鼠结肠髓系细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
225 2025-10-06
Transcriptional dynamics of pluripotent stem cell-derived endothelial cell differentiation revealed by single-cell RNA sequencing
2020-03-01, European heart journal IF:37.6Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示多能干细胞分化为内皮细胞的转录动态过程 首次使用单细胞RNA测序技术绘制人多能干细胞向内皮细胞定向分化的转录景观和细胞动态过程,发现了新的转录特征 研究仅使用人类胚胎干细胞系,未涵盖其他类型的多能干细胞 解析多能干细胞向内皮细胞分化的分子机制和转录动态 人类胚胎干细胞及其分化的内皮细胞产物 单细胞组学 缺血性血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 105,727个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
226 2025-10-06
Single-Cell Transcriptomics: A High-Resolution Avenue for Plant Functional Genomics
2020-02, Trends in plant science IF:17.3Q1
综述 本文综述了单细胞转录组学在植物功能基因组学中的应用与潜力 首次系统阐述单细胞RNA测序技术在植物复杂组织中研究调控过程的新能力,无需依赖报告基因系即可分析任何植物组织 面临复杂数据集处理和分析的挑战 探索单细胞转录组学在植物功能基因组学研究中的应用 植物组织和单细胞 植物基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
227 2025-10-06
The genetic architecture of Parkinson's disease
2020-02, The Lancet. Neurology
综述 本文综述了帕金森病的遗传结构研究现状与挑战 系统总结了90个已鉴定的独立风险相关变异,并指出新兴技术将推动该领域发展 大多数遗传研究基于欧洲血统患者,对其他人群的遗传学了解有限 解析帕金森病的遗传结构及其对疾病风险、发病和进展的影响 帕金森病相关遗传变异(罕见和常见变异) 遗传学 帕金森病 全基因组关联研究、单细胞RNA测序、机器学习、高通量筛选 NA 遗传数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
228 2025-10-06
Probabilistic cell typing enables fine mapping of closely related cell types in situ
2020-01, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 提出一种名为pciSeq的概率细胞分型方法,通过原位测序技术实现紧密相关细胞类型的精细空间定位 结合单细胞RNA测序分类结果,利用多重原位RNA检测技术实现细胞类型的概率识别和空间定位 方法依赖于先前的scRNA-seq分类结果,需要已有充分的基础研究数据支持 开发能够精确定位紧密相关细胞类型空间组织的新方法 小鼠海马CA1区抑制性神经元和等皮质锥体细胞 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序, 原位测序 概率模型 空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA pciSeq(概率细胞分型原位测序)
229 2025-10-07
Heterogeneity of human prostate carcinoma-associated fibroblasts implicates a role for subpopulations in myeloid cell recruitment
2020-02, The Prostate
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示人类前列腺癌相关成纤维细胞的异质性及其在髓系细胞招募中的作用 首次在前列腺癌中发现CAF存在六个功能异质性亚群,并证实特定亚群通过分泌CCL2趋化因子招募髓系细胞 研究样本量有限(3321个CAF),机制研究主要基于体外实验,需要更多体内验证 鉴定前列腺癌相关成纤维细胞的功能亚群及其在肿瘤微环境中的作用机制 人类前列腺癌相关成纤维细胞(CAF)和正常前列腺成纤维细胞(NPF) 单细胞生物学 前列腺癌 单细胞RNA测序,贝叶斯分析,体外迁移实验 无监督聚类分析 单细胞转录组数据 3321个CAF细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
230 2025-10-07
Single-Cell Profiling of Ebola Virus Disease In Vivo Reveals Viral and Host Dynamics
2020-11-25, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞技术揭示了埃博拉病毒感染期间宿主免疫细胞和病毒在体内的动态变化 首次在体内使用单细胞转录组学和质谱流式细胞技术全面表征埃博拉病毒感染期间的免疫反应,并量化细胞内病毒RNA以确定病毒嗜性 实验在高度防护环境下进行,样本获取困难,研究仅使用恒河猴模型 表征埃博拉病毒感染期间的宿主-病毒相互作用动态 恒河猴外周免疫细胞 单细胞生物学 埃博拉病毒病 单细胞转录组学, CyTOF质谱流式细胞技术 NA 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 100,000个转录组和15,000,000个蛋白质谱 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 NA NA
231 2025-10-07
Ketogenesis activates metabolically protective γδ T cells in visceral adipose tissue
2020-01, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示生酮饮食通过激活内脏脂肪组织中代谢保护性γδ T细胞抑制炎症的机制 首次发现生酮饮食通过激活内脏脂肪组织中具有代谢保护功能的γδ T细胞来抑制炎症 长期随意采食生酮饮食会导致肥胖并耗竭脂肪组织γδ T细胞 探究生酮作用对脂肪组织炎症控制和能量稳态的影响机制 小鼠脂肪组织驻留免疫细胞 免疫代谢学 代谢性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠脂肪组织免疫细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
232 2025-10-07
Ageing hallmarks exhibit organ-specific temporal signatures
2020-07, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过多器官转录组和血浆蛋白质组分析揭示小鼠衰老过程中器官特异性时间特征 首次在完整生命周期内对17个器官进行系统性衰老动态分析,发现基因表达变化的线性与非线性模式 研究仅限于小鼠模型,人类衰老过程可能存在差异 阐明衰老过程中器官间和器官内分子变化的时空动态特征 小鼠(Mus musculus)的17个器官和血浆样本 生物信息学 老年疾病 RNA测序, 蛋白质组学 NA 基因表达数据, 蛋白质数据 10个年龄点的多器官样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 血浆蛋白质组学 NA NA
233 2025-10-07
Single-Cell and Population Transcriptomics Reveal Pan-epithelial Remodeling in Type 2-High Asthma
2020-07-07, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型细胞因子高表达型哮喘中IL-13诱导的全上皮细胞重塑机制 发现IL-13在所有上皮细胞类型中诱导黏液分泌程序,导致黏液和防御分泌细胞转化为具有新生黏蛋白产生和分泌能力的化生状态 研究主要基于体外细胞培养模型,需要在更多临床样本中验证 探究2型细胞因子高表达型哮喘中IL-13对气道上皮细胞的影响机制 人气道上皮细胞培养物和儿童哮喘患者的鼻气道上皮 单细胞转录组学 哮喘 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
234 2025-10-07
Improved detection of tumor suppressor events in single-cell RNA-Seq data
2020, NPJ genomic medicine IF:4.7Q1
研究论文 提出一种名为SCIRA的计算方法,用于在单细胞RNA测序数据中推断组织特异性转录因子的调控活性并识别肿瘤抑制事件 开发了能够克服单细胞数据高丢失率挑战的计算工具SCIRA,首次在单细胞分辨率下系统识别肿瘤抑制事件 方法主要针对单细胞RNA测序数据,可能不适用于其他类型的数据 提高单细胞RNA测序数据中肿瘤抑制事件检测的灵敏度 组织特异性转录因子在癌症中的失活机制 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序 SCIRA(专有计算策略) 单细胞RNA测序数据 吸烟者正常非纤毛肺上皮细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
235 2025-10-07
Single-cell sperm transcriptomes and variants from fathers of children with and without autism spectrum disorder
2020, NPJ genomic medicine IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术分析自闭症谱系障碍患儿父亲和神经典型儿童父亲精子中的转录组和基因变异 首次在单精子水平进行转录组和变异分析,突破了传统批量精子检测只能发现高频变异的限制 样本量较小(仅6名捐赠者),需要更大规模研究验证发现 探究自闭症谱系障碍与父系精子基因变异之间的关联 人类精子细胞 单细胞基因组学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序,RNA-seq NA 单细胞转录组数据 6名精子捐赠者的超过65,000个单精子细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞测序平台
236 2025-10-07
IL-7 receptor alpha defines heterogeneity and signature of human effector memory CD8+ T cells in high dimensional analysis
2020-09, Cellular immunology IF:3.7Q2
研究论文 通过高维质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,研究IL-7Rα在定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性中的作用 首次揭示IL-7Rα在人类效应记忆CD8+ T细胞中具有多样化但有序的表达模式,并定义了细胞亚群的异质性景观 未明确说明样本规模和研究人群特征 探究IL-7Rα是否可作为定义人类效应记忆CD8+ T细胞异质性的关键分子 人类效应记忆CD8+ T细胞 免疫学 NA 质谱流式细胞术(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 蛋白质表达数据, 基因表达数据 NA NA 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA NA
237 2025-10-07
Succinate Produced by Intestinal Microbes Promotes Specification of Tuft Cells to Suppress Ileal Inflammation
2020-12, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物通过产生琥珀酸促进簇细胞分化,从而抑制回肠炎症的机制 首次发现琥珀酸介导的微生物-簇细胞互作在克罗恩病中的保护作用,并鉴定出ATOH1非依赖性簇细胞亚群 样本量有限(人类样本n=33),机制研究主要基于小鼠模型 研究肠道簇细胞在克罗恩病炎症反应中的功能机制 克罗恩病患者肠道组织、小鼠炎症模型、肠道微生物 肠道免疫学 克罗恩病 单细胞RNA测序、质谱分析、微生物组分析、显微成像、细胞因子检测 NA 基因表达数据、代谢组数据、微生物组数据、图像数据 人类样本33例(19例克罗恩病患者+14例健康对照),多种基因工程小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
238 2025-10-07
Dual indexed library design enables compatibility of in-Drop single-cell RNA-sequencing with exAMP chemistry sequencing platforms
2020-Jul-02, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 开发了一种名为TruDrop的双索引文库设计,使inDrop单细胞RNA测序平台与新型测序化学平台兼容 在inDrop单细胞RNA测序平台上设计了双索引文库结构,解决了与新型测序技术兼容性的挑战 尚未系统评估其生成高质量数据的能力 解决单细胞RNA测序文库设计与新型测序技术的兼容性问题 单细胞RNA测序文库 单细胞测序技术 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA Illumina 单细胞RNA测序 inDrop, NovaSeq 6000 inDrop单细胞RNA测序平台, Illumina NovaSeq 6000测序仪
239 2025-10-07
Quantitative planar array screen of 1000 proteins uncovers novel urinary protein biomarkers of lupus nephritis
2020-10, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 通过定量平面蛋白质微阵列筛选1000种蛋白质,发现狼疮性肾炎的新型尿液生物标志物 首次使用定量平面蛋白质微阵列技术对1000种尿液蛋白质进行无偏筛选,发现多个优于传统标志物的新型生物标志物 样本量有限,需要在更大队列中进一步验证 发现狼疮性肾炎的新型尿液生物标志物 系统性红斑狼疮患者的尿液样本 生物标志物研究 狼疮性肾炎 定量平面蛋白质微阵列, ELISA, 单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据, RNA测序数据 多个独立SLE患者队列(包括非活动期、活动非肾脏期、活动肾脏期患者) NA 蛋白质微阵列, 单细胞RNA测序 NA 定量平面蛋白质微阵列
240 2025-10-07
Single-cell RNA-seq analysis identifies meniscus progenitors and reveals the progression of meniscus degeneration
2020-03, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析鉴定半月板祖细胞并揭示半月板退变进程 首次在人类半月板中发现两个新型细胞群体,鉴定出具有祖细胞特征的退化半月板特异性细胞簇,揭示了FCP向DegP分化的异常过程 研究样本量有限,主要基于体外实验和计算分析,需要进一步体内验证 阐明半月板细胞异质性及半月板退变机制 健康人类和退变半月板细胞 单细胞生物学 骨科疾病 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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